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Dissertations / Theses on the topic 'Protéines – Séparation – Simulation par ordinateur'

Author: Grafiati
Published: 8 June 2024
Last updated: 31 July 2025

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Irankunda, Rachel. "Nickel Chelating Peptides & Chromatography : From Peptides Separation Simulation up to their Antioxidant Activities - related Applications." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2023. http://www.theses.fr/2023LORR0213.

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Abstract:
Les peptides chélateurs de métaux (PCMs), issus d'hydrolysats de protéines, présentent diverses applications dans les domaines de la nutrition, de la pharmacie, des cosmétiques, etc. Cependant, l'approche empirique généralement utilisée pour découvrir des peptides bioactifs à partir d'hydrolysats est longue et coûteuse en raison de nombreuses étapes de fractionnement, de séparation et d'évaluation des activités biologiques. Cette thèse a donc pour but de développer une nouvelle approche pour la prédiction de la séparation des PCMs en utilisant la modélisation et la simulation chromatographique
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Chlendi, Mohamed. "Séparation de gaz par adsorption modulée en pression." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1993. http://www.theses.fr/1993INPL048N.

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Abstract:
L'objet de ce travail est la conception, l'étude et le dimensionnement d'opérations multicolonnes et multiadsorbants. Le travail présenté est surtout de nature méthodologique: il s'agit de développer et de tester des nouveaux outils et des nouvelles méthodes ayant un caractère assez géneral. Néanmoins, l'ensemble de cette étude s'appuiera sur une application proposée par le partenaire industriel de cette recherche: il s'agit de la production d'hydrogène pur par adsorption modulée en pression (PSA), à partir de gaz de cracking du gaz naturel. On a développé les modèles mathématiques utilisés po
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Joulia, Xavier. "Simulation des procédés chimiques en régime permanent : formulation et convergence." Toulouse, INPT, 1987. http://www.theses.fr/1987INPT021G.

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Abstract:
Définition de la stratégie de calcul optimal, à adopter pour simuler le procédé considéré. Une étude comparative est faite entre les performances des approches modulantes simultanées et séquentielles. On applique cette étude plus précisément aux procédés de séparation diphasique multiétage et multicomposant et plus particulièrement à une installation liquide liquide multiétagée à contrecourant. Finalement on propose un système de sélection automatique de la méthode en fonction du problème considéré.
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Hénin, Jérôme. "Simulations moléculaires d'événements rares dans les systèmes biologiques membranaires." Nancy 1, 2006. http://www.theses.fr/2006NAN10007.

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Abstract:
Les processus lents ou non spontanés impliquant les macromolécules du vivant peuvent être étudiés par simulations de dynamique moléculaire, pourvu qu'un algorithme assiste l'exploration par le système d'une coordonnée de réaction bien choisie. Nous avons mis en place un tel algorithme dans le programme NAMD destiné aux simulations à grande échelle des systèmes biomoléculaires. Il nous est ainsi possible d'explorer le repliement de peptides en hélice alpha, la reconnaissance et l'association de protéines au sein de la membrane, ou encore le transport spécifique d'une petite molécule, le glycéro
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Henry, Daniel. "Simulation numérique 3D des mouvements de convection thermosolutale d'un mélange binaire : étude paramétrique de l'influence de la convection sur la séparation des espèces du mélange par effet Soret, dans un cylindre incliné." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO10029.

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Rottereau, Manuel. "Agrégation, percolation et séparation de phase d'une assemblée de sphères dures browniennes adhésives : approche par simulation hors réseau." Le Mans, 2005. http://cyberdoc.univ-lemans.fr/theses/2005/2005LEMA1003.pdf.

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Abstract:
Les fluides et systèmes complexes constituent une classe de " matériaux " au sens large dont l'originalité des propriétés statiques et dynamiques résulte a la fois de la structure chimique des particules élémentaires qui les constituent et de leur organisation dans l'espace en particulier aux échelles mésoscopiques. Ces systèmes sont souvent le lieu de phénomènes d'agrégation, de gélification et/ou de séparation de phase dus aux interactions entre les entités constituantes. L'objectif de cette thèse est de comprendre la formation de ces structures et leur façon de remplir l'espace par modélisa
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Chouikhi, Najib. "Production de biométhane à partir de biogaz par technologie de séparation par adsorption PSA : optimisation numérique par approche multi-échelle." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPAST043.

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Abstract:
A mesure que l'intérêt mondial pour les énergies renouvelables s'intensifie, la production de biogaz ne cesse de croître, car elle est une source renouvelable et propre. La technologie de séparation par adsorption modulée en pression (Pressure Swing Adsorption ou PSA) se présente alors comme une des technologies intéressantes permettant la valorisation du biogaz en biométhane. La grande flexibilité du procédé PSA est liée en une certaine manière à sa complexité avec plusieurs paramètres de design et opératoires contrôlant les performances de l’unité de séparation. L’identification de ces param
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Rhioui, Saloua. "Nouvelles approches pour la séparation de sources." Toulon, 2006. http://www.theses.fr/2006TOUL0020.

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Abstract:
La séparation aveugle de source est un domaine en pleine effervescence dans la communauté du traitement du signal en raison de ces nombreuses applications potentielles en télécommunications, bio-médicale, géophysique, traitement du son, traitement d'images, radar, etc. . . . Ceci explique en partie la grande popularité de cette thématique. Cette thèse propose de nouvelles approches pour la séparation de sources aléatoires. Deux grands problèmes sont abordés. Le premier concerné la séparation de mélange instantané de signaux sources cyclestationnaires et le second, plus conséquent, concerne la
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Youssef, Siham. "Conception de colonnes de rectification complexes par une méthode short-cut : application aux cascades de séparation." Toulouse, INPT, 1989. http://www.theses.fr/1989INPT042G.

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Abstract:
Ce memoire est consacre a une methode short-cut de dimensionnement d'une colonne de rectification comportant plusieurs alimentations et soutirages lateraux pour la separation de melanges multi-constituants. La procedure est fondee sur un principe de decomposition de la colonne en plusieurs sections pour chacune desquelles il est possible de determiner le reflux minimum ainsi que le nombre de plateaux minimum a partir de formules classiques de fenske, underwood, gilliland. L'algorithme fournit tres rapidement le reflux operatoire, le nombre de plateaux theoriques, les debits et compositions des
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Achir, Samira. "Etude des mécanismes de stabilisation des protéines par spectroscopie Raman et dynamique moléculaire." Thesis, Lille 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LIL10022/document.

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Abstract:
Cette thèse est une contribution à l’étude des mécanismes de stabilisation des protéines en solution et à l’état sec. Un nombre considérable de biomolécules thérapeutiques émanant des avancées de la technologie ADN recombinant sont porteuses de nouvelles approches thérapeutiques, mais ne peuvent pas être utilisées à cause de leur très faible stabilité. Celle-ci est améliorée à l’état sec, après lyophilisation qui est toutefois source de nombreux stress pour la protéine. Les travaux ont principalement focalisé sur l’étude de la stabilité de l’état physique de protéines modèles, par micro-spectr
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Santini, Sébastien. "Flexibilité et changements topologiques de la protéine prion et du peptide β-amyloi͏̈de d'Alzheimer par simulations numériques". Aix-Marseille 1, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX11029.

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Abstract:
Les amyloi͏̈doses sont des maladies neuro-dégénératives caractérisées par l'accumulation de fibres protéiques dans le système nerveux. Nous avons choisi d'étudier les mécanismes d'agrégation en fibre pour deux des protéines amyloi͏̈des les plus connues : la protéine prion (fragment PrP90-231) et le peptide Aß d'Alzheimer (fragment 16-22). Les études de la protéine prion ont été menées par dynamique moléculaire pour appréhender les changements topologiques impliqués lors de la conversion de PrP[C] en PrP[Sc]. Ainsi, nous avons mis en évidence que la dynamique du coeur structuré (124-226) de PrP
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Lelimousin, Mickaël. "Traitement des interactions électrostatiques dans les systèmes moléculaires : étude par simulation numérique de protéines fluorescentes." Grenoble 1, 2009. http://www.theses.fr/2009GRE10075.

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Abstract:
Les processus réactionnels des systèmes biologiques sont désormais modélisés par des méthodes de plus en plus précises de mécanique quantique (MQ) associées aux champs de force de mécanique moléculaire (MM). Cette amélioration induit des complications dans le traitement habituel des interactions électrostatiques MQ/MM. Dans la première partie de cette thèse, nous avons développé une approche plus cohérente pour le calcul de ces interactions. Dans une seconde partie, nous avons appliqué certaines méthodes de simulation numérique aux protéines fluorescentes. Une étude de dynamique moléculaire a
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Salmon, Joseph. "Agrégation d'estimateurs et méthodes à patchs pour le débruitage d'images numériques." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077195.

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Abstract:
Le problème étudié dans cette thèse est celui du débruitage d'images numériques corrompues par un bruit blanc gaussien. Les méthodes utilisées pour récupérer une meilleure image reposent sur les patchs et sont des variantes des Non-Local Means. Les contributions de la thèse sont à la fois pratiques et théoriques. Tout d'abord, on étudie précisément l'influence des divers paramètres de la méthode. On met ensuite en lumière une limite observée sur le traitement des bords par les méthodes à patchs habituelles. On donne alors une meilleure façon de combiner l'information fournie à partir des patch
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Paul, Nicodème. "Développement de nouvelles applications en criblage virtuel." Strasbourg 1, 2003. http://www.theses.fr/2003STR13193.

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Abstract:
Basé sur le docking moléculaire, le criblage virtuel devient de plus en plus utilisé dans la recherche pharmaceutique. En vue d'améliorer les résultats de docking, nous avons développé Consdock, outil d'analyse des interactions Ligand - Récepteur. Appliqué à trois outils de docking, Gold, FlexX et Gold pour un ensemble de 100 complexes, ConsDock a pu générer des résultats meilleurs que ceux obtenus par chacun des outils utilisés, avec une précision avoisinant 1 Å. Par ailleurs, nous nous sommes intéressés à une application moins connue du criblage virtuel, le criblage inverse. Celui-ci consist
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Faiget, Laurent. "Séparation de l'influence du local et de l'enceinte pour la prévision de l'intelligibilité dans des conditions d'écoute difficiles." Toulouse 3, 1997. http://www.theses.fr/1997TOU30151.

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Abstract:
Le theme de la recherche est la modelisation de l'intelligibilite de la parole dans de grands locaux bruyants et reverberants en dissociant la contribution du systeme de transmission electroacoustique de celle du local ou s'effectue la propagation. L'etude traite le cas d'une enceinte acoustique et d'un auditeur place dans l'axe principal de rayonnement du transducteur. Les contributions respectives de la salle, de l'enceinte et du bruit masquant sont incluses dans la variable du modele appelee rapport signal-sur-bruit equivalent. Celle de l'enceinte est representative de l'influence de la rep
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Druart, Karen. "Défis algorithmiques pour les simulations biomoléculaires et la conception de protéines." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLX080/document.

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Abstract:
Le dessin computationnel de protéine, ou CPD, est une technique qui permet de modifier les protéines pour leur conférer de nouvelles propriétés, en exploitant leurs structures 3D et une modélisation moléculaire. Pour rendre la méthode de plus en plus prédictive, les modèles employés doivent constamment progresser. Dans cette thèse, nous avons abordé le problème de la représentation explicite de la flexibilité du squelette protéique. Nous avons développé une méthode de dessin "multi-états", qui se base sur une bibliothèque discrète de conformations du squelette, établie à l'avance. Dans un cont
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Ribault, Judicaël. "Reuse and Scalability in Modeling and Simulation Software Engineering." Phd thesis, Université de Nice Sophia-Antipolis, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00604014.

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Abstract:
L'étude d'un système à l'aide de simulations informatiques à événements discrets implique plusieurs activités: spéci cation du modèle conceptuel, description de l'architecture logicielle du modèle, développement des logiciels, scénarisation de la simulation, instrumentation, plani cation d'expérimentation, con guration des ressources de calcul, exécution, post-traitement et analyse, validation et de véri cation (V&V). De nombreux éléments logiciels sont requis pour remplir toutes ces activités. Toutefois, il est fréquent de créer un nouveau simulateur à partir de rien quand on commence une étu
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Guifo, Fodjo A. Yvan. "Séparation des préoccupations dans les modèles compartimentaux étendus." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS262.

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Abstract:
La modélisation mathématique et la simulation informatique ont très souvent contribué à améliorer notre degré de compréhension, de prédiction et de prise de décision face aux épidémies. Cependant, un problème très souvent rencontré lors de l’élaboration et la mise en œuvre des modèles épidémiologiques est le mélange des différents aspects du modèle. En effet, les modèles épidémiologiques deviennent de plus en plus complexes au fur et à mesure que de nouvelles préoccupations sont prises en compte (âge, sexe, hétérogénéité spatiale, politiques de confinement ou de vaccination, etc.). Ces aspects
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Lanrezac, André. "Interprétation de données expérimentales par simulation et visualisation moléculaire interactive." Electronic Thesis or Diss., Université Paris Cité, 2023. http://www.theses.fr/2023UNIP7133.

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Abstract:
L'objectif de l'approche des simulations moléculaires interactive (Interactive Molecular Simulations - IMS) est d'observer en direct la dynamique conformationnelle d'une simulation moléculaire en cours. Le retour visuel instantané permet un suivi instructif ainsi que l'observation des changements structurels imposés par la manipulation de l'IMS par l'utilisateur. J'ai mené une étude approfondie des connaissances pour rassembler et synthétiser l'ensemble des recherches qui ont développé l'IMS. La dynamique moléculaire interactive (Interactive Molecular Dynamics - IMD) est l'un des premiers prot
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Hervy, Jordan. "Modélisation de l'interaction dynamique protéines Tau - microtubules." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018GREAY062/document.

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Abstract:
La maladie d’Alzheimer, de nombreux syndromes parkinsoniens, certaines démences fronto-temporales telle que la maladie de Pick sont des exemples de maladies neurodégénératives appelées « tauopathies » qui sont caractérisées par la présence d’agrégats intracellulaires de protéines Tau dans le cerveau des sujets atteints. La formation de tels agrégats résulterait de l’altération des propriétés et fonctions normales des protéines Tau à réguler et structurer les réseaux de microtubules au sein des axones ; ce qui se traduit par une perte progressive de la masse des microtubules dans les axones, la
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Cinar, Éric. "Structure et dynamique dans les solutions aqueuses d'urée et d'acétone : étude par simulation de dynamique moléculaire." Lille 1, 2006. https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Num/2006/50376_2006_164.pdf.

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Abstract:
La stabilité et l'activité des molécules biologiques sont liées à la structure et la dynamique de l'eau, du fait des nombreuses liaisons hydrogène que l'eau forme avec celles-ci. L'urée est une molécule organique qui est bien connue pour ses propriétés dénaturantes vis-à-vis des protéines, alors que l'acétone ne présente pas cette particularité. Nous avons étudié par simulation de dynamique moléculaire l'influence de l'urée et de l'acétone sur la structure et la dynamique de l'eau, à l'aide d'observables que nous avons préalablement définies. Nous avons validé les modèles de potentiels d'inter
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Chaouchi, Chahinez. "Méthodes de séparation aveugle de sources non linéaires, étude du modèle quadratique 2X2." Toulouse 3, 2011. http://thesesups.ups-tlse.fr/1375/.

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Abstract:
Cette thèse présente des méthodes de séparation aveugle de sources pour un modèle de mélange non-linéaire particulier, le cas quadratique avec auto-termes et termes croisés. Dans la première partie, nous présentons la structure de séparation étudiée qui se décline sous deux formes : étendue ou basique. Les propriétés de ce réseau récurrent sont ensuite analysées (points d'équilibre, stabilité locale). Nous proposons alors deux méthodes de séparation aveugle de sources. La première exploite les cumulants des observations en un bloc placé en amont de la structure récurrente. La deuxième méthode
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Noël, Marilyne. "Influence de la température et des hautes pressions hydrostatiques sur l'activité et la stabilité d'enzymes en présence ou non d'additifs." Toulouse, INSA, 2001. http://www.theses.fr/2001ISAT0018.

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Abstract:
La stabilité thermique (40-60ʿC) ou hyperbare (300-500MPa) de la lipase de Rhizomucor miehei a été étudiée. Les cinétiques d'inactivation obtenues ont permis la détermination des paramètres cinétiques et thermodynamiques liés à la dénaturation irréversible de la lipase. L'utilisation d'un modèle a conduit à la validation de ces paramètres. Cette étude a été complétée par des observations en spectrophotométrie de fluorescence qui ont confirmé l'existence de deux mécanismes différents au niveau moléculaire, lors de la dénaturation de l'enzyme par ces deux agents. La combinaison des effets de la
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Siangsanun, Vorasiri. "Hybrid process : hydrocyclone, coagulation, floculation and flotation for water treatment process." Thesis, Toulouse, INSA, 2010. http://www.theses.fr/2010ISAT0019/document.

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Abstract:
L'objectif de cette étude est de développer un procédé hybride qui combine à lacoagulation, la floculation et le procédé de flottation dans un hydroclone pour réaliser letraitement de l'eau. Le développement sert à déterminer la caractérisationhydrodynamique ainsi que les conditions optimales pour réaliser le traitement de l'eau.L'étude de caractérisation hydrodynamique est réalisée à l’aide d’une simulationnumérique (Computational Fluid Dynamics). Le travail expérimental a été réalisé à l’aidede la technique dite de l'échographie Doppler afin d’étudier l'hydrodynamique. Lesrésultats ont servi
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Folch, Benjamin. "Etude bioinformatique de la stabilité thermique des protéines: conception de potentiels statistiques dépendant de la température et développement d'approches prédictives." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2010. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210106.

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Abstract:
Cette thèse de doctorat s’inscrit dans le cadre de l’étude in silico des relations qui lient la séquence d’une protéine à sa structure, sa stabilité et sa fonction. Elle a pour objectif de permettre à terme la conception rationnelle de protéines modifiées qui restent actives dans des conditions physico chimiques non physiologiques. Nous nous sommes plus particulièrement penchés sur la stabilité thermique des protéines, qui est définie par leur température de fusion Tm au delà de laquelle leur structure n’est thermodynamiquement plus stable. Notre travail s’articule en trois grandes parties :la
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Rudwill, Floriane. "Conséquences d’une simulation d’impesanteur de 21 jours chez l’homme sur le métabolisme des lipides et effets d’une supplémentation en protéines testée comme contremesure." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ009/document.

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Abstract:
Au cours d’une simulation de la microgravité de 21 jours, le développement de plusieurs altérations métaboliques ont été étudiées : une inflammation de bas-niveau et une altération de la sensibilité à l’insuline et du métabolisme lipidique. Connues pour leurs impacts positifs sur le métabolisme, une supplémentation en protéines du petit lait, combinée à des sels alcalins, a également été testée.Contrairement aux études précédentes, aucune inflammation, ni altération du métabolisme lipidique n’a été clairement décrite dans notre étude. En revanche une diminution de l’oxydation des glucides en f
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Bertrand, Carl. "Modélisation de la séparation magnétique de basse intensité sur tambours rotatifs : enrichissement du minerai Havre Saint-Pierre de Rio Tinto, Fer et Titane." Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/27756/27756.pdf.

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Malod-Dognin, Noël. "La comparaison structurale des protéines : de la maximisation du recouvrement de cartes de contacts à l'alignement basé sur les distances." Phd thesis, Université Rennes 1, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00509142.

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Abstract:
En biologie structurale, il est couramment admit que la structure tridimensionnelle d'une protéine détermine sa fonction. Ce paradigme permet de supposer que deux protéines possédant des structures tridimensionnelles similaires peuvent partager un ancêtre commun et donc posséder des fonctions similaires. Déterminer la similarité entre deux structures de protéines est une tâche importante qui a été largement étudiée. Parmi toutes les méthodes proposées, nous nous intéressons à la mesure de similarité appelée “maximisation du recouvrement de cartes de contacts” (ou CMO), principalement parce qu'
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Sirota, Leite Fernanda. "Role of the amino acid sequences in domain swapping of the B1 domain of protein G by computation analysis." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2007. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210657.

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Abstract:
Domain swapping is a wide spread phenomenon which involves the association between two or more protein subunits such that intra-molecular interactions between domains in each subunit are replaced by equivalent inter-molecular interactions between the same domains in different subunits. This thesis is devoted to the analysis of the factors that drive proteins to undergo such association modes. The specific system analyzed is the monomer to swapped dimer formation of the B1 domain of the immunoglobulin G binding protein (GB1). The formation of this dimer was shown to be fostered by 4 amino acid
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Ballivian, Renaud. "Étude de complexes non-covalents et de polymères organiques par couplage entre la spectrométrie de masse et la mobilité ionique." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10219.

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Abstract:
L’étude de la structure de complexes non-covalents présente un intérêt fondamental dans la recherche en chimie des protéines. Le premier objectif est de caractériser les interactions physico-chimiques sur lesquelles repose l’adoption d’une structure tridimensionnelle fonctionnelle par un édifice multimoléculaire. Le second objectif est de mettre en évidence les changements structuraux induits par le phénomène de complexation, et leur influence sur la fonction du système. Le couplage entre la spectrométrie de masse et la mobilité ionique (IM/MS) est une technique d’étude structurale en phase ga
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Gillet, Natacha. "Simulations Numériques de Transferts Interdépendants d’Electrons et de Protons dans les Protéines." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112159/document.

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Abstract:
Les processus d’oxydo-réduction impliquant des molécules organiques se retrouvent très fréquemment dans les protéines. Ces réactions comprennent généralement des transferts d’électrons et de protons qui se traduisent dans le bilan réactionnel par des transferts couplés proton-électron, des transferts simples d’hydrogène, d’hydrure... Une des principales méthodes pour élucider ces mécanismes est fournie par l'évaluation de grandeurs thermodynamiques et cinétiques. Expérimentalement, ces informations sont cependant obtenues avec une résolution temporelle souvent limitée à la milli/microseconde.
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Cregut, David. "Application de la modélisation moléculaire à l'étude stsructurale de la tropomyosine et des annexines : une approche complémentaire de l'expérience." Montpellier 2, 1995. http://www.theses.fr/1995MON20026.

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Abstract:
Les methodes recentes de modelisation moleculaire ont ete appliquees a deux problematiques de biologie structurale des proteines concernant la tropomyosine et les annexines. Des modeles moleculaires de la super-helice de tropomyosine ont ete construits a partir de donnees partielles de cristallographie. L'analyse de ces modeles a permis de preciser l'influence et la specificite des interactions hydrophobes et electrostatiques sur l'association entre les deux chaines en helice alpha de la molecule. Des modeles moleculaires d'annexine i ont ete construits par homologie, a partir de la structure
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Patient, Guillaume. "Étude in silico de la structure et des interactions protéine-ligand de FFA4 à des fins de Drug Design." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024ULILS073.

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Abstract:
Les récepteurs couplés aux protéines G (GPCR) sont des cibles médicamenteuses importantes, représentant 35 % du total des cibles médicamenteuses approuvées. Ces récepteurs sont des protéines transmembranaires impliquées dans la signalisation cellulaire de stimuli externes (hormones, neurotransmetteurs, ions...) et induisent l'activation de la protéine G associée via l'échange GDP/GTP. Au cours des 20 dernières années, des RCPG désorphanisés ont été mis en évidence comme étant actifs dans le métabolisme des lipides : des études ont montré que la modulation de l'activité du GPR 120 (FFA4), princ
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Belghit, Hayet. "VASSIMODo - Analyse visuelle des structures secondaires en dynamique moléculaire." Electronic Thesis or Diss., Reims, 2024. http://www.theses.fr/2024REIMS003.

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Abstract:
En modélisation moléculaire, les simulations numériques de dynamique moléculaire sont de plus en plus utilisées. Avec l’évolution du calcul haute performance, grâce aux nouvelles générations de processeurs, ces simulations sont produites pour des systèmes de plus en plus complexes ainsi que sur des temps de simulation de plus en plus longs. Avec l’essor du rendu graphique, le rôle de l’image est devenu primordial. Ces progrès ont donné naissance à une nouvelle discipline informatique, la visualisation scientifique, étudiant la génération de représentations graphiques intelligibles et interacti
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Xu, Zeren. "Le rôle et les mécanismes de l'assemblage de REMORIN." Electronic Thesis or Diss., Bordeaux, 2024. http://www.theses.fr/2024BORD0307.

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Abstract:
Les remorines (REMs) sont des protéines multifonctionnelles qui jouent des rôles essentiels dans l'immunité des plantes, le développement et la symbiose en s'associant à la membrane plasmique et en séquestrant des lipides spécifiques dans des nanodomaines membranaires fonctionnels. Ces protéines sont classées dans une famille multigénique avec six groupes caractérisés par des compositions distinctes de domaines de protéines. Tous les membres de la famille des REMs partagent une ancre membranaire C-terminale (REM-CA), un domaine d'homo-oligomérisation, et une région N-terminale intrinsèquement
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Wang, Guan. "Roles of substrate rigidity and composition in membrane trafficking." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC195.

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Abstract:
Du cerveau à l’os, la rigidité et la composition de la matrice extracellulaire varient énormément et jouent un rôle dans les réponses cellulaires. La rigidité influe également sur la tension de la membrane plasmique, elle-même régulée par le trafic membranaire. Comment la rigidité et la composition du substrat peuvent réguler l'exocytose, qui à son tour régule la tension de la membrane, reste largement inconnu. Ici, j'ai utilisé l’imagerie pHluorin d’évènements uniques d’exocytose de cellules cultivées sur des substrats de rigidité et de composition contrôlée pour explorer la régulation de VAM
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Medkour, Terkia. "Modélisation mathématique et simulation numérique de la polymérisation de l’hémoglobine drépanocytaire." Thesis, Paris Est, 2008. http://www.theses.fr/2008PEST0044/document.

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Abstract:
La drépanocytose, ou anémie falciforme, présente une variabilité interindividuelle considérable, conditionnée par de multiples facteurs, dynamiques et interactifs, depuis le niveau moléculaire jusqu’au niveau du patient. L’hémoglobine drépanocytaire, ou hémoglobine S (HbS, tétramère a2bS 2), est un mutant de l’hémoglobine A (a2b2) : elle possède à sa surface une valine (hydrophobe) substituant un acide glutamique natif (négativement chargé). Cette mutation entraîne l’agrégation de l’HbS désoxygénée en polymères, ainsi que l’altération des propriétés de l’érythrocyte -dont sa rhéologie et ses i
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Bernales, chavez Braulio. "Modélisation de l'hydrodynamique et des transferts dans les procédés de filtration membranaire." Thesis, Aix-Marseille, 2013. http://www.theses.fr/2013AIXM4779/document.

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Abstract:
L'accumulation du soluté à la surface d'une membrane entraîne le phénomène de polarisation de concentration. Ceci est un problème qui affecte tous les systèmes de filtration membranaire car il a pour effet une augmentation de la pression osmotique et par conséquence une réduction substantielle du flux de perméat. Afin de comprendre ce phénomène, nous avons d'abord mené une étude analytique de la filtration tangentielle en solvant pur prenant en compte de l'influence de la pression motrice locale sur le taux de perméation. Lors de cette étude, des solutions analytiques qui augmentent en précisi
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Tran, Thanh Thuy. "Lattice model for amyloid peptides : OPEP force field parametrization and applications to the nucleus size of Alzheimer's peptides." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCC187/document.

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Abstract:
La maladie d’Alzheimer touche plus de 40 millions de personnes dans le monde et résulte de l’agrégation du peptide beta-amyloïde de 40/42 résidus. En dépit de nombreuses études expérimentales et théoriques, le mécanisme de formation des fibres et des plaques n’est pas élucidé, et les structures des espèces les plus toxiques restent à déterminer. Dans cette thèse, je me suis intéressée à deux aspects. (1) La détermination du noyau de nucléation (N*) de deux fragments (Aβ)16-22 et (Aβ)37-42. Mon approche consiste à déterminer les paramètres OPEP du dimère (Aβ)16-22 en comparant des simulations M
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Ruiz, Echartea Maria Elisa. "Pairwise and Multi-Component Protein-Protein Docking Using Exhaustive Branch-and-Bound Tri-Dimensional Rotational Searches." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2019. http://www.theses.fr/2019LORR0306.

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Abstract:
La détermination des structures tri-dimensionnelles (3D) des complexes protéiques est cruciale pour l’avancement des recherches sur les processus biologiques qui permettent, par exemple, de comprendre le développement de certaines maladies et, si possible, de les prévenir ou de les traiter. Face à l’intérêt des complexes protéiques pour la recherche, les difficultés et le coût élevé des méthodes expérimentales de détermination des structures 3D des protéines ont encouragé l’utilisation de l’informatique pour développer des outils capables de combler le fossé, comme par exemple les algorithmes
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Jobic, Yann. "Numerical approach by kinetic methods of transport phenomena in heterogeneous media." Thesis, Aix-Marseille, 2016. http://www.theses.fr/2016AIXM4723/document.

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Abstract:
Les phénomènes de transport en milieux poreux sont étudiés depuis près de deux siècles, cependant les travaux concernant les milieux fortement poreux sont encore relativement peu nombreux. Les modèles couramment utilisés pour les poreux classiques (lits de grains par exemple) sont peu applicables pour les milieux fortement poreux (les mousses par exemple), un certain nombre d’études ont été entreprises pour combler ce manque. Néanmoins, les résultats expérimentaux et numériques caractérisant les pertes de charge dans les mousses sont fortement dispersés. Du fait des progrès de l’imagerie 3D, u
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Babajee, Jayson. "Detailed numerical characterization of the separation-induced transition, including bursting, in a low-pressure turbine environment." Phd thesis, Ecole Centrale de Lyon, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00984351.

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Abstract:
La turbine basse-pression est un composant essentiel d'un turboréacteur car elle entraine la soufflante qui génère la plus grande partie de la poussée dans la configuration actuelle des turboréacteurs à double flux. Dans la perspective d'accroître son rendement en termes de consommation de carburant, il y a une recherche permanente dans la réduction du nombre d'aubage (c'est-à-dire la réduction de la masse) qui implique un chargement plus élevé par aube de rotor. Cet environnement est caractérisé par un écoulement dont le nombre de Reynolds est faible ainsi qu'une large diffusion le long de la
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Peng, Shuiran. "Analyse mathématique et numérique de plusieurs problèmes non linéaires." Thesis, Poitiers, 2018. http://www.theses.fr/2018POIT2306/document.

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Abstract:
Cette thèse est consacrée à l’étude théorique et numérique de plusieurs équations aux dérivées partielles non linéaires qui apparaissent dans la modélisation de la séparation de phase et des micro-systèmes électro-mécaniques (MSEM). Dans la première partie, nous étudions des modèles d’ordre élevé en séparation de phase pour lesquels nous obtenons le caractère bien posé et la dissipativité, ainsi que l’existence de l’attracteur global et, dans certains cas, des simulations numériques. De manière plus précise, nous considérons dans cette première partie des modèles de type Allen-Cahn et Cahn-Hil
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Wong, King Jye. "Moisture absorption characteristics and effects on mechanical behaviour of carbon/epoxy composite : application to bonded patch repairs of composite structures." Phd thesis, Université de Bourgogne, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00949293.

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Abstract:
Le travail présenté dans ce mémoire avait pour objectif d'étudier le processus de la pénétration d'eau dans les composites en carbone/époxyde dans un premier temps, et dans un deuxième temps, d'étudier l'effet de la prise en eau par ces matériaux sur les performances mécaniques des composites et leur joints collés. L'intégration de ces phénomènes physiques dans la modélisation numérique est d'une grande importance dans la prédiction de la durabilité d'une structure en composite subissant un vieillissement hygrothermique. Par conséquent, ce travail consiste non seulement en des observations exp
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