Dissertations / Theses: 'Populations locales'

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Fotsa, Jean Claude. "Caractérisation des populations de poules locales (Gallus gallus) au Cameroun." Phd thesis, AgroParisTech, 2008. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00004904.

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Abstract:

La caractérisation zootechnique, phénotypique et moléculaire des populations de poules locales des hauts plateaux et des forêts a été menée pour une meilleure connaissance de la variabilité génétique disponible et de leurs potentialités, afin de développer des stratégies d'amélioration et de conservation. Il ressort en milieu paysan que les poules locales représentent 69,4% des espèces élevées sous la responsabilité des femmes (57%). Leur élevage est motivé par leur adaptation au milieu (56%), la qualité des produits locaux (27%) et les traditions culturelles (15%). Les sujets du Sud et de l'Est étudiés sur le terrain ont des poids comparables (1400g chez les mâles et 1160g chez les femelles), mais inférieurs à ceux des animaux du Centre (1665g chez les mâles et 1259g chez les femelles). La ponte annuelle déclarée est en moyenne de 54 œufs au Sud, 51 au Centre et 49 à l'Est et le taux d'éclosion est supérieur à 80%. La diversité phénotypique montre la faible fréquence (1 à 10%) de plusieurs mutations (tarse emplumé, huppe, cou nu, barbe et favoris, frisé, nanisme) alors que la fréquence est plus élevée pour le plumage de couleur noire étendue (locus E) et argenté (locus S). En milieu contrôlé en station, les mâles labels normaux (FR) sont 48,75%, 49,55% et 41,98% plus lourds à 16 semaines d'âge que respectivement ceux du Centre, du Sud et du Nord-Ouest/Ouest (NO/OU). L'indice de consommation entre 12 et 16 semaines d'âge est de 3,16 pour le FR et varie de 3,92 à 4,16 chez les écotypes locaux. Les femelles FR (1550g) et les labels naines FR1 (1260g) sont plus lourdes que la femelle locale (NO/OU) la plus lourde (889g). Les indices de consommation sont de 4,62 (témoins FR et FR1), de 4,94 (Centre), de 4,31 (NO/OU) et de 4,35 (Sud). L'abattage des mâles à 16 semaines montre un taux de gras extrêmement faible chez le label comme chez les écotypes locaux. Le test sensoriel sur les morceaux cuisinés ne montre pas de différence entre label et écotypes locaux pour la tendreté, la jutosité et la flaveur. La mortalité en station a été élevée chez les jeunes mais elle est inférieure à 8% de 18 à 52 semaines d'âges. Chez les femelles adultes, la FR (2604 g) a un poids corporel supérieur à celui de la FR1 (2083 g) tandis que les femelles du NO/OU (1481g), du Centre (1362g) et du Sud (1404g) sont plus légères dans leur ensemble. La masse d'œufs entre 32 et 36 semaines d'âge montre un avantage de la FR1 (875g) et de l'écotype du Sud (803g) par rapport aux autres types génétiques avec toutefois des valeurs comparables entre celles du NO/OU (687g) et de la FR (671g), celle du Centre (722g) étant intermédiaire. Tous ces génotypes montrent de faibles valeurs de consommation résiduelle (-4,70g (Sud), 17,32g (Centre), -50,26g (FR), 11,12g (FR1)) par rapport aux besoins d'entretien et de production. L'emploi de 22 marqueurs microsatellites chez 4 populations locales et 3 lignées commerciales a produit un total de 156 allèles pour une moyenne de 7,09 allèles par locus ; les populations locales présentent une bien plus grande richesse allélique que les commerciales. Chez les populations locales, l'hétérozygotie attendue (He) et observée (Ho) varient respectivement de 0,617 à 0,634 et de 0,628 à 0,664. La population du NO/OU semble plus homogène que celles du Centre et du Sud, qui semblent génétiquement plus proches des lignées commerciales. Un programme d'amélioration génétique d'un troupeau pépinière de poules locales est proposé, en combinaison avec un protocole de croisement à court terme avec le poulet label.

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Fotsa, Jean-Claude. "Caractérisation des populations de poules locales (Gallus gallus) au Cameroun." Paris, AgroParisTech, 2008. http://pastel.paristech.org/4904/01/THESE_FOTSA_[18_DEC_2008]_Agro_Paris_Tech.pdf.

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Abstract:

La caractérisation zootechnique, phénotypique et moléculaire des populations de poules locales des hauts plateaux et des forêts a été menée pour une meilleure connaissance de la variabilité génétique disponible et de leurs potentialités, afin de développer des stratégies d’amélioration et de conservation. Il ressort en milieu paysan que les poules locales représentent 69,4% des espèces élevées sous la responsabilité des femmes (57%). Leur élevage est motivé par leur adaptation au milieu (56%), la qualité des produits locaux (27%) et les traditions culturelles (15%). Les sujets du Sud et de l’Est étudiés sur le terrain ont des poids comparables (1400g chez les mâles et 1160g chez les femelles), mais inférieurs à ceux des animaux du Centre (1665g chez les mâles et 1259g chez les femelles). La ponte annuelle déclarée est en moyenne de 54 œufs au Sud, 51 au Centre et 49 à l’Est et le taux d’éclosion est supérieur à 80%. La diversité phénotypique montre la faible fréquence (1 à 10%) de plusieurs mutations (tarse emplumé, huppe, cou nu, barbe et favoris, frisé, nanisme) alors que la fréquence est plus élevée pour le plumage de couleur noire étendue (locus E) et argenté (locus S). En milieu contrôlé en station, les mâles labels normaux (FR) sont 48,75%, 49,55% et 41,98% plus lourds à 16 semaines d’âge que respectivement ceux du Centre, du Sud et du Nord-Ouest/Ouest (NO/OU). L'indice de consommation entre 12 et 16 semaines d’âge est de 3,16 pour le FR et varie de 3,92 à 4,16 chez les écotypes locaux. Les femelles FR (1550g) et les labels naines FR1 (1260g) sont plus lourdes que la femelle locale (NO/OU) la plus lourde (889g). Les indices de consommation sont de 4,62 (témoins FR et FR1), de 4,94 (Centre), de 4,31 (NO/OU) et de 4,35 (Sud). L’abattage des mâles à 16 semaines montre un taux de gras extrêmement faible chez le label comme chez les écotypes locaux. Le test sensoriel sur les morceaux cuisinés ne montre pas de différence entre label et écotypes locaux pour la tendreté, la jutosité et la flaveur. La mortalité en station a été élevée chez les jeunes mais elle est inférieure à 8% de 18 à 52 semaines d’âges. Chez les femelles adultes, la FR (2604 g) a un poids corporel supérieur à celui de la FR1 (2083 g) tandis que les femelles du NO/OU (1481g), du Centre (1362g) et du Sud (1404g) sont plus légères dans leur ensemble. La masse d’œufs entre 32 et 36 semaines d’âge montre un avantage de la FR1 (875g) et de l’écotype du Sud (803g) par rapport aux autres types génétiques avec toutefois des valeurs comparables entre celles du NO/OU (687g) et de la FR (671g), celle du Centre (722g) étant intermédiaire. Tous ces génotypes montrent de faibles valeurs de consommation résiduelle (–4,70g (Sud), 17,32g (Centre), -50,26g (FR), 11,12g (FR1)) par rapport aux besoins d’entretien et de production. L’emploi de 22 marqueurs microsatellites chez 4 populations locales et 3 lignées commerciales a produit un total de 156 allèles pour une moyenne de 7,09 allèles par locus ; les populations locales présentent une bien plus grande richesse allélique que les commerciales. Chez les populations locales, l’hétérozygotie attendue (He) et observée (Ho) varient respectivement de 0,617 à 0,634 et de 0,628 à 0,664. La population du NO/OU semble plus homogène que celles du Centre et du Sud, qui semblent génétiquement plus proches des lignées commerciales. Un programme d’amélioration génétique d’un troupeau pépinière de poules locales est proposé, en combinaison avec un protocole de croisement à court terme avec le poulet label.

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Tremblay, Martin. "L'implantation des aires protégées au Vietnam : quels impacts pour les populations locales?" Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24979/24979.pdf.

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Lompo, Minkiéba Kevin. "Impact de la responsabilité sociétale des compagnies pétrolières sur les populations locales du Delta du Niger." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2013. http://www.theses.fr/2013VERS042S.

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Abstract:

La puissance publique n’est pas la seule concernée par le défi du développement humain dans les pays en développement, les acteurs privés le sont également. La Responsabilité Sociétale des Entreprises (RSE) peut-elle être pour les entreprises extractives un moyen de contribuer au développement local des communautés hôtes ? Mon argumentation, dans cette thèse, utilise comme terrain le Delta du Niger. Dans cette région du Nigeria, les compagnies pétrolières, en particulier Total et Agip, réalisent des projets de développement locaux qu’elles considèrent comme s’inscrivant dans le cadre de leurs responsabilités sociétales. Notre étude permet d’opérer une distinction entre les projets RSE directement menés par les compagnies pétrolières elles-mêmes, et les projets impliquant la gestion par les communautés locales. Dans le premier cas, les projets bénéficient davantage aux individus déjà nantis de capabilités qu’à ceux, les plus pauvres, qui en sont encore privés. A l’inverse, les projets impliquant fortement les communautés locales, ont un impact positif sur les capabilités collectives même si leur impact sur les capabilités individuelles des plus pauvres reste faible
In developing countries, the main challenge is to succeed in human development. Private actors are also concerned by the challenge of human development in developing countries. Could the Corporate Social Responsibility (CSR) be a tool for extractive companies to contribute to local development in host communities? My argumentation is based on the CSR projects that have been implemented in the Niger Delta region of Nigeria, mainly by Total and Agip oil companies. Our work shows that the impact of CSR projects differs according to the strategy of implementation: non-participatory approaches to CSR extend the access to basic capabilities for some privileged socio-economic groups, while participatory approaches positively impact collective capabilities of the whole community, but little effect on the expansion of basic capabilities

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Lauvie, Anne. "Gérer les populations animales locales à petits effectifs : Approche de la diversité des dispositifs mis en oeuvre." Phd thesis, AgroParisTech, 2007. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00003464.

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Abstract:

Depuis la préoccupation de conservation génétique apparue dans les années 1970, les enjeux autour de la gestion des populations animales à petits effectifs en France se sont diversifiés (valorisation etc.). Les dispositifs de gestion de ces populations ont pris des formes multiples, les acteurs s'y impliquant s'étant eux même diversifiés. L'objectif de ce travail est de contribuer à caractériser ces dispositifs, dans leur diversité et dans leurs dynamiques. La démarche adoptée combine une lecture transversale de récits concernant vingt dispositifs de gestion, et une étude approfondie de trois cas, les cas du porc Blanc de l'Ouest, de la brebis Landaise, et de la vache Rouge Flamande, dans lesquels une attention particulière est portée aux controverses qui se développent. Ce travail propose de porter trois regards sur les dispositifs selon trois pôles : la conservation, la valorisation, l'orientation des populations animales. Des éléments clés de chacun de ces pôles sont repérés dans la lecture transversale des vingt récits. L'étude des controverses dans les trois cas fait ressortir des éléments de compréhension des processus de construction des choix techniques et des organisations. Les dynamiques d'interaction entre conservation et valorisation sont en particulier soulignées, ainsi que le rôle central de la définition des races.

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Azinheira, José. "Caractéristiques locales dans des écoulements réactifs, détermination des masses volumiques et populations rotationnelles par des techniques laser." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37595619b.

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Azinheira, José. "Caractéristiques locales dans des écoulements réactifs : détermination des masses volumiques et populations rotationnelles par des techniques laser." Châtenay-Malabry, Ecole centrale de Paris, 1986. http://www.theses.fr/1986ECAP0002.

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Abstract:

L'utilisation d'un laser à diode continument accordable dans l'infrarouge permet de mesurer, par absorption, les populations rotationnelles de la molécule Co dans des jets supersoniques libres. Grace à l'effet doppler créé par l'écoulement ou à l'inversion d’Abel on obtient des mesures locales. La mesure des déviations d'un faisceau laser par effet mirage, associée à l'inversion d’Abel, donne accès au champ d'indice de réfraction. Détermination, dans un jet supersonique libre d'azote, de la forme de la structure de choc et de l'évolution de la masse volumique. Application a une flamme de diffusion à contre-courant

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Ott, Cécile Chantal. "Exploitation forestière et droits des populations locales et autochtones en Afrique centrale (Cameroun, Congo, Congo RDC et Gabon)." Thesis, Lyon 3, 2011. http://www.theses.fr/2011LYO30047.

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Abstract:

Les forêts du Cameroun, du Congo, du Congo RCD et du Gabon regorgent d’énormes ressources. Plusieurs potentialités sont offertes à ces pays par la richesse et la diversité de la faune, la flore, l’exploitation des ressources du sous-sol, du bois et des produits forestiers non ligneux. L’exploitation forestière de ces ressources pourrait être un moyen efficace pour l’amélioration des conditions de vie des populations locales et autochtones qui dépendent de ces forêts. Toutefois, malgré les mécanismes juridiques, politiques et économiques mis en place par les différents gouvernements, la participation des populations à la gestion des forêts reste très relative. La promotion et la protection de leurs droits sociaux et économiques demeurent aussi problématiques
The forests of Cameroon, Congo, CongoRCD and Gabon are full of enormous resources. Several possibilities are available to these countries by the richness and diversity of fauna, flora, exploitation of resources underground resources, wood and non wood forest products. Logging of these resources could be an effective means of improving the living conditions of local and indigenous people who depend on these forests. However, despite the legal, political and economic setup by different governments, people's participation in forest management is very relative. The promotion and protection of their social and economic rights also remain problematic

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Chopelet, Julien. "Variations clonales de la croissance et adaptations locales du métabolisme chez des populations de daphnies originaires d'environnements thermiques différents." Thèse, [Rimouski, Québec] : Université du Québec à Rimouski, 2006.

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Abstract:

Thèse (M.Sc.) - Université du Québec à Rimouski, 2006.
Titre de lʹécran-titre (visionné le 26 avril 2007). Mémoire présenté à l'Université du Québec à Rimouski comme exigence partielle du programme de maîtrise en gestion de la faune et de ses habitats. CaQRU CaQRU Bibliogr.: f. 49-53. Paraît aussi en éd. imprimée. CaQRU

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Touré, Aboubacar. "L'impact des rivalités franco-britanniques dans la Mellacorée sur les populations locales dans la seconde moitié du XIXe siècle." Aix-Marseille 1, 1997. http://www.theses.fr/1997AIX10026.

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Abstract:

Au regime strict de l'exclusif prone par la france, l'angleterre opposa un mercantilisme de type offensif. Le traite de pans, signe le 10 fevrier 1763 pour mettre fin a une guerre franco-anglaise, adjugea a l'angleterre la cote du senegal abritant des etablissements et comptoirs francais. Ce territoire comprenait aussi les rivieres du sud et la mellacoree. De cet ancien domaine colonial, la france ne garda que l'ile de goree. L'expedition d'egypte, sous le directoire, et la rupture de la paix d'amiens, ne purent juguler les effets pervers de la suppression de l'esclavage. Les traites de 1814 et 1815 permirent neanmoins a la france de reprendre ses anciennes possessions du senegal et des rivieres du sud (comprenant la mellacoree). Les chefs politiques de la mellacoree furent alors sollicites pour la conclusion de traites de protectorat que la france et l'angleterre proposaient sans se preoccuper de la presence de l'autre. La guerre de succession du moria donna l'occasion aux deux protagonistes de s'impliquer dans cette guerre de clans qui se transforma en guerre coloniale, ou s'affrontaient partisans et adversaires des anglais ou des francais. Cette longue guerre se termina en 1890. Les rivalites s'estomperent a la faveur de differents arrangements qui reglerent la quartier litigieuse de la delimitation des frontieres. Il s'en suivit une politique de demantelement des anciennes principautes et chefferies, tandis qu'un nouveau corps de chefs infeodes a l'ordre colonial est en promotion
England replies an offensive mercantilism against the strict regime of the exclusive commended by france. Signed on 10 february to put an end to the anglo-french war, the treaty of paris gave the england the senegalese coast, where a few french trading posts and establishments were settled. The territory also entailed the south rivers and the mellacoree. From that former colonial territory, the island of goree was the only thing left for france. The expedition of egypt under the directorate and the breach of the peace of amiens, could not conceal the perverse effects of the abolition of slavery. Nevertheless, the 1814 and 1815's treaties allowed france to get back her former possessions : senegal and the south rivers (including the mellacoree). Then, the political leaders of the mellacoree had been invited to sign treaties of protectorate, that england and france proposed to them without worrying about each other's presence. During the succession war of moria, the protagonists took the opportunity to get involved in the clans' war which turned into a colonial war where french and english proponents and opponents fought against each other. This long war ended in 1890. The rivalties came to an end in favour of different arrangements that solved the litigious issue of the boundaries' demarcation. As a result, a policy to demantle the former principalities followed, whereas a new body of chiefs submitted to the colonial rule was being promoted

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Diop, Omar. "Etat, décentralisation et populations : analyse des capacités développantes des collectivités locales au Sénégal : exemple de la commune de Thiès." Paris 8, 2010. http://octaviana.fr/document/171348818#?c=0&m=0&s=0&cv=0.

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Abstract:

Le Sénégal, à l’instar de beaucoup d’autres pays africains, s’est engagé dans la voie de la décentralisation politique et administrative pour relancer un processus de développement largement à la traîne. Les nouvelles collectivités locales qui ont été instituées peinent à asseoir leur viabilité, et les efforts de coopération avec les différents acteurs du « développement local » (ONG, populations locales, associations…) sont mal articulés. Cette thèse démontre l’erreur de perspective qui a consisté d’abord, pour les dirigeants politiques, à s’inspirer des grandes lignes de la décentralisation mise en œuvre en France, mais également à créer artificiellement des entités (régions, communes, communautés rurales) incapables de susciter des dynamiques populaires. Ce travail réinterroge les concepts de développement, développement local, ou tout autre qualificatif apposé au concept de développement, et postule, à travers des exemples concrets, l’émergence du Quartier comme seul cadre unificateur capable de mettre en branle les dynamiques dont les populations locales sont déjà porteuses pour satisfaire au mieux leurs besoins primordiaux
Senegal, like many other African countries, engaged to the way of political and administrative decentralization to enhance development process. The new local collectivities are in very sluggish conditions, compromising their viability, and efforts of cooperation between NGOs, associations and local populations, are not well articulated. This research demonstrates the leaders’ error of prospect consisting first in imitating France decentralization model, and then, creating artificially entities that are unable to sustain popular dynamics. The research also questions concepts of development, local development or any other qualification applied to the concept of development. It shows, through concrete examples, the emergence of the District as the most effective entity for powering popular dynamics and helping populations meet their basics needs

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Ricroch, Agnès. "Evaluation des ressources genetiques de populations locales d'allium cepa l. Et analyses de la bulbification en conditions naturelles et controlees." Paris 11, 1990. http://www.theses.fr/1990PA112348.

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Abstract:

Une des plus anciennes cultures, l'oignon (allium cepa l. ), s'etant diversifiee tres tot, ses selections adaptees a la photoperiode, a la temperature et aux contraintes culturales se distribuent des latitudes les plus basses aux plus elevees. La bulbification ne se declenche qu'au-dela d'un seuil photoperiodique inherent au cultivar (cv). Dans le cadre de la conservation des ressources genetiques d'une collection de cv d'origines geographiques diverses, leur formation du bulbe (precocite a bulbifier et a murir), leur norme de reaction face a nos pratiques culturales (date de semis, densite de culture) et leurs caracteristiques morphologiques sont observees sous notre latitude (versailles, 49#o9n). Les variabilites inter et intravarietales, par l'etude du polymorphisme enzymatique, sont analysees chez les cv les plus representatifs. Pour ameliorer les conditions culturales, cinq varietes francaises (3 hybrides f#1 et 2 varietes-populations) d'une gamme de precocite etendue (cv de semis d'automne et de printemps) sont etudiees a des dates de semis et a des densites de culture variables. La regulation photoperiodique de la bulbification est particulierement analysee sur une variete cultivee en conditions controlees. Un dispositif factoriel a trois composantes (photoperiode, temps de croissance prealable en jours courts et duree d'exposition aux jours longs inducteurs) est mis en place afin d'etudier l'impact des conditions environnementales et la reponse a la duree de l'induction sur la bulbification

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Ndong, Ngoua Pascal. "La politique de décentralisation au Gabon (1996-2007) : entre conflits de compétences, manœuvres politiques et des populations urbaines non urbanisées : les cas de Libreville et de Médouneu." Paris 8, 2011. http://www.theses.fr/2011PA083989.

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Abstract:

Les collectivités locales sont aujourd’hui présentées comme un gage de meilleure « gouvernance » et de développement économique, social et cultuel. Avec l’appui des bailleurs de fonds internationaux et du renouveau démocratique des années 1990, ces collectivités locales incarnent une approche nouvelle d’organisation des Territoires locaux, bénéficient de crédits nouveaux, et la plupart des gouvernements d’Afrique subsaharienne engagent d’ambitieuses réformes dans ce sens. Ces réformes qui sont à la fois structurelles et fonctionnelles permettent d’aboutir aux politiques dites de décentralisation, c’est-à-dire « le transfert ou la délégation des différents niveaux de pouvoirs, par le gouvernement central, aux différentes institutions étatiques, au plus bas niveau ». Au Gabon, cet élan naît le 6 juin 1996 avec la promulgation de la Loi organique n°15/96 relative à la décentralisation. Ce pas amorcé tente de rompre avec les situations anciennes caractérisées par une forte centralisation des dispositifs gestionnaires. Il crée ainsi les conditions d’un repositionnement des acteurs politiques [ou non] tant à l’échelle locale que nationale, mobilise anciennes et nouvelles notabilités, suscite alliances et compétions, même lorsque les transferts de pouvoir sont encore, dans les faits, nuls. Ainsi, à travers le ton du texte, il s’agit de voir et surtout de comprendre comment les dispositifs de la Loi organique n°15/96 sont appréhendés, parfois manipulés par les différents pouvoirs engagés dans le processus en cours. Aussi, il importe d’identifier les points aporétiques qui empêchent l’application efficiente de la Loi, de déterminer le degré des rapports entre la politique mise en place et les pesanteurs socio- politiques et culturelles, de mesurer le niveau de développement économique, social, ainsi que la participation des populations aux différentes activités de l’espace public. Par ailleurs, la présente réflexion permet d’apprécier l’impact de la célébration rotative des fêtes du 17 août dans chacune des provinces du Gabon depuis leur reprise en 2002, et voir dans quelle mesure une coopération décentralisée pour le développement contribuerait à l’amélioration des structures socioéconomiques des collectivités locales gabonaises, notamment celles de Libreville et de Medouneu
Local communities are now presented as a guarantee for better “governance” and economic, social and cultural development. With the support of international donors and the democratic revival of the 1990s, these local communities embody a new approach to the organization of local territories, benefit from new credits, and most of the governments of sub-Saharan Africa are committed to ambitious reforms in this direction. Both structural and functional in their nature, these reforms have involved so-called decentralisation policies, i. E. “the transfer or the delegation of different levels of power, by the central Government to various State institutions at the lowest level”. In Gabon, this process was started on June 6, 1996, with the promulgation of the organic law n° 15/96 relative to decentralisation. This step towards reform attempts to break with a strong tendency towards the centralisation of management devices. It thus creates the conditions for a repositioning of political actors [or not], both on the local and national levels, mobilising old and new opinion leaders, creating alliances and competitions, even when the transfers of power, in fact, amount to zero. An analysis of the text seeks to understand how the devices of the organic law n° 15/96 are apprehended, and sometimes manipulated by the various authorities involved in the ongoing process. Also, it is important to identify important points of contradiction which prevent the efficient application of the Law and to analyse the relationship between policy development and socio-political and cultural factors. Moreover, grasping the impact of the reform requires us measure the level of social and economic development it stimulated and to grasp how people participate in public spaces. Reflection on local government reform also involves an assessment of the impact of the Gabonese National Commemoration celebrations on August 17, which, since their resumption in 2002, are every year held in a different province of the country. Finally, the discussion of decentralization in Gabon leads us to ask, to what extent decentralised development cooperation could contribute to the improvement of the socio-economic structures of local Gabonese municipalities, in particular those of Libreville and Medouneu

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Gnamien, Yao. "L'Industrie minière face aux évolutions sociétales : quels impacts des attentes des populations et des collectivités locales sur le développement des projets miniers ?" Thesis, Paris, ENMP, 2014. http://www.theses.fr/2014ENMP0086/document.

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Abstract:

Depuis le début des années 1990, quasiment partout dans le monde, les communautés riveraines des projets miniers s'opposent au déroulement des travaux d'exploitation. Ce phénomène s'observe aussi bien dans les pays développés que dans les pays non développés. Il se vit également dans les pays démocratiques comme dans les pays non démocratiques.Afin de justifier la détermination à proposer des solutions à ce problème, la première partie de ce travail démontre que l'industrie minière est le catalyseur et le socle de la croissance économique moderne et que par conséquent, toute perturbation de la sécurité des approvisionnements en produits miniers mérite une mobilisation de la communauté internationale.Dans la deuxième partie, la conclusion montre que ces actions de défiance sont loin d'être des revendications à caractère idéologique. Elles sont tout simplement l'expression d'une requête contemporaine qui consiste à intégrer dans les décisions de mise en valeur des ressources minières les principes sur lesquels repose la mondialisation à savoir : le respect du droit au développement collectif et individuel, le respect des droits humains dont le droit à l'environnement et la participation des communautés ou des individus à la prise de toute décision pouvant avoir des conséquences sur leur existence.Dans une troisième partie, il est démontré que le Continent africain est devenu le nouveau pôle de développement minier depuis la fin de la guerre froide. Dans ces conditions, l'étude de la question des Mobilisations communautaires contre l'exploitation minière dans quatre pays d'Afrique aux traditions minières établies comme la Guinée et le Maroc et en voie d'émergence minière comme le Mali et la Côte d'Ivoire, permet de comprendre que les Mobilisations Contre les projets miniers sont bel et bien une réalité en Afrique.Les tentatives de solutions apportées et les institutions conçues pour leur mise en œuvre dans ce nouvel eldorado sont loin de mettre durablement la plupart des projets miniers qui y sont entrepris à l'abri des colères des manifestants. Toute chose qui expose l'économie mondiale à d'éventuels chocs qui seraient préjudiciables à la paix et à la sécurité internationale.Dans ces conditions et en guise de conclusion, il faut souhaiter dans un premier temps, que la communauté internationale se saisisse de la question pour organiser un sommet mondial sur l'avenir de l'industrie minière au XXIe siècle, et que soit créé un Fonds Mondial au service du Développement des Communautés Affectées par les Projets Miniers (FMDCAPM).Dans un deuxième temps, il faut envisager à l'échelle des États producteurs, que les politiques minières nationales soient le reflet d'un véritable consensus entre les États, les entreprises minières et les collectivités locales en insistant sur la nécessité de doter ces dernières de Fonds d'Investissement alimenté par chaque projet.Finalement, et toujours à l'échelle des États, il est à souhaiter que la recherche de solutions à apporter aux préoccupations tant sociales qu'économiques des zones affectées par les projets miniers soit confiée à une Autorité Nationale Autonome (ANA) qui saura négocier indépendamment des services gouvernementaux au mieux des intérêts des collectivités et populations locales
Since the beginning of the 1990s, almost throughout the world, bordering communities of mining projects oppose the proceedings of mining exploitation works. This phenomenon occurs in developed countries as well as in developing countries. It is also present both in democratic and in non democratic countries.To justify the determination to offer solutions to this problem, the first part of this work proves that the mining industry is the catalyst and the base of the modern economic growth and that, consequently, any disturbance in the safety of mining product supplying deserves a mobilization of the international community.In the second part, the conclusion shows that these mistrust actions are far from being ideological claims. They are simply the expression of a contemporary request which consists in integrating into mining resource development decisions the principles globalization is based on : the respect for the right to collective and individual development, the respect for human rights, including the right to the environment and the participation of communities or individuals in any decision-making that may affect their lives.In the third part, it is proved that the African continent has turned to be the new mining development pole since the end of the cold war. In these conditions, the study of the issue of the community mobilizations against mining exploitation, in four African countries with strong mining traditions such as Guinea and Morocco and in the process of mining development such as Mali and Ivory Coast, allows us to understand that mobilizations against mining projects do really exist in Africa.In these conditions and as a conclusion, it is first of all necessary to wish that the international community be concerned by this issue to organize a world summit on the future of the mining industry in the 20th century, and that a World Fund in the service of the Development of Communities Concerned by Mining Projects (FMDCAPM) be created.Secondly, one must consider, at the scale of the producing States, that the national mining policies be the reflection of a real consensus between the States, the mining companies and the local authorities by insisting on the necessity of giving the latter ones Investment funds fed by each project.Finally, and always at the scale of States, it is to wish that the search for solutions to be brought to both social and economic concerns of the zones affected by the mining projects be entrusted to an Autonomous National Authority (ANA) which will know how to negotiate at best, independently from governmental authorities, the interests of communities and local populations

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Gil, Marie-Ève. "Analyse d'équations intégro-différentielles et d'EDP non locales issues de la modélisation de dynamiques adaptatives." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0346.

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Abstract:

Ce manuscrit de thèse porte sur l’analyse mathématique de modèles intégro-diﬀérentiels issus de la génétique des populations. Les deux modèles étudiés sont des équations de réaction-dispersion de type ∂tp(t,m) = UD[p](t,m) + f[p](t,m). Ils décrivent la dynamique de la distribution de la ﬁtness (ou valeur sélective) dans une population asexuée sous l’eﬀet des mutations et de la sélection représentées respectivement par les termes non locaux UD[p](t,m) et par f[p](t,m). La diﬀérence entre les deux modèles se situe au niveau du terme de mutation. En eﬀet, dans le premier modèle, les eﬀets des mutations sur la ﬁtness ne dépendent pas de la ﬁtness du parent, cela se traduit donc par un terme de convolution classique : D[p](t,m) =RR J(m−y)p(t,y)dy−p(t,m). Lorsqu’une mutation a lieu, la fonction J(m−y) représente la densité de probabilité pour un individu de ﬁtness y d’avoir un descendant de ﬁtness m. Le taux de mutation est donné par la constante U. Dans le second modèle, les eﬀets des mutations sur la ﬁtness dépendent aussi de la ﬁtness du parent. Dans ce cas, un individu de ﬁtness y a un descendant de ﬁtness m avec la densité de probabilité Jy(m−y). Ce type de dépendance apparaît naturellement lorsque l’on suppose qu’il existe une ﬁtness optimale (ou encore un optimum phénotypique). Pour chacun des deux modèles, nous établissons dans un premier temps des résultats d’existence et d’unicité ainsi que des propriétés de décroissance de la solution. Cette décroissance permet de déﬁnir la fonction génératrice des cumulants (CGF) associée à la distribution de ﬁtness. La CGF est la solution d’une équation de transport non locale. Pour le premier modèle, l’étude de cette équation permet d’obtenir une solution analytique et donc d’obtenir une description complète de la distribution p(t,m) via ses moments. Nous étudions ensuite les états stationnaires pour chacun des deux modèles, et établissons des conditions suﬃsantes pour l’existence et la non-existence de phénomènes de concentration, correspondant à une accumulation d’individus de phénotypes optimaux. Nos résultats sont comparés à des sorties de modèles stochastiques individu-centrés représentant le même type de dynamiques évolutives
This manuscript is devoted to the mathematical analysis of integro-diﬀerential models from population genetics. Both models are reaction-dispersion equations of the form ∂tp(t,m) = UD[p](t,m)+ f[p](t,m). They describe the dynamics of ﬁtness distribution in an asexual population under the eﬀect of mutation and selection. These two processes are represented by the nonlocal terms UD[p](t,m) and by f[p](t,m) respectively. The diﬀerence between the models rests on the mutation term. Indeed, in the ﬁrst model, the mutation eﬀects on ﬁtness do not depend on the ﬁtness of the parent. Thus, the mutation term is a standard convolution product: D[p](t,m) =RR J(m−y)p(t,y)dy −p(t,m). When a mutation occurs, the function J(m − y) represents the density of probability for an individual with ﬁtness y to have an oﬀspring with ﬁtness m. The mutation rate is given by the constant U. In the second model, the mutation eﬀects on ﬁtness depend on the ﬁtness of the parent. In this case, an individual with ﬁtness y has an oﬀspring with ﬁtness m with a probability density Jy(m−y). This type of dependence naturally arises when the existence of an optimal ﬁtness (or a phenotypic optimum) is assumed. For both models, we ﬁrst establish existence and uniqueness results as well as decay properties of the solution. The decay property allows us to deﬁne the cumulant generating function (CGF). The CGF obeys a nonlocal transport equation. In the ﬁrst model, we compute the analytical solution of this transport equation and thus, we obtain a complete description of the distribution p(t,m) through its moments. Then, we study the stationary states for both models, and establish suﬃcient conditions for the existence and non-existence of a concentration phenomenon corresponding to an accumulation of individuals with best possible phenotype. The results are compared to the results of stochastic individual based models which represent the same kind of evolutionary dynamics

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Grandcolas, Delphine. "Pêcheurs, Etat et mondialisation : stratégies des populations locales et gestion des ressources naturelles : le cas du delta de la Godavari, Inde du sud." Paris 10, 2006. http://www.theses.fr/2006PA100026.

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Abstract:

La mangrove du delta de la Godavari et les villages de pêcheurs environnants ont connu de profonds bouleversements depuis 40 ans. L'État indien a d'abord introduit la pêche mécanisée en 1965, puis la crevetticulture en 1985, afin de dynamiser le secteur des produits de la mer et d'améliorer le niveau de vie des populations littorales. La crise de la pêche et l'inaccessibilité de la crevetticulture ont plongé les pêcheurs dans une situation d'autant plus critique que dans le même temps, l'État indien a classé la mangrove de la Godavari en Sanctuaire de la vie sauvage. Face à la privation de droits d'usage et d'exploitation de ressources naturelles indispensables, les gestions villageoises des ressources, fondées sur une exploitation pérenne et collective, disparaissent, remplacées par une exploitation libérale et indivuelle des ressources de la mangrove. Le passage d'une gestion locale à une gestion étatique, entre intérêts privés et protection écologique, menace l'existence de la mangrove en entraîne une paupérisation des pêcheurs
The region of the Godavari delta's mangrove and fishermen villages surrounding experimented great changes since 40 years. Indian government first introduced mechanised fishing in 1965 and then prawn culture in 1985, in order to dynamise fisheries sector and to improve the level of life of coastal population. But the fishery crisis and the impossibility for fishermen to access to prawn culture have caused a degradation of the fishers economic situation. In the same time, the indian state classified the Godavari mangrove into a Wildlife Sanctuary. Traditional management of natural resources, based on a perennial and collective exploitation, have disappeared and gave place to a liberal and individual exploitation of mangrove resources, threatening the existence of the mangrove and leading to the pauperization of fishermen

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Rejo-Fienena, Félicitée, and Yves Monnier. "Etude phytosociologique de la végétation de la région de Tulear (Madagascar) et gestion des ressources végétales par les populations locales (cas du P. K. 32)." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 1995. http://www.theses.fr/1995MNHN0027.

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Abstract:

Le sujet consiste en l'étude phytosociologique et ethnobotanique du P. K. 32, région située au nord de Tulear, sud-ouest de Madagascar, une végétation actuellement menacée par la pression humaine importante qui affecte ce lieu. Il s'agit dans un premier temps de faire l'inventaire floristique des groupements existants et dans un deuxième temps d'étudier les utilisations des ressources végétales par les populations locales afin d'analyser l'organisation des modes d'exploitation de la région. L'objectif a donc un double but: - d'une part maintenir la biodiversité du P. K. 32 et du sud malgache, en général. - d'autre part une utilisation rationnelle des ressources végétales par les populations, dans le cadre d'une éventuelle mise en réserve du P. K. 32. Le P. K. 32 est le dernier témoin du fourre de la région. C'est une zone qui ne fait l'objet d'aucune gestion, alors qu'elle abrite une forte proportion d'espèces endémiques constituant ainsi une réserve floristique et génétique pour la région. Pour les populations environnantes, elle est un lieu d'extraction de nombreux bois d'uvre, de bois de service et de récolte de divers produits couvrant tous les besoins quotidiens. Mais c'est surtout le site privilégié de la production de charbon de bois et de bois de chauffe destinée a la consommation de la ville de Tulear. Cette activité est très destructrice pour le P. K. 32et elle est pratiquée par une catégorie de population migrante en voie d'installation, une population provenant d'une région désertique située, au sud de Tulear. Beaucoup de problèmes socio-économiques et fonciers existent dans le P. K. 32, son cas est alarmant et nécessité une attention particulière

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Genay, Lucie. "La conquête scientifique du Nouveau-Mexique : héritage local du Projet Manhattan 1942-2015." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAL017/document.

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Abstract:

Le 16 novembre 1942, dans le désert du Nouveau-Mexique, J. Robert Oppenheimer suggéra à son homologue militaire, le Général Leslie Groves, que la Los Alamos Ranch School d'Ashley Pond serait une localisation idéale pour l'établissement d'un laboratoire secret où continuer la recherche sur la conception et la construction de la bombe atomique. Cet événement scella le destin du Nouveau-Mexique, surnommé la « terre d'enchantement », qui se vit alors octroyé une nouvelle identité en tant que berceau de l'ère nucléaire. Le laboratoire de Los Alamos a déclenché la troisième colonisation de la région : une conquête scientifique financée par le gouvernement fédéral et entretenue par la course à l'armement avec l'Union Soviétique. Le long du Rio Grande, les installations nées à la suite du Projet Manhattan ont révolutionné l'ordre social, économique et démographique établi dans l'État tout en y produisant des bouleversements environnementaux et culturels. Et pourtant, soixante–dix ans plus tard, le Nouveau-Mexique demeurait l'un des cinq États les plus pauvres du pays malgré son Eldorado nucléaire. Cette thèse évalue l'ambivalence et les multiples facettes de l'héritage du Projet Manhattan au Nouveau-Mexique. En estimant la durabilité et la répartition des profits générés par l'industrie nucléaire en termes d'emplois, d'éducation et de niveau de vie, cette thèse interroge l'étendue réelle des gains perçus par les populations locales grâce à cette révolution vers le nucléaire et la haute technologie, ainsi que l'évolution des coûts socio-économiques et environnementaux qu'il a fallu et qu'il faudra encore payer pour la panacée nucléaire. Depuis l'arrivée des premiers pionniers atomiques à Los Alamos, les populations natives du Nouveau-Mexique (qu'il s'agisse des Indiens pueblos, des villageois hispaniques ou des ranchers anglos) ont dû s'adapter aux changements en dents de scie d'un nouvel ordre reposant sur des fonds fédéraux, eux–mêmes déterminés par la scène politique internationale et ils furent confrontés à une concurrence de plus en plus rude avec les nouveaux arrivants, c'est-à-dire les immigrés du nucléaire venant d'autres États. L'association du pouvoir militaire, du gouvernement et de l'omniprésente confidentialité a renforcé les mécanismes du complexe militaro-industriel et scientifique local, ce qui a maintenu la région dans son statut de colonie interne des États-Unis. Depuis les années 1980, une prise de conscience progressive de la société concernant les conséquences environnementales et sanitaires de la radioactivité a entraîné des réactions antinucléaires au Nouveau-Mexique. Dès lors, de nombreuses voix précédemment restées dans le silence se sont levées pour mettre en évidence une autre vision de l'héritage nucléaire dans l'État. Cette perspective locale des participants les plus modestes, les oubliés de l'avènement de l'ère nucléaire, manque de reconnaissance historique. Par conséquent, l'objectif de cette thèse est d'examiner la relation entre ces Nouveaux-Mexicains et l'industrie nucléaire locale
On November 16, 1942, in the New Mexican desert, J. Robert Oppenheimer suggested to his military counterpart, General Leslie Groves, that Ashley Pond's Los Alamos Ranch School would be an ideal location for the establishment of a secret laboratory to pursue research on the design and construction of the atomic bomb. This event sealed the fate of New Mexico, dubbed the “Land of Enchantment,” which acquired a new identity as the cradle of the nuclear age. The Los Alamos Laboratory paved the way to a third colonization of the area; a scientific conquest funded by the Federal Government and maintained by the arms race with the Soviet Union. Along the Rio Grande, the derivative installations of the Manhattan Project revolutionized the social, economic, and demographic order in the state while introducing environmental and cultural disruptions. And yet, seventy years later, New Mexico was still among the five poorest states in the nation despite its nuclear Eldorado. This thesis assesses the double-edged quality and the multiple facets of the Manhattan Project's legacy in New Mexico. By evaluating the durability and distribution of the benefits entailed by the nuclear industry in terms of jobs, education, and standards of living, this dissertation focuses on the question of the extent to which local populations actually gained from this high-technology revolution, and of the environmental, socio-economic price, which has been and will have to be paid for the nuclear bonanza. Since the settlement of the first atomic pioneers in Los Alamos, the native populations of New Mexico—be they Indian Pueblo dwellers, Hispanic villagers, or Anglo ranchers—have had to adapt to the ups and downs of the new order based on a dependence on federal funds that were, in turn, determined by global politics, and to face an increasingly harsh competition with outsiders, i.e. nuclear immigrants to the state. A combination of military and government power with secrecy built up the mechanism of a local military-industrial and scientific complex, which maintained the region's status as an internal colony of the United States. Since the 1980s, growing public awareness of environmental and health consequences of radioactivity have prompted antinuclear reactions in New Mexico. Thereupon, many previously unheard voices have spoken up to shed a new light on the nuclear heritage in the state. This local perspective of the humblest, forgotten participants in the advent of the nuclear age lacks historical recognition; therefore, the purpose of this dissertation is to address the relations between New Mexicans and the local nuclear industry

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Worliczek, Elisabeth. "La vision de l’espace littoral sur l’île Wallis et l’atoll Rangiroa dans le contexte du changement climatique : Une analyse anthropologique de la perception des populations locales." Thesis, Nouvelle Calédonie, 2013. http://www.theses.fr/2013NCAL0049/document.

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Abstract:

Ce travail de thèse analyse la perception locale des changements de l’environnement, et plus précisément, celle du changement climatique. Les deux terrains étudiés sont l’île de Wallis (Wallis et Futuna) et l’atoll de Rangiroa (Polynésie Française), qui se distinguent par leur géomorphologie et leur organisation sociale, bien que faisant partie, toutes deux, de l’ensemble francophone du Pacifique sud et de la région culturelle polynésienne. Il s’agit de comprendre la vision de la population locale sur les changements en cours et à venir. Le travail réalisé s’appuie sur l’analyse de quatre indicateurs, réalisée sur la base des méthodes de l’anthropologie. L’indicateur « espace » informe sur la perception de l’espace, l’habitat, le foncier et la migration. Celui consacré aux « ressources » révèle des dynamiques importantes dans le contexte des prélèvements de sable, de l’érosion du littoral et de la construction des murs de protection. L’indicateur « catastrophes », qui traite des cyclones et des tsunamis, aide à cerner la perception des dangers potentiels liés aux risques naturels. Le dernier indicateur, « faits sociaux », décrit la conception du « changement climatique » et de son discours scientifique, le rôle des médias et des politiques, les observations réalisées et leur interprétation locale, qui est fortement liée à des diverses représentations du sujet. Enfin, des scénarios d’avenir dans le contexte de la montée des eaux sont évoqués.Les analyses présentées sont nées d’un questionnement posé par les spécialistes du génie civil côtier soucieux, d’une part, d’avoir une meilleure connaissance de la perception de l’espace littoral par les populations locales, et d’autre part, d’obtenir les clefs de compréhension utiles à l’acceptation de leurs actions. Dans un contexte océanien où la gestion intégrée de l’espace littoral est complexe et différente de celle du monde occidental, les finalités sous tendues par l’analyse anthropologique étaient la prévention contre les dysfonctionnements actuellement observés et la préservation améliorée d’un espace vital pour les populations insulaires
The focus of this thesis is environmental change or, more precisely, climate change. The two study areas are Wallis Island (Wallis and Futuna) and the Rangiroa Atoll (French Polynesia). They have a different geomorphology and social organisationeven though both of them are part of the francophone islands in the Pacific and the cultural region of Polynesia.The study aims to gain an understanding of the local view of current change and future changes expected by scientists. This work is based on four indicators and was developed with the methods of anthropology. The indicator ‘space’ reveals a great deal about the real perception of space on these islands, about residence, land tenure and migration. The indicator ‘resources’ was used to analyse the dynamics of beach sand mining, beach erosion and the construction of protective sea walls. The indicator ‘disasters’ covers cyclones and tsunamis and the perception of potential dangers linked to natural hazards. The last indicator, ‘social conditions’, describes the local understanding of climate change and its scientific discourse, the role of media and politics. The thesis also analyses the locals’ observations of the environment and theirinterpretation, which is strongly linked to the different representations of the subject. It ends with a description of scenarios of a future sea level rise. Work on the thesis started from issues raised by specialists of coastal development planning. They needed a deeper understanding of the local population’s perception of the coastal area and they were looking for indications of what would make the locals accept the proposals of the planners. In the context of Oceania, the integratedmanagement of the coast is complex and very different from the Western world. The aim of this anthropological analysis was to improve communication between the affected parties and to avoid further destruction of this sensitive environment which is crucial to the islands’ populations
Diese Dissertation analysiert die Wahrnehmung von lokalem Wandel, und im Speziellen des Klimawandels. Die beiden untersuchten Felder sind die Insel Wallis (Wallis und Futuna) und das Atoll Rangiroa (Französisch Polynesien). Dieseunterscheiden sich hinsichtlich ihrer Geomorphologie und ihrer Sozialorganisation, jedoch sind sie beide Teil der französischen Überseegebiete im Südpazifik und der Kulturregion Polynesien.Ziel dieser Arbeit ist es, die Sichtweise der lokalen Bevölkerung betreffend aktueller und zukünftiger Veränderungen zu verstehen. Die Analyse, basierend auf den Methoden der Anthropologie, definiert vier Indikatoren: Der Indikator „Raum“ steht für die örtliche Raumwahrnehmung, den Residenzmodus, Landverwaltung und Migration.Der Indikator „Ressourcen“ identifiziert wichtige Dynamiken im Zusammenhang mit dem Sandabbau an den Küsten, der Stranderosion und der Errichtung von Ufermauern. Der Indikator „Katastrophen“ behandelt Zyklone und Tsunamis, welche Hinweise geben können auf die lokale Wahrnehmung von potentiellen Gefahren auf Grund von Naturkatastrophen. Der letzte Indikator, „soziale Gegebenheiten“, beschreibt die lokale Auffassung des Konzepts „Klimawandel“ und dessen wissenschaftlichen Diskurs, die Rolle der Medien und der Politik, sowie lokale Umweltbeobachtungen und derenInterpretation. Außerdem werden Zukunftsszenarien im Zusammenhang mit einem ansteigenden Meeresspiegel gezeichnet.Am Beginn dieser Arbeit standen Fragestellungen von Spezialisten der Küstenraumplanung, die einerseits ein besseres Verständnis der lokalen Konzeptionen des Küstenraumes wünschten, und andererseits Mittel und Wege suchten, um die lokale Akzeptanz ihrer Ideen und Aktionen betreffend der Raumplanung zu erhöhen. Im Kontext Ozeaniens ist die Verwaltung des Küstenraumes sehr komplex und unterschiedlich verglichen mit westlichen Verwaltungskonzepten. Das Ziel dieser Analysen war also eine verbesserte Kommunikation aller Beteiligten, um weitere Zerstörungen dieses Lebensraumes, welcher lebenswichtig für die betroffenen Bevölkerungen ist, zu verhindern

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Figueroa, Iglesias Susely. "Integro-differential models for evolutionary dynamics of populations in time-heterogeneous environments." Thesis, Toulouse 3, 2019. http://www.theses.fr/2019TOU30098.

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Abstract:

Cette thèse porte sur l'étude qualitative de plusieurs équations paraboliques de type Lotka-Volterra issues de la biologie évolutive et de l'écologie, équations qui prennent en compte un taux de croissance périodique en temps et un phénomène de compétition non locale. Dans une première partie nous étudions d'abord la dynamique des populations phénotypiquement structurées sous l'effet des mutations et de la sélection dans des environnements qui varient périodiquement en temps, puis nous étudions l'impact d'un changement climatique sur ces populations, en considérant que les conditions environnementales varient selon une tendance linéaire, mais de manière oscillatoire. Dans les deux problèmes nous commençons par étudier le comportement en temps long des solutions. Ensuite nous utilisons une approche basée sur les équations de Hamilton-Jacobi pour l'étude asymptotique de ces solutions en temps long lorsque l'effet des mutations est petit. Nous prouvons que lorsque l'effet des mutations disparaît, la densité phénotypique de la population se concentre sur un seul trait (qui varie linéairement avec le temps dans le deuxième modèle), tandis que la taille de la population oscille périodiquement. Pour le modèle de changement climatique nous fournissons également un développement asymptotique de la taille moyenne de la population et de la vitesse critique menant à l'extinction de la population, ce qui est lié à la dérivation d'un développement asymptotique de la valeur propre de Floquet en fonction du taux de diffusion. Dans la deuxième partie, nous étudions quelques exemples particuliers de taux de croissance en donnant des solutions explicites et semi-explicites au problème, et nous présentons quelques illustrations numériques pour le modèle périodique. De plus, étant motivés par une expérience biologique, nous comparons deux populations évoluant dans des environnements différents (constants ou périodiques). En outre, nous présentons une comparaison numérique entre les modèles stochastiques et déterministes pour le phénomène de transfert horizontal des gènes. Dans un contexte Hamilton-Jacobi, nous parvenons à reproduire numériquement le sauvetage évolutif d'une petite population que nous observons dans le modèle stochastique
This thesis focuses on the qualitative study of several parabolic equations of the Lotka-Volterra type from evolutionary biology and ecology taking into account a time-periodic growth rate and a non-local competition term. In the initial part we first study the dynamics of phenotypically structured populations under the effect of mutations and selection in environments that vary periodically in time and then the impact of a climate change on such population considering environmental conditions which vary according to a linear trend, but in an oscillatory manner. In both problems we first study the long-time behaviour of the solutions. Then we use an approach based on Hamilton-Jacobi equations to study these long-time solutions asymptotically when the effect of mutations is small. We prove that when the effect of mutations vanishes, the phenotypic density of the population is concentrated on a single trait (which varies linearly over time in the second model), while the population size oscillates periodically. For the climate change model we also provide an asymptotic expansion of the mean population size and of the critical speed leading to the extinction of the population, which is closely related to the derivation of an asymptotic expansion of the Floquet eigenvalue in terms of the diffusion rate. In the second part we study some particular examples of growth rates by providing explicit and semi-explicit solutions to the problem and present some numerical illustrations for the periodic model. In addition, being motivated by a biological experiment, we compare two populations evolved in different environments (constant or periodic). In addition, we present a numerical comparison between stochastic and deterministic models modelling the horizontal gene transfer phenomenon. In a Hamilton-Jacobi context, we are able to numerically reproduce the evolutionary rescue of a small population that we observe in the stochastic model

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Taing, Cécile. "Dynamique de concentration dans des équations aux dérivées partielles non locales issues de la biologie." Thesis, Sorbonne université, 2018. http://www.theses.fr/2018SORUS077.

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Abstract:

Cette thèse porte sur l'étude des dynamiques de masses de Dirac dans des équations aux dérivées partielles et intégro-différentielles issues de la biologie évolutive. Nous nous intéressons à des modèles de populations structurées en trait phénotypique en tenant compte des phénomènes d'adaptation et de mutations, afin de montrer la sélection d'individus les plus adaptés dans un environnement donné. La description de ces problèmes biologiques conduit à l'étude d'équations non linéaires et non locales, avec la présence d'un petit paramètre qui induit deux échelles de temps. Les solutions asymptotiques de ces équations sont des distributions de populations dans l'espace des traits et se concentrent en masses de Dirac en les traits dominants. Dans une première partie, nous nous intéressons à la dynamique des masses de Dirac dans un modèle de chémostat en utilisant une formulation Hamilton-Jacobi. Le modèle de chémostat est constitué d'un système d'équations décrivant la dynamique consommateurs-nutriment dans un système fermé. Dans une deuxième partie, nous étudions un modèle de compétition structuré en âge et en trait. Grâce à une factorisation adaptée, nous obtenons la limite asymptotique de la solution comme le produit d'un profil en âge et d'un profil en trait. Lorsque les mutations sont introduites, une équation d'Hamilton-Jacobi apparaît et nous démontrons un résultat d’unicité associé dans le cadre des solutions de viscosité. La dernière partie s'intéresse aux populations sexuées. Nous étudions une famille de modèles de populations sexuées présentant une asymétrie dans l'hérédité ou la fécondité : chaque individu hérite principalement des traits de la mère
This thesis focuses on the dynamics of Dirac mass concentrations in non-local partial differential and integro-differential equations motivated by evolutionary biology. We consider population models structured in phenotypical traits and, taking into account adaptation and mutation phenomena, we aim to describe the selection of the fittest traits in a given environment. The mathematical modeling of these biological problems leads to nonlinear and nonlocal equations, with a small parameter that induces two time-scales. The asymptotic solutions to these equations are population distributions on the traits space and concentrate in Dirac masses located on the dominant traits. In the first part, we study the Dirac mass dynamics in a chemostat model, using a Hamilton-Jacobi formulation. The chemostat model is a system of equations describing the dynamics of consumers and nutrients in a bioreactor. In a second part, we investigate a competition model structured in age and phenotypical traits. By means of an appropriate factorization, we obtain the asymptotic limit of the solution as a decomposition into two profiles, one in age, the other in traits. When mutations are introduced, a Hamilton-Jacobi equation arises and we prove a uniqueness result of the solution to this equation in the framework of viscosity solutions. The last part is devoted to sexual population models. These models under investigation include asymmetric trait heredity or asymmetric trait-dependent fecundity between the parents: each individual inherits mostly its traits from the female

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Shang, Peipei. "Analyse mathématique et contrôle optimal de lois de conservation multi-échelles : application à des populations cellulaires structurées." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00847756.

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Dans cette thèse, on a surtout étudié le caractère bien posé pour des équations aux dérivées partielles et des problèmes de contrôle optimal. On a étudié les problèmes de Cauchy associés à des lois de conservation hyperboliques avec des vitesses non locales, pour un modèle 1D (système de fabrication industrielle), puis 2D (processus de sélection folliculaire). Dans les deux cas, on montre l'existence et l'unicité de solutions des problèmes de Cauchy, en utilisant le théorème du point fixe de Banach. On a étudié par la suite des problèmes de contrôle optimal, d'abord sur le modèle 2D, puis sur un modèle basé sur des équations differentielles ordinaires (amplification de protéines mal repliées). Dans le premier modèle, on montre que les contrôles optimaux sont bang-bang avec un seul instant de commutation. Dans le second modèle, les contrôles optimaux sont relaxés, nous déterminons leur positionnement dans l'espace des contrôles admissibles.

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Martins, Helena. "Méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans les populations continues et mélangées." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018GREAS022/document.

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Abstract:

La recherche des signatures génétiques de l'adaptation locale est d'un grand intérêt pour de nombreuses études de génétique des populations. Les approches pour trier les loci sélectifs à partir de leur contexte génomique, se concentrent sur les valeurs extrêmes de l'indice de fixation, FST, à travers les loci. Cependant, le calcul de l'indice de fixation devient difficile lorsque la population est génétiquement continue, lorsque la prédéfinition des sous-populations est une tâche difficile et en présence d'individus mélangés dans l'échantillon. Dans cette thèse, nous présentons une nouvelle méthode pour identifier les loci sous sélection basée sur une extension de la statistique FST à des échantillons avec des individus mélangés. Considérant notre objectif d'explorer des méthodes statistiques pour identifier l'adaptation locale dans la population mélangée, nous avons inclus des données spatiales pour calculer les coefficients d'ascendance et les fréquences d'allèles. Pour enrichir notre travail, nous avons investigué les effets du déséquilibre de liaison et des méthodes d'élagage de LD dans les analyses de génomes pour la sélection
Finding genetic signatures of local adaptation is of great interest for many population genetic studies. Common approaches to sorting selective loci from their genomic background focus on the extreme values of the fixation index, FST, across loci. However, the computation of the fixation index becomes challenging when the population is genetically continuous, when predefining subpopulations is a difficult task, and in the presence of admixed individuals in the sample. In this thesis, we present a new method to identify loci under selection based on an extension of the FST statistic to samples with admixed individuals. Considering our goal of exploring statistical methods to identify local adaptation in admixed population, we included spatial data to compute ancestry coefficients and allele frequencies. To enrich our work, we investigated the effects of linkage disequilibrium and LD-pruning methods in genome scans for selection

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Nguyen, Thi Nhu Thao. "Modélisation mathématique et simulation de la dynamique spatiale de populations de campagnols dans l’est de la France." Thesis, Bourgogne Franche-Comté, 2020. http://www.theses.fr/2020UBFCD031.

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Abstract:

L'objectif principal de la thèse est de proposer et d'analyser des modèles mathématiques basés sur des équations aux dérivées partielles (EDP) afin de décrire la dynamique spatiale de deux espèces de campagnols (Microtus arvalis et Arvicola terrestris), qui sont particulièrement surveillés dans l'est de la France. Les modèles que nous avons proposés reposent sur des EDP qui décrivent l'évolution de la densité de la population de campagnols en fonction du temps, de l'âge et de la position dans l'espace. Nous avons suivi deux approches complémentaires pour représenter la dynamique. Dans la première approche, nous avons proposé un premier modèle qui consiste en une EDP scalaire en structurée en temps, en âge, et en espace. Elle est complétée par une condition au bord non locale. Le flux est linéaire à coefficient constant dans la direction de l'âge mais contient un terme non local dans les directions de l'espace. De plus, l'équation contient un terme de second ordre par rapport aux variables spatiales. Nous avons démontré l'existence et la stabilité de solutions faibles entropiques pour le modèle en utilisant, la compacité par compensation établie par Panov et un argument du type doublement de variables. Dans la deuxième approche, nous nous sommes inspirés du modèle Multi Agents introduit par Marilleau-Lang-Giraudoux, où la dynamique spatiale des juvéniles est découplée de l'évolution locale dans chaque parcelle. Pour mettre en place ce deuxième modèle, nous avons introduit un graphe orienté dont les nœuds sont les parcelles (ou colonies). Dans chaque nœud, l'évolution de la colonie est décrite par une équation de transport structurée en temps et en âge, et les mouvements de dispersion dans l'espace sont représentés par les passages d'un nœud à un autre. Nous avons proposé une discrétisation du modèle, par des schéma volumes finis, et, grâce à des simulations numériques, nous avons pu illustrer le fait que le modèle est capable de reproduire certaines caractéristiques qualitatives de la dynamique spatiale observée dans la nature. Nous avons ensuite proposé un troisième modèle qui est un système proie-prédateur constitué d'une équation hyperbolique pour les prédateurs et d'une équation parabolique-hyperbolique pour les proies analogue à celle proposée dans le premier modèle. Le terme de force dans l'équation des prédateurs dépend de manière non localement de la densité des proies et les deux équations sont également couplées via des termes sources classiques de type Lotka-Volterra. Nous avons établi l'existence de solutions en appliquant la méthode de la viscosité évanescente, et nous avons établi un résultat de stabilité par un argument de type doublement de variables. Enfin nous avons proposé et validé un schéma de type volumes finis pour le premier modèle.La dernière partie de mes travaux de recherche est dédiée à un projet auquel j'ai participé lors d'une école d'été CEMRACS. Il concerne un sujet de biomathématiques différent du thème principal de la thèse et porte sur un modèle épidémiologique pour la salmonellose. Nous avons proposé un nouveau cadre de modélisation générique multi-échelles de la transmission hétérogène d'agents pathogènes dans une population animale. Au niveau intra-hôte, le modèle décrit l'interaction entre le microbiote commensal, le pathogène et la réponse inflammatoire. Des fluctuations aléatoires de la dynamique écologique du microbiote individuel et de la transmission à l'échelle inter-hôte sont ajoutées pour obtenir un modèle EDP de la distribution des agents pathogènes au niveau de la population. Une extension du modèle a, par ailleurs, été développé pour représenter la transmission entre plusieurs populations. Le comportement asymptotique ainsi que l'impact des stratégies de contrôle, y compris le nettoyage et l'administration d'antimicrobiens, sont étudiés par des simulations numériques
The main objective of the thesis is to propose and analyze mathematical models based on partial differential equations (PDE) to describe the spatial dynamics of two species of voles (Microtus arvalis and Arvicola terrestris), which are particularly monitored in Eastern France. The models that we have proposed are based on PDE which describe the evolution of the density of the population of voles as a function of time, age and position in space. We have two complementary approaches to represent the dynamics. In the first approach, we propose a first model that consists of a scalar PDE depending on time, age, and space supplemented with a non-local boundary condition. The flux is linear with constant coefficient in the direction of age but contains a non-local term in the directions of space. Moreover, the equation contains a second order term in the spatial variables only. We have demonstrated the existence and stability of weak entropy solutions for the model by using, respectively, the Panov's theorem of the multidimensional compensated and a doubling of the variables type argument. In the second approach we were inspired by a Multi Agent model proposed by Marilleau-Lang-Giraudoux, where the spatial dynamics of juveniles is decoupled from local evolution in each plot. To apply this model, we have introduced a directed graph whose nodes are the plots. In each node, the evolution of the colony is described by a transport equation with two variables, time and age, and the movements of dispersion, in space, are represented by the passages from one node to the other. We have proposed a discretization of the model, by finite volume methods, and noticed that this approach manages to reproduce the qualitative characteristics of the spatial dynamics observed in nature. We also proposed to consider a predator-prey system consisting of a hyperbolic equation for predators and a parabolic-hyperbolic equation for preys, where the prey's equation is analogous to the first model of the vole populations. The drift term in the predators' equation depends nonlocally on the density of prey and the two equations are also coupled via classical source terms of Lotka-Volterra type. We establish existence of solutions by applying the vanishing viscosity method, and we prove stability by a doubling of variables type argument. Moreover, concerning the numerical simulation of the first model in one-dimensional space, we obtain a finite volume discretization by using the upwind scheme and then validate the numerical scheme.The last part of my thesis work is a project in which I participated during a Summer school CEMRACS. The project was on a subject of biomathematics different from that of the thesis (an epidemiological model for salmonellosis). A new generic multi-scale modeling framework for heterogeneous transmission of pathogens in an animal population is suggested. At the intra-host level, the model describes the interaction between the commensal microbiota, the pathogen and the inflammatory response. Random fluctuations in the ecological dynamics of the individual microbiota and transmission at the inter-host scale are added to obtain a PDE model of drift-diffusion of pathogen distribution at the population level. The model is also extended to represent transmission between several populations. Asymptotic behavior as well as the impact of control strategies, including cleaning and administration of antimicrobials, are studied by numerical simulation

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Duran, Saltuk. "La vapeur des Français dans la Méditerranée ottomane des Tanzimat : les Messageries maritimes françaises face à l’évolution des politiques protectionnistes ottomanes de 1851 à 1875." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018PSLEE068.

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Abstract:

Dès l’établissement de leur première ligne de Constantinople en 1851, les Messageries françaises se trouvèrent au sein des diverses dynamiques politiques et économiques dans l’Empire ottoman à l’ère des Tanzimat. À partir de cette date, dans le cadre de leurs activités de transport de correspondances, de marchandises et de voyageurs, elles furent confrontées aux différents comportements des acteurs locaux dans les ports ottomans. C’est ainsi qu’elles subirent de nombreux obstacles douaniers imposés par le gouvernement ottoman et son administration provinciale. Malgré ce protectionnisme, l’État ottoman lui-même, et certaines couches des populations locales continuèrent à faire l’usage des services de la compagnie française pour leurs échanges et mobilités dans l’Empire ou à l’étranger. Ces différentes réponses données par les acteurs locaux à la pénétration des services des Messageries françaises, étaient révélatrices avant tout des difficultés économiques importantes traversées par l’Empire à l’époque des Tanzimat. Néanmoins, en même temps, elles indiquaient un développement sans précédent de communications et des transports dans l’Empire, en particulier dans le domaine de la navigation à vapeur. Par cette thèse, nous avons donc pour objectif principal d’étudier ces évolutions économiques, notamment autour de la problématique de la réception des services des Messageries françaises dans l’Empire ottoman, à travers les différentes étapes politiques et économiques de la période entre 1851 et 1875
As they established their first line to Constantinople in 1851, the French Messageries found themselves within various political and economical dynamics of the Tanzimat era in the Ottoman Empire. These dynamics were especially visible on different attitudes of the Ottoman State and Ottoman populations towards the transport services of the French company in the framework of local steamship market during the period between 1851 and 1876. Within this chronological framework, the French Messageries were exposed to several barriers put up by the Ottoman government and its provincial administration in front their postal and commercial activities in the ports of the Ottoman Empire. However, despite these barriers, the French Messageries continued to carry the mails, the goods and passengers of the Ottoman state and Ottoman populations. The different responses given by these actors, to the penetration of the services of French Messageries in the Ottoman Empire were indicating two major facts: the Ottoman government and it’s provincial administration were facing financial problems, but despite these problems, transportation and communications within the empire were developing. In this thesis, our aim is to analyse the evolution of these economical facts around the question of the reception of the French Messageries services in the Ottoman Empire, through different political and economic processes of the Tanzimat era, between 1851 and 1875

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Nono, Njepang Luidor. "Les radios communautaires au Cameroun." Thesis, Paris 2, 2012. http://www.theses.fr/2012PA020051.

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Abstract:

L’ouverture du secteur audiovisuel camerounais a consacré l’avancée du processus d’acquisition et de l’octroi des libertés individuelles commencé autour des années 1990. Le décret d’application d’avril 2003 a entériné une dizaine d’années plus tard, le dispositif enclenché par la loi n°90-052 du 19 décembre 1990 relative à la liberté de communication sociale. Depuis lors, organes de presse et audiovisuels se côtoient et se heurtent à des pesanteurs susceptibles de limiter leur efficacité, en tant qu’outils et moyens de communication de proximité. Leur jeunesse, les problèmes endogènes et exogènes au paysage médiatique camerounais justifierait une étude sur l’existence et la manière dont les organes de communication sociale produisent et diffusent informations et nouvelles en direction des populations ciblées. A ce sujet, la radio communautaire, tout en cherchant à les impliquer et à les faire participer à cet objectif de communication sociale, promeut par ses programmes, la propre image des populations à laquelle elle est destinée. Il ne reste qu’à garantir les modalités pratiques, les conditions nécessaires pour une participation transparente des différents acteurs à la gestion et au fonctionnement de la radio. Pour une grande part, les populations sont prêtes à soutenir les projets de radios communautaires qui s’installent dans les localités. Les différentes techniques d’appropriation et d’usage des médias permettent d’appréhender de l’extérieur les différents enjeux qui se tissent. Elles permettent d’observer les pratiques mises en place et les conditions d’engagement des acteurs sociaux pour garantir, une longue vie à la radio
The opening of the Cameroonian audiovisual sector dedicated the overhang of the process of acquisition and the granting of the personal freedoms begun around 1990s. The application decree of April, 2003 confirmed a decade later, the plan engaged by the law 90/052 of December 19th, 1990 relative to the freedom of social communication. Since then, newspapers and broadcasting mix and come up against gravities susceptible to limit their efficiency, as tools and means of communication of nearness. Their youth, the endogenous and exogenous problems in the Cameroonian media landscape justify a study on the existence and the way the organs of social communication produce and broadcast information and news in the direction of the targeted populations. For this subject, the community radio, while trying to imply them and to make them participate in this objective of social communication, promotes by its programs, the own image of the populations for which is intended. It remains only to guarantee the practical methods, the necessary conditions for a transparent participation of the various actors in the management and in the functioning of the radio. Mostly, the populations are ready of supporting the projects of community radios which settle down in villages. The various techniques of appropriation and uses of the media allow dreading from the outside the various stakes which weave. They allow observing the organized practices and the conditions of commitment of the civil society to guarantee, a long life on the radio

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Sjöstrand, Agnès. "Origins and adaptation in humans : a case study of taste and lifestyle." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066724/document.

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Abstract:

Cette thèse utilise des approches de génétique des populations et de statistique pour étudier des événements anciens de démographie humaine, inférer de l’adaptation locale dans diverses populations et étudier le déterminisme du goût. En utilisant une approche bayésienne, j’évalue les preuves génétiques d’une réduction de population entre 190 000 et 130 000 ans avant notre ère. Je trouve que les données sont en faveur d’un modèle sans goulot d’étranglement durant cette période. Dans le second article, je développe une méthode destinée à la détection d’adaptation locale basée sur l’étude des haplotypes privés. Appliquée à des données de génotypage, cette méthode permet de détecter des signaux d’adaptation connus chez l’Homme mais aussi d’étendre nos connaissances en matière d’adaptation. J’étudie ensuite les signaux d’adaptation dans des données de génomes entiers de plusieurs populations et montre que le régime alimentaire et les pathogènes ont une influence majeure sur la variabilité adaptative des populations prises en compte. J’étudie dans un dernier article les perceptions gustatives de populations ayant différents modes de vie. Je présente les résultats phénotypiques de perception des goûts, et les associe à des données de génotypage. Je montre que les gènes impliqués dans la perception des goûts ont évolué avec le mode de vie. En effectuant une étude d’association, je montre aussi que les variations dans la perception des goûts impliquent plus de gènes que les seuls gènes codant pour les récepteurs gustatifs. Mes résultats montrent l’utilité des données génétiques denses pour mieux comprendre l’évolution humaine
This thesis uses population genetics and statistical approaches to investigate early human demography, infer local adaptation in diverse sets of populations, and study the genetic basis for taste perception. Using a Bayesian approach, I evaluate the genetic evidence of a bottleneck between 190,000 and 130,000 years ago and find that the data is in favor of a model without bottleneck at this time point. I further develop a method to detect local adaptation based on frequencies of private haplotypes. Applied to large-scale human genotype data, this method detects known signals of positive selection but also permits to improve knowledge on potential adaptation events in humans. I further investigate patterns of adaptation in whole genome data based on a diverse set of African populations. The results from the regions potentially selected show that diet and pathogens are the common driving forces of adaptation in all studied populations. I last study taste perception in populations differing on lifestyle (hunter-gatherers, farmers and nomad herders). I present taste perception phenotypes for all tastes (sweet, bitter, sour, salty and umami) and relate them to high density genotype data. I show that taste and taste-involved genes have evolved with lifestyle. By performing an association study, I also show that variation in taste perception involves more genes than only the taste receptors genes.I covered several topics of human ancient demography and adaptation and show the utility of using large-scale genetic data to better understand human history

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Fischer, Stephan. "Modélisation de l'évolution de la taille des génomes et de leur densité en gènes par mutations locales et grands réarrangements chromosomiques." Phd thesis, INSA de Lyon, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00924831.

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Abstract:

Bien que de nombreuses séquences génomiques soient maintenant connues, les mécanismes évolutifs qui déterminent la taille des génomes, et notamment leur part d'ADN non codant, sont encore débattus. Ainsi, alors que de nombreux mécanismes faisant grandir les génomes (prolifération d'éléments transposables, création de nouveaux gènes par duplication, ...) sont clairement identifiés, les mécanismes limitant la taille des génomes sont moins bien établis. La sélection darwinienne pourrait directement défavoriser les génomes les moins compacts, sous l'hypothèse qu'une grande quantité d'ADN à répliquer limite la vitesse de reproduction de l'organisme. Cette hypothèse étant cependant contredite par plusieurs jeux de données, d'autres mécanismes non sélectifs ont été proposés, comme la dérive génétique et/ou un biais mutationnel rendant les petites délétions d'ADN plus fréquentes que les petites insertions. Dans ce manuscrit, nous montrons à l'aide d'un modèle matriciel de population que la taille du génome peut aussi être limitée par la dynamique spontanée des duplications et des grandes délétions, qui tend à raccourcir les génomes même si les deux types de ré- arrangements se produisent à la même fréquence. En l'absence de sélection darwinienne, nous prouvons l'existence d'une distribution stationnaire pour la taille du génome même si les duplications sont deux fois plus fréquentes que les délétions. Pour tester si la sélection darwinienne peut contrecarrer cette dynamique spontanée, nous simulons numériquement le modèle en choisissant une fonction de fitness qui favorise directement les génomes conte- nant le plus de gènes, tout en conservant des duplications deux fois plus fréquentes que les délétions. Dans ce scénario où tout semblait pousser les génomes à grandir infiniment, la taille du génome reste pourtant bornée. Ainsi, notre étude révèle une nouvelle force susceptible de limiter la croissance des génomes. En mettant en évidence des comporte- ments contre-intuitifs dans un modèle pourtant minimaliste, cette étude souligne aussi les limites de la simple " expérience de pensée " pour penser l'évolution. Nous proposons un modèle mathématique de l'évolution structurelle des génomes en met- tant l'accent sur l'influence des différents mécanismes de mutation. Il s'agit d'un modèle matriciel de population, à temps discret, avec un nombre infini d'états génomiques pos- sibles. La taille de population est infinie, ce qui élimine le phénomène de dérive génétique. Les mutations prises en compte sont les mutations ponctuelles, les petites insertions et délétions, mais aussi les réarrangements chromosomiques induits par la recombinaison ectopique de l'ADN, comme les inversions, les translocations, les grandes délétions et les duplications. Nous supposons par commodité que la taille des segments réarrangés suit une loi uniforme, mais le principal résultat analytique est ensuite généralisé à d'autres dis- tributions. Les mutations étant susceptibles de changer le nombre de gènes et la quantité d'ADN intergénique, le génome est libre de varier en taille et en compacité, ce qui nous permet d'étudier l'influence des taux de mutation sur la structure génomique à l'équilibre. Dans la première partie de la thèse, nous proposons une analyse mathématique dans le cas où il n'y a pas de sélection, c'est-à-dire lorsque la probabilité de reproduction est identique quelle que soit la structure du génome. En utilisant le théorème de Doeblin, nous montrons qu'une distribution stationnaire existe pour la taille du génome si le taux de duplications par base et par génération n'excède pas 2.58 fois le taux de grandes délétions. En effet, sous les hypothèses du modèle, ces deux types de mutation déterminent la dynamique spontanée du génome, alors que les petites insertions et petites délétions n'ont que très peu d'impact. De plus, même si les tailles des duplications et des grandes délétions sont distribuées de façon parfaitement symétriques, leur effet conjoint n'est, lui, pas symétrique et les délétions l'emportent sur les duplications. Ainsi, si les tailles de délétions et de duplications sont distribuées uniformément, il faut, en moyenne, plus de 2.58 duplications pour compenser une grande délétion. Il faut donc que le taux de duplications soit quasiment trois fois supérieur au taux de délétions pour que la taille des génomes croisse à l'infini. L'impact des grandes délétions est tel que, sous les hypothèses du modèle, ce dernier résultat reste valide même en présence d'un mécanisme de sélection favorisant directement l'ajout de nouveaux gènes. Même si un tel mécanisme sélectif devrait intuitivement pousser les génomes à grandir infiniment, en réalité, l'influence des délétions va rapidement limiter leur accroissement. En résumé, l'étude analytique prédit que les grands réarrangements délimitent un ensemble de tailles stables dans lesquelles les génomes peuvent évoluer, la sélection influençant la taille précise à l'équilibre parmi cet ensemble de tailles stables. Dans la deuxième partie de la thèse, nous implémentons le modèle numériquement afin de pouvoir simuler l'évolution de la taille du génome en présence de sélection. En choisissant une fonction de fitness non bornée et strictement croissante avec le nombre de gènes dans le génome, nous testons le comportement du modèle dans des conditions extrêmes, poussant les génomes à croître indéfiniment. Pourtant, dans ces conditions, le modèle numérique confirme que la taille des génomes est essentiellement contrôlée par les taux de duplications et de grandes délétions. De plus, cette limite concerne la taille totale du génome et s'applique donc aussi bien au codant qu'au non codant. Nous retrouvons en particulier le seuil de 2.58 duplications pour une délétion en deçà duquel la taille des génomes reste finie, comme prévu analytiquement. Le modèle numérique montre même que, dans certaines conditions, la taille moyenne des génomes diminue lorsque le taux de duplications augmente, un phénomène surprenant lié à l'instabilité structurelle des grands génomes. De façon similaire, augmenter l'avantage sélectif des grands génomes peut paradoxalement faire rétrécir les génomes en moyenne. Enfin, nous montrons que si les petites insertions et délétions, les inversions et les translocations ont un effet limité sur la taille du génome, ils influencent très largement la proportion d'ADN non codant.

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Sierra, Jimenez Mara Johanna. "Parcs nationaux en transition vers des parcs nationaux naturels anthropisés (PNNa) ? Étude comparative de trois parcs nationaux naturels habités du Continent américain (Colombie, Guyane française, Québec)." Thesis, Pau, 2016. http://www.theses.fr/2016PAUU1010/document.

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Abstract:

L’évolution des politiques de gouvernance environnementale internationale et la transition des contextes nationaux et locaux de conservation favorisent de plus en plus l’intégration de la dimension anthropique au sein des parcs nationaux (catégorie II-UICN). Cette dimension s’adresse d’une part aux populations locales qui habitent de manière permanente les diverses zones de protection, et d’autre part, aux acteurs économiques (légaux et illégaux) qui exploitent le territoire protégé (tourisme, orpaillage, bois, etc.) ou qui participent de manière directe et indirecte aux processus de construction territoriale du parc national. L’intégration de la dimension anthropique au sein de ces territoires naturels de protection favorise en conséquence l’émergence de nouvelles dynamiques et stratégies de gestion et de gouvernance participatives.Avec une triple approche scientifique construite autour des regards croisés de la géographie politique, de la géographie socioculturelle et de la political ecology, cette thèse s’intéresse à l’analyse de trois cas d’études particuliers du continent américain afin de comprendre comment l’intégration de cette dimension anthropique (socioculturelle et économique) favorise la transition de certains espaces naturels protégés classiques vers une nouvelle configuration que nous proposons d’identifier ici sous le nom de « parcs nationaux naturels anthropisés - PNNa ». L’analyse systémique de la structure et du fonctionnement des macrostructures de gouvernance et des microstructures de gestion du Parc amazonien de la Guyane en France, du Parc marin du Saguenay-Saint-Laurent au Québec (Canada) et du Parc national naturel Amacayacu en Amazonie colombienne, nous ont permis ainsi de mettre en évidence quelques aspects de cette transition dans la gestion territoriale des espaces naturels protégés de catégorie II, ainsi que les conflits de pouvoir qui en résultent
The evolution of international environmental policies and national and local conservation contexts gives increasing importance to the anthropic dimension within the national parks (category II UICN). Not only does this dimension takes into account the local population that lives permanently in these various natural areas, but also the economic actors who, legally or illegally, benefit from those protected areas (tourism, gold-washing, wood, etc.) or participate directly or indirectly in the process of the territorial elaboration of a national park. The integration of the anthropic aspect definitely help the emergence of new dynamics and strategies of collaborative management and policies. Building on political geography, socio-cultural geography and political ecology, this thesis aims to shed light how that anthropic dimension (sociocultural as well as economical) entails the transition of some protected areas from a classical type to a new category we identify as the “Nature and Anthropic National Park” (PNNa). We focus on three specific study cases in the American continent: the Amazonian park of the French Guiana, the Sea Park of Saguenay-Saint-Laurent of Québec, Canada, and the Amazonian Amacayacu National Park of Colombia. The systemic analysis of their structure and their functioning, as far as macrostructure of policies and microstructures of management are concerned, has allowed us to bring out that transition in the territorial management of these category II protected natural areas and the deriving conflicts for power
La evolución de las políticas de gobernanza medioambiental internacional y la transición de los contextos nacionales y locales de conservación, favorecen cada vez más la integración de la dimensión antrópica al interior de los parques nacionales (categoría II-UICN). Esta dimensión corresponde de una parte, a las poblaciones locales que habitan de manera permanente las diversas zonas de protección dentro del parque nacional, y de otra parte, a los actores económicos (legales e ilegales) que explotan el territorio protegido (Turismo, explotación minera, explotación de madera, etc), o que participan de manera directa o indirecta en los procesos de construcción territorial del parque nacional. La integración de la dimensión antrópica dentro de estos territorios naturales de protección favorece en consecuencia la emergencia de nuevas dinámicas y estrategias participativas de gestión y de gobernanza. A través de un triple enfoque científico construido mediante el cruce de diversos puntos de vista de la geografía política, de la geografía sociocultural y de la political ecology, esta tesis se interesa en el análisis de tres casos de estudio particulares del Continente americano. El objetivo de esta contribución es el de intentar mostrar, cómo la integración de la dimensión antrópica (sociocultural y económica) influencia la transición de algunos espacios naturales protegidos hacia una nueva configuración que nosotros proponemos identificar aquí bajo el nombre de “parques nacionales naturales antropizados – PNNa”.El análisis sistémico de la estructura y del funcionamiento de las macroestructuras de gobernanza y de las microestructuras de gestión participativa del Parque amazónico de la Guayana, en Francia, del Parque marino del Saguenay-Saint-Laurent en Quebec, Canadá, y del Parque nacional natural Amacayacu en Amazonia colombiana, nos permitieron poner en evidencia este tipo de transición en la gestión territorial de los espacios naturales protegidos de categoría II, así que los conflictos de poder que resultan de esta transformación

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Trabelsi, Salma. "Développement local et valorisation du patrimoine culturel fragile : le rôle médiateur des ONG : cas du Sud-tunisien." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016AZUR2030/document.

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Abstract:

Le concept de « patrimoine culturel » intègre notre champ de recherche en sciences de l’information et de la communication reliant sa mise en valeur et sa protection à la médiation territoriale. Dans une vision de développement local, le patrimoine culturel naturel, matériel et immatériel, constitue un atout économique et touristique. Notre thèse étudie la mise en valeur patrimoine culturel dans les régions et zones rurales du Sud-tunisien. Il s’agit de traiter une problématique traduisant les soucis d’une population locale en termes de sauvegarde de son héritage patrimonial contre les formes de marginalisation et l’oubli. Les familles rurales souhaitent développer leur production locale fondée sur les ressources patrimoniales, les fabrications de produits du terroir et l’artisanat mais rencontrent des difficultés financières et institutionnelles pour soutenir leurs activités locales. Cela est dû à une absence de communication entre la population et les instances publiques pour collaborer autour de la problématique de la valorisation du patrimoine qui devient de plus en plus fragile. Notre thèse est d’avancer un élément central de soutien institutionnel pour médiatiser le dialogue entre les acteurs locaux. Il s’agit d’introduire les organisations non gouvernementales (O.N.G.) comme acteur de médiation pour renforcer des actions de concertation et impliquer encore plus les institutions publiques et la population locale dans la question de la valorisation du patrimoine culturel. Une recherche-action a été mise en œuvre pour explorer un nouveau terrain d’investigation, et comprendre les rôles et les responsabilités des acteurs réunis sur un territoire
This research in the field of information communication Sciences connects the promotion and protection of cultural heritage with the notion of territorial management. From a local development perspective, a region's natural and cultural heritage provides the basis for advancing the economy and tourism. Our thesis focuses on promoting and protecting cultural heritage in rural regions of Southern Tunisia. This research addresses an important problem for many rural Tunisian communities preserving their cultural heritage in the face of marginalization and poverty because of The financial and institutional difficulties needed to support their professional activities. The problems of under development continue as local partners are frequently confronted with disaccord related to responsibility and the actions necessary for promoting cultural heritage. These problems are often due to a lack of communication between communities and local authorities that is essential for promoting cultural heritage in times when identity loss due to globalization is a serious concern. Our research underlines the fundamental aspect of institutional support for mediating dialogue between local actors. It implicates the participation of non-governmental organizations as actors in strengthening and mediating collaborations between local institutions and populations in the process of promoting cultural heritage. Our research action project was developed in order to explore new grounds of investigation and to gain a better understanding of the roles and responsibilities of actors collaborating in the region

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Bouteiller, Xavier. "Une histoire écologique et évolutive du robinier faux-acacia (Robinia pseudoacacia L.) depuis son introduction en Europe." Thesis, Bordeaux, 2018. http://www.theses.fr/2018BORD0162/document.

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Abstract:

Robinia pseudoacacia L. est un arbre nordaméricain qui est largement répandu à travers l’Europe. Afin d’évaluer les mécanismes évolutifs pouvant expliquer son potentiel invasif, il est indispensable d’identifier les populations sources de l’introduction et de comprendre quels traits ont contribué à son succès dans l’aire européenne Une étude de génétique des populations a été réalisée, un large échantillonnage a été conduit au sein des deux aires et 818 individus provenant de 63 populations ont été génotypés grâce à 113 marqueurs SNPS. En premier lieu, nous avons démontré que le robinier européen provenait d’un nombre restreint de populations situées au nord du plateau des Appalaches, ce qui est en accord avec les données historiques. Au sein des ÉtatsUnis la structure reflète des processus évolutifs au long cours tandis qu’en Europe, la structure est plus ténue et pourrait être due à l’activité humaine, notamment aux programmes de sélection entrepris en Europe centrale depuis le 18ème siècle. En deuxième lieu, un goulot d’étranglement génétique associé à une perte de diversité a été mis en évidence dans l’aire d’introduction. Enfin un plus fort taux de clonalité a été observé au sein des populations d’Europe Conjointement à cette étude de génétique des populations. Une expérimentation de génétique quantitative a été réalisée afin d’évaluer la différenciation de traits juvéniles entre populations des deux aires (3000 individus de 20 populations) cultivées dans 3 conditions de température différentes (18°C ; 22°C et 31°C). Les résultats ont révélé une augmentation du taux de germination parmi les populations européennes par rapport aux américaines (88% vs 60%) quelles que soient les conditions environnementales. Un scénario possible est que l’Homme aurait sélectionné et propagé les meilleures graines en Europe favorisant alors l’évolution du taux de germination. De plus, les traits phénotypiques juvéniles sont extrêmement plastiques à la température avec une tendance générale à l’augmentation de la valeur du trait avec la température. Cela suggère qu’un réchauffement climatique favoriserait le développement de l’espèce, au moins en conditions d’alimentation en eau non limitante. Cependant, seules les populations américaines montrent un signal une adaptation locale à la température d’origine Dans tous les cas, ils semblent que l’action de l’Homme sur le potentiel reproductif, sexué ou asexué, a probablement influencé le potentiel invasif du robinier en Europe
Robinia pseudoacacia L. is a North American tree which has now broadly spread in Europe. In order to evaluate the evolutionary mechanisms behind its invasiveness, it is crucial to identify the population sources of the introduction and to understand which traits contributed to its success in the European range. To undertake a population genetics study, we performed a large sampling both in the invasive and native ranges; 818 individuals from 63 populations were genotyped using 113 SNPs. First, we demonstrated that European black locust was introduced from only a limited number of populations located in the Northern plateau of the Appalachians Mountains; this is in agreement with historical records. Within America, population structure reflected long time evolutionary processes whereas in Europe, it was largely impacted by human activities. In the European range, the genetic clustering may be a signal of evolution caused by artificial selection due to human oriented mass selection or tree breeding initiated in Central Europe since the 18th century. Second, we evidenced a genetic bottleneck among ranges with a decrease in allelic richness and in the total number of alleles in Europe. Lastly, we found more clonality within the European populations. Conjointly to the population genetic analysis, we conducted a quantitative genetics experiment to evaluate juvenile traits of both native and invasive black locust populations (3000 individuals from 20 populations) grown under 3 different temperature conditions. Results revealed an enhanced germination rate among European populations compared to that of the native American populations whatever the environmental condition (88% vs 60%). Thus a possible scenario may be that Man would have selected and propagated the best seeds in the new range that would have favored an evolution of germination rate through European populations. Phenotypic traits of juvenile development are extremely plastic in response to temperature (18/22/31°C), with a general tendency to increasing trait values with increasing temperature. This suggests that global warming would favor the development of the species, at least under nonlimiting water supply conditions. However, only American populations demonstrated a signal of local adaptation to the temperature at the sampling location. In any case, the human role on the reproductive potential, both sexual and asexual, within the introduced rangewould likely be a key process in the success of black locust dynamics in Europe

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Blanquart, François. "Adaptation des populations en environnement variable." Thesis, Montpellier 2, 2012. http://www.theses.fr/2012MON20104.

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Abstract:

Populations often experience environmental conditions that are variable both in space and in time. Understanding the demographic and evolutionary dynamics of populations in such variable environments has very practical implications for conservation biology, pest and pathogen control, management of antibiotic resistance. This thesis is an attempt to study the ecological and evolutionary implications of spatial and temporal variations of the environment.First, I study how spatially heterogeneous and temporally changing conditions influence the demographic dynamics of a genetically uniform population. The growth of the population is enhanced when individuals preferentially accumulate in high quality habitats. Migration between locations facilitates a good arrangement of individuals such that in general, an intermediate rate of migration maximizes the growth rate.Second, I develop a model where the growth rate of individuals depends on the environment but also on their genetic quality, and possibly on the interaction between the environment and the genotype. If the performance of different genotypes tradeoffs across the environments, several genotypes may be maintained locally in the environment that suit them and a pattern of local adaptation emerges. Moreover, I show that adaptation of populations to environmental fluctuations in the environment generates very dynamic changes in the genetic composition that lag behind the environmental change. Adaptation may be facilitated by the influx of migrants coming from other demes.How can we detect such patterns of adaptation in wild or experimental populations? I develop a formal analysis of several experimental and statistical techniques that are used to detect patterns of local and temporal adaptation. I provide recommendations regarding efficient experimental designs and statistical techniques to detect local adaptation. I also develop a new framework for the analysis of patterns of adaptation in time. I illustrate the potential use of this approach using a data set measuring the adaptation of HIV to the immune response of several recently infected patients
Populations often experience environmental conditions that are variable both in space and in time. Understanding the demographic and evolutionary dynamics of populations in such variable environments has very practical implications for conservation biology, pest and pathogen control, management of antibiotic resistance. This thesis is an attempt to study the ecological and evolutionary implications of spatial and temporal variations of the environment.First, I study how spatially heterogeneous and temporally changing conditions influence the demographic dynamics of a genetically uniform population. The growth of the population is enhanced when individuals preferentially accumulate in high quality habitats. Migration between locations facilitates a good arrangement of individuals such that in general, an intermediate rate of migration maximizes the growth rate.Second, I develop a model where the growth rate of individuals depends on the environment but also on their genetic quality, and possibly on the interaction between the environment and the genotype. If the performance of different genotypes tradeoffs across the environments, several genotypes may be maintained locally in the environment that suit them and a pattern of local adaptation emerges. Moreover, I show that adaptation of populations to environmental fluctuations in the environment generates very dynamic changes in the genetic composition that lag behind the environmental change. Adaptation may be facilitated by the influx of migrants coming from other demes.How can we detect such patterns of adaptation in wild or experimental populations? I develop a formal analysis of several experimental and statistical techniques that are used to detect patterns of local and temporal adaptation. I provide recommendations regarding efficient experimental designs and statistical techniques to detect local adaptation. I also develop a new framework for the analysis of patterns of adaptation in time. I illustrate the potential use of this approach using a data set measuring the adaptation of HIV to the immune response of several recently infected patients

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Piri, Rebecca D. "Spatial Genetic Structure and Local Adaptation within and among Foxtail Pine (Pinus balfouriana subsp. balfouriana) Populations Located in the Klamath Mountains, California." VCU Scholars Compass, 2019. https://scholarscompass.vcu.edu/etd/6018.

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Abstract:

Foxtail pine (Pinus balfouriana) is a subalpine conifer endemic to California, notably separated into two disjunct subspecies. Previous studies have described the northern subspecies,Pinus balfouriana subsp. balfouriana,as having an uncommonly high level of genetic differentiation and no discernible spatial patterns in phenotypic variation. This study seeks to characterize the spatial genetic structure and patterns of selection of the northern subspecies (Pinus balfouriana subsp. balfouriana) using genome-wide data and to identify the influence of ecology and environment on the unique genetic patterns. I show that genetic differentiation among populations is much less than previously estimated (FST= 0.000644) and there is weak isolation-by-distance structure, but ongoing gene flow is unlikely. Within populations, stand density and competitor effects contribute to inbreeding. I also show that previously measured traits are predominantly determined by genetics. Analyzing by sliding window in the genome, I show that connectivity patterns vary widely throughout the genome and identify several areas that are important to the genetic architecture of the phenotypic traits and plasticity (GxE). Overall, there is high connectivity, genetic similarity, and genetically based trait variation among and within populations of the northern subspecies of foxtail pine due to historical processes, despite biotic interactions driving inbreeding. Persistent genetic isolation, however, may make adaptation to future climate a challenge for the subspecies.

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Pédron, Nicolas. "Structure génétique, réponses bioénergétiques et traits de vie, de populations de flets (Platichthys flesus) soumises au réchauffement climatique, sur un gradient latitudinal." Thesis, Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0058/document.

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Abstract:

Le flet européen (Platichthys flesus) est un poisson catadrome dont l’aire de répartition dans le Nord-Est Atlantique s’étend du cercle polaire Arctique jusqu’au Portugal. Depuis quelques décennies, la limite Sud de son aire de distribution remonte le long des côtes Portugaises. Une étude préliminaire sur la biologie des populations de flet a identifié un métabolisme énergétique spécifique pour une population périphérique Sud au Portugal vs des populations situées dans le Golfe de Gascogne et en Manche. Dans la présente étude, nous avons combiné une approche en génétique de populations avec des challenges expérimentaux menés en situation de common garden, pour approfondir nos connaissances sur la différentiation génétique entre les populations de flets sur la façade Atlantique et sur le possible différentiel phénotypique qui pourrait en résulter, particulièrement en terme de bioénergétique et de traits d’histoire de vie. L’approche génétique considérant le polymorphisme de marqueurs de type microsatellites et de différents gènes candidats met en évidence une différentiation génétique très significative entre les populations de la Péninsule Ibérique et celles situées plus au Nord. Une pression de sélection différentielle s’exerce probablement sur un gène impliqué dans le métabolisme énergétique (GAPDH) et confirme la particularité génétique des populations Ibériques. Un challenge thermique et hypoxique conduit sur des poissons juvéniles et mettant en oeuvre une combinaison d’approches ciblées (activités enzymatiques sur des proxies du métabolisme énergétique en aérobiose vs anaérobiose, et de l’anabolisme) et sans a priori (protéomique par électrophorèse 2D) suggère une meilleure aptitude des populations centrales (Canche et Vilaine, France) et de la population périphérique (Lima, Portugal) à se maintenir respectivement en conditions froide vs chaude et hypoxique. Enfin, l’analyse de normes de réaction des traits de vie pour des stades embryo-larvaires exposés à un gradient thermique met en évidence une probable adaptation locale des populations de flet à leur environnement thermique
The European flounder (Platichthys flesus) is a catadromous fish species distributed along the North-East Atlantic coasts, from the Arctic polar circle to the Iberian Peninsula. For several decades, the southern limit of its distribution area is shifting towards the North of the Portuguese coast. A preliminary study on the flounder population biology has detected a specific energetic metabolism for a southern peripheral population in Portugal compared to Northern populations located in the Bay of Biscay and in the Channel. In the present study, we have combined population genetics with experimental challenges in the laboratory to improve our knowledge on the genetic structure of flounder populations over Europe, and on the potentially resulting phenotypic differences among populations, mainly considering bioenergetics and life-history traits. The polymorphism of microsatellite markers and of several candidate genes highlighted a significant genetic differentiation between Iberian Peninsula populations and Northen populations. A thermal and hypoxia challenge has been conducted on flounder juveniles, considering (1) enzymatic activities linked to energetic metabolism (aerobiosis and anaerobiosis) and anabolism, and (2) a proteomic approach; this common garden experiment suggested a higher capacity of central populations (from Canche and Vilaine, France) and of one peripheral Southern population (from Lima, Portugal) to cope with respectively cold condition, warm and hypoxia condition. Finally, the analysis of thermal reaction norms in fish early life history traits, considering embryo-larval stages submitted to a thermal gradient, underlined a possible local adaptation of the flounder populations to their thermal environments

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Beugin, Marie-Pauline. "The European wildcat as a model for the study of wildlife : focus on hybridization and the circulation of viruses." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSE1275/document.

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Abstract:

L'hybridation et les maladies infectieuses sont deux problématiques majeures pour la conservation de la faune sauvage à travers le monde. Le Chat sauvage européen Felis silvestris silvestris, à travers ses interactions avec son proche apparenté le Chat domestique Felis silvestris catus, représente un modèle intéressant pour l'étude de ces deux problématiques et de leurs interactions. Le fait que le Chat sauvage soit touché par ces deux phénomènes, combiné à la variabilité des habitats dans lesquels il vit en Europe, permet de conduire des études comparées et de comprendre quels déterminants environnementaux influencent les flux de gènes et de pathogènes. Ici, nous proposons deux nouvelles approches méthodologiques basées sur l'analyse de marqueurs génétiques, pour une meilleure comparabilité entre études et une détection rapide des hybrides respectivement. Nous avons recherché les hybrides et regardé la distribution spatiale des individus apparentés dans deux populations locales divergeant principalement sur le niveau de fragmentation de l'environnement. Dans l'une de ces populations, nous avons également conduit une étude sérologique pour déterminer si les chats sauvages et domestiques échangeaient certains des virus communs du Chat domestique (PVF, HVF, CVF, VIF). Nous avons observé un taux d'hybridation plus élevé dans l'environnement le plus fragmenté. Malgré la ceinture de chats domestiques infectés à haute prévalence autour d'elle, la population de chats sauvages de ce même environnement n'était infectée par aucun des virus. La présence de barrières génétiques et/ou comportementales expliquerait ce résultat dans un environnement fragmenté permettant par ailleurs le maintien de souches généralistes. L'échantillonnage local présenté ici nous a permis de comprendre les mécanismes à la base de l'hybridation et de la circulation des virus. Présentement, le Chat sauvage européen ne semble pas menacé par le Chat domestique. Toutefois, des mesures préventives devraient être adoptées pour éviter que cela ne devienne le cas
Hybridization and infectious diseases are two major issues for wildlife conservation worldwide. The European wildcat Felis silvestris silvestris, through its interactions with its close relative the domestic cat Felis silvestris catus, represents a valuable model for the study of these two issues and their interactions. The European wildcat is both threatened by hybridization and infectious diseases. This, combined with the high diversity of environments where it lives throughout Europe, allows to lead comparative studies and to understand which environmental determinants impact gene and pathogen flows. Here we propose two new methodological developments for the detection of hybrids based on genetic markers allowing for a better comparability between studies and leading to a fast detection of hybrids respectively. Hybrid detection and assessment of spatial relatedness pattern were carried out in two local populations of European wildcats differing mostly on the level of fragmentation of their environment. On one of this population, we led a serological survey to investigate whether domestic cats and wildcats exchange some of the most common viruses of the domestic cat (FPV, FHV, FCV, FIV). We found a higher rate of hybridization in the most fragmented environment. There, the wildcat population, in spite of the domestic cats surrounding it that were infected at high prevalence with the viruses, was not infected by any of the viruses. The presence of genetic or behavioral barriers may explain this result in an environment that is not incompatible with the persistence of generalist strains. The local sampling achieved in this work allowed us to investigate mechanisms behind hybridization and viruses’ circulation. At the time, the European wildcat does not seem threatened by domestic cats. However, preventive measures should be taken to prevent a future increase in frequency of the phenomenon both for the control of gene and virus flows

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Watkins, Laura Louise. "Tracer populations in the local group." Thesis, University of Cambridge, 2011. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/240582.

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Abstract:

So often in astronomy, an object is not considered for its individual merits, but for what we may learn from its properties regarding some larger population. The existence of dark matter is a prime example of this; we cannot see it directly but we can infer its presence by noting its effects on the stars orbiting within its potential. This thesis describes how various sets of tracer populations can be used to probe the properties of a variety of galaxies in the Local Group. I begin by describing the extraction of a variable catalogue from the Sloan Digital Sky Survey Stripe 82 dataset and then use the catalogue to select a high-quality set of RR Lyrae stars. Analysing the distribution of the RR Lyraes reveals three significant substructures in the Milky Way halo: the Hercules-Aquila Cloud and the Sagittarius Stream, which were already known to exist, and the Pisces Overdensity, which was previously undetected. It is a faint, extended structure found at ~80 kpc and is of unknown origin. Altogether, I find that nearly 80% of the RR Lyraes are associated with substructures, consistent with the theory that galaxy halos are predominantly, or even entirely, made up from disrupted satellites. I also investigate the density distribution of RR Lyraes in the halo, finding that it is best fit by a broken-power-law model, in good agreement with previous work. I go on to develop a set of tracer mass estimators that build on previous work which make use of actual (and not projected) distance and proper motion data, reflecting the amount and quality of data now available to us. I show that proper motion data is, in theory, very useful and can greatly increase the accuracy of the mass estimates; in practice, however, current analysis is hampered by the large errors inherent in the proper motion data. The results are also subject to mass-anisotropy degeneracy, which current data is not yet able to break. Nevertheless, I am able to estimate the mass of the Milky Way to be M = 2.7 ± 0.5 x 10¹² Msun and the mass of M31 to be M = 1.5 ± 0.4 x 10¹² Msun. Andromeda XII and Andromeda XIV are two M31 satellites that have been dubbed 'extreme' and are thought to be on first infall into the M31 system. I modify the classical Timing Argument so that it can be applied to two external galaxies and then apply it to M31 and each of And XII and And XIV in turn to investigate the properties of their orbits. I then run a series of Monte Carlo simulations to investigate how likely such satellites are to exist and conclude that they are not as unusual as previously believed. Finally, I discuss three upcoming wide-field, all-sky surveys and their implications for the future of the study of the Local Group.

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Villemereuil, Pierre de. "Méthodes pour l’étude de l’adaptation locale et application au contexte de l’adaptation aux conditions d’altitude chez la plante alpine Arabis alpina." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016GREAS003/document.

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Abstract:

L'adaptation locale est un phénomène micro-évolutif qui peut survenir lorsque des populations d'une même espèce sont exposées à des conditions environnementales différentes.Si cet environnement exerce une pression sous forme de sélection naturelle, qu'il existe un potentiel adaptatif au sein des populations et que le flux de gènes est suffisamment modéré, les populations vont alors tendre vers un optimum adaptatif local.Dans cette thèse, je m'intéresse aux moyens méthodologiques de l'étude de l'adaptation locale d'une part, et à l'étude de ce phénomène le long d'un gradient d'altitude chez la plante alpine Arabis alpina d'autre part.Dans la première partie méthodologique, je montre que les méthodes de scan génomique pour détecter les marqueurs génétiques sous sélection peuvent souffrir de forts taux de faux positifs lorsqu'exposées à des jeux de données complexes, mais réalistes.Je présente ensuite une méthode statistique de détection de marqueurs génétiques sous sélection qui, contrairement aux méthodes existantes, utilisent à la fois la notion de différentiation génétique (ou Fst) et une information environnementale.Cette méthode a été développée de manière à limiter son taux de faux positifs de manière générale.J'offre enfin une perspective concernant les liens entre une expérience ancienne en biologie évolutive (l'expérience de jardin commun) et les nouveaux développements moléculaires et statistiques modernes.Dans la seconde partie empirique, je présente une analyse de la démographie d'A. alpina dans six populations naturelles. Outre qu'elle révèle des caractéristiques biologiques intéressantes sur cette espèce (faible espérance de vie, reproduction et survie très différentielle...), cette analyse montre que la croissance diminue et la survie augmente chez cette espèce avec la baisse de la température moyenne (donc avec l'altitude).Puisque ces analyses ne permettent pas d'exclure des hypothèses de dérive et de plasticité phénotype, je présente une analyse en jardin commun sur A. alpina qui permet de lisser les problèmes de plasticité phénotypique et qui, combinée à des analyses moléculaires, permettent d'exclure l'hypothèse de dérive.Les résultats montrent qu'il existe un syndrome phénotypique adaptatif lié à la température moyenne qui tend à des plantes plus petites, plus compactes, qui croissent et se reproduisent moins, dans les milieux froids.À l'aide des données moléculaires et de méthodes de scan génomique, je présente une liste de 40 locus qui peuvent être impliqués dans ce processus.Pour finir, je discute l'ensemble de ces résultats empiriques dans un contexte plus général d'écologie alpine. Je résume ensuite les principaux obstacles méthodologiques à l'étude de l'adaptation locale et je fourni quelques perspectives méthodologiques
Local adaptation is a micro-evolutionary phenomenon, which arises when populations of the same species are exposed to contrasted environmental conditions.If this environment exert some natural selection pressure, if an adaptive potential exists among the populations and if the gene flow is sufficiently mild, populations are expected to tend toward a local adaptive optimum.In this thesis, I study the methodological means of the study of local adaptation on the one hand, and I investigate this phenomenon along an elevation gradient in the alpine plant Arabis alpina on the other hand.In the first, methodological part, I show that the genome scan methods to detect selection using genetic markers might suffer strong false positive rates when confronted to complex but realistic datasets.I then introduce a statistical method to detect markers under selection, which, contrary to existing methods, make use of both the concept of genetic differentiation (or Fst) and environmental information.This method has been developed in order to reduce its global false positive rate.Finally, I present some perspectives regarding the relationships between the relatively old ``common garden'' experiment and the new developments in molecular biology and statistics.In the second, empirical part, I introduce an analysis of the demographic characteristics of A. alpina in six natural populations. Besides providing interesting biological information on this species (low life expectancy, strongly contrasted reproduction and survival...), these analyses show that growth increase and survival decrease with the decrease of average temperature (hence with altitude).Since these analyses do not allow us to rule out hypotheses such as drift and phenotypic plasticity, I show the results of a common garden experiment which enable us to smooth phenotypic plasticity and, when combined with molecular data, enable us to rule out the hypothesis of drift.The results show the existence of an adaptive phenotypic syndrome, in which plants are smaller, are more compact, grow slower and reproduce less in cold temperature environments.Using the molecular data, I draw a list of 40 locus which might be involved in this adaptive process.In the end, I discuss these empirical findings as a whole to place them in a more general context of alpine ecology. I sum up the main methodological challenges when studying local adaptation and offer some methodological perspectives

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Guzinski, Jaro, and guzi0002@flinders edu au. "Investigating genetic population substructure of an Australian reptile tick, Bothriocroton hydrosauri, using highly polymorphic microsatellite markers." Flinders University. School of Biological Sciences, 2009. http://catalogue.flinders.edu.au./local/adt/public/adt-SFU20090324.125811.

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Abstract:

Despite long-term study, the mechanism explaining the parapatric distribution of two Australian reptile ticks species, Bothriocroton hydrosauri and Amblyomma limbatum, is not understood. This project aimed to use molecular genetic data to investigate aspects of the population biology of these two tick species, such as population structure and dispersal, to gain further insights into the cause and maintenance of this parapatric boundary. I developed and subsequently tested for Mendelian inheritance a suite of B. hydrosauri and A. limbatum species-specific microsatellites markers. Pedigree analysis showed one B. hydrosauri locus and all of the A. limbatum loci to be inherited in a non-Mendelian manner. Thus I could not investigate A. limbatum population structure and focused solely on B. hydrosauri. The first part of this study tested predictions of a model formulated to explain B. hydrosauri transmission dynamics. The ripple model, based on detailed ecological and behavioural data on B. hydrosauri and Tiliqua rugosa, B. hydrosauris most common host, predicts higher relatedness among larvae than among nymphs or adults on a host, and significant spatial autocorrelation in larvae extending further than for the later life stages. The model also predicts that adult ticks are likely to encounter related partners and that this will generate inbreeding within the population. I tested those predictions using nine microsatellite loci on a sample of 848 ticks (464 larvae, 140 nymphs and 244 adults) collected from 98 T. rugosa hosts at the northern edge of B. hydrosauris distribution range. My data did support all of the predictions of the ripple model and indicated that the dynamics of transmission among hosts play an important role in parasite population structure. The second part of this project focused on investigating the population genetic structure of B. hydrosauri at the edge of its geographic range and testing the predictions of a population model derived to explain B. hydrosauris parapatric boundary with A. limbatum. The ridge and trough model suggested the tick population was organised spatially into a series of ridges where tick density was high and troughs where it was low. Genetically, the expectation was to find clusters of more closely related individuals associated with the ridges. Cluster analysis of microsatellite allele frequencies and analysis of molecular variance of mitochondrial haplotype frequencies revealed the presence of four genetic clusters within a sample of 244 B. hydrosauri adults. As the highly genetically divergent clusters had overlapping distributions, and in some cases were syntopic, the genetic population structure predicted for these ticks by the ridge and trough model was not observed. Several explanations were considered for the observed B. hydrosauri genetic population structure, but syntopy of the clusters suggested that assortative mating is the most likely. I speculated that the clusters have formed in allopatry, when the environment was extremely heterogeneous, such that the ticks (and their hosts) were confined to isolated patches of high-quality habitat. Given sufficient time, this could have resulted in reproductive incompatibility between ticks occupying different patches. The population structure I uncovered indicates subsequent secondary recontact of divergent groups. Although my study allowed for a better understanding of B. hydrosauri biology and population structure, the reasons for the parapatric distributions of B. hydrosauri and A. limbatum are still unclear. Further research should focus on investigating the population genetic structure of A. limbatum at the edge of its range, as well as on performing a larger-scale study of B. hydrosauri population genetic structure and a more detailed investigation of the applicability of the ridge and trough model to this tick species. Moreover, it will be useful to inspect the population structure of both these species within the centers of their ranges and compare these findings with population structure found at the edge of the range.

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Benjelloun, Badr. "Diversité des génomes et adaptation locale des petits ruminants d’un pays méditerranéen : le Maroc." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAV011/document.

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Abstract:

Les progrès technologiques récents nous permettent d'accéder à la variation des génomes complets ce qui nous ouvre la porte d'une meilleure compréhension de leur diversification via des approches de génomique des populations et de génomique du paysage. Ce travail de thèse se base sur l'analyse des données de génomes complets (WGS) pour caractériser la diversité génétique des petits ruminants (chèvre et moutons) et rechercher les bases génétiques d'adaptations locales.Dans un premier temps, ce travail appréhende un aspect méthodologique et examine la précision et le biais de différentes approches d'échantillonnage des génomes pour caractériser la variabilité génétique, en les comparant aux données WGS. Nous mettons en évidence un fort biais des approches classiques (i.e. puces à ADN, capture de l'exome) ainsi que des séquençages de génomes à faibles taux de couverture (1X et 2X), et nous suggérons des alternatives basées sur un échantillonnage aléatoire de marqueurs dont la densité est variable selon les objectifs d'étude (évaluation de la diversité neutre, déséquilibre de liaison, signatures de sélection). Le jeu de données produit a permis d'évaluer l'état des ressources génétiques de différentes populations domestiques (races locales marocaines, iraniennes, races industrielles) et sauvages (aegagre, mouflon asiatique). Nous relevons une très forte diversité génétique dans les populations indigènes et sauvages qui constituent des réservoirs d'allèles et peuvent jouer un rôle important pour préserver le potentiel adaptatif des petits ruminants domestiques dans un contexte de changement climatique. L'étude plus approfondie des populations de chèvres du Maroc montre une forte diversité génétique faiblement structurée géographiquement, et met en évidence des portions de génome présentant des signaux de sélection. Leur étude montre l'existence de mécanismes adaptatifs potentiellement différents selon les populations (e.g. transpiration/halètement dans l'adaptation probable à la chaleur).Enfin, nous explorons les bases génétiques de l'adaptation locale à l'environnement chez les moutons et chèvres via une approche de génomique de paysage. En scannant les génomes de 160 moutons et 161 chèvres représentant la diversité éco-climatique du Maroc, nous identifions de nombreux variants et gènes candidats qui permettent d'identifier les voies physiologiques potentiellement sous-jacentes à l'adaptation locale. En particulier, il apparait que les mécanismes respiratoires et les processus cardiaques joueraient un rôle clé dans l'adaptation à l'altitude. Les résultats suggèrent que les chèvres et moutons ont probablement développé différents mécanismes adaptatifs pour répondre aux mêmes variations environnementales. Cependant, nous identifions plusieurs cas probables de voies adaptatives communes à plusieurs espèces. Par ailleurs, nous avons caractérisé les patrons de variations du niveau de différenciation de régions chromosomiques sous sélection en fonction de l'altitude. Cela nous permet de visualiser la diversité des réponses adaptatives selon les gènes (par exemple, sélection de variants à faible et/ou haute altitude). Ainsi, ce travail pose les bases de la compréhension de certains mécanismes d'adaptation locale
Recent technological developments allow an unprecedented access to the whole genome variation and would increase our knowledge on genome diversification using population and landscape genomics. This work is based on the analysis of Whole Genome Sequence data (WGS) with the purpose of characterising genetic diversity in small ruminants (sheep and goats) and exploring genetic bases of local adaptation.First, we addressed a methodological aspect by investigating the accuracy and possible bias in the widely used genotyping approaches to characterize genetic variation in comparison with WGS data. We highlighted strong bias in conventional approaches (SNP chips and exome capture) and also in low-coverage whole genome re-sequencing (1X and 2X), and we suggested effective solutions based on sampling panels of random markers over the genome depending the purpose of the study (assessing neutral diversity, linkage disequilibrium, selection signatures). The various datasets produced allowed assessing genetic resources in various domestic (Moroccan and Iranian indigenous breeds and industrials) and wild populations (bezoars and Asiatic mouflons). We identified a very high diversity in indigenous and wild populations. They constitute a reservoir of alleles allowing them to play a possible key role in the preservation of these species in the context of global changes. The deep study of Moroccan goats showed a high diversity that is weakly structured in geography and populations, and highlighted numerous genomic regions showing signatures of selection. These regions identified different putative adaptive mechanisms according to the population (e.g. panting/sweating to adapt to warm/desert environment).Then, we explored genetic bases of local adaptation to the environment in sheep and goats using a landscape genomics framework. We scanned genomes of 160 sheep and 161 goats representing the eco-climatic Moroccan-wide diversity. We identified numerous candidate variants and genes, which allowed for identifying physiological pathways possibly underlying local adaptation. Especially, it seems that respiration and cardiac process have key roles in the adaptation to altitude. Our results suggest dissimilar adaptive mechanisms for the same environment in sheep and goats. However, we highlighted several cases of common metabolic pathways in different species. Moreover, we characterized some patterns for the variation of genetic differentiation in some candidate genomic regions over environmental gradients. This allowed us to visualise different adaptive reaction depending genes. This work points the way towards a better understanding of some mechanisms underlying local adaptation

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Salles, Océane. "Potentiel évolutif d'une population naturelle de poissons coralliens à fort auto-recrutement dans un environnement variable." Thesis, Paris, EPHE, 2016. http://www.theses.fr/2016EPHE3071.

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Abstract:

Le potentiel évolutif des populations naturelles à répondre aux changements environnementaux détermine leur capacité à s'adapter et à survivre. Pour achever une évolution adaptative, la fitness doit être héritable, i.e. doit être transmise des parents à leurs descendants par des gènes. Pour pouvoir mesurer le potentiel évolutif d'une population en milieu naturel, il est primordial d'avoir au préalable des informations sur la fitness des individus qui la composent, mais aussi de connaître la fitness de leurs descendants. Les mesures de fitness sont extrêmement rares, en particulier pour les espèces marines, où les relations entre les générations sont rarement connues. Dans cette thèse, je présente le premier pedigree construit pour une population de poissons marins sur la base du suivi génétique mené depuis plus de 10 ans sur les poissons-clowns orange de l'île de Kimbe (Papouasie-Nouvelle Guinée). Le pédigrée comprend 2927 individus et révèle une philopatrie natale sur 5 générations. L'approche en génétique quantitative révèle que la fitness locale a une très faible valeur d'héritabilité (<1%). La variation génétique additive et les effets maternels sont également très faibles (<1%). En revanche, l'habitat est le principal facteur qui explique les différences de fitness locale observées entre les individus (jusqu'à 96,5%). Ensemble, ces résultats suggèrent que, bien que l'environnement impose une forte pression de sélection sur la fitness locale, la population de poissons-clowns orange a un très faible potentiel d'évolution face aux changements environnementaux
The evolutionary potential of wild populations to respond to environmental change will determine their capacity to adapt and survive. However, in order to achieve evolutionary change, variation in the contribution of an individual to the next generation — its fitness — must have a genetic basis and be heritable. The study of the evolutionary potential of populations requires longitudinal and relatedness data with different environments to partition the contribution of genes, maternal effects and environment on fitness. Estimates of genetic heritability of fitness traits are extremely rare, especially for marine species, where inter-generational relationships are rarely known. Here, we present the first multi-generational pedigree for a marine fish population by repeatedly genotyping all individuals in a population of the orange clownfish (Amphiprion percula) at Kimbe Island (Papua New Guinea) over a 10-year period. Based on 2927 individuals, our pedigree analysis revealed that longitudinal philopatry was recurrent over five generations. We show that local reproductive success has a very low (<1%) but significant heritability. We also show that additive genetic variation and maternal effects on local fitness are both extremely low (<1%). Habitat is the major driver that explain differences in the contribution of individuals to the next generation in the local population (until 96.5%). Together these results suggest that while the environment imposes strong selection pressures on the local fitness, the low heritability indicates the orange clownfish population has little evolutionary potential to adapt to local environmental changes

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Rawle, Timothy David. "Stellar populations of local cluster early-type galaxies." Thesis, Durham University, 2009. http://etheses.dur.ac.uk/2123/.

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Abstract:

This thesis investigates local cluster early-type galaxies, combining new spectroscopy with multi-wavelength imaging. We probe the stellar content of elliptical and lenticular galaxies, exploring the interconnection between age, chemical composition and dynamical substructure. We analyse the ultraviolet-infrared colour-magnitude relation, using new GALEX imaging of quiescent red-sequence galaxies in local clusters, and confirm that the intrinsic scatter is an order of magnitude larger than for the analogous optical relation. We compare the UV-IR colours to spectroscopic stellar populations parameters, and find a strong correlation with metallicity (albeit still with a large scatter), and only a marginal trend with age. We argue that the UV upturn is not significant in this sample, and demonstrate that the intrinsic scatter could be attributed to simple frosting by either a young or low metallicity subpopulation. We present a comprehensive study of the internal gradients in age, metallicity and a-element abundance for 25 cluster early-type galaxies, using data from the VLT VIMOS integral field unit. We find negative metallicity gradients, with a large intrinsic scatter for galaxies with σ ≥ 130 km s-(^1) which we speculate could be the lower limit for a formation history dominated by major mergers. Stellar population gradients are primarily related to the central metallicity: early-type galaxies with super-solar centres have steep negative metallicity gradients and positive age gradients; those with solar metallicity centres have negligible [Z/H] gradients and negative age gradients. B-R colour gradients predicted from the spectroscopic age and metallicity generally agree well with those measured directly from photometry. There is a strong observed anti-correlation between the gradients in age and metallicity. While a part of this trend can be attributed to correlated measurement errors, we demonstrate that there is an underlying intrinsic relation. We present new CMOS long-slit observations of seven edge-on lenticular galaxies in the Coma cluster, probing to several disc scale lengths in each. We strongly confirm that these S0s are significantly offset in luminosity from the spiral Tully-Fisher relation, and show that the size of this offset is correlated with projected local density. However, there appears to be no difference in the mean offset between S0 samples from various global environments (i.e. group and cluster). We derive the radial trends in the stellar populations, and find generally regular profiles consistent with those observed in the VIMOS sample. Significant deviations from the general radial trends coincide with structural and kinematic boundaries. We find that the age of the disc component is correlated with the offset from the Tully-Fisher relation, and agrees well with simple models of abrupt star formation truncation in a spiral disc. We show that SO discs tend to be older and more metal poor than the central regions, supporting the theory of bulge growth alongside disc quenching, during S0 formation

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Meyer, Claire-Lise. "Évolution des populations métallicoles d’Arabidopsis halleri (Brassicaceae) : étude sur les traits et sur le génome en populations naturelles." Thesis, Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10056/document.

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Abstract:

Les milieux métallifères d’origine anthropique sont des habitats particulièrement stressants pour les êtres vivants du fait des fortes concentrations en métaux lourds et des changements environnementaux profonds qui y sont présents. Certaines espèces, dites métallophytes, sont capables de se développer dans ces milieux extrêmes. Parmi ces espèces, les pseudométallophytes (qui peuvent se développer à la fois dans des sites pollués et dans des sites non pollués) constitue des modèles particulièrement intéressants pour étudier l’adaptation locale et l’influence des différences forces évolutives dans la différentiation phénotypique entre populations. Arabidopsis halleri est une espèce pseudométallophyte modèle pour l’étude de la tolérance et de l’hyperaccumulation des métaux du fait de sa proximité avec l’espèce prééminente A. thaliana. Des études préalables sur la tolérance et l’hyperaccumulation du zinc chez cette espèce ont suggéré une possible évolution des populations métallicoles sous l’effet des fortes concentrations en métaux. Notre objectif a donc été de mieux comprendre les mécanismes évolutifs prenant place dans ces populations. Pour cela nous avons proposé d’utiliser la génomique des populations ainsi que l’expérimentation en milieu contrôlé et ce à une échelle locale. Nous avons tout d’abord cherché des traces de sélection dans le génome de cette espèce par une approche de criblage génomique sur 820 marqueurs AFLP. Nous avons pu identifier des locus potentiellement sous sélection dans les populations métallicoles qui constituent de bons candidats pour l’adaptation aux sites métallifères. De manière intéressante, certains candidats sont spécifiques à des populations ce qui suggère une évolution convergente ou des pressions de sélection différentes entre les sites. Une partie de ces candidats a été cartographiée chez A. thaliana dans le but de définir des gènes candidats. Nous avons dans un deuxième temps cherché à comprendre l’influence des différentes forces évolutives dans la distribution de la tolérance au zinc chez A. halleri. La tolérance au zinc de populations a été caractérisée par des mesures morphologiques et physiologiques et l’influence de la sélection par une approche Qst/Fst. Nos résultats suggèrent que, pour les populations échantillonnées, la tolérance au zinc augmente dans les populations métallicoles sous l’effet de la sélection. Cette sélection s’exerçant potentiellement sur la variabilité présente dans les populations non métallicoles ancestrales. Enfin, la dernière partie de cette étude s’intéresse à l’association entre les génotypes et les phénotypes de la tolérance au zinc
Due to the high concentration of heavy metals and the important environmental modifications, ecological conditions of metalliferous sites are very stressing for most organisms. A few plant species, coined “metallophyte”, have acquired the capacity to grow on heavy metal contaminated soils. Among this group, the pseudometallophyte species (able to grow on contaminated as well as on non contaminated soils) constitute highly relevant models to study local adaptation and relative influence of evolutionary forces in shaping phenotypic differentiation among populations The pseudometallophyte plant Arabidopsis halleri is a model species for tolerance and hyperaccumulation of heavy metal because it is a close relative of the pre-eminent species A. thaliana. Previous studies on heavy metal tolerance and hyperaccumulation of A. halleri suggested evolution of metallicolous populations in response to high level of metal exposure. In order to investigate the evolutionary processes in neighboring metallicolous and non-metallicous A. halleri populations, we adopted population genomics and phenotyping approaches. First we explored the A. halleri genome to detect signatures of directional selection. We performed a genome-wide scan analysis using 820 AFLP markers. We identified some loci potentially under selection in metallicolous populations that constitute high-quality candidates for general adaptation to metalliferous sites. Interestingly, some candidates were population specifics, suggesting the possibility of convergent evolution or existence of different selection pressure in the different sites. Some of these candidates were mapped on A. thaliana genome to identify candidate genes. Our second objective was to evaluate the contribution of selection versus other forces in shaping distribution of zinc tolerance in A. halleri. We measured morphological and physiological traits to estimate zinc tolerance and role of selection was inferred using Qst/Fst approach. Our results suggest that, in the sampled populations, zinc tolerance has been increased in metallicolous populations through selection on standing variation within local non-metallicolous ancestral populations. The last part of this study focuses on looking for a link between genotype and phenotype of zinc tolerance

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Morin, Benjamin R. "The Effect of Static and Dynamic Spatially Structured Disturbances on a Locally Dispersing Population Model." Fogler Library, University of Maine, 2006. http://www.library.umaine.edu/theses/pdf/MorinBR2006.pdf.

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HENON, NICOLAS. "Longevite familiale et sporadique (etude de 19 marqueurs polymorphes dont 14 sont localises dans le complexe majeur d'histocompatibilite, dans deux populations longevives comparees a une population temoin)." Paris 7, 1998. http://www.theses.fr/1998PA077325.

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Abstract:

Nous avons etudie le polymorphisme allelique de neuf loci de la region du cmh (dmb, lmp2, lmp7, tap1, tnf, tnf, hla a, hla b et hla dr) dans deux populations agees (90 ans) comparees a une population temoin composee de 429 sujets non apparentes plus jeunes (17 a 73 ans) apparies pour leur origine regionale de naissance en france. Les populations agees sont divisees en deux groupes. Le premier inclut 337 centenaires sans antecedents familiaux de longevite (c). Le second compte 102 nonagenaires provenant de 66 fratries (n). Le but de ce travail est de comparer les polymorphismes en terme de frequence des marqueurs, dans les populations longevives et temoin. Nous avons aussi etudie la composition des haplotypes deduits dans les paires de germains nonagenaires. Une augmentation statistiquement significative de la frequence allelique de hla dr11 a ete observee chez les nonagenaires comparee aux temoins (pc<0,04%). Cette difference est observee uniquement chez les femmes nonagenaires (pc<1 10 - 3). Apres correction, seuls quelques alleles hla classe i presentent des differences significatives entre populations longevives et temoins. Hla a30 est diminue chez les centenaires femmes (pc<5 10 - 5), l'allele hla a24 est augmente chez les nonagenaires femmes (pc<0,03). Pour la premiere fois, une association significative entre les alleles du tnf et du tnf a ete observee dans les deux populations longevives, comparees a la population temoin : tnf ncoi (pc<0,02) et tnf ncoi+ (pc<0,007). Nos observations favorisent plutot l'hypothese du role fonctionnel, moleculaire des alleles associes a la longevite. En conclusion, le role du cmh en tant que facteur potentiel influencant la longevite est complexe. Il pourrait par exemple jouer un role

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Jemuce, Jaime Luis. "Gentrificação e urbanização extensiva : caso do Distrito de Boane, Província de Maputo - Moçambique." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2016. http://hdl.handle.net/10183/148307.

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Abstract:

A presente dissertação é um debate teórico-conceitual sobre os aspectos de gentrificação e urbanização extensiva no Distrito de Boane, onde a relação entre o espaço urbano e o rural é vista como determinante para o crescimento e desenvolvimento econômico em Moçambique. Neste debate, são apresentadas sob a perspectiva do uso e aproveitamento do solo, várias reflexões, a partir da ideia de que a terra em Moçambique é pública e propriedade do Estado, cabendo ao Estado a atribuição das funções sociais e econômicas sobre a mesma. O objeto do estudo é uma reflexão sobre a problemática da não prevalência dos direitos de uso e aproveitamento de terra das populações pobres que habitam certas áreas (urbanas ou rurais) e tem as suas terras expropriadas, passando a instalar-se nas áreas periféricas longínquas e desprovidas de serviços e equipamentos urbanos essenciais. O objetivo é chamar atenção para as causas e efeitos no uso e aproveitamento da terra que vem sendo desencadeado por processos designados no país por “requalificação urbana” e que, de acordo com a nossa pesquisa, poderiam ser identificados como “gentrificação” e “urbanização extensiva”. O método utilizado pela pesquisa, foi o trabalho de campo que conferiu um domínio sobre a realidade local em diversos aspectos e, permitiu perceber o quão a função social da propriedade da terra é importante para a população de baixa renda que aí reside, apesar desse direito ser reconhecido legalmente, não é implementado na sua totalidade. Na sequência faz-se uma interpretação dos múltiplos efeitos resultantes da gentrificação e urbanização extensiva, assim como a multicausalidade dos intervenientes na produção do espaço. Procura-se, nas conclusões, legitimar o direito de usos e aproveitamento de terra pelas comunidades no processo de adesão, ou resistência, aos fatores que movem ou produzem esta dinâmica no uso e aproveitamento do solo, no Distrito de Boane.
This thesis is a theoretical and conceptual debate on the issues of gentrification and extensive urbanization in Boane district, where the relationship between urban and rural areas is seen as crucial for growth and economic development in Mozambique. In this discussion, it is presented from the perspective of the use and land use, several reflections, from the idea that the land in Mozambique is public and state property, and the State assignment of social and economic functions on it. The object of study is a reflection on the problem of no prevalence of use rights and land use of the poor who inhabit certain areas (urban or rural) and have their expropriated land, going to settle in remote peripheral areas and devoid of essential services and urban facilities. The aim is to draw attention to the causes and effects in the use and enjoyment of land that has been triggered by processes designated in the country for "urban renewal" and that, according to our research, they could be identified as "gentrification" and "urbanization extensive ". The method used in the survey was the field work which gave a stranglehold on the local reality in many aspects and has allowed realize how the social function of land ownership is important for the low-income population that there lies, in spite of this right legally be recognized is not implemented in its entirety. Following makes an interpretation of the multiple effects of gentrification and extensive urbanization, as well as the multi-causality of those involved in the production. The findings, legitimate right to use and exploit land by communities in the accession process, or resistance, to the factors that drive or produce this dynamic use and land use, in Boane district.

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Gross, Thilo. "Population dynamics general results from local analysis /." [S.l.] : [s.n.], 2004. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=972885455.

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Purves, Drew William. "Local spatial structure and plant population dynamics." Thesis, University of York, 2001. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.251813.

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Holberg, J. B., T. D. Oswalt, E. M. Sion, and G. P. McCook. "The 25 parsec local white dwarf population." OXFORD UNIV PRESS, 2016. http://hdl.handle.net/10150/621732.

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Abstract:

We have extended our detailed survey of the local white dwarf population from 20 to 25 pc, effectively doubling the sample volume, which now includes 232 stars. In the process, newstars within 20 pc have been added, a more uniform set of distance estimates as well as improved spectral and binary classifications are available. The present 25 pc sample is estimated to be about 68 per cent complete (the corresponding 20 pc sample is now 86 per cent complete). The space density of white dwarfs is unchanged at 4.8 +/- 0.5 x 10(-3) pc(-3). This new study includes a white dwarf mass distribution and luminosity function based on the 232 stars in the 25 pc sample. We find a significant excess of single stars over systems containing one or more companions (74 per cent versus 26 per cent). This suggests mechanisms that result in the loss of companions during binary system evolution. In addition, this updated sample exhibits a pronounced deficiency of nearby 'Sirius-like' systems. 11 such systems were found within the 20 pc volume versus only one additional system found in the volume between 20 and 25 pc. An estimate of white dwarf birth rates during the last similar to 8 Gyr is derived from individual remnant cooling ages. A discussion of likely ways new members of the local sample may be found is provided.

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Rousseau, Alain. "Archipel Bolama-Bijagos en Guinée-Bissau : population locale et développement planifié /." Thèse, Chicoutimi : Université du Québec à Chicoutimi, 1990. http://theses.uqac.ca.

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Seno, Alves Daiane. "Participation et tourisme : quelle place pour la population ? Une étude exploratoire d'initiatives participatives au Brésil." Thesis, Montpellier 3, 2018. http://www.theses.fr/2018MON30009/document.

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Abstract:

Les débats autour du « durable » retournent le regard du développement vers le local. La participation citoyenne commence ainsi à intégrer les projets de développement territorial en tant qu’outil pour faire rapprocher les habitants aux décisions et aux décideurs de projets, en même temps qu’ils se réapproprient leur territoire. Les publications apparues autour de la participation jusqu’à présent se dédient notamment à sa définition et moyens. Certaines se positionnent dans un contexte précis et nous donnent des idées plus concrètes du terrain. Cependant, la plupart de recherches sur la participation et la concertation analysent soit des cas liés à la gestion de ressources naturelles (gestion de l’eau ou des forêts...), soit de l’aménagement urbain. Il existe pourtant une activité qui est encore peu étudiée et qui touche l’ensemble des caractéristiques du territoire : le tourisme. Peu d’ouvrages (notamment sur le tourisme solidaire ou responsable) sont dédiés à analyser l’importance du développement participatif dans le domaine. Nous souhaitons étudier ce type de développement dans le tourisme de manière globale afin de comprendre les relations complexes entre la population, les décideurs, les autres acteurs, le projet, le territoire et les touristes. Même si nous nous inspirons des cas de développement participatif dans d’autres domaines, il restera toujours une marge de différence assez significative entre eux et le tourisme. C’est pourquoi nous croyons que des analyses plus précises d’un développement participatif dans le tourisme doivent être menées en parallèle. Ces analyses cherchent comprendre tout d’abord dans quelles mesures ce type de développement est important pour l’évolution durable du tourisme pour ensuite déterminer les niveaux de participation plus pertinents et comment les mettre en oeuvre. Ce travail a un caractère exploratoire et cherche développer une compréhension théorique du(des) rôle(s) de la participation citoyenne aux décisions et projets touristiques. Même si cette recherche devrait être considérée plus exploratoire que comparative, nous avons autant l’ambition de tracer quelques comparaisons vers la fin. La motivation première de cette étude concerne la nécessité d’impliquer les habitants dans les politiques et projets touristiques locaux. Ainsi, la question globale de la recherche a été identifiée : la participation de la population peut-elle représenter un facteur de durabilité pour le développement d’un tourisme plus inscrit dans le territoire ? À partir de là, d’autres questionnements sont faits : Quelle est la réalité de la participation citoyenne dans les décisions touristiques ? Les avis de la population sont-ils pris en compte par les autorités responsables ? Comment cette implication peut-elle influencer à la fois le tourisme installé sur le territoire (images, valorisation, accueil, flux...) et la vie quotidienne des habitants (qualité, sentiments, aménités, relations...) ?
Debates around “sustainability” focus the development on the local level. Citizen participation becomes therefore part of territorial development projects as a tool that at the same time brings closer inhabitants and projects decision-makers and allows the first ones to reappropriate their territory. Publications about participation so far worry about its definition and the necessary means. Some talk about more precised contexts and give us real concrete ideas. Nevertheless, research about participation and dialogue analyzes either cases of natural resources management (e.g. water or forests management) or city planning. There is however a less studied activity which touches all the characteristics of a territory: tourism. Few texts (mainly about solidarity or responsible tourism) are dedicated to the analysis of the importance of participatory development in the sector. We propose a general study of this kind of development in tourism in order to understand complex relations between population, decision-makers, other actors, projects, territory and tourists. Even if we get inspired by cases of participatory development in other fields, there will always be a large margin of difference between them and tourism. That is why we believe that more specific analyses of participatory development in tourism must be drawn in parallel. These analyses try firstly to understand in which ways this kind of development is important to a sustainable evolution of tourism. In this way, later on the study it is possible to determine the pertinent levels of participation and how to employ them. This work has an explorative character and seeks to develop a theoretical understanding of citizen participation role(s) in touristic decision-making and projects. Even though the study should be considered as explorative rather than comparative, our ambition is to make some comparative notes by the end of it. The initial research problem motivating this study concerns the need of involvement of inhabitants in local touristic politics and projects. Hence, one overall research question has been defined: Can people’s participation represent a factor of sustainability to the development of a tourism fitting well in a territory? From that reflection, other questions are made: What is the reality of citizen participation in touristic decision-making? Are people’s opinions taken into consideration by the responsible authorities? How can this involvement influence at the same time the tourism on a territory (images, promotion, welcome, flows, etc.) and the everyday life of inhabitants (quality, feelings, amenities, relations, etc.)?

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Dissertations / Theses on the topic 'Populations locales'

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