Journal articles: 'Puces à ADN complémentaire'

1

Baron, D., M. Raharijaona, and R. Houlgatte. "Puces à ADN." IRBM 28, no. 5-6 (November 2007): 210–15. http://dx.doi.org/10.1016/j.rbmret.2007.11.010.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

2

Maréchal, V. "Puces à ADN (biopuces)." EMC - Biologie médicale 2, no. 3 (January 2007): 1–4. http://dx.doi.org/10.1016/s2211-9698(07)71386-9.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

3

Hinfray, Jérôme. "Puces à ADN, les intérêts rebondissent." Biofutur 1999, no. 194 (November 1999): 91–92. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(99)90131-x.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

4

Christen, R., C. Mabilat, and M. F. Gros. "Applications des puces à ADN en bactériologie." Archives de Pédiatrie 7 (May 2000): 330s—331s. http://dx.doi.org/10.1016/s0929-693x(00)80089-5.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

5

Chneiweis, Hervé. "Chroniques génomiques : des puces ADN en clinique ?" médecine/sciences 23, no. 2 (February 2007): 210–14. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2007232210.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

6

Feugeas, J. P. "Apport des puces à ADN en cancérologie." Bio tribune magazine 39, no. 1 (October 2011): 14–18. http://dx.doi.org/10.1007/s11834-011-0053-9.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

7

Jordan, B. "Puces à ADN : les brevets contre le progrès ?" médecine/sciences 17, no. 8-9 (2001): 893. http://dx.doi.org/10.4267/10608/2024.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

8

Minvielle, S. "Puces à ADN: techniques et apports en cancérologie." La Revue de Médecine Interne 28, no. 9 (September 2007): 662–66. http://dx.doi.org/10.1016/j.revmed.2007.04.019.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

9

Hinfray, Jérôme. "Puces à ADN et autres systèmes d'analyse génomique." Biofutur 2000, no. 206 (December 2000): E1—E14. http://dx.doi.org/10.1016/s0294-3506(00)90101-7.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

10

Merel, Patrick. "Congrès de l'AACC: de nouvelles puces à ADN." Biofutur 1995, no. 142 (February 1995): 46. http://dx.doi.org/10.1016/0294-3506(95)80042-5.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

11

Guéguen, Paul, Sylvia Redon, and Cédric Le Maréchal. "Puces à ADN (microArrays) et séquençage de nouvelle génération." Revue Francophone des Laboratoires 2015, no. 473 (June 2015): 63–70. http://dx.doi.org/10.1016/s1773-035x(15)30161-1.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

12

Lacombe, Didier, and Caroline Rooryck-Thambo. "Apport des puces à ADN et nouveaux syndromes microdélétionnels." Bulletin de l'Académie Nationale de Médecine 202, no. 3-4 (March 2018): 693–705. http://dx.doi.org/10.1016/s0001-4079(19)30310-3.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

13

-FUCHS, Alexandra. "Les puces à ADN : une révolution dans l'analyse génétique." Revue de l'Electricité et de l'Electronique -, no. 06 (2000): 91. http://dx.doi.org/10.3845/ree.2000.064.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

14

Donatin, E., and M. Drancourt. "Diagnostic des infections bactériennes par les puces à ADN." Bio tribune magazine 39, no. 1 (October 2011): 4–13. http://dx.doi.org/10.1007/s11834-011-0051-y.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

15

Raynal, Florence, Frédéric Plaza, Aurélien Beuf, Philippe Carrière, Éliane Souteyrand, Jean-René Martin, Jean-Pierre Cloarec, and Michel Cabrera. "Micromélangeur à advection chaotique pour l’hybridation des puces à ADN." La Houille Blanche, no. 2 (March 2006): 78–82. http://dx.doi.org/10.1051/lhb:200602009.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

16

Glaser, Philippe. "Les puces à ADN vont-elles révolutionner l’identification des bactéries ?" médecine/sciences 21, no. 5 (May 2005): 539–44. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2005215539.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

17

Sabatier, R., P. Finetti, N. Cervera, D. Birnbaum, and F. Bertucci. "Puces à ADN et prédiction de l'évolution clinique des cancers ovariens." Bulletin du Cancer 97, no. 8 (August 2010): 979–89. http://dx.doi.org/10.1684/bdc.2010.1162.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

18

Lajonchère, J. P. "Émergence de la technologie puces à ADN et conséquences à l’hôpital." IRBM 28, no. 5-6 (November 2007): 269–71. http://dx.doi.org/10.1016/j.rbmret.2007.11.001.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

19

Devauchelle, V., and G. Chiocchia. "Quelle place pour les puces à ADN dans les maladies inflammatoires ?" La Revue de Médecine Interne 25, no. 10 (October 2004): 732–39. http://dx.doi.org/10.1016/j.revmed.2004.02.004.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

20

De Witte, J. C., I. Deblauwe, Gill De Deken, R. De Deken, M. Madder, and Rudolf Meiswinkel. "Puces à ADN comme outil d'identification moléculaire pour Culicoides." Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 62, no. 2-4 (February 1, 2009): 144. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.10054.

Full text

Abstract:

A DNA microarray test based on internal transcribed spacer 1 (ITS1) genotype expression was developed to identify Culicoides species of Northwestern Europe belonging to the Culicoides Obsoletus complex. The assay was designed so as to allow interpretation by the naked eye. False positive and false negative results were eliminated. The need for expensive laboratory equipment and reagents was kept as low as possible, making the technique affordable and feasible for any diagnostic laboratory with polymerase chain reaction (PCR) facilities. The microarray test could be validated through the three ringtests organised by Medreonet. Use of this microarray can improve monitoring adult and immature Culicoides species.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

21

-BELLIS, M. "Miniaturisation et hauts débits en analyse biologique : les puces à ADN." Revue de l'Electricité et de l'Electronique -, no. 06 (2000): 88. http://dx.doi.org/10.3845/ree.2000.063.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

22

Devauchelle, Valérie, and Gilles Chiocchia. "Apports des puces à ADN dans la compréhension de la polyarthrite rhumatoïde." Revue du Rhumatisme 72, no. 4 (April 2005): 281–86. http://dx.doi.org/10.1016/j.rhum.2004.12.018.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

23

Ducray, F., J. Honnorat, and J. Lachuer. "Principes et intérêts pour l’étude des maladies neurologiques et technologie des puces ADN." Revue Neurologique 163, no. 4 (April 2007): 409–20. http://dx.doi.org/10.1016/s0035-3787(07)90417-8.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

24

Béri-Dexheimer, M., C. Bonnet, P. Chambon, K. Brochet, M. J. Grégoire, and P. Jonveaux. "L'hybridation génomique comparative sur microréseau d'ADN (puces à ADN) en pathologie chromosomique constitutionnelle." Pathologie Biologie 55, no. 1 (February 2007): 13–18. http://dx.doi.org/10.1016/j.patbio.2006.04.002.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

25

Andrieux, J. "Puces à ADN (CGH-array) : application pour le diagnostic de déséquilibres cytogénétiques cryptiques." Pathologie Biologie 56, no. 6 (September 2008): 368–74. http://dx.doi.org/10.1016/j.patbio.2008.04.011.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

26

Greillier, L., P. Roll, F. Barlesi, A. Robaglia-Schlupp, A. Fraticelli, P. Cau, and P. Astoul. "Apport des puces à ADN dans le diagnostic étiologique des pleurésies : étude de faisabilité." Revue des Maladies Respiratoires 24, no. 7 (September 2007): 859–67. http://dx.doi.org/10.1016/s0761-8425(07)91388-1.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

27

Beau, J., F. Delaunay, S. Lacoche, A. Gréchez-Cassiau, and F. Lévi. "Algorithme de détermination des profils d'expression génique circadienne analysés avec des puces à ADN." Pathologie Biologie 53, no. 5 (June 2005): 295–99. http://dx.doi.org/10.1016/j.patbio.2004.12.011.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

28

Bertucci, F., P. Viens, and D. Birnbaum. "Profils d'expression génique sur puces à ADN en cancérologie mammaire : principes et applications pronostiques." Pathologie Biologie 54, no. 1 (February 2006): 49–54. http://dx.doi.org/10.1016/j.patbio.2005.02.003.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

29

Bertucci, François, Pascal Finetti, Nathalie Cervera, and Daniel Birnbaum. "Classification pronostique du cancer du sein et profils d’expression génique sur puces à ADN." médecine/sciences 24, no. 6-7 (June 2008): 599–606. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20082467599.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

30

PITEL, F., and J. RIQUET. "Les marqueurs anonymes et la détection de leur polymorphisme." INRAE Productions Animales 13, HS (December 22, 2000): 45–53. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2000.13.hs.3810.

Full text

Abstract:

Les marqueurs génétiques les plus utilisés actuellement en génétique animale sont présentés, sans que soient développées dans le détail toutes les techniques mises en oeuvre. Nous distinguons les marqueurs utilisés avant la PCR (Polymerase Chain Reaction) et ceux qui sont employés depuis. Les marqueurs actuels sont également présentés en deux groupes : ceux qui sont utilisés pour une approche globale du génome et ceux que l’on emploie dans des approches ponctuelles, en distinguant la mise en évidence d’un polymorphisme et son exploitation à grande échelle. Nous évoquons enfin les SNP (Single Nucleotide Polymorphism), qui seront probablement des marqueurs très utilisés dans l’avenir grâce à la technologie des ’puces à ADN’.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

31

Phou, Ty, David Jugieu, and Anne-Marie Gue. "Conception d'un micro-injecteur matriciel pour la synthèse in situ d'oligonucléotides sur les puces ADN." La Houille Blanche, no. 5 (October 2003): 97–103. http://dx.doi.org/10.1051/lhb/2003096.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

32

Hedjazi, L., M. V. Le Lann, T. Kempowsky-Hamon, J. Aguilar-Martin, F. Dalenc, G. Favre, and M. Lacroix. "R80 – Oral: Élaboration de signatures de cancers par apprentissage de données issues de puces ADN." Bulletin du Cancer 97, no. 4 (October 2010): S46—S47. http://dx.doi.org/10.1016/s0007-4551(15)30998-x.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

33

Beuf, Aurélien, Florence Raynal, Jean-Noël Gence, and Philippe Carrière. "Optimisation du protocole de mélange et de la géométrie d’une chambre d’hybridation de puces à ADN." La Houille Blanche, no. 6 (December 2007): 39–44. http://dx.doi.org/10.1051/lhb:2007080.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

34

Paris, S., G. Bertrand, C. Kaplan, D. Rigal, and J. C. Brès. "Développement de puces à ADN pour le génotypage des antigènes plaquettaires humains HPA-1, -5 et -15." Transfusion Clinique et Biologique 20, no. 3 (June 2013): 321–22. http://dx.doi.org/10.1016/j.tracli.2013.03.107.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

35

Dalmasso, C., P. Broët, and T. Moreau. "Procédures de comparaisons multiples : principes et limites Applications à l’étude différentielle de l’expression transcriptionnelle par puces à ADN." Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique 52, no. 6 (December 2004): 523–37. http://dx.doi.org/10.1016/s0398-7620(04)99092-x.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

36

Guerrin Weber, M. "Développement et validation de puces à ADN dédiées à l’étude de la différenciation de l’épiderme humain normal et pathologique." Annales de Dermatologie et de Vénéréologie 131, no. 6-7 (June 2004): 648. http://dx.doi.org/10.1016/s0151-9638(04)93740-4.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

37

Bergot, E., and G. Zalcman. "Les puces ADN en oncologie thoracique : du diagnostic moléculaire à la définition de nouvelles cibles thérapeutiques, une révolution en marche ?" Revue des Maladies Respiratoires 24, no. 7 (September 2007): 821–24. http://dx.doi.org/10.1016/s0761-8425(07)91383-2.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

38

LE MIGNON, G., Y. BLUM, O. DEMEURE, E. LE BIHAN-DUVAL, P. LE ROY, and S. LAGARRIGUE. "Apports de la génomique fonctionnelle à la cartographie fine de QTL." INRAE Productions Animales 23, no. 4 (November 14, 2010): 343–58. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2010.23.4.3313.

Full text

Abstract:

De nombreux progrès ont été réalisés ces dernières années en génomique. Le développement de technologies à base de supports miniaturisés, permet aujourd’hui d’explorer les génomes tant au niveau de leur structure que de leur expression. Les puces à ADN permettent ainsi de génotyper plusieurs milliers de marqueurs SNP d’un génome ou encore de mesurer le niveau d’expression de plusieurs milliers de gènes d’un tissu. Combiner l’information génotypique avec des mesures phénotypiques élémentaires (ARNm, protéines ou encore métabolites) ouvre de nouvelles perspectives dans l’étude du fonctionnement du vivant et a donné naissance à un nouveau concept, la «génétique génomique». Cet article est centré sur les apports de la «génétique génomique» dans le contexte de la détection de QTL (Quantitative Trait Locus). Après avoir défini la notion de QTL d’expression (eQTL), cet article propose dans un premier temps un bilan des différents programmes de cartographie de QTL d’expression décrits dans la littérature. Sont ensuite présentés les différentes méthodes utilisant des données d’expression pour préciser ou caractériser fonctionnellement des régions QTL responsables de la variation de caractères d’intérêt avec des exemples concernant les animaux d’élevage.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

39

Tran, Trang, Cam Chi Nguyen, and Ngoc Minh Hoang. "Biclustering des données de biopuces par les arbres pondérés de plus long préfixe. Modélisation discrète des données de puces à ADN." Techniques et sciences informatiques 27, no. 1-2 (March 19, 2008): 83–108. http://dx.doi.org/10.3166/tsi.27.83-108.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

40

Viaux Savelon, Sylvie, Margaux Decherf, Nicolas Bodeau, Yves Ville, Isabelle Marey, David Cohen, and Marc Dommergues. "Le dépistage anténatal sur puces ADN (ACPA) lors des anomalies mineures de l’échographie fœtale affecte les représentations et l’état émotionnel maternel : une étude exploratoire." Devenir 32, no. 2 (2020): 105. http://dx.doi.org/10.3917/dev.202.0105.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

41

BIDANEL, J. P., D. BOICHARD, and C. CHEVALET. "De la génétique à la génomique." INRAE Productions Animales 21, no. 1 (April 20, 2008): 15–32. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2008.21.1.3372.

Full text

Abstract:

Cet article retrace les principales étapes et la contribution de l’INRA au développement de la génomique, qui révolutionne depuis deux décennies les connaissances sur la structure et le fonctionnement du génome des animaux d’élevage. L’élaboration, dans les années 90, des premières cartes de marqueurs microsatellites a rapidement permis de mettre en évidence de nombreux locus à effets quantitatifs et de localiser les premiers gènes majeurs. En parallèle, les travaux de cytogénétique et de génomique comparative permettaient de tirer parti de l’avancée des connaissances sur le génome de l’homme et de la souris. A la fin des années 90, la construction d’outils de cartographie à haute densité, cartes d’hybrides d’irradiation et banques de grands fragments, a permis l’essor des travaux de cartographie fine et l’identification des premières mutations causales. Le début des années 2000 a été marqué par le développement des outils d’étude systématique de l’expression des gènes, micro-réseaux et puces à ADN, le démarrage du séquençage des premiers génomes d’animaux d’élevage, et l’essor des bases de données génomiques et de la bioinformatique. La connaissance des séquences permet ensuite de détecter in silico leurs variations, en particulier les très nombreuses variations ponctuelles (SNP) et de caractériser finement la structure des génomes des populations animales. La génomique a également renouvelé les méthodes d’amélioration génétique des populations, avec la mise en place de programmes de sélection assistée par marqueurs, de caractérisation et de gestion de la variabilité génétique et le développement d’applications en matière de contrôle de généalogie ou de traçabilité.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

42

Renouard, L. "Projet financé par la SFRMS: modification de l’expression génique dans le cortex cérébral du rat pendant le sommeil paradoxal révélée par des puces à ADN et l’immuno-histochimie." Médecine du Sommeil 8, no. 1 (January 2011): 2–4. http://dx.doi.org/10.1016/j.msom.2011.01.003.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

43

BOICHARD, D., C. GROHS, P. MICHOT, C. DANCHIN-BURGE, A. CAPITAN, L. GENESTOUT, S. BARBIER, and S. FRITZ. "Prise en compte des anomalies génétiques en sélection : le cas des bovins." INRA Productions Animales 29, no. 5 (January 9, 2020): 351–58. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2016.29.5.3003.

Full text

Abstract:

Pendant plusieurs dizaines d’années après la mise en place des programmes de sélection génétique, la découverte de nouvelles anomalies est restée sporadique. Cela a incité jusqu’à présent les gestionnaires de ces programmes à appliquer une politique d’éradication drastique des reproducteurs porteurs, combinée à la procréation de futurs reproducteurs non porteurs. Mais la situation est en train de changer avec l’avènement de la sélection génomique et des technologies associées, qui permettent de détecter les anomalies plus rapidement et donc en plus grand nombre. Il est donc indispensable de faire évoluer la façon de les prendre en compte dans les programmes de sélection. Un état de la situation dans la population doit d’abord être établi en estimant la fréquence allélique de l’anomalie et en caractérisant le statut des reproducteurs les plus importants avec les tests moléculaires disponibles, en particulier avec les puces à « Single Nucleotide Polymorphism » (SNP). Dans certains cas, une prédiction indirecte, à partir d’haplotypes ou d’imputation, permet de connaître le statut à la mutation des reproducteurs plus anciens avec une forte probabilité sans nécessité de ré-analyser leur ADN. Une fois ce bilan établi, les mesures à prendre dépendent du poids économique des anomalies qui est fonction de deux paramètres, le coût par individu atteint et la fréquence allélique dans la population. La méthode optimale permettant une éradication progressive des anomalies repose sur l’utilisation d’un objectif de sélection combinant les anomalies aux autres caractères. Une phase délicate à gérer, principalement au travers des accouplements, est celle de l’utilisation de reproducteurs porteurs durant la période de transition entre la découverte de l’anomalie et l’éradication complète. Enfin, il est rappelé qu’une mesure simple permettant de limiter l’émergence de nouvelles anomalies est d’utiliser un nombre élevé de reproducteurs tout en restreignant leur taille de descendance.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

44

Edery, P. "Les nouvelles techniques de génétique moléculaire vont-elles révolutionner la psychiatrie ?" European Psychiatry 29, S3 (November 2014): 549–50. http://dx.doi.org/10.1016/j.eurpsy.2014.09.340.

Full text

Abstract:

Durant longtemps, la psychiatrie et la génétique n’ont eu que de rares points de rencontre, essentiellement autour de travaux de recherche fondamentale, dans le cadre des études visant à déterminer un gène de vulnérabilité aux troubles mentaux. Aujourd’hui, un grand pas a été franchi qui amène à penser que la génétique fera partie du quotidien de la psychiatrie dans les années à venir et sortira du strict champ de la recherche. En effet, le développement et la diffusion de l’hybridation génomique comparative sur des puces à ADN ou CGH array est en train de bouleverser la pratique hospitalière du diagnostic des anomalies chromosomiques. Dans l’autisme, le déficit intellectuel et dans les troubles mentaux atypiques, la CGH array permet d’augmenter les potentialités diagnostiques syndromiques de plus de 15 % en comparaison aux moyens moléculaires classiques. C’est toute la pratique clinique quotidienne du psychiatre et du pédopsychiatre qui pourrait en être bouleversée. Cette révolution va être poussée plus loin encore avec le développement à venir du Next Generation Sequencing ou séquençage de nouvelle génération qui va permettre de séquencer l’ensemble du génome d’un individu. Encore à ses débuts, cette technique pourrait un jour expliquer l’origine de troubles mentaux comme la schizophrénie, les troubles bipolaires ou la dépression. Si le NGS promet d’éclairer sous un jour nouveau l’étiologie des maladies mentales, l’application au quotidien ne sera pas sans poser un certain nombre de questions, en particulier éthiques. La psychiatrie de demain doit donc se préparer au diagnostic génétique : ce qu’il implique en termes de soins, d’appréhension de la maladie et de conseil génétique. Cette rencontre avec l’expert permettra la présentation des principes et des limites de ces techniques, leurs potentielles indications en psychiatrie et les bouleversements attendus par leur introduction future en pratique clinique.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

45

Vasselon, V., F. Rimet, I. Domaizon, O. Monnier, Y. Reyjol, and A. Bouchez. "Évaluer la pollution des milieux aquatiques avec l’ADN des diatomées : où en sommes-nous ?" Techniques Sciences Méthodes, no. 5 (May 2019): 53–70. http://dx.doi.org/10.1051/tsm/201905053.

Full text

Abstract:

L’évaluation de l’état écologique des cours d’eau repose sur le calcul d’indices de qualité basés sur la sensibilité de certains groupes biologiques, dont les diatomées, à la pollution. La détermination et la quantification des espèces de diatomées reposent généralement sur des méthodes d’identification morphologique en microscopie qui peuvent paraître complexes, chronophages et relativement onéreuses. Au cours de la dernière décennie, une nouvelle méthode de biologie moléculaire basée sur l’ADN a été développée, permettant d’identifier les espèces sur la base de critères génétiques plutôt que sur des critères morphologiques : le métabarcoding. En combinaison avec les technologies de séquençage à haut débit, le métabarcoding permet d’identifier l’ensemble des espèces présentes au sein d’un échantillon environnemental et de traiter plusieurs centaines d’échantillons en parallèle. Cet article présente les résultats de deux études récentes menées sur les cours d’eau de Mayotte (2013-2018) et de France métropolitaine (2016-2018), visant à tester le potentiel d’application du métabarcoding pour la bio-indication au sens de la directive cadre sur l’eau (DCE). Nous abordons les différents développements méthodologiques et optimisations qui ont été réalisés pour fiabiliser les inventaires taxonomiques de diatomées produits en métabarcoding, notamment en matière de quantification des espèces basée sur l’abondance relative des séquences ADN. Nous présentons ensuite les résultats d’application de l’approche moléculaire pour l’évaluation de l’état écologique de plus de 500 sites de cours d’eau nationaux, en les confrontant avec les résultats obtenus via l’approche classique en morphologie. Finalement, nous discutons du potentiel d’application en routine du métabarcoding à l’échelle des réseaux de surveillance des cours d’eau, de ses limites d’application et proposons certaines recommandations pour une future implémentation complémentaire à l’approche morphologique actuellement prescrite dans les arrêtés réglementaires.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

46

Kammerer-Jacquet, Solène-Florence, Frédéric Dugay, Laurence Cornevin, Angélique Brunot, Julien Dagher, Gregory Verhoest, Karim Bensalah, et al. "Étude par analyse chromosomique sur puces à ADN d’une série de 45 cancers du rein à cellule claires métastatiques : caractérisation des profils génomiques prédictifs de la réponse ou de la résistance à un traitement antiangiogénique (sunitinib)." Morphologie 100, no. 330 (September 2016): 184–85. http://dx.doi.org/10.1016/j.morpho.2016.07.054.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

47

MULSANT, P. "Glossaire général." INRAE Productions Animales 24, no. 4 (September 8, 2011): 405–8. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2011.24.4.3273.

Full text

Abstract:

Allèle : une des formes alternatives d'un locus. Dans une cellule diploïde, il y a deux allèles pour chaque locus (un allèle transmis par chaque parent), qui peuvent être identiques. Dans une population, on peut avoir plusieurs allèles pour un locus.Annotation structurale : repérage des coordonnées des diverses structures dans le génome, telles que les gènes.Annotation fonctionnelle : renseignements sur les fonctions des séquences, le plus souvent pour les gènes.BAC : Bacterial Artificial Chromosome. Vecteur de clonage permettant l’obtention de clones bactériens contenant un grand fragment d’ADN génomique (taille > 100 kb*). Les BAC assemblés en contigs* sont à la base des cartes physiques du génome.Carte cytogénétique : carte des chromosomes. Réalisée par localisation visuelle (FISH*) au microscope de fragments d’ADN sur les chromosomes au stade métaphase de la mitose.Carte d’hybrides irradiés : réalisée en testant par PCR la présence ou l’absence de fragments d’ADN dans une collection de clones d’hybrides irradiés (RH*). Deux fragments d’ADN sont proches sur le génome s’ils sont trouvés fréquemment dans les mêmes clones.Carte génétique : obtenue par l’étude de la ségrégation dans des familles ou des populations, de marqueurs polymorphes, soit moléculaires, soit phénotypiques, deux séquences étant d’autant plus proches qu’elles sont souvent transmises ensemble lors de la méiose.Clonage positionnel : stratégie visant à identifier un gène responsable de l’expression d’un phénotype en utilisant des informations de position sur le génome.Contig : ensemble de clones (le plus souvent des BAC*) ou de lectures de séquence ordonnés grâce à des informations sur leur parties chevauchantes.Cosmide : vecteur de clonage permettant l’obtention de clones bactériens contenant des fragments d’ADN génomique de taille avoisinant les 50 kb*.CNV : Copy Number Variation ; polymorphisme du génome correspondant à la variation du nombre de copies d’une séquence, pouvant dans certains cas contenir un ou plusieurs gènes.Déséquilibre gamétique : pour deux loci quelconques, c'est le fait que la fréquence des haplotypes* estimée pour tous les gamètes est différente de celle attendue à partir du produit des fréquences alléliques de chaque locus. Synonyme : déséquilibre de liaison. Contraire de : équilibre gamétique.Dominance : qualificatif de l’effet d'un allèle, dont une copie suffit à l'expression du phénotype* approprié. L’allèle A est dominant sur l’allèle a si l’hétérozygote* Aa a le même phénotype* que l’homozygote AA.EST : Expressed Sequence Tag : séquences étiquettes (partielles) de transcrit, obtenues par séquençage aléatoire d’ARN.Evaluation génomique : évaluation de la valeur génétique d’individus d’après leurs génotypes pour un ensemble de loci distribués sur le génome, d’après des équations établies à partir des performances d’individus de référencephénotypés et génotypés.Expression génique : études visant à estimer le niveau de production (expression) des gènes en fonction d’états physiologiques ou de tissus différents.Exon : fraction de la partie codante d’un gène eucaryote. Les gènes des organismes eucaryotes sont le plus souvent fractionnés en plusieurs séquences d’ADN dans le génome, les exons, séparés entre eux par d’autres séquences (introns*).FISH : Fluorescent In Situ Hybridisation. Hybridation de sondes d’ADN marquées à l’aide d’un fluorochrome, sur des chromosomes au stade métaphase de la mitose. Permet la réalisation de la carte cytogénétique.Fingerprinting : technique permettant d’estimer très grossièrement la similarité entre des séquences d’ADN sans les séquencer, par la comparaison des longueurs de bandes produites par des enzymes de restriction coupant l’ADN à des sites précis.Fosmide : vecteur de clonage permettant l’obtention de clones bactériens contenant des fragment d’ADN génomique de taille déterminée et égale à 40 kb*.FPC : FingerPrint Contig* ; contig* de clones (généralement des BAC*) ordonnés par la technique du fingerprinting, afin d’obtenir une carte physique du génome.Génotype 1 : constitution génétique d'un individu. 2. Combinaison allélique* à un locus particulier, ex: Aa ou aa.Haplotype : combinaison allélique spécifique pour des loci appartenant à un fragment de chromosome défini.Héritabilité au sens strict : proportion de la variance phénotypique due à la variabilité des valeurs génétiques = proportion de la variance phénotypique due à la variance génétique additive.Hétérozygote : individu ayant des allèles non identiques pour un locus* particulier ou pour plusieurs loci. Cette condition définit l’ «hétérozygotie». Contraire de: homozygote.Homologues : séquences similaires en raison d’une origine évolutive commune.Hybride irradié : cellule hybride obtenue par fusion entre cellules hôte d’une espèce et donneuse d’une autre espèce, contenant une fraction aléatoire du génome de l’espèce donneuse, après cassures par irradiation, reconstitution aléatoire de chromosomes ou insertion dans des chromosomes de la cellule hôte et rétention partielle. Deux séquences proches sur le génome sont en probabilité dans les mêmes clones RH*, tandis que deux séquences distantes ont une probabilité faible d’être conservées ensemble.IBD : pour identity by descent. Identité entre deux chromosomes (ou parties de chromosomes), liée à leur descendance d’un même chromosome ancestral.Indel : Insertion – deletion ; polymorphisme de présence ou absence d’un ou plusieurs nucléotides.Intron : séquence non-codante dans les gènes, séparant les exons, qui codent pour une protéine.Kb : kilobase ; séquence de mille paires de bases (pb*).Locus (pl. : loci) : Site sur un chromosome. Par extension, emplacement d’un gène ou d’un marqueur génétique sur un chromosome.Marqueur génétique : séquence d'ADN dont le polymorphisme est employé pour identifier un emplacement particulier (locus) sur un chromosome particulier.Mate-pair : séquences appariées (1 à 10 kb* de distance), produites en circularisant les fragments d’ADN, puis par séquençage à travers le point de jointure.Mb : mégabase ; séquence d’un million de paires de bases (pb*) de longueur.Orthologues : séquences homologues* entre deux espèces.Paired-end : séquences appariées produites par la lecture des deux extrémités de courts fragments d’ADN (moins de 500 pb*) dans le cas des nouvelles technologies de séquençage.Paralogues : séquences homologues* résultat de la duplication d’une séquence ancestrale dans le génome. Il s’agit de deux (ou plus) séquences similaires par homologie dans un même génome.Pb : paire de base ; unité de séquence d’ADN, représentée par une base et sa complémentaire-inverse sur l’autre brin.Phénotype : caractère observable d'un individu résultant des effets conjugués du génotype et du milieu.Phylogénomique : utilise les méthodes de la génomique et de la phylogénie. Par la comparaison de génomes entiers, permet de mettre en évidence des pertes et gains de gènes dans les génomes, ainsi que leur variabilité moléculaire, afin (entre autres buts) d’aider à prédire leur fonctions.Plasmide : vecteur de clonage permettant l’obtention de clones bactériens contenant des fragment d’ADN génomique de taille allant de 500 pb* à 10 kb* environ.Polymorphisme d'ADN : existence de deux ou de plusieurs allèles* alternatifs à un locus.Puce à ADN ou puce pangénomique : Système permettant pour un individu le génotypage simultané de très nombreux marqueurs génétiques (de quelques milliers à quelques centaines de milliers).QTL : abréviation de locus à effets quantitatifs (de l’anglais Quantitative Trait Locus).Récessivité : qualificatif de l’effet d'un allèle, où l'homozygotie* est nécessaire pour l'expression du phénotype* approprié. opposé de : dominance*.RH : Radiation Hybrid (hybride irradié*)Sanger (méthode de) : méthode de séquençage publiée en 1977 (Sanger et al 1977) et encore utilisée de nos jours avec les séquenceurs à électrophorèse capillaire.Scaffold : ensemble de contigs* de séquence reliés entre eux par des informations apportées par des lectures appariées (mate-pairs* ou paired-ends*).Sélection assistée par marqueurs (abréviation : SAM) : utilisation d’un jeu restreint de marqueurs de l'ADN pour améliorer la réponse à la sélection dans une population : les marqueurs sont choisis comme étroitement liés à un ou plusieurs loci cibles, qui sont souvent des loci à effets quantitatifs ou QTL*.SNP : polymorphisme d'un seul nucléotide à une position particulière de la séquence d’ADN (abréviation de l’anglais Single Nucleotide Polymorphism).Supercontig : nom alternatif pour les scaffolds*.WGS : Whole Genome Shotgun ; production de lectures de séquence d’un génome entier de manière aléatoire.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

48

"Disponibilité des puces à ADN." Revue Francophone des Laboratoires 2005, no. 374 (June 2005): 74. http://dx.doi.org/10.1016/s1773-035x(05)80034-6.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

49

"Fabriquer soi-même des puces à ADN." Revue Française des Laboratoires 2001, no. 337 (November 2001): 89. http://dx.doi.org/10.1016/s0338-9898(01)80437-6.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

50

Henni, Khadidja, Olivier Alata, Lynda Zaoui, Abdellatif ELIDRISSI, and Ahmed Moussa. "Classification non Supervisée de Données Multidimensionnelles par les Processus Ponctuels Marqués." Revue Africaine de la Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées Volume 21 - 2015 - Special... (September 3, 2015). http://dx.doi.org/10.46298/arima.2000.

Full text

Abstract:

International audience Cet article décrit un nouvel algorithme non supervisé de classification des données multidimensionnelles. Il consiste à détecter les prototypes des classes présentes dans un échantillon et à appliquer l’algorithme KNN pour la classification de toutes les observations. La détection des prototypes des classes est basée sur les processus ponctuels marqués, c’est d’une part une adaptation de la méthode de Métropolis-Hasting-Green qui génère des mouvements manipulant les objets du processus (naissance, mort…) et d’autre part une modélisation de Gibbs qui introduit la fonction de potentiel matérialisant les interactions du processus en termes d’énergie. Plusieurs expérimentations ont été réalisées sur des données ponctuelles multidimensionnelles où les classes sont non linéairement séparables et des données réelles issues des puces à ADN. Une comparaison avec des méthodes de classification existantes a permis de montrer l’efficacité de ce nouvel algorithme.

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Journal articles on the topic 'Puces à ADN complémentaire'

Create a spot-on reference in APA, MLA, Chicago, Harvard, and other styles