Academic literature on the topic 'Reproduction temporelle'

Dans les sociétés modernes, le fait de mener de front un travail domestique ou familial et une vie professionnelle, notamment un travail salarié, constitue pour la majorité des femmes une réalité sociale : une double charge, mais aussi une double expérience, dans la mesure où la socialisation des femmes et le développement de leurs compétences s'opèrent dans deux domaines clés de la société, celui de la reproduction et celui de la production. Les femmes se distinguent ainsi de la majeure partie des hommes et sont ainsi confrontées au conflit de domaines qui ont en réalité partie liée, aussi bien du point de vue de la logique temporelle et spatiale que du point de vue de la hiérarchie sociale.

The eighteenth century is considered as the golden age of epistolary art. If we analyze the historical and social value of letters, we will notice that epistolary change soon becomes one of the principal ways of communication and of providing information. The most relevant merit, which is attributed to the epistolary novel, is the immediate reproduction that touches feelings. So, the epistolary novel removes the temporal distance existing between the personal history and its written reproduction. The most famous writers of the time (like Montesquieu) and libertine writers (Laclos and Sade particularly) have employed the epistolary novel showing several intentions. Le dix-huitième siècle est l’âge d’or qui concerne le roman épistolaire. Si l’on analyse la portée historique et sociale de la lettre, il est fondamental de mettre en relief que l’échange épistolaire représente l’un des principaux moyens d’information et de communication de l’époque. Le plus grand mérite que l’on attribue à la lettre est de représenter l’expression « à chaud » des sentiments parce qu’elle supprime la distance temporelle existant entre le sentiment vécu et sa reproduction écrite. Enfin, l’absence du narrateur garantit l’authenticité des faits car personne ne pense et ne parle à la place des personnages. Les auteurs les plus célèbres de l’époque (Montesquieu) ainsi que les écrivains libertins (Laclos et Sade en particulier) ont fait recours au roman épistolaire en montrant des propos très différents.

Les systèmes d’élevage extensifs de ruminants reposent largement sur l’exploitation de l’herbe. Leur objectif est de produire tout en maintenant des coûts de production à un faible niveau (recours limité aux intrants et à la complémentation). Or, dans de tels systèmes les ressources alimentaires pâturées (disponibilité et qualité) sont caractérisées par leur grande variabilité spatiale et temporelle et leur sensibilité aux aléas climatiques. Le milieu d’élevage étant faiblement contrôlé par l’éleveur, c’est sur l’animal et sur ses capacités adaptatives que reposent en grande partie la pérennité du troupeau et sa productivité. En particulier, la collecte de la ressource alimentaire étant principalement confiée à l’animal, celui-ci doit être capable d’assurer au mieux sa ration quotidienne par le pâturage et doit être capable de subir des périodes de sous-alimentation plus ou moins longues et intenses. Dans cette synthèse, nous montrons que pour faire face à de telles contraintes de l’environnement, les herbivores sont capables de développer des réponses adaptatives qui mettent en œuvre des ajustements physiologiques et comportementaux. Ces réponses, lorsqu’elles sont analysées sur le long terme, révèlent des stratégies d’adaptation différentes entre races. Ces stratégies sont analysées du point de vue de leur efficacité et de leur aptitude à soutenir des priorités orientées vers la survie et le développement de l’organisme ou privilégiant l’investissement reproductif et maternel.

Resumo: Ao longo das últimas décadas, os etnosaberes de culturas tradicionais têm sido objeto de inúmeros estudos em distintos campos científicos. Com frequência, os estudos realizados buscam levantar e analisar dados e informações a respeito dos múltiplos usos da biodiversidade, compreender as formas de classificação, domesticação e manipulação da fauna e da flora, assim como interpretar a complexa relação homem-natureza em suas diferentes dimensões, escalas espaço-temporais e significações culturais. Neste sentido, examinamos no presente artigo os etnosaberes relacionados aos usos de plantas, animais e insetos em práticas terapêuticas, mágico-ritualísticas e simbólico-culturais de comunidades quilombolas do Vale do Jequitinhonha mineiro. Para consecução desse objetivo, recorremos ao uso de uma metodologia essencialmente qualitativa, operacionalizada por meio de entrevistas semiestruturadas com agricultores e agricultoras quilombolas, caminhadas transversais e observações diretas nos quintais agroflorestais de seus estabelecimentos produtivos, além de registros iconográficos (fotografias e croquis) destes espaços e de seus cultivos. Por meio deste estudo, constatamos que os etnosaberes constituem uma importante expressão cultural da relação homem-natureza, das experiências espaço-temporais, interações sociais, costumes e cosmovisões dos membros das comunidades quilombolas, contribuindo para a manutenção dos processos de reprodução material e simbólico-cultural de suas famílias e coletividades e para a preservação da espaço-temporalidade da cultura afro-brasileira no Vale do Jequitinhonha mineiro.Palavras-chave: Saberes Tradicionais. Etnobotânica. Etnozoologia. Etnoentomologia. Plantas medicinais. Ethnoknowledge and traditional afro-brazilian cultures: pharmacopoeia, magic and material and symbolic reproduction of quilombola communities of the Jequitinhonha Valley, state of Minas Gerais, BrazilAbstract: During the past several decades ethno-biological knowledge of traditional cultures has been an object of innumerous studies. Such studies often intend to take and analyse data pertaining to; the many uses of biodiversity, understanding the forms of classification and techniques of domestication and manipulation of fauna and flora, as well as, to interpret the complex relationship between man and nature in its different dimensions, spatio-temporal scales and cultural significances. Conforming to this tradition we examine in the following article ethno-biological knowledge related to the uses of plants, animals and insects in the therapeutical, magical and culturally-symbolic practises of the Quilombola communities of the Jequitinhonha Valley in Minas Gerais. To achieve our objective we relied upon the use of an essentially qualitative methodology carried out by means of semi-structured interviews with farmers and Quilombola farmers, cross-country hikes and direct observations from agro-florestal field cultivations, also documenting in the form of iconographic records (photographs and sketches) these spaces and their crops. Through this study we show that ethno-biological knowledge constitutes an important cultural expression of the relationship between man and nature, spatio-temporal experiences, social interactions, customs and worldviews of the members of Quilombola communities. This knowledge contributes to the maintenance of the processes of material and symbolic-cultural production of these families and collectives and thus aids in the preservation of the living afro-brazilian culture within the Jequitinhonha Valley of Minas Gerais.Keywords: Traditional knowledge. Ethnobotany. Ethnozoology. Ethnoentomology. Medicinal Plants. Ethno-savoirs et cultures traditionnelles afro-brésiliennes: pharmacopée, magie et reproduction matérielle et symbolique des communautés quilombolas dans la Valée du Jequitinhonha, état de Minas Gerais, BrésilRésumé: Au cours des dernières décennies, les ethno-savoirs des cultures traditionnelles ont fait l’objet de nombreuses études dans les différents domaines scientifiques. Souvent, les études menées visent à collecter et analyser des données et des informations sur les multiples usages de la biodiversité ; à comprendre les formes de classification, de domestication et de manipulation de la faune et de la flore ; ainsi qu’à interpréter la relation complexe entre l’homme et la nature dans ses différentes dimensions, échelles spatio-temporelles et significations culturelles. Dans ce sens, nous examinons dans cet article les ethno-savoirs liés aux utilisations des plantes, des animaux et des insectes dans les pratiques thérapeutiques, magiques, rituelles, symboliques culturelles des communautés quilombolas dans la Vallée du Jequitinhonha, état de Minas Gerais, Brésil. Pour atteindre cet objectif, nous avons eu recours à une méthodologie essentiellement qualitative, opérationnalisée à partir d’entretiens semi-structurés avec des agriculteurs et agricultrices quilombolas, des randonnées et des observations directes dans les systèmes agroforestiers dans les jardins de leurs exploitations agricoles, en plus des enregistrements iconographiques (photographies et croquis) de ces espaces et de leurs cultures agricoles. À travers cette étude, nous avons constaté que les ethno-savoirs constituent une expression culturelle importante de la relation homme-nature, des expériences spatio-temporelles, des interactions sociales, des coutumes et des visions du monde des membres des communautés quilombolas, contribuant au maintien des processus de reproduction matérielle et symbolique de leurs familles et communautés et à la préservation de l’espace-temporalité de la culture afro-brésilienne dans la Valée du Jequitinhonha.Mots-clé: Savoirs traditionnels. Ethnobotanique. Ethnozoologie. Ethnoentomologie. Plantes médicinales.

L’enjeu majeur du phénotypage animal est d’acquérir une connaissance systémique de la robustesse des animaux d’élevage pour répondre au mieux à une double finalité en termes d’exploitation de la variabilité des aptitudes animales : une sélection éclairée vers des objectifs majeurs pour améliorer l’efficience et la robustesse des génotypes, et un élevage de précision exploitant la variabilité individuelle des animaux pour gagner en résilience à l’échelle du troupeau, ou pour améliorer la conduite à génotype donné. Deux défis majeurs de connaissance, interdépendants et communs à toutes les filières animales, sont à relever pour améliorer la robustesse des animaux : i) comprendre et prédire les compromis entre fonctions vitales, c’est-à-dire les changements de priorités dans l’allocation de ressources limitées ; ii) comprendre et exploiter les aspects temporels de la robustesse au cours de la vie de l’animal pour lui permettre de maintenir son niveau de production dans une large gamme d’environnements sans pour autant compromettre sa reproduction, sa santé et son bien-être. Atteindre ces objectifs nécessite de lever les verrous techniques suivants : i) définir des phénotypes complexes à partir de l’intégration de données obtenues à différentes échelles moléculaires, tissulaires, de l’animal ou d’une de ses fonctions ; ii) mettre en oeuvre des technologies à haut débit pour caractériser à moindre coût et le plus précisément possible le plus grand nombre d’animaux ; iii) développer d’importantes bases de données, des méthodes et outils informatiques performants, nécessaires aux traitements des informations à des fins de modélisation et de biologie prédictive.

Cadre de la recherche :L’intérêt renouvelé de la sociologie pour les dimensions temporelles de l’activité sociale offre des perspectives éclairantes sur le fonctionnement des groupes familiaux. Le temps social dominant impose un cadre pour la coordination des activités des différents membres des familles, et, comme durée, il offre la possibilité de narrations multiples et de projections variées dans l’à venir.Pour les familles, le temps est à la fois une contrainte et une ressource.Objectifs :L’introduction de ce numéro sur « les temps des familles », dont le pluriel veut souligner l’irréductibilité du temps à une seule dimension, pose une double question. Comment les temps construisent les familles ? Comment les familles construisent leurs temps ?Méthodologie :Sont recensés dans cette introduction des travaux qui relèvent de la sociologie du temps dans ce qu’ils peuvent éclairer les pratiques des familles, aussi bien dans une perspective synchronique que diachronique, pour l’ensemble du groupe, ou pour certains de ses membres.Résultats :Les temporalités de la scolarité, comme celles de l’activité professionnelle constituent des cadres socio-temporels qui s’imposent à toutes les familles, aussi bien dans la nécessité de construire une organisation calendaire adaptée, que dans la préparation du futur. Les niveaux d’adaptation aux contraintes sociales et physiques du temps varient selon les milieux sociaux et selon le genre. Les femmes ont un rôle privilégié dans l’organisation du temps familial et dans la transmission des savoirs faire temporels.Conclusions :Le temps n’est pas un milieu extérieur dans lequel se déploient les activités des individus et les familles. Les acteurs familiaux travaillent leurs différents temps, ensemble ou de façon séparée, pour remplir des objectifs de reproduction, physique, familiale ou sociale, de façon stratégique et planifiée, ou opportuniste et dispersée. Les temps des familles ne sont pas seulement subis, ils sont agis.Contribution :En plus d’être une contribution à une analyse temporelle des dynamiques familiales, cette introduction ouvre des pistes peu explorées sur les manières dont les familles travaillent les différents temps qui les façonnent.

Les nauplii de copépodes sont abondants dans les milieux aquatiques en zone tropicale et présentent des caractéristiques biochimiques et physiques intéressantes qui font d’eux, une bonne alternative et/ou un supplément de nourriture pour les larves de poissons. Tous les facteurs environnementaux gouvernant leur variation peuvent avoir un impact sur le succès de reproduction et le développement de ces larves de poissons. Ce travail vise principalement à connaître les variations spatio-temporelles de l’abondance des nauplii de copépodes dans les milieux lagunaires de Côte d’Ivoire en relation avec les paramètres physico-chimiques de ces écosystèmes saumâtres afin d’en identifier le déterminisme. Cette étude montre que l’abondance des nauplii varie significativement durant les saisons, avec les valeurs moyennes de la saison sèche (12-98 ind.l-1) supérieures à celle de la saison humide (9-88 ind.l-1). Nos résultats montrent également qu’au niveau des lagunes de Grand-Lahou et de Fresco, les abondances les plus faibles ont été enregistrées au niveau de la zone de communication entre la lagune et la mer (canal) à toutes les saisons. L’étude de la corrélation entre les paramètres physico-chimiques et l’abondance des nauplii des copépodes montre que l’abondance des nauplii augmente avec la température, la conductivité, l’oxygène dissous, le nitrite, l’ammonium avec une corrélation significativement positive (Rs: 0,21-0,94 et p < 0,001). En revanche, l’abondance des nauplii montre une corrélation négative et non significative à la turbidité et au pH dans tous les milieux d’étude (Rs: -0,03 à -0,62 et p > 0,05).

Alexandrium minutum est un dinoflagellé à l’origine d’efflorescences toxiques récurrentes le long des côtes bretonnes. Originaire de Méditerranée, cette espèce a progressivement envahi l’Europe. L’objectif de ce travail était d’étudier les processus pouvant influencer la diversité génétique des populations d’A. Minutum. Tout d’abord, des expériences que nous avons réalisées montrent que la rencontre des gamètes suit un processus complexe où les fusions ne sont pas régies par un système bipolaire. Ce qui pourrait expliquer la forte diversité observée au sein des efflorescences. En effet, l’utilisation des microsatellites a permis de révéler une forte diversité génétique et génotypique. La reproduction sexuée chez cette espèce serait donc prédominante. L’étude de la variabilité génétique spatiotemporelle au cours des efflorescences pendant deux années consécutives dans les estuaires de Penzé et de Rance révèle des différenciations génétiques significatives aux deux échelles. Ces résultats indiquent que les populations d’A. Minutum le long des côtes bretonnes sont isolées génétiquement mais aussi que leur composition génétique évolue au cours de la saison. Les traits d’histoire de vie de cette espèce (production de kystes sexués) pourraient expliquer cette dynamique spatio-temporelle en renforçant la différenciation génétique entre estuaires. Les kystes pourraient constituer une réserve de génotypes, leur présence en grand nombre pourrait par un effet de tampon génétique et de compétition limiter l’arrivée de nouveaux migrants dans ces estuaires. Ces résultats fournissent des paramètres essentiels pour la gestion des milieux côtiers menacés par les algues toxiques
Alexandrium minutum is a dinoflagellate producing recurrent toxic blooms along the French Atlantic coast. Originally from the Mediterranean, this species has gradually invaded the European coasts. In this study we examined the processes that may affect population genetic diversity of A. Minutum. We made crossing experiments to determine its reproductive system. Then we used molecular tools to determine the importance of sexual reproduction in natural populations. Finally, we studied the genetic variability of annual blooms for two consecutive years in Penzé and Rance estuaries. Crossing experiments showed that gametes recognition in this species is not a bipolar system but involves different mating types. Using microsatellite markers, we found that blooms have a high genetic and genotypic diversity suggesting that clonal reproduction is not a dominant process during bloom period. The spatio-temporal genetic analyses showed significant differentiation at both spatial and temporal scales and indicates a restricted gene flow between the two sites. The genetic differentiation between estuaries could also be closely linked to the life history traits. Indeed, the rapid development of blooms in a new site, followed by the formation of a large number of cysts accumulated in estuaries could be a particular system characterized by high genetic buffer and limiting arrival of immigrants by competition. Finally, our results suggest that the toxic blooms observed in Rance, in the Morlaix Bay and Brest estuaries correspond to different introductions processes

Dans la présente étude, l’effet de traitement non temporel sur la tâche de reproduction d’intervalles de temps est testé dans quatre expériences. Trois tâches non temporelles nécessitant l’encodage ou la récupération d’information en mémoire ainsi qu’une tâche d’interruption d’estimation temporelle sont combinées à une tâche de reproduction temporelle nécessitant l’encodage et la reproduction de durées (environ 2 secondes). Les résultats obtenus révèlent que les tâches non temporelles affectent davantage la phase de reproduction que la phase d’encodage de durées suggérant ainsi que l’interférence du traitement non temporel avec la reproduction temporelle simultanée diffère selon que le traitement prenne place durant la phase d’encodage ou la phase de reproduction. Une hypothèse explicative est proposée selon laquelle l’interférence du traitement non temporel avec l’estimation temporelle concurrente varie selon les processus impliqués et les ressources requises dans les deux phases de la tâche temporelle. L’ensemble des résultats est interprété dans le cadre des modèles d’accumulation de l’information temporelle.

L’environnement physique de l'estuaire de la Loire est aussi naturellement complexe que modifie par les pollutions et aménagements. La variabilité de la salinité, la mosaïque des sédiments, une turbidité accentuée sont les caractéristiques de ce milieu. Les peuplements macrozoobenthiques s'organisent selon le gradient de salinité mais l'oxygène dissous, la teneur en fines du sédiment et la matière organique conditionnent la présence de certaines espèces sensibles ainsi que la densité et la diversité des peuplements. Le long du gradient halin, trois communautés, elles-mêmes parfois divisées en facies, se succèdent. Les espèces recensées sont peu nombreuses, la diversité reste faible et l'abondance est maximale en milieu limnique. Le suivi sur deux ans d'une radiale coupant le secteur polyhalin à travers une vasière franche et deux estrans sablo-vaseux, montre l'existence de trois micropeuplements définis par des facteurs abiotiques et microphytobenthiques: matière organique, microphytobenthos, pourcentage de fines. Les paramètres de richesse et structure des peuplements ainsi que l'évolution des espèces principales, dans le temps comme dans l'espace, ont complète l'étude. Les facteurs du milieu justifient très souvent la variabilité spatio-temporelle des abondances et des biomasses tandis que la richesse spécifique reste toujours faible. Les peuplements alternent entre les divers stades de maturité, dans un état néanmoins révélateur d'immaturité. L’ensemble des espèces est euryece tolérant mais celles-ci peuvent devenir sensibles ou opportunistes à un facteur particulier. Macoma balthica et Scrobicularia plana montrent aussi une plasticité adaptative aux conditions de l'environnement, mais ce sont les fluctuations des quantités de nourriture disponible et les températures hivernales qui sont les plus restrictives pour ces Tellinidés. . .

Alexandrium minutum est un dinoflagellé qui est à l'origine des efflorescences toxiques observées de façon récurrente le long des côtes Bretonnes. Cette microalgue produit des toxines paralysantes qui sont parmi les plus puissantes au monde. Originaire de Méditerranée, cette espèce a progressivement envahi les côtes européennes atlantiques. Cette algue invasive a été observée en Bretagne dans les années 80, puis a atteint successivement l'Angleterre, l'Irlande et le Danemark. Aujourd'hui, elle semble durablement installée dans de nombreux estuaires bretons, produisant de façon récurrente des efflorescences toxiques, bien que dans certains sites les proliférations semblent être limitées par la présence de parasite. Dans cette étude nous nous sommes interrogés sur les processus pouvant influencer la diversité génétique des populations d'A. minutum et les répercussions de ces capacités d'adaptation vis à vis des facteurs biotiques et abiotiques. Nous avons en particulier, réalisé des expériences de croisement en laboratoire afin de mieux comprendre sa reproduction et de déterminer son système de reproduction. Puis nous avons utilisé des outils moléculaires afin de déterminer quelle était l'importance de la reproduction sexuée dans les populations naturelles en Bretagne (reproduction sexuée versus asexuée). Enfin, nous avons étudié la variabilité génétique des efflorescences annuelles pendant deux années consécutives dans les estuaires de la Rance et de la Penzé. Les expériences de croisement in vitro ont permis de mettre en évidence que la reconnaissance gamétique était un processus complexe où les fusions ne sont pas régit par un système bipolaire comme c'est généralement le cas chez de nombreux organismes. D'autre part nos résultats suggèrent que les kystes temporaires auraient une capacité de survie de plusieurs mois au froid et à l'obscurité dans les conditions de laboratoire. Grâce à l'utilisation des marqueurs microsatellites, nous avons montré que les efflorescences d'A. minutum présentaient une diversité génétique et génotypique très élevée et que les génotypes étaient tous différents les uns des autres au sein de ces efflorescences. Ces résultats suggèrent que la reproduction clonale n'est pas dominante au cours des évènements d'efflorescence. L'analyse génétique spatio-temporelle (entre Penzé et Rance, entre années et entre période d'efflorescence) montre des différenciations significatives aux différentes échelles. La différence spatiale indique un flux de gènes restreint entre les deux sites et cela principalement au cours des blooms. En effet, les efflorescences qui se développent généralement pendant les marées de morte-eau restent relativement isolées. Ces résultats ont été confirmés par l'étude de la structure génétique des populations A. minutum le long des côtes Bretonnes qui révèle des flux de gènes limités entre populations. Ces résultats suggèrent que la migration est relativement restreinte entre estuaires. De plus, la différenciation génétique entre estuaires pourrait également étroitement être liée aux traits d'histoire de vie de cette espèce. En effet, le développement rapide des efflorescences dans un nouveau site colonisé, suivi par la formation d'un grand nombre de kystes de résistance qui s'accumulent au sein des estuaires pourrait constituer un système particulier présentant une forte inertie au changement (tampon génétique) et limitant, par compétition, l'arrivée de nouveaux migrants (hypothèse de monopolisation des sites (De Meester et al. 2002). Enfin, nos résultats suggèrent que les efflorescences toxiques observées en Rance, en Baie de Morlaix et en Rade de Brest correspondraient à des évènements d'introduction différents.

Cette thèse s'intéresse aux variations spatio-temporelles de la reproduction du sapin pectine (Abies alba), en limite sud de son aire de répartition dans les populations du mont Ventoux et de la montagne de Lure. En général, les populations marginales présentent des densités faibles et variables. Pour nos populations de sapins, nous avons montré que les densités faibles entraînent une augmentation des taux d'autofécondation par loi d'action de masse, à l'échelle de la population mais également individuelle. Les populations moins denses présentent également une réduction du taux de germination par expression de la dépression de consanguinité, mais qui est compensée par une meilleure survie des semis pouvant provenir d'une purge plus efficace du fardeau génétique. Cependant, la diminution de la densité entraîne dans nos populations une baisse de la production efficace de graines par augmentation du taux de graines vides, probablement à cause d'une dispersion du pollen limitée. En effet, nos analyses génétiques conduisent à une distance de dispersion moyenne estimée de 20 à 50m. Cette faible dispersion induit également une forte variabilité individuelle du régime de reproduction liée aux variations locales de densité et de productions individuelles de pollen. Finalement, nous avons trouvé des variations inter-annuelles importantes de la structure génétique spatiale du nuage de pollen avec une différenciation entre arbres-mères de 8% et une différenciation entre années au sein des mères de 13%. Les années avec les plus fortes productions de pollen étaient également celles avec la plus faible diversité génétique globale. Cette étude confirme donc la nécessité de considérer de multiples années quand on s'intéresse à la reproduction d'une espèce pérenne comme le sapin, à la fois pour des études théoriques et pour des questions centrées sur la gestion de la diversité
This study focuses on the spatio-temporal varibility of reproduction in silver fir (Abies alba), in its French rear edge populations in the Mont Ventoux and Lure mountain. Usually, marginal populations contrast from core populations with lower and more variable densities. In our populations of firs, we found that lower densitiy leads to higher selfing rates through a mass-action law at both population and individual levels. As a consequence, germinative abilities were lower for seeds from lower density populations, mainly because of inbreeeding depression. But this was balanced by a higher survival rates at the seedling stage. A more efficient genetic purge could explain this. However, in our populations, a lower density also induced a lower effective seed production, through an increased rate of empty seeds. This can result from pollen limi tation. Indeed, genetic analyses revealed a rather high spatial genetic structure of pollen pool, indicating a limited dispersal with a mean dispersal distance between 20 and 50m. This limited dispersal also induced a high inter-individual variability of the mating system mainly due to variations of local density and individual pollen production. Finally, we found strong inter-annual variations of the pollen pools : giving an inter-mothers differentiation of 8%, we obtained an inter-annual differenciation of 13% within mothers. The year with the higher pollen productions also presented the lower overall genetic diversity. Thus this study confirms the necessity to consider multiple years in studies on the reproduction of a perennial tree such as fir, either for theoretical concerns of for practical questions focused on the management of genetic diversity

Le fonctionnement écologique des écosystèmes côtiers est soumis à l’action synergique des changements climatiques et des pressions anthropiques. Au sein du Bassin d’Arcachon, l’huître Crassostrea gigas, montre depuis quelques années une modification du cycle reproductif (i.e. faible formation des gamètes, retard de ponte), qui semble lié aux modifications globales des conditions thermiques et trophiques du milieu. L’objectif de ce travail consiste à réaliser un état des lieux de la variabilité spatio-temporelle de l’état reproductif des huîtres dans le Bassin d’Arcachon, en lien avec l’origine, la quantité et la qualité de la ressource trophique. Les résultats obtenus ont permis de révéler d’importants gradients spatiaux de variabilité du développement gonadique et du signal trophique chez C. gigas, entre les parties internes sous influences des rivières (sud-est et nord-est), et la partie externe sous influences océaniques. Deux facteurs clés se sont révélés en partie explicatifs de cette variabilité, le temps d’immersion et le temps de renouvellement océanique. Un comparatif de la gamétogenèse et du pool nutritif entre les parties sud-est et nord-est du bassin a permis de démontrer une variabilité temporelle de la composition phytoplanctonique associée à une variabilité des apports en acides gras essentiels à la formation et la maturité des gamètes. La dynamique de la mise en réserves ainsi que le déclenchement des pontes chez C. gigas se sont révélés synchrones à la variabilité saisonnière de la quantité et la qualité du pool nutritif. Ces résultats représentent une première étape vers le développement d’un modèle prédictif des besoins énergétiques de l’espèce sous l’effet des changements globaux des conditions environnementales
The ecological functioning of coastal ecosystems is subjected to the synergistic action of climate change and anthropogenic pressures. In Arcachon Bay, the reproductive cycle of the oyster Crassostrea gigas has changed in recent years (e.g. weak gametogenesis, spawning delay). This pattern seems to be associated with global changes in thermal and trophic conditions. The aim of this work was to characterize the spatio-temporal variability in the reproductive investment of oysters in Arcachon Bay. This variability has been investigated in relation to the origin, quantity and quality of the trophic resources. The results revealed important spatial gradients of variability in gonadal development and trophic signal in C. gigas, between inner parts of the bay influenced by river inputs (south-east and north-east) and the external part of the bay, which is influenced by oceanic inputs. Two hydrodynamic factors explained most of the observed variability: immersion time and oceanic water renewal. A comparison of C. gigas gametogenesis and the nutritional value of available food sources between the south-eastern and north-eastern parts of the bay revealed temporal variability in the composition of phytoplankton. This variability was associated with variability in the amounts of essential fatty acids, necessary for gametogenesis. Changes in energy reserves and gamete release cycle were synchronized with the seasonal nutrient variability. These results constitute a first approach in the development of a model predicting the evolution of the energetic needs of C. gigas under the global change in environmental conditions

L'élevage de précision consiste à enregistrer des paramètres sur les animaux ou leur environnement grâce à divers capteurs. Dans cette thèse, il s'agit de suivre le comportement de vaches laitières via un système de localisation en temps réel. Les données sont collectées en une suite de valeurs à intervalle régulier, c'est ce que l'on appelle une série temporelle. Les problèmes liés à l'utilisation de capteurs sont le grand nombre de données engendré et la qualité de ces données. Le Machine Learning (ML) permet d'atténuer ce problème. Le but de cette thèse est de détecter les comportements anormaux de vaches. L'hypothèse de travail, étayée par la littérature en biologie, est que le rythme circadien d'activité d'une vache change si celle-ci passe d'un état normal à un état de maladie, stress ou encore un stade physiologique spécifique (œstrus, mise-bas) et ce, de manière très précoce. La détection d'une anomalie de comportement permettrait de prendre des décisions plus rapidement en élevage. Pour cela, il existe des outils de classification de séries temporelles ou Time Series Classification (TSC) en anglais. Le problème avec les données de comportement est que le schéma comportemental dit normal de la vache varie selon les vaches, les jours, la ferme, la saison, etc. Trouver un schéma normal commun à toutes les vaches est donc impossible. Or, la plupart des outils de TSC se basent sur l'apprentissage d'un modèle global pour définir si un comportement donné est proche de ce modèle ou non. Cette thèse s'articule autour de deux grandes contributions. La première consiste à l'élaboration d'une nouvelle méthode de TSC : FBAT. Elle se base sur les transformées de Fourier pour identifier un pattern d'activité sur 24 h et le comparer à celui d'une autre période de 24 h consécutive, afin de palier le problème de l'absence de schéma commun d'une vache normale. La deuxième contribution consiste à utiliser les étiquettes floues. En effet, autour des jours considérés comme anormaux, il est possible de définir une zone incertaine où la vache serait dans un état intermédiaire. Nous montrons que la logique floue permet d'améliorer les résultats quand les étiquettes sont incertaines et nous introduisons une variante floue de FBAT : F-FBAT
Precision livestock farming consists of recording parameters on the animals or their environment using various sensors. In this thesis, the aim is to monitor the behaviour of dairy cows via a real-time localisation system. The data are collected in a sequence of values at regular intervals, a so-called time series. The problems associated with the use of sensors are the large amount of data generated and the quality of this data. The Machine Learning (ML) helps to alleviate this problem. The aim of this thesis is to detect abnormal cow behaviour. The working hypothesis, supported by the biological literature, is that the circadian rhythm of a cow's activity changes if it goes from a normal state to a state of disease, stress or a specific physiological stage (oestrus, farrowing) at a very early stage. The detection of a behavioural anomaly would allow decisions to be taken more quickly in breeding. To do this, there are Time Series Classification (TSC) tools. The problem with behavioural data is that the so-called normal behavioural pattern of the cow varies from cow to cow, day to day, farm to farm, season to season, and so on. Finding a common normal pattern to all cows is therefore impossible. However, most TSC tools rely on learning a global model to define whether a given behaviour is close to this model or not. This thesis is structured around two major contributions. The first one is the development of a new TSC method: FBAT. It is based on Fourier transforms to identify a pattern of activity over 24 hours and compare it to another consecutive 24-hour period, in order to overcome the problem of the lack of a common pattern in a normal cow. The second contribution is the use of fuzzy labels. Indeed, around the days considered abnormal, it is possible to define an uncertain area where the cow would be in an intermediate state. We show that fuzzy logic improves results when labels are uncertain and we introduce a fuzzy variant of FBAT: F-FBAT