Dissertations / Theses: 'Résistance aux parasites'

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Leignel, Vincent. "Diversité génétique et résistance aux benzimidazoles chez ""Teladorsagia circumcincta" (Nematoda, Trichostrongylidea) parasite de petits ruminants." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20142.

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Abstract:

Mes travaux de these s'inserent dans le cadre general des recherches developpees sur la resistance aux benzimidazoles (bzs) chez teladorsagia circumcincta, trichostrongle parasite de petits ruminants. Dans une premiere partie, une etude sur la diversite genetique a tout d'abord montre que t. Circumcincta est en fait un complexe d'especes qui regroupe au moins deux especes distinctes t. Circumcincta et t. Goat. Elle a aussi mis en evidence chez t. Circumcincta (espece la plus frequente du complexe), une absence de structuration des populations a l'echelle regionale (< 200 km) et une faible structuration a plus large echelle. Compte tenu des caracteristiques des elevages caprins etudies et des parametres demographiques de t. Circumcincta, ce resultat traduit l'existence d'une faible derive genetique qui permet le maintien d'alleles rares (dont les alleles de resistance) dans les populations parasites. Dans une seconde partie, ces travaux se sont interesses a l'influence de differents types de traitement anthelminthiques sur la selection des genotypes resistants et aux consequences de l'acquisition de la resistance aux bzs sur certains traits de vie des parasites. En absence de traitement, la proportion des genotypes reste constante ce qui indique que le succes reproductif des genotypes resistant et sensibles est semblable. La resistance aux bzs augmente proportionnellement avec le nombre de traitements aux bzs. Il est donc tres difficile de combattre la resistance, lorsque les premiers genotypes resistants sont apparus dans la population parasite.

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Martin, Thibaud. "La résistance aux insecticides de Heliccoverpa armigera (Hübner) en Afrique de l'Ouest : du mécanisme à la gestions." Toulouse 3, 2003. http://www.theses.fr/2003TOU30087.

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Lecouls, Anne-Claire. "Spectre d'activité et marquage moléculaire du gène Ma1 contrôlant la résistance aux nématodes Meloidogyne chez Prunier myrobolan." Aix-Marseille 2, 2000. http://www.theses.fr/2000AIX22031.

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Menard, Sandie. "Plasmodium falciparum et résistance aux antipaludiques : aperçu et conséquences des facteurs impliqués dans la sélection et la diffusion des parasites résistants." Thesis, Toulouse 3, 2017. http://www.theses.fr/2017TOU30116/document.

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Abstract:

Le paludisme reste l'une des plus redoutables maladies infectieuses avec plus de 200 millions d'infections et près de 430 000 décès chaque année, principalement des enfants de moins de 5 ans vivant en Afrique subsaharienne. L'espèce Plasmodium falciparum est responsable de la grande majorité de la mortalité. Le contrôle de l'endémie palustre reste encore aujourd'hui un problème majeur de santé publique, notamment à cause des résistances aux antipaludiques développées par les parasites. L'apparition de ces résistances s'opère par la pression de sélection médicamenteuse, et leur diffusion progressive se fait principalement via le déplacement des hôtes infectés. Cependant, la dynamique d'émergence, de diffusion et de persistance des parasites résistants résulte d'interactions complexes entre les antipaludiques, l'Homme, le parasite et le vecteur. Le travail présenté ici participe à la démarche de lutte contre le paludisme en proposant tout d'abord un état des lieux de la résistance de Plasmodium aux antipaludiques utilisés au Cameroun, avec des outils moléculaires, phénotypiques et cliniques. Une deuxième partie explore, in vitro, les possibles conséquences d'une utilisation prolongée des dérivés d'artémisinine sur le phénotype de P. falciparum, alors que la résistance à cette molécule est déjà installée. Le modèle in vitro utilisé a permis de mettre en évidence un nouveau profil de pluri-résistance suite à des pressions continues à l'artémisinine. Enfin, une dernière partie de ce travail analyse le rôle du moustique dans l'épidémiologie des résistances et montre que la sporogonie favoriserait la diffusion des allèles minoritaires, résistants ou non, présents chez l'Homme. L'ensemble de ces travaux confirme la multiplicité des facteurs agissants sur la dynamique de résistance et la complexité de leurs interactions rendant toute prévision très spéculative. Même si une meilleure connaissance des phénomènes sociétaux, épidémiologiques, biologiques et pharmacologiques impliqués dans les résistances reste une priorité, la surveillance phénotypique et génotypique régulière sur le terrain apparait à ce jour, le meilleur outil pour adapter au mieux les stratégies de contrôle du paludisme Malaria remains one of the most terrible infectious diseases with more than 200 million infections and 430,000 deaths each year, mostly children under five years old in sub-Saharan Africa. Plasmodium falciparum is responsible for the vast majority of malaria mortality cases. Control of malaria still remains a major public health problem, in particular because of resistances to antimalarials that parasites developed. The apparition of these resistances is due to the drug pressure, and their progressive diffusion is mainly via the travelling of infected hosts. However, the dynamics of emergence, diffusion and persistence of resistant parasites result from complex interactions between the antimalarials, the Human, the parasite and the vector. The work presented here participates in the malaria control process by first proposing an inventory of Plasmodium resistance to antimalarials used in Cameroon, thanks to molecular, phenotypic and clinical tools. A second part explores the possible consequences of prolonged use of artemisinin derivatives on the P. falciparum phenotype, in areas where resistance to this molecule is already established. The in vitro model used showed that continuous artemisinin pressures induced a new pluri-resistance profile. Finally, a last part analyses the role of the mosquito in the epidemiology of resistances and shows that the sporogony favours the diffusion of minority alleles, resistant or not, presented in humans. All this work confirms the multiplicity of forces acting on the dynamics of resistances and the complexity of their interactions making any prediction very speculative. Even if better knowledge of the societal, epidemiological, biological and pharmacological phenomena involved in resistances is a priority, regular phenotypic and genotypic surveillance in the field remains the best tool for adapting malaria control strategies

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Boudsocq-Silvestre, Anne. "Résistance aux benzimidazoles des communautés de nématodes parasites du tractus digestif des petits ruminants : mécanismes génétiques et facteurs environnementaux." Tours, 2000. http://www.theses.fr/2000TOUR3805.

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Poitrineau, Karine. "Evolution de la résistance aux ennemis naturels et intéractions multiples : théorie et système biologique drosophiles-parasitoi͏̈des." Montpellier 2, 2004. http://www.theses.fr/2004MON20016.

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Beveraggi, André. "Etude des interactions hôte-parasite chez les bananiers sensibles et résistants inoculés par "Cercospora fijiensis" responsable de la maladie des raies noires." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20264.

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Abstract:

La maladie des raies noires causee par c. Fijiensis (m. Fijiensis) constitue l'un des principaux facteurs limitants de la culture des bananiers (aaa), plantains (aab) et autres bananes a cuire, dans les principales zones de production intertropicales. Les recherches, actuellement menees en relation etroite avec le programme d'amelioration genetique, ont pour objectif une meilleure connaissance des interactions hote-parasite. Trois niveaux de comportements vis-a-vis de la maladie: sensible, s; partiellement resistant, pr; tres resistant, tr, avec blocage des premiers stades de l'infection, caracterisent l'ensemble des varietes sauvages ou cultivees (aa, aaa, aab, abb). Les differents travaux utilisent un modele experimental h-p (controle de l'infection) comprenant 3 cultivars representatifs de chaque niveau de comportement: g. Naine, s; fougamou, pr; yangambi km5, tr. Une analyse des tissus sains et de la dynamique de l'infection a ete realisee. Les observations de nature biochimique et cytologique (micr. Optique et electronique, fluorescence), permettant une analyse fine a l'echelle cellulaire, mettent en evidence deux interactions distinctes. Le comportement pr apparait etre lie en partie a l'existence d'une composante preformee fongitoxique de nature polyphenolique. Cette composante est tres reduite chez le cultivar tr pour lequel il est mis en evidence un mecanisme actif de defense induit juste apres la penetration stomatique

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Riou, Mickaël. "Rôles et régulation des P-glycoprotéines de membrane impliquées dans les mécanismes de résistance multiple des nématodes parasites des petits ruminants aux anthelminthiques." Tours, 2005. http://www.theses.fr/2005TOUR4001.

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Abstract:

Les P-glycoprotéines (P-gp) jouent un rôle primordial dans la résistance multiple aux anthelminthiques des nématodes parasites des petits ruminants. Ce travail de thèse a permis de décrire le premier schéma du transport des anthelminthiques pour un modèle œuf de nématode impliquant les P-gp et de montrer le rôle de l’environnement membranaire dans leur activité. Les anthelminthiques pénétreraient dans les œufs soit par diffusion passive soit par capture directe par les P-gp (influx). Les anthelminthiques activeraient les P-gp et changeraient leur conformation. Les P-gp activées éliminent les anthelminthiques (efflux) et préserveraient ainsi l’œuf de leurs effets toxiques. Ce transport des anthelminthiques est altéré par la modification de la teneur en cholestérol des œufs. Le cholestérol agirait soit indirectement sur la solubilisation des anthelminthiques dans les membranes soit directement sur l’activité des P-gp P-glycoproteins (Pgp) play an important role in the multiresistance to anthelmintics in the parasitic nematodes of small domestic ruminants. This work allowed to describe the first scheme for the transport of anthelmintics in nematode egg implying Pgp and to show the role of membrane environment in their activity. The anthelmintics could penetrate into eggs either by passive diffusion or by direct capture by Pgp (influx). The presence of anthelmintics would activate Pgp by changing their conformation. Once activated, Pgp eliminate the anthelmintics (efflux) and protect eggs from their toxic effects. The transport of anthelmintics is altered by changes in cholesterol content of eggs. Cholesterol could act either indirectly on the solubilisation of anthelmintics in membranes or directly on Pgp activity

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Bonneaud, Camille. "Stratégies génétique, physiologique et comportementale de résistance aux parasites au sein de populations naturelles de moineaux domestiques (Passer domesticus)." Paris 6, 2004. http://www.theses.fr/2004PA066010.

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Boivin, Thomas. "Pléiotropie de la résistance aux insecticides : estimation, manifestations écologiques et modélisation chez le carpocapse des pommes Cydia pomonella (L.)." Avignon, 2003. http://www.theses.fr/2003AVIG0311.

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Abstract:

L'adaptation des populations à un nouvel environnement via la sélection de mutations modifiant fortement le phénotype peut être contrainte par des effets pléiotropes des nouveaux allèles sélectionnés, qui sont susceptibles de générer des compromis génétiques et physiologiques affectant certains traits d'histoire de vie. La résistance des insectes aux insecticides offre l'opportunité d'appréhender ce phénomène car la nature des changements environnementaux ainsi que leurs réponses adaptatives peuvent être clairement identifiés. L'objectif de ce travail fut de caractériser les effets pléiotropes de la résistance aux insecticides chez le carpocapse des pommes Cydia pomonella. Ce travail suggère que (i) les allèles de résistance sont associés à des compromis physiologiques imposant un coût pour la fitness en l'absence d'insecticide, et (ii) ces compromis physiologiques se traduisent par des modifications significatives de la phénologie et du voltinisme, toutefois susceptibles de constituer un mécanisme de sélection des allèles de résistance indépendant de la pression insecticide. Enfin, la modélisation de l'impact de ces effets pléiotropes sur la phénologie permet une approche à la fois explicative et prédictive de l'évolution saisonnière des allèles de résistance, et semble établir de nouvelles perspectives quant à la gestion de la résistance aux insecticides chez ce ravageur majeur de l'arboriculture fruitière Adaptation of populations to a new environment through the involvement of mutations with large phenotypic effects may be strongly constrained by deleterious pleiotropic effects of the newly selected characters that may affect life-history traits. Insecticide resistance is a convenient model for studying the pleiotropic trade-offs associated with adaptation because both the nature of the environmental changes and the adaptive responses of populations can be clearly identified. This study was undertaken to characterize the pleiotropic effects of insecticide resistance in the codling moth Cydia pomonella. Here we suggest that (i) insecticide resistant alleles are associated with life-history trade-offs that result in selection against insecticide resistant phenotypes in the absence of insecticide, and (ii) these life-history trade-offs result in significant alterations of both phenology and voltinism, which may however contribute to the selection process of insecticide resistant alleles independently from chemical treatments. A modelling approach of the interactions between both insecticide resistance and phenology allows the assessment of the seasonal evolution of insecticide resistant alleles, and may shed a light on new resistance management tactics of this major pest species

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Gaba, Sabrina. "Processus impliqués dans la résistance aux benzimidazoles chez les nematodes d'ovins : des données biologiques à la modelisation." Tours, 2005. http://www.theses.fr/2005TOUR4017.

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Abstract:

L'adaptation aux pressions environnementales est caractériseée par l'apparition par mutation de nouveaux états pour un caractère et la sélection de ces états. La résistance aux benzimidazoles (traitement anthelminthique) des nématodes Teladorsagia circuncincta parasites de petits ruminants (ovins) est un cas d'adaptation aux pressions environnementales, pour lequel le déterminisme génétique (un gène à deux allèles) est bien connu, mais où les processus impliqués dans sa sélection demeurent indéterminés. Les premières phases de la sélection de la résistance, qui sont cruciales dans la compréhension de l'émergence de la résistance, restent inaccessibles à l'expérimentateur et le recours à la modélisation est alors nécessaire. L'objectif de cette étude fut de caractériser les processus impliqués dans la sélection de la résistance aux benzimidazoles chez T. Circumcincta. Il a ainsi été possible (i) de préciser la nature des facteurs influençant l'installation du nématode chez l'ovin au moyen d'une meta-analyse (ii) de proposer la loi de Weibull comme distribution plus représentative des fortes abondances de nématodes que la loi binomiale négative et (iii) de déterminer l'effet de l'hypobiose (arrêt du développement) sur la dynamique hôte-parasite. Une approche simulatoire, permettant d'intégrer les connaissances sur l'interaction T. Circumcincta-ovin, a montré le rôle majeur dans la sélection de la résistance aux benzimidazoles (i)de l'agrégation des larves infestantes ingérées dans les premiers stades de la résistance et (ii) des zones refuges constituées, soit par les larves infestantes sensibles sur la parcelle soit par les nématodes sensibles non soumis au traitement dans les ovins. Dans le contexte de la résistance aux anthelminthiques, ces résultats permettent d'envisager des stratégies de gestion, et cette tude pourra être étendue à d'autres nématodes (modification du paramétrage) et complexifiée pour tester l'influence d'autres zones refuges comme l'hypobiose Mutation of a trait and selection of the new mutant form is the key step of adaptation to environmental selective pressure. The resistance to benzimidazoles (anthelmintic treatments) of the nematodes Teladorsagia circumcincta, parasites of small ruminants (sheep) in a suitable model to study this process. The genetics of the resistance is well documented (one gene with two alleles) but the mechanisms governing selection still need to be disentangled. The early stage of selection of resistant strains cannot be studied experimentally and modelling is the only available approach. To characterize the processes involved in the selection of the resistance to benzimidazoles in T. Circumcicta, (i) we used a meta-analysis to identify the main factors governing the establishment of nematodes in sheep populations, (ii) we promoted the Weibull distribution rather than the Negative Binomial to describe the large numbers of nematodes observed in the most infected hosts and (iii) we investigated the effect of hypobiosis (arrested development) on the host-parasite dynamics. A simulation study, aiming to aggregate the knowledge on the T. Cicumcincta-sheep system, proved that the selection of the resistance to benzimidazoles was mainly affected by (i) the ingestion of clumps of infective larvae in the early stage of resistance selection and (ii) the refuge constituted by susceptible infective larvae remaining on pasture and by susceptible nematodes not exposed to treatments in sheep. We propose management rules in order to maintain selection for resistance as low as possible. It remains to extend this study to other nematodes species by adapting the parameters involved in the models. A further investigation of other potential refuges is also needed, of which refuge-effect of hypobiosis is of particular interest

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Hita, Meseguer Maria Teresa. "Caracterización genética y molecular de un gen de resistencia específica de Drosophila melanogaster al himenóptero parásito Leptopilina boulardi." Tours, 2001. http://www.theses.fr/2001TOUR4014.

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Abstract:

Drosophila melanogaster est parasitée par plusieurs espèces de guêpes, comme Leptopilina boulardi et Asobara tabida. Après le parasitisme, le système immunologique de la drosophile peut détecter la présence d'un corps étranger et mettre en place une réaction de défense caractérisée par l'encapsulement de l'oeuf. Normalement cette réaction n'est pas menée à bien car le parasitoi͏̈de possède un mécanisme de virulence capable de contourner la réaction de défense de l'hôte. Des souches virulentes et avirulentes des deux espèces de guêpes et des souches de drosophile résistantes et sensibles contre ces parasitoi͏̈des sont disponibles. Ainsi, on a pu montrer que la résistance à Leptopilina boulardi et Asobara tabida est due à deux gènes majeurs, Rlb et Rat, les allèles résistants étant dominants. Les gènes sont localisés sur le chromosome 2R, Rlb en 2-86. 7 et Rat en 2-51. 3. L'utilisation de souches délétées sur le deuxième chromosome nous a permis de localiser Rlb dans la région 55C1-C3 ; 55F3, la région 55E2-E4 ; 55F3 étant particulièrement impliquée. La cartographie faite avec deux banques d'ADN génomique montre que cette région correspond à 300 kb. Cette localisation a été restreinte à 100 kb en utilisant des hybridations in situ sur chromosomes polytènes des souches délétées et la technique du Southern-blot. Avec une souche contenant un élément P dans la région de 100 kb et l'obtention de mâles recombinants à partir de cette souche nous perment de suggérer que Rlb est localisé près de cet élément P. La séquence de la région de 100 kb, publiée par le BDGP, montre la présence de 11 gènes hypothétiques. Les deux gènes situés de part et d'autre de l'élément P sont susceptibles de jouer le rôle de Rlb. . .

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Brahmi, Inès. "Obtention et Caractérisation de nouveaux génotypes de pois chiche, par radio-mutagenèse, résistants à Orobanche foetida." Nantes, 2015. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=45659d0d-6b67-49d1-b028-2d8c9262ca9c.

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Abstract:

Les orobanches sont des adventices parasites largement répandues dans les agrosystèmes du bassin méditerranéen. En Tunisie, Orobanche foetida s’attaque aux Légumineuses cultivées et en cause d’importantes pertes. Les méthodes de lutte actuellement proposées demeurent insuffisantes. Parmi ces dernières, la sélection des variétés résistantes reste la méthode de contrôle la plus économique. Dans ce contexte, l’induction de mutations génétiques en utilisant les rayons gamma a été testé pour augmenter la variabilité génétique de pois chiche avec l’objectif ici à moyen terme de proposer de nouvelles lignées résistantes. L’effet de l’irradiation sur la germination et la croissance des plantes de pois chiche (cv. Amdoun) a été étudié. La dose 150 Gy a été définie comme la dose mutagène capable d’induire des mutations génétiques chez le pois chiche (cv. Amdoun). Une première sélection phénotypique dans une parcelle naturellement infestée par O. Foetida a permis de sélectionner 30 génotypes mutants (M2), en raison de leur faible sensibilité, qui se traduisait par un nombre réduit d’orobanches émergées. Ces génotypes ont été ensuite étudiés au laboratoire pour apprécier d’une part leur capacité à induire la germination des graines d’orobanche et d’autre part leur degré de résistance en conditions d’infestation artificielle. Aucun des mutants n’a perdu totalement sa capacité à induire la germination de l’orobanche mais cinq d’entre eux ont une capacité significativement réduite par rapport au témoin Amdoun. La résistance repose également sur l’induction d’une nécrose précoce du parasite, empêchant la formation du suçoir, et sur une perturbation du développement souterrain de la hampe florale qui limite l’émergence du parasite. L’ensemble de ces caractères induits par radiomutagenèse est stable puisque conservés dans la génération M3. L’efficacité de la radiomutagenèse pour induire une résistance forte repose sur la modulation, dans les racines sous infestation, du profil d’accumulation des composés phénoliques solubles et de l’expression d’acteurs majeurs de la résistance à l’orobanche tels que les peroxydases et la polyphénoloxydase Broomrapes are parasitic weeds widespread in agricultural systems of the Mediterranean basin. In Tunisia, Orobanche foetida attacks on cultivated legumes cause significant losses. Currently proposed control methods are insufficient. The selection of resistant varieties is the most economic method of control. In this context, the induction of genetic mutations is used to increase the genetic variability in the medium term for propose new resistant lines. In our study, the effectiveness of radio mutagenesis was evaluated in chickpea. The effect of irradiation on the germination and growth of chickpea plants (cv. Amdoun) was studied. The 150 Gy dose was defined as the mutagen dose capable of causing genetic mutations in chickpea A first phenotypic selection in a naturally O. Foetida infested plot was used to select 30 genotypes (M2 progeny), because of their low sensitivity which resulted in a reduced number of emerged orobanche. These genotypes were then studied in the laboratory to appreciate first their ability to induce seed germination broomrape and also their degree of resistance under artificial infestation. None of the mutants has completely lost the ability to induce germination of Orobanche seeds but five of them displayed a significantly reduced capacity compared to Amdoun control. Additional resistance components were observed, such as early necrosis of the parasite which prevents haustorium formation, and late disturbance in the subterranean development of the floral shoot which reduced parasite emergence. All the radiomutagenesis induced characters were stable as kept in the following M3 generation. This study shows that the effectivness of radiomutagenenis for producing strong resistance is related to modulations of accumulation of phenolic compounds and expression patterns of peroxidases and polyphenoloxidase in chickpea roots under infestation

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Garamszegi, László Zsolt. "Parasitism and the evolution of bird song." Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066149.

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Ihabi, Mounia. "Les parasites de conservation des pommes, du verger au fruitier : étude épidémiologique, étude comparative des cuticules de variétés très sensibles et de variétés résistantes." Littoral, 1997. http://www.theses.fr/1997DUNK0006.

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Abstract:

Pendant leur période de conservation, les pommes sont sujettes à de nombreuses altérations causées essentiellement par des champignons. L'apparition de ces pourritures et l'importance des dégâts qui en découlent, dépendent en premier lieu des caractéristiques variétales du fruit, en particulier la sensibilité ou la résistance vis à vis des parasites de conservation. Le travail présenté dans cette thèse a pour principal objectif une meilleure connaissance de cette interaction pomme/pathogène chez différentes variétés traditionnelles du Nord-Pas-de-Calais caractérisées par des aptitudes différentes à la conservation. Ainsi sur deux saisons successives (1994-1996), un suivi épidémiologique a été effectué au verger pendant le cycle de végétation des variétés de pommes choisies, puis, au fruitier pendant leur période conservation. Les différents prélèvements révèlent l'existence d'une flore fongique diversifiée constituée de nombreux champignons saprophytes et pathogènes tels que Botrytis cinerea, Cladosporium cladosporioides, Ramularia sp. . . La contamination des fruits, surtout par les populations pathogènes, se fait à des stades bien précis de la période de développement du pommier et dans des conditions environnementales bien définies. Au fruitier l'état sanitaire des pommes est fortement influencé par les conditions de conservation. Par ailleurs, Penicillium expansum représente le pathogène majeur impliqué dans les pourritures observées chez les différentes variétés. Parallèlement au suivi épidémiologique, une étude comparative de l'évolution des caractéristiques physico-chimiques de la cuticule des différentes variétés de pommes pendant la conservation a été également conduite. D'un point de vue structural, les résultats obtenus ont montré que les variétés résistantes Colapuis et Cabarette sont caractérisées par un revêtement cuticulaire plus épais. De plus chez Cabarette la formation de plusieurs assises liégeuses vient renforcer la cuticule existante. D'un point de vue biochimique, des différences sont également observées surtout au niveau des cires épicuticulaires. En effet, Colapuis et Cabarette sont caractérisées par des proportions d'acides gras libres plus élevées que dans les variétés plus sensibles telles que golden. De plus la composition chimique de cette fraction est marquée par la prédominance des acides gras à très longue chaines C28 et C30 tout au long de la conservation. La présence de ces molécules connues comme étant des agents antifongiques pourrait expliquer en partie, la sensibilité moindre des fruits aux agents de pourritures.

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Barjau, Michelle. "Isolement, purification, et essai de détermination de la structure de la toxine issue d'un champignon : Colletotrichum gloeosporidoides." Aix-Marseille 3, 1995. http://www.theses.fr/1995AIX30040.

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Abstract:

L'hevea, arbre producteur de latex, est soumis a de fortes attaques de champignons tel que le colletotrichum gloeosporioides. Celui-ci provoque une anthracnose entrainant des derangements physiologiques qui diminuent sa capacite de production. Plusieurs souches ont ete isolees a partir de feuilles infectees. Toutes se sont revelees pathogenes. Elles sont susceptibles d'excreter dans le milieu de culture de richard modifie, des composes toxiques capables de reproduire les symptomes de la maladie sur des plantules de tomates. L'analyse de ces composes toxiques (apres purification par chromatographie d'affinite sur concanavaline a et fractionnement par tamisage moleculaire sur sephadex g75) montre qu'ils sont de nature glycoproteique. La partie saccharidique est tres developpee, et represente environ 90% de la molecule. Les sucres neutres et amines, identifies par cpg et clhp, sont caracteristiques de la presence de chaines n- et o- glycosylees. Les acides amines sont essentiellement neutres et hydroxyles. Les hydrolyses alcalines et enzymatiques confirment la presence de chaines o- et n- glycosylees, ces dernieres etant de type bi-antennee

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Kanika-Kiamfu, Justin. "Etude expérimentale des potentialités bioéthologiques d'Exochomus flaviventris Mader (Coléoptère - Coccinellidae) prédateur de la cochenille du manioc, Phenacoccus manihoti Mat. -Ferrero (Homoptère - Pseudococcidae)." Toulouse 3, 1991. http://www.theses.fr/1991TOU30230.

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Abstract:

E. Flaviventris est une espece coccidiphage capable de se nourrir d'aphides. Polyphage et sedentaire, elle adopte une strategie de reproduction du type r et peut developper dans les conditions optimales d'elevage, 7 a 8 generations par an. Elle presente l'avantage de consommer beaucoup de proies tous stades de developpement confondus. Malgre une capacite d'accroissement assez faible, un cycle de developpement et une maturation sexuelle relativement longs, une fecondite assez moyenne, une constante thermique et un seuil thermique theorique tres eleves, e. Flaviventris presente des qualites antagonistes interessantes. Son utilisation en lutte biologique et son role dans la maitrise des populations de la cochenille farineuse du manioc sont largement justifies par rapport aux autres especes de coccinelles. Elle presente, en effet, de meilleures chances sur le plan de l'occupation spatiale du terrain grace a sa polyphagie qui lui offre ainsi des garanties supplementaires de survie dans les ecosystemes les plus divers, meme en l'absence periodique de p. Manihoti. Sa grande voracite devrait lui permettre de jouer un role de regulation des les premieres pullulations de la cochenille du manioc. Son aptitude a pouvoir se multiplier massivement sur une nourriture de substitution (les ufs d'e. Kuehniella) contribue a augmenter ses potentialites biologiques et a faciliter le renforcement periodique de ses populations naturelles.

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Vittu, Anaïs. "Outils bioinformatiques pour l'analyse génétique de la résistance du moustique Anopheles gambiae vis-à-vis des parasites du paludisme." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ096/document.

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Abstract:

Au cours de ma thèse, j’ai développé et mis en place de nouvelles méthodes utilisant les récentes technologies du séquençage à très haut débit, des outils bioinformatiques et du «reciprocal allele-specifique RNA interference » (rasRNAi) dans l’objectif d’identifier les facteurs génétiques et non génétiques responsables de la résistance du moustique Anopheles gambiae aux parasites du paludisme murin Plasmodium berghei. J’ai mis en place une stratégie d’identification des polymorphismes dans les lignées résistantes et sensibles afin de sélectionner des marqueurs génétiques pour de futures analyses génétiques et lister les gènes polymorphiques. J’ai contribué à l’élaboration de nouvelles sondes ARN double-brin (dsRNAs) allèle spécifique pour la méthode du rasRNAi en identifiant le processus de découpage du dsRNA injecté chez des moustiques par l’analyse des petits ARNs séquencés issus du dsRNA injecté. J’ai élaboré un pipeline pour identifier la composition du microbiote des lignées sensibles et résistantes dans le but de les comparer During my PhD, I developed and implemented new methods and tools using the latest technologies of the Next Generation Sequencing, bioinformatics tools and the « reciprocal allele-specific RNA interference » (rasRNAi) method with the aim of identifying genetic and non-genetic factors responsible for the resistance of the mosquito Anopheles gambiae to the mouse malaria parasites Plasmodium berghei. I have implemented a strategy for identifying polymorphisms in the resistant and susceptible lines to (1) select genetic markers for future genetic analysis and (2) list the polymorphicgenes. I contributed to the development of a new allele-specific dsRNA probe for the rasRNAi method by identifying how mosquitoes process the injected dsRNA by the analysis of sequenced small RNAs from the injected dsRNA. I developed a pipeline to identify the microbiota composition in susceptible and resistant lines in order to compare them

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Fouchet, David. "Rôle des anticorps maternels dans le changement d' impact d'une maladie infectieuse : impact du choix du modèle sur la compréhension des relations hôte parasites." Lyon 1, 2006. http://www.theses.fr/2006LYO10151.

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Abstract:

En opposition avec la vision classique selon laquelle les anticorps maternels sont immunosuppesseurs, Zinkernagel (2001) a proposé qu’ils ne bloquent pas les infections mais servent uniquement à les atténuer, activant ainsi le système immunitaire de l’hôte à moindre coût. Je me suis appuyé sur le système lapin-myxomatose pour, à l’aide de modèles mathématiques, formaliser l’atténuation des maladies par les anticorps maternels, en comprendre les causes évolutives et les conséquences épidémiologiques. En effet, dans un tel système, les jeunes se trouvent face à deux situations. D’un côté, ils peuvent s’infecter tôt, développer une maladie atténuée et ainsi s’immuniser contre une éventuelle réinfection. De l’autre, ils peuvent grandir sans jamais être infectés, mais ils deviennent alors sensibles à la forme la plus sévère de la maladie. Un fort niveau de circulation du pathogène peut donc en réduire l’impact en permettant aux jeunes de s’immuniser à faible coût

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Lespinasse, Denis. "Cartographie génétique de l'"Hevea (Hevea spp)" et déterminisme de la résistance au champignon pathogène "Microcyclus ulei"." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20053.

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Abstract:

Le champignon microcyclus ulei represente le principal frein au developpement de l'heveaculture en amerique latine, ainsi qu'une menace potentielle pour l'heveaculture mondiale. Ameliorer la resistance de l'hevea passe par une meilleure comprehension des interactions entre l'hevea et m. Ulei et necessite l'etude des bases genetiques de la resistance. Les premieres cartes genetiques de l'hevea (2n = 36) ont ete realisees a partir d'une descendance de 195 individus issue d'un croisement entre deux parents heterozygotes. Deux cartes parentales ont ete construites grace a une strategie pseudo-testcross. Une carte consensus a ensuite ete elaboree par fusion des cartes parentales, grace a 172 marqueurs communs aux deux cartes, ou marqueurs ponts. La carte consensus est constituee de 717 locus (rflp, aflp, microsatellites, isozymes) repartis sur 18 groupes de liaison. Une segregation disomique des marqueurs a ete observee, et peu de locus dupliques ont ete reveles. L'inoculation de la descendance en conditions controlees par 6 souches differentes de m. Ulei a permis de mettre en evidence 8 qtl repartis sur 7 des 18 chromosomes de l'hevea. Le plus important d'entre eux, detecte avec toutes les souches, explique jusqu'a 36% de la variation phenotypique observee. Il a pu etre montre que presque tous les alleles favorables aux qtl identifies proviennent du parent femelle de ro38, le clone f4542, qui appartient a l'espece sauvage hevea benthamiana et dont la resistance est consideree a ce jour comme jamais mise en defaut. Un seul qtl mineur a pu etre detecte chez le parent sensible appartenant a l'espece cultivee h. Brasiliensis. Ces resultats offrent des perspectives encourageantes pour l'amelioration de la resistance a m. Ulei.

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Villain, Luc. "Caractérisation et bioécologie du complexe parasitaire du genre pratylenchus (nemata : pratylenchidae) présent sur caféiers (coffea spp. ) au Guatemala." Rennes, Agrocampus Ouest, 2000. http://www.theses.fr/2000NSARA033.

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Abstract:

Les présents travaux ont pour premier objectif de caractériser quatre isolats de Pratylenchus morphologiquement proches de P. Coffeae, prélevés sur caféiers et sur quatre sites géographiques différents du Guatemala. Le mode de reproduction amphimictique obligatoire de ces isolats est confirmé. L'observation d'isolements sur le plan reproductif suggère l'appartenance de ces isolats à plusieurs espèces. Les outils de caractérisation utilisés montrent deux niveaux de diversité. L'observation détaillée au microscope électronique à balayage a permis de séparer les isolats en deux groupes. Pour trois de ces isolats, qui ont peu être étudiés par la suite, cette dichotomie morphologique coi͏̈ncide avec les différences de capacit reproductive sur rondelles de carottes in vitro en fonction de la empérature avec un optimum thermique situé entre 27 et 30ʿC ou entre 24 et 27ʿC. L'analyse multivariée d'un ensemble de descripteurs morphométriques a permis de différencier les trois isolats étudiés. Sur le plan biologique, chacun de ces trois isolats se différencie également l'un de l'autre par sa capacité reproductive sur cet hôte. La quantité de dommages observée sur la plante est pour chacun des isolats directement liée à sa capacité parasitaire. L'aptitude à produire des dégâts sur le système radiculaire apparaît identique pour les trois isolats. Cette étude suggère que le complexe parasitaire polyspécifique de Pratylenchus spp. Sur Coffea spp. Au Guatemala présente une importante diversité qui doit être étudiée au niveau méso-américain dans les différentes régions productrices de café.

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Bonato, Olivier. "Dynamique des populations de l'acarien vert du manioc "Mononychellus progresivus" et de l'acarien rouge "Oligonychus gossypii" au Congo. Modélisation du sous-système acariens phytophages-manioc." Montpellier 2, 1993. http://www.theses.fr/1993MON20049.

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Abstract:

Cette etude realisee au congo, porte sur l'agrosysteme defini par le manioc (manihot esculenta) et deux de ses principaux acariens phytophages tetranychidae mononychellus progresivus et oligonychus gossypii. Le premier, d'origine neotropicale et d'introduction recente en afrique, a d'apres la bibliographie une tres forte incidence sur le rendement de cette plante en afrique de l'est, au nigeria et au benin. Le second, d'origine vraisemblablement africaine, n'avait jusqu'a present fait l'objet d'aucune etude biologique. Les differents resultats ont abouti a la construction d'un modele de recherche permettant d'analyser les interactions au sein de cet agrosysteme. L'elaboration du modele de simulation a necessite l'obtention d'informations concernant, d'une part la phenologie de la croissance du manioc avec et sans acariens, d'autre part la dynamique de leurs populations et l'etude de l'influence de la temperature sur leurs parametres biologiques et demographiques

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Chylinski, Caroline. "Qu'est ce qui fait le succès des nématodes gastro-intestinaux chez leur hôte ? : Etude du rôle des nématodes, des moutons et des éleveurs." Thesis, Tours, 2014. http://www.theses.fr/2014TOUR4028/document.

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Abstract:

Le titre de la thèse concernant le succès des nématodes peut sembler extremement vaste. Notre projet était pourtant bien d’avoir une vue d’ensemble de l’ensemble des acteurs, à savoir les nématodes parasites du tube digestif mais également l’hôte et certains aspects de sa réponse, et enfin l’éleveur qui est celui qui décide du mode d’élevage et des traitements antiparasitaires. Nous avons essentiellement travaillé en conditions expérimentales et sur une espèce de ces strongles. En ce qui concerne les traits de vie des nématodes plusieurs grands phénomènes conditionnent leur succès : a) leur capacité assez variable selon les isolats à infester un hôte, b) l’interaction entre résistance aux antiparasitaires et cette capacité à infester, c) enfin leur aptitude à survivre aux stress climatiques au cours de leur phase non-parasitaire The success of gastrointestinal nematodes in their sheep hosts is so extensive that they present one of the leading threats to ruminant health and production throughout the globe. This thesis research identified three key factors which influence their success including the gastrointestinal nematode biology, the sheep host protective response and the farmers control decisions. Using Haemonchus contortus as a model species, we demonstrated that the success of GIN biology is aided by their capacity to overcome numerous selective pressures that target both parasitic and free-living stages in their life cycle. This was achieved by amplifying life-history traits following challenge to recoup any costs in survival and reproduction. In turn, high levels of fitness were maintained and they remained stable in the face of numerous selective pressures. Sheep have the capacity to exert almost perfect control over GIN success by blocking their life cycle through via protective responses

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Ali-Haimoud, Djamel-Eddine. "Contribution à l'étude de la lutte biologique contre Drechslera teres (Sacc. ) Shoem. , parasite de l'orge." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT007A.

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Abstract:

Les principaux resultats de cette etude preliminaire montrent qu'a partir du phylloplan et des residus de recoltes de l'orge, des antagonistes tres actifs in vitro contre les principales sequences biologiques du pathogene peuvent etre isoles. Ce sont principalement differentes especes de trichoderma qui inhibent totalement la morphogenese des organes sclerotioides sur pailles, leur myceliogenese et egalement l'agressivite du mycelium qui en est issu. Ces antagonistes de meme qu'une espece de cephalosporium et une espece d'acremonium sont egalement tres actifs sur la sporulation du resting mycelium sur paille. Parmi les differentes especes de trichoderma utilisees, t. Koningii et t. Pseudokoningii sont capables egalement de reduire en conditions controlees l'expression de la maladie a partir de l'inoculum seminicole. La germination conidienne de d. Teres semble etre une sequence biologique hautement sensible aux antagonistes, a l'exception de fusarium graminearum, cephalosporium sp et ascochyta sp. Cette etude montre egalement que si certains de ces microorganismes conservent in vivo leur pouvoir de s'opposer au bon deroulement de certaines sequences biologiques et epidemiologiques de d. Teres (tels les trichoderma spp), d'autres au contraire se revelent etre de pietres candidats pour la lutte contre le developpement de la maladie in vivo et en conditions controlees. Ainsi, il semble donc qu'il n'existe pas de methode de screening preponderante par rapport a telle ou telle autre methode et que la multiplication de ces derniers soit une condition sine qua non a un choix exhaustif reel de tous les antagonistes potentiels existant dans un environnement donne. L'etude comparee des deux formes du pathogene montre que ces dernieres reagissent differemment aux traitements a l'aide des antagonistes. Ce comportement a deja ete observe par differents auteurs, notamment concernant l'environnement chimique et pourraient expliquer la soudaine explosion de cette maladie en france, particulierement celle due a la forme maculata, liee a l'inadequation de la lutte chimique actuellement pratiquee. Nos resultats montrent par ailleurs que certains antagonistes agissent en fait par effet synergique car ils inhibent in vitro certaines sequences biologiques du pathogene et induisent l'elicitation de proteines de defenses chez l'hote. Ainsi, l'actinomycete micromonospora 6 induit la production d'une chitinase chez l'orge qui est egalement produite lors de l'attaque par d. Teres. Les pr proteines pourraient constituer un outil efficace de l'amelioration genetique de l'orge si l'on etablit une relation (qualitative ou quantitative) entre leur production et la resistance a l'helminthosporiose

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Genois, Marie-Michelle. "Rôles de la recombinaison homologue dans la résistance aux drogues chez le parasite "Leishmania"." Doctoral thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26177.

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Abstract:

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2015-2016 Bien que l’on attribue généralement un effet néfaste à l’instabilité génomique, pour le parasite Leishmania, elle s’avère pourtant bénéfique. De façon étonnante, ce protozoaire possède la capacité de remanier le nombre de copies de ses gènes pour s’adapter à son environnement et résister aux drogues utilisées contre lui. La présence de séquences répétées identiques près des gènes essentiels à sa survie permet une recombinaison homologue (RH) efficace et entraîne subséquemment la formation d’une copie extrachromosomique supplémentaire du gène ciblé. Ce phénomène de réarrangement génique induit la formation d’amplicons circulaires ou linéaires et est, entre autres, responsable de la résistance aux agents thérapeutiques. À l’heure actuelle, les enzymes impliquées dans ce processus sont peu connues et l’émergence d’un nombre croissant de cas d’infections réfractaires aux traitements favorise l’étude des protéines médiant la RH dans des conditions de résistance. Il a été récemment montré que la formation d’amplicons circulaires est compromise en l’absence du gène LiRad51, mais n’est toutefois pas abolie. Cette observation suggère l’implication d’autres acteurs dans ce processus, alors que le mécanisme par lequel les amplicons linéaires sont formés demeure inconnu. Cette thèse présente la caractérisation biochimique et cellulaire des protéines clés de la RH impliquées dans l’amplification génique chez le parasite Leishmania infantum. Plus précisément, le rôle de LiBrca2, en tant que médiateur de LiRad51, est tout d'abord démontré en raison de son implication essentielle dans la localisation nucléaire de LiRad51 et dans la stimulation d’invasion de brins effectuée par la recombinase. De façon similaire, les paralogues de LiRad51 peuvent, possiblement grâce à leur capacité de lier et d’apparier de l’ADN, eux aussi, stimuler LiRad51 pour l’invasion d’un ADN simple-brin dans un duplex homologue. L’inactivation génique pour l’un d’entre eux (LiRad51-4) a montré un rôle considérable sur l'amplification circulaire, malgré le fait qu’aucune activité d’invasion n’a pu être observée en l’absence de LiRad51. Enfin, en accord avec son rôle bien établi chez l’humain, cette étude confirme que la protéine LiMre11 possède une activité exonucléase et qu’elle serait impliquée dans la production d’amplicons linéaires. Ces résultats mettent en évidence le potentiel thérapeutique des protéines de la réparation de l’ADN, domaine de recherche prometteur pour mieux lutter contre la leishmaniose. Genomic instability is usually known as a harmful hallmark, although in the parasite Leishmania this represents a beneficial feature. Surprisingly, this protozoan takes advantage of its ability to reorganize its genome for adapting itself to different environments as well as for drug resistance. In fact, the presence of identical repeats near essential genes allows homologous recombination (HR) between them, and subsequently causes the formation of an additional extrachromosomally copy of the targeted gene. This phenomenon of gene rearrangement induces circular or linear amplicons which leads to drug resistance. However, little is known about the enzymes involved in this process. In addition, the increasing number of infection cases refractory to treatment promotes the study of proteins mediating HR in these circumstances. It has been shown recently by gene inactivation that LiRad51 recombinase plays an important role in circular amplicon formation but was not essential. This observation suggested the presence of other players involved in this process while the mechanism by which linear amplicons are formed is still unknown. This thesis presents biochemical and cellular characterization of key HR proteins involved in extrachromosomal DNA amplification. We first determine the role of LiBrca2 as a mediator of LiRad51. In particular, LiBrca2 is involved in LiRad51 nuclear localisation and stimulates the homology search performed by the recombinase. Secondly, we show evidence that the LiRad51 paralogs help LiRad51 to promote HR through their capacity to bind and anneal DNA. Similary to LiBrca2, they can stimulate LiRad51 to invade a resected DNA double-strand break in an undamaged template to form a D-loop structure. However, they cannot perform this key step on their own. We succeed to inactivate one paralog (LiRad51-4) and provide insights on circular gene amplification. Finally, we show that LiMre11 harbors both DNA binding and exonuclease activities while inactivation of this gene led to a reduction of linear amplicon formation after drug selection. These results highlight a novel LiMre11-dependent pathway used by Leishmania to amplify stochastically portions of its genome. The relevance of DNA repair for drug resistance and its potential as a drug target represent a promising area of research for future treatments of leishmaniasis.

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Buxton, Samuel. "Parasitic nematode ion channels : improving understanding of pharmacology and genetic composition." Thesis, Tours, 2012. http://www.theses.fr/2012TOUR4047/document.

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Abstract:

Actuellement, les infections des humains, des plantes et des animaux par les nématodes parasites ont un impact économique majeur. En l’absence de vaccin efficace, les anthelminthiques sont les principaux agents chimiothérapeutiques utilisés pour le traitement et la prophylaxie des infections à nématodes. Cependant, la résistance est apparue pour la plupart des anthelminthiques. Par conséquent il est urgent de comprendre la génétique des récepteurs ciblés par ces anthelminthiques et de trouver des cibles alternatives afin de développer de nouveaux anthelminthiques. Nous avons démontré les effets du nouvel anthelminthique cyclooctadepsipeptide, emodepside, sur le potentiel de membrane et les courants voltagedépendants chez le parasite du porc Ascaris suum. Enfin, nous avons cloné quatre gènes codant des sous-unités du récepteur de l'acétylcholine d'un autre parasite du porc, Oesophagostomum dentatum et caractérisé dans des ovocytes de Xenopus laevis quatre sous-types de récepteurs au lévamisole Parasitic nematode infections of humans, plants and animals are of major economic impact. Anthelmintics are the main chemotherapeutic agents used for treatment and prophylaxis of nematode infections because there is presently no effective vaccine on the market. However, resistance has been reported to the mainstay anthelmintics. There is therefore the urgent need to understand the genetics of the receptors targeted by these anthelmintics and to find alternative targets for developing new anthelmintics. We have demonstrated the effects of the new novelacting cyclooctadepsipeptide anthelmintic, emodepside, on the membrane potential and voltageactivated currents in the pig parasite Ascaris suum. Finally, we show the cloning of four acetylcholine receptor subunit genes from another pig parasite, Oesophagostomum dentatum and the expression and characterization of four levamisole receptor subtypes in Xenopus laevis oocytes

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Courtot, Élise. "Etude de la diversité des récepteurs à l'acétylcholine chez les nématodes : de l'identification à la caractérisation fonctionnelle." Thesis, Tours, 2015. http://www.theses.fr/2015TOUR4039.

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Abstract:

Les récepteurs à l’acétylcholine (AChRs) des nématodes parasites sont des cibles pharmacologiques majeures pour les anthelminthiques utilisés en médecine vétérinaire. Cependant, face à l’émergence d’isolats résistants, l’optimisation des stratégies de lutte nécessite une meilleure connaissance du mode d’action des anthelminthiques et du répertoire d’AChRs pour l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques. Les nématodes parasites possèdent potentiellement une grande diversité d’AChR dont un nombre très restreint a été caractérisé fonctionnellement à ce jour. Dans ce contexte, nous avons identifié deux sous-unités d’AChR : ACR-26 et ACR-27 spécifiquement retrouvées chez les nématodes parasites. En exprimant ces sous-unités en œuf de Xénope et dans le nématode modèle Caenorhabditis elegans, nous avons mis en évidence un nouveau sous-type d’AChR musculaire sensible au morantel : le M-AChR. De plus, nous avons réalisé une étude moléculaire et fonctionnelle comparative des sous-unités d’AChR du groupe ACR-16 chez différentes espèces de nématodes. L’identification de ces nouveaux récepteurs constitue une base solide pour le développement de nouveaux anthelminthiques Acetylcholine receptors (AChRs) of parasitic nematodes are the major pharmacological targets for anthelmintics used in veterinary medicine. However, with the emergence of resistant isolates, the optimization of control strategies requires a better knowledge of the mode of action of anthelmintics and of the AChR repertoire for the identification of new therapeutic targets. Indeed, parasitic nematodes possess a large diversity of AChR subunits. In this context, we identified two AChR subunits: ACR-26 and ACR-27, specifically found in parasitic nematodes. By expressing these subunits in Xenopus oocytes and in the model nematode Caenorhabditis elegans, we identified a novel muscular AChR subtype sensitive to morantel: the M-AChR. Moreover, we performed a molecular and functional comparative study of the AChR subunits from ACR-16 group in different nematode species. The identification of these new receptors paves the way for the development of new anthelmintic drugs

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Laffitte, Marie-Claude. "Caractérisation des mécanismes de réarrangements géniques chez le parasite Leishmania résistant aux drogues." Doctoral thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26690.

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Abstract:

Le parasite Leishmania est un protozoaire de l’ordre des Kinetoplastidae et de la famille des Trypanosomatidae, responsable de maladies appelées leishmanioses. En tant qu’eucaryote unicellulaire, Leishmania possède de nombreux mécanismes d’adaptation aux stress environnementaux. En effet, plusieurs mécanismes de résistance peuvent être développés par le parasite pour répondre au stress et sont basés sur la modulation du génome, comme l’amplification génique ou l’introduction de mutations. De fait, l’étude de l’intégrité génomique et des mécanismes sous-jacents l’acquisition de la résistance sont des éléments clés de la compréhension du fonctionnement de ce parasite. L’amplification génique est rendue possible par la présence de nombreuses séquences répétées distribuées à travers le génome de Leishmania et qui permettent la formation d’amplicons circulaires et linéaires contenant des gènes essentiels à l’acquisition de la résistance. Les mécanismes sous-jacents la formation des amplicons restent encore à élucider mais les protéines de réparation de l’ADN semblent jouer un rôle majeur dans l’amplification génique. Dans le laboratoire, il a été démontré que l’amplification circulaire reposait essentiellement sur la protéine de réparation de l’ADN RAD51. Cependant, les acteurs impliqués dans la formation d’amplicon linéaire restaient inconnus. Les travaux de cette thèse ont permis de caractériser les fonctions de la protéine MRE11 chez Leishmania, protéine majeur de la réparation de l’ADN par recombinaison homologue, et qui possède une activité de liaison à l’ADN ainsi qu’une activité nucléase. MRE11 semble impliquée dans l’amplification linéaire puisque son inactivation conduit à une diminution du nombre d’amplicons linéaires dans la cellule. De plus, inhiber l’activité nucléase de MRE11 conduit à une augmentation de l’amplification circulaire, suggérant ainsi un rôle prépondérant de cette activité nucléase dans la formation d’amplicons. Cette étude a également permis d’étudier l’implication des protéines de réparation de l’ADN dans le maintien de l’intégrité du génome. Nous avons pu établir un lien entre MRE11 et RAD50, deux protéines agissant au sein d’un même complexe MRN (MRE11-RAD50-NBS1), et l’instabilité génomique. En effet, l’inactivation de MRE11 et RAD50 a conduit à des réarrangements chromosomiques qui semblent être survenus par micro-homologie. Ces travaux ont donc permis de mettre en lumière qu’en l’absence des protéines majeures de la recombinaison homologue, un mécanisme de réparation par micro-homologie indépendant de MRE11 se met en place dans la cellule. De plus, l’inactivation du gène RAD50 dans une souche sauvage s’est révélée impossible alors qu’elle l’était dans une souche préalablement inactivée pour MRE11, suggérant une certaine hiérarchie dans le complexe MRN. Cette thèse présente également l’étude de l’acquisition de mutations ponctuelles dans le gène du transporteur de miltéfosine qui conduit à la résistance des parasites à cette drogue. La technologie de séquençage à profondeur élevée (« deep-sequencing ») nous a permis de séquencer ce gène à différents stades intermédiaires de la résistance, afin de déterminer la fréquence d’acquisition et la stabilité de ces mutations. Nous avons pu observer que les mutations ponctuelles dans le gène du transporteur de miltéfosine ne sont pas présentes dans les premiers stades de la résistance mais acquises à des concentrations plus élevées. L’analyse du gène a également démontré un plus grand nombre de mutations au fur et à mesure que la pression de sélection s’intensifie ainsi qu’une certaine stabilité des mutations après retrait de la pression de drogue, laissant entrevoir un maintien de la résistance. Ces résultats mettent en évidence l’implication des protéines de réparation de l’ADN dans la stabilité génomique chez Leishmania, mais surtout un rôle dans l’amplification extra-chromosomique liée à la résistance. L’utilisation des nouvelles technologies de séquençage nous a également permis d’étudier la dynamique d’acquisition de mutations ponctuelles impliquées dans la résistance.

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Coqueret, Victoire. "How do plants defend themselves? : Study of the Tomato - Tuta absoluta pathosystem in interaction with nitrogen fertilization." Thesis, Université de Lorraine, 2017. http://www.theses.fr/2017LORR0234.

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Abstract:

L’identification des réponses écophysiologiques des plantes est un préalable pour améliorer les défenses naturelles des plantes et réduire l’usage d’intrants chimiques dans les cultures. Les réponses des plantes vis-à-vis d’une agression herbivore fait intervenir des mécanismes de résistance et de tolérance. Les réponses à une agression d’une larve mineuse sont peu documentées contrairement aux insectes piqueurs ou broyeurs. L’objectif de ma thèse a été de caractériser les traits de réponse de la tomate vis-à-vis de Tuta absoluta afin de déterminer les réponses locales et systémiques en termes de composés solubles et volatils. Nous avons regardé les réponses de la tomate soumise à deux niveaux contrastés de la disponibilité en azote, sachant que l’azote est un levier sur lequel il est possible de s’appuyer pour modifier le niveau de défense des plantes. Nous avons travaillé sur la tomate, une solanacée cultivée en hydroponie et sujette à un ravageur Tuta absoluta. Notre stratégie de recherche s’est portée sur l’identification et la quantification des composés de défense solubles et volatils, et sur la détermination du pouvoir nutritionnel des tissus foliaires. Nous avons montré que la plante de tomate met en place une résistance induite par l’herbivore se traduisant par une augmentation de la concentration en acide chlorogénique, caffeoyl putrescine et tomatine localement au niveau de la zone parasitée et / ou de manière systémique dans les autres compartiments foliaires non infestés. Le rôle de ces molécules dans la défense de la tomate vis-à-vis de Tuta absoluta doit encore être confirmé. Nous avons montré aussi que la tomate met en place une défense indirecte contre Tuta absoluta, basée sur l’émission de composés volatils au voisinage des plantes. Nous avons identifié plusieurs nouveaux COVs synthétisés lors de l’herbivorie par Tuta absoluta (m-cymène, menthatriène, ß-cis-ocimène, ß-phellandrène, terpinolène, ß−caryophyllène, humulène). Parmi tous les COVs que nous avons identifiés, certains sont connus pour être émis en plus grande quantité lors d’une attaque herbivore et jouer un rôle dans l’attraction des insectes prédateurs ou la répulsion des femelles pondeuses. Ainsi, leur élicitation semble générique de l’herbivorie et pas spécifique de Tuta absoluta. La spécificité des interactions tomate - Tuta absoluta pourrait être renforcée par des analyses plus poussées en métabolomique, transcriptomique (expression de gènes RNAseq) et en s’intéressant aux voies de signalisation induite. Contrairement à ce qui était attendu, nos résultats montrent peu d’effets de la limitation en azote sur les réponses observées. Néanmoins, comme ce qui a été démontré précédemment, la limitation azotée impacte le développement larvaire. Mes travaux ont permis de renforcer l’hypothèse "trophique" du ralentissement du développement larvaire par la limitation en azote. Ainsi, la stœchiométrie du bol alimentaire est fortement modifiée et les larves doivent consommer plus de matières pour acquérir l’azote nécessaire à leur développement. Néanmoins nous ne pouvons pas écarter l’hypothèse "composés de défense". En effet, nous avons montré que les concentrations en composés phénoliques et tomatine et des émissions de COVs supposés être impliqués dans la défense constitutive, sont plus fortes en cas d’une limitation en azote. La diversité et la complémentarité des expérimentations permettront aux données acquises d’alimenter un modèle de fonctionnement de la plante agressée qui pourrait comporter une fonction de défense réactive à la nutrition azotée The identification of ecophysiological responses of plants is a prerequisite for improving the natural defences of plants and reducing the use of chemical inputs in crops. Plant responses to herbivorous attack involve defence and tolerance mechanisms. Plant responses to a leafminer larva are pourly documented, in contrast to chewing and piercing insects. The objective of my Ph.D. was to characterize the tomato trait responses to Tuta absoluta herbivory in order to determine the local and systemic responses in terms of soluble and volatile compounds. We looked at the responses of tomatoes subjected to two contrasting levels of nitrogen availability, knowing that nitrogen is a lever to promote the basal plant defence level. We worked on tomato, a Solanaceae, grown in hydroponics and subjected to Tuta absoluta. Our research strategy has focused on identifying and quantifying soluble and volatile defence compounds and determining the nutritional value of foliar tissues. We have shown that tomatoes establish an induced- resistance against the herbivore, which results in a concentration increase of chlorogenic acid, caffeoyl putrescine and tomatine locally at the level of the parasite zone and / or systemically in the others non-infested foliar compartments. The defence role of these molecules on Tuta absoluta has yet to be confirmed. We have also shown that tomatoes set up an indirect defence against Tuta absoluta, based on the emission of volatile compounds in the vicinity of plants. We have identified several new herbivore-induced VOCs (m-cymene, menthatriene, ß-cis-ocimene, ß-phellandrene, terpinolene, ß−caryophyllene, humulene). Some of the identified VOCs are known to be emitted in greater quantities during a herbivorous attack and to play a role in attracting predatory insects or repelling egg-laying females. Thus, their elicitation seems generic to herbivory and not specific to Tuta absoluta. The specificity of tomato - Tuta absoluta interactions could be enhanced by further analysis in metabolomics, transcriptomics (expression of RNAseq genes) and by investigating the induced signaling pathways. Contrary to what was expected, our results show little effect of the nitrogen limitation on the observed responses. Nevertheless, as demonstrated previously, nitrogen restriction affects larval development. My work has reinforced the “trophic“ hypothesis of slowing larval development by a limited nitrogen availability. Thus, the stoichiometry of the food bowl is highly modified and the larvae have to consume more material to acquire the nitrogen necessary for their development. Nevertheless, we can not exclude the hypothesis “compounds of defence“. Indeed, we have shown that the concentrations of phenolic compounds and tomatine and of the VOC emission supposed to be involved in the constitutive defence are increased in the case of nitrogen limitation. The diversity and complementarity of the experiments will allow the acquired data to feed a functional model of the attacked plant. This model might include plant nitrogen regimes as a reactive plant defence factor

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Brotherton, Marie-Christine. "Études protéomiques chez le parasite protozoaire Leishmania." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/29748/29748.pdf.

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Petitprez, Michel. "Pouvoir pathogène et épidemiologie de Exserohilum turcicum, parasite du mai͏̈s." Toulouse, INPT, 1989. http://www.theses.fr/1989INPT027A.

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Abstract:

Exserohilum turcicum, parasite foliaire du mais, produit deux types de fractions phytotoxiques. La fraction hydrosoluble contient deux composes (pm300 d) qui reproduisent les symptomes de la maladie et induisent la degradation des cellules du mesophylle et la fermeture des stomates. La fraction soluble dans le chloroforme reduit l'index mitotique des meristemes, perturbe la mise en place du fuseau et altere la structure chromosomique. Au cours de l'infection, le parasite produit des alterations membranaires et la destructuration des chloroplastes. Chez les lignees porteures du gene ht#1, la mort rapide de quelques cellules du mesophylle s'accompagne de l'activation metabolique des cellules voisines (ribosomes, mitochondries). Cette reaction du type hypersensible ralentit le processus necrogene. A partir de quatre souches representatives des isolats du sud-ouest de la france, deux pathotypes se degagent. La race 1, thermophile, est endemique du sud de la france, la race 2 a cause de graves epidemies en maisiculture intensive (landes 1971 et 1982). Un suivi epidemiologique de cette derniere region durant cinq annees consecutives a permis de definir l'evenement contaminant primaire, la duree d'incubation et les pratiques culturales qui modulent l'epidemie. Sous contamination controlee, un protocole de comparaison multilocale de comportement varietal permet d'apprecier les parametres de la tolerance et leur stabilite spatiotemporelle

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Julien, de Zélicourt Axel de. "Les défensines de tournesol : implication dans la résistance à la plante parasite Orobanche cumana et mode d'action." Nantes, 2008. http://www.theses.fr/2008NANT2120.

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Abstract:

La résistance du tournesol LR1 à l'infestation par la plante parasite Orobanche cumana est caractérisée par une surexpression du gène de défensine HaDef1. Les défensines sont de petits peptides basiques antifongiques d'une cinquantaine d'acides aminés. Chez le tournesol, trois gènes de défensines avaient été identifiés jusqu'à présent. Afin de mieux caractériser leur rôle dans la résistance à O. Cumana, une étude moléculaire de cette famille multigénique été entreprise. Ainsi, deux nouveaux gènes ont pu être identifiés et sur les cinq identifiés, trois sont exprimés dans les racines, dont HaDef1, et répondent différemment à des molécules activatrices des voies de défenses des plantes telles que le SA ou le JA. Par contre, seul le gène HaDef1 est très fortement surexprimé en réponse à l'infestation par O. Cumana. Une production du peptide correspondant HaDEF1 en système bactérien a permis d'étudier son activité. A des concentrations micromolaires, la défensine Ha-DEF1 provoque une mort cellulaire à l'apex de la radicule de graines germées d'O. Cumana et O. Ramosa alors qu'elle reste sans effet sur A. Thaliana et Striga hermonthica. Ha-DEF1 est fortement inhibée en présence d'ion calcium, de plus l'AAL toxine, une molécule perturbant la voie de biosynthèse des sphingolipides, provoque les mêmes symptômes que cette défensine. Enfin, Ha-DEF1 provoque une élévation de calcium intracellulaire en activant la voie de l'IP3. Ces résultats ont permis de mettre en évidence pour la première fois, une activité toxique de défensine de plante sur des cellules de plantes et ouvrent de nouvelles perspectives dans la compréhension du mode d'action des défensines The resistance of the LR1 sunflower to the parasitic plant Orobanche cumana is chracaterized by an overexpression of the defensin gene HaDef1. Defensins are small basic antifungal peptides of around 50 amino acids. To date, three genes had been identified in the sunflower. In order to better understand the defensin role in sunflower resistance to O. Cumana, a molecular study was conducted on this small multigenic family. Thus, two new genes were identified and among the five identified, three of them including HaDef1 are expressed in roots but response differently to defence activating molecules like SA or JA. On the other hand, only HaDef1 is highly overexpressed after O. Cumana infestation. A peptide production in an heterologous bacterial system was conducted to study the Ha-DEF1 activity. At micromolar concentrations, Ha-DEF1 induces cell death at the radicle apex of germinated seeds of O. Cumana or O. Ramosa, but has no effect on A. Thaliana or the parasitic plant Striga hermonthica. Ha-DEF1 is strongly inhibited by calcium addition and AAL toxin, a sphingolipid metabolism disruptant, provokes the same symptoms as this defensin. Ha-DEF1 triggers also an intracellular calcium increase by activating the IP3 pathway in orobanche cells which could explain cell death. Theses results highlight for the first time a toxic activity of plant defensins on plant cells and open up new perspectives in the comprehension. Of its mode of action

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Moreira, Wilfried. "Stress oxydatif, différentiation et mort cellulaire chez le parasite Leishmania." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28186/28186.pdf.

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Leprohon, Philippe. "Caractérisation de la famille des protéines ABC et étude transcriptomique de la résistance à l'antimoine chez le parasite protozoaire Leishmania." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25561/25561.pdf.

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Abstract:

Les parasites protozoaires du genre Leishmania sont responsables de différentes pathologies et représentent une cause importante de morbidité et de mortalité au niveau mondial. En absence de vaccins, le contrôle de la leishmaniose repose sur l’administration d’agents chimiothérapeutiques. Les médicaments disponibles sont peu nombreux et la plupart d’entre eux sont associés à des facteurs limitants, comme une toxicité relative à leur administration ou un coût trop élevé pour être utilisés de routine au niveau des zones endémiques les plus pauvres. Les composés à base d’antimoine pentavalent sont utilisés en thérapie depuis plusieurs décennies et demeurent encore aujourd’hui un traitement de première ligne contre les différentes formes de leishmanioses. Cependant, l’augmentation du nombre d’infections réfractaires au traitement, associée à la présence de foyers épidémiques de résistance, amenuisent le potentiel thérapeutique de ces molécules. Les mécanismes impliqués dans la résistance sont partiellement élucidés et ont révélé l’importance de la famille des protéines ATP-binding cassette (ABC) dans la résistance. De plus, l’étude de mutants résistants sélectionnés en laboratoire indique la présence de mécanismes de résistance supplémentaires, pour lesquels les gènes impliqués n’ont pas encore été identifiés. Les objectifs de cette thèse étaient i) de définir la famille des protéines ABC chez Leishmania et d’en effectuer l’analyse phylogénique, pour ensuite ii) étudier l’implication de la sous-famille ABCC dans la résistance à l’antimoine chez ce parasite, et finalement iii) de profiter de la disponibilité de la séquence du génome de Leishmania pour évaluer le profil d’expression génique associé au phénotype de résistance à l’antimoine à l’échelle génomique. L’analyse phylogénique a d’abord permis de démontrer la diversité de la famille des protéines ABC chez Leishmania, qui semble avoir évoluée par des événements de duplication génique suite à la divergence évolutive du parasite. Ensuite, des études de localisation protéique, associées à des expériences de surexpression génique, ont permis de déterminer la localisation intracellulaire de l’ensemble des protéines appartenant à la sous-famille ABCC chez Leishmania et de démontrer l’implication de deux d’entre elles dans la résistance à l’antimoine chez ce parasite. Enfin, une étude transcriptomique a confirmé l’importance du gène MRPA dans la résistance à l’antimoine et a permis d’identifier les mécanismes de recombinaison homologue impliqués dans son amplification chez une souche de L. infantum hautement résistante. Finalement, l’analyse transcriptomique a également révélé la présence de chromosomes aneuploïdes chez différents mutants résistants à l’antimoine, alors que la sélection d’une souche révertante partielle a permis d’observer une bonne corrélation entre les niveaux de résistance et le nombre de copies des chromosomes aneuploïdes. The parasite Leishmania is responsible for considerable morbidity and mortality around the world. No effective vaccine is yet available against this parasite and treatment thus relies on chemotherapy. Few drugs are available and most of them are associated with limitations such as toxicity and high cost. Pentavalent antimonials have been used for decades in the treatment of leishmaniasis and remain the mainstay against all forms of Leishmania infections in most endemic regions. However, the efficacy of these compounds is compromised by the selection of resistant parasites that are now described on a frequent basis in several endemic regions. The mechanisms involved in antimony resistance are partly understood and have pinpointed the role of ATP-binding cassette (ABC) proteins. Moreover, drug resistance studies with different in vitro-selected mutants have suggested the presence of unidentified mechanisms involved in antimony resistance. The objectives of this thesis were i) to define the complete ABC protein family in Leishmania and to analaze their evolution by phylogenetic analyses, ii) to assess the role of the entire ABCC subfamily in antimony resistance, and iii) to take advantage of the availability of the Leishmania genome sequence to study the gene expression profile associated with an antimony resistance phenotype at the genomic level. Phylogenetic analyses revealed the magnitude of the ABC gene family in Leishmania, which seemed to have undergone gene duplication events following the divergence of the Leishmania lineage. Moreover, subcellular localization experiments indicated that the entire ABCC protein subfamily is located to intracellular compartments in Leishmania, and gene overexpression experiments revealed the involvement of two of these proteins in antimony resistance. Finally, a whole-genome transcriptomic study confirmed the involvement of MRPA in antimony resistance and revealed the recombination events associated with its amplification in the highly resistant L. infantum Sb2000.1 mutant. More importantly, the transcriptomic study revealed the presence of aneuploid chromosomes in at least two different antimony-resistant mutants and selection of a partial revertant strain allowed the observation of a good correlation between the antimony resistance levels and the copy number of the aneuploid chromosomes.

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Chapuis, Laurence. "L'eutypiose de la vigne : contribution à l'étude des relations hôte-parasite." Bordeaux 2, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR22002.

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Abstract:

Une étude exploratoire des mécanismes de défense mis en œuvre dans les tissus ligneux pour s'opposer au développement d'Eutypa lata (agent de l'Eutypiose de la vigne) a été réalisée chez quatre cépages de sensibilité différente à la maladie. Il a été montré que la diminution de la réceptivité des plaies de taille, au cours de l'hiver et avec l'âge de la blessure, avait valeur générale, quel que soit le cépage. L'évolution est fortement influencée par les conditions climatiques qui vont agir sur l'installation, la quantité et la diversité de la microflore saprophyte, ainsi que sur la vitesse d'apparition et l'intensité de la réponse de la plante au stress induits par la taille et par la contamination par le parasite. On observe ainsi une formation de thylles, de gommes et de composés phénoliques. Après une étude préalable sur les potentialités enzymatiques d'E. Lata et la mise en évidence d'une différence se situant dans la production de phénoloxydases, le suivi de la dégradation des constituants pariétaux sur le bois mort montre une cinétique différente de dégradation de la lignine dans le couple cépage sensible-cépage résistant. Le mode de dégradation observé au niveau ultrastructural permet de classer E. Lata dans le groupe des champignons de la pourriture molle. Les modifications histochimiques des tissus ligneux de boutures inoculées et de ceps malades montrent une accumulation de composés phénoliques en avant de la nécrose, qui subissent ensuite une modification dans la nécrose. L'analyse quantitative et qualitative des composés phénoliques du bois situé en avant de la nécrose montre une accumulation des composés phénoliques préexistants dans le bois sain. Des différences apparaissent pour certains composés, ce qui pourrait être mis en relation avec la sensibilité des cépages. Par ailleurs, le pouvoir inhibiteur des extraits phénoliques du bois en avant de la nécrose est plus important chez les cépages tolérants.

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Aguerre, Sophie. "Résistance génétique aux nématodes gastro-intestinaux chez les ovins : évaluation des stratégies de sélection et de leur impact à l'échelle de l'élevage." Thesis, Toulouse, INPT, 2019. http://www.theses.fr/2019INPT0111.

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Abstract:

Les nématodes gastro-intestinaux constituent une contrainte majeure pour la santé des ruminants élevés au pâturage et sont à l’origine d’importantes pertes de production. Le recours systématique aux anthelminthiques est remis en question depuis plusieurs années du fait du développement de résistance à ces molécules chez les parasites, de leur impact sur l’environnement et des attentes de la société envers les filières d’élevage. Un effort de recherche important est fourni pour trouver des stratégies qui, associées à un usage raisonné des anthelminthiques, permettraient un contrôle durable des nématodes gastro-intestinaux. La sélection génétique d’animaux plus résistants fait partie des plus prometteuses. Cette thèse vise à étudier la mise en oeuvre de cette sélection et à évaluer les impacts qu’elle pourrait avoir sur les autres caractères en sélection et sur les différentes fonctions biologiques de l’animal (croissance, production, reproduction). Un protocole d’infestation expérimentale a été mis au point afin d’évaluer les capacités de résistance des animaux au nématode hématophage Haemonchus contortus grâce à la mesure du nombre d’oeufs de parasite excrétés dans les fèces et de l’hématocrite. Les paramètres génétiques de ces caractères de résistance montrent que la résistance est héritable et qu’une très bonne corrélation existe entre des béliers infestés expérimentalement et des brebis infestées au pâturage en race laitière Manech Tête Rousse. Ces résultats ont permis de valider l’efficacité de l’utilisation de protocoles d’infestation expérimentale dans les schémas de sélection pour prédire la résistance au parasitisme en conditions d’infestations naturelles. La recherche de régions du génome impliquées dans la résistance aux nématodes gastro-intestinaux a permis de conclure à un déterminisme polygénique de ce caractère. Une sélection concomitante pour les caractères laitiers et un faible nombre d’oeufs excrétés dans les fèces est conseillée à l’avenir. Elle est réalisable puisque des corrélations génétiques certes défavorables mais faibles ont été estimées entre le nombre d’oeufs excrétés dans les fèces et les caractères de production laitière. Enfin, l’étude de lignées divergentes sélectionnées en race Romane pour une résistance ou une sensibilité accrue à H. contortus a permis d’évaluer les effets à long terme de la sélection. L’efficacité de la sélection a pu être démontrée chez de jeunes femelles en croissance. Les résultats montrent que cette sélection pourrait être associée chez les animaux résistants à un coût énergétique plus élevé de la réponse immunitaire dans les premières semaines suivant l’infestation. Ce coût énergétique doit encore être estimé à un moment plus tardif par rapport à l’infestation et à d’autres stades physiologiques de l’animal. En conclusion, une sélection pour la résistance au parasitisme efficace peut être mise en place mais des études complémentaires doivent être menées afin d’estimer ses impacts sur le long terme Gastrointestinal nematodes are a major constraint on the health of grazing ruminants and cause significant production losses. The systematic use of anthelmintics has been questioned for several years due to the development of parasite resistance to these molecules, their impact on the environment and consumer concerns about livestock industry. A major research effort is being made to find strategies that, combined with a rational use of anthelmintics, would allow sustainable control of gastrointestinal nematodes. The genetic selection of more resistant animals is one of the most promising. This thesis aims to study the implementation of this selection and to evaluate the impacts it could have on the other traits under selection and on the different biological functions of the animal (growth, production, reproduction). An experimental infestation protocol has been developed to evaluate the resistance capacities of animals to the hematophagus nematode Haemonchus contortus by measuring the number of parasite eggs excreted in the faeces and the hematocrit. The genetic parameters of these parasite resistance traits show that resistance is heritable and that a very good correlation exists between experimentally infested rams and ewes infested on pasture in the Blond-faced Manech dairy breed. These results validated the effectiveness of the use of experimental infestation protocols in selection schemes to predict parasite resistance in natural conditions of infestation. The search for genome regions involved in resistance to gastrointestinal nematodes has revealed a polygenic determinism of this trait. Concomitant selection for milk production traits and low fecal egg counts is recommended in the future. It is feasible since low, although unfavourable, genetic correlations have been estimated between the number of eggs excreted in faeces and milk production traits. Finally, the long-term effects of the selection were evaluated in a study involving divergent lines selected in Romane breed for increased resistance or sensitivity to H. contortus. The effectiveness of the selection has been demonstrated in young growing females. The results showed that this selection could be associated with a higher energy cost of the immune response in resistant animals during the first weeks after infestation. But we have to evaluate this energy cost at a later time post infestation and for different physiological status of the animal. In conclusion, a selection for effective parasite resistance can be put in place but additional studies must be carried out in order to estimate its long-term impacts

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Tey-Rulh, Patricia. "Métabolites toxiques secrètes in vitro par Eutypa lata (Pers. : Fr. ) tul. : parasite de la vigne : isolement et activité biologique." Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT019A.

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Abstract:

En vue de selectionner des clones resistants a l'eutypiose a partir d'un cultivar tres sensible (cabernet-sauvignon), on met au point des essais biologiques permettant de tester rapidement l'activite toxique de composes purifies ou d'extraits. Eutypa lata produit une famille de composes acetyleniques (vinylacetylene aromatique) parmi lesquels l'hydroxy-4-methyl-3-benzaldehyde est le plus toxique. Elle modifie la permeabilite membranaire des cellules de vigne et l'activite respiratoire des varietes resistantes et sensibles

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Gauthier, Mathieu. "Etude et caractérisation des mécanismes de résistance de Brassica napus (colza, Brassicaceae) vis-à-vis de la plante parasite Phelipanche ramosa (L. ) Pomel (Orobanchaceae)." Nantes, 2012. http://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show.action?id=eccc5cb9-1665-449d-ba79-cd8e9ba06f72.

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Abstract:

Depuis une quinzaine d'années, la plante parasite, Phelipanche ramosa, est en pleine expansion dans les champs de colza d'hiver en France. Plusieurs génotypes de colza ont montré au champ des comportements contrastés vis-à-vis de ce pathogène, suggérant qu'une variabilité génétique était disponible pour des programmes de sélection. Dix génotypes sélectionnés pour leur réponse contrastée ont été analysés en co-cultures hydroponiques et en serres afin de déterminer les composantes de cette résistance. Si aucune résistance totale n'a pu être identifiée, des caractères de résistance partielle ont été mis en évidence : un faible taux d'induction de la germination des graines du parasite par les racines de l'hôte, une limitation du nombre de tubercules fixés sur le système racinaire, et le déclenchement d'un retard de développement, voire une perturbation de la croissance des orobanches fixées, minimisant et retardant l'émergence du sol du parasite. La possible induction de mécanismes de résistance du colza par un SDN (BTH) a aussi été étudiée afin de mettre en évidence des voies de défense induites dans les racines, suite à un traitement foliaire. La cDNA-AFLP réalisée a révélé que le signal BTH appliqué sur les feuilles n'induit pas de réponse transcriptomique dans les racines de colza. En revanche, par application directe sur les racines, le BTH induit l'expression de PR-1, un gène marqueur de la voie signalisation du SA, et provoque une diminution du nombre de fixations d'orobanche. De même, un autre SDN, la laminarine extraite de l'algue Laminaria digitata, induit une diminution du nombre de fixations d'orobanche suite à un traitement du sol mais pas par pulvérisation foliaire Over the past decade, Phelipanche ramosa, a weedy parasitic plant (broomrape), has been increasingly infesting winter oilseed rape fields in France. Elite lines have shown different responses in P. Ramosa infested fields, suggesting that genetic variability might be available for breeding programmes. Ten WOSR genotypes selected for their contrasting response in field experiments were analysed using hydroponic and greenhouse co-culture experiments to determine the components of resistance. While no total resistance was identified, some partial resistance mechanisms were observed : a low induction of P. Ramosa seed germination by host roots, a limitation of parasite attachments on root systems, and the induction of a delayed or even disturbed growth of tubercles, minimising and delaying parasite emergence from the soil. The possible induction of resistance mechanisms in oilseed rape by BTH, an elicitor of natural plant defences, was also studied in order to identify defence pathways induced in roots upon leaf treatment. The cDNA-AFLP expriment revealed that BTH signal applied on leaves did not induce a transcriptomic response in oilseed rape roots. However, BTH, directly applied on roots, induced the expression of PR1, a gene marker of the SA signalling pathway, and prevented P. Ramosa attachments. Similarly, another elicitor compound, the laminarin extracted from the algae Laminaria digitata, induced a reduction of broomrape attachments when applied by soil drench but not by leaf spray

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Dwivedi, Ankit. "Functional analysis of genomic variations associated with emerging artemisinin resistant P. falciparum parasite populations and human infecting piroplasmida B. microti." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT073/document.

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Abstract:

Le programme d’élimination du paludisme de l’OMS est menacé par l’émergence etla propagation potentielle de parasites de l’espèce Plasmodium falciparum résistants à l’artémisinine. Récemment il a été montré que (a) des SNPs dans une région du chromosome 13 subissaient une forte sélection positive récente au Cambodge,(b) plusieurs sous-populations de parasites de P. falciparum résistants et sensibles à l’artémisinine étaient présentes au Cambodge, (c) des mutations dans le domaine Kelch du gène k13 sont des déterminants majeurs de la résistance à l’artémisinine dans la population parasitaire cambodgien et (d) des parasites de sous-populations du nord du Cambodge près de la Thaïlande et du Laos sont résistants à la méfloquine et portent l’allèle R539T du gène de k13.Il est donc nécessaire d’identifier la base génétique de la résistance dans le but de surveiller et de contrôler la transmission de parasites résistants au reste du monde, pour comprendre le métabolisme des parasites et pour le développement de nouveaux médicaments. Ce travail a porté sur la caractérisation de la structure de la population de P. falciparum au Cambodge et la description des propriétés métaboliques des sous-populations présentes ainsi que des flux de gènes entre ces sous-populations. Le but est d’identifier les bases génétiques associées à la transmission et l’acquisition de résistance à l’artémisinine dans le pays.La première approche par code-barre a été développée pour identifier des sous-populations à l’aide d’un petit nombre de loci. Une approche moléculaire de PCR-LDR-FMA multiplexée et basée sur la technologie LUMINEX a été mise au point pour identifier les SNP dans 537 échantillons de sang (2010 - 2011) provenant de 16centres de santé au Cambodge. La présence de sous-populations le long des frontières du pays a été établie grâce à l’analyse de 282 échantillons. Les flux de gènes ont été décrits à partir des 11 loci du code-barre. Le code-barre permet d’identifier les sous-populations de parasites associées à la résistance à l’artémisinine et à la méfloquine qui ont émergé récemment.La seconde approche de caractérisation de la structure de la population de P.falciparum au Cambodge a été définie sur la base de l’analyse de 167 génomes de parasites (données NGS de 2008 à 2011) provenant de quatre localités au Cambodge et récupérés à partir de la base de données ENA. Huit sous-populations de parasites ont pu être décrites à partir d’un jeu de 21257 SNPs caractérisés dans cette étude. La présence de sous-populations mixtes de parasite apparait comme un risque majeur pour la transmission de la résistance à l’artémisinine. L’analyse fonctionnelle montre qu’il existe un fond génétique commun aux isolats dans les populations résistantes et a confirmé l’importance de la voie PI3K dans l’acquisition de la résistance en aidant le parasite à rester sous forme de stade anneau.Nos résultats remettent en question l’origine et la persistance des sous-populations de P. falciparum au Cambodge, fournissent des preuves de flux génétique entre les sous-populations et décrivent un modèle d’acquisition de résistance à l’artémisinine.Le processus d’identification des SNPs fiables a été ensuite appliqué au génome de Babesia microti. Ce parasite est responsable de la babésiose humain (un syndrome de type malaria) et est endémique dans le nord-est des Etats-Unis. L’objectif était de valider la position taxonomique de B. microti en tant que groupe externe aux piroplasmes et d’améliorer l’annotation fonctionnelle du génome en incluant la variabilité génétique, l’expression des gènes et la capacité antigénique des protéines. Nous avons ainsi identifié de nouvelles protéines impliquées dans les interactions hôte-parasite The undergoing WHO Malaria elimination program is threatened by the emergenceand potential spread of the Plasmodium falciparum artemisinin resistant parasite.Recent reports have shown (a) SNPs in region of chromosome 13 to be understrong recent positive selection in Cambodia, (b) presence of P. falciparum parasiteresistant and sensitive subpopulations in Cambodia, (c) the evidence that mutationsin the Kelch propeller domain of the k13 gene are major determinants ofartemisinin resistance in Cambodian parasite population and (d) parasite subpopulations in Northern Cambodia near Thailand and Laos with mefloquine drugresistance and carrying R539T allele of the k13 gene.Identifying the genetic basis of resistance is important to monitor and control thetransmission of resistant parasites and to understand parasite metabolism for the development of new drugs. This thesis focuses on analysis of P. falciparum population structure in Cambodia and description of metabolic properties of these subpopulations and gene flow among them. This could help in identifying the genetic evidence associated to transmission and acquisition of artemisinin resistance over the country.First, a barcode approach was used to identify parasite subpopulations using smallnumber of loci. A mid-throughput PCR-LDR-FMA approach based on LUMINEXtechnology was used to screen for SNPs in 537 blood samples (2010 - 2011) from 16health centres in Cambodia. Based on successful typing of 282 samples, subpopulations were characterized along the borders of the country. Gene flow was described based on the gradient of alleles at the 11 loci in the barcode. The barcode successfully identifies recently emerging parasite subpopulations associated to artemisinin and mefloquine resistance.In the second approach, the parasite population structure was defined based on167 parasite NGS genomes (2008 - 2011) originating from four locations in Cambodia,recovered from the ENA database. Based on calling of 21257 SNPs, eight parasite subpopulations were described. Presence of admixture parasite subpopulation couldbe supporting artemisinin resistance transmission. Functional analysis based on significant genes validated similar background for resistant isolates and revealed PI3K pathway in resistant populations supporting acquisition of resistance by assisting the parasite in ring stage form.Our findings question the origin and the persistence of the P. falciparum subpopulations in Cambodia, provide evidence of gene flow among subpopulations anddescribe a model of artemisinin resistance acquisition.The variant calling approach was also implemented on the Babesia microti genome.This is a malaria like syndrome, and is endemic in the North-Eastern USA. Theobjective was to validate the taxonomic position of B. microti as out-group amongpiroplasmida and improve the functional genome annotation based on genetic variation, gene expression and protein antigenicity. We identified new proteins involved in parasite host interactions

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Delamasure, Servane. "Activation et signalisation de la réponse immunitaire innée chez la drosophile : Rôle des recepteurs Toll." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2003/DELAMASURE_Servane_2003.pdf.

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Ceriac, Steve. "Impacts des interactions entre le statut nutritionnel et parasitisme gastro-intestinal sur les réponses animales chez les petits ruminants." Thesis, Antilles, 2018. http://www.theses.fr/2018ANTI0284/document.

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Abstract:

Les infestations par les strongles gastro-intestinaux (SGI) constituent une cause majeure de morbidité et de mortalité chez les petits ruminants élevés au pâturage et entraînent donc des pertes de production. En raison de l'émergence de la résistance aux anthelminthiques et des préoccupations des consommateurs concernant les résidus chimiques dans les produits animaux, des stratégies alternatives de contrôle sont nécessaires. L'objectif n'est plus l'éradication totale de la population parasitaire, mais plutôt un meilleur contrôle de ces populations pour atteindre un équilibre favorable à la production animale entre l'hôte et les parasites. Une stratégie prometteuse pour le contrôle des SGI est l'amélioration de la réponse de l'hôte par le statut nutritionnel des animaux. Bien que les chèvres soient plus sensibles que les moutons aux infestations par les NGI, la plupart des programmes de recherche visant à caractériser les interactions hôtes-NGI est menée chez les ovins. Contrairement à l’idée que les résultats acquis chez le mouton seraient applicables aux chèvres du fait de leur proximité, de nombreuses études soulignent des différences significatives entre ces modèles. L’objectif de ce travail de thèse était d’étudier l’impact du statut nutritionnel en termes de quantité de protéines et d’énergie et de la qualité des protéines apportée par la ration sur les réponses (production vs réponse contre le parasitisme) de caprins Créole infestés expérimentalement par Haemonchus contortus. Nous avons montré que le statut nutritionnel permettait de réduire la sévérité et la durée de l’anémie régénérative et de la thrombopénie induite par H. contortus chez le caprin Créole. La ration enrichie en protéines était associée à de la résilience vis-à-vis de l’infestation plutôt que de la résistance Gastrointestinal nematode (GIN) infections are a major cause of morbidity and mortality in small ruminants at pasture and therefore lead to production losses. Due to the emergence of anthelmintic resistance and consumer concerns about chemical residues in animal products, alternative control strategies are needed. The objective is no longer the total eradication of the parasite population, but rather a better control of these populations to achieve a favorable balance between the host and the parasites to improve animal production. A promising strategy for NGI control is to improve the host response through the nutritional status of the animals. Although goats are more susceptible than sheep to NGI infestations, most research programs to characterize host-NGI interactions are conducted in sheep. In contrast with the idea that the results obtained in sheep will be applicable to goats because of their proximity, many studies highlight significant differences between these models. The objective of this research project was to study the impact of nutritional status in terms of protein and energy quantity and protein quality provided by the diet on the responses (production vs response against parasitism) of Creole goats experimentally infested by Haemonchus contortus. We have shown that nutritional status reduces the severity and duration of regenerative anemia and H. contortus-induced thrombocytopenia in Creole goats. The protein-enriched diet was associated with resilience to infection rather than resistance

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Renault, Patricia. "Méthodes de réduction de réseaux RC appliquées aux outils de vérification de circuits submicroniques." Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066579.

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Li, Hua. "Etude de la relation entre le mildiou de la vigne (Plasmopara viticola (B. Et C) Berl. Et de Toni) et l'espèce Vitis vinifera L. : variabilité de l'agent pathogène et de la sensibilité de l'hôte." Bordeaux 2, 1985. http://www.theses.fr/1985BOR20007.

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Manga, Bella. "Etude de la diversité de "Colletotrichum kahawae" responsable de l'anthracnose des baies et caractérisation de la résistance du caféier Arabica à cet agent pathogène." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20088.

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Abstract:

Colletotrichum kahawae, agent pathogene responsable de l'anthracnose des baies du cafeier arabica (coffea arabica l. ) est un fleau economiquement important pour les pays producteurs. Actuellement limitee au seul continent africain, cette maladie constitue une grave menace pour les grandes zones de production d'amerique latine. La diversite genetique des populations pathogenes des pays d'afrique de l'est et du cameroun a ete evaluee par determination des groupes de compatibilite vegetative (gcv) et a l'aide des marqueurs rapd (random amplified polymorphic dna). La caracterisation des relations hote/parasite a ete realisee a l'aide d'inoculations artificielles sur hypocotyles de semenceaux deracines et sur baies vertes detachees de cafeiers arabica. A une exception pres, tous les isolats de c. Kahawae etudies appartiennent au meme gcv. Les caracteristiques des heterocaryons sub-divisent ce groupe en deux sous groupes geographiques : les isolats provenant d'afrique de l'est d'une part et les isolats provenant du cameroun d'autre part. L'analyse de la distribution des marqueurs rapd confirme l'existence d'une differenciation genetique entre ces deux populations geographiques. Une faible diversite genetique a ete detectee dans chacune d'elles. Des tests de pathogenie realises avec les differents isolats etudies n'ont pas mis en evidence de reactions specifiques de resistance. Toutefois, differents niveaux d'agressivite entre les isolats et differents niveaux de resistance entre les genotypes ont ete observes. La resistance du cafeier arabica semble de nature non specifique et quantitative. Les resultats obtenus avec les tests sur baies vertes detachees et sur hypocotyles de semenceaux deracines classent la majorite des genotypes sensibles. Les resultats obtenus avec le test sur hypocotyles lors des evaluations des genotypes du cameroun vis-a-vis des isolats du cameroun se sont montres reproductibles. Toutefois, il n'a pas ete possible d'etablir des correlations entre les resultats obtenus par inoculations artificielles et les resultats disponibles du comportement des arbres au champ. Cependant, des genotypes presentant des caracteres de resistance vis a vis des trois methodes d'evaluations ont ete identifies et peuvent etre retenus comme des geniteurs resistants a l'anthracnose des baies.

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Mac-Daniel, Laura. "Etude immunobiologique de la phase cutanéo-ganglionnaire du paludisme murin." Paris 7, 2013. http://www.theses.fr/2013PA077290.

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Abstract:

Le paludisme est une des maladies infectieuses les plus meurtrières au monde, étant responsable de près de 700. 000 morts par an. L'infection par Plasmodium, l'agent causal de la maladie, débute avec la phase pré-érythrocytaire (PE), au cours de laquelle la forme sporozoïte déposée dans la peau de l'hôte par le moustique rejoint le foie via la circulation sanguine avant d'initier une différenciation intra-hépatocytaire dans la forme qui infectera les globules rouges et causera les symptômes de la maladie. Les stades PE de Plasmodium représentent une cible privilégiée en matière de vaccination anti-palustre. A ce jour, les vaccins vivants atténués dirigés contre ces stades ont démontré leur supériorité en terme d'efficacité protectrice à la fois chez le rongeur et chez l'homme. Avec la description récente d'une nouvelle étape cutanéo-ganglionnaire, notre vision de la phase PE a complètement changé, en particulier si l'on se place dans un contexte vaccinal d'immunisation dans la peau. Si la plupart des études se sont essentiellement concentrées sur la caractérisation des effecteurs impliqués dans l'établissement d'une réponse protectrice efficace après immunisation par voie intraveineuse, peu d'éléments sont disponibles sur le devenir parasitaire après immunisation intradermique, notamment en terme d'interactions avec le système immunitaire inné. Par ailleurs, la capacité du parasite à initier un développement intracellulaire dans la peau et à rejoindre le ganglion lymphatique drainant par sa propre mobilité pose la question de l'importance des différentes formes antigéniques parasitaires dans l'initiation de la réponse protectrice au niveau du ganglion. Mon travail de thèse a consisté à disséquer les étapes précoces de la mise en place d'une immunité protectrice efficace en conditions d'immunisation par voie intradermique utilisant le modèle des sporozoïtes irradiés. A l'échelle tissulaire, le parasite irradié cible les mêmes tissus que le parasite sauvage, avec un développement arrêté dans la peau, tout comme au niveau du foie. A l'échelle cellulaire, l'inoculation d'un nombre significatif de sporozoïtes dans la peau induit une réponse inflammatoire importante au niveau de la sphère cutanéo-ganglionnaire, caractérisée par un recrutement de polynucléaires neutrophiles et de monocytes inflammatoires. Cette inflammation est corrélée à une élimination locale préférentielle des parasites et associée à une polarisation Thl de la réponse immune au niveau du ganglion lymphatique drainant. Dans les deux tissus, le parasiteM interagit préférentiellement avec les polynucléaires neutrophiles recrutés et avec les populations de cellules myéloïdes résidentes. In vitro, nous avons confirmé la capacité du parasite à envahir activement des cellules phagocytaires et avons mis en évidence pour la première fois sa capacité à se maintenir dans la peau au sein de cellules myéloïdes. Nous avons par la suite évalué l'importance des formes antigéniques parasitaires cutanées dans l'initiation de la réponse protectrice. Dans ce cadre, nous avons mis au point un protocole d'immunisation par voie intradermique efficace ainsi qu'une méthode d'évaluation de cette réponse via l'imagerie par bioluminescence. Nous avons démontré que les antigènes dérivés des formes sporozoïtes rejoignant le ganglion lymphatique drainant par leur propre mobilité jouent un rôle prédominant dans l'initiation de cette réponse comparativement au réservoir antigénique cutané Malaria is one of the most deadly infectious diseases in the world, being responsible for nearly 700,000 deaths per year. The infection by Plasmodium, the causal agent of the disease, begins with the pre-erythrocytic (PE) phase, during which the sporozoite deposited in the skin by the mosquito reaches the liver via the bloodstream where it differentiates into the form that will infect red blood cells and cause the symptoms of the disease. The PE stages of Plasmodium represent a privileged target for anti-malaria vaccination. Indeed, the live attenuated vaccines against these stages have demonstrated their superiority in terms of efficiency of protection in both rodents and humans. The recent description of a new cutaneous-lymph node step has completely changed our vision of the PE phase, in particular in the context of immunisation in the skin. Most studies have concentrated on the characterisation of the effectors implicated in establishing a protective immune response after intravenous immunisation, whereas there is much less information concerning the fate of the parasite after intradermal immunisation, especially the interactions with the innate immune system. Furthermore, the capacity of the parasite to initiate intracellular development in the skin and gain the draining lymph node by its motility poses the question of the importance of the different antigenic forms of the parasite in the initiation of a protective response in the draining lymph nodes. My thesis consisted in dissecting the early steps that lead to a protective immune response via intradermal immunisation with irradiated sporozoites. At the tissue level, the irradiated parasite targets the same tissues as the non-irradiated sporozoites but their development is arrested in the skin and in the liver. At the cellular level, the inoculation of a high number of sporozoites in the skin gives rise to an important inflammatory response in the skin and draining lymph nodes, characterised by the recruitment of polynuclear neutrophils and inflammatory monocytes. This inflammation is correlated with a local elimination of the parasites and is associated with a Thl polarisation of the immune response in the draining lymph node. In both tissues, the parasite interacts preferentially with recruited polymorphonuclear neutrophils and the resident myeloid cells. In vitro, we have confirmed that the parasite can actively invade phagocytic cells and have shown for the first time that it can remain in the skin within myeloid cells. We next evaluated the importance of the antigens of these skin parasites in the initiation of a protective immune response. In this context, we established an efficient protocol for intradermal immunisation and its evaluation using bioluminescence imaging. We have shown that the antigens derived from the motile sporozoites that gain access to the draining lymph node play a predominant role in the initiation of this response compared to the cutaneous antigenic reservoir

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Maillot, Gaétan. "Étude d’effecteurs de l’oomycète pathogène Phytophthora capsici exprimés au cours de l’interaction avec le piment et la tomate." Thesis, Avignon, 2018. http://www.theses.fr/2018AVIG0350.

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Abstract:

Les plantes ont développé des mécanismes de défense complexes pour se prémunir de l’attaque des agents pathogènes. Ces mécanismes conduisent à des résistances pouvant être partielles ou totales.Les agents pathogènes codent des effecteurs de pathogénicité qui perturbent ces mécanismes et permettent ainsi leur développement au sein de la plante. Les effecteurs sont des protéines diverses,souvent à évolution rapide et à l’origine du contournement des résistances. Les approches de pathogénomiques, telles que les études transcriptomiques et les criblages à haut-débit de plantes par des effecteurs, renseignent sur les fonctions assurées par les effecteurs et leur rôle dans le contournement des résistances. Les résistances quantitatives sont supposées être plus durables,même si des évènements de contournement ont été décrits dans la littérature. Cette thèse, centrée sur l’étude des effecteurs de Phytophthora capsici vis-à-vis du piment (Capsicum annuum) et de la tomate (Solanum lycopersicum), s’articule autour de 3 chapitres de résultats. Le Chapitre I traite des effets du génotype de l’hôte sur les mécanismes moléculaires déployés par Phytophthora capsici. J’ai comparé les profils transcriptomiques de deux isolats de P. capsici, contrastés par leur niveau d’agressivité sur le piment, pendant leur interaction avec deux génotypes de piment, contrastés par leur niveau de résistance. Ces comparaisons ont révélé des différentiels d’expression pour des gènes associés au transport et au métabolisme et pour des gènes codant des effecteurs. Dans le Chapitre II,l’activité d’avirulence des effecteurs cytoplasmiques détectés différentiellement exprimés dans le chapitre précédent a été testée. Le criblage des effecteurs via un pipeline d’expression transitoire in planta a révélé le lien entre les différences d’expression et leur capacité à induire les réponses immunitaires des plantes. Le Chapitre III s’intéresse à l’analyse de la diversité des effecteurs. J’ai utilisé des données transcriptomiques issues du séquençage d’ARN de 33 isolats, provenant de différentes régions géographiques et collectés sur différents hôtes, prélevés à 24 et 72 heures après infection d’un génotype de tomate sensible. Les effecteurs montrent des niveaux élevés de diversité mais les isolats ne se structurent pas significativement selon l’hôte sur lequel ils ont été collectés.Cette étude transcriptomique a révélé 53 effecteurs « core » exprimés. Les résultats obtenus au cours de ce travail de thèse permettent d’approfondir notre connaissance de l’interaction entre P.capsici et le piment ou la tomate, et fournissent des outils aux sélectionneurs pour développer des résistances plus durables Plants have developed complex defense mechanisms against pathogens, providing partial to total resistance. Nonetheless, some pathogens effector genes disrupt these mechanisms and help breaking down plant host defenses. Effectors are diverse proteins, with diverse range of evolution constraints. Pathogenomic approaches, such as transcriptomic studies and high-throughput screens of plant resistance factors by effectors, provide information on the effectors molecular functions and their role during the interaction in planta. Quantitative resistances are supposed to be more durable, even though some of them have been overcome by pathogens. This PhD is focused on effectors of Phytophthora capsici deployed during its interaction with pepper (Capsicum annuum) and tomato (Solanum lycopersicum). In Chapter I, I analysed the impact of the plant host genotype on the molecular mechanisms deployed by P. capsici when interacting with pepper, comparing two pathogen’s aggressiveness level and two plant resistance levels. These comparisons revealed differentials expression of genes associated with transport, metabolism and genes encoding pathogenicity effectors. In Chapter II, the avirulence activity of the differentially expressed cytoplasmic effectors was tested. The screening of pepper accessions with in planta transient expression assays revealed a link between expression differences and the ability of the effector to induce the pepper immune responses. Chapter III is focused on analysing effectors polymorphism within 33 isolates P. capsici isolates collected on different hosts and from different geographic regions, using RNA Seq samples at 24 and 72 hours post infection of a susceptible tomato genotype. Effectors showed high levels of diversity, with no correlation between polymorphism and the host on which they were collected. Some expression changes were observed between isolates collected on different hosts or in different geographic regions. Altogether, these results revealed 53 "core" effectors, bringing new insight into P. capsici and pepper/tomato interaction, and providing tools toward durable resistance breeding

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Ponte, Costa Sónia Catarina Da. "Etude de l'interaction des bactéries du genre Photorhabdus avec les cellules du système immunitaire." Montpellier 2, 2008. http://www.theses.fr/2008MON20197.

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Abstract:

Les entérobactéries du genre Photorhabdus sont pathogènes pour les insectes et récemment ont été décrites des souches cliniques de l'espèce P. Asymbiotica, isolées aux États-Unis et en Australie. Nous nous sommes consacrés à l'étude de certains mécanismes de virulence utilisés par Photorhabdus. Le génome de P. Luminescens subsp laumondii, souche TT01, présente un locus qui code pour un système de sécrétion de type trois et un effecteur, LopT. Nous avons étudié un nouvel effecteur de P. Luminescens, homologue de LopT et appelé LopT2, mais codée sur un prophage défectif. Comme LopT, LopT2 présente une activité de cysteine protéase dont les cibles sont les protéines de la famille des Rho GTPases. LopT2 est produit in vivo spécifiquement dans des organes de défense, ce qui suggère qu'il joue un rôle essentiel dans l'inhibition des réactions de défense immunitaire de l'insecte. Pour ce qui concerne P. Asymbiotica, notre travail montre, pour la première fois, qu'il s'agit d'une bactérie à croissance intracellulaire facultative. Les souches américaines sont faiblement internalisées par les macrophages THP-1 tandis que les souches australiennes pénètrent facilement dans les THP-1 aussi bien que dans des cellules non phagocytaires (HeLa). En plus, seules les souches australiennes induisent une forte et rapide apoptose des cellules du systeme immunitaire d'insectes et de mammifères. Nous montrons que la plus grande virulence des souches australiennes vis-à-vis de cellules in vitro, peut être corrélée à la plus grande gravité des cas cliniques enrégistrés en Australie par rapport aux Etats-Unis As enterobactérias do género Photorhabdus são patogénicas para os insectos e recentemente foram descritas estirpes clínicas da espécies P. Asymbiotica isoladas nos Estados Unidos da América e na Austrália. Consagramo-nos ao estudo de alguns mecanismos de virulência utilizados por Photorhabdus. O genoma P. Luminescens subsp laumondii, estirpe TT01, apresenta um locus que codifica para o sistema de secreção do tipo três e um efector, LopT. Estudamos um novo efector de virulência de P. Luminescens, homólogo de LopT e designado LopT2, mas codificado sobre um vestígio de prófago. Como LopT, LopT2 apresenta uma actividade protease de cisteína, tendo como alvo as proteínas da família das Rho GTPases. LopT2 é produzido in vivo especificamente em órgãos de defesa, sugerindo que este factor de virulência desempenha um papel essencial na inibição das reacções de defesa imunitárias do insecto. Em relação a P. Asymbiotica, o nosso trabalho mostra, pela primeira vez, que se trata de uma bactéria de crescimento intracelular facultativa. As estirpes americanas são fracamente interiorizadas pelos macrófagos THP-1, enquanto que as estirpes australianas penetram facilmente em THP-1 bem como em células não fagocitárias (HeLa). Além disso, apenas as estirpes australianas induzem uma rápida e forte apoptose das células do sistema imunitário de insectos e de mamíferos. Mostramos que a maior virulência das estirpes australianas em relação às células, in vivo, pode estar correlacionada com a maior gravidade dos casos clínicos detectados na Australia, relativamente aos Estados Unidos da América

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Missoh, Claudia. "Division of labor in anti-parasite defense strategies in ant colonies." Thesis, Paris 6, 2014. http://www.theses.fr/2014PA066450/document.

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Abstract:

La division du travail est une caractéristique clé chez les insectes sociaux et contribue à leur succès écologique. En ce qui concerne les tâches sanitaires, la division du travail au sein d’une colonie peut permettre de réduire la transmission des maladies, de libérer certaines ouvrières pour d’autres tâches, permettant de diminuer les couts associés à l’exécution des tâches sanitaires (sur le plan comportementale et physiologique). Les facteurs externes et internes aux individus déterminant leur participation aux tâches sanitaires ne sont pas bien connus. La plupart des études portent sur l’importance des différences génétiques entre ouvrières. Dans les deux premières études, j’ai examiné le rôle de l’expérience des individus (par exposition répétée à des déchets sanitaires ou à l’exécution d’une tâche) sur la mise en place de différences interindividuelles dans l’exécution d’une tâche sanitaire comportementale. L’exposition à un parasite est une menace fréquente au sein de colonies d’insectes sociaux. En utilisant la fourmi clonale Platythyrea punctata, j’ai voulu savoir si une exposition répétée des individus à des larves portant une faible quantité de conidiospores du champignon Metarhizium robertsii affectait la performance des soins sanitaires portés au couvain. J’ai trouvé que la durée de nettoyage des larves était plus élevée chez des fourmis entrainées, aux larves exposées ou non exposées au champignon, que chez des fourmis inexpérimentées. Un temps de nettoyage plus élevé améliorait l’élimination des conidiospores. Ainsi les fourmis entrainées pourraient être plus efficaces pour éliminer les conidiospores lors d’une attaque parasitaire de la colonie. La décomposition des cadavres représente un risque sanitaire dans les colonies d’insectes sociaux, nécessitant une gestion de cadavres. Dans la deuxième étude, j’ai étudié la possibilité d’une division du travail dans la gestion des cadavres (c'est-à-dire le nettoyage et le transport) chez les ouvrières de la fourmi polygyne et polymorphe Cataglyphis velox. J’ai plus spécifiquement testé si la propensité d’accomplir ces tâches était en rapport avec une récente expérience individuelle ou avec la taille des ouvrières. Nos observations ont montré que la majorité des individus de la colonie n’effectuait que rarement des tâches de gestion de cadavres même si quelques individus pouvaient être impliqués plus fréquemment, au moins sur un laps de temps cours, dans l’exécution de ces tâches. Les résultats suggèrent une faible division du travail dans le nettoyage et le transport des cadavres et une faible modulation de ces tâches par l’exposition répétée des ouvrières à des cadavres Division of labor is a key characteristic of social insects and contributes to their ecological success. Especially in disease defense, the intra-colony partitioning of sanitary work can reduce disease transmission, keep nestmates available for other tasks and reduce costs associated with sanitary task performance (i.e. at the behavioral and physiological level). Factors internal and external to the individual affecting sanitary task allocation are not well known and most studies investigated genetic differences between workers performing behavioral sanitary work. In the first two studies I addressed whether individual experience (through repeated exposure to a sanitary hazard or performance of the task) can generate interindividual differences in the performance of behavioral sanitary tasks. Repeated parasite exposure is a common threat in colonies of social insects, posing selection pressures on colony members to respond with improved disease-defense performance. In the clonal ant Platythyrea punctata, I tested whether experience gained by repeated tending of low-level fungus-exposed (Metarhizium robertsii) larvae alters the performance of sanitary brood care. I found that ants trained both with sham- and fungus-treated larvae groomed the brood longer than naive ants. Increased grooming of fungus-treated larvae resulted in more effective fungal removal, thus making trained ants better caretakers under parasite attack of the colony. Decomposing cadavers pose a sanitary risk to social insect colonies, necessitating cadaver management. In the second study I investigated whether cadaver management (i.e. cadaver grooming and transports) is divided among workers and task allocation affected by recent individual experience or worker size in the polymorphic and polygynous ant Cataglyphis velox. Many individuals performed cadaver management infrequently and few individuals dominated task performance. Our results suggested low division of labor for cadaver grooming and transport and a reduced modulation of these behaviors by recurrent exposure to nestmate cadavers

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Boëte, Christophe. "Ecologie évolutive de la réponse de mélanisation chez le moustique Aedes aegypti et utilisation des moustiques génétiquement modifiés pour le contrôle du paludisme." Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066028.

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Baron, Olga. "Functional analysis of lipopolysaccharide binding proteins/Bactericidal permeability increasing proteins in immune responses of the freshwater snail, Biomphalaria glabrata." Thesis, Strasbourg, 2012. http://www.theses.fr/2012STRAJ016.

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Abstract:

Les LBP/BPIs sont des protéines importantes de la réponse antimicrobienne des mammifères, encore mal caractérisées chez les invertébrés. L'objectif de ce projet était d'élucider le rôle des LBP/BPIs dans la réponse immunitaire du gastéropode B. glabrata. Nous avons montré que l'une des LBP/BPI (BgLBP/BPI1) était une protéine majeure de la glande albumène et des masses d'oeufs et possédait les activités attendues des BPIs telle que la capacité de perméabilisation des bactéries.De plus, nous avons découvert une nouvelle activité biocide (anti-oomycète) inconnue jusqu'alors chez les LBP/BPI, et démontré que BgLBP/BPI1 influence à la fois la production d'oeufs et leur protection contre les infections à oomycètes. Nous avons ensuite examiné la diversité et l'évolution des BgLBP/BPIs et montré qu'au moins 5 LBP/BPIs, regroupées en 3 clades phylogénétiques, étaient exprimées chez B. glabrata. Une étude de l'expression de représentants de ces 3 clades a montré qu'ils étaient exprimés dans différents tissus, appuyant l'hypothèse de l'acquisition de spécificités fonctionnelles par les membres de cette famille multigénique LBP/BPIs are important immune factors of the mammalian antimicrobial response,poorly characterized in invertebrates. The aim of this work was to elucidate the role of LBP/BPIs in the immune response of the fresh-water snail B. glabrata. Firstly, we showed that one member, BgLBP/BPI1, was highly abundant in the albumen gland and the egg masses. Importantly, in addition to the expected activities of BPIs, such as the induction of bacterial permeability, we discovered a novel biocidal (antioomycete) activity that was unsuspected so far. We demonstrated that BgLBP/BPI1 is a major fitness-related protein, acting on both egg production and offspring protection against oomycete infections. Then, we investigated the sequence diversity and evolution of this LBP/BPI protein family and showed that at least 5 LBP/BPIs were expressed in B. glabrata, belonging to three distinct phylogenetic clades. Expression studies of representatives of the three clades showed that they are expressed in different tissues, differently regulated, and therefore supported the hypothesis of the acquisition of functional specificities by the members of this multigenic family

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Dissertations / Theses on the topic 'Résistance aux parasites'

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