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Dissertations / Theses on the topic 'Prédiction de structure de boucle'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 7 February 2022

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1

Santini, Guillaume. "Vers la prédiction de la structure tridimensionnelle des épingles à cheveux d' ADN et d' ARN comportant un appariement dans la boucle à partir de la théorie de l'élasticité et de la mécanique moléculaire." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066355.

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Alshukur, Malek. "On the structure of multi-thread boucle yarn." Thesis, Heriot-Watt University, 2017. http://hdl.handle.net/10399/3362.

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Abstract:
This research had two dimensions. The first one was theoretical and the geometry of doubled fancy yarn, including bouclé yarn, was modelled mathematically. As a result, the length of the effect component that is necessary to make a copy of those types of fancy yarn was estimated. Further, a geometrical model for the width of the effectthread helices in the First Spinning Zone was presented. One important benefit of this model was using it to control the structure of the bouclé yarn and to prevent the formation of faults and loops on the bouclé yarns. The second dimension was experimental. T
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3

Li, Zhan. "Nouvelle modalité de contrôle en boucle fermée de l'activation musculaire et prédiction en ligne du couple musculaire sous SEF." Thesis, Montpellier 2, 2014. http://www.theses.fr/2014MON20095/document.

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Abstract:
La stimulation électrique fonctionnelle (SEF) est une des techniques utilisées pour la rééducation ou la suppléance fonctionnelle de déficiences motrices. Un stimulateur génère des impulsions électriques qui induisent des contractions des muscles paralysés, au travers des unités motrices toujours intactes. Aujourd'hui, les systèmes fonctionnant en boucle ouverte sont majoritairement utilisés. Ils permettent aux chercheurs d'évaluer hors-ligne de la SEF. Cependant, leur réglage reste basé sur un cycle essai-erreur ce qui est loin de simplifier la mise en œuvre de systèmes en boucle fermée. Dans c
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Sedano-Pelzer, Audrey. "Design computationnel de protéines pour la prédiction de structure." Phd thesis, Ecole Polytechnique X, 2013. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00826589.

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Abstract:
Grâce aux récents progrès technologiques et à l'arrivée des séquenceurs de nouvelle génération, la quantité de données génomiques croît exponentiellement, alors que l'écart avec le nombre de structures résolues se creuse. Dans l'idéal, on aimerait pouvoir prédire par informatique la structure 3D de n'importe quelle protéine à partir de l'information de séquence seule, même en l'absence d'homologie. En effet, en dessous de 30% d'identité de séquence, les mesures de similarité de séquences ne sont plus suffisantes pour détecter l'homologie. Il faut donc mettre en place d'autres méthodes afin de
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5

Sedano, Audrey. "Design computationnel de protéines pour la prédiction de structure." Palaiseau, Ecole polytechnique, 2013. http://www.theses.fr/2013EPXX0013.

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6

Shen, Yimin. "Bioinformatique appliquée à la prédiction de structure de peptides." Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077070.

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Abstract:
Les peptides sont devenus, au cours des années récentes, une alternative de plus en plus crédible aux petits composés chimiques. Une première partie de cette thèse porte sur l'optimisation de PEP-FOLD, une approche rapide et précise de prédiction de novo de la structure des peptides. Nous montrons qu'il est possible de biaiser la recherche conformationnelle à moins de 20% de l'espace total tout en conservant la conformation native. Ce biais résulte d'une analyse a posteriori des trajectoires d'alphabet structural utilisées pour la génération 3D par PEP-FOLD. Sur la base de ce biais, nous montr
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7

Girard, Stéphanie. "Simulation numérique de matériaux microporeux : structure, stabilité, design et prédiction." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2001. http://www.theses.fr/2001VERS012V.

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Abstract:
Ce mémoire traite des contributions possibles de quelques techniques de simulations numériques à l'étude de matériaux microporeux. Après un premier chapitre d'introduction au sujet, le deuxième chapitre bibliographique présente l'évolution de la synthèse et de la structure des matériaux à charpente ouverte depuis les premières zéolithes jusqu'aux composés à très larges pores synthétisés actuellement, et évoque certaines de leurs applications. Le troisième chapitre bibliographique présente quelques-unes des principales méthodes utilisées en simulation. Les deux axes principaux qui y sont décrit
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8

Oubrahim, Rachid. "Auto-réglage PID par structure unifiée et performante." Metz, 1998. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/1998/Oubrahim.Rachid.SMZ9805.pdf.

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Abstract:
Dans ce travail, nous présentons en premier lieu une description détaillée de la commande PID ainsi que les différentes méthodes de réglages empiriques et analytiques. Deux procédures ont été élaborées, en boucle fermée et ouverte sur l'utilisation du relais en présence d'une perturbation de charge statique pour la détermination automatique des paramètres caractérisant le modèle fréquentiel de Ziegler-Nichols incluant le gain statique. Une structure PID unifiée est présentée, où toute structure PID peut se subdiviser en deux correcteurs. L'un des correcteurs influe sur la régulation et la pour
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9

Domínguez, Del Angel Victoria. "Prédiction de relations séquence-structure-fonction : modélisation de la botrocétine, une protéine du venin de B. Jararaca : prédiction de segments potentiellement fusogènes." Paris 7, 2003. http://www.theses.fr/2003PA077037.

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10

Perriquet, Olivier. "Approche algorithmique pour la prédiction de la structure secondaire des ARN." Lille 1, 2003. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/2003/50376-2003-211.pdf.

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Abstract:
Les travaux présentés dans cette thèse se placent dans le cadre des recherches informatiques liées à la génétique (bioinformatique) et concernent plus précisément la prédicition de la structure secondaire des ARN. Les Acides RiboNucléiques- ARN - sont des polymères qu'on peut considérer comme des longues chaînes de bases symbolisées par les lettres A, U, C, G. Ces chaînes se replient dans l'espace de manière spécifique à chaque séquence et adoptent une forme globulaire compacte. La modélisation de la structure peut être hierarchisée en niveaux de précision croissante: structure primaire (la sé
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Boudard, Mélanie. "Prédiction de structure tridimensionnelle de molécules d’ARN par minimisation de regret." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLV026/document.

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Abstract:
Les fonctions d'une molécule d'ARN dans les processus cellulaires sont très étroitement liées à sa structure tridimensionnelle. Il est donc essentiel de pouvoir prédire cette structure pour étudier sa fonction. Le repliement de l'ARN peut être vu comme un processus en deux étapes : le repliement en structure secondaire, grâce à des interactions fortes, puis le repliement en structure tridimensionnelle par des interactions tertiaires. Prédire la structure secondaire a donné lieu à de nombreuses avancées depuis plus de trente ans. Toutefois, la prédiction de la structure tridimensionnelle est un
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Levin, Jonathan Mark. "Prédiction de la structure des protéines par homologie : structures secondaires et modélisation de la structure tertiaire." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112135.

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Abstract:
Ce travail présente de nouvelles méthodes pour extraire des informations structurales à partir d'une séquence en acides aminés et l'application de ces méthodes à la modélisation des protéines. Nous avons mis au point un algorithme d'alignement multiple pour des séquences protéiques basé sur l'algorithme de Needleman et Wunsch, mais qui n'est pas limité par le nombre et la taille des séquences protéiques à aligner. Nous avons développé une méthode de prédiction des structures secondaires, la Méthode des Homologues, basée sur les similarités entre peptides, qui prédit correctement 63% des résidu
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Pages, Guillaume. "Développements algorithmiques pour l'analyse et la prédiction de la structure des protéines." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019GREAM036.

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Abstract:
Les protéines sont omniprésentes dans les processus biologiques. Identifier leurs fonctions aide à comprendre et éventuellement à contrôler ces processus. Cependant, si la détermination de la séquence protéique est désormais une procédure de routine, il est souvent difficile d'utiliser cette information pour extraire des connaissances fonctionnelles pertinentes sur le système étudié. En effet, la fonction d'une protéine repose sur ses propriétés chimiques et mécaniques, lesquelles sont définies par sa structure. Ainsi, la prédiction, la compréhension et l'analyse de la structure des protéines
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Ait, El Faqir Marouane. "Prédiction de la structure de contrôle de bactéries par optimisation sous incertitude." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSEC036/document.

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Abstract:
L'approche de la biologie des systèmes vise à intégrer les méthodologies appliquées dans la conception et l'analyse des systèmes technologiques complexes, au sein de la biologie afin de comprendre les principes de fonctionnement globaux des systèmes biologiques. La thèse s'inscrit dans le cadre de la biologie des systèmes et en particulier dans la prolongation d'une méthode issue de ce cadre : la méthode Resource Blance Analysis (RBA). Nous visons dans cette thèse à augmenter le pouvoir prédictif de la méthode via un travail de modélisation tout en gardant un bon compromis entre représentativi
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FRANK, FABRICE. "Conformation bioactive de la substance p et structure de la boucle e3 de son recepteur." Paris 6, 1999. http://www.theses.fr/1999PA066195.

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Abstract:
Le but de ces recherches concerne l'etablissement d'un modele de structure tridimensionnelle du complexe entre la substance p (sp) et nk-1. La premiere partie de cette etude porte sur la determination de la conformation bioactive de la substance p. L'analyse structurale a ete realisee sur la base des resultats du dichroisme circulaire et de la rmn de la sp et de certains analogues -methyles. Un accent particulier a ete mis sur l'interpretation des index de deplacements chimiques, et leur correlation, dans le cas des protons amides, avec les gradients avec la temperature. Ces donnees ont ete ut
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Bourquard, Thomas. "Exploitation des algorithmes génétiques pour la prédiction de structure de complexe protéine-protéine." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00782396.

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Abstract:
Les fonctions de la majorité des protéines sont subordonnées à l'interaction avec un ou plusieurs partenaires : acides nucléiques, autres protéines... La plupart de ces interactions sont transitoires, difficiles à détecter expérimentalement et leurs structures sont souvent impossible à obtenir. C'est pourquoi la prédiction in silico de l'existence de ces interactions et la structure du complexe résultant ont été l'objet de nombreuses études depuis plus d'une décennie maintenant. Pour autant les protéines sont des objets complexes et les méthodes informatiques classiques sont trop "gourmandes"
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Tran, Thuong Van Du. "Modélisation et prédiction de la structure super-secondaire des protéines transmembranaires canaux-beta." Phd thesis, Ecole Polytechnique X, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00711285.

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Abstract:
Les protéines transmembranaires canaux-β (TMBs) se trouvent dans les membranes externes des bactéries à Gram négatif, des mitochondries ainsi que des chloroplastes. Elles traversent entièrement la membrane cellulaire et exercent différentes fonctions importantes. Vu qu'il y a un petit nombre des structures des TMBs déterminées, en raison des difficultés avec les méthodes expérimentales, il est douteux que ces approches puis- sent bien trouver et prédire les TMBs qui ne sont pas homologues avec celles connues. Nous construisons un modèle de graphe pour la classification et la prédiction de stru
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Boutassetta, Nabil. "Prédiction théorique de la structure électronique de molécules diatomiques comportant un alcalino-terreux." Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO10127.

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Abstract:
Les methodes ab initio de chimie quantique sont utilisees pour etudier la structure electronique de molecules diatomiques comprenant un atome alcalino-terreux ba ou sr (bana, bak, sr#2, srli). Les atomes sont decrits par des pseudopotentiels, le calcul hartree-fock scf est suivi d'une interaction de configurations ci avec l'algorithme cipsi. Les effets de correlation et de polarisation lies au cur sont introduits par un potentiel semi-empirique de polarisation de cur. Apres de premiers resultats theoriques et experimentaux sur bah et bali, nous avons predit les spectres des molecules isovalent
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Grigori, Laura. "Prédiction de structure et algorithmique parallèle pour la factorisation LU des matrices creuses." Nancy 1, 2001. http://www.theses.fr/2001NAN10264.

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Abstract:
Cette thèse traite du calcul numérique parallèle et les résultats de recherche portent sur la factorisation LU, telle qu'elle est utilisée pour résoudre des systèmes linéaires creux non-symétriques. En général, les calculs sur des matrices creuses ont une phase initiale de prédiction structurelle de la sortie, qui permet l'allocation de la mémoire, l'initialisation des structures de données et l'ordonnancement des tâches en parallèle. Dans ce but, nous étudions la prédiction structurelle pour la factorisation LU avec pivotage partiel. Nous nous intéressons principalement à identifier des limit
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Prana, Vinca. "Approches structure-propriété pour la prédiction des propriétés physico-chimiques des substances chimiques." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066304.

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Abstract:
Le règlement REACH nécessite l’évaluation, d’ici 2018, des propriétés physico-chimiques, toxicologiques et éco-toxicologiques des substances chimiques importées ou produites en Europe à plus d’une tonne par an. Compte-tenu du nombre de propriétés et de substances, le développement de méthodes prédictives alternatives à l’expérimentation pour l’obtention de ces propriétés est recommandé. L’objectif de cette thèse, intégrée dans le projet ANR PREDIMOL, était le développement de modèles QSPR (Quantitative Structure-Property Relationship) prédictifs pour la caractérisation des propriétés physico-c
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Ghouzam, Yassine. "Nouvelles approches pour l'analyse et la prédiction de la structure tridimensionnelle des protéines." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC217.

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Abstract:
Ce travail de thèse est une étude in silico des structures tridimensionnelles des protéines, qui a fait l’objet de 5 publications scientifiques.D’une manière plus précise, les travaux s’articulent autour de trois thématiques originales et complémentaires dans le domaine de la bioinformatique structurale : la caractérisation d’un nouvel échelon de description de la structure des protéines (les unités protéiques), intermédiaire entre les structures secondaires et les domaines.Le deuxième axe de cette thèse porte sur le développement d’une nouvelle méthode de prédiction des structures protéiques,
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Martin, Juliette. "Prédiction de la structure locale des protéines par des modèles de chaîne de Markov cachées." Paris 7, 2005. http://www.theses.fr/2005PA077154.

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Madaoui, Hocine. "Prédiction structurale et ingénierie des assemblages macromoléculaires par bioinformatique." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00553875.

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Abstract:
La caractérisation à haut débit des interactions protéines-protéines a permis d'établir les premières cartes d'interactions de différents organismes modèles, y compris l'homme. Cependant, la caractérisation structurale des assemblages protéiques reste limitée à un nombre très faible de ces interactions. En mettant en évidence une pression de sélection évolutive spécifique aux interfaces de complexes protéiques, ce travail a permis d'élucider certains mécanismes évolutifs essentiels à l'association entre protéines qui n'avaient pas été décrits jusqu'à présent. Sur cette base, une nouvelle appro
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Lamiable, Alexis. "Méthodes de théorie des jeux pour la prédiction de la structure 3D de l'ARN." Phd thesis, Université de Versailles-Saint Quentin en Yvelines, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00700679.

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Abstract:
L'objectif de cette thèse est la prédiction de la structure tertiaire des molécules d'ARN à partir de leurs séquences. L'approche présentée repose sur l'observation que leur repliement est hiérarchique et modulaire ; elle consiste, dans un premier temps, en l'extraction de ces modules (les hélices et jonctions entre hélices) et en leur classification en familles topologiques puis, dans un second temps, en une étape d'optimisation pour réunir chacun de ces modules autonomes en une molécule repliée sur elle-même et stable. Ce repliement repose sur une approche algorithmique de la théorie des jeu
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Allali, Oussama. "Structure et dynamique des graphes de terrain bipartis : liens internes et prédiction de liens." Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066201.

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Abstract:
Beaucoup de graphes de terrain comme les relations acteur-film ou fichier-fournisseur sont modélisables par des graphes bipartis, dont les noeuds sont divisés en deux ensembles avec des liens entre les noeuds de différents ensembles seulement. Cependant, des méthodes manquent actuellement pour analyser correctement ces graphes, la plupart des méthodes existantes étant conçues pour des graphes classiques. Une approche courante, mais limitée, consiste à transformer les graphes bipartis en graphes classiques, par un procédé appelé projection. Cependant ceci entraîne une perte importante d'informa
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Jedidi, Mohamed Yassine. "Vers une meilleure prédiction des limites de formabilité des matériaux polycristallins à structure hexagonale." Thesis, Paris, HESAM, 2020. http://www.theses.fr/2020HESAE029.

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Abstract:
Cette thèse a pour objectif d’étudier la ductilité des matériaux à structure cristallographique hexagonale qui sont couramment utilisés dans différents secteurs de l’industrie, telles que les industries aéronautique et aérospatiale. Après compréhension de la physique des différents mécanismes de plasticité, tels que le glissement et le maclage, plusieurs modèles de comportement sont identifiés et enrichis pour décrire d’une manière pertinente le comportement mécanique des matériaux à structure hexagonale, à savoir l’alliage de titane et l’alliage de magnésium. Ces modèles sont intégrés numériq
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Guermeur, Yann. "Combinaison de classifieurs statistiques : application à la prédiction de la structure secondaire des protéines." Paris 6, 1997. http://www.theses.fr/1997PA066667.

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Abstract:
La combinaison de modeles a permis ces dernieres annees des avancees significatives dans le domaine de l'apprentissage statistique, que ce soit en regression ou en reconnaissance des formes. Cependant, des questions essentielles sont demeurees pratiquement inexplorees. Ainsi, les criteres gouvernant le choix d'une methode particuliere sont mal definis et l'effet de la combinaison en discrimination n'a pas ete specifiquement mis en evidence. Cette these porte sur l'une des techniques de combinaison les plus utilisees : la regression lineaire. Dans un premier temps, nous caracterisons l'effet re
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Romanet, Patrick. "Prédiction de la structure secondaire des protéines par analyse spectrale de la séquence d'hydrophobicité." Grenoble 1, 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10139.

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Abstract:
Ce travail presente trois methodes de prediction de la structure secondaire des proteines par analyse spectrale de la sequence d'hydrophobicite. Une etude comparative preliminaire sur 41 echelles d'hydrophobicite ainsi que sur differentes methodes d'analyse spectrale classiques et parametriques a ete menee pour determiner l'echelle optimale et la methode spectrale la mieux adaptee a chaque type de prediction. Les parametres des methodes de prediction ont ete evalues a partir d'une base de donnees, comportant 1028 chaines peptidiques ayant moins de 25% d'homologie (223157 residus). Les trois me
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Gimenes, Guillaume. "Traitement des gestes sans signification en mémoire de travail : Structure, stratégies et optimalisation." Thesis, Tours, 2014. http://www.theses.fr/2014TOUR2017.

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Abstract:
L’objectif de ce travail vise l’approfondissement des connaissances sur le traitement des gestes sans signification en mémoire de travail. Cette recherche se décompose en 5 études réparties sur trois temps : la caractérisation de la structure dédiée à ces stimuli ; les stratégies utilisées spontanément ; l’optimalisation des performances par des stratégies induites. Nos deux premières études montrent que les gestes sans signification sont traités par une composante dédiée en mémoire de travail. Celle-ci fonctionnerait à la manière de la boucle phonologique de Baddeley, Allen et Hitch (2011) to
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Joli, Flore. "Etude par RMN et modélisation moléculaire de la structure d'une tige-boucle d'ARNm, cible préférentielle d'oligonucléotide antisens." Paris 13, 2006. http://www.theses.fr/2006PA132015.

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Abstract:
Une cible d'oligonucléotides antisens, visant la région +1 de l'ARNm du gène PGY/MDR1 codant pour la P-gp, est constituée par une tige contenant une paire G. U et une hexaboucle riche en purine. Nous avons étudié par RMN et modélisation moléculaire ce 18 mère en portant notre attention sur les conformations des sucres et des angles du groupement phosphate. La tige est proche d'une double hélice forme A, et ce, malgré la présence du mésappariement G. U. La paire G. U, de type wobble, privilégie les interactions avec un cation. La partie supérieure de la tige est soumise à des distorsions optimi
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Ducongé, Frédéric. "Sélection in vitro d'aptamères ARN pouvant interagir avec la structure ARN TAR du VIH-1." Bordeaux 2, 1999. http://www.theses.fr/1999BOR28671.

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De, Brevern Alexandre. "Nouvelles stratégies d'analyses et de prédiction des structures tridimensionnelles des protéines." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2001. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00133819.

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Abstract:
Caractériser la structure tridimensionnelle des protéines avec les structures secondaires classiques est assez pauvre structurellement. Nous avons donc développé une nouvelle méthodologie pour concevoir des séries de petits prototypes moyens nommés Blocs Protéiques (BPs) qui permettent une bonne approximation des structures protéiques. L'analyse de la spécificité des blocs protéiques a montré leur stabilité et leur spécificité sur le plan structural. Le choix final du nombre de BPs est associé a une prédiction locale correcte.<br />Cette prédiction se base avec une méthode bayésienne qui perme
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Gross, David. "Nage sous marine générée par boucle de rétroaction de courbure avec modélisation de muscles locomoteurs." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019AZUR4053.

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Abstract:
L'autopropulsion basée sur la propagation d'ondes de déformation, comme pour les poissons, pourrait être une alternative intéressante par rapport au déplacement généré par des hélices pour les bateaux et les véhicules sous-marins. La locomotion par ondulations implique une flexibilité de la structure du véhicule, dont il faut prendre en compte pour la dynamique des fluides et donc quantifier la vitesse et le rendement du déplacement. Dans cette thèse, nous avons développé une nouvelle méthode d'interaction fluide-structure (IFS) liant un solveur de dynamique de structure par éléments finis ave
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Carrias, Jean-François. "La boucle microbienne en milieu lacustre : structure et fonctionnement des communautés picoplanctoniques et de protistes flagellés et ciliés." Clermont-Ferrand 2, 1996. http://www.theses.fr/1996CLF21822.

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Abstract:
Les dynamiques saisonniere et vertical des protistes, en relation avec les ressources nutritives particulaires ont ete etudiees dans deux lacs differents: le lac pavin et le lac de vassiviere. Par ailleurs, l'impact de predation des protistes phagotrophes sur les bacteries a ete estime au lac pavin. Les principaux resultats de ces etudes sont les suivants: 1) le developpement du picoplancton est essentiellement dependant de la temperature et de l'impact de predation, notamment des protistes phagotrophes 2) la distribution saisonniere et verticale des differents groupes de protistes est dependa
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Bauer, Franklin. "Une meilleure caractérisation des mécanismes d’action toxique à partir de la structure moléculaire." Thesis, Mulhouse, 2017. http://www.theses.fr/2017MULH1360/document.

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Abstract:
Connaître le mécanisme d’action (MechoA) des substances est une première étape clé pour l’évaluation de risque (éco)toxicologique. Les MechoAs désignent les interactions moléculaires entre les xénobiotiques et le matériel biologique, entraînant des effets toxiques.Des informations de MechoA ont été collectées pour des centaines de molécules chez différentes espèces, principalement le rat et le poisson. Une première méthode pour prédire les MechoAs à partir de la structure a été développée à l’aide de calculs quantiques. Elle a résulté en 70% de classifications correctes.Par la suite, une deuxi
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Gomes, Benros Cristina. "Analyse et prédiction des structures tridimensionnelles locales des protéines." Paris 7, 2005. http://www.theses.fr/2005PA077090.

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Bornot, Aurélie. "Analyse et prédiction de la relation séquence - structure locale et flexibilité au sein des protéines globulaires." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00583885.

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Abstract:
La prédiction in silico de la structure tridimensionnelle d'une protéine à partir de sa séquence en acides aminés constitue un défi scientifique d'intérêt majeur. Il est à présent admis que les structures protéiques peuvent être décrites à partir d'un répertoire limité de structures locales récurrentes. Cette observation a conduit au développement de techniques de prédiction de la structure 3D par assemblage de fragments. Ces techniques sont aujourd'hui parmi les plus performantes. Dans ce contexte, la prédiction des structures locales constitue une première étape vers la prédiction de la stru
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Bitard, Tristan. "Méthode de prédiction ab initio de la structure tertiaire des protéines dans l'espace des angles dièdres." Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077264.

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Abstract:
Les protéines sont des composantes indispensables du fonctionnement cellulaire. L'obtention d'une séquence protéique est un travail relativement aisé. La compréhension fine du fonctionnement d'une protéine nécessite l'acquisition et l'analyse de sa structure tri-dimensionnelle. L'acquisition d'une structure par des méthodes biochimiques est un travail long et coûteux. De plus certaines structures protéiques peuvent être très difficiles à obtenir. La mise en place de méthodologies informatiques pour prédire la structure d'une protéine à partir de sa séquence est donc un travail de première impo
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Camelio, Philippe. "Corrélation structure-propriétés : le modèle EVM prédiction de la température de transition vitreuse de polymères amorphes." Aix-Marseille 3, 1997. http://www.theses.fr/1997AIX30109.

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Abstract:
Nous presentons dans ce travail, un modele original pour la prediction de la temperature de transition vitreuse (t#g) de polymeres amorphes. Ce modele, appele evm (pour energie, volume, masse) permet d'estimer correctement la t#g des polymeres etudies et de mieux comprendre les effets de structure (forme et taille des groupements lateraux) parfois antagonistes qui ont une influence importante sur la t#g. Il est base sur une estimation de la flexibilite de la chaine principale represente par l'equation suivante : t#g = f((e x m)/v) developpe pour les polyacrylates et les polymethacrylates, le m
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Cailler, Mélody. "Mécanismes chimiques virtuels optimisés pour la prédiction des polluants dans des flammes turbulentes." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLC084/document.

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Abstract:
La nature conflictuelle des contraintes de performances, d'opérabilité et de respect des normes environnementales conduit les motoristes à optimiser finement la géométrie du brûleur afin d'identifier le meilleur design.La Simulation aux Grande Echelles (SGE) est aujourd'hui un outil performant et est déployé de manière courante dans les Bureaux d'Etudes pour la prédiction des propriétés macroscopiques de l'écoulement.Toutefois, de nombreux phénomènes influencés par les effets de chimie complexe, tels que la stabilisation, l'extinction de flamme et la formation des polluants, reste un problème
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Marquis-Favre, Catherine. "Construction de la fonction de transfert vibroacoustique pour la prédiction du rayonnement acoustique d'une structure sur site." Lyon, INSA, 1997. http://www.theses.fr/1997ISAL0027.

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Abstract:
L'objectif de cette étude est d'élaborer un outil permettant d'accéder au calcul du rayonnement acoustique d'une structure vibrant dans son environnement réel, à partir des seules données de vitesses vibratoires acquises sur sa surface. La difficulté de ce calcul réside dans la connaissance de la fonction de Green analytique jouant le rôle de fonction de transfert vibroacoustique entre la structure et le milieu acoustique environnant. L'approche proposée repose sur la construction numérique de cette fonction à partir d'acquisitions de vitesses vibratoires normales et de pressions acoustiques d
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Chatelain, Grégory. "Synthèse d'oligonucléotides de structure tige-boucle ou alpha phosphoramidates modifiés par des ferrocènes : application à la détection électrochimique d'acides nucléiques." Lyon 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LYO10013.

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Mohamad-Alderf, Nisrine. "Prédiction numérique des aspects instationnaires du surenfoncement dynamique d'un navire dans des chenaux fortement confinés." Compiègne, 2010. http://www.theses.fr/2010COMP1854.

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Abstract:
Nous nous intéressons à la modélisation numérique par éléments finis du phénomène de surenfoncement dynamique des navires. Il est proposé une chaîne de traitement numérique modulaire et donc interchangeable. Celle-ci permet d'étudier l'interaction entre m écoulement bidimensionnel à fond variable et à surface libre. Ce modèle est validé par m modèle malique d'équilibre dynamique basé sur l'extension de la théorie de Schijf (1949) aux effets dynamiques. L'intégration des contributions dynamiques du surenfoncement nous a permis de mettre en cause les critères de stabilité définis par les approch
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Prudhomme, Nicolas. "Prédiction des résidus clés du repliement et classification structurale de fragments protéiques en interaction." Paris 6, 2009. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00445545.

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Abstract:
Nous avons développé un algorithme de prédiction des résidus impliqués dans le noyau du repliement par des approches couplées. La prédiction des Most Interacting Residues (MIR) est associée aux méthodes d’analyse structurale par fragments, les Tightened End Fragments (TEF) et d’alignement multiple. Cet algorithme a été développé sur une banque de protéines à faible identité en séquence appartenant à une famille bien documentée, les immunoglobulines. Les résultats obtenus sont comparés à ceux produits par d’autres techniques similaires, mais aussi à ceux provenant d’études expérimentales. Comme
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Zeng, Cong. "Classification of RNA Pseudoknots and Comparison of Structure Prediction Methods." Thesis, Paris 11, 2015. http://www.theses.fr/2015PA112127/document.

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Abstract:
De nombreuses recherches ont constaté l'importance des molécules d'ARN, car ils jouent un rôle vital dans beaucoup de procédures moléculaires. Et il est accepté généralement que les structures des molécules d'ARN sont la clé de la découverte de leurs fonctions.Au cours de l'enquête de structures d'ARN, les chercheurs dépendent des méthodes bioinformatiques de plus en plus. Beaucoup de méthodes in silico de prédiction des structures secondaires d'ARN ont émergé dans cette grosse vague, y compris certains qui sont capables de prédire pseudonoeuds, un type particulier de structures secondaires d'
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Hoffmann, Brice. "Développement d'approches de chémogénomique pour la prédiction des interactions protéine - ligand." Phd thesis, École Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00679718.

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Abstract:
Cette thèse porte sur le développement de méthodes bioinformatiques permettant la prédiction des interactions protéine - ligand. L'approche employée est d'utiliser le partage entre protéines, des informations connues, à la fois sur les protéines et sur les ligands, afin d'améliorer la prédiction de ces interactions. Les méthodes proposées appartiennent aux méthodes dites de chémogénomique. La première contribution de cette thèse est le développement d'une méthode d'apprentissage statistique pour la prédiction des interactions protéines - ligands par famille. Elle est illustrée dans le cas des
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Salamero, Christophe. "Méthodologie de prédiction du niveau de robustesse d'une structure de protection ESD à l'aide de la simulation TCAD." Phd thesis, Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2005. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00126914.

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Abstract:
Les travaux de cette thèse ont consisté à développer une méthodologie permettant de prédire, à l'aide d'un outil de simulation physique, le niveau de robustesse d'une structure de protection ESD réduisant ainsi le nombre d'itérations silicium. Cette méthode ne peut être appliquée que si un calibrage minutieux de la simulation est préalablement réalisé. L'originalité de notre méthodologie repose sur le fait que la simulation ne sera réalisée que dans le domaine de validité en température des modèles physiques utilisés (c'est-à-dire pour des températures inférieures à 600K). Plutôt que d'utilise
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Belotserkovets, Anastasia. "Vers une prédiction du profil de rugosité à l'échelle mésoscopique lors de l'opération de laminage à froid." Valenciennes, 2009. http://ged.univ-valenciennes.fr/nuxeo/site/esupversions/4eafb7c6-c646-43cb-aa41-1654ba11f8dd.

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Abstract:
Une méthodologie originale, prenant en compte la présence de lubrifiant lors du laminage à froid, est développée pour mieux contrôler la rugosité finale de la bande. Pour alimenter ce modèle, il est indispensable de connaître la rhéologie de l’acier de la bande ainsi que celle de la couche grenaillée. Elle est déterminée par une méthode inverse couplant MEF et des essais de Vickers. Pour permettre de déterminer le comportement à la déformation plastique, une relation entre les conditions mécaniques de contact est établie à partir du modèle éléments finis. Le modèle de laminage à froid est comp
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Chalvet, Vincent. "Conception, réalisation et commande d'un microrobot numérique, planaire, non-redondant et en technologie MEMS." Phd thesis, Université de Franche-Comté, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00913321.

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Abstract:
Le développement récent en micro- et nano-technologies (dans des domaines tels que l'horlogerie, l'électronique, l'optique, le biomédical, . . .) a créé un fort besoin concernant des systèmes capables de manipuler et d'assembler des objets de plus en plus petits. La conception de stations robotisées, capables de manipuler des micro-objets, s'est multipliée à travers le monde, faisant intervenir des actionneurs de haute résolution adaptés au micromonde, ainsi que de nombreux capteurs. Ce mémoire ouvre une nouvelle voie pour le développement de robots de micromanipulation. Il présente la concept
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Saffarian, Azadeh. "Algorithmes de prédiction et de recherche de multi-structures d'ARN." Phd thesis, Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00832700.

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Abstract:
L'ARN (acide ribonucléique) est une molécule ubiquitaire qui joue plusieurs rôles fondamentaux au sein de la cellule: synthèse des protéines avec les ARN messagers, activité catalytique ou implicationdans la régulation, les ARN non-codants. Les nouvelles technologies de séquençage à haut-débit permettent de produire des milliards de séquences à moindre coût, posant de manière cruciale la question de l'analyse de ces données. L'objectif de cette thèse est de définir de nouvelles méthodes computationnelles pour aider à l'analyse de ces séquences dans le cas des ARN non-codants. Dans cette perspe
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