Relevant bibliographies by topics / Résonance magnétique nucléaire fonctionnelle RMNf / Dissertations / Theses
To see the other types of publications on this topic, follow the link: Résonance magnétique nucléaire fonctionnelle RMNf.

Dissertations / Theses on the topic 'Résonance magnétique nucléaire fonctionnelle RMNf'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 11 February 2022

Create a spot-on reference in APA, MLA, Chicago, Harvard, and other styles

Select a source type:

Consult the top 50 dissertations / theses for your research on the topic 'Résonance magnétique nucléaire fonctionnelle RMNf.'

Next to every source in the list of references, there is an 'Add to bibliography' button. Press on it, and we will generate automatically the bibliographic reference to the chosen work in the citation style you need: APA, MLA, Harvard, Chicago, Vancouver, etc.

You can also download the full text of the academic publication as pdf and read online its abstract whenever available in the metadata.

Browse dissertations / theses on a wide variety of disciplines and organise your bibliography correctly.

1

Baligand, Céline. "De la visualisation directe de traitements à l'évaluation fonctionnelle du muscle strié squelettique : une approche intégrative par RMN in vivo." Paris 11, 2009. http://www.theses.fr/2009PA112067.

Full text
Abstract:
Les travaux effectués au cours de ce doctorat ont porté sur le développement d'outils d'exploration atraumatique par résonance magnétique nucléaire (RMN) à 4 Tesla, pour l'étude du muscle strié squelettique, de sa fonction et de ses thérapies. Dans la première partie du travail nous abordons l'imagerie de la thérapie cellulaire. Nous avons étudié le marquage cellulaire par charge directe non spécifique avec deux agents de contraste RMN : un chélate de Gadolinium et un agent superparamagnétique. A l'aide d'un modèle de xénogreffe de myoblastes humains dans la patte de souris immunocompétentes, nous avons pu mettre en évidence la persistance d'un signal non spécifique des superparamagnétiques jusqu'à trois mois au-delà du rejet du greffon cellulaire dans notre modèle. Cette modalité, qui est la plus utilisée dans la littérature, est donc inappropriée pour le suivi à long terme de la thérapie cellulaire. La deuxième partie présente différents outils d'exploration fonctionnelle par RMN. La spectroscopie dynamique du phosphore 31 (31P) permet l'estimation des capacités oxydatives mitochondriales in vivo à l'exercice. Par ailleurs, l'imagerie combinée au marquage magnétique des spins de l'eau artérielle (ASL) permet la mesure quantitative de la perfusion tissulaire. Une étude théorique des modèles à 1 et 2 compartiments pour le calcul de la perfusion a permis de valider l'utilisation du modèle à 1 compartiment dans nos conditions expérimentales. Dans ce travail de thèse, nous avons mis au point un protocole d'exploration multiparamétrique fonctionnelle (mpf) du muscle à l'exercice électrostimulé adapté aux modèles murins et permettant l'entrelaçage des séquences de spectroscopie du 31P et d'imagerie ASL. Nous présentons les adaptations de l'instrumentation et des séquences et nous proposons un protocole de répétition d'exercices et la sommation des résultats successifs pour pallier le manque de signal 31 P inhérent à la taille de l'animal. Les résultats montrent l'établissement d'un état d'équilibre dans la réponse à l'exercice et autorisent la sommation des résultats au-delà des deux premiers exercices. Enfin, dans la dernière partie, la méthodologie mpf est appliquée à l'étude des relations entre l'apport perfusionnel et le métabolisme énergétique à l'exercice dans deux modèles d'hypertrophie musculaire, constitutive (knock-out pour la myostatine, mstn-/-) ou induite par électrotransfert du gène de la follistatine, inhibiteur de la myostatine
This work deals with the development of non-invasive NMR tools at 4T dedicated to the study of skeletal muscle function and therapies. The first part includes a review of cell therapy imaging technics. We explored the possibility of using direct loading with MR contrast agents: gadolinium chelates (Gd-DTPA) and iron oxide particles (SPIOs). A xenograft model was used to take advantage of the rapid rejection process. In this way, we evaluated the capacity of each agent to strictly reflect the status of the graft in vivo. Loaded human myoblasts were injected in the leg of immunocompetent mice and Tl weighted imaging was regularly performed until 3 months after injection. Results showed that SPIOs could dramatically overestimate cell surviving while Gd-DTPA was visible only few weeks after cells rejection. We concluded that SPIOs could hardly be recommended for long-term monitoring studies. The second part describes the classic NMR tools for perfusion and energy metabolism measurement. We compared one-compartment and two- compartment models for the calculation of perfusion. In a simulation study, we tested the validity of the one compartment model at 4T in our experimental conditions. In the third part, we proposed a new method to explore both perfusion and energy metabolism in vivo in exercising mouse leg. ³¹P-NMR spectroscopy and ASL-perfusion imaging were interleaved so that in a single exam both vascular and energetic responses were obtained. The strategy we use dis based on the repetition of several successive exercises and the gated summation of results. Improved coefficients of variation allowed for a better estimate of mitochondrial oxidative capacities. We then used our method to investigate perfusion and metabolism changes in different models of muscle hypertrophy: myostatin knock-out and myostatin blockade using follistatin coding plasmid electrotransfer
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
2

Truflandier, Lionel. "Détermination de paramètres RMN par la théorie de la fonctionnelle de la densité : application aux éléments 3d en RMN de l'état solide." Nante, 2007. http://www.theses.fr/2007NANT2083.

Full text
Abstract:
La spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) appliquée à l'état solide permet d'observer, outre les perturbations des niveaux Zeeman, un grand nombre d'interactions internes, généralement moyennées à l'état liquide. Lorsque les développements séquentiels expérimentaux ne permettent pas de s'affrranchir de certaines d'entre elles, l'interprétation des spectres est rendue délicate voire impossible. Théorie et méthodes numériques se mettent alors au service de l'expérience pour une meilleure compréhension des bservations. Néanmoins, un dilemme doit être résolu entre précision des calculs, taille des édifices atomiques traités et nature des noyaux sondés. A partir de l'approximation pseudo-potentiel développée dans le formalisme de la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT), il est montré dans ce travail qu'il est possible de prédire avec précision les paramètres de déplacement chimique et de gradient de champ électrique des éléments 3d dans des systèmes étendus. Une étude fine des différentes approximations présentes dans la méthode "gauge-including projector augmented-wave" (GIPAW) a permis le développement d'outils fiables pour l'étude des noyaux 49Ti, 51V et 55Mn. Après validation sur des composés modèles d'oxydes de vanadium, ces outils ont été légitimement appliqués à d'autres systèmes périodiques. Ainsi, l'étude de composés complexes comme un décavanadate de césium ou des phosphovanadates, a permis d'apporter des réponses quant aux indéterminations structurales et aux problèmes d'interprétation des spectres RMN. Quelques problèmes inhérents à l'approche DFT ont été soulevés et discutés
Besides Zeeman levels perturbation, nuclear magnetic resonance spectroscopy (NMR) applied to solid state allows the observation of numerous coupling interactions that are not accessible in liquid state. Despite sequential developments for high resolution measurements, interpretation of resonance spectra remains delicate. .
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
3

Agez, Morgane. "Etude structurale et fonctionnelle de la protéine chaperon d'histones Asf1." Paris 6, 2008. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00268886.

Full text
Abstract:
Au sein des cellules eucaryotes, l’ADN est compacté sous la forme de chromatine dont l’unité de base est le nucléosome. Cette structure protéique protège l’ADN des agressions oxydantes et a un rôle essentiel dans la régulation des processus nucléaires. Ce travail a pour objectif de mieux comprendre les mécanismes de remodelage de la chromatine. Nous nous sommes plus particulièrement intéressés à l’interaction entre les protéines du nucléosome que sont les histones H3 et H4 et le chaperon d’histones Asf1. Nous avons résolu par RMN la structure du complexe entre Asf1 et les histones. Ce travail a constitué une base pour, d’une part, analyser la fonction de cette interaction in vivo et, d’autre part, initier la conception de peptides inhibiteurs spécifiques de cette interaction et anti-tumoraux potentiels. Au cours de ce travail, nous avons également développé une méthode in vitro d’étude des mécanismes moléculaires d’assemblage et de désassemblage de nucléosomes par Asf1
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
4

Blanc, Jordy. "Modifications métaboliques lors de l'activation cérébrale : suivi par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire du proton et du carbone 13." Thesis, Bordeaux, 2018. http://www.theses.fr/2018BORD0336/document.

Full text
Abstract:
Le lactate est considéré comme un métabolite déchet depuis de très nombreuses années. Cependant, cette vision semble revisitée depuis quelques temps, avec l'apparition de la notion de glycolyse aérobie et de navettes lactate dans différents types cellulaires (muscle, cerveau et sperme). Concernant le cerveau, des études in vitro, ex vivo et in vivo réalisées ces 20 dernières années ont montré, d'une part, que les astrocytes produisent du lactate et d’autre part que le lactate pouvait être un substrat énergétique pour le système nerveux central (SNC), et plus particulièrement les neurones. Cette notion de navette lactate entre astrocyte et neurone a été proposée pour la première fois en 1994 par Pellerin et Magistretti (ANLS, pour astrocyte-neuron lactate shuttle). Malgré de nombreuses recherches depuis, l'existence d'un transfert net de lactate entre les astrocytes et les neurones n'a toujours pas pu être démontrée in vivo. Dans cet optique, la visualisation de la production de lactate in vivo dans le cerveau activé est essentielle. Le rôle des transporteurs au lactate, MCTs (Monocarboxylate Transporters), dans la détection de ce signal est également un point capital. L’objectif de cette thèse a été de développer la spectroscopie de RMN in vivo localisée dans le cortex somato-sensoriel du rat en condition d’activation cérébrale. Dans un premier temps, un travail de développement a été effectué afin de mettre au point le protocole de stimulation neuronale et d’obtenir un rapport signal sur bruit suffisant pour pouvoir quantifier de façon fiable le lactate. Une fois le protocole établi sur des rats contrôles, l’étude a été réalisée sur des rats modifiés génétiquement et réprimés pour le MCT, soit neuronal, soit astrocytaire. Le but était de déterminer si ce partenaire clef de l’ANLS avait une influence sur les fluctuations de lactate lors de l'activation cérébrale. En plus de la spectroscopie proton in vivo et de l’IRM fonctionnelle, des études de RMN du carbone-13 ont été réalisées ex vivo. Le résultat majeur de cette thèse montre qu’en l’absence du transporteur de lactate neuronal, non seulement on perd l’augmentation de lactate lors de la stimulation cérébrale mais on perd également le signal BOLD sur l’IRMf. Ce résultat suggère, et ce pour la première fois, que l’activité neuronale est fortement dépendante du transporteur au lactate
Lactate has been considered as a waste metabolite for many years. However, this vision has been reconsidered recently, with the appearance of the notion of aerobic glycolysis and lactate shuttles in different cell types (muscle, brain, and sperm). Concerning the brain, in vitro, ex vivo and in vivo studies carried out over the last 20 years have shown, on the one hand, that astrocytes produce lactate and, on the other hand, that lactate can be an energetic substrate for the central nervous system (CNS), and more particularly neurons. This lactate shuttle between astrocyte and neuron was first proposed in 1994 by Pellerin and Magistretti (called ANLS, for astrocyte-neuron lactate shuttle). Despite many studies since then, the existence of a net transfer of lactate between astrocytes and neurons has still not been demonstrated in vivo. In this regard, visualization of lactate production in vivo in the activated brain is essential. The role of lactate transporters, MCTs (Monocarboxylate Transporters), in detecting this signal is also a key issue. The objective of this thesis was to develop in vivo NMR spectroscopy located in the somato-sensory cortex of rats under brain activation conditions. First, experiments were carried out to develop the neural stimulation protocol and to obtain a sufficient signal-to-noise ratio to be able to quantify lactate. Once the protocol was established on control rats, the study was performed on genetically modified rats and down-regulated for MCT, either neuronal or astrocytic. The aim was to determine whether this key partner of the ANLS has an influence on lactate fluctuations during brain activation. In addition to in vivo proton spectroscopy and functional MRI, carbon-13 NMR studies were performed ex vivo. The major result of this thesis shows that in the absence of the neuronal lactate transporter, not only is the increase in lactate lost during brain stimulation but the BOLD signal on the fMRI is also lost. This result suggests, for the first time, that neural activity is highly dependent on the lactate transporter
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
5

Boudet, Julien. "Etude RMN structurale et fonctionnelle de macromolécules biologiques impliquées dans des modulations de pathogénicité bactérienne et virale." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2007. http://www.theses.fr/2007GRE10215.

Full text
Abstract:
Au niveau cellulaire, une communication continue et régulée doit être maintenue entre les centres de contrôles internes (en charge de la production et de la gestion des macromolécules biologiques) et les récepteurs périphériques (extra ou intracellulaires) initiateurs moléculaires de la réponse. Cette opération a pour but de préserver l'intégrité de tout organisme vivant. Le décryptage moléculaire des différentes étapes requises pour expliquer les systèmes complexes d'interactions (transduction du signal) nécessite de disposer de méthodes biophysiques puissantes, susceptibles de fournir des informations pertinentes pour la construction de modèles physiologiques ou pathologiques intégrés. Ainsi, trois méthodes biophysiques complémentaires (calorimétrie de titration isotherme, résonance magnétique nucléaire et fluorescence) ont été analysées en terme de stratégies d'investigation et de limites de validité. Par la suite, deux sujets liés à des modulations de pathogénicité bactérienne et virale ont été abordés. Dans une première phase, le phénomène de résistance de souches bactériennes aux molécules antibiotiques a été abordé selon deux angles différents. Tout d'abord, plusieurs expériences RMN ont été effectuées afin d'améliorer le niveau de connaissance actuel concernant les détails moléculaires de la transduction du signal requise pour la destruction des antibiotiques de type beta-lactames. Plus particulièrement la levée de répression du gène codant pour la beta-lactamase a été étudiée. Dans une seconde approche, de nouvelles cibles protéiques ont été recherchées et la structure en solution d'une nouvelle protéine a été résolue. Les résultats obtenus et les modèles déduits sont exposés dans ce manuscrit. Pour terminer, une étude combinant génie génétique, RMN, cristallographie et fluorescence in vivo a ouvert une brèche, à l'échelle atomique, vers la compréhension intégrée du phénomène de transmissibilité inter-espèce du virus influenza (notamment grâce à l'obtention de la première structure haute-résolution du ITagment C-terminal de la sous-unité PB2 de la polymérase virale d'irifluenza)
At the cellular level, a continually regulated communication must be maintained between internai control centers (in charge of biological macromolecules production and management) and the peripheral receptors (extra or intracellular) starting points of the response. This process is dedicated to the living organism integrity preservation. Decoding the molecular steps required to explain complicated interaction mechanisms (like signal transduction requires the use of powerful biophysical tools, as they are able to provide appropriate information for the building of integrated physiological or pathological models. Thus, three complementary biophysical methods (isothermal titration calorimetry, nuclear magnetic resonance and fluorescence) were analyzed in terms of investigation strategy and limitations. Two projects linked to bacterial and viral pathogenicity modulations were subsequently treated. One ofthem, the phenomenon ofbacterial resistance to antibiotics, was approached according to two different angles. First ofall, several NMR experiments were performed to improve the current knowledge ofmolecular details constituting the signal transduction processes responsible for the destruction ofbeta-lactams antibiotics. More particularly, the lack ofrepression of genes encoding for the beta-lactamase was studied. Ln a second approach, new protein targets were searched and the solution structure oh new protein was solved. Acquired results and deduced models are displayed in this manuscript. To finish, a study combining genetic engineering, NMR, crystallography and in vivo fluorescence was intended to break through an understanding of the inter-species transmissibility phenomenon of the influenza virus at the atomic level (notably thanks to the first high-resolution structure of the C-terminal ITagment of the PB2 subunit of the viral irifluenza polymerase)
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
6

El, Antak Latifa. "Analyse génomique fonctionnelle par RMN de cytochromes c3 de la Bactérie Desulfovibrio vulgaris Hildenborough." Aix-Marseille 1, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX11030.

Full text
Abstract:
Les cytochromes c3 sont multihémiques et caractérisés par des potentiels redox très bas. Plusieurs gènes codant pour un cytochrome c sont présents dans le génome de la bactérie Desulfovibrio vulgaris Hildenborough (DvH). Nous avons étudié par arrimage moléculaire sous contraintes de données de RMN les complexes formés par le cytochrome c3 soluble de type I de DvH avec ses deux partenaires redox. La surface d'interaction du cytochrome c3 est similaire dans les deux complexes, impliquant l'hème 4 du cytochrome dans le transfert d'électron avec les deux protéines. L'analyse du génome de DvH nous a permis de déterminer la présence de trois opérons codant pour trois formiate déshydrogénases différentes dont deux possèdent une sous-unité cytochrome c3. Nous avons mis en évidence l'expression de ces trois enzymes et caractérisé l'une de ces sous-unités cytochrome c3. Nos études d'interactions par RMN hétéronucléaire montre que cette sous-unité est le donneur terminal d'électron de l'enzyme.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
7

Lefèvre, Julien. "Etude structurale et fonctionnelle de la protéine HasB, impliquée dans l'acquisition de l'hème chez Serratia marcescens." Paris 6, 2007. http://www.theses.fr/2007PA066463.

Full text
Abstract:
Chez les bactéries à Gram négatif, certaines molécules comme les sidérophores ou l’hème doivent être activement transportées à travers la membrane externe via des récepteurs membranaires qui permettent la fixation et l’internalisation du ligand. Ce type de transport nécessite la protéine de membrane interne TonB qui interagit avec ces récepteurs via un domaine globulaire appelé domaine périplasmique. En plus de la protéine TonB, la bactérie Serratia marcescens possède une protéine homologue, appelée HasB, impliquée dans le système d’acquisition de l’hème via les hémophores. Ce système est basé sur la sécrétion d’une protéine extracellulaire qui capture l’hème libre ou lié à des hémoprotéines et qui le délivre ensuite à un récepteur spécifique de la membrane externe (HasR). Chez S. Marcescens, les deux protéines HasB et TonB sont actives pour le transport de l’hème via le récepteur HasR. Cependant, HasB ne peut pas remplacer TonB pour les autres fonctions TonB-dépendantes. La protéine HasB se comporte donc comme une protéine TonB spécifique de l’acquisition de l’hème via le récepteur HasR. Afin de comprendre les bases de cette spécificité, l’étude structurale par RMN du domaine périplasmique de HasB a été entreprise. Pour cela, les étapes de clonage, d’expression et de purification d’un échantillon isotopiquement marqué ont été mises au point. L’analyse des spectres 3D hétéronucléaires correspondants a permis l’attribution des signaux de la protéine ainsi que l’identification des éléments de structures secondaires. L’interaction entre le domaine périplasmique de HasB et HasR a aussi été étudiée par ITC afin de mieux comprendre la spécificité de cette interaction
In Gram negative bacteria, some molecules such as siderophores or heme must be actively transported through the outer membrane. This transport requires outer membrane receptors which interact and internalize the ligand through the membrane. This transport requires the inner membrane protein TonB, which interacts with these receptors through a globular domain named periplasmic domain. In addition to the TonB protein, the Gram negative bacteria Serratia marcescens possesses a supplementary TonB-like protein called HasB. This protein is a component of the hemophore-dependent heme acquisition system of S. Marcescens. This system involves a soluble extracellular protein that acquires free or hemoprotein-bound heme and delivers it to a specific outer membrane receptor (HasR). In S. Marcescens both HasB and TonB are active for heme uptake via the HasR receptor. However, HasB can not replace TonB for the others TonB-dependent processes. There is a great deal of evidence that HasB behaves as a specific TonB-like protein dedicated to heme uptake through the HasR receptor. In order to understand the basis of this specificity, NMR structural study of the periplasmic domain of HasB was carried out. Cloning, expression and purification steps of an isotopically labeled sample were optimized. Heteronuclear 3D spectra analysis enabled us to assign backbone and side chain resonances and to localize secondary structure elements. Additionally, the HasB-HasR interaction was studied by ITC microcalorimetry in order to characterize the specificity of this interaction
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
8

Mas, Guillaume. "Etude structurale et fonctionnelle par RMN d'une chaperonine de 1 MDa en action." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAV036/document.

Full text
Abstract:
Les chaperonines sont des chaperonnes moléculaires indispensables pour le repliement de certaines protéines dans les cellules. La taille et la complexité de ces machineries biologiques rendent complexes l'étude de leurs propriétés structurales et fonctionnelles. La spectroscopie RMN permet de suivre des changements structuraux et dynamiques en temps réel avec une résolution atomique. Cependant, l'étude par RMN de protéines ou de complexes de haut poids moléculaires a été un challenge pendant de nombreuses années. Dans la première partie de cette thèse, il a été montré que la combinaison de marquage spécifique des groupements méthyles, d'expériences RMN optimisées et de microscopie électronique peut être utilisée pour suivre différents états du cycle fonctionnel d'une chaperonine de 1 MDa. Pour étudier ce mécanisme, la chaperonine native a été reconstituée avec un marquage des groupements méthyles des méthionines et valines. Les résidus méthionines ont pu être utilisés comme des sondes pour identifier les spectres RMN correspondant aux états intermédiaires et aux espèces actives du cycle fonctionnel. Grâce à ces sondes il a été possible de suivre en temps réel les réarrangements structuraux correspondant aux différentes conformations de la chaperonine durant son cycle fonctionnel. La seconde partie traite de la caractérisation de l'interaction de la chaperonine avec une protéine cliente dépliée. L'observation de la stabilisation de l'état déplié de la protéine par la chaperonine a permis de mettre en évidence une activité de "holdase" de la chaperonine. En utilisant une combinaison astucieuse de différents marquages de groupements méthyles et d'expériences RMN optimisés pour des assemblages de haut poids moléculaire, il a été possible d'observer le repliement de cette protéine par la chaperonine et les effets de la présence d'une protéine dépliée sur le cycle fonctionnel de la chaperonine en action
Chaperonins are essential molecular chaperons for the refolding of proteins in the cells. Size and complexity of these biological machineries make complex the study of their structural and functional properties. NMR spectroscopy offers an unique ability to monitor structural and dynamic changes in real-time and at atomic resolution. However, the NMR studies of large proteins and complexes has been a real challenge for a long time. In the first part of this thesis, it has been shown that the combination of methyl specific labeling, optimized NMR spectroscopy for large assemblies and electron microscopy can be used to monitor the different states of the functional cycle of a 1 MDa chaperonin. To study this mechanism, the native chaperonin was reconstituted with a labeling of the methionines and valines methyl groups. Methionines residues have been used as probes to identify the NMR spectra corresponding to intermediates states and active species of the functional cycle. Thanks to theses probes, it has been possible to follow in real time the structural rearrangements corresponding to the different conformations of the chaperonin during its functional cycle. The second part deals with the characterization of the interaction between the chaperonin and an unfolded protein. Observation of the stabilization of the unfolded protein by the chaperonin allowed to identify the holdase activity of the chaperonin. Using a clever combination of a differential methyl labeling and optimized NMR spectroscopy for large assemblies, it has been possible to follow the refolding of the unfolded protein by the chaperonin and the effects of the unfolded protein on the functional cycle of the chaperonin in action
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
9

ROTH, MURIEL. "Développements méthodologiques en imagerie d'activation cérébrale chez l'homme par résonance magnétique nucléaire : quantification de flux, imagerie de l'effet BOLD et correction des mouvements de la tête." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1998. http://www.theses.fr/1998GRE10016.

Full text
Abstract:
Ce travail est centre sur les developpements methodologiques en imagerie par resonance magnetique des fonctions du cerveau. Une nouvelle methode d'irm fonctionnelle quantitative basee sur la mesure du debit sanguin est tout d'abord decrite. Des images angiographiques ont permis de mesurer le debit dans une veine drainant le cortex moteur. Des variations significatives du debit sanguin entre des periodes de repos, de simulation mentale et d'execution d'un acte moteur ont ete mises en evidence. Ces informations fonctionnelles ne permettent pas de localiser precisement les regions corticales activees. Cette localisation a ete effectuee en appliquant un traitement approprie sur des images sensibles aux variations du taux d'oxygenation sanguine. Des cartes d'activation cerebrale de bonne resolution spatiale ( 3 mm) sont ainsi obtenues. Nous avons alors demontre que l'aire motrice primaire est activee lors de la simulation mentale d'un acte moteur. Les mouvements de la tete survenant pendant un examen fonctionnel induisent des erreurs sur les cartes d'activation. Un nouvel algorithme de correction des deplacements dans le plan des images est presente. Cet algorithme utilise les proprietes de la transformation de fourier concernant les rotations et les translations afin de determiner rapidement les parametres du deplacement. Des tests sur des images simulees ont permis de montrer la fiabilite et la precision de l'algorithme.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
10

Frenal, Karine. "Caractérisation structurale et fonctionnelle de TgDRE : une enzyme de réparation de l' ADN du parasite Toxoplasma gondii." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066031.

Full text
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
11

Galloux, Marie. "Etude fonctionnelle et structurale d' un peptide impliqué dans le mécanisme d' entrée d' un virus non enveloppé." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066035.

Full text
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
12

Vernhes, Emeline. "Maturation de la capside du bactériophage T5 : étude structurale et fonctionnelle de la protéine de décoration pb10." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS465/document.

Full text
Abstract:
Le bactériophage T5, qui infecte la bactérie Escherichia coli, est constitué d’une capside icosaédrique renfermant un ADN double brin et d’une queue permettant le transfert de son ADN dans le cytoplasme de la cellule hôte. Au cours de la morphogénèse, la capside et la queue sont assemblées séparément puis connectées pour former les particules infectieuses. La capside de T5 est d'abord assemblée sous forme d'une procapside vide constituée de 775 copies d’une protéine unique qui s'organise en hexamères et pentamères pour former respectivement les faces et les sommets de l’icosaèdre. Un des sommets est occupé par la protéine portale qui constitue un pore d’entrée pour l’ADN. L’encapsidation du génome à travers le canal portal, assurée par un moteur moléculaire, provoque l’expansion de la procapside. La capside pleine d'ADN est ensuite décorée par la protéine pb10 qui se fixe sur sa surface externe, au centre des 120 hexamères, et elle est fermée par la protéine p144 qui constitue le point d'ancrage pour la queue.Les objectifs de ma thèse étaient de déterminer la structure, la fonction et le mécanisme de fixation à la capside des deux protéines pb10 et p144. J’ai produit et purifié la protéine de fermeture p144 dont la structure et les caractéristiques de fixation sur la capside seront prochainement étudiées. J’ai résolu la structure de la protéine de décoration pb10 en solution par résonance magnétique nucléaire (RMN), ce qui a révélé une protéine formée de deux domaines. Le domaine N-terminal structuré en hélices alpha se fixe à la capside, alors que le domaine C-terminal, de type immunoglobuline, est exposé au solvant. La détermination des constantes cinétiques d'association et de dissociation par résonance plasmonique de surface (SPR) a permis de montrer que pb10 se fixe sur la capside de T5 de manière quasi-irréversible, avec une affinité de l’ordre du picomolaire. Des expériences de mutagenèse dirigée sur le domaine de fixation de pb10 indiquent que cette forte affinité repose sur un réseau d’interactions électrostatiques et hydrophobes. J’ai démontré que pb10 participe à la stabilisation de la capside de T5 par des techniques de calorimétrie différentielle à balayage (DSC) et thermo-fluorescence (FTSA). Par ailleurs, j'ai démontré qu’il était possible de fusionner des protéines de grande taille au domaine C-terminal de pb10 sans affecter sa haute affinité pour la capside. J’ai ainsi pu fonctionnaliser des capsides avec une protéine d’intérêt fusionnée à pb10. Ces résultats ouvrent la voie vers diverses applications, dont la présentation d’antigènes en vue de créer de nouveaux vaccins
Bacteriophage T5, a lytic phage which infects the bacterium Escherichia coli, is composed of an icosahedral capsid containing a double stranded DNA and a tail responsible for DNA transfer into the host cell cytoplasm. The capsid and the tail are assembled separately and then connected to form infectious viruses. The T5 capsid is first assembled as an empty procapsid composed of 775 copies of the major head protein organized in hexamers on the faces and pentamers on the vertices of the icosahedron. A single vertex is occupied by the portal protein which forms an entry channel for DNA. DNA is packaged through the portal channel by a molecular motor thus triggering procapsid expansion. The DNA-filled capsid is then decorated by the protein pb10 which binds on the outer surface in the center of each hexamer, and closed by the connector protein p144 needed for tail attachment.The goals of my PhD were to characterize the structure, function and mechanisms of capsid binding of both pb10 and p144 proteins. I have produced and purified the head completion protein p144 for future exploration of its structure and capsid binding properties. I have solved the solution structure of the decoration protein pb10 by nuclear magnetic resonance (NMR), thus unravelling that pb10 has two domains. The alpha-helical N-terminal domain binds to the capsid and the immunoglobulin-like C-terminal domain is exposed to the environment. Surface plasmon resonance (SPR) showed that that pb10 attachment to the T5 capsid is quasi-irreversible with a picomolar affinity. Site-directed mutagenesis of the binding domain of pb10 suggested that the decoration mechanism is driven by both hydrophobic and electrostatic interactions. Differential scanning calorimetry (DSC) and fluorescence thermal shift assays (FTSA) demonstrated the role of the decoration protein in capsid stabilization. I have also demonstrated that a large protein can be fused to the C-terminal end of pb10 without affecting its high affinity for the T5 capsid. Capsids can thus be functionalized with a protein of interest fused to pb10. Possible applications of this work include antigen presentation for new vaccines
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
13

Grenier, Benjamin. "Spectroscopie théorique : description des effets de la température sur les paramètres de résonance magnétique nucléaire." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0494/document.

Full text
Abstract:
- Notre objectif est de pouvoir définir une méthodologie théorique qui permet de simuler les spectres de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) en prenant en compte les effets de la température, afin de proposer une aide à l’interprétation des résultats expérimentaux plus pertinente.- Pour traiter la description des effets de la température sur les paramètres de RMN, nous avons étudiés les azacalixarènes, qui sont des oligomères cycliques d’unités phénol reliées entre elles par des ponts azotés. Ces molécules ont une forme de calice d’où leur nom de azacalixarènes. Par cette cavité ces molécules peuvent capter différents types de composés et sont utilisées dans le domaine de la chimie hôte-invité.- Une grande variété de substituants peut être fixée sur ces azacalixarènes. Expérimentalement on peut suivre facilement les effets des variations de structures au niveau des propriétés physico-chimiques par la RMN.- C’est pourquoi, dans un premier temps, nous nous avons étudié la description géométrique des azacalixarènes en fonction de différents substituants et de différentes isoméries à l’aide de la théorie de la fonctionnelle de la densité, donc sans prise en compte de la température. - Enfin, nous avons simulé les paramètres de RMN de ces systèmes en utilisant la Théorie de la Fonctionnelle de la Densité. Ceci pour calculer le spectre RMN des azacalixarènes à l’état fondamental.- Enfin, en effectuant des simulations de dynamique moléculaire, en utilisant la Mécanique Moléculaire, nous avons pu prendre en compte les effets de la température. Nous avons pu simuler les paramètres de RMN de ces systèmes en prenant désormais en compte les effets de la température
- Our objective is to define a theoretical methodology, which allows to simulate the Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectra taking into account the temperature effects, in order to propose a help to the interpretation of the more relevant experimental results.- To deal with the description of the temperature effects on the NMR parameters, we have studied azacalixarenes, which are cyclic oligomers of phenol units linked together by nitrogen bridges. These molecules have a calyx shape, hence their name azacalixarenes. By this cavity these molecules can capture different types of compounds and are used in the host-guest chemistry field.- A wide variety of substituents can be attached to these azacalixarenes. Experimentally, one can easily follow the structure variations effects, at the level of physicochemical properties by NMR.- For this reason, we first investigated the geometric description of azacalixarenes as a function of different substituents and different isomers using the Density Functional Theory, so without taking into account the temperature. - Then, we simulated the NMR parameters of these systems using the Density Functional Theory. This is to calculate the azacalixarenes NMR spectrum in the ground state.- FInally, by performing molecular dynamics simulations using Molecular Mechanics, we were able to take into account the temperature effects. We were able to simulate the NMR parameters of these systems taking now into account the effects of temperature
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
14

Van, de moortele Pierre-françois. "Irm fonctionnelle cérébrale à 3 Tesla : développements méthodologiques." Paris 11, 1999. http://www.theses.fr/1999PA11T018.

Full text
Abstract:
Le cadre de ce travail est l'optimisation des protocoles d'IRM fonctionnelle cérébrale chez l'homme basés sur les propriétés paramagnétiques de la désoxyhémoglobine, sur un imageur à haut champ (3 Tesla). Cette technique expose à de nombreux obstacles méthodologiques. En particulier, les séquences Echo Planar choisies pour leur extrême rapidité d'acquisition, sont très sensibles à certains artefacts (déformations image dédoublée) et produisent un bruit acoustique intense. Ces effets sont aggravés par l'existence d'un haut champ magnétique. Nous avons proposé, validé et mis en œuvre des développements méthodologiques originaux pour corriger cerfains artefacts et améliorer les conditions de réalisation de ces études : Nous avons mis en œuvre une technique de correction des distorsions géométriques (selon P. Jezzard), que nous avons validée sur des mesures d'activation cérébrale. Pour supprimer l'image "fantôme" caractéristique des séquences Echo Planar, nous avons modifié une technique de double échantillonnage (selon Yang) pour l'Echo Planar à encodage continu, et programmé un algorithme spécifique de reconstruction. Le bruit de la séquence gênant la compréhension des stimuli verbaux, nous avons modifié des séquences, validées sur fantôme, comportant des périodes de silence pour présenter le matériel verbal aux sujets adaptées aux exigences temporelles des paradigmes "en bloc" et des paradigmes "événementiels". Nous avons développé et validé un outil pour corriger systématiquement les déphasages intercoupés dus à l'étalement dans le temps de l'échantillonnage des coupes d'un volume de cerveau, après avoir mis en évidence les biais que produisent ces déphasages. Pour appréhender les mouvements involontaires de la tête, une des principales causes d'échec dans les protocoles d'IRM fonctionnelle, nous avons démontré la faisabilité, sur fantôme et chez le volontaire, d'un système de mesure directe basé sur des marqueurs externes non protoniques
The aim of this work is to optimize functional studies of the human brain on a whole body 3 Tesla MRI scanner. A number of artifacts were to be fixed, mainly related to the Echo Planar Imaging sequence, which affords extremely fast acquisition rates, but is highly sensitive to strong artifacts (distortion, ghost image) and produces a high level of noise. These effects are even worsened at high magnetic field values. We proposed, validated and implemented sorne original methodological approaches to attenuate some artifacts and improve the quality of fMRI studies conducted in the laboratory. We have implemented a correction procedure for image distortions (from P. Jezzard) that we have validated on cerebral activation measurements. To suppress the ghost image, which is characteristic of Echo Planar Imaging, we modified a double sampling technique (from Yang), for continuous phase encoding Echo Planar Imaging, and we wrote a specifie algorithm needed for image reconstruction. To present auditory stimuli in the context of the high level of noise, we designed two modified Echo Planar sequences with the insertion of silent periods to present verbal material to the subject. One sequence is dedicated for blocked design experiments, the other for event-elated paradigms. The modified sequences were also validated in phantom studies. After having shown that sarnpling the brain slice by slice over time produced significant bias in images analysis, we have developed and implemented a correction algorithm to interpolate samples on the first slice acquisition time for each brain volume. Head motions are one of the main sources of unsuccessful fMRI studies. To measure the head position in the magnet, we demonstrate the feasibility of a method based on non proton fiducial markers, the position of which is measured by projections interleaved in the Echo Planat imaging scheme
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
15

Delaforge, Elise. "Dynamique structurale et fonctionnelle du domaine C-terminal de la protéine PB2 du virus de la grippe A." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAV037/document.

Full text
Abstract:
La capacité du virus de la grippe aviaire à traverser la barrière des espèces et à devenir fortement pathogène chez les mammifères est un problème majeur de santé publique. Chez les oiseaux, la réplication a lieu dans l'intestin, à 4C, tandis que chez les humains elle a lieu dans l'appareil respiratoire, plus froid, à 33C. Il a été montré que l'adaptation à la température du virus de la grippe a lieu par de nombreuses mutations de la polymérase virale, notamment dans le domaine 627-NLS situé en C-terminal de la protéine PB2. Ce domaine est impliqué dans l'adaptation à l'hôte et interagit avec la protéine de l'hôte, importine alpha, étant donc indispensable pour l'entrée de la polymérase virale dans le noyau de la cellule [Tarendeau et al., 2008]. Les structures cristallographiques du 627-NLS et du complexe importine alpha/NLS existent. Cependant, lors de la superposition de ces structures via leur domaine NLS commun, un important choc stérique entre le domaine 627 et l'importine alpha devient évident. Ceci indique qu'une autre conformation du 627-NLS est requise pour l'interaction avec l'importine alpha [Boivin and Hart, 2011]. Dans cette étude, nous avons examiné les bases moléculaires de l'adaptation inter-espèces du virus à travers l'étude de la structure et de la dynamique du 627-NLS aviaire et humain. Nous avons identifié deux conformations du 627-NLS en échange lent (10-100 s-1), correspondant apparemment à une conformation ouverte et une conformation fermée des deux domaines. Nous proposons que la conformation ouverte du 627-NLS est la seule conformation compatible avec l'interaction avec l'importine alpha, et que l'équilibre entre conformation ouverte et fermée pourrait jouer le rôle de thermostat moléculaire, contrôlant l'efficacité de la réplication virale chez différents hôtes. La cinétique et la dynamique de ce comportement conformationnel important ainsi que de l'interaction entre le 627-NLS et l'importine alpha ont été caractérisées par résonance magnétique nucléaire (déplacements chimique, augmentation paramagnétique de la relaxation, relaxation de spin, transfert de saturation par l'échange chimique), combinée à la diffusion des rayons X et des neutrons aux petits angles ainsi qu'au transfert d'énergie par résonance de type Förster. Aussi, nous avons déterminé les affinités d'une série de mutants évolutifs du 627-NLS pour l'importine alpha et du 627-NLS aviaire ou humain pour différents isoformes de l'importine alpha, montrant que les affinités observées sont cohérentes avec les préférences d'interactions vues in vivo
The ability of avian influenza viruses to cross the species barrier and become dangerously pathogenic to mammalian hosts represents a major threat for human health. In birds the viral replication is carried out in the intestine at 40°C, while in humans it occurs in the cooler respiratory tract at 33°C. It has been shown that temperature adaption of the influenza virus occurs through numerous mutations in the viral polymerase, in particular in the C-terminal domain 627-NLS of the PB2 protein. This domain has already been shown to participate in host adaptation and is involved in importin alpha binding and therefore is required for entry of the viral polymerase into the nucleus [Tarendeau et al., 2008]. Crystallographic structures are available for 627-NLS and the complex importin alpha/NLS, however, a steric clash between importin alpha and the 627 domain becomes apparent when superimposing the NLS domain of the two structures, indicating that another conformation of 627-NLS is required for binding to importin alpha [Boivin and Hart, 2011]. Here we investigate the molecular basis of inter-species adaptation by studying the structure and dynamics of human and avian 627-NLS. We have identified two conformations of 627-NLS in slow exchange (10-100 s-1), corresponding to an apparently open and closed conformation of the two domains. We show that the equilibrium between closed and open conformations is strongly temperature dependent. We propose that the open conformation of 627-NLS is the only conformation compatible with binding to importin alpha and that the equilibrium between closed and open conformations may play a role as a molecular thermostat, controlling the efficiency of viral replication in the different species. The kinetics and domain dynamics of this important conformational behaviour and of the interaction between 627-NLS and importin alpha have been characterized using nuclear magnetic resonance chemical shifts, paramagnetic relaxation enhancement, spin relaxation and chemical exchange saturation transfer, in combination with X-ray and neutron small angle scattering and Förster resonance energy transfer. Also, we have determined the affinities of various evolutionnary mutants of 627-NLS to importin alpha and of avian and human 627-NLS to different isoforms of importin alpha, showing that the observed affinities are coherent with the preferred interactions seen in vivo
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
16

Cuny, Jérôme. "RMN du solide et modélisation : outils convergents pour le développement de nouveaux matériaux." Rennes 1, 2010. http://www.theses.fr/2010REN1S067.

Full text
Abstract:
Ce travail est consacré à l’étude de composés à cluster de molybdène (Mo) par une approche combinant RMN ⁹⁵Mo en phase solide et calculs quantiques. La RMN en phase solide et les outils de mesure utilisés sont présentés dans une première partie. Les aspects théoriques liés au calcul de paramètres RMN dans les systèmes périodiques sont décrits. La validation des méthodes de calcul est présentée dans le cas de molybdates ternaires et de l’hexacarbonyle de Mo. L’étude de composés à clusters de Mo est ensuite abordée. Nous présentons la validation des méthodes de calcul et des approches expérimentales utilisées dans le cas du ⁹⁵Mo pour six composés modèles. L’étude de composés présentant des indéterminations structurales est ensuite abordée. La dernière partie est dédiée à l’étude d’oxydes de Mo: une famille de composés incorporant le cluster Mo₃O₁₃ le composé NaMo₄O₆ et les composés AR₉Mo₁₆ O₃₅ (A = Li, Mg, Zn et R = terre-rare) qui présentent un cluster original Mo₁₆
This thesis is devoted to the study of molybdenum (Mo) cluster compounds using an approach that combines solid-state ⁹⁵MoNMR and quantum calculations. The solid-state NMR spectroscopy and the measurement tools that were used are presented in the first part. The theoretical aspects related to the quantum calculation of NMR parameters in periodic systems are described. The validation of the computational methods used in the case of model Mo compounds: ternary molybdates and the Mo hexacarbonyl. The study of Mo cluster compounds is then presented. We present the validation of the computational methods and the experimental approaches used in the case of the ⁹⁵Mo nucleus for six model compounds. The study of compounds that present structural indetermination is then presented. The last part is devoted to the study of oxide compounds : a family of compounds that contain the cluster Mo₃O₁₃, NaMo₄O₆ and the compounds AR₉Mo₁₆ O₃₅ (A = Li, Mg, Zn and R = rare-earth) that present the cluster Mo16
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
17

Bailac, Laura. "Composés organiques fluorés : Étude par RMN multinoyaux {1H, 13C, 19F} et calculs DFT." Rouen, 2016. http://www.theses.fr/2016ROUES008.

Full text
Abstract:
Depuis plus de 40 ans, les composés fluorés sont en plein essor dans le milieu pharmaceutique, le diagnostic, la chimie agro-alimentaire et les matériaux polymères. La connaissance de la structure 3D de ces composés peut s'avérer importante notamment dans le cas d'étude d'interactions entre molécules. La RMN est un outil de choix pour la caractérisation structurale de produits de synthèse et de composés naturels. De plus, le fluor 19 possède des propriétés magnétiques remarquables qui en font une sonde intéressante pour la caractérisation structurale par RMN de composés organiques fluorés. Au cours de ce travail, une étude structurale approfondie de composés organiques fluorés par RMN et DFT a été réalisée. Des expériences RMN récentes, utilisant des impulsions sélectives et des gradients d'encodage telles que les expériences 1D Pure Shift et 2D G-SERF, ont permis d'extraire des données spectroscopiques précises telles que des déplacements chimiques et des constantes de couplage scalaire homo- et hétéro-nucléaire. Ces données spectroscopiques ont été complétées par des données structurales (distances interatomiques, angles dièdres) obtenues par optimisation de la géométrie des composés par DFT. Dans la seconde partie de ce travail, les données obtenues par RMN ont servi de point d'étalonnage pour développer un modèle de calcul DFT à l'aide d'un "benchmark" permettant de prédire, à partir de la structure 3D, les couplages scalaires hétéro-nucléaires nJHF pour les familles de composés étudiés. Cette méthode permet également de déterminer les différentes contributions qui composent le couplage scalaire. L'accès au poids de chacune de ces contributions pour un couplage donné permet une meilleure compréhension du mécanisme de transmission de ce couplage, en particulier dans le cas de couplages scalaires à longue distance
For more than 40 years, fluorinated compounds have become increasingly important in the field of pharmaceutical, food chemistry and polymers. The knowledge of the 3D structure of those compounds can be of great importance especially in the case of molecule interaction studies. NMR is the most powerful method for the structural characterization of synthetic and natural compounds. Moreover, fluorine 19 owns remarkable magnetic properties which make it an interesting probe for the structural characterization of fluorinated organic compounds by NMR. During this project, a thorough structural study of fluorinated compounds by NMR and DFT has been realized. Recent NMR experiments, using selective pulses and encoding gradient such as the 1D Pure Shift and 2D G-SERF experiments, helped extract very accurate spectroscopic data such as chemical shifts and homo- and heteronuclear scalar coupling constants. Those spectroscopic data have been then completed by structural data such as internuclear distances and dihedral angles obtained by DFT geometry optimization of those compounds. In the second part of this work, the data obtained by NMR were used to develop a DFT computational model using a benchmark to predict, from the 3D structure, the heteronuclear coupling constants nJHF. This model also allows to determine the different contributions composing the scalar coupling. The access to each contribution's weight for a given coupling allows a better understanding of the mechanism of coupling's transmission, in particular in the case of long distance scalar couplings
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
18

Guerrin, Clément. "Etude des propriétés de commutation de composés en série indolino-oxazolidine par spectroscopie RMN et calculs DFT." Thesis, Lille 1, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL1R024/document.

Full text
Abstract:
Les composés moléculaires étudiés présentent une fonction indolino-oxazolidine (Box) et une jonction éthylénique (lié à un groupement thiényle – Box simples) qui sont toutes deux commutables chimiquement ou photochimiquement entre deux états. Le suivi des réactions associées a été réalisé en solution par spectroscopie RMN 1H afin de caractériser les différents états de commutation de ces composés. L’ouverture de la fonction Box peut être provoquée par ajout d’acide ou par irradiation dans l’UV (chloroforme), et ce processus est réversible en présence de base. Quel que soit l’état de la Box, l’isomérisation trans  cis de la jonction éthylénique est photochimique par irradiation à 436 nm alors que la réaction inverse est spontanée et thermique. Des composés comportant deux fonctions Box et deux jonctions éthyléniques liées à un groupement aromatique phényle ou bithiényle (BiBox) ont également été étudiés et des processus de commutation similaires ont été observés entre un nombre d’états supérieur du fait de la présence de quatre entités commutables. La commutation entre les différents états a donc été montrée et est déterminé le stimulus le plus adapté pour donner un été sélectivement et quasi quantitativement. Des calculs de chimie quantique de DFT et de TD-DFT ont permis de caractériser les structures moléculaire et électronique de chacun des états de commutation des Box simples ainsi que certains états des systèmes BiBox et de rationaliser certaines observations expérimentales. Des propriétés de fluorescence ont été observées et les spectres d’émission mesurés et les rendements quantiques de fluorescence calculés en fonction de l’état ouvert ou fermé de la (des) Box
Molecular systems studied here present an indolino-oxazolidine (Box) moiety and an ethylenic junction (linked to a thienyl residue – Box simple) which are both chemically and photochemically switchable between two states. The switching reactions were followed in solution by 1H NMR spectroscopy in order to characterize the different metastable states. Opening of the Box moiety can be triggered upon acidification or by UV irradiation in chloroform and the reaction is reversible upon neutralization with base. Whatever the closed/open state of the Box moiety is, ethylenic junction trans  cis isomerization is photochemically driven by 436 nm irradiation, whereas the reverse reaction is thermally spontaneous. Compounds with two Box moieties and two ethylenic junction linked together by a phenyl or bithienyl aromatic bridge (BiBox) have also been studied and similar switching behavior have been observed between much more states due to the presence of four switchable functions. Thus, the commutation between different states has been shown and most suitable stimulus to convert selectively and almost quantitatively from one state to another have been evidenced. Based on DFT and TDDFT methods, quantum chemistry calculations allowed to characterize molecular and electronic structures of the four switching states for Box simple systems and of some of BiBox and to rationalize some experimental observations. Fluorescence properties being surprisingly observed and so, then emission spectra and corresponding fluorescence quantum yields have been determined. The fluorescence data depend on the open/closed state of the Box moieties, allowing additional properties to these compounds
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
19

Viallon, Magalie. "Imagerie par résonance magnétique nucléaire de l'hélium3 hyperpolarisé : application à l'étude fonctionnelle du poumon et perspectives biomédicales." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10135.

Full text
Abstract:
Ce travail de these concerne le developpement methodologique de techniques d'imagerie par resonance magnetique nucleaire de l'helium3 hyperpolarise. Dans le premier chapitre, nous rappelons les bases physiques de l'imagerie par rmn et exposons les specificites de l'imagerie par resonance magnetique des gaz rares relativement a la diffusion, la relaxation et la gestion de la polarisation. Nous menons ensuite une analyse comparative des potentialites de differentes sequences d'imagerie rapide permettant de realiser l'irm de ces gaz rares, etudiant le rapport signal sur bruit de l'image obtenue pour chaque sequence. Nous examinons successivement le cas des techniques codant l'espace de fourier de facon cartesienne puis les techniques d'imagerie radiale et spirale, codant le signal de precession libre. Ces gaz etant utilises sous une forme hyperpolarisee, nous rappelons au chapitre 2, les diverses techniques de polarisation existantes, en mettant en evidence leurs differences tant au niveau des rendements que de l'ingenierie mise en uvre. Le troisieme chapitre porte sur les techniques d'imagerie. Nous en rappelons le principe d'acquisition et les techniques de reconstruction particulieres requises pour la reconstruction des images. Le developpement et la mise en uvre de ces sequences sont presentees pour deux applications de ces methodes en irm du poumon et sur le petit animal. Nous montrons qu'il est desormais possible d'etudier par irm, les deux aspects de la fonction pulmonaire que sont la ventilation et la perfusion pulmonaire, deux examens necessaires au depistage de nombreuses pathologies. Dans un deuxieme temps, nous realisons l'etude dynamique du cycle ventilatoire (et donc de la fonction ventilation). Les variations dynamiques du signal au cours de la respiration peuvent etre correlees a celle de la pression pulmonaire et leur interpretation represente un premier pas vers une quantification de la ventilation. Le quatrieme chapitre, presente le developpement de sequences ultra-rapides codant le signal de precession libre dans l'espace de fourier sous forme de trajectoires spirales. Nous expliquons son principe d'acquisition, et sa mise en uvre experimentale. Le developpement de ces sequences est illustre par des applications a l'imagerie en temps reel des gaz hyperpolarise au cours du cycle ventilatoire. Le dernier chapitre decrit les perspectives biomedicales de l'irm de l'helium3 pour le depistage des pathologies chez l'homme. Dans ce meme chapitre, nous etudions une autre application potentielle du gaz rare helium3 en irm : son encapsulation pour une utilisation comme traceur sanguin en imagerie de perfusion.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
20

Coudevylle, Nicolas. "Etude structurale, dynamique et fonctionnelle par résonance magnétique nucléaire de la méthionine sulfoxyde réductase A d'Escherichia coli." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2005. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL/2005_COUDEVYLLE_N.pdf.

Full text
Abstract:
Les méthionine sulfoxyde réductases (Msr) sont une famille d'enzymes capables de réduire les méthionines sulfoxydes, générées en condition de stress oxydant, en méthionine. Nous avons entrepris l'étude structurale et dynamique par RMN de la forme réduite et d'une forme oxydée de la Msr de classe A d'Escherichia coli. Nous avons ainsi résolu les structures tridimensionnelles en solution de ces deux formes et pu caractériser leur dynamique en solution. Nous avons, de plus, entrepris l'étude du complexe non covalent enzyme/substrat, déterminé les valeurs de KD locaux, et réalisé l'étude préliminaire de l'intermédiaire acide sulfénique intervenant lors du cycle catalytique. L'ensemble de ces résultats conduit à une meilleure connaissance des déterminants structuraux et dynamiques intervenant lors d'une cycle catalytique de cette classe d'enzyme mais aussi lors de l'interaction avec le substrat (notamment en terme de spécificité) et avec la thiorédoxine
Methionine sulfoxide reductases (Msr) are a class of enzymes able to reduced back methionine sulfoxide, generated during an oxidative stress, to methionine. We performed a structural, dynamical and functional study by NMR of the reduced form and of an oxidized form of Escherichia coli MsrA. We solved the solution structures of these two forms and characterized their dynamic in solution. We also studied the non covalent enzyme/substrate complex, in order to determine local KD values, and made a preliminary study of the sulfenic acid intermediate which occurs in the catalytic cycle. All these results lead to a better knowledge of the structural and dynamical factors involved in the catalytic cycle of this class of enzyme and involved in the interaction with substrate (in specificity terms) and thioredoxin
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
21

Delbecq, Stéphane. "Caractérisation structurale et fonctionnelle de la protéine Bd37 de Babesia divergens et étude de ses potentialités vaccinales." Montpellier 1, 2002. http://www.theses.fr/2002MON13513.

Full text
Abstract:
Babesia divergens est un parasite intraérythrocytaire membre du phylum des apicomplexes, et proche de Toxoplasma ( agent de la toxoplasmose) et Plasmodium ( agent du paludisme). B. Divergens est capable de se développer chez le bovin ( hôte naturel), chez l'homme ( hôte accidentel) et chez la gerbille ( modèle de laboratoire de la babésiose). Le parasite est transmis à son hôte mammifère lors du repas sanguin de l'arthropode vecteur, la tique Ixodes ricinus. La protéine Bd37 est un antigène parasitaire qui, lorsqu'il est utilisé en vaccination, est capable d'induire une immunoprotection totale des gerbilles contre la babésiose à B. Divergens. Le but de ce travail est d'étudier la fonction de Bd37 et son éventuelle implication dans les phénomènes d'invasion de l'érythrocyte par le parasite. La capacité d'adhésion de cette protéine a été démontré, et le site d'adhésion aux érythrocytes à été identifié et partiellement caractérisé. L'étude structurale par spectroscopie RMN de Bd37 a été entreprise afin de permettre d'établir une relation structure-fonction dans le cadre du rôle de Bd37 dans l'invasion de l'érythrocyte et des relations immunologiques entre l'hôte et le parasite. Enfin, le développement du vaccin contre la babésiose bovine, basé sur l'utilisation de protéines Bd37 recombinantes, a été poursuivi.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
22

Lamberton, Franck. "Correction des distorsions en imagerie fonctionnelle cérébrale par résonance magnétique nucléaire : application à la séquence d'imagerie ultra-rapide EPI." Caen, 2003. http://www.theses.fr/2003CAEN2002.

Full text
Abstract:
L'imagerie fonctionnelle par résonance magnétique permet de localiser l'activité cérébrale, en détectant les variations d'oxygénation du sang. Cette imagerie a été rendue possible grâce à la mise en œuvre d'une technique d'acquisition ultra-rapide EPI. Néanmoins, cette rapidité n'est possible qu'au détriment d'une faible qualité des images, dont des déformations géométriques. Après un état de l'art sur cette modalité d'imagerie et des différents artefacts présents dans les images, ce mémoire présente une nouvelle technique de cartographie du champ magnétique qui prend en compte son évolution dans le temps. L'information ainsi recueillie ne nécessite qu'une acquisition supplémentaire en début d'expérience, et permet une correction optimale de chaque image acquise, en fonction des perturbations magnétiques associées. Après discussion des biais de mesure, l'efficacité de la méthode est démontrée par rapport aux autres techniques existantes, puis validée à l'aide d'une série d'expériences.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
23

Blondot, Marie-Lise. "Etude structurale et fonctionnelle du facteur de transcription M2-1 du virus respiratoire syncytial." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2013. http://www.theses.fr/2013VERS0020.

Full text
Abstract:
Le virus respiratoire syncytial (VRS) est le principal agent responsable de maladies respiratoires graves chez les jeunes enfants. Il n’y a pas de vaccin pour l’homme et le développement d’antiviraux est nécessaire. Le génome du VRS est constitué d’un ARN simple brin de polarité négative qui sert de matrice pour la transcription et la réplication des ANR viraux. L’ARN polymérase virale est un complexe composé de protéines N, L, P, et M2-1 est capable de se lier à l’ARN mais aussi d’interagir avec la phosphoprotéine P. Ces propriétés de liaison sont liées à la région globulaire de M2-1 allant de la Sérine 58 à l’Arginine 177. Nous avons déterminé la structure de ce domaine par résonance magnétique nucléaire (RMN). Le recouvrement partiel des surfaces d’interaction pour l’ARN et P sur M2-158-177 confirme les résultats obtenus préalablement concernant une compétition entre ces deux partenaires. Nous avons identifié huit résidus localisés sur ces surfaces critiques pour l’activité transcriptionnelle du complexe polymérase. Des mutations simples suffisent à perturber spécifiquement soit l’interaction avec P soit avec l’ARN sur M2-1. Le recrutement de M2-1 dans le corps d’inclusion cytoplasmiques, correspondant à des sites de synthèse de l’ARN viral, est diminué par des mutations affectant uniquement l’interaction avec P. Ces résultats révèlent que les interactions entre M2-1 et l’ARN ou P peuvent être découplées bien qu’elles soient essentielles pour la fonction d’activateur de la transcription de M2-1
Respiratory Syncytial Virus (RSV) is the main cause of pneumonia and bronchiolitis in young children. There is no vaccine nor antiviral for humans. This virus encodes its own NA-dependent RNA polymerase (RdRp) to transcribe and replicate viral genes. The RdRp is composed of the nucleoprotein N, the phosphoprotein P, the large protein L and the transcription factor M2-1. Our aim is to characterize the structure and the function of the RdRp proteins to develop antiviral strategies. The M2-1 protein functions as an essential transcriptional cofactor of the RdRp complex by increasing polymerase processivity. M2-1 is a modular RNA binding protein that also interacts with the viral phosphoprotein P, another component of the RdRp complex. These binding properties are related to the core region of M2-1 encompassing residues S58 to K177. Here we report the NMR structure of the RSV M2-158-177 core domain. The partial overlap of RNA and P interaction surfaces on M2-158-177 rationalizes the previously observed competitive behavior of RNA versus P. We identified eight residues located on these surfaces that are critical for an efficient transcription activity of the RdRp complex. Single bodies, which are regarded as sites of viral RNA synthesis, was impared by mutations affecting only binding to P, but not to RNA, suggesting that M2-1 is associated to the hononucleocapsid by interacting with P. These results reveal that RNA and P binding to M2- can be uncoupled and that both are critical for the transcriptional activation function of M2-1
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
24

Poulet, Guillaume. "Phénomènes d'hydratation des aluminophosphates : étude couplée expérience - théorie." Phd thesis, Ecole normale supérieure de lyon - ENS LYON, 2003. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00003216.

Full text
Abstract:
Les aluminophosphates microporeux AlPO4-n possèdent un large potentiel d'applications en tant que catalyseurs et adsorbants, et présentent une affinité très particulière avec l'eau. L'hydratation de ces composés à structure zéolithique provoque généralement une modification réversible de leur structure, ce qui entraîne une altération de leurs propriétés. Ici, l'utilisation conjointe de résultats expérimentaux (RMN de l'aluminium et du phosphore, diffraction des rayons X, analyse thermique, spectroscopie infrarouge) et de calculs théoriques basés sur la Théorie de la Fonctionnelle de la Densité (DFT) amène une meilleure compréhension des interactions entre molécules d'eau et AlPO4-n.
L'étude d'une structure modèle, l'AlPO4-34, apporte des informations sur le comportement de l'eau dans les pores. Elle permet également de présenter les mécanismes d'hydratation et de déshydratation et de proposer une phase partiellement hydratée, en accord avec des résultats expérimentaux. Une synergie est proposée entre la diffraction et une approche par dynamique moléculaire. Une description des domaines de stabilité des phases hydratées est aussi développée.
A l'aide de cette approche théorique, de nouvelles structures sont ensuite étudiées. Tout d'abord, grâce à la diffraction des rayons X et des calculs DFT, la maille complète de l'AlPO4-36 calciné déshydraté est décrite. Ensuite, une étude expérimentale détaillée est complétée par une approche théorique statique et dynamique pour proposer des éléments de réponses sur la phase hydratée de l'AlPO4-18.
Afin de généraliser l'étude à des mailles plus complexes et des temps de calcul plus courts, une comparaison des méthodes théoriques avec des bases d'ondes planes ou des bases d'orbitales localisées est effectuée. Ce comparatif fournit, après optimisation de la base, des résultats structuraux similaires entre les deux méthodes. Enfin, une approche d'ordre N est mise en oeuvre avec succès sur les structures microporeuses étudiées.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
25

Guipponi, Olivier. "Bases neurales de la représentation de soi chez le primate non-humain grâce à l'imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf)." Thesis, Lyon 1, 2013. http://www.theses.fr/2013LYO10188/document.

Full text
Abstract:
L'objectif de cette thèse est d'identifier les bases neurales de la représentation de soi chez le primate non-humain, par une approche d'imagerie par résonnance magnétique fonctionnelle. Nous avons pour cela étudié la convergence multimodale 1) à l'échelle de l'aire par la description de la cartographie du sillon intraparietal dans un contexte de stimulations auditives, tactiles et visuelles et 2) à l'échelle du cerveau entier où nous décrivons précisément les sites de convergence visuo-tactile au niveau cortical. Nous avons également étudié le phénomène d'intégration multisensorielle dans un contexte visuo-tactile dynamique, pour lequel nous montrons que les effets comportementaux (étude psychophysique menée chez l'homme) et le réseau d'activations cortical sont maximisés quand le stimulus visuel prédit le stimulus tactile plutôt que lors de leur présentation simultanée. Enfin, nous avons étudié la représentation de l'espace en caractérisant les bases neurales de l'espace proche et de l'espace lointain à partir d'un dispositif expérimental naturaliste et nous montrons l'existence de deux réseaux corticaux qui traitent séparément les informations appartenant à l'espace proche et à l'espace lointain
The aim of this thesis is to investigate the neural basis of self-representation in the non human primate. We studied the multimodal convergence both 1) at the area level precisely mapping auditory, tactile and visual convergence in the intraparietal sulcus and 2) at the whole brain level capturing the spatial pattern of visuo-tactile cortical convergence. We also investigated the neural network subserving multisensory integration in a dynamical visuo tactile context, showing that the strongest behavioral and cortical are obtained when the visual stimuli is predictive of the tactile stimulus rather than during simultaneous presentations. Finally, we studied the representation of space by characterizing the neural bases of near space and far space in a real naturalistic environment, thus providing the neural grounds for the observed behavioral and neuropsychological dissociation between near and far space processing
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
26

Forler, Nina. "A multinuclear solid-state NMR approach to the weathering of model phosphate glasses." Thesis, Lille 1, 2011. http://www.theses.fr/2011LIL10003/document.

Full text
Abstract:
Les travaux de cette thèse portent sur la compréhension du processus du vieillissement des verres de phosphate à la base des études de résonance magnétique nucléaire (RMN) des solides. Le terme vieillissement se traduit dans ce cas par l’attaque aqueuse du verre sous atmosphère humide. Ce processus est d’un intérêt particulier dans tous les domaines où une haute résistance des verres de phosphate contre cette attaque constitue une propriété essentielle. Notamment c’est le cas pour la vitrification des déchets nucléaires. Dans le cadre de cette étude des systèmes modèles ont été étudiés (Na2O-P2O5 et Na2O-Al2O3-P2O5) pour obtenir une idée des changements structuraux qui ont lieu pendant l’attaque aqueuse. La résonance magnétique multinucléaire des solides (1H, 27Al, 31P et 17O) étant l’outil principal, des expériences en 1D et en 2D permettent de caractériser l’environnement proche des noyaux ainsi que leur environnement intermédiaire (connectivité hétéro- et homonucléaire). L’interprétation des données RMN de l’oxygène-17 est accompagnée d’une approche complémentaire. Des paramètres RMN calculés de l’oxygène-17 (DFT / GIPAW) des hydrogénophosphates cristallines ont été vérifiés et validés expérimentalement. Des corrélations entre les paramètres RMN de l’oxygène-17 (δCS, δiso, CQ, ηQ) et l’environnement structural du noyau ont été obtenu. Ces dernières permettent de caractériser les environnements du noyau oxygène-17 qui sont générés pendant le vieillissement d’un verre Na2O-P2O5 (NaPO3)
The present manuscript focuses on the investigation of phosphate glass weathering by multinuclear solid-state magnetic resonance. Weathering, that is aqueous attack and aging of the phosphate glass under humid atmosphere, becomes important in application domains where high resistance against aqueous attack is an essential property. In particular, this is the case for phosphate glass matrices for the immobilization of nuclear waste. In the frame of this work, binary (Na2O-P2O5) and ternary (Na2O-Al2O3-P2O5) model glass systems are considered. The aim is to obtain further insight into fundamental processes and structural changes that are taking place upon weathering attack on the glass. Solid-state nuclear magnetic resonance is used as the main tool for structural characterization. 1H, 27Al, 31P and 17O are employed as probe nuclei. A number of one- and two-dimensional techniques allows for insight into the glass structure on the low and intermediate range. The interpretation of 17O NMR data is accompanied by a complementary approach. Therefore, the reliability of calculated 17O NMR parameters of protonated crystalline phosphate phases has been validated for the first time. Relationships between 17O NMR parameters and the structural environment of the nucleus could be drawn. Those relationships prove to be helpful for the characterization of oxygen environments emerging in weathered NaPO3 glass based on the chemical shift (δCS, δiso) and the quadrupolar parameters (CQ, ηQ)
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
27

Manival, Xavier. "Etude fonctionnelle et structurale de l'interaction de la protéine antiterminatrice SacY avec son ARN cible chez Bacillus subtilis : mise en évidence d'un nouveau type de domaine protéique de liaison à l'ARN." Montpellier 1, 1997. http://www.theses.fr/1997MON1T010.

Full text
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
28

Nominé, Yves. "Caractérisation biophysique de la qualité des protéines de fusion : application à l'étude structurale et fonctionnelle de l'oncoprotéine virale E6." Strasbourg 1, 2002. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2002/NOMINE_Yves_2002.pdf.

Full text
Abstract:
"L'oncoprotéine E6 des papillomavirus humains (HPV) à " haut-risque " est à l'origine du cancer du col de l'utérus. Elle participe à l'oncogénèse notamment en dégradant p53, la protéine cellulaire suppresseur de tumeurs. Le but de la thèse était d'obtenir la structure tridimensionnelle par Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) de la protéine E6. Le manuscrit revient d'abord sur les différents états (micro- et macroscopique) d'une protéine globulaire en solution, et sur des notions telles que repliement et stabilité. Il rappelle ensuite les principes et limites de différentes techniques biophysiques appliquées à l'étude de protéines. Enfin, il décrit brièvement le contexte biologique de E6. Bien que sa séquence primaire soit connue depuis 1985, la protéine E6 n'avait pas encore été purifiée. Nous décrivons ici un protocole d'expression et de purification de cette molécule, en montrant tout d'abord que l'expression bactérienne de fusions MBP-E6 (Maltose Binding Protein) génère des " corps d'inclusion solubles ". Ces particules, engendrés par l'agrégation de protéines E6 mal repliées, restent toutefois en solution grâce à la haute solubilité de MBP. Grâce à ces observations, nous avons pu produire des échantillons de la protéine E6 entière soluble et repliée, puis de ses deux domaines à zinc. Nous avons finalement obtenu la détermination de la structure tridimensionnelle par RMN du domaine C-terminal de E6. L'amélioration de la qualité de E6 recombinante a permis également de démontrer l'interaction de E6 avec un motif structural d'ADN présent dans l'ADN cruciforme, puis de déterminer les paramètres cinétiques de cette interaction par BIAcore. Ce travail ouvre donc la voie à une meilleure compréhension moléculaire des modes d'actions de E6, et donc à de nouvelles stratégies de thérapie du cancer du col de l'utérus. De plus, nos méthodologies de contrôle et d'optimisation de la qualité des protéines de fusion sont généralisables à l'étude de toute protéine récalcitrante. "
E6 is an oncoprotein produced by "high risk" Human Papillomaviruses (HPVs) involved in cervical cancers. E6 participates oncogenesis through different pathways, in particular by degrading the cellular tumor suppressor protein p53. The aim of this thesis was to solve the solution structure of E6 by Nuclear Magnetic Resonance (NMR). The introduction chapter first focuses on the different states (micro- and macroscopic) adopted by globular proteins in solution, including notions such as folding and stability. Then we record the principles, applications and limits of various biophysical techniques for the study of proteins. Finally, we briefly introduce the biological context of E6 protein. At the start of this work, E6 had never been purified although its sequence was known since 1985. In the results section, we first demonstrate that bacterial expression of E6 fused to the C-terminus of MBP (Maltose Binding Protein) generates " soluble inclusion bodies ". These particles, which originate from agregation of misfolded E6 moieties, remain soluble thanks to the high solubility of MBP moities. These observations have allowed us to produce soluble and folded samples of full-length E6 as well as its two zinc-binding domains. Finally, we have managed to solve the NMR structure of the C-terminal zinc-binding domain. On another hand, the optimized quality of our E6 samples have allowed us to demonstrate E6 binding to a particular DNA structural motif found in four-way DNA junctions. The kinetic parameters of this interaction have been determined by BIAcore. This work will provide a better understanding of the molecular pathways of E6 action and opens the way for new therapeutic strategies against cervical cancers. Furthermore, our methods for control and optimization of protein fusion quality can be generalized for future studies of other recalcitrant proteins
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
29

Le, Maire-Coirier Albane. "Etude structurale et fonctionnelle de la protéine KIN17 humaine." Paris 6, 2008. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00361216.

Full text
Abstract:
Très conservée, plus abondante dans les cellules en prolifération que dans les cellules normales, stimulée par les rayonnements UV et ionisants, autant de caractéristiques qui ont suscité notre intérêt pour l’analyse structurale et fonctionnelle de la protéine KIN17 humaine (hKIN17) dans le but de caractériser sa ou ses fonction(s) dans la cellule. Plusieurs propriétés ont été décrites pour la protéine hKIN17 dans différents mécanismes cellulaires tels que la réplication de l’ADN, la réparation de l’ADN et le métabolisme de l’ARN. Pendant ma thèse, j’ai montré en combinant des données de DC, RMN et SAXS que la protéine hKIN17 possède un domaine structuré adoptant probablement le repliement d’un doigt de zinc et un domaine winged helix dans sa région N-terminale. Seul le premier domaine lie les acides nucléiques, le deuxième domaine ayant pour partenaires plusieurs hélicases à ARN impliquées dans la transcription et la traduction. J’ai résolu par cristallographie aux rayons X la structure du domaine C-terminal qui est retrouvé uniquement chez les eucaryotes supérieurs et se replie en un double domaine de type SH3. J’ai montré par différentes méthodes biochimiques (filtration sur gel, gel IEF natif) que ce domaine ancre la protéine hKIN17 à un complexe nucléaire acide de haut poids moléculaire dont les composants sont en cours d’identification par spectrométrie de masse. De plus, il lie l’ARN et les histones modifiées. L’ensemble de ces résultats confirment l’implication de la protéine hKIN17 dans le métabolisme de l’ARN et précisent le rôle de chacun des domaines au sein de la protéine.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
30

Fages, Anne. "High-field NMR Metabonomics for Investigation of Cancer in Human Populations and Metabolic Perturbations in Model Systems." Thesis, Lyon, École normale supérieure, 2013. http://www.theses.fr/2013ENSL0876.

Full text
Abstract:
La métabonomique est une approche de choix pour l’identification de biomarqueurs d’intérêts pour le diagnostic de pathologies mais aussi pour l’amélioration de notre compréhension des processus physiopathologiques. La métabonomique offre de nouvelles perspectives en épidémiologie moléculaire, objet principale de cette thèse. Nous avons appliqué l’approche métabonomique par RMN à haut champ à l’analyse de sérums sanguins issus de la cohorte prospective EPIC (European Prospective Investigation into Cancer and nutrition) dans le but d’identifier des biomarqueurs de la survenue du cancer du foie et du cancer du pancréas. L’analyse statistique des profiles métaboliques des sérums obtenus par RMN à 800MHz a permis de mettre en évidence une signature métabolique associée à l’occurrence des hépatocarcinomes (HCC) à cinq ans avant diagnostic en moyenne. L’analyse stratifiée des données a révélé des biomarqueurs précoces mais aussi des biomarqueurs de l’étiologie des HCC. L’analyse métabonomique portée sur le cancer du pancréas n’a à l’inverse pas été concluante. Des méthodes pertinentes pour l’analyse des cohortes épidémiologiques par métabonomique ont été développées, telle qu’une méthode de correction d’effet batch rendant possible la comparaison de données RMN acquises au cours d’une longue période de temps. La méthode statistique PCPR2 développée permet de quantifier l’impact de différents facteurs sur les données métabonomique afin d’en révéler les sources de variations systématiques. D’autre part, l’approche métabonomique permet également l’investigation de questions biologiques plus fondamentales. Cette thèse offre une approche de génomique fonctionnelle à l’étude des cibles métaboliques du récepteur aux hormones thyroïdiennes TRβ dans le foie. L’analyse des données HR-MAS de tissus de foie intacts complémentée par l’analyse d’extraits hépatiques sur un modèle de souris a permis d’éclaircir le rôle de ce récepteur nucléaire
Metabonomics is a recent approach that enables not only to identify relevant biomarkers for disease diagnosis but also to improve our understanding of biological processes by gaining insight into metabolism. This thesis is mainly dedicated to the application of metabonomics to molecular epidemiology. High-field NMR metabonomic approach was applied to the analysis of serum samples from the large prospective cohort EPIC (European Prospective Investigation into Cancer and nutrition) to identify biomarkers of liver cancer and pancreatic cancer occurrence. The statistical analysis of NMR serum metabolic profiles obtained at 800 MHz enabled to highlight a metabolic signature associated with the occurrence of hepatocellular carcinoma (HCC), in average five years before diagnosis. The stratified analysis revealed both early and etiologic biomarkers of HCC. The NMR metabonomic analysis of the pancreatic cancer did not reveal any metabolic signature of this cancer. Moreover, relevant methods to allow the NMR metabonomic analysis of epidemiological cohort were developed. This thesis proposes a method to correct data for batch effect, making possible the comparison of NMR data recorded in a long period of time. The statistical method PC-PR2 developed enables the quantification of the contribution of different factors onto metabonomic data to reveal systematic variation sources. In addition, the metabonomic approach is also suitable to address specific biological questions by providing a new read-out of the metabolism. Functional genomics by NMR metabonomics was used in this thesis to study the metabolic targets of the thyroid hormone nuclear receptor TRβ in the liver. The analysis of HR-MAS data obtained on intact liver tissue in addition to the analysis of NMR data of liver extracts from a mice model enabled to better understand the role of this nuclear receptor
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
31

Girard, Guillaume. "Caractérisation structurale de systèmes désordonnés par RMN de l’état solide et calculs DFT." Thesis, Lille 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL10081.

Full text
Abstract:
La combinaison de la spectroscopie RMN de l'état solide avec des calculs DFT du type GIAO/GIPAW constitue, de nos jours, une nouvelle approche afin de caractériser la structure de systèmes moléculaires ou cristallisés simples. Ce travail de thèse est consacré à l'application de cette méthodologie à des matériaux plus complexes, en particulier à des systèmes présentant un désordre local. Ainsi, ce manuscrit traite, dans un premier temps, de la caractérisation structurale de composés cristallins à base de niobiophosphate par l'association de résultats issue de la RMN du 31P/93Nb et de calculs DFT-GIPAW. Ainsi, le désordre cationique d'une structure particulière a pu être parfaitement identifié et caractérisé par l'utilisation d'une approche combinatoire associant RMN du 31P et des calculs DFT-GIPAW. Parallèlement, une nouvelle méthodologie combinant la RMN des solides en 17O et calculs DFT-GIAO a été développée en vue de caractériser la structure d'un précatalyseur organométallique à base d'oxo-tungstène supporté sur de la silice amorphe. Cette approche a été validée dans un premier temps par l'étude de composés moléculaires de structure proche. La réponse RMN en 17O des groupements oxo présents sur ces espèces est en effet spécifique du complexe étudié et les calculs GIAO réalisés ont permis de reproduire avec une grande précision les paramètres RMN anisotropes associés à ces groupements. Grâce à cette méthodologie, nous avons pu vérifier la nature et la structure de l'espèce greffée, tout en confirmant de façon non ambiguë le mode de greffage en surface de la silice
The combination of solid-state NMR spectroscopy with GIAO/GIPAW-DFT calculations is nowadays a well-established method to characterize the atomic structure of simple molecular and crystalline compounds. The present work is dedicated to the application of this methodology to more complex systems, in particular those with local disorder. In a first part, this manuscript is dedicated to the structural characterization of niobiophosphate based materials by 31P/93Nb solid-state NMR and DFT-GIPAW calculations. The cationic disorder of one of these phases has been identified and characterized by the use of a combinatory approach associating 31P solid-state NMR and DFT-GIPAW calculations. In parallel, a new methodology combining 17O solid-state NMR and DFT-GIAO calculations has been proposed in order to characterize the structure of one oxo-tungsten based precatalyst supported on amorphous silica. This approach was initially validated by studying molecular oxo-tungsten based molecular compounds. The 17O-NMR response of each oxo group is, in fact, specific to the studied compound and the related anisotropic NMR parameters can be reproduced with high accuracy by DFT-GIAO calculation. Finally, this methodology allowed us to verify the nature and structure of the supported species by taking into account different grafting pathways
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
32

Macouillard-Poulletier, de Gannes Florence. "Caractérisation fonctionnelle de cellules microgliales immortalisées lors de situations de stress thermique et apoptotique." Bordeaux 2, 1998. http://www.theses.fr/1998BOR28602.

Full text
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
33

Vasconcelos, Filipe. "RMN premiers principes de l’17O appliqués à l’étude des phosphates cristallins et amorphes." Thesis, Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10170/document.

Full text
Abstract:
La méthodologie employée dans cette thèse, est de combiner des données RMN haute-résolution aux calculs des paramètres RMN à partir de la structure électronique, afin de comprendre l'influence de l'environnement chimique local de 17O sur les paramètres RMN (déplacement chimique, paramètres quadrupolaires). Les calculs ont été réalisés à l'aide de l'algorithme GIPAW, développé par Pickard etMauri, qui donne accès à l'écrantage magnétique pour tous les noyaux d'une structure donnée. Cette méthode améliore les précédentesapproches ab-initio en prenant en compte les conditions périodiques. Le manuscrit traite de différentes études menés sur plusieurs phases cristallines ou composés amorphes de phosphate de sodium. Des corrélations entre les paramètres RMN et les environnements locaux de l'17O ont ainsi pu être mises en évidence. Dans une étape suivante, des simulations de dynamique moléculaire nous ont permis de générer des configurations de structures vitreuses. Les paramètres RMN obtenus à partir de ces configurations sont présentés et comparés aux résultats expérimentaux. Finalement, les distributions des paramètres RMN sont interprétés par une extension du modèle de Czjzek
Our strategy is to associate NMR high resolution results and first-principles calculation in order to better understand the influence of 17O local environment onto the NMR parameters (chemical shift, quadrupolar parameters). The calculations were performed using the GIPAW algorithm, developed by Pickard and Mauri, which gives access to the NMR magnetic shielding for all nuclei of a given structure. This method improved previous approaches based on first-principles calculation by considering the symmetrical translation properties in crystals. The document will include data on crystalline as well as glass systems. Indeed, we report data obtained on cristalline sodium phosphates and from which general trends were deduced between the NMR parameters and the structural/local 17Oenvironments. In a following step, molecular dynamics has been used inorder to generate a number of glass structures that would model our real glass systems. The calculated NMR parameters are discussed and compared to those obtained experimentally. Finally, the distribution of NMR parameters usually observed on high resolution spectra will be interpreted using a new distribution model, which is an extension of the so-called Czjzek model
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
34

le, Maire Albane. "étude structurale et fonctionnelle de la protéine KIN17 humaine." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00361216.

Full text
Abstract:
Très conservée, plus abondante dans les cellules en prolifération que dans les cellules
normales, stimulée par les rayonnements UV et ionisants, autant de caractéristiques qui ont
suscité notre intérêt pour l'analyse structurale et fonctionnelle de la protéine KIN17 humaine
(hKIN17) dans le but de caractériser sa ou ses fonction(s) dans la cellule. Plusieurs propriétés ont
été décrites pour la protéine hKIN17 dans différents mécanismes cellulaires tels que la réplication
de l'ADN, la réparation de l'ADN et le métabolisme de l'ARN. Pendant ma thèse, j'ai montré en
combinant des données de DC, RMN et SAXS que la protéine hKIN17 possède un domaine
structuré adoptant probablement le repliement d'un doigt de zinc et un domaine winged helix
dans sa région N-terminale. Seul le premier domaine lie les acides nucléiques, le deuxième
domaine ayant pour partenaires plusieurs hélicases à ARN impliquées dans la transcription et la
traduction. J'ai résolu par cristallographie aux rayons X la structure du domaine C-terminal qui
est retrouvé uniquement chez les eucaryotes supérieurs et se replie en un double domaine de type
SH3. J'ai montré par différentes méthodes biochimiques (filtration sur gel, gel IEF natif) que ce
domaine ancre la protéine hKIN17 à un complexe nucléaire acide de haut poids moléculaire dont
les composants sont en cours d'identification par spectrométrie de masse. De plus, il lie l'ARN et
les histones modifiées. L'ensemble de ces résultats confirment l'implication de la protéine
hKIN17 dans le métabolisme de l'ARN et précisent le rôle de chacun des domaines au sein de la
protéine.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
35

Hédouin, Matthieu. "RMN multinoyaux {1H,6,7Li, 15N} et calculs DFT : structures d'agrégats mixtes de sulfoximine lithiée et analyse du couplage scalaire 2j (Li-Li)." Thesis, Normandie, 2020. http://www.theses.fr/2020NORMR082.

Full text
Abstract:
Au cours de ce travail, nous avons étudié le comportement en solution d’une sulfoximine S-perfluoroalkylée en tant que groupement ortho-directeur, en présence de différentes équivalences en n-Butyllithium, dans le THF à basse température. Les résultats obtenus par RMN multinoyaux {1H, 6,7Li, 15N} et calculs DFT révèlent qu’en présence d’au moins 3 équivalents de n-butyllithium, la sulfoximine dilithiée forme deux agrégats mixtes sulfoximie dilithiée/n-BuLi dimère (1 :1) et tétramère (1 :3) dont les structures comportent un lithium monomère trisolvaté sur le cycle aromatique de la sulfoximine qui explique la réactivité importante de la sulfoximine dans ces conditions. Dans une seconde partie, une méthode robuste a été proposée pour permettre la détermination de la constante de couplage effective 2JLi-Li dans des agrégats d’alkyllithiens tétramériques. L’accès a cette valeur a permis d’évaluer l’influence sur la constante de couplage 2JLi-Li de nombreux paramètres, incluant la dynamique, la solvatation, la présence d’hétéroatomes ainsi que l’encombrement stérique généré par la chaîne alkyle. Un travail complémentaire, utilisant des calculs DFT à l’aide du logiciel ADF, a montré le lien entre la constante de couplage 2JLi-Li et la distance entre les noyaux lithium
In this work, we studied the solution behaviour of an S-perfluoroalkylated sulfoximine as an ortho-directing group, in the presence of different n-Butyllithium equivalents, in THF at low temperature. The results obtained by {1H, 6.7Li, 15N} NMR and DFT calculations reveal that in the presence of at least 3 equivalents of n-butyllithium, the dilithiated sulfoximine forms two mixed aggregates dilithiated sulfoximine/n-BuLi dimer (1:1) and tetramer (1:3). The structure of these mixed aggregates contains a trisolvated monomeric lithium on the aromatic ring of the sulfoximine, which explains the strong reactivity of the sulfoximine under these conditions. In a second part, a robust method was proposed to allow the determination of the effective scalar coupling constant 2J Li-Li in tetrameric alkyllithium aggregates. This effective value enabled to evaluate the influence of numerous parameters, including dynamics, solvation, the presence of heteroatoms and the steric hindrance generated by the alkyl chain. Complementary work, using DFT calculations performed with the ADF software, has shown the link between the 2JLi-Li scalar coupling constant and the distance between the lithium nuclei
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
36

Perard, Julien. "Etudes structurales et fonctionnelles de l'IRES du VHC en association avec le motif de reconnaissance à l'ARN de la sous-unité b du facteur eIF3." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00436687.

Full text
Abstract:
L'IRES du VHC est organisé en une structure secondaire, complexe et hautement conservée, qui comprend quatre domaines distincts (I-IV). Cette organisation permet la liaison directe du facteur d'initiation eucaryote eIF3 et de la sous-unité 40S du ribosome. Le facteur d'initiation eucaryote eIF3 est un complexe de 13 protéines (~ 800 kDa). Certaines de ses sous-unités montrent une affinité pour l'ARN, et parmi elles deux possèdent des motifs de reconnaissance à l'ARN (MRR) : eIF3b (aa : 185-268) et eIF3g (aa : 239-317). Afin de déterminer l'implication de ces motifs dans l'interaction ARN-protéine, nous avons cloné les domaines contenant ces motifs MRR, ainsi que les protéines entières eIF3b et eIF3g. Nous avons ensuite étudié l'interaction de l'ARN et/ou domaines d'ARN avec le complexe eIF3 et/ou protéines ou domaines protéiques en utilisant la méthode de rétention sur filtre. Nous avons ainsi calculé les différentes constantes apparentes de dissociation entre : eIF3/IRES, eIF3b/IRES et MRR-eIF3b/IRES. Ces résultats montrent que la sous-unité eIF3b se lie directement au domaine III de l'IRES via son motif MRR situé dans le domaine N-terminal. Dans un deuxième temps, nous avons utilisé la spectroscopie RMN pour identifier précisément les acides aminés impliqués dans la reconnaissance de l'ARN viral. En utilisant différentes techniques telles que FBA, RMN et SAXS, il s'avère que le domaine IIId (30 nucléotides) représente le motif minimum impliqué dans l'interaction MRR-eIF3b/IRES. Enfin, la technique de SAXS a été mise à profit pour étudier la structure tridimensionnelle de l'IRES libre en solution.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
37

Grekov, Denys. "Apport de la RMN du solide de l’17O à l’étude structurale d’espèces moléculaires et greffées sur silice pour la métathèse des oléfines." Thesis, Lille 1, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL10104.

Full text
Abstract:
Ce manuscrit décrit l’application de la RMN du solide de l’17O à l’étude structurale d’espèces oxo de tungstène bien définies en lien avec des catalyseurs industriels pour la métathèse des oléfines. Dans un premier temps, pour compenser la faible réceptivité de l’17O, des techniques d'amélioration de signal tels que DFS (Double Frequency Sweep) et HS (Hyperbolic Secant) ont été évaluées de façon critique pour ces systèmes comportant des interactions anisotropes d’amplitudes très diverses. La méthode DFS s’est avérée la plus robuste, avec un gain en signal de 2-2,4. Dans une seconde étape, des complexes oxo de tungstène moléculaires et supportés sur silice ont été étudiés par RMN MAS 17O, après enrichissement isotopique du groupement oxo. Les paramètres RMN de W=O sont très sensibles à la sphère de coordination du métal : combiné avec des calculs DFT, ceci permet une évaluation de la structure des espèces greffées. Le marquage sélectif en 17O de la surface de silice a également amené à une meilleure compréhension de ces systèmes, plus particulièrement en ce qui concerne les interactions métal-support. Des informations supplémentaires ont été obtenues grâce à l'application des méthodes de haute résolution (17O MQ MAS) et de corrélation hétéronucléaire (1H-17O HMQC). Quelques perspectives de ce travail sont avancées, plus particulièrement sur la chimie de surface du molybdène
This manuscript aims at the use of 17O solid state NMR for accessing the structure of well-defined silica-supported oxo-tungsten species related to industrial olefin metathesis catalysts. As a first step, to compensate for the low receptivity of 17O, signal enhancement techniques such as DFS (Double Frequency Sweep) and HS (Hyperbolic Secant) were critically assessed for such systems featuring large range of anisotropic interactions. DFS proved to be the most robust method, providing a signal enhancement of 2-2.4. In a second stage, series of molecular and silica-supported tungsten-oxo complexes have been studied by 17O MAS NMR, following isotopic enrichment of the oxo moiety. The W=O NMR parameters showed a high sensitivity to the metal coordination sphere, thus allowing structural assessment of grafted species when combined with DFT calculations. Silica-surface selective 17O labelling also afforded deeper understanding of these systems, most particularly regarding metal-support interactions. Further elements were obtained thanks to application of methods for high resolution (17O MQ MAS) and heteronuclear correlation (1H-17O HMQC). Some perspectives of this work are drawn, most particularly on the related molybdenum surface chemistry
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
38

Nguyen, Thui Thuong. "First-principles calculations of solid-state transition metal NMR parameters in functional inorganic materials." Thesis, Rennes 1, 2015. http://www.theses.fr/2015REN1S115/document.

Full text
Abstract:
Ce manuscrit de thèse est dédié aux calculs quantiques de paramètres de spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) de métaux de transition dans des composés inorganiques de l’état solide. Le manuscrit est divisé en cinq parties. La première partie présente les atouts de la spectroscopie RMN en tant que technique d’investigation de composés inorganiques de l’état solide. Dès lors que le noyau sondé est un métal de transition, l’expérience doit être complétée par des calculs quantiques afin d’interpréter au mieux les données expérimentales. La seconde partie du manuscrit est dédiée à la description de la RMN et des outils méthodologiques utilisés dans ce travail. Le troisième chapitre est dédié au calcul du déplacement chimique de l’isotope 95 du molybdène dans des clusters halogénés de formule [Mo6X14]2- (X = Cl, Br, I). Une attention particulière est donnée à l’influence des effets de solvatation sur le calcul. Le quatrième chapitre est dédié à l’étude des composés A6Re3Mo3S8(CN)5 (A = K, Cs) dont la structure cristallographique est basée sur un motif octaédrique hétéronucléaire Re3Mo3S8(CN)6. La résolution structurale par diffraction des rayons X sur monocristal n’ayant pas permis de résoudre le problème de la distribution des métaux de transition dans l’octaèdre, une étude spectroscopique in silico sur la base de calculs DFT moléculaires et périodiques a été entreprise. Dans le dernier chapitre, des composés hétéronucléaires de formule [Ln6-6xLn6xO(OH)8(NO3)6(H2O)12]2+ (Ln = Pr-Lu, Y) ont été étudiés du point de vue théorique afin de mieux comprendre les données spectroscopiques collectées
This work is devoted to the calculations of nuclear magnetic resonance (NMR) parameters of transition metal nuclei in inorganic solid-state materials using first-principles calculations. The manuscript is divided in five chapters. The first one shows that NMR is an interesting spectroscopic method to gain some information on the properties of inorganic materials. As far as the probed nucleus is a transition metal, experiments must be completed with quantum chemical calculations in order to better interpret the spectroscopic data. The second chapter is devoted to the quantum chemical tools that are necessary to the understanding of this work are presented. The third chapter deals with the computations of 95Mo NMR parameters of [Mo6X14]2- (X = Cl, Br, I) octahedral clusters. A special attention is paid to the influence of solvation effects on the computed NMR parameters. The fourth chapter is devoted to the study of A6Re3Mo3S8(CN)5 (A = K, Cs) compounds. Their crystal structures are based on a heteronuclear octahedral motif Re3Mo3S8(CN)6. Since X-ray diffraction refinements did not solve the colouring problem in the octahedron, an in silico spectroscopic study has been carried out using molecular and periodic DFT calculations. The last chapter of this report deals with heteronuclear polyoxolanthanides that have been studied using first-principles calculations in order to better understand their 89Y NMR spectra
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
39

Hernandez, Nadia. "La perception des visages et des expressions émotionnelles dans la pathologie autistique : approche comportementale et fonctionnelle." Thesis, Tours, 2008. http://www.theses.fr/2008TOUR3110/document.

Full text
Abstract:
L’autisme est un trouble développemental se caractérisant par des altérations de la socialisation associée à un déficit de la perception des visages et des émotions. Le but de ce travail fut de caractériser chez l’adulte et l’enfant le comportement oculaire lors de la perception de visages émotionnels ou non, et d’identifier les dysfonctionnements chez les sujets avec autisme. Une étude fonctionnelle a aussi été réalisée chez l’adulte lors la perception des visages émotionnels ou non. La maturation de l’exploration visuelle chez le sujet sain a été caractérisée et semble associée à un mécanisme d’expertise. Une altération de la mise en place d’une stratégie appropriée a été observée chez les sujets avec autisme et semble liée à une non focalisation de l’attention sur les zones pertinentes. La perception des émotions n’influencerait pas l’exploration des visages mais induirait un pattern d’activation propre à chaque émotion recrutant des structures impliquées dans des mécanismes miroirs. Chez les sujets avec autisme, les aires normalement impliquées dans le traitement de ces émotions ne s’activent pas, suggérant un dysfonctionnement du système miroir
Autism is a developmental disorder characterized by socialization troubles associated with a deficit of faces and emotional expressions perception. The aim of our work was to investigate typical development of gaze behaviour during face and emotion expression perception on a wide number of subjects, using an eye tracking system, and a fMRI to identify dysfunction in patients with autism. The work has established on healthy patients, the features of typical maturation of visual exploration during face scanning, which was due to an expertise mechanism. A deterioration of appropriate gaze exploration was observed in subjects with autism. This study revealed that the perception was not influenced by emotional expression but instead induced a pattern of activation of each emotion in healthy subjects. Indeed, a different pattern of activation was observed for each type of emotion. These observations suggest that the perception of emotion would appeal to mechanisms mirrors. In subjects with autism, most of the areas normally involved in the treatment of these emotions are not activated
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
40

Utrera, Melero Raquel. "Luminescent mechanochromic materials based on copper iodide clusters." Thesis, Nantes, 2020. http://www.theses.fr/2020NANT4074.

Full text
Abstract:
Les matériaux luminescents dont les propriétés sont modifiables sous l’effet de stimuli externes, présentent des applications potentielles en tant que systèmes de détection. Cette thèse a porté sur l’étude de clusters moléculaires d’iodure du cuivre (I) coordinés par des ligands phosphines, présentant des propriétés de mécanochromisme de luminescence. Ces composés se caractérisent par un changement de leur longueur d’onde d’émission en réponse à une sollicitation mécanique. Ainsi, au cours de cette thèse, de nouveaux clusters ont été synthétisés et caractérisés. L’établissement de relations structure-propriétés a permis d’étudier les mécanismes à l’origine de leurs propriétés mécanochromiques. Les principales techniques de caractérisation employées sont la RMN solide, la diffraction des rayons X, les spectroscopies Infrarouge et Raman. Des calculs DFT (Density functional theory) ont également été menés et ont permis de rationaliser les différents résultats obtenus et en particulier les propriétés optiques observées. En plus des propriétés de mécanochromisme, ces composés ont la particularité de présenter des propriétés de thermochromisme de luminescence. Des propriétés d’émission induite par agrégation (AIE) ont été aussi mises en évidence pour ces clusters. Afin d’obtenir des clusters présentant une émission multiple, des ligands portant de groupements luminescents ont également été étudiés
Materials exhibiting luminescence stimuli-responsive properties, present potential applications as detection systems. This thesis concerns the study of copper (I) iodide molecular clusters coordinated by phosphine ligands, which exhibit mechanochromic luminescence properties. These compounds are characterized by a change of their emission wavelength in response to mechanical stress. In this thesis, new clusters were synthesized and characterized. The establishment of structureproperties relationships permit to study the mechanisms responsible for their mechanochromic properties. The main characterization techniques used are solid-state NMR, X-ray diffraction, Infrared and Raman spectroscopies. DFT (Density functional theory) calculations were also carried out to rationalize the different results and in particular the optical properties. In addition to the mechanochromic properties, these compounds have the particularity of exhibiting thermochromic luminescence properties. Aggregation-induced emission (AIE) properties were also demonstrated for these clusters. In order to obtain clusters exhibiting multiple emission, ligands having luminescent groups were also studied
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
41

Bor, Julie. "Une nouvelle approche de la physiopathologie de la schizophrénie : imagerie des modifications cérébrales biochimiques et fonctionnelles induites par des thérapeutiques non pharmacologiques." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10147.

Full text
Abstract:
Malgré le développement de nouvelles générations d’antipsychotiques, certains symptômes schizophréniques ne répondent pas à ces traitements. S’appuyant sur des hypothèses physiopathologiques sous tendant ces symptômes, de nouvelles thérapeutiques comme la thérapie de remédiation cognitive et les techniques de neurostimulation externe ont été développées. Cette approche était restée essentiellement clinique. Dans ce travail, l’étude en imagerie des mécanismes biologiques sous tendant les effets bénéfiques de ces thérapeutiques non pharmacologiques nous a permis de tester des hypothèses physiopathologiques. L’IRM fonctionnelle (IRMf) et la spectroscopie par résonance magnétique (SRM) ont été utilisées pour rechercher les effets d’une thérapie de remédiation cognitive (TRC), de la stimulation magnétique transcrânienne (TMS) et de la stimulation électrique transcrânienne en courant continu (tDCS). Nous avons mis en évidence (1) que la TRC modifie les activations cérébrales durant une tâche de mémoire de travail chez des patients schizophrènes (2) que la TMS modifie la biochimie cérébrale de la zone stimulée et de régions cérébrales profondes chez un patient schizophrène, (3) que la tDCS modifie les réseaux de connectivité fonctionnelle d’une tâche de repos chez des volontaires sains
Despite the development of new generation antipsychotic drugs, some symptoms of schizophrenia do not respond to these treatments. Based on the pathophysiological hypothesis underlying these symptoms, new therapies such as cognitive remediation therapy and neurostimulation techniques have been developed. This approach remained essentially clinical. In this work, the study of biological mechanisms tending benefits of these non-pharmacological treatment has allowed us to test these pathophysiological hypotheses. Functional MRI (fMRI) and magnetic resonance spectroscopy (MRS) were used to investigate the effects of cognitive remediation therapy (CRT), transcranial magnetic stimulation (TMS) and transcranial direct current stimulation (tDCS). We demonstrated (1) that CRT modifies cerebral activations during a working memory task in patients with schizophrenia, (2) that TMS modifies brain biochemistry of the stimulated area and of deep brain regions in a patient with schizophrenia and (3) that tDCS modifies the functional connectivity in resting state networks of healthy volunteers
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
42

Machado, Kelly. "Chimie des Bains pour l’Electrolyse de l’Aluminium : Étude RMN Haute Température et Modélisation." Thesis, Orléans, 2017. http://www.theses.fr/2017ORLE2054/document.

Full text
Abstract:
Cette thèse porte sur l’étude structurale de mélanges de fluorures fondus utilisés pour la production d’aluminium par électrolyse. Ce procédé est obtenu par dissolution de l'alumine (Al₂O₃) dans un bain de cryolithe fondue (NaF-AlF₃ plus quelques additifs) à 960°C. Afin d’obtenir des données d’entrée pour la modélisation électrocinétique des phénomènes de transport durant le procédé, une meilleure description de la spéciation dans les bains en fonction de leur température et de leur composition est nécessaire.Pour déterminer cette spéciation in situ, nous avons développé une démarche originale combinant la spectroscopie par Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) à haute température avec des simulations de Dynamique Moléculaire (DM) couplés à des calculs de premiers principes. Ces derniers basés sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) ont permis de calculer les paramètres d’interaction mis en jeu lors des expériences RMN et d’évaluer la qualité des modèles issus de la DM par comparaison avec les données expérimentales.Les mesures et simulations effectuées dans les systèmes binaires MF-AlF₃ (M= Na ou K) ont confirmé la présence d’ions F‾ et d’espèces anioniques [AlFₓ]³‾ˣ avec une durée de vie comprise entre 5 et 25 ps. La probabilité de former des dimères du type [Al₂Fm]⁶‾ᵐ est inférieure à 10 %. Quel que soit l’alcalin, l’ajout d’alumine dans ces systèmes affecte la proportion d’espèce AlF5²‾ pour former des oxyfluoroaluminates : [Al₂OF6] ²‾, [Al₂OF8]⁴‾, [Al₂O₂F4] ²‾, [Al₂O₂F6]⁴‾ et [Al₂O₃F₂]²‾. Ces derniers sont peu influencés par la présence de CaF₂. En se dissociant partiellement, celui-ci contribue à modifier les équilibres chimiques vers les milieux plus basiques et à augmenter la coordinence moyenne des ions aluminium
This thesis deals with the structural study of molten fluorides mixtures used for aluminium production by electrolysis. This process is obtained by dissolving alumina (Al₂O₃) in a molten cryolite bath (NaF-AlF₃ plus some additives) at 960°C. In order to obtain input data for the electrokinetic modeling of transport phenomena during the process, a better description of speciation in baths as a function of their composition and temperature is required.To determine this in situ speciation, we developed an original approach combining high temperature nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy with Molecular Dynamics (MD) simulations coupled with first principle calculations. Based on the density functional theory (DFT), it was possible to calculate the interaction parameters involved in NMR experiments and to evaluate the quality of the models derived from MD when compared to the experimental data.The measurements and simulations carried out in the MF-AlF₃ binary systems (M = Na or K) confirmed the presence of F- and anionic species [AlFₓ]³‾ˣ with a lifetime between 5 and 25 ps. The probability of forming dimers [Al2Fm]6-m is less than 10%. Regardless of alkali, the addition of alumina in these systems affects the proportion of AlF5²‾ species to form oxyfluoroaluminates: [Al₂OF6] ²‾, [Al₂OF8]⁴‾, [Al₂O₂F4] ²‾, [Al₂O₂F6]⁴‾ et [Al₂O₃F₂]²‾. The latter are little influenced by the presence of CaF₂. By partially dissociating, this contributes to modifying the chemical equilibria towards the more basic media and to increasing the average coordination of the aluminium ions
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
43

Dabachi, Jamal. "Etude par RMN du solide multi-noyaux et modélisation des paramètres RMN de fluorures et d’oxyfluorures inorganiques." Thesis, Le Mans, 2017. http://www.theses.fr/2017LEMA1006/document.

Full text
Abstract:
Cette thèse porte sur l’étude structurale de fluorures et d'oxyfluorures, en combinant la RMN du solide, la diffraction des rayons X et les calculs PAW/GIPAW des paramètres RMN. La première partie est consacrée à l’étude des cinq composés du binaire KF-YF3. Des corrélations linéaires entre valeurs expérimentales de déplacements chimiques isotropes et de constantes d’écran isotropes calculées ont été établies pour 19F, 89Y et 39K, à partir des attributions des raies RMN aux sites cristallographiques. Ces corrélations conduisent à des accords satisfaisants. Dans le cas de 19F et 89Y, le lien entre paramètres RMN et environnement a été établie. Les paramètres RMN calculés de 39K permettent des reconstructions satisfaisantes des spectres complexes.La deuxième partie est dédiée à l’étude des deux phases ordonnées de LaOF. Les optimisations et les calculs de valence de liaison montrant que les positions atomiques de F et O devaient être inversées dans ces deux phases, leurs structures ont été réaffinées. L’accord entre paramètres RMN expérimentaux et calculés de 19F et 139La valide nos modèles structuraux. Enfin les composés MO2F (M = Nb, Ta), isotypes et désordonnés vu que les atomes de O et F occupent le même site anionique, ont été étudiés. Il est montré que la synthèse en milieu aqueux conduit à des composés hydroxylés lacunaires dont les compositions ont été déterminées en combinant RMN 19F, DRX sur poudre et ATG. La synthèse en phase solide permet d’obtenir ces composés purs. Les calculs DFT ont été réalisés sur des supermailles 3 × 3 × 3 en respectant l'ordre -M-O-M-O-M-F-. Le bon accord entre paramètres RMN de 19F expérimentaux et calculés valide les modèles proposé
This thesis focuses on the structural study of fluorides and oxyfluorides by combining solid state NMR, X-ray diffraction and PAW/GIPAW calculations of NMR parameters. The first part is devoted to the study of compounds of the KF-YF3 binary system. Linear correlation between experimental isotropic chemical shift (delta iso) and calculated isotropic shielding (sigma iso) values have been established, for 19F, 89Y and 39K, from assignments of NMR lines to crystallographic sites. These correlations lead to satisfactory agreements. In the case of 19F and 89Y, the link between NMR parameters and environment has been established. The calculated 39K NMR parameters allow satisfying reconstructions of the experimental complex spectra. The second part is dedicated to the study of the two ordered phases of LaOF. The optimizations and bond valence calculations showing that the atomic positions of F and O should be interchanged in both the phases, their structures have been refined. The agreement between experimental and calculated NMR parameters of 19F and 139La validates our structural models. Finally, the isotypic and disordered MO2F (M = Nb, Ta) compounds, since the O and F atoms occupy the same anionic site, have been studied. It is shown that the aqueous solution synthesis leads to hydroxylated and lacunary compounds, whose formulations have been determined by combining 19F NMR, XRD and TGA. The solid state synthesis enables to obtain pure compounds. DFT calculations were carried out on optimized 3 × 3 × 3 supercells that respect the partial order -M-O-M-O-M-F-. The good agreement between experimental and calculated NMR parameters of 19F validates the proposed model
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
44

Fadda, Elisa. "A new SOS-DFPT approximation for NMR shielding calculations : the Loc.3 correction applied to the catalytic mechanism of Serine Proteases." Thèse, [Montréal] : Université de Montréal, 2003. http://wwwlib.umi.com/cr/umontreal/fullcit?pNQ92745.

Full text
Abstract:
Thèse (Ph.D.) -- Université de Montréal, 2004.
"Thése [sic] présentée à la Faculté des études supérieures en vue de l'obtention du grade de Philosophiae Doctor (Ph.D.) en chimie" Version électronique également disponible sur Internet.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
45

Bamine-Abdesselam, Tahya. "Etudes combinées par RMN et calculs DFT de (fluoro, oxy)-phosphates de vanadium paramagnétiques pour les batteries Li-ion ou Na-ion." Thesis, Bordeaux, 2017. http://www.theses.fr/2017BORD0607/document.

Full text
Abstract:
Ce travail consiste en l’étude par RMN multinoyaux de matériauxparamagnétiques d’électrodes positives pour batteries Li ou Na-ion. La RMN du solidepermet une caractérisation de l’environnement local du noyau sondé grâce à l’exploitationdes interactions hyperfines dues à la présence d’une certaine densité d’électrons célibataires(déplacement de contact de Fermi) sur ce noyau (densité transférée selon des mécanismesplus ou moins complexes). Les matériaux étudiés sont des fluoro ou oxy phosphates devanadium de formules générales AVPO4X (A= Li ou Na; X = F, OH, ou OF) (structure typeTavorite), et Na3V2(PO4)2F1-xOx. Tous ces matériaux ont été caractérisés par RMN du 7Li ou23Na, 31P et 19F combiné à des calculs DFT, afin de mieux comprendre les structure etstructure électroniques locales. Notamment, ces études nous ont permis de mettre enévidence la présence de défauts dans certains matériaux et donc de discuter leur impact surles propriétés électrochimiques. L’utilisation de la méthode PAW nous a permis de modéliserdes défauts dilués dans des supermaille. Ensuite, l’impact de ces défauts sur la structurelocale a été étudié afin d’envisager les mécanismes de transfert de spin possibles etreproduire leur déplacements de RMN
Paramagnetic materials for positive electrodes for Li or Na-ion batteries havebeen studied by multinuclear NMR. The local environment of the probed nucleus can becharacterized by solid state NMR making use of hyperfine interactions due to transfer ofsome electron spin density (Fermi contact shift) on this nucleus, via more or less complexmechanisms. The materials studied are vanadium fluoro or oxy phosphates of generalformulas AVPO4X (A= Li or Na; X = F, OH, or OF) belonging to the Tavorite family and theNa3V2(PO4)2F1-xOx . All these materials have been characterized by 7Li or 23Na, 31P and 19F,combined with DFT calculations to better understand local electronic structures andstructures. In particular, these studies have enabled us to highlight the presence of defects incertain materials and to discuss their impact on the electrochemical properties. The use ofthe PAW method allowed us to model diluted defects in large supercells, to calculate theFermi contact shifts of the surrounding nuclei and to study the mechanisms of electron spintransfer. This allowed us to better understand the nature of defects in materials.For some systems, the mechanisms related to the intercalation or deintercalation of Li+ orNa+ ions have also been studied by NMR
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
46

Lisboa, Johnny. "Etude structurale et fonctionnelle de DprA et de ses partenaires au cours de la transformation génétique naturelle." Thesis, Paris 11, 2013. http://www.theses.fr/2013PA114853.

Full text
Abstract:
La transformation génétique naturelle est un mode de transfert horizontal de gènes chez les bactéries, qui contribue au maintien et à l'évolution de leurs génomes. C’est un mécanisme clé pour l’adaptation des bactéries, qui pourrait être responsable de la transmission des résistances aux antibiotiques observée en clinique chez certaines espèces pathogènes (S. pneumoniae, H. pylori,…). La transformation naturelle s’effectue par l’internalisation d’ADN exogène à travers la membrane, puis par sa prise en charge jusqu’à son intégration dans le chromosome bactérien par recombinaison homologue. Le processus de prise en charge fait intervenir la protéine DprA, très conservée dans le monde bactérien, impliquée dans la protection de l’ADN entrant contre les nucléases, et dans le recrutement de la recombinase universelle RecA sur l’ADNsb. DprA joue donc un rôle majeur et a récemment été décrite comme étant impliquée dans d’autres aspects de la transformation génétique naturelle, comme la fermeture de la compétence via une interaction directe avec le régulateur de réponse ComE, ou la levée de la barrière du système de restriction-modification afin de faciliter la transformation. Chez H. pylori, DprA est en opéron avec DprB, suggérant l’implication de ces 2 protéines dans une même voie et une interaction directe entre elles. DprA apparaît donc comme étant au cœur d’un véritable réseau d’interaction, protéique et nucléique
The natural genetic transformation is a mode of horizontal gene transfer that contributes to the maintenance and to the evolution of the genomes in bacteria. It is a key mechanism for their adaptation which could be responsible for the transmission of antibiotic resistances observed clinically for some pathogenic species (S. pneumoniae, H. pylori...). Natural transformation is performed by internalizing exogenous DNA followed by its processing and its integration into the bacterial chromosome by homologous recombination. The DNA processing involves the highly conserved DprA protein for the protection of the incoming DNA against nucleases and the recruitment of the universal recombinase RecA on ssDNA. DprA plays a key role and has recently been suggested to be involved in other aspects of the natural genetic transformation, such as the shut-off of the competence via a direct interaction with the response regulator ComE, or removal of the restriction-modification barrier system in order to facilitate the processing. In H. pylori, the dprA gene is in operon with dprB, whose function is unknown, suggesting their involvement in the same pathway and their likely direct interaction. DprA appears to be central in protein/nucleic acid interactions network
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
47

Nguyen, Long Hoang Bao. "Cristallochimie d’oxyphosphates fluorés de vanadium : De l’étude de leur structure à leurs performances en batteries Na-ion." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0356.

Full text
Abstract:
Les batteries Na-ion se développent comme une nouvelle alternative aux batteries Li-ion. Parmi le grand nombre de matériaux déjà étudiés à l’électrode positive, Na3V2(PO4)2F3 et Na3(VO)2(PO4)2F sont les plus performants grâce à des capacités théoriques élevées, des potentiels d’extraction des ions Na+ élevés, et la stabilité de la structure lors de cyclages longues durées. De plus, la structure et les propriétés électrochimiques des matériaux Na3V2(PO4)2F3 et Na3(VO)2(PO4)2F peuvent être modulées par un effet de substitution cationique ou anionique. Ce travail de thèse a pour but d’explorer la cristallochimie de nouveaux matériaux dérivés de Na3V2(PO4)2F3 et Na3(VO)2(PO4)2F. Dans un premier temps, différentes modes de synthèse (voies tout solide, céramique assistée par sol-gel, et broyage mécanique) sont explorées pour réaliser des substitutions cationiques et anioniques. La structure tridimensionnelle à longue distance de ces matériaux est déterminée par diffraction des rayons X synchrotron, tandis que les environnements locaux sont ensuite décrits finement en combinant des techniques de spectroscopies (résonance magnétique nucléaire à l’état solide, absorption des rayons X, et infra-rouge) dont l’interprétation est appuyée par des calculs théoriques. Les diagrammes de phases et les processus d’oxydoréduction impliqués lors des réactions de dés-intercalation et de ré-intercalation des ions Na+ de la structure hôte sont étudiés pour chacune des compositions, operando (cad. lors du fonctionnement de la batterie) en diffraction et absorption des rayons X synchrotron. Une compréhension des mécanismes structuraux et redox impliqués au cours du cyclage permet d’identifier les limitations de ces phases et de nous guider pour proposer des nouveaux matériaux dérivés présentant de meilleures performances
Na-ion batteries are currently developed as a future alternative to the conventional Li-ion batteries. Among all the polyanion materials studied as positive electrodes for Na-ion batteries, Na3V2(PO4)2F3 and Na3(VO)2(PO4)2F are the two promising compositions thanks to their high theoretical capacity, high Na+-extraction voltage, and especially the high stability of their structural framework upon long-term cycling. Furthermore, the crystal structure and the electrochemical properties of these materials can be greatly modulated through an effect of cationic or anionic substitution. This PhD work aims at exploring the diversity in crystal chemistry of Na3V2(PO4)2F3, Na3(VO)2(PO4)2F and their derivatives obtained through different synthesis methods. The three-dimensional long range crystal structure of these phases is determined by the use of high resolution synchrotron X-ray powder diffraction whereas their local atomic and electronic structures are investigated through a combination of solid-state nuclear magnetic resonance supported by first-principles theoretical calculations, synchrotron X-ray absorption spectroscopy and infrared spectroscopy. Thereafter, the phase diagram and the redox processes involved in the Na+ de-intercalation and intercalation are established thanks to operando synchrotron X-ray diffraction and absorption. An in-depth understanding on the crystal structure as well as the involved redox couples for each composition helps us to determine the limitations of these vanadium fluorinated oxy-phosphates and sheds light to the development of new materials with better performance based on their structure
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
48

Ait, Bentaleb Lahcen. "Études cognitive et neuroanatomique fonctionnelle des hallucinations auditives dans la schizophrénie." Thèse, 2003. http://hdl.handle.net/1866/14174.

Full text
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
49

R, Chabot Philippe. "Caractérisation structurale et fonctionnelle des interactions impliquant TFIIH et les domaines de transactivation viraux." Thèse, 2014. http://hdl.handle.net/1866/11003.

Full text
Abstract:
Le facteur de transcription IIH (TFIIH) joue un rôle crucial dans la transcription et dans la réparation de l’ADN. La sous-unité Tfb1/p62 (levure et humain) de TFIIH interagit avec de nombreux facteurs de transcription (p53, NFκB, TFIIEα) et de réparation (Rad2/XPG and Rad4/XPC) (1). La majorité des interactions avec Tfb1/p62 requiert le domaine d’homologie à la Pleckstrin (PH) localisé dans la région N-terminal de la protéine (2, 3). Ce domaine PH forme des complexes avec des domaines de transactivation acide provenant de protéines cibles impliquées dans la transcription et la réparation de l’ADN. De récentes études ont montré que Tfb1/p62 est une cible pour les protéines virales telles que la protéine VP16 du virus de l’herpès simplex (HSV) de type 1, la protéine E1 du virus du papillome humain (VPH) et la protéine EBNA-2 du virus Epstein-Barr (EBV) (4, 5). Ces protéines virales interagissent avec la sous-unité Tfb1/p62 par un domaine de transactivation acide suggérant une interaction similaire à ce qui est observé chez les facteurs de transcription humains comme p53. Ce mémoire présente une caractérisation structurelle et fonctionnelle du complexe formé par la protéine virale EBNA2 et la protéine humaine Tfb1/p62. L’analyse est faite en utilisant le titrage calorimétrique isotherme (ITC), la résonance magnétique nucléaire (RMN) et une expérience de transactivation chez la levure. Cette étude amène une plus grande compréhension des protéines impliquées dans les maladies comme le lymphome de Burkitt et le lymphome de Hodgkin qui sont souvent associées à l’infection à l’EBV (revue dans (6)) et caractérise une cible potentielle pour un antiviral.
The general transcription factor IIH (TFIIH) plays crucial roles in both transcription and DNA repair. Tfb1/p62 (yeast and human), one of the ten/eleven subunits of TFIIH, has been shown to interact with several important transcription (p53, NFκB, TFIIEα) and repair factors (Rad2/XPG and Rad4/XPC) (1). Most of the interactions with Tfb1/p62 require the Pleckstrin homology (PH) domain located at the amino-terminal end of the protein (2, 3). This PH domain in particular forms complexes with highly acidic domains from target proteins involved in both transcriptional activation and DNA repair. Recent studies has shown that the Tfb1/p62 subunit of TFIIH is also targeted by a number of viral proteins including the Herpes Simplex virus (HSV) protein VP16, the Human papillomavirus (HPV) protein HPV E1 and the Epstein-Barr virus (EBV) protein EBNA-2 (4, 5). These viral proteins interact with the Tfb1/p62 subunit via acidic domain which suggests that they are forming similar interactions as the one observed with human transcription and repair factors. This thesis provides a structural and functional characterization of the complex formed by the viral proteins EBNA2 and the human protein Tfb1/p62 subunit of TFIIH. The analysis is done using isothermal titration calorimetry (ITC), nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and a yeast activation assay. This study brings a greater understanding of proteins implicated in diseases such as the Burkitt’s lymphoma directly linked to an EBV infection (review in (6)) and shows a viable target for antiviral drug.
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
50

Fahim, Cherine. "Étude neuroanatomique fonctionnelle de l'émoussement affectif dans la schizophrénie : les implications du traitement à la quetiapine." Thèse, 2005. http://hdl.handle.net/1866/15689.

Full text
APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles
We offer discounts on all premium plans for authors whose works are included in thematic literature selections. Contact us to get a unique promo code!

To the bibliography