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Dissertations / Theses on the topic 'Protéines de poisson'
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Dupret, Barbara. "Etude du rôle des protéines Polycomb Pcgf1 et Ezh2 chez le poisson zèbre Danio rerio." Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL10115/document.
Full textAbstract:
Les complexes PRC1 et PRC2 contrôlent l’expression génique via l’organisation de la structure de la chromatine. Ce contrôle se fait par l’ajout de la marque H2AK119ub1 par le PRC1 et l’ajout de la marque H3K27me3 par le PRC2. Cette étude s’attache à étudier le rôle de la protéine Pcgf1 (membre du complexe PRC1) et de la protéine Ezh2 (membre du complexe PRC2) lors du développement du poisson-zèbre. Les gènes sont inactivés par TALEN. Le complexe PRC1 est formé par différentes protéines dont les Pcgf. Il existe de nombreux homologues Pcgf qui ont des fonctions distinctes. Cette étude s’intéresse au rôle de la protéine Pcgf1 lors du développement du poisson-zèbre. Les individus pcgf1-/- sont viables et fertiles. Cependant, leur développement précoce est retardé et les adultes montrent des signes de vieillissement accéléré. Ce mutant est le premier modèle de vertébré qui met en évidence le rôle de Pcgf1 dans la prolifération cellulaire lors du développement et son association au vieillissement. La protéine Ezh2 est impliquée dans le devenir cellulaire et la différenciation. Les embryons se développent normalement puis les larves meurent à 12 jours post-fécondation. De façon intéressante, les embryons de poisson-zèbre peuvent gastruler en l’absence d’Ezh2, contrairement au modèle murin. Les organes sont correctement mis en place à 5 jours post-fécondation. Les larves présentent un défaut de maintien de la paroi du bulbe intestinal. La protéine Ezh2 est importante pour le maintien du pancréas exocrine. L’absence d’Ezh2 cause une augmentation importante du nombre de cellules apoptotiques. Ezh2 est essentiel lors de la régénération de la nageoire caudalePCR1 and PRC2 are complexes that control gene expression via chromatin structure reorganization. This expression regulation is maintained by adding epigentics marks H2AK119ub1 by the PRC1 and adding of H3K27me3 by the PRC2. The study devotes to study the role of the protein Pcgf1 (part of the PRC1 complex) and of the Ezh2 protein (part of the PRC2 complex) during the zebrafish development. The PRC1 complex is formed by different proteins including Pcgf proteins. There are several Pcgf homologs that have different functions. The study reveals that some Pcgf proteins have a different expression during caudal fin regeneration and development. We are interested in Pcgf1 protein during the zebrafish development. The pcgf1 gene was inactivated by using TALEN. The fish pcgf1-/- are viable and fertile. However, the early development is delayed and adults show signs of accelerated aging. This mutant is the first vertebrate model showing the role of Pcgf1 in cells proliferation during development and aging. Ezh2 protein is involved in cell-fate decisions and differenciation. Inactivation of ezh2 gene by TALEN reveals the essential role of Ezh2 during development. Indeed, at the beginning embryos develop normally then larvae die at 12 days post-fertilization. Interestingly, zebrafish embryo can gastrulate without Ezh2. This contradicts with observations in mouse model. The organs are properly formed at 5 days postfertilization. Larvae show defects in the intestinal bulb wall. Ezh2 is important for exocrine pancreas maintenance. The absence of Ezh2 causes an increase in apoptic cells. Ezh2 is essential during caudale fin regeneration
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Galland-Irmouli, Anne-Valérie. "Etude des propriétés allergéniques et nutritionnelles de protéines d'origine marine : cabillaud, algue rouge Palmaria palmata." Nancy 1, 1999. http://www.theses.fr/1999NAN11012.
Full textAbstract:
Dans une première partie, nous avons purifié par précipitation au sulfate d'ammonium, chromatographie sur hydroxylapatite et électrophorèse préparative un nouvel allergène de 41 kDa du cabillaud. La détermination de sa séquence N-terminale a montré qu'il s'agissait d'une glycéraIdéhyde-3-phosphate-deshydrogénase. Son allergénicité a été confirmée par western-blot avec des sérums de patients allergiques au cabillaud. Une sonde immunologique a été préparée. Elle a permis de détecter cet allergène de 41 kDa, purifié à partir d'un filet de cabillaud pre rigor mortis, dans des filets de cabillaud commerciaux, surgelé ou frais et dans des filets surgelés de colin, merlan, limande, saumon et thon. Dans une seconde partie, nous avons évalué les opportunités de valorisation de l'algue Palmaria palmata. Cette algue s'est confirmée être une source potentielle de protéines contenant la majeure partie des acides aminés essentiels. La digestion in vitro des protéines de cette algue s'est toutefois avérée modérée. Cette faible digestibilité était sans doute due à la présence de fibres solubles (xylane). La digestibilité des protéines de l'algue a pu être améliorée par une fermentation préalable de l'algue par Aspergillus oryzae et/ou Trichoderma pseudokoningii. Deux voies de purification de la phycoérythrine ont été mises au point: par l'électrophorèse préparative et par IMAC qui a donné de meilleurs rendements. La phycoérythrine obtenue a présenté un spectre caractéristique de la R-phycoérythrine (maximum d'absorption à 499, 545 et 565 nm) et un maximum de fluoresœnce à 578 nm. Une seule bande protéique de 240 kDa a été détectée en électrophorèse native. L'électrophorèse SDS-PAGE a montré deux bandes majoritaires de 20 et 21 kDa et une minoritaire de 30 kDa. Ces observations sont en accord avec une composition sous-unitaire de type (αβ)6γ, caractéristique de la R-phycoérythrine. La phycoérythrine ainsi purifiée a montré une bonne stabilité jusqu'à 60°C et entre pH 3,5 et 9,5.
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Ouellet, Véronique. "Effets de la protéine de morue sur la sensibilité à l'insuline chez des hommes et des femmes résistants à l'insuline." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26307/26307.pdf.
Full text
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Mahuzier, Alexia. "Etude de la fonction du gène rpgrip1l dans les processus de différenciation et de polarité cellulaire chez le poisson-zèbre." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066402.
Full textAbstract:
Le cil primaire, présent à la surface de la majorité des cellules chez les vertébrés, a un rôle primordial dans le développement embryonnaire et dans la modulation de voies de signalisation, notamment Hedgehog et Wnt. Des défauts de cette structure sont associés à des maladies héréditaires, les ciliopathies. Le gène Rpgrip1l est impliqué dans deux ciliopathies, le syndrome de Joubert de type B et le syndrome de Meckel, caractérisées par une polydactylie, des kystes rénaux et des malformations du système nerveux central. Rpgrip1l code pour une protéine localisée principalement à la zone de transition des cils, une région impliquée dans le contrôle du trafic des protéines vers et hors du compartiment ciliaire. Mon projet de thèse a porté sur les fonctions de Rpgrip1l dans les processus de différenciation et de polarité cellulaire dans le système nerveux du poisson-zèbre. Mon premier travail, basé sur la perte de fonction de rpgrip1l par injection de morpholino dans des embryons de poissons zèbre, a mis à jour une fonction de Rpgrip1l dans la mise en place de la polarité planaire via la stabilisation de dishevelled, une protéine clé de la voie Wnt/PCP. J’ai ensuite étudié les fonctions plus tardives du gène rpgrip1l et de son paralogue rpgrip1 dans la rétine, via l’analyse de lignées de poissons zèbre hypomorphes. Cette étude a montré l’existence de multiples isoformes de Rpgrip1l et suggère de nouvelles fonctions extra-ciliaires pour Rpgrip1l dans la morphogenèse des photorécepteurs. L’ensemble de ce travail devrait permettre de mieux comprendre l’origine développementale des anomalies cérébrales et rétiniennes observées dans les ciliopathiesIn vertebrates, primary cilia are present in virtually every cell and are involved in several signaling pathways such as the Hedgehog and Wnt pathways. Cilium dysfunctions have been causally linked to a group of pleiotropic and genetically heterogeneous human diseases, the ciliopathies. The human RPGRIP1L gene is one of the causal genes in Meckel and Joubert type B syndromes, two ciliopathies characterized by polydactyly, kidney cysts, and central nervous system malformations. The Rpgrip1l protein is enriched in the ciliary transition zone that establishes the ciliary gate controlling entry and exit of proteins in and out of the cilium. During my PhD, I studied the function of the Rpgrip1l gene in differentiation and planar cell polarity events that participate in brain morphogenesis. The first study, based on the loss of function of rpgrip1l by morpholino injection in zebrafish embryo, highlights rpgrip1l function in planar cell polarity via dishevelled stabilization, a core protein of Wnt/PCP pathway. Then, I studied the later functions of rpgrip1l and its paralogue rpgrip1 in the retina, using hypomorphic zebrafish. This work, by the discovery of rpgrip1l variants and description of photoreceptors defects, provides leads for new extra-ciliary functions of rpgrip1l in retinal morphogenesis. Ultimately, this work should result in a better understanding of the developmental origin of cerebral and retinal defects found in ciliopathies
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Papa, Iris. "Etude de la strie z de muscle blanc de poisson, mécanismes de destructuration et protéines impliquées : interaction capz-alpha-actinine." Montpellier 1, 1997. http://www.theses.fr/1997MON13502.
Full text
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Amanajas, Claudio Chaves. "Contribution à la préparation de concentré protéique de poissons gras en vue de résoudre le problème du faux-poisson de la pêche de crevettes sur les côtes nord-brésiliennes : recherche sur l'extraction d'eau et d'huile par solvants." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT008A.
Full textAbstract:
La pèche de crevettes correspond à une capture importante d'animaux marins dont tous ne sont pas valorises alors qu'il existe un déficit local de protéines (malnutrition). Les animaux non-conformes ou d'autres espèces constituant le faux-poisson, peuvent représenter jusqu'à 10 fois la masse de crevettes et sont rejetés, morts, a la mer. La production de produits alimentaires nobles à partir de ce poisson s'accompagne d'une grande quantité de déchets qui se rajoutent aux pertes initiales de la sélection de la pèche. L'étude réalisée montre que l'extraction des lipides peut être pratiquée à basse température et aboutir, avec peu de pertes, a un concentre protéique déshydrate, très purifie et peut être appliquée a des matières premières diverses (filet, tètes, viscères) de teneur variable en lipides. La modélisation de cette extraction avec de la farine de soja met en évidence le rôle de l'eau pour l'efficacité du procède et a permis de réaliser un fractionnement des lipides extraits. Mise à part l'élimination finale du solvant résiduel, retenu par les produits, le procède de fractionnement ne met en œuvre que des opérations de mélange et des séparations solide-liquide a basse (ou moyenne) température (environ 0c). L'efficacité des séparations solide-liquide due aux différences de masse spécifique des liquides et des solides, favorise considérablement les extractions. De plus, l'utilisation de la rupture in-situ de l'azéotrope (hexane-éthanol) permet d'obtenir un pré-raffinage des fractions lipidiques ce qui doit faciliter leur purification ultérieure en vue d'usages spécifiques. Le concentre protéique, après élimination de l'alcool et broyage, se classifie facilement en protéines de haute pureté (supérieur à 90%) avec très peu de lipides (inferieur a 2% sur sec) et en déchets (écailles, arêtes)
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Richard, Lenaïg. "Conséquences métaboliques du remplacement de la farine de poisson par des protéines végétales chez la crevette géante tigrée (Penaeus monodon)." Thesis, Bordeaux 1, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR14256/document.
Full textAbstract:
De part son profil équilibré en acides aminés essentiels (AAE), la farine de poisson (FP) est la source protéique principale utilisée dans l’alimentation des crevettes d’élevage. Cependant, compte tenu des enjeux du développement durable de la production aquacole, son utilisation doit être réduite, et remplacée par d’autres sources protéiques comme les protéines végétales (PV), qui sont souvent carencées en lysine et méthionine mais riches en cystine. Les conséquences d’un tel changement alimentaire sont peu connues chez la crevette tigrée Penaeus monodon. Pour les évaluer, nous avons utilisédes aliments semi-purifiés reflétant les carences/excès en AA des PV pour estimer les besoins en protéine, lysine et méthionine pour l’entretien et la croissance. Tout en confirmant les données antérieures sur les besoins pour la croissance des stades postlarves, nous avons pu préciser la contribution de l’apport en ces deux acides aminés pour l’entretien. Au niveau métabolique, la variation de l’apport protéique (10, 30, 50% protéine brute) et la carence en méthionine (-30% par rapport au besoin) entraînent une modification de l’activité des enzymes du catabolisme des AA, mais pas celle des voies de reméthylation et transsulfuration. En revanche, et pour la première fois chez la crevette, nos résultats démontrent une épargne de la méthionine par la cystine (et la choline), soulignant l’importance de l’apport en AA soufrés totaux (methionine + cystine). Nos résultats illustrent aussi l’importance qu’il convient d’accorder à la disponibilité des AAE dans les études de remplacement de la FP par un mélange de PV pour améliorer l’utilisation azotée chez la crevette P. monodonDue to its well balanced essential amino acid (EAA) profile, fishmeal (FM) is the major protein source used in the formulation of aquafeed for cultured shrimp. To sustain farming systems, its incorporation, however, must be reduced and substituted by other protein sources less well nutritionally balanced, such as plant protein ( PP) which are often low in lysine and methionine but rich in cystine. The metabolic consequences of such a shift in dietary profile are not well known for the black tiger shrimp, Penaeus monodon. To describe these consequences, we used semi-purified diets limiting in lysine and methionine (to reflect PP profile) to determine juvenile requirements of protein, lysine and methionine for both maintenance and growth, applying a factorial approach. Our results confirm the previous data on growth requirement for post-larvalstages of P. monodon while also providing new data on maintenance requirements. At the metabolic level, a variation in the dietary protein level (10, 30, 50 % crude protein) and methionine (adequate or 30% lower) resulted in a significant change in the activity of transdeaminating enzyme, but not those of remethylation and transsulfuration. Nevertheless, we found for the first time that methionine utilisation for body protein accretion can be spared by cystine and choline (up to 50%) in this species, illustrating the importance to consider total sulphur AA supply. Our data also show that full consideration should be given to AA availability in order to develop practical diets with low FM levels for P. monodon
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Bouzaffour, Mohamed. "Voies de signalisation impliquées dans la régénération chez le poisson zèbre adulte." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077065.
Full textAbstract:
Le poisson zèbre à la capacité de régénérer à l'identique de nombreux organes et toutes ses nageoires par épimorphie. L'amputation de la nageoire caudale va induire le recrutement de cellules progénitrices du moignon vers la lésion afin de former un amas de cellules indifférenciées, le blastème, qu va permettre de régénérer la partie manquante de la nageoire. Sa formation et son devenir vont impliquer une régulation coordonnée de la prolifération cellulaire et de la morphogenèse. De précédentes études mettent en évidence le rôle primordial de voies de signalisation telles que Wnt, Fgf, Sdfl, Shh ou Bmp dans la formation et la prolifération des cellules du blastème. Au cours de ce travail, nous montrons que Sdfl a va exercer une double fonction: d'une part en relayant le signal Fgf pour la mise en place du blastème et d'autre part en participant à l'extinction de la voie Fgf via un rétrocontrôle négatif sur l'expression de fgfZOa. Cela va ainsi permettre de réguler la croissance du blastème afin de régénérer une nageoire identique à celle de départ. Un autre aspect de ce travail a permis de mettre en évidence une implication de la signalisation des hormones thyroïdiennes et de l'apoptose dans la formation du blastème. L'amputation va ainsi induire l'expression de la Déiodinase 3. Cette enzyme, qui inactive localement les hormones thyroïdiennes, est indispensable à la formation du blastème. L'analyse de l'apoptose révèle une régulation très fine de ce processus aussi bien dans le temps que dans l'espace. Son inhibition par un inhibiteur de l'activation des caspases ou son induction par l'acide rétinoïque entraine une inhibition de la régénérationZebrafish present the ability to faithfully regenerate organs and fins after an injury by a process called epimorphic regeneration. During caudal fin regeneration, the amputation triggers the recruitment of progenitor cells towards the lesion to form a mass of undifferentiated cells, the blastema, which gives rise to the lost part of the fin. Its formation and its fate involve a coordinated regulation of cell proliferation, morphogenesis and patterning. Previous studies highlight the crucial role of signalling pathways like Fgf, Wnt, Sdfl, Shh or Bmp for the blastemal cell formation and proliferation. During this study, we show that the chemokine Sdfl a has a dual role throughout the first steps of caudal fin regeneration. First, it relays the Fgf Signalling for the formation of the blastema and then it exerts, with the Wnt pathway, a negative feedback on the Fgf pathway through the inhibition of fgfZOa expression. This negative feedback permits the regulation of the blastema size in order to regenerate a fin with the same length that the original one. Another aspect of this work was the identification of novel signalling pathways involved in blastema formation. We demonstrate that thyroid hormones signalling and apoptosis are involved in this process. The amputation triggers the expression of Deiodinase 3. This enzyme regulates locally the thyroid hormones concentration and is essential for blastema formation. The analysis of apoptotic cell death shows that this process is highly regulated in time and in space. Its inhibition by caspases activation inhibitor or its induction by retinoic acid inhibits the regeneration
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Leinot, Alain. "Propriétés gélifiantes des protéines myofibrillaires (surimi) de sardines en fonction de la saison de pêche et de la durée d'entreposage réfrigéré ou congelé des poissons." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20025.
Full textAbstract:
La valorisation d'un poisson gras pelagique, la sardine de mediterranee (sardina pilchardus), a ete etudiee en utilisant la technologie japonaise de preparation de surimi (concentre de proteines myofibrillaires). Les proprietes gelifiantes de ces proteines ont ete evaluees en mesurant la texture des gels de surimi prepares par incubation en presence de nacl, et par cuisson. L'alteration progressive des proprietes gelifiantes des proteines myofibrillaires a ete systematiquement etudiee en fonction de la temperature et de la duree d'entreposage refrigere ou congele des sardines. La vitesse d'alteration est toujours plus elevee avec les sardines pechees en periode de reproduction (mars ou juin 89) qu'avec celles pechees a d'autres periodes de l'annee (octobre ou decembre 88 ou 89). Les mecanismes biochimiques responsables de l'alteration des proprietes gelifiantes des proteines myofibrillaires ont ete etudies par mesures de solubilite a diverses forces ioniques, par electrophorese, et par calorimetrie differentielle a balayage
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Picard-Deland, Éliane. "Les effets combinés d'une protéine de poisson et d'un supplément d'acides gras N-3 d'origine marine sur le profil lipidique et l'inflammation chez des hommes et des femmes résistants à l'insuline." Master's thesis, Université Laval, 2011. http://hdl.handle.net/20.500.11794/23134.
Full textAbstract:
Ce mémoire présente les travaux de maîtrise vérifiant les effets de l'ajout d'un supplément de gélatine de poisson à un supplément d'AGPI n-3 sur l'apport énergétique et le poids corporel ainsi que sur le profil lipidique et les marqueurs inflammatoire et du risque cardiovasculaire chez des sujets résistants à l'insuline. Suivant un dispositif d'expérience en chassé-croisé, 16 sujets ont été soumis à deux périodes expérimentales de huit semaines (AGPI n-3 seul et AGPI n-3+ un supplément de gélatine de poisson). Les résultats de cette étude ont montré que l'administration d'un supplément de gélatine de poisson provoque une diminution de l'apport en glucides sans modification de l'apport énergétique total et du poids corporel chez les hommes et les femmes. Ce même supplément de gélatine de poisson potentialise également les effets réducteurs d'un supplément d'AGPI n-3 sur les TG plasmatiques chez les femmes, mais non chez les hommes, montrant que l'effet de la supplementation en gélatine est dépendant du sexe.
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Dolez, Dixsaut Morgane. "Les Laminines participent à la diversification des types de fibres musculaires squelettiques et à la morphogenèse du myotome chez le poisson zébré." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066164.
Full textAbstract:
Chez le poisson zébré, la formation d’un myotome fonctionnel implique la diversification de types musculaires et la migration au travers du myotome des fibres lentes. L'expression spécifique du facteur de transcription engrailed à la fois dans les fibres lentes pionnières et les fibres rapides médianes définit un compartiment central dans le myotome. Cependant, le mécanisme qui permet de restreindre l'expression d’Engrailed à ce compartiment central n’est que partiellement élucidé. Une fois déterminées, les fibres lentes, ancrées aux frontières intersomitiques riches en Laminines, migrent latéralement au travers du myotome jusqu’à atteindre leur position latérale finale. Les mécanismes sous-jacents à cette migration remarquablement coordonnée ne sont pas compris. Le rôle des Laminines dans la diversification des types de fibres musculaires et dans les comportements cellulaires dynamiques de ces fibres est analysé à l’aide du mutant sleepy/lamc1. Nos résultats montrent que les Laminines sont requises pour l’exclusion de la signalisation Bmp du compartiment central du myotome ce qui conduit à la restriction de l’expression d’Engrailed à ce compartiment central. Les Laminines, via la régulation spatiale de la réponse au signal Bmp, et en combinaison avec le signal Hedgehog provenant de la notochorde, ont donc un rôle organisateur du myotome en créant un domaine central Engrailed positif. Nos résultats montrent également que les Laminines sont requises pour la polarisation de la morphologie des fibres lentes en migration et pour la concentration d'adhésions focales aux extrémités de ces fibres, ce qui permettrait la coordination spatiale de la migration des fibres lentes
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Pezeron, Guillaume. "Aspects moléculaires et cellulaires de la formation de l'endoderme chez le poisson zèbre." Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077046.
Full textAbstract:
Au cours la gastrulation, l'embryon de vertébré s'organise en une structure complexe composée de trois populations cellulaires distinctes, les feuillets embryonnaires, et présentant des axes antéro-postérieur et dorso-ventral morphologiquement identifiables. Au cours de ma thèse je me suis intéressé aux mécanismes moléculaires et cellulaires permettant la formation de l'endoderme, le feuillet embryonnaire le plus interne, à l'origine du tractus digestif et de l'épithélium du système respiratoire. J'ai étudié le rôle d'un nouveau gène, raslllb, sélectionné pour son expression dans le mésendoderme dorsal au début de la gastrulation. Cette étude m'a permis de montrer que Rasl11b est un modulateur négatif d'Oep qui est un corécepteur de Nodal, mais aussi qu'Oep, en plus de sa fonction de corécepteur de Nodal, peut réguler indépendamment la formation de l'endoderme. Parallèlement, j'ai analysé le comportement des cellules endodermiques in vivo en utilisant une lignée transgénique qui exprime une protéine rapporteuse fluorescente dans les cellules endodermiques. Ainsi, j'ai pu montrer que contrairement à ce qui était admis jusqu'à maintenant, l'endoderme se comporte différemment du mésoderme pendant la gastrulation et migre selon un mouvement actif de marche aléatoire. Ce mouvement permet aux cellules de l'endoderme de coloniser la surface du vitellus et ainsi de former le feuillet endodermiqueDuring gastrulation, vertebrate embryos form the tree germ layer and develop antero-posterior and dorso-ventral axis. For my thesis, I have been working on molecular and cellular aspects of endoderm formation. The endoderm is the inner-most germ layer and give rise to digestive apparatus and respiratory epithelium. I studied the function of a new gene, rasl11b, selected for its expression within dorsal mesendoderme during gastrulation. 1 have shown that Rasll Ib is a negative modulator of Oep, a Nodal coreceptor, but also that Oep, beside its Nodal coreceptor function, can independently regulate the formation of the endoderm. Beside this study, using a transgenic line that express a fluorescent reporter protein, I analysed the behaviour of endodermal cells in vivo. I have shown that endoderm behave differently from mesoderm during gastrulation and migrate in a active random walk movement. This behaviour allow endodermal cell to colonise the yolk surface and thus to form the endodermal germ layer
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Durand, Rachel. "Valorisation d'hydrolysat de poisson pour la santé humaine : séparation des composés bioactifs par électrodialyse avec membranes d'ultrafiltration et évaluation de leurs activités biologiques impliquées dans le développement du syndrome métabolique." Doctoral thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66672.
Full textAbstract:
La valorisation des co-produits de poisson est un enjeu économique et environnemental. Depuis plusieurs années, des recherches ont montré que les co-produits de poisson contenaient des molécules actives pour la santé humaine comme des acides gras polyinsaturés et des peptides bioactifs. L’objectif principal de cette thèse était d’évaluer l’utilisation potentielle d’hydrolysats de laitance de hareng pour l’amélioration de la santé humaine, spécifiquement en agissant positivement sur certaines fonctions physiologiques associées au syndrome métabolique, et l’effet de leur séparation par électrodialyse avec membranes d’ultrafiltration (EDUF) sur la production de fractions bioactives. Dans un premier temps, il a été démontré qu’une supplémentation avec différents hydrolysats de laitance de hareng d’une diète riche en gras et en sucre chez des souris permettait de moduler certains paramètres physiologiques impliqués dans le développement du syndrome métaboliques (MetS) : amélioration de la tolérance au glucose, augmentation de l’apport énergétique total et protection de la population de Lactobacillus dans le microbiote intestinal. De plus, les hydrolysats ont aussi montré des activités antiinflammatoires in vitro à des concentrations de 1ng/ml et 100pg/ml. Dans un second temps, la faisabilité d’une séparation par EDUF de deux hydrolysats de laitance de hareng différents a été évaluée : le premier plus complexe était un mélange de molécules (lipides, acides nucléiques, peptides, acides aminés libres), alors que le second était principalement composé de peptides et d’acides aminés libres. Une nouvelle configuration utilisant quatre membranes d’ultrafiltrations (deux de 50kDa et deux de 20kDa) a permis un double fractionnement simultané des composés anioniques et cationiques en seulement une étape. Il a d’abord été montré que seuls les peptides chargés ainsi que les acides aminés libres pouvaient être séparés par EDUF alors que les lipides et les acides nucléiques ne migraient pas dans les fractions de récupérations. De plus, l’utilisation de membranes présentant deux tailles de pores distinctes a permis le fractionnement des hydrolysats en différentes classes de poids moléculaires. En effet, l’utilisation de membranes de 20kDa a permis la concentration de peptides de faibles poids moléculaires (< 600Da) et IV d’acides aminés libres, alors que les populations peptidiques des fractions obtenues avec les membranes de 50kDa présentaient des poids moléculaires supérieurs et plus variés. Dans un troisième temps, les bioactivités des fractions de récupérations et des hydrolysats de laitance de hareng ont été évaluées in vitro. Ainsi, la séparation du premier hydrolysat a permis l’obtention d’une fraction finale stimulant la captation du glucose in vitro et d’une fraction anionique antioxydante. Le fractionnement du second hydrolysat a permis quant à lui la production de deux fractions cationiques anti-inflammatoires ainsi que l’identification subséquente de deux séquences peptidiques bioactives. L’ensemble de cette thèse a donc démontré que les hydrolysats de laitance de hareng contenaient des composés actifs, comme des acides gras polyinsaturés et des peptides, modulant positivement certains paramètres physiologiques impliqués dans le MetS et pouvant ainsi permettre la diminution de son occurrence. De plus, la séparation des hydrolysats par EDUF a permis la production de fractions bioactives ainsi que l’identification de deux nouvelles séquences peptidiques anti-inflammatoires (IVPAS et FDKPVSPLL). Ces travaux ont démontré l’effet bénéfique pour la santé humaine des hydrolysats de laitance de hareng et de ses fractions, permettant d’envisager une valorisation plus efficace de ces coproduits de poisson par les industries de transformation dans les secteurs liés à la santé humaine.Fish by-product valorization is an economic and environmental issue. For several years, scientific researches have shown that fish by-products contained active molecules for human health, as polyunsaturated fatty acids and peptides. The aim of this thesis was to evaluate the potential use of herring milt hydrolysates for human health, especially by evaluating their potential actions in physiological parameters involved in the metabolic syndrome and the effect of their separation by electrodialysis with ultrafiltration membrane (EDUF) for the production of bioactive fractions. First, we have demonstrated that the supplementation of three different herring milt hydrolysates in a high fat high sucrose diet in mice was able to modulate some physiological functions involved in the metabolic syndrome: improvement of glucose tolerance, increase of the total energy intake and protection against the Lactobacillus disappearance in the gut microbiota. Moreover, the hydrolysates decreased the inflammation induction in macrophages stimulated with LPS at 1ng/ml and 100pg/ml. Secondly, we have evaluated the separation of two herring milt hydrolysates by EDUF: the first one was more complex with a mix of different molecules (lipids, nucleic acids and peptides) while the second one was mainly composed of peptides. A new configuration using four ultrafiltration membranes (two of 50kDa and two of 20kDa) allowed a simultaneous double separation of anionic and cationic compounds. It has been shown that only charged peptides and free amino acids were fractionated in EDUF, while the lipids and nucleic acids didn’t migrate to the recovery fractions. Moreover, the use of membranes with different cut-off allowed a separation of the hydrolysates in different molecular weight ranges. Indeed, the use of 20kDa membranes allowed the concentration of peptides with small molecular weights (<800Da) and free amino acids, while the recovery fractions obtained with the 50kDa membranes were composed oh peptide with higher molecular weights.Thirdly, the potential bioactivities of the recovery fractions and the herring milthydrolysates were evaluated in vitro. Hence, the separation of the first hydrolysate allowed the production of a final fraction increasing the glucose uptake and an antioxidant anionicfraction. While the separation of the second hydrolysate allowed the production of two antiinflammatory cationic fractions as well as the identification of two bioactive peptides sequences. All these results showed that milt herring hydrolysate contained bioactive compounds such as polyunsaturated fatty acids and peptides, improving some physiological functions involved in the MetS and may decrease its occurrence. More over, the separation of the hydrolysates by EDUF allowed the production of bioactive fractions and the identification of two new anti-inflammatory peptide sequences. This work demonstrated the existence of a beneficial effect of herring milt hydrolysate and its fractions for the human health, allowing a better valorization of this by-product of the food industry for the health sector.
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Bonneau, Benjamin. "Implication des protéines de la famille Bcl-2 dans la régulation des flux calciques au cours du développement embryonnaire précoce du poisson zèbre." Thesis, Lyon 1, 2013. http://www.theses.fr/2013LYO10155/document.
Full textAbstract:
L'apoptose est un processus cellulaire fondamental pour l'homéostasie tissulaire. Ce type de mort cellulaire est sous le contrôle des protéines de la famille Bcl-2 qui régulent la perméabilité de la membrane externe de la mitochondrie. Cependant, au-delà de leur rôle dans le contrôle de l'apoptose, les protéines de la famille Bcl-2 peuvent intervenir dans d'autres processus tels que le cycle cellulaire ou le métabolisme. Au sein du laboratoire, nous nous intéressons tout particulièrement aux rôles non-apoptotiques des protéines Bcl-2 au cours du développement embryonnaire. Grâce à l'utilisation du poisson zèbre, nous avons pu montrer que les protéines de la famille Bcl-2 contrôlent différents processus au cours du développement grâce à leur capacité à réguler l'homéostasie calcique. En effet, nous avons montré que la protéine anti-apoptotique Nrz participe au remodelage du cytosquelette d'actine au cours de l'épibolie en régulant la concentration de calcium cytosolique par son interaction avec le récepteur à l'IP3 (IP3R). Nous avons de plus pu montrer que Nrz diminue la sortie de calcium du réticulum endoplasmique en inhibant la fixation de l'IP3 sur son récepteur. Nous avons également identifié un nouveau membre pro-apoptotique de la famille Bcl-2, Bclwav, spécifiquement exprimée chez les poissons et le xénope. Cette protéine participe à la régulation de l'homéostasie calcique mitochondriale en interagissant avec VDAC. Nous avons de plus montré que cette activité est essentielle pour les mouvements de convergence et d'extension au cours du développement embryonnaire précoce du poisson zèbreApoptosis is a key cellular process for tissue homeostasis. Apoptotic cell death is under control of Bcl-2 family proteins which regulate outer mitochondrial membrane permeability. However, beyond their role in apoptosis, Bcl-2 family proteins are also involved in other cellular processes such as cell cycle or metabolism. In our laboratory we are interested in non-apoptotic functions of Bcl-2 family proteins in embryonic development. Using zebrafish model we have shown that Bcl-2 proteins control different processes during early development thanks to their ability to regulate calcium homeostasis. Indeed, we have shown that the anti-apoptotic protein Nrz participates in actin cytoskeleton remodeling during epiboly by regulating cytosolic calcium concentration via an interaction with the IP3 receptor (IP3R). We have also demonstrated that Nrz decreases calcium release from the endoplasmic reticulum by inhibiting IP3 fixation on its receptor. We have furthermore identified a new pro-apoptotic member of Bcl-2 family, Bcl-wav which is expressed only in fish and frogs. This protein regulates mitochondrial calcium homeostasis by interacting with VDAC. We have moreover shown that this activity is essential for convergence and extension movements during early zebrafish development
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Dort, Junio. "Effet de la protéine de morue sur la régénération musculaire consécutive à une blessure chez le rat." Doctoral thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25208.
Full textAbstract:
Cette thèse visait à déterminer les effets de la protéine de morue sur la régénération post-blessure du muscle squelettique chez le rat. Nous avons observé que la croissance et la récupération de la masse musculaire étaient meilleures lorsque les animaux consommaient de la protéine de morue, conduisant à une augmentation de l’aire des fibres musculaires comparée à la caséine. Ces effets bénéfiques de la protéine de morue étaient accompagnés d’un niveau plus élevé de myogénine et d’une réduction de noyaux centraux et de l’espace interstitiel. Plus spécifiquement, cette thèse consistait à déterminer des mécanismes et à identifier un groupe d’acides aminés présent dans la protéine de morue pouvant expliquer ses effets bénéfiques. Nos résultats ont démontré que la protéine de morue, grâce à ses niveaux élevés d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine, a réduit la densité des macrophages pro-inflammatoire (ED1+) et le niveau de COX-2 tandis qu’elle a augmenté la densité des macrophages anti-inflammatoires (ED2+) comparée à la caséine. Cependant, cette réponse anti-inflammatoire ne pouvait expliquer que partiellement l’effet positif de la protéine de morue. En effet, l’ajout d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine à la caséine, bien que simulant adéquatement l’effet anti-inflammatoire, reproduisait en partie seulement la croissance et la régénération musculaire accrues observées avec la protéine de morue. De plus, nous avons observé que la protéine de morue diminuait le niveau de MuRF1 à la phase inflammatoire, indiquant une réduction de dégradation des protéines musculaires comparée à la caséine. La protéine de morue pourrait avoir aussi favorisé la protéosynthèse musculaire lors de la phase avancée du processus puisque les niveaux de phospho-Akt-Ser473 étaient augmentés. Par ailleurs, les effets hypertrophiques et anti-cataboliques de la protéine de morue n’étaient que partiellement expliqués par ses niveaux élevés d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine. En conclusion, les effets anti-inflammatoires de la protéine de morue sont attribués à ses niveaux élevés d’arginine, de glycine, de taurine et de lysine alors que ces acides aminés contribuent partiellement aux effets bénéfiques observés avec la protéine de morue sur la récupération de la masse musculaire. Ces données pourront servir de tremplin vers des traitements nutritionnels efficaces pour optimiser la régénération musculaire post-blessure.The overall aim of this thesis was to study the effects of cod protein on regeneration of skeletal muscle following injury in rats. We observed that recovery of muscle mass and/or growth were higher in animals consuming the cod protein regimen, leading to larger fiber size compared with those consuming the casein diet. The beneficial effects of cod protein on muscle regeneration were also shown by higher level of myogenin, lower number of centrally-nucleated fibers and reduced interstitial space. Specifically, the current thesis was designed to identify which specific amino acids in cod protein could underly its impact on muscle repair and to investigate the pathways supporting these effects. Our results showed that cod protein reduced the density of pro-inflammatory macrophages (ED1+) and the level of COX-2 while increasing the density of anti-inflammatory macrophages (ED2+) compared to casein, due to its high levels of arginine, glycine, taurine and lysine. However, this anti-inflammatory action could only partially explain the positive effect seen with cod protein on muscle recovery because the addition of arginine, glycine, taurine and lysine to casein, although it closely mimicked the anti-inflammatory effect of cod protein, did not support muscle growth and regeneration as did cod protein. When examining the IGF1-Akt/PKB signaling during the recovery period, we observed that cod protein decreased the level of MuRF1 early after the injury, indicating a reduced muscle protein degradation compared to casein. Data also suggest that cod protein might have increased muscle protein synthesis during the later phase of the recovery process based on an increased phospho-Akt-Ser473. Hypertrophic and anti-catabolic effects exerted by cod protein were only partially driven by its high levels of arginine, glycine, taurine and lysine. Through this work in rats, we have demonstrated that while the beneficial effects of consuming cod protein on inflammation are driven by its high levels of arginine, glycine, taurine and lysine, these amino acids only partly contribute to the effect seen with cod protein on muscle mass recovery following injury. These data could help elaborate more efficient nutritional strategies in order to optimize muscle recovery after injury.
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Gauron, Carole. "Rôle de l'apoptose et des ROS (Reactive Oxygen Species) dans les premières étapes de la régénération chez l'adulte." Paris 7, 2014. http://www.theses.fr/2014PA077208.
Full textAbstract:
Nous avons utilisé la régénération de la nageoire caudale du poisson zèbre comme modèle physiologique pour comprendre le rôle des cellules apoptotiques dans le recrutement des cellules souches chez l'adulte. Peu de temps après l'amputation, les cellules formant le moignon répondent à la blessure par dédifférenciation, en acquérant une identité de cellule progénitrice. Nous avons récemment identifié la mort cellulaire et les espèces réactives de l'oxygène (ou ROS, pour Reactive Oxygen Species) comme étant des signaux précoces régulés après blessure et amputation. La cicatrisation induit une mort cellulaire rapide et locale, tandis que l'amputation induit une seconde vague d'apoptose, spécifique de la régénération. Nous avons ensuite posé la question de la voie de signalisation engagée par les cellules apoptotiques, et un criblage chimique nous a permis d'identifier un signal purinergique. Par ailleurs, l'inhibition de la régénération par inhibition de l'apoptose peut être restaurée par de l'adénosine exogène. De façon surprenante, l'adénosine seule est suffisante pour augmenter le nombre de cellules progénitrices ainsi que pour stimuler la régénération. Afin de mieux comprendre la diffusion du signal apoptotique in vivo, nous avons mis au point des outils optogénétiques. Ces systèmes nous permettent d'induire l'apoptose et suivre sa progression in vivo. Combiné à des senseurs physiologiques fluorescents, ces outils nous permettent d'étudier de façon dynamique les effets de l'apoptose sur les cellules avoisinantesWe used regeneration of the zebrafish caudal fin as a physiological model to understand the role of apoptotic cells in stem cell recruitment in adult. Shortly after amputation, cells from the stump respond to injury by dedifferentiating and acquiring a progenitor identity. We recently identified cell death and ROS signalling as early events regulated after healing and amputation. Wound healing induces fast local cell death, while amputation induces a second round of apoptosis, specific of the regeneration. We then ask for the signalling pathway engaged by apoptotic cells and chemical screening allows us to identify a purinergic signalling. Moreover, the inhibition regeneration by inhibition of apoptosis could be rescued by exogenous adenosine. Surprisingly, adenosine alone is sufficient to enhance the number of progenitor cells and to stimulate fin regeneration. To better understand the spreading of apoptosis signalling in vivo, we implemented optogenetic tools. This system allows us to induce apoptosis and follow its progression in vivo. Combined with physiological fluorescent sensors, this allows us to investigate the dynamical effects of apoptosis on neighbouring cells
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Gibon, Guillaume. "Mécanismes moléculaires et cellulaires de la différenciation de l'endoderme pharyngien et des structures associées chez le poisson zèbre." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077149.
Full textAbstract:
Chez les vertébrés, le développement du pharynx nécessite des interactions cellulaires et moléculaires coordonnées dont l'endoderme pharyngien est l'un des acteurs clés. Un des dérivés de l'endoderme dans le pharynx sont les organes sensoriels de la gustation, les bourgeons gustatifs. Au cours de ma thèse, j'ai examiné le développement de cet organe en utilisant une approche de génétique classique et une approche pharmacologique. J'ai caractérisé le phénotype présent dans la lignée mutante OL185 obtenue par mutagenèse ENU. Ce mutant présente une réduction du nombre de bourgeons gustatifs et une altération de leur distribution dans le pharynx. De plus, la mutation altère la maturation du cartilage et de la musculature des arcs pharyngiens. Donc cette mutation affecte à la fois plusieurs composés du pharynx. La mutation OL185 a été cartographiée dans un intervalle de 1,58Mb sur le chromosome 21. D'autre part, afin d'étudier les interactions cellulaires et moléculaires intervenant au cours du développement des bourgeons gustatifs, j'ai mis au point un protocole pharmacologique qui permet d'altérer l'expression de la sérotonine dans les bourgeons gustatifs. Cet outil devrait permettre de mieux comprendre le rôle de la sérotonine au cours de la formation des bourgeons gustatifsThe development of the pharynx relies on coordinated cellular and molecular interactions, largely conserved in vertebrates. Among different components, the endoderm and its derivatives play a key role in this process. My thesis was focused on the development of an endoderm derivative, the sensory organs of taste (taste buds). I analysed the development of taste buds in zebrafish, through forward genetics and a pharmacological approach. In particular, I characterized the phenotype of the OL185 mutant line obtained through ENU mutagenesis. In OL185, the number of taste buds and their distribution are altered. In addition, the late developments of skeletal and muscular components in the pharynx are also affected by this mutation. Introduction of wild type endoderm in the mutant pharynx restores the skeletal but not muscular development. The OL185 locus was genetically mapped on chromosome 21, in an interval of 1,58Mb. In parallel, to get further insight into the taste bud development, I established a pharmacological assay that affects the expression of serotonin in taste buds. This tool should allow the analysis of the role of serotonin in taste bud formation
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Passet, Bruno. "Contribution à l’étude du rôle biologique des gènes de la famille Prion." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2012. http://www.theses.fr/2012VERS0055.
Full textAbstract:
La protéine Prion, PrP, est connue pour son implication dans les encéphalopathies spongiformes transmissibles. Cette protéine appartient à une famille de glycoprotéines membranaires qui comprend également la protéine Shadoo. Le rôle biologique de ces deux protéines reste peu connu. L’objectif de cette thèse a été de d’étudier le rôle de Shadoo par dérégulation de l'expression de son gène chez la souris et le poisson zèbre. Les résultats montrent que les protéines PrP et Shadoo interviendraient chez la souris dans le développement précoce de l’embryon, notamment dans la mise en place du placenta. Chez le poisson zèbre, le gène Shadoo1, exprimé précocement, aurait aussi un rôle dans le développement embryonnaire. Ces données apportent un éclairage nouveau sur le rôle de Shadoo et de la PrP dans le développement embryonnaire des vertébrésThe prion protein, PrP, is known for its involvement in transmissible spongiform emcephalopathies. This protein belongs to a membrane-associated glycoprotein family that comprises also the Shadoo protein. The biological role of these two proteins remains poorly understood. The aim of this thesis was to study the function of Shadoo by deregulating its gene expression in mice and zebrafish. The results indicate that PrP and Shadoo appear to be involved in early mouse embryonic development, and more precisely in the placenta development. In zebrafish, expressed Shaddo1-encoding gene is also involved in early embryogenesis. These data highlight a new role of PrP and Shadoo in vertebrate embryonic development
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Bernard, David Claude. "Etude du système lymphocytaire Tαβ d'un poisson téléostéen, la truite arc-en-ciel : répertoires, récepteurs de co-stimulation, réponse antivirale." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2005. http://www.theses.fr/2005VERS0018.
Full textAbstract:
Les poissons osseux possèdent les principaux constituants du système immunitaire des vertébrés dans un contexte physiologique particulier. En cela, le système lymphocytaire T et sa réponse spécifique contre les agents pathogènes présentent des aspects originaux, différents des mécanismes observés chez l'homme ou la souris. En réponse à une vaccination ADN contre le virus de la Septicémie Hémorragique Virale (SHV) et en utilisant une méthodologie de spectratypage de CDR3, les modifications du répertoire TCR des splénocytes ont été analysées. Cette approche a permis de montrer que la truite arc-en-ciel est capable, comme les mammifères, de produire une réponse publique présentant une surprenante complexité interne, dirigée contre une protéine virale. Des homologues des récepteurs de co-stimulation CD28 et CTLA4 ont également été identifiés. La structure des gènes, les profils d'expression des transcrits et la fonctionnalité des protéines ont été étudiés, suggérant que ces récepteurs possèdent des fonctions homologues à celles de leurs équivalents chez les mammifères. Enfin, une population intestinale d'IEL a été caractérisée, qui exprime des homologues de marqueurs T. Cette population possède un répertoire TCR polyclonal chez des individus naïfs, ce qui contraste fortement avec les répertoires humains ou murins. Ces IEL sont également capables d'élaborer une réponse publique après une infection systémique. La truite arc-en-ciel effectue donc des réponses T d'une grande diversité suivant des mécanismes d'activation proches de ceux des mammifères. En revanche, l'organisation des compartiments T semble différente au regard des observations réalisées sur les IELMost of the basic components of the vertebrate adaptive immune system are present in teleost fish, in the context of a particular physiology. Original aspects of the T-cell system and specific cellular response could be observed, compared to other vertebrate immune mechanisms. Using a CDR3 spectratyping method, we have described the modifications of the TCR repertoire induced by DNA vaccination against Viral Hemorrhagic Septicemia (VHS). This approach demonstrated that a public response was targeted to VHS glycoprotein and revealed a great internal complexity. CD28 and CTLA4 homologues were also identified. Several lines of evidences as intron/exon structure, mRNA expression profiles and functional experiments suggest that these receptors constitute co-stimulatory receptors as their mammalian counterparts. At last, an intestinal IEL population was characterized. These cells expressed typical T-cell markers, and displayed a polyclonal and diverse TCR repertoire in naive fish, in sharp contrast to what is observed in human and in the mouse. Moreover, IEL contain antigen responsive T cells, since they participate to the specific T-cell response against a systemic viral infection. The specific immune T-cell response in rainbow trout is extremely diverse and displays activation mechanisms comparable to their mammalian counterparts. However, the IEL characterization revealed that the organization of T-cell compartments is different from the one observed in human or in the mouse
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Turcotte, Stéphane. "Effets et mécanismes d'action de la consommation de protéines de saumon hydrolysées et des huiles de menhaden et d'argan sur la sensibilité à l'insuline chez un modèle de rat obèse." Master's thesis, Université Laval, 2008. http://hdl.handle.net/20.500.11794/20261.
Full textAbstract:
La consommation d'une diète riche en lipides et en sucre et à base de protéines de saumon hydrolysées améliore la sensibilité à l'insuline des rats Wistar comparativement aux rats consommant une diète à base de caséine. Cette amélioration de la sensibilité à l'insuline pourrait être expliquée par un plus faible gain de poids des animaux consommant la diète avec la protéine de saumon hydrolysée comparativement à l'autre diète diabétogénique. Comme aucune variation au niveau du poids des tissus adipeux viscéraux n'est remarquée chez ces animaux, l'hypothèse d'une augmentation de la dépense énergétique, due à la présence de composés tels que la calcitonine du saumon et les sels biliaires, pourrait être une explication possible à ce gain inférieur de poids corporel. Malgré un effet positif de cette protéine sur la sensibilité à l'insuline, cet effet n'est pas aussi remarquable que celui observé avec la protéine de morue dans une diète riche en lipides et en sucre, une étude réalisée précédemment dans notre laboratoire. Une explication possible de cette différence dans la protection de la sensibilité à l'insuline entre les deux diètes pourrait être la qualité de la protéine utilisée. Une partie de la protéine de saumon hydrolysée provient des viscères tandis que la protéine de morue provient entièrement de muscles. Par ailleurs, la consommation d'une diète riche en lipides et en sucre où 6% des lipides ont été remplacés par de l'huile de menhaden a démontré que ces rats ont une amélioration du profil glucidique et insulinémique comparativement aux animaux consommant la diète sans remplacement. La diminution de la phosphorylation de la protéine AKT sur le résidu serine 473 des foies de ces animaux comparativement aux animaux consommant une diète chow démontre que le foie n'est pas le tissu cible de cette amélioration du profil glucidique et insulinémique observée chez ces animaux. La baisse de poids des tissus adipeux viscéraux suggère que cette amélioration observée au niveau du métabolisme pourrait s'expliquer par l'implication des tissus périphériques. D'autre part, la consommation d'une diète riche en lipides et en sucre chez des rats Wistar où 6% des lipides ont été remplacés par de l'huile d'argan a démontré que cette huile n'exerce pas d'effet positif sur la sensibilité à l'insuline. De plus, les huiles d'argan et de menhaden n'ont pas d'effet notable sur la voie des MAPK.
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Lifrani, Awatif. "Etude du risque allergique à différentes protéines alimentaires Mise au point de modèle de souris allergiques à l'arachide, à l'albumine, à la caséine et à la colle de poisson." Phd thesis, INAPG (AgroParisTech), 2006. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00001928.
Full textAbstract:
L'allergie alimentaire est actuellement inquiétante par sa fréquence dans les pays industrialisés. En effet, son incidence est en constante et rapide augmentation. Parmi les allergènes majeurs: l'arachide, le poisson, l'oeuf et le lait de vache sont couramment trouvés dans de nombreux produits agro-alimentaires (farines, vins...) d'où l'obligation d'un étiquetage systématique. Notre objectif était d'établir des modèles de souris allergiques, à certaines protéines alimentaires (arachide, colle de poisson, albumine et caséine), caractérisés par la production in vivo d'IgE et d'IgG1 sériques spécifiques de ces protéines et par les manifestations cliniques suites aux tests de provocation avec ces mêmes protéines. Nous avons étudié, tout d'abord, l'allergénicité des vins sur quatre souches de souris (C3H, CBA, DAB/2 et SJL) après les différentes étapes du collage et nous avons montré que la décantation, la filtration et le vieillissement sont des étapes importantes pour l'élimination des produits utilisés pour la clarification des vins. Ensuite, nous avons étudié la réaction croisée arachide-lupin chez les souris C3H, CBA, SJL et BALB/c sensibilisées à l'arachide et nous avons montré que la réaction croisée arachidelupin in vitro n'implique pas une allergie croisée arachide-lupin. Enfin, nous avons, expérimenté et comparé plusieurs approches et voies de sensibilisation pour identifier les facteurs environnementaux nécessaires à la manifestation de la réponse allergique. Nous avons conclu que la sensibilisation avec l'arachide par voie orale naturelle sur un modèle de souris sensibilisable (C3H et CBA), en présence et en absence d'adjuvant, ne provoque pas d'allergie. En conclusion, la voie intrapéritonéale en présence d'adjuvant reste le moyen le plus rapide et le plus efficace pour obtenir un modèle de souris allergiques.
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Lifrani, Awatif. "Etude du risque allergique à différentes protéines alimentaires : mise au point de modèles de souris allergiques à l'arachide, à l'albumine, à la caséine et à la colle de poisson." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2006. http://www.theses.fr/2006INAP0001.
Full text
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Talbot, Émilie. "Impact de la protéine de morue sur la sensibilité à l'insuline, le métabolisme du glucose et divers marqueurs cardiovasculaires chez des femmes atteintes du syndrome des ovaires polykystiques." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/29767/29767.pdf.
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Grauffel, Cédric. "Etude in silico de la reconnaissance de la méthylation des lysines sur les queues d'histones." Strasbourg, 2009. http://www.theses.fr/2009STRA6202.
Full textAbstract:
Les modifications post-traductionnelles (MPT) sur les queues d'histone jouent un rôle important dans des mécanismes comme la régulation de l'expression des gènes. Un mode d'action passe par le reconnaissance d'une modification covalente par un domaine protéique appartenant généralement à une protéine associée au remodelage de la chromatine (enzyme, facteur de transcription, etc. . . ). La méthylation des lysines est une modification particulièrement importante, pour laquelle plusieurs sites ont été identifiés sur les histones. Nous avons entrepris de déterminer les bases de la sélectivité de domaines protéiques pour un site de méthylation donné, en utilisant les nombreuses données disponibles dans les banques de données structurales (PDB). Nous avons utilisé des calculs de dynamique moléculaire, couplés à un protocole dérivé de la méthode MM/PBSA, pour étudier les interactions entre les peptides d'histone et les domaines protéiques. Il a dans un premier temps fallu développer et valider un jeu de paramètres permettant l'étude par dynamique moléculaire des MPT. L'analyse de nos résultats a notamment mis en évidence le fait que certains domaines protéiques reconnaissent un court motif de séquence afin de discriminer entre différents sites de méthylation. Il apparaît ainsi clairement que les chromodomaines sont spécifiques d'un motif ARKmeS, tandis que les domaines PHD lient le motif ARTKme sur H3. L'ensemble de nos données peut servir de point de départ à la recherche de nouveaux effecteurs des MPT, comme nous avons entrepris de le faire pour le cas particulier des domaines PHDPost-translationnal modifications (PTMs) of histone tails play an important role in cellular processes such as gene expression and regulation. They can act through their specific recognition by proteic domains belonging to chromatin remodeling factors (enzymes, transcription factors, etc). A particularly important modification is the methylation of specific histone tail sites, for which there exist many. Our goal was to get insights into the molecular selectivity of these proteic domains towards a given methylation site by taking advantage of the numerous structural data available in the Protein Data Bank. We studied the interactions between the domains and histone peptides, using molecular dynamics simulations combined with a protocol using the MM/PBSA method. A pre-requisite was to develop and validate force field parameters for the of PTMs. Our results notably revealed that some domains discriminate the methlyation sites by recognizing short linear sequence motifs. It thus appears that chromodomains are specific to an ARKmeS motif, while PHD fingers bind the ARTKme motif of H3. The study carried out on PHD fingers also proves that our overall results can be used as a reference for research of other effectors of histone tails
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Fievet, Lorraine. "ARN non-codants et protéines effecteurs de la biologie du cil : identification du microARN let-7b comme modulateur de la ciliogenèse et rôle ciliaire putatif de l'Ataxine-7 dans l'ataxie spinocérébelleuse 7." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ050.
Full textAbstract:
Le cil est une organelle conservée au fil de l’évolution qui se projette de presque toutes les cellules de vertébrés. Des mutations dans les gènes codant pour des protéines impliquées dans la structure ou la fonction des cils peuvent causer différentes anomalies développementales ou dégénératives, qui sont collectivement appelés ciliopathies. Les individus atteints de ciliopathies présentent une importante variabilité inter- et intra-familliale, suggérant la présence de gènes modificateurs de la pénétrance et de l’expression de la maladie. L’utilisation du poisson-zèbre comme organisme modèle permet de 1) valider le rôle du microARN let-7 comme modulateur de la ciliogenèse et ainsi de le considérer comme potentiel gène modificateurs dans les ciliopathies; et 2) d’explorer le rôle putatif de l’Ataxine-7 dans la biologie du cil et une potentielle contribution développementale à la maladie d’ataxie spinocérebelleuse 7 qui est une maladie dégénérative. Une meilleure compréhension de la biologie du cil et des ciliopathies permettrait de mieux diagnostiquer et prendre en charge les patientsCilia are conserved organelles projecting from almost every vertebrate cell. Mutations in genes coding for proteins involved in cilia structure or function can cause different developmental and degenerative anomalies, which are collectively termed ciliopathies. Ciliopathy patients present an important inter- and intra-familial phenotypic variability, suggesting the presence of modifier genes of the penetrance and expressivity of the disease. Using the zebrafish model organism enables to 1) validate the role of the microRNA let-7 as a modulator of ciliogenesis, and thus consider it as a potential modifier gene of ciliopathies; and 2) explore the putative ciliary role of Ataxin-7 and a potential developmental contribution to spinocerebellar ataxia 7, which is a degenerative disease. A better understanding of cilia biology and ciliopathies would allow better diagnostics and care of patients
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Lot, Perrine. "Les protéines antigel." Paris 5, 1988. http://www.theses.fr/1988PA05P219.
Full text
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Mikdache, Aya. "Analyse in vivo du comportement des cellules de Schwann et du rôle de rgs4 dans le développement du système nerveux périphérique chez le poisson zèbre." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS463.
Full textAbstract:
Les cellules de Schwann (CS) sont les cellules gliales myélinisantes du Système Nerveux Périphérique (SNP). Il existe une communication étroite entre ces cellules et les axones auxquels elles s’associent et ce dès les stades les plus précoces de leur développement. Elles migrent tout en se divisant le long des axones; cette division migratoire est suivie d’une deuxième division post-migratoire dans le but d’établir un ratio 1:1 avec les axones pour ensuite les myéliniser. Ce travail vise à analyser, in vivo, le comportement des CS chez le poisson zèbre au cours de leurs divisions.Nous avons remarqué que les CS se divisent parallèlement aux axones le long du nerf de la Ligne Latérale Postérieure (PLL). En analysant les deux mutants has et nok, nous avons montré que les gènes de polarité apicale aPKC et pals1 ne sont pas requis pour la migration et la division des CS, ni pour leur capacité à myéliniser. Nous avons mis en évidence, en analysant le mutant cassiopeia qui présente des défauts d’organisation du fuseau mitotique et en utilisant l’agent pharmacologique le nocodazole, que l’assemblage du fuseau mitotique au cours de la division des CS est essentiel pour la myélinisation.En parallèle, nous avons analysé le rôle du gène rgs4 (regulator of G-protein Signaling 4) dans le développement du SNP chez le poisson zèbre. Nous avons généré un mutant stable rgs4 par la technique CRISPR/Cas9 et montré un rôle de ce gène dans le développement du ganglion de la PLL et des motoneurones, et ce en agissant en amont de la voie PI3K/Akt/mTOR.Contrairement à l’inhibition pharmacologique qui suggère un rôle de rgs4 dans la myélinisation périphérique, le mutant ne présente pas de défauts de myélineSchwann cells (SCs) are the myelinating glial cells of the Peripheral Nervous System (PNS). They derive from neural crest cells during development, then migrate and divide along the axons of the peripheral nerves. This migratory division is followed by a post-migratory division in order to radially sort the axons in a 1:1 ratio and wrap them with a myelin sheath. This work provides an analysis of the polarity of SC divisions, in vivo, in intact zebrafish embryos.We showed that SCs divide parallel to the axons along the Posterior Lateral Line nerve (PLL). By analyzing the two mutants has and nok, we revealed that the apical polarity genes aPKC and pals1, are neither required for the migration and division of SCs, nor for their capacity to myelinate. By studying the cassiopeia mutant that shows defects in mitotic spindle, we revealed that the assembly of the mitotic spindle is essential for SC myelination.We have also analysed the role of rgs4 (regulator of G-protein Signaling 4) in PNS development. We generated a stable rgs4 mutant using the CRISPR/Cas9 technology. We showed that rgs4 plays an essentiel role in PLLg and motoneurons development by acting upstream of PI3K/Akt/mTOR pathway. Pharmacological analysis suggested a role for rgs4 in peripheral myelination, however, the rgs4 mutant do not show any myelin defects
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Munoz-Ruiz, Raphaël. "Novel aspects of TDP-43's interaction with ALS-related autophagy genes." Thesis, Sorbonne université, 2019. http://www.theses.fr/2019SORUS268.
Full textAbstract:
La Sclérose Latérale Amyotrophique (SLA) est une maladie dégénérative des neurones moteurs. Sa signature est la présence d’inclusions cytoplasmiques ubiquitinées (synonyme de protéostasie défaillante) majoritairement positives pour TDP-43, une protéine de liaison aux ARNs. Les altérations de l’autophagie et du métabolisme des ARNs sont particulièrement étudiées dans la SLA. Cette thèse explore le rôle de TDP-43 dans la régulation de l’autophagie et particulièrement sur les récepteurs de l’autophagie p62 et OPTN ainsi que leur kinase activatrice TBK1. Chez l’embryon de poisson zèbre, la sous-expression de tardbp (codant pour tdp-43) conduit à un phénotype moteur altéré que nous associons à une régulation négative de tbk1. De l’ARN humain de TBK1 améliore ce phénotype. Sur des cellules SH-SY5Y, une sous-expression de TARDBP conduit à un profil d’expression de gènes clés de l’autophagie contradictoire à celui du poisson zèbre. Cependant, activer l’autophagie basale grâce à la Torine 1 conditionne l’effet d’une déplétion de TDP-43 sur l’expression de p62/SQSTM1 et TBK1. De plus, la Torine 1 inhibe les liaisons de TDP-43 aux ARNs de RAPTOR et OPTN mais promeut celles avec p62/SQSTM1 et TBK1. Dans ces cellules, la surexpression progressive de TDP-43 conduit potentiellement à des effets antagonistes sur p62/SQSTM1. Plus globalement, moduler TARDBP se traduit par une apparition de phénomènes caractéristiques de la protéinopathie TDP-43 chez les patients SLA. Parallèlement, des techniques de visualisation des ARNs in vivo et in vitro sont développées. Ce travail met en lumière la faculté de TDP-43 à s’adapter au contexte cellulaire et d’influer différemment sur l’autophagieAmyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a degenerative disease of motoneurons. Its histological hallmark is the presence of ubiquitin-positive cytoplasmic inclusions in motor neurons of patients which indicates defective proteostasis. In the majority of cases, these inclusions are positive for TDP-43, an RNA-binding protein. Alterations of autophagy and RNA metabolism are widely investigated in ALS. This thesis explores the role of TDP-43 on autophagy regulation with a focus on autophagy receptors p62 and OPTN and their upstream activator TBK1. In the zebrafish embryo, knockdown of tardbp leads to an altered motor phenotype and correlates with a downregulation of tbk1. Human TBK1 RNA ameliorates this phenotype in a significant manner. In SH-SY5Y cells, knockdown of TARDBP leads to a profile of expression of key autophagy genes that is in opposition with the one obtained in the zebrafish. However, activating basal autophagy through Torin 1 treatment unveils conditional effect of TDP-43 on p62/SQSTM1 and TBK1. Moreover, Torin 1 treatment inhibits binding of TDP-43 to RAPTOR and OPTN mRNAs but promotes novel binding to p62/SQSTM1 and TBK1 mRNAs. In these cell lines, increasing overexpression of TARDBP also seems to affect p62/SQSTM1 in different manners. Overall, modulating TARDBP expression is accompanied by the appearance of characteristic traits of TDP-43 pathology in ALS. In parallel, techniques to visualize target RNAs in vivo and in vitro are being developed. This work highlights TDP-43 ability to adapt to cellular context and affect autophagy in different manners
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Georgopoulou, Uranie. "Aspects originaux de l'absorption intestinale des protéines chez les poissons téleostéens." Paris 11, 1986. http://www.theses.fr/1986PA112196.
Full textAbstract:
Les cellules épithéliales du segment intestinal postérieur de la Truite, espèce carnivore pourvue d'un estomac et dont le développement s'effectue sans passage par une forme larvaire, possèdent des caractéristiques ultrastructurales évoquant celles des cellules iléales du rat nouveau-né. Chez celui-ci, l'absorption des protéines du colostrum et du fait et leur digestion intracellulaire sont liées à l'immunisation durant cette phase de l'alimentation. Ce processus disparaît quand la sécrétion peptique commence. Chez la truite adulte nous montrons que les cellules de l'intestin postérieur absorbent des protéines, comme l'HRP et la ferritine, retrouvées dans le système vacuolaire caractéristique de ces cellules. La visualisation d'une activité phosphatasique acide au niveau de ce système vacuolaire et la mise en évidence biochimique d'une forte activité catheptique caractéristique des cellules de l'intestin postérieur, nous laissent penser à une digestion intracellulaire des protéines. Nous montrons ensuite par des techniques immunologiques, que ces cellules absorbent et digèrent une même protéine (IgGH et HBSAg) et nous visualisons l'activité des enzymes lysosomales essentielles {cathepsines D et B) qui permettent cette digestion dans le système vacuolaire. Chez la truite juvénile, au moment de la première prise de nourriture, les cellules épithéliales de l'intestin postérieur qui possèdent déjà leur différenciation ultrastructurale caractéristique, voient leur activité catheptique augmenter brutalement. Le phénomène d'absorption des macromolécules est similaire à celui observé chez l'adulte, les vitesses de pénétration étant supérieures. Durant toute la vie de l'animal, l'intestin postérieur présente donc des caractéristiques ultrastructurales et fonctionnelles en relation avec l'absorption et la digestion intracellulaire des protéines. L'hypothèse, émise par différents auteurs, limitant l'éventualité d'un tel processus aux seules formes larvaires des téléostéens dépourvus d’estomac n'est donc pas avérée. Nous avons de plus montré qu’une partie des protéines jusqu’à 6% de PHRP ingérée échappe à la dégradation lysosomale, gagne l'espace intercellulaire, la lamina propria sous épithéliale et la circulation générale. Ce passage déclenche une réponse immunitaire locale qui se traduit par une augmentation considérable du nombre des cellules immunocompétentes infiltrées susceptibles de produire des anticorps agglutinants spécifiques. Chez une espèce carnivore pourvue d'un estomac, la Truite arc-en-ciel, nous démontrons donc que l'intestin postérieur assure deux fonctions essentielles a priori exclues, nutritionnelle et immunitaireThe epithelial cells of the posterior intestinal segment of Trout, a carnivorous species with a stomach and with a developmental cycle which does not include a larval phase, possess the ultrastructural characteristics resembling that of ileal cells of neonatal rat. For this one the absorption of proteins of colostrum and milk and their intracellular digestion arc related to the immunization during this phase of alimentation. This process disappears when peptic secretion begins. Ln the adult we show that cells of the posterior intestine absorb proteins like HRP and ferritin, which are found in the vacuolar system which is characteristic of these cells. Furthermore a capacity for intracellular protein digestion is strongly suggested by the visualization of a phosphatasic acid activity in the intracellular vacuolar system and the demonstration of a high catheptic activity which is characteristic of the posterior intestinal cells. Always in the adult we show by immunological methods, that cells absorb and digest the same protein (lgGH and HBSAg) and we visualize the essential lysosomal enzymes (cathepsins B and D) enabling this digestion to occurs. Ln the juvenile trout at the moment of the first feeding, the epithelial cells of the posterior intstine possess yet the characteristic ultrastructural differentiation, at the same time their catheptic activity increases. The phenomenon of macromolecular absorption is similar to that observed in adult, but the rates of penetration are superior. During the whole life of the animal the posterior intestine presents the ultrastructural and functional characteristics related to the intracellular absorption and digestion of proteins. The hypothesis emits by differents authors, limiting the eventuality of such a process only for teleost larval forms without a stornach, is not established. Furthermore we observed that a quantity of proteins (about 6% of the dose of ingested HRP) escapes from lysosomal degradation, reach the intercellular space, the intraepithelial lamina propina and general circulation. The immediate result of this passage is the beginning of a local immunological response with a considerable increase of the number of immunocompetents cells infiltrated between susceptible to produce specific agglutinating antibodies. Ln a carnivorous species, with a stornach, the rainbow Trout, we demonstrate that the posterior intestine assure two essential functions excluded a priori, nutritional and immune
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Dubois, Morvan Ghislaine. "Le collagène de type I de Danio rerio : isolement, caractérisation et rôle au cours du développement." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO1T099.
Full text
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Bessin, Yannick. "Caractérisation et production de protéines impliquées dans le système de défense " inné " des poissons." Rouen, 2004. http://www.theses.fr/2004ROUES005.
Full textAbstract:
Le mucus épidermique de poisson contient de nombreux composés lui conférant un rôle de protection contre les microorganismes. Récemment plusieurs protéines antibactériennes ont été isolées des fractions hydrophobes des mucus épidermiques d'anguille, de tanche et de truite. Ces protéines possédaient une forte activité antibactérienne corrélée à une activité "formeur" de pores, responsable de la perméabilisation des membranes bactériennes. La première partie de ce travail a consisté à montrer que de telles protéines étaient présentes dans le mucus d'un poisson d'eau de mer. A partir du mucus de turbot une protéine de 55 kDa, possédant de telles activités, a été isolée et caractérisée. Dans la seconde partie de cette étude, nous nous sommes intéressés à la protéine de 65 kDa de truite (Tr65). A partir d'une banque d'ADNc de la peau et des séquences primaires de fragments protéiques obtenus après digestions, le gène de Tr65 a pu être identifié. Le fort caractère hydrophobe de Tr65 et sa puissante activité antibactérienne ont rendu impossible sa production dans différents systèmes in vivo ou in vitro. En suivant les prédictions de structure secondaire et surtout la position des hélices transmembranaires, Tr65 a été découpée en trois fragments qui ont été produits et purifiés avec succès. Seuls les fragments possédant les hélices transmembranaires ont pu restaurer l'activité "formeur" de pores. Par contre, l'activité antibactérienne n'a pu être retrouvée. Ce résultat peut s'expliquer par, (i) leur forte insolubilité dans les milieux permettant la croissance bactérienne, (ii) des problèmes de conformation comme le suggèrent des expériences de dichroi͏̈sme circulaireMany compounds are present in skin mucus of fishes were they serve as the first line of defence against bacterial invasion. Recently, several antibacterial proteins have been extracted from mucus of eel, tench and trout. These proteins have strong antimicrobial activity correlated to a pore forming properties inducing permeabilisation of bacterial membranes. In the first part of this work, we have identified a 55 kDa hydrophobic protein with such activities in the mucus of a sea fish, the turbot. In a second part, we have studied the 65 kDa protein of trout (Tr65). Tr65 gene was identified from skin cDNA library and from primary sequences of digested protein fragments. Due to its strong hydrophobic nature and antibacterial activity, Tr65 could not be successfully produced in in vivo and in vitro systems. According to secondary structure predictions, Tr65 was successfully produced as three protein fragments: N-terminal and C-terminal fragments containing transmembrane helices and a middle one. The segments with transmembrane helices were the only ones to show pore-forming activity in planar lipid bilayers. In contrast no antibacterial activity was observed with any segments. This last result can be explained by: (i) the high insolubility of the segments in bacterial culture media, (ii) the unfolding of the segments as revealed by circular dichroism measurements
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Vinot-Renaud, Catherine. "Contribution à la connaissance et à la valorisation d'hydrolysats industriels de protéines de poissons." Compiègne, 1989. http://www.theses.fr/1989COMPD208.
Full textAbstract:
Des hydrolysats enzymatiques de protéines de poissons sont produits industriellement par la CTPP (Boulogne sur Mer) à partir des déchets engendrés par l'industrie locale de la pêche. Ils présentent des propriétés intéressantes notamment en alimentation animale comme substituts des protéines laitières ou en microbiologie comme stimulateurs des cultures. Toutefois aucune molécule active n'a pu jusqu'alors être identifiée. Le travail effectué a eu pour but d'approfondir notre connaissance de ces hydrolysats industriels afin d'en améliorer la valorisation. Il présente dans un premier temps une synthèse bibliographique des propriétés mises en évidence, un bref exposé du procédé d'obtention des hydrolysats ainsi que les résultats de la détermination de leur composition. La démarche chromatographique ayant permis la mise au point d'un fractionnement des hydrolysats par échange d'ions est ensuite décrite. Enfin la composition des fractions obtenues est déterminéee et la mise en place de deux tests d'activités est réalisée, d'une part sur des cul¬tures bactériennes, d'autre part sur des cultures de lymphocytes. Ainsi nous avons pu mettre en évidence des propriétés immunostimulantes remarquables pour certaines fractions, ouvrant ainsi la voie à une obtention potentielle de molécules à haute valeur ajoutée à partir d'hydrolysats de protéines de poissons.
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Ravallec, Rozenn. "Valorisation d'hydrolysats d'origine marine : optimisation de la concentration en peptides apparentés aux facteurs de croissance et aux agents sécrétagogues : essais in vitro et in vivo." Brest, 2000. http://www.theses.fr/2000BRES2041.
Full textAbstract:
L'utilisation d'hydrolysats d'origine marine dans les aliments destinés à l'aquaculture est en pleine expansion face au plafonnement des pêches mondiales. Cependant les besoins des animaux sont encore mal définis orientant les recherches vers la fabrication d'aliments plus spécifiquement adaptés. Les objectifs de ce travail étaient d'identifier et de caractériser des facteurs de croissance et des agents sécrétagogues présents dans des hydrolysats d'origine marine et pouvant avoir un effet in vivo sur la croissance et le développement des larves de la crevette tropicale Litopenaeus vannamei. Cette recherche a été réalisée en trois parties : l'optimisation de la fabrication des hydrolysats, la caractérisation des activités biologiques et l'effet in vivo de l'incorporation des hydrolysats dans l'alimentation des larves de l. Vannamei. L'optimisation de l'hydrolyse du muscle de morue, Gadus morhua, par l'alcalase a défini les conditions opératoires permettant de détecter la présence d'activités biologiques. L'affinité que possèdent les facteurs de croissance et les agents sécrétagogues pour certains récepteurs présents sur les cellules ar4-2j a été exploitée afin de caractériser les activités biologiques détectées dans les hydrolysats de morue et de crevette (litopenaeus aztecus). Des fractions partiellement purifiées ont présenté des caractéristiques d'élution ainsi que des affinités de liaisons comparables à celles retrouvées avec les peptides de la famille des cholecystokinines et les facteurs de croissance. La purification d'une enzyme spécifique du système digestif des crevettes pénaeides, la chymotrypsine, a permis la fabrication d'un hydrolysat de muscle de morue en quelque sorte plus spécifique des larves cultivées. L'influence de ces hydrolysats sur la croissance et le développement des larves de la crevette l. Vannamei a été étudiée. Bien qu'il soit difficile de conclure à l'effet stimulateur de croissance et de digestion des peptides précédemment détectés, l'hydrolysat de morue par la chymotrypsine a un effet bénéfique sur le développement des animaux. Ces différents types d'approches de recherche sont des étapes essentielles afin de caractériser de nouveaux hydrolysats susceptibles de favoriser la croissance, la survie et le développement des larves de poissons et de crustacés.
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Cotto, Emmanuelle. "Caractérisation moléculaire de la protéine prion de poisson-zèbre et expression génique au cours du développement." Bordeaux 1, 2004. http://www.theses.fr/2004BOR12817.
Full textAbstract:
Les maladies à prions se caractérisent par l'accumulation d'une isoforme anormale (PrPsc) d'une protéine physiologique (PrPc) codée par le gène Prnp chez l'homme. Une protéine homologue a été caractérisée chez différents Mammifères et Oiseaux, la tortue et le Xénope. Chez les Poissons, plusieurs protéines de type prion ont été identifiées, sans pouvoir déterminer avec certitude les relations d'orthologie et de paralogie par rapport au gène Prnp humain. Nous avons caractérisé, après clonage de son ADNc, la protéine prion (PrP1) du poisson-zèbre. Même si sa séquence primaire en acides aminés est relativement divergente, PrP1 présente des motifs bien conservés caractéristiques des protéines de type PrP. Le profil d'expression génique de prp1 a été déterminé sur des embryons et larves de poisson-zèbre en hybridation in situ in toto et comparé à celui du gène prp2. Ce second gène, présent dans le génome du poisson-zèbre, code également pour une protéine de la famille des PrP. Prp1 s'exprime dans l'embryon dès l'activation zygotique, ce qui suggère un rôle pléiotrope de la protéine au cours de l'embryogenèse précoce. A partir de 24 heures après la fécondation, les transcrits de prp1 sont localisés dans des structures bien individualisées, avec une expression majeure au niveau du système nerveux central, des neuromastes de la ligne latérale, des structures rénales, hépatique, cardiaque, de l'intestin postérieur et des nageoires pectorales. Prp2 s'exprime de façon remarquable dans les neuromastes et les nageoires pectorales. En conclusion, nos travaux confirment que le gène PrP est apparu à la base de l'évolution des Vertébrés. Le profil d'expression différentiel des gènes de type prion, observé au cours du développement, pourrait être utilisé comme un argument supplémentaire pour clarifier les relations phylogénétiques après duplication génique du gène prp dans le génome des Poissons TéléostéensPrion diseases are characterized by the accumulation of an abnormal isoform (PrPsc) of a physiologic protein (PrPc) that is encoded by the Prnp gene in humans. A homologous protein has been characterized in different Mammal species and Birds, the turtle and Xenopus. Different prion-like proteins have been identified in Fish, but their orthologous and paralogous relationship to the human Prnp gene are unknown. Here, we characterized the prion protein (PrP1) of the zebrafish after cloning of its cDNA. Although its primary amino acid sequence is relatively divergent, the PrP1 protein shows preserved PrP-type characteristic motifs. The prp1 gene expression pattern has been determined in zebrafish embryos and larvae by using in situ in toto hybridization and compared to the expression of the prp2 gene. The latter exists also in the zebrafish genome and encodes for another protein of the PrP family. The prp1 gene is expressed in the zebrafish embryo from the beginning of zygotic activation, suggesting a pleiotropic role of this protein during early embryogenesis. Twenty-four hours after fertilization, transcripts of prp1 are localized in distinct anatomical structures, with a main expression in the central nervous system, lateral line neuromasts, different parts of kidney, liver, heart, posterior intestine and pectoral fins. The prp2 gene is mainly expressed in neuromasts and pectoral fins. In conclusion, we confirm the appearance of the PrP gene at the origin of Vertebrate evolution. Moreover, the differential expression pattern for PrP-type genes during development could be used as an additional argument to clarify phylogenetic relations emanating from the duplication of the prp gene in the Teleostean Fish genome
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Lescat, Laury. "Caractérisation et étude du rôle de lamp2a chez les poissons." Thesis, Pau, 2019. http://www.theses.fr/2019PAUU3014.
Full textAbstract:
L’Autophagie médiée par les protéines chaperonnes (ou CMA pour Chaperone-Mediated Autophagy) est une voie majeure du catabolisme lysosomal considérée aujourd’hui comme un acteur central de contrôle de nombreuses fonctions cellulaires, et dont les défauts sont associés à plusieurs pathologies humaines, dont des maladies neurodégénératives, des cancers et des troubles du système immunitaire. Selon l’idée actuellement admise, cette fonction cellulaire n’existerait que chez les mammifères ou les oiseaux, qui seraient les seuls à exprimer la protéine LAMP2A, une protéine nécessaire au fonctionnement de la CMA. Or, récemment, nous avons pu mettre en évidence l’existence de séquences exprimées présentant une forte homologie avec LAMP2A de mammifères chez plusieurs espèces de poissons, remettant ainsi en question ce point de vue et suggérant que la CMA soit apparue beaucoup plus tôt au cours de l'évolution qu'on ne l'avait initialement cru. Dans cette thèse, nous retraçons l’histoire évolutive du gène LAMP2 chez les vertébrés. Nous démontrons que ce gène est apparu après la seconde duplication complète du génome survenue chez l'ancêtre commun des vertébrés il y a environ 500 millions d'années. En outre, en adaptant une méthode récemment décrite pour mesurer l’activité de la CMA dans des cellules de mammifères à une lignée de fibroblastes de medaka (Oryzias latipes), nous apportons la preuve de l’existence de cette fonction cellulaire chez cette espèce de poisson. Enfin, afin de caractériser le rôle physiologique de cette fonction chez les poissons, nous avons procédé à l’invalidation par crispR-cas9 de lamp2a chez le medaka. Les poissons générés présentaient de sévères perturbations du métabolisme intermédiaire, comme précédemment décrit chez des souris dont LAMP2A a été invalidée dans le foie. Dans l’ensemble, ces résultats démontrent clairement, et pour la toute première fois, qu’il existe bien une activité CMA fonctionnelle chez les poissons, et apportent ainsi de nouvelles perspectives dans ce domaine de recherche, notamment en autorisant l'utilisation de modèles génétiques complémentaires, tels que le poisson zèbre ou le medaka, pour faire avancer nos connaissances sur les mécanismes régissant cette fonction cellulaireChaperone-Mediated Autophagy (CMA) is a major pathway of lysosomal proteolysis recognized as a key player in the control of numerous cellular functions, and whose defects have been associated to several human pathologies, including neurodegenerative diseases, cancers and immune disorders. To date, this cellular function was presumed to be restricted to mammals and birds, due to the absence of an identifiable lysosome-associated membrane protein 2A (LAMP2A), a limiting and essential protein for CMA, in non-tetrapod species. However, we recently identified the existence of expressed sequences displaying high homology with the mammalian LAMP2A in several fish species, challenging that view and suggesting that CMA appeared much earlier during evolution than initially thought. In the present thesis, we first present new evidences about the evolutionary history of the gene LAMP2 in vertebrates. We demonstrate that LAMP2 appeared after the second whole genome duplication that occurred at the root of the vertebrate lineage approximately 500 million years ago. By using a fluorescent reporter previously used to track CMA in mammalian cells, we then revealed the existence of a CMA-like pathway in a fibroblast cell line of the fish medaka (Oryzias latipes). Finally, to address the physiological role of Lamp2a in fish, we generated, medaka knockout for the splice variant lamp2a, and found severe alterations in the intermediary metabolism, as previously demonstrated in mice deficient for CMA in liver. Altogether, our data provide the first evidence for a CMA-like pathway in fish and bring new perspectives on the use of complementary genetic models, such as zebrafish or medaka, for studying CMA in an evolutionary perspective
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Gaillard, Sandrine. "Détermination et différenciation sexuelles chez les poissons : "le sexe des esturgeons" : SPACne et "opeintre" devient "protéine"." Toulon, 2006. http://www.theses.fr/2006TOUL0019.
Full textAbstract:
L'esturgeon, de la famille des Acipenséridés, est un poisson ancestral, commercialement très intéressant et menacé d'extinction. Déjà élevé depuis plusieurs années pour la réintroduction dans le milieu et la production de caviar, des questions demeurent quant à son système de détermination du sexe. Nous avons entrepris d'en explorer la voie génétique, d'une part en recherchant le polymorphisme moléculaire par des approches de criblages aléatoires, d'autre part en étudiant l'expression du génome par une technique de criblage différentiel. SPAC,ME a été développé en réponse à des évolutions devant être opérées sur le logiciel SPAC créé précédemment. Une protéine peut désormais, grâce à son poids moléculaire et à sa composition en acides aminés, être identifiée parmi les données d'une banque protéique ou nucléique par le biais d'une requête plus complète et avec des résultats plus pertinentsThe sturgeon, family of Acipenseridae, is an ancestral fish, commercially very interesting and threatened of extinction. Sturgeons are raised for reintroduction in their environment and for the caviar production. Questions have remained as for its system of sex determination. We undertook to explore the genetic way of it, on the one hand by seeking molecular polymorphism by approaches of random screening, on the other hand by studying the expression of the genome by a technique of differential screening, SPACNE was developed in response to evolutions having to be operated on software SPAC previously created. A protein can from now on, only with its molecular weight and its aminoacids composition, be identified among the data of a protein or nucleic bank by the means of a more complete request and with more relevant results
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Conto, Cinier Christine de. "Analyse de la bioaccumulation des métaux chez les poissons : complexation du cadmium par des protéines de détoxication : les métallothionéines." Lyon 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LYO10357.
Full textAbstract:
Les elements metalliques introduits a l'etat de traces, dans le milieu aquatique, se repartissent dans trois compartiments interactifs : l'eau, les matieres en suspension et les organismes vivants. Par exemple, dans les milieux pollues par le cadmium, les poissons constituent une cible potentielle d'accumulation de ce metal. L'importance des poissons dans les chaines trophiques, ainsi que l'aspect toxicologique pour les poissons eux-memes, conferent un grand interet a l'etude de la bioaccumulation de tels micropolluants. En laboratoire, des experiences de longues durees ont ete conduites pour contaminer des carpes par voie directe dans une eau dont la teneur en cadmium etait soit de 500 g. L#-#1 soit de 50 g. L#-#1. A differents temps d'intoxication, plusieurs individus ont ete preleves et disseques. Le cadmium a ete dose par icp-ms dans le rein, le foie et le muscle afin de comprendre les mecanismes de bioaccumulation et de bioelimination du polluant. La realisation de plusieurs experiences a permis d'etudier l'influence de l'age, du sexe et du niveau de contamination sur les cinetiques d'accumulation et de detoxication. Les metallothioneines, proteines de faibles masses moleculaires cytosolubles qui fixent le cadmium, le cuivre et le zinc, ont ete recherchees dans le rein et le foie de carpes intoxiquees. Apres ultracentrifugation des tissus, les fractions cytoplasmiques recuperees ont ete deposees sur une colonne d'exclusion-diffusion. Le dosage du cadmium, du cuivre et du zinc dans les fractions eluees ainsi que l'analyse des spectres uv de ces fractions ont permis de mettre en evidence la presence de metallothioneines dans le rein et le foie des poissons. Enfin, le dosage des metallothioneines par polarographie impulsionnelle differentielle dans les fractions cytoplasmiques issues du rein et du foie preleves a differents temps d'intoxication a conduit a mettre clairement en evidence une correlation lineaire entre la biosynthese des metallothioneines et le taux de cadmium fixe dans les organes. Une investigation en milieu naturel a ete realisee afin de detecter une eventuelle pollution metallique d'une riviere de la region lyonnaise, l'ardieres, a partir du dosage du cadmium, du plomb, du cuivre et du zinc dans differents milieux : l'eau, les sediments, les mousses aquatiques et les poissons (chevesne et blageon). Une etude statistique, notamment par analyse en composantes principales, a montre une correlation entre differents parametres concernant, d'une part les poissons et, d'autre part les sites de prelevements.
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Ebran, Nathalie. "Propriétés antibactériennes et « formeur de pores » de protéines du mucus épidermique. Implication dans les mécanismes de défense des poissons." Rouen, 1999. http://www.theses.fr/1999ROUES077.
Full textAbstract:
Au cours de ces dernières années de nombreux peptides possédant des propriétés antimicrobiennes ont été isolés aussi bien dans le monde végétal qu'animal. Ces peptides présenteraient une première ligne de défense entre l'organisme et le parasite. Le mucus épidermique de poisson est souvent décrit comme participant à cette lutte, comme le montre la présence de nombreuses substances appartenant au système immunitaire (IgM, le lyzosime,. . . ). Dans cette étude, réalisée sur le mucus épidermique de 4 poissons (anguille, tanche, truite, turbot), il a été montré que la partie non-soluble du mucus possédait des propriétes formeur de pores, qui ont pu être corrélées avec une forte activité antibactérienne. La purification de cette fraction a permis d'isoler des protéines de 49, 47, 28 et 26 kDa pour la tanche (T49, T47, T28, T26), de 45 kDa pour l'anguille (A45) et de 65 kDa pour la truite (Tr65). Toutes ces protéines induisent la formation de canaux ioniques lors de leur reconstitution dans des BLP. Leur insertion massive dans la BLP se traduit par l'apparition d'un grand état ouvert (>1000 pS dans KCl 1M) sur lequel des fluctuations de conductances plus faibles sont ensuite observées. Des tests antibactériens menés avec chacune de ces protéines a permis de déterminer des CMI < 1microM contre les bactéries Gram- et Gram+. Une étude de la structure secondaire a permis de montrer que ces protéines présentaient principalement une structure aléatoire et en hélice. Toutes ces protéines sont des glycoprotéines porteuses d'acides sialiques (exceptée la glycoprotéine A45). Un séquençage de la partie N-terminale a été réalisé mais seules les séquences de T26 et T28 ont pu être déterminées car les autres sont bloquées sur leur partie N-terminale. Une digestion enzymatique des Tr65 et A45 a permis d'accéder à des fragments de leur séquence et la recherche d'homologie a montré que ces 4 protéines présentent des homologies avec la protéine ON3 (Carassius auratus) et la cytokératine S (Oncorrhynchus mykiss). L'utilisation de ces fragments protéiques a permis de synthétiser des amorces nucléotiques nécessaires pour extraire le gène de Tr65.
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Lobbardi, Riadh. "Rôle de Quaking, protéine de liaison aux ARNm, dans le développement précoce des fibres musculaires lentes et rapides chez le poisson zèbre." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066279.
Full textAbstract:
Chez les Vertébrés, se déplacer nécessite l’intervention de structures comme les motoneurones (MN), les muscles ainsi que les jonctions neuromusculaires. Pendant ma thèse, j’ai identifié un mutant de motilité présentant des défauts de MN et de fibres musculaires lentes et rapides. Le clonage positionnel a mis en évidence le gène qkA, orthologue du gène quaking chez la souris, codant une protéine de liaison aux ARNm. QkA est exprimé dans les fibres lentes et rapides. Des greffes ont montré le rôle cellulaire-non autonome de ce gène dans la formation des fibres rapides suggérant que qkA est nécessaire dans les fibres lentes. Des études ont montré le rôle des fibres lentes dans l’élongation des fibres rapides et dans le guidage axonal des MN. Ensemble, ces données suggèrent que qkA est requis dans les fibres lentes qui agiront de manière permissive sur le développement des fibres rapides et sur les MN montrant ainsi une nouvelle fonction de ce gène dans la myogenèse chez les Vertébrés.
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Lemaître, Christelle. "Purification et caractérisation de protéines hydrophobes extraites du mucus épidermique de carpe (cyprinus carpio). Relations entre activités ionophores et antibactériennes." Rouen, 1996. http://www.theses.fr/1996ROUES056.
Full textAbstract:
Le rôle de défense contre les microorganismes a déjà été démontré parmi les nombreuses fonctions du mucus épidermique du poisson. En effet, les sécrétions épidermiques de la carpe (cyprinus carpio) contiennent des composés dont l'activité est comparable à celle des peptides de défense, connus chez les bactéries, les insectes, les amphibiens et les mammifères, actifs par la formation de pores dans les membranes cellulaires. Le mucus épidermique possède lui aussi la faculté de générer des canaux ioniques dans des bicouches lipidiques planes et les substances responsables de cette activité ionophore ont été mises a jour. Ainsi, pour la première fois, des protéines de masses moléculaires de 31 kDa et 27 kDa hydrophobes ont été purifiées à partir du mucus épidermique de carpe, solubilisé dans une fraction détergent (octylpolyoxyéthylène). Ces deux protéines forment des canaux transmembranaires, non voltage-dépendants et très légèrement sélectifs pour les anions (31-kDa) ou pour les cations (27-kDa). Les deux protéines sont des antibiotiques très efficaces puisqu'elles agissent à des CMI entre 0. 16 et 0. 18 microM contre les bactéries Gram + et Gram -. D'autre part, des caractérisations préliminaires ont permis de montrer que la glycoprotéine 27-kDa possède une structure secondaire majoritairement en hélice-α. Par contre, la protéine 31-kDa qui n'est pas glycosylée a une structure secondaire qui est organisée en feuillet-β. La question concernant l'origine de synthèse de ces deux protéines a été étudiée afin de déterminer s'il s'agissait d'une sécrétion épidermique ou d'une contamination bactérienne. Les faits sont que (i) les protéines sont actives contre les bactéries pathogènes revivifiées du poisson, (ii) elles ne possèdent pas d'homologue recensé dans les banques protéiques et (iii) ce phénomène existe chez d'autres poissons contenant des protéines ionophores différentes dans leurs sécrétions épidermiques. A ce jour, tout semblerait indiquer que les protéines 31-kDa soient de nouvelles protéines antibiotiques, sécrétées par le mucus épidermique de carpe.
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Salmon, Michel André. "Etude génétique et biochimique des propriétés 'poison-antidote' et régulatrices des protéines CcdA et CcdB du plasmide F de Escherichia coli." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1993. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/212783.
Full text
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Noble, Marie-Elisabeth. "Effets d'un régime hypoprotéique à base de soja sur la fonction de nutrition et les capacités de conjugaison chez la carpe, Cyprinus carpio." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10051.
Full textAbstract:
Pour determiner l'influence du regime alimentaire sur les fonctions de nutrition et de detoxication, de jeunes carpes (cyprinus carpio) elevees en laboratoire ont recu durant 8 semaines ou 1 an, soit une alimentation standard (50% de proteines animales), soit une alimentation hypoproteique a base de soja. Cette experience est egalement effectuee en milieu naturel durant 7 mois. Les effets de ces regimes sur la fonction de nutrition ont ete controles par le dosage des activites enzymatiques de digestion et de transport au niveau intestinal et par la determination de la composition du foie, du muscle et du sang. Les effets sur la fonction de detoxication ont ete suivis a l'etat basal ou apres injection de beta-naphthoflavone par la mesure des activites des enzymes de conjugaison gst et udpgt dans le foie, le rein et les erythocytes et le controle de la composition en isoenzymes de gst du foie et du rein. Il ressort de ce travail que la duree de l'alimentation, trop peu souvent prise en compte dans les experiences de nutrition et de toxicologie, determine la nature des reponses de la carpe aussi bien au niveau du metabolisme energetique qu'au niveau de la fonction de detoxication
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Dumetz, Fabien. "Les antigènes de surface de Flavobacterium psychrophilum : approche protéomique et caractérisation de deux protéines (OmpA/P60 et OmpH/P18)." Bordeaux 2, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR21363.
Full textAbstract:
Flavobacterium est une bactérie Gram négative pathogène de poissons. Par une approche protéomique, nous avons pu identifier certains composants de la membrane externe : des adhésines putatives, des protéines impliquées dans l'acquisition du fer ou dans les systèmes d'efflux, une HtrA homologue et plusieurs molécules de fonctions inconnues. L'analyse de la membrane externe a révélé plusieurs antigènes protéiques majoritaires dont OmpA/P60. La susceptibilité des deux protéines aux traitements in situ des cellules avec de la protéinase K et la mise en évidence d'effets bactériostatiques/bactéricides d'anticorps spécifiques indiquent sans ambiguité l'exposition en surface de ces deux molécules. Des essais de vaccination ont montré que ces deux protéines pouvaient induire un fort taux d'anticorps protecteurs. Ces résultats indiquent qu'OmpA/P60 et OmpH/P18 sont des candidats prometteurs pour le développement de futurs vaccinsFlavobacterium psychrophilum is a Gram negative bacteria responsible for fish infection. We used a proteomic approach to identify some outer membrane components such as putative adhesins, proteins involved in iron acquisition or in efflux systems, a HtrA homologue and some other molecules with unknown function. Several major antigens have been identified in the outer membrane including the two components OmpH/P18 and OmpA/P60. They are surface-exposed since they were completely digested by in situ proteinase K treatment and the two monospecific sera were bacteriostatic/bactericidal. Vaccination trials showed that both proteins can induce a high titter of specific antibodies which are protective. Collectively, these results indicate that these two proteins could be used in future vaccine development as promising candidate antigens
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Ying, Yilin. "La trajectoire non télomérique de l'évolution de TRF2 chez le poisson zèbre révèle le rôle que joue cette protéine au cours du neurodéveloppement." Electronic Thesis or Diss., Université Côte d'Azur, 2020. http://www.theses.fr/2020COAZ6045.
Full textAbstract:
Mon projet de doctorat est de comprendre la fonction de la protéine TERF2 sous-unité du complexe shelterin dans le poisson zèbre. Je présente mon travail en deux parties. J’ai d’abord utilisé deux modèles animaux différents et mesuré le niveau d’ARNm et le niveau de protéine des gènes de shelterin dans divers tissues pendant le développement de la souris et pendant la vie adulte chez le poisson zèbre. J’ai révélé que les sous-unités de shelterin présentent des expressions spatiales et temporelles distinctes qui ne sont pas corrélées avec le statut prolifératif des organes examinés. Par exemple, le gène terfa (gène codant pour TRF2 chez les poissons zèbres) est beaucoup plus élevé dans le cerveau que dans d’autres tissus au cours du développement et chez l’ adulte et diminue fortement avec l’âge. Ceci suggère une fonction particulière de TRF2 dans le cerveau pendant le développement et le vieillissement, indépendamment de sa fonction de protection des telomere. Ainsi, dans la deuxième partie, je me suis concentré sur la façon dont TRF2 fonctionne pendant le développement du poisson zèbre, en particulier pour comprendre la fonction extra-télomérique de TRF2 dans le développement neuronal. J’ai pu montré que l’ortholog chez le poisson zèbre de TRF2 (zfTRF2 codé par le gène TERFA) joue un rôle général dans la protection du génome sans spécificité apparente pour la protection des télomères. Afin d’explorer le rôle de zfTRF2 in vivo, j’ai généré un modèle de poisson zèbre invalidés pour terfa. J’ai démontré que zfTRF2 est nécessaire pour empêcher la signalisation des dommages de l’ADN mais pas spécifiquement aux télomères. Une ablation complète de terfa induit une insuffisance et une mort embryonnaire avec des défauts majeurs du système nerveux tandis que son haploinsuffisance mène à un phénotype de vieillissement prématuré chez l’adulte. L’inhibition des points de contrôle de la réponse à l’ADN endommagé chez les embryons compromis pour terfa ne permet pas ’une récupération complkète des défauts neurodéveloppementaux, ce qui suggère que zfTRF2 contrôle d’autres processus que la stabilité du génome. En effet, restaurer l’expression de gènes régulés par zfTRF2 agit de manière epistatique avec l’inhibition de la réponse au dommage à l’ADN pour améliorer les problèmes neurodéveloppementaux des poissons compromis pour terfa. Une restauration spécifique de l’expression zfTRF2 dans les cellules gliales est suffisante pour améliorer le phénotype embryonnaire de neurodéveloppement, dévoilant un rôle clé de zfTRF2 dans les cellules gliales pendant le neurodéveloppement. Ainsi, ces résultats révèlent qu’une sous-unité de shelterin a évolué dans le poisson zèbre en tant que gardien général de génome nécessaire pour un neurodéveloppement approprié en empêchant la signalisation de dommages d’ADN et en régulant l’expression spécifique de gènes cibles.Ces travaux posent la question des mécanismes de protection des télomères chez le poisson zèbre et de connaitre le détail des mécanismes moléculaires qui régissent le rôle spécifique de TRF2 dans les cellules gliales pour réguler le développement neuronalThe shelterin protein complex is a key player of telomere protection, a process inextricably linked to ageing. Accordingly, decrease in shelterin expression is associated with increasing age in many organisms. Here we demonstrate that the zebrafish ortholog of the mammalian shelterin subunit TRF2 (zfTRF2 encoded by the TERFA gene) exhibits a higher expression in neural system decreasing during aging. Further investigation shows that zebrafish TRF2 is required to prevent ATM-dependent DNA damage signaling, but not specifically at the telomeres. Complete TERFA ablation induced severe embryonic neurodevelopmental failure and death, whereas TERFA haploinsufficiency led to premature aging in adult fishes. Remarkably, ATM inhibition completely prevented DNA damage signaling in terfa-compromised embryos but led to only partial recovery from embryonic neurodevelopmental failure, suggesting that zfTRF2 controls processes other than genome stability. Indeed, overexpressing genes that were downregulated in terfa-compromised embryos had an epistatic effect with ATM inhibition, resulting in a better recovery from neurodevelopmental failure. Furthermore, glial cell-specific restoration of zfTRF2 expression was sufficient to rescue the embryonic neurodevelopment phenotype, unveiling a key neurodevelopmental role of zfTRF2 in glial cells. Our results suggest that the key shelterin subunit TRF2 evolved in zebrafish as a general genome caretaker that is required for proper neurodevelopment by both preventing DNA damage signaling and regulating gene expression. I propose a model of telomere evolution based on the redeployment of general factors involved in genome maintenance, coupling telomere status to development and aging
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Venchard, Vomakasy. "Recherches sur l'élevage d'Ocyurus Chrysurus (Lutjanidae) : adaptation de l'espèce à la stabulation en cages et recherche des besoins en protéines : étude histologique des foies des poissons." Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT020A.
Full textAbstract:
Dans une premiere experimentation visant a adapter l'espece a l'elevage en cages flottantes, des juveniles d'o. Chrysurus ont ete nourris d'aliments contenant respectivement 40% et 60% de proteines. Les meilleurs resultats de la croissance et de l'efficacite alimentaire sont obtenus avec le regime a 40% de proteines. Dans une deuxieme experimentation sur la meme espece, ont ete testes pendant 130 jours, 6 regimes alimentaires differents mais isoenergetiques et renfermant 30%, 40% et 50% de proteines respectivement. Pour chaque taux de proteines, 2 types d'aliments ont ete elabores: l'un dont la totalite des proteines est fournie par de la farine de poisson et l'autre dont le tiers de l'apport proteique provient du tourteau de soja. Les meilleures performances enregistrees pour la croissance, l'efficacite et le rendement alimentaire sont obtenus avec un regime a 44% de proteines animales et presentant un rapport p/e de 22 mg de proteines/kj
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Taste, Corinne. "Fonctions et régulation de la protéine suppresseur de tumeurs BRCA1 dans la réponse cellulaire aux poisons du fuseau mitotique." Toulouse 3, 2007. http://www.theses.fr/2007TOU30065.
Full textAbstract:
Le gène BRCA1 est un suppresseur de tumeurs prédisposant au cancer du sein. Des données récentes ont suggéré l'implication de BRCA1 dans la réponse aux agents anti-mitotiques. Durant ma thèse, j'ai étudié les fonctions et la régulation de BRCA1 au cours de cette réponse cellulaire. Dans une première partie, j'ai mis en évidence le rôle de BRCA1 dans la régulation du checkpoint mitotique activé après dommages aux microtubules. Puis, j'ai analysé sa régulation dans ces conditions et ai montré que la protéine kinase Chk2 phosphoryle BRCA1 sur la sérine 988 après dommages aux microtubules et ainsi module le rôle de BRCA1 dans la nucléation des microtubules. Enfin, mes travaux suggèrent que la kinase mitotique Plk-1 pourrait également phosphoryler BRCA1 après traitement au paclitaxel. Ces travaux montrent que BRCA1 est impliquée dans la réponse cellulaire aux poisons du fuseau mitotique et suggèrent que Chk2 et Plk-1 régulent les fonctions de la protéine impliquées dans cette réponseInherited mutations of the tumor suppressor gene BRCA1 confer an increase risk for breast and ovarian cancer. BRCA1 has been recently implicated in the response to anti-mitotic agents. In the present report, we studied BRCA1 functions ans regulation in this response. In a first part, we demonstrated that BRCA1 is involved in the regulation of the mitotic checkpoint activated by microtubules damage. Then, we have analyzed its regulation in this conditions and we have showed that Chk2 phsophorylates BRCA1 on serine 988 after mitotic spindle disruption and thus, regulates microtubule nucleation activity of BRCA1. Further data also suggest that BRCA1 is a potential target of the mitotic kinase Plk-1 after paclitaxel treatment. Our findings show that BRCA1 is involved in the cellular response to agent that disrupt tje mitotic spindle and suggest that Chk2 and Plk1 regulate functions of BRCA1 in this response
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Bucher, Guillaume. "Développements analytiques pour la spéciation de l’uranium dans les branchies du poisson zèbre (Danio rerio) après exposition." Thesis, Pau, 2013. http://www.theses.fr/2013PAUU3044/document.
Full textAbstract:
L’objectif de cette thèse porte sur l’étude de la compartimentalisation cellulaire et de la prise en charge de l’uranium (U) par les protéines cytosoliques des cellules branchiales du poisson zèbre (Danio rerio, espèce modèle en toxicologie aquatique) après exposition contrastées (chronique vs. aiguë, 20 et 250 µg.L-1) par voie directe. Cette étude a nécessité le développement, l’utilisation et le couplage d’outils analytiques de pointe (SEC, IEF hors-gel, RP-UHPLC pour la séparation, ICP-SFMS, ESI-FTMS/MS pour la détection) avec comme défis majeurs la conservation des interactions non-covalentes U biomolécule et une sensibilité maximale pour travailler à des niveaux d’exposition proches de ceux rencontrés dans l’environnement. Après extraction, 24 à 32% de la charge branchiale totale en U est contenue dans le cytosol dans lequel la distribution de l’U sur les biomolécules (en fonction de leur PM mais aussi de leur pI) diffère selon le niveau d’exposition. Enfin, une cartographie des biomolécules cibles de l’U a permis (i) de mettre en évidence une affinité particulière de l’U pour les protéines à caractère acide et/ou contenant du phosphore et (ii) d’identifier 24 protéines candidates pour lier UThe objective of this thesis is to study the cellular compartmentalization and the chelation of uranium (U) by cytosolic proteins of gill cells of the zebrafish (Danio rerio, model species in aquatic toxicology) under different direct exposure conditions (chronic vs. acute, 20 and 250 µg.L 1). This study required the development of hyphenated techniques (SEC, IEF off-gel, RP-UHPLC for the separation, ICP-SFMS, ESI-FTMS/MS for the detection) with the main challenges of maintaining the non-covalent U-biomolecule interactions and enhancing sensitivity for the analysis of environmentally relevant samples. After extraction, 24% to 32% of the total U detected in the gills were present in the cytosolic fraction, in which the U distribution on the biomolecules (as a function of their MW and pI) varied depending on the exposure level. Finally, U target biomolecules mapping allowed us (i) to highlight a particular affinity of U for acidic and/or P-containing proteins and (ii) to identify 24 protein candidates for U binding
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Picard-Deland, Eliane. "Les effets combinés d'une protéine de poisson et d'un supplément d'acides gras N-3 d'origine marine sur le profil lipidique et l'inflammation chez des hommes et des femmes résistants à l'insuline." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28567/28567.pdf.
Full text
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Dal-Pra, Sophie. "Etude des mécanismes contrôlant la formation de l’axe dorso-ventral et analyse de l’établissement et du maintien des structures axiales au cours de l’embryogenèse précoce du poisson zèbre (Danio rerio)Study of the mechanisms controling the formation of the dorso-ventral axis and analysis of the establishment and the maintenance of axial structures during early embryogenesis of the zebrafish (Danio rerio)." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2007. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2007/DAL-PRA_Sophie_2007.pdf.
Full textAbstract:
Le centre organisateur de Spemann, situé dorsalement, participe à l’établissement de l’axe Dorso-Ventral et se différencie en structures axiales. J’ai étudié ces deux aspects de l’écusson embryonnaire, la structure analogue à l’Organisateur chez le poisson zèbre. La régionalisation DV des embryons résulte en partie de l’interaction entre les BMP, exprimés ventralement,et leurs antagonistes sécrétés dorsalement. J’ai montré que les antagonistes Nog1 et Fstl2 fonctionnent de façon redondante à Chd, un autre antagoniste des BMP, pendant les stades Blastula/Gastrula pour établir un gradient DV de BMP. Ensuite j’ai étudié le rôle des facteurs de transcription de la famille FoxA dans le développement des structures axiales. Ces facteurs sont requis pendant la gastrulation afin de maintenir l’identité des précurseurs de l’axe. Cette activité est partiellement redondante à celle de Flh. En conclusion, l’écusson participe à la formation de l’axe DV et à celle des structures axiales, en utilisant des molécules aux activités redondantes.
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Letellier, Guillaume. "Modélisation du complexe récepteur muscarinique/ toxique MT7 à partir de données thermodynamiques." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00447060.
Full textAbstract:
Les récepteurs muscariniques à l'acétylcholine sont des protéines transmembranaires jouant des rôles dans de nombreux processus physiologiques. La toxine MT7 est un puissant modulateur allostérique de ces récepteurs. De plus, cette toxine est le seul ligand connu spécifique du sous-type 1 des récepteur muscariniques (hM1). Nous avons étudié les bases moléculaires de l'interaction entre la toxine MT7 et le récepteur hM1 par modélisation. Tout d'abord un échantillonnage des structures des deux partenaires a été réalisé par dynamique moléculaire. Les mouvements de grande amplitude de la boucle e2 du récepteur ont été prédits par dynamique activée. Puis la toxine a été arrimée sur le récepteur par des calculs de dynamique moléculaire sous contraintes ambigües dérivées de données de mutagénèse. Ce modèle a ensuite été optimisé par une simulation de dynamique moléculaire libre, en environnement membranaire explicite. Enfin, des calculs en retour des valeurs d'énergie libre de liaison ont été effectués afin de valider le modèle. Nous prédisons que la toxine se lie sur un dimère de récepteurs hM1. Le cœur de l'interaction est localisé sur un des monomères en contact avec les boucles II et III de la toxine. Cette interaction est complétée par des interactions hydrophobes au niveau de la boucle I sur le second monomère. L'analyse de ce modèle apporte des éléments de compréhension à la fois sur bases structurale de la haute affinité de cette toxine ainsi que sur sa sélectivité pour ce sous-type de récepteur. Il apparaît que cette sélectivité est essentiellement portée par la boucle extracellulaire e2 du récepteur.