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Dissertations / Theses on the topic 'Rhizobium meliloti'
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1
Bardin, Sylvie D. "Phosphate uptake in Rhizobium meliloti." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/tape16/PQDD_0011/NQ30071.pdf.
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2
Grzemski, Wojciech. "Biochemical and molecular genetic studies of the Rhizobium meliloti mos locus." Title page, table of contents and summary only, 1994. http://web4.library.adelaide.edu.au/theses/09PH/09phg895.pdf.
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3
Ouahal, Mohamed. "Étude de l'activité de restriction chez Rhizobium meliloti." Lille 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LIL10114.
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4
Meek, David J. J. "Molecular and genetic characterization of putative TCA cycle operons on Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2001. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=33808.
Full textAbstract:
Genetic mapping of pDS15 revealed that this cosmid clone carries the Sinorhizobium meliloti TCA cycle genes mdh, sucCDAB, sdhAB and part of lpdA. Three genes (mdh, sucC , and sucA) were completely sequenced and submitted to GenBank. The nucleotide and amino acid sequences of the TCA cycle genes encoded on pDS15 were aligned and found to be highly homologous with other closely related rhizobial species. S. meliloti cells grown in LBmc express the mdh-sucCDAB operon as one transcript, based on RT-PCR results. Alternative sigma factor sigma54 was not found to have a role in mdh-sucCDAB expression. Despite considerable effort, we have not been able to isolate sucA mutants via random transposon Tn5tac1 mutagenesis to date. Homologous recombination between a plasmid-borne sucA::Tn5 and wild-type S. meliloti sucA failed to generate a bona fide mutant, as revealed by Southern blot analysis. Plasmid pDS15 was mutagenized with transposons Tn5, Tn5tac1, and Tn5-B20. Three Tn5-B20 insertions were mapped to mdh, sucD, and sucA respectively, and preliminary gene expression studies were done.
5
Thaha, Fathuma Zuleikha. "Characterization of acetate metabolism genes in Sinorhizobium, Rhizobium, meliloti." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape7/PQDD_0016/MQ55093.pdf.
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6
Bouslamti, Rabia. "L'absorption des phages chez Rhizobium meliloti : rôle des lipopolysaccharides." Lille 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LIL10121.
Full textAbstract:
L'adsorption d'un bactériophage sur rhizobium meliloti M11S a été étudiée. La nature lipopolyosidique des récepteurs est mise en évidence. L'analyse des LPS a révélé une forte proportion d'acides sialiques. La neutralisation des récepteurs pohagiques par la lectine spécifique de l'acide n-acetyl-neuraminique et par la déacétylation alcaline du LPS met en évidence l'importance des groupements acétyles des acides sialiques dans l'adsorption du phage
7
Shishido, Masahiro 1960. "Effectiveness of dominant Rhizobium meliloti indigenous to Arizona soil." Thesis, The University of Arizona, 1988. http://hdl.handle.net/10150/276929.
Full textAbstract:
A total of 200 Rhizobium meliloti isolates were sampled from alfalfa (Medicago sativa L.) nodules in five uninoculated fields throughout Arizona. Dominant strains (≥ 20% nodule occupancy at each site) were identified using plasmid profile analysis and intrinsic antibiotic resistance patterns. The major dominant strains and a commercial strain (102F77b) were evaluated for their N fixing effectiveness in a Leonard jar study. All strains were highly effective, and no significant differences were found (p ≥ 0.05) in shoot weight, root weight, nodule weight, acetylene reduction and total N content among the strain treatments. These effective dominant R. meliloti strains indigenous to Arizona soil probably contribute to the state's high alfalfa yield. Furthermore, indigenous strains AZTCYJ, AZSC, and AZY have potential as inoculants for arid lands due to their high effectiveness and unique resistances to extreme abiotic stresses present in arid land soils.
8
Kohring, Bodo. "Kultivierung von Bodenbakterien der Spezies Sinorhizobium meliloti und die Aufarbeitung ihrer Signalmoleküle." [S.l.] : [s.n.], 2001. http://deposit.ddb.de/cgi-bin/dokserv?idn=963784005.
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9
Werquin, Michel. "Les bacteriophages de rhizobium meliloti : isolement, multiplication, morphologie et classification." Lille 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LIL10165.
Full textAbstract:
33 bactériophages de rhizobium meliloti sont étudiés. Parmi ceux-ci, 21 ont été isolés du sol de champs de luzerne (medicago sativa l. ). Les 12 autres ont été obtenus par inductin aux rayons ultraviolet ou à la mitomycine c de 46 souches de R. Meliloti. Les bactériophages ont été caractérisés par leur morphologie, leur spécificité d'hôte, leurs propriétés antigèniques, les profils de restriction et les homologies de leurs ADN. Tous les phages observés montrent des particules à tête icosaédrique et à queue contractile ou non. Ils représentent 5 morphotypes différents correspondant aux familles des myoviridées (morphotype CM1, 11 phages); des siphoviridées (morphotype phi M11S, 3 phages; NM1, 5 phages; NM8, 12 phages) et des podoviridées (morphotype MM1H, 2 phages). Le type phagique NM1 est peu commun de par la présence de barres transversales sur la queue. Les phages du sol ont une large spécificité d'hôte tandis que les phages tempérés montrent des spécificités d'hôte plus ou moins étroites. Les profils de restriction et les expériences d'hybridation ADN-ADN indiquent que les génomes des 5 morphotypes ne sont pas apparentés. Les masses moléculaires estimées des ADN sont compatibles avec la taille des capsides excepté pour le phage NM8. Les phages du morphotype phi M11S ne correspondent a aucun autre phage de R. Meliloti décrit à ce jour et représentent donc une nouvelle espèce
10
Aneja, Punita. "Molecular genetic characterization of polyhydroxyalkanoate metabolism in Rhizobium (Sinorhizobium) meliloti." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape7/PQDD_0025/NQ50287.pdf.
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11
Lauzon, Jean-François. "Characterization of TN5TAC1 conditional mutants of Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2006. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=98745.
Full textAbstract:
Four Sinorhizobium meliloti mutants with IPTG-dependent phenotypes were isolated via random Tn5tac1 mutagenesis. The growth phenotypes of Rm30192 (pheT), Rm30193 (ffh ), and Rm300196 (unmapped) were conditional on the presence of IPTG, while that of Rm30194 was conditional on its absence. The insertion in Rm30194 is upstream of tacA, which appears to be under conditional control of the Tn5tac1 Ptac. While all four strains formed root nodules on alfalfa, Rm300192 and Rm30193 attained only 53% and 36% respectively, of the wild-type shoot dry weight value.<br>Five previously isolated Tn5tac1 mutants were also characterized. Significantly, Rm30044 (bhbA) was able to use arabinose but not glutamate as sole carbon source, a novel finding. Finally, Rm30047 (gpsA), which lacks NADPH-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase (G3PDH) activity, was found to have an NADH-dependent G3PDH activity that was repressed by IPTG, possibly due to conditional expression by the Tn5tac1 P tac of genes downstream of gpsA.
12
Klein, Shoshana. "The role of rhizobium meliloti exopolysaccharide in nodulation of alfalfa." Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 1987. http://hdl.handle.net/1721.1/14626.
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13
LeCour, Louis (Louis Francis) 1970. "Studies of symbiotically important Rhizobium meliloti exopolysaccharides EPSII and succinoglycan." Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 1999. http://hdl.handle.net/1721.1/85367.
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14
TALIBART, ROLAND. "MECANISMES IMPLIQUES DANS L'ADAPTATION AU STRESS HYPEROSMOTIQUE CHEZ Rhizobium meliloti." Rennes 1, 1993. http://www.theses.fr/1993REN10147.
Full textAbstract:
La glycine betaine restaure la croissance de r. Meliloti (bacterie symbiotique fixatrice d'azote) lorsque celle-ci est cultivee en milieu de forte pression osmotique. Nous avons, lors de cette these, identifie, partiellement purifie et caracterise la proteine affine impliquee dans le transport de la glycine betaine avant d'etudier la regulation de la synthese de cette proteine et les relations osmoprotecteurs endogenes/ectoine et glycine betaine chez cette bacterie. Nous avons identifie, par une technique originale d'affinomarquage avec des ligands marques au c#1#4, la proteine affine pour la glycine betaine (pagb) impliquee dans le transport de cette molecule ainsi que d'autres proteines periplasmiques de liaison. La chromatographie d'echange d'ions combinee a l'electrophorese sur suspension d'agarose a permis de purifier partiellement la pagb sous sa forme native et de preparer un serum dirige contre cette proteine. La caracterisation de ce polypeptide montre qu'il possede une masse apparente de 33 kda, un pl de 4,3, une grande thermostabilite et des ponts disulfure intramoleculaires indispensables a l'activite biologique. D'autre part, la comparaison des pagb d'e. Coli et r. Meliloti indique qu'il s'agit de deux proteines qui different par leur pl, leur antigenicite et leur specificite de liaison mais qu'elles peuvent interagir avec le meme complexe membranaire du systeme de transport. A l'aide de l'immunoelectrophorese quantitative, nous avons ensuite montre que la synthese de cette proteine etait augmentee proportionnellement avec l'osmolarite du milieu de culture et que, contrairement a ce qui est observe chez e. Coli, la glycine betaine ne la reprimait pas. D'autre part, nous avons mis en evidence chez d'autres rhizobia et bradyrhizobia que la presence de cette proteine et de l'activite de transport de la glycine betaine n'etait pas correlee avec le pouvoir osmoprotecteur de cette molecule. Les modalites de transport de l'ectoine et ses potentialites osmoprotectrices chez cette bacterie ont ensuite ete comparees a celles du modele de la glycine betaine. Le transport de l'ectoine est induit par son substrat et fait intervenir une proteine affine distincte de la pagb. Cette molecule etant entierement degradee dans la cellule, son pouvoir osmoprotecteur chez r. Meliloti n'est pas du a un processus d'accumulation intracellulaire, mais plutot a une augmentation de la synthese de l'osmoprotecteur endogene qu'est le glutamate. En comparaison, la glycine betaine est accumulee intracellulairement jusqu'a une concentration de 0,6 m et metabolisee aussitot, jusqu'a son epuisement dans la cellule. Ce phenomene induit la synthese des osmoprotecteurs endogenes comme le glutamate, l'amide n-acetyl-glutaminyl-glutamine et le trehalose. Il y a donc, dans ce cas, une succession de deux modes d'osmoprotection durant la croissance de la bacterie
15
Theodoropoulos, Panayotis. "Le transport du glucose et sa régulation chez Rhizobium meliloti." Lille 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LIL10012.
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16
Theodoropoulos, Panayotis. "Le Transport du glucose et sa régulation chez Rhizobium meliloti." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37601501b.
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17
CREN, MICHELE. "Interaction rhizobium meliloti/medicago : caracterisation et role physiologique du represseur nolr." Paris 11, 1994. http://www.theses.fr/1994PA112183.
Full textAbstract:
Rhizobium meliloti est une bacterie du sol qui forme des nodules fixateurs d'azote sur les racines de sa plante hote medicago sativa. L'etablissement de cette symbiose implique plusieurs echanges de signaux entre les partenaires. L'organogenese du nodule s'etablit grace a deux signaux consecutifs. Tout d'abord, les flavonoides exsudes par la plante hote, en conjonction avec la proteine nodd de la bacterie, induisent specifiquement l'expression des genes bacteriens de nodulation (nod et nol). Puis, les enzymes codees par ces genes participent a la synthese de facteurs nod, lipooligosaccharides emis par la bacterie et impliques dans la formation des nodules. Ces facteurs agissent a des concentrations de l'ordre du nano- et du pico-molaire. Nos resultats montrent que le represseur de l'expression des genes nod, nolr, joue un role important dans la production optimale de ces molecules. Le gene chromosomique nolr code pour une proteine de 13kda, active sous forme de dimere et contenant, dans sa partie n-terminale, un domaine helice-coude-helice fonctionnel. La partie c-terminale de la proteine joue un role essentiel dans l'activite de la proteine et serait impliquee dans la formation de dimeres. Le represseur nolr controle l'expression de tous les genes nod, exceptee celle des genes nod de specificite d'hote, ainsi que sa propre expression. Cette regulation differentielle des genes nod par nolr semble necessaire pour une nodulation optimale de la plante hote
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El-Haloui, Nour-Eddine. "Incidences de la mobilité et du chimiotactisme sur la compétitivité chez Rhizobium meliloti." Lille 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LIL10056.
Full textAbstract:
Dans la première partie du travail, l'influence de la mobilité et du chimiotactisme sur la compétitivité est étudiée après isolement de mutants affectés sur ces caractères et préparés à partir de la souche de Rhizobium meliloti Ve26. Trois types de mutants ont été isolés : un mutant non mobile (mob-), un mutant non chimitactique (che-) et un mutant hypermobile (mob+). Toutes les souches étudiées ont été rendues résistantes à des antibiotiiques différents afin de pouvoir les identifier dans les trsts biologiques. De tels marquages n'ont pas provoqué d'altération de leurs propriétés symbiotiques. En milieu liquide, les mutants ne présentent pas de différence de leur infectivité et de leur efficience par rapport au type sauvage parental. En substrat solide (essais en mini-serre expérimentale), la mobilité et le chimitactisme confèrent un avantage compétitif incontestable lors d'inoculations mixtes de souches de R. Meliloti. La seconde partie du travail concerne l'étude de la compétitivité d'une autre souche de R. Meliloti (2011) avec les mutants de la souche Ve26 (mob+ et mob-). Un effet antagoniste pour la nodulation entre la souche 2011 et le mutant Ve26 mob- est mis en évidence ; l'importance de la mobilité est de toute première importance puisque cet effet est "masqué" quand la souche 2011 est inoculée avec le mutant Ve26 mob+.
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Defives, Claude. "La relation phage-bactérie chez Rhizobium meliloti : rôle des polysaccharides de surface." Lille 1, 1991. http://www.theses.fr/1991LIL10059.
Full textAbstract:
Rhizobium meliloti est une bactérie induisant chez la Luzerne une symbiose qui aboutit à l'assimilation de l'azote atmosphérique dans des nodules racinaires. Prédateurs des bactéries, les bactériophages semblent jouer un rôle non négligeable sur les populations bactériennes de la rhizosphère et ainsi influencer la symbiose. Nous avons donc étudié quelques aspects de la relation entre R. Meliloti et ses rhizobiophages. Dans une première partie, nous avons précisé l'importance des ions bivalents Ca2+ et Mg2+ et de la multiplicité d'infection. Des cinétiques nous ont permis de mesurer les durées de lyse et les rendements en phage. De plus, nous avons montré que l'infection phagique est contrôlée par des systèmes de Restriction-Modification bactériens. Dans une deuxième partie, nous avons réalisé une étude de l'adsorption du phage sur les bactéries. Ainsi, nous avons constaté que l'accumulation des exopolysaccharides (EPS), secrétés par R. Meliloti lors de sa croissance, constitue une barrière physique qui gène l'adsorption. Seul le phage CM1 est capable d'agir sur ces EPS grâce à une activité originale associant une dépolymérase et une succinylestérase qui élimine la plus grande partie des succinates substituant les EPS. Les véritables récepteurs phagiques sont les lipopolysaccharides (LPS). Après extraction et purification, l'analyse des LPS par chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse a permis d'identifier les acides gras et les oses constitutifs parmi lesquels il est remarquable de constater la présence d'acide-N-acétylneuraminique et 9-O-N-acétylneuraminique très inhabituels dans les LPS bactériens. Nous avons déterminé que la fraction osidique du LPS neutralisait le rhizobiophage NM8 et mis en évidence le rople majeur des acides sialiques et, en particulier, les fonctions acétyles dans l'adsorption phagique. L'action d'une neuraminidase a détruit les sites récepteurs des phages suggérant ainsi une location externe des acides sialiques dans les LPS
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Guezzar, Mounir El. "Contribution à l'étude de la symbiose rhizobium-légumineuse : obtentions et études de deux mutants métaboliques de rhizobium meliloti." Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10220.
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21
El, Guezzar Mounir. "Contribution à l'étude de la symbiose rhizobium-légumineuse obtentions et études de deux mutants métaboliques de Rhizobium meliloti /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376056398.
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22
Trottier, Oliver. "Genetic characterization of gamma-aminobutyrate metabolism in Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2008. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=111551.
Full textAbstract:
Transcriptional fusion mutants and Tn5-B20 transposon mutants were isolated where the only genes affected are believed to either be involved in the hypothetical GABA shunt or code for subunits of the alpha-ketoglutarate dehydrogenase enzyme complex of Sinorhizobium meliloti. The growth phenotypes of Rm30222 (gabT) and eight mutants in gabD1, 2, 3, and 4 on minimal media were comparable to that of the wild-type. Compared to wild-type, Rm30222 (gabT) lacked alpha-ketoglutarate-dependent gamma-aminobutyrate transaminase activity showed high induction of gabT on GABA but produced green plants indicative of being Fix+. Mutants in gabD alleles maintained wild-type levels of succinic semialdehyde dehydrogenase activity and could fix nitrogen as well as the wild-type in symbiosis.<br>Mutation of sucB encoding a subunit of a-ketoglutarate dehydrogenase produced a mutant, Rm30230, that initially had difficulty growing on minimal media supplemented with either arabinose or glutamate. In symbiosis with alfalfa, Rm30230 had a fix- phenotype and was also devoid of alpha-ketoglutarate dehydrogenase activity. The ability of Rm30230 to grow on arabinose or glutamate, without alpha-ketoglutarate dehydrogenase activity, strengthens the hypothesis that S. meliloti has a functional GABA shunt allowing it to circumvent the forward-direction TCA cycle from alpha-ketoglutarate to succinate. Mutation of the second potential dihydrolipoamide succinyltransferase component (E2) of alpha-ketoglutarate dehydrogenase yielded Rm30267 (SMb20019) with wild-type growth on minimal media and a Fix+ phenotype in plants. The introduction or a sucB mutation into the SMb20019 mutant background (Rm30275) was comparable to the sole sucB mutation. This finding shows that the locus SMb20019 cannot be substituted for sucB in the alpha-ketoglutarate dehydrogenase enzyme complex.
23
Dymov, Sergiy. "Isolation and characterization of malate dehydrogenase mutant of Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2000. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=31224.
Full textAbstract:
A Sinorhizobium meliloti (S. meliloti ) mutant, Rm30O49, deficient in malate dehydrogenase (MDH) activity was isolated via random Tn5tac1 mutagenesis. DNA sequence analyses revealed 60 the inaction is within the mdh gene. Rm30049 lacks MDH activity under all growth conditions, but shows increased or decreased activities of the TCA cycle enzymes 2-oxoglutarate dehydrogenase and succinate dehydrogenase in the presence or absence, respectively, of IPTG (isopropyl beta-D-thiogalactoside). The symbiotic phenotype of the mutant is an inability to fix nitrogen. Alfalfa seedlings inoculated with Rm30049 produced small white root nodules, but were chlorotic and failed to reach a wild-type shoot dry weight. Cosmid clone pDS15 was isolated by heterologous complementation of a Rhizobium leguminosarum sucD mutant by the S. meliloti pLAFR1 clone bank. This cosmid also restored MDH activity to Rm30049, and complemented the mutant growth and symbiotic phenotypes. Three Tn5 insertions isolated in pDS15 within sucA failed to complement Rm30049. DNA sequence analyses indicate that the mdh gene is part of the TCA cycle operon with sucCD, and that downstream and upstream of this, are operons encoding sucAB and sdhCDAB, respectively.
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Moreno, Troconis Miryam. "Symbiose Rhizobium meliloti - Medicago sativa : mesure de la compétition des souches pour la formation des nodosités." Dijon, 1986. http://www.theses.fr/1986DIJOS010.
Full textAbstract:
Nous avons cherché à déterminer si des mesures simplifiées, réalisées au laboratoire, pouvaient permettre de mesurer l'aptitude de souches de Rhizobium meliloti à former des nodosités sur la luzerne lorsque ces souches sont apportées dans un sol contenant des rhizobium de même spécificité. Deux méthodes, directe et indirecte, ont été effectuées en tube, sur sable et sur terre. Nous avons pu montrer que la fonction: NA : NB = CAB(IA:IB)**(k) (Amarger-Lobreau, 1982) s'appliquait pour Rhizobium meliloti. L'utilisation de la méthode directe doit permettre de faire un tri rapide sur un nombre relativement important des souches.
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Willis, Laura B. (Laura Bethg) 1967. "Identification and characterization of novel Rhizobium meliloti genes involved in carbon metabolism." Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 1998. http://hdl.handle.net/1721.1/50353.
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26
Sancan, Jean-Philippe. "Les glycoprotéines riches en hydroxiproline (HRGPs) dans la symbiose luzerne - Rhizobium meliloti." Toulouse 3, 1993. http://www.theses.fr/1993TOU30113.
Full textAbstract:
Les glycoproteines riches en hydroxyproline (hrgps) sont des molecules structurales presentes dans la paroi primaire des vegetaux superieurs. Elles s'accumulent fortement en reponse a des variations de nombreux facteurs de l'environnement. Leur participation dans les mecanismes de defense des plantes ayant ete clairement demontree, nous avons cherche a les caracteriser et a etudier leur role dans un cas d'acceptation mutuelle apparente: la symbiose rhizobium meliloti-luzerne, et dans differents cas de nutrition azotee, impliquant en particulier la presence de nitrate en concentration inhibitrice de nodulation. Au plan biochimique, les resultats obtenus montrent que l'inoculation ou l'apport de nitrate exogene a des plantes deja inoculees modifient fortement le profil de glycosylation des hrgps parietales presentes dans les racines.
27
Leprevost, Corinne. "Etude de la modification des caractères de Rhizobium meliloti après transformation génétique." Lille 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LIL10086.
Full textAbstract:
L'application d'une technique de transformation génétique à une souche de Rhizobium meliloti M5N1 exigeante en isoleucine et en valine (Ile- Val-) a permis le transfert des caractères Ile+ et Val+. Les cellules transformées obtenues qui présentent des modifications morphologiques par rapport à la souche initiale ont aussi perdu le caractère muqueux ; certaines de ces cellules sont devenues incapables d'infecter la luzerne. L'expression des caractères correspondant à une information génétique spécifique, nous avons analysé le contenu plasmidique des bactéries transformées. Cette étude a révélé d'importantes modifications soit la disparition des plasmides indigènes de la souche initiale avec ou sans apparition d'un nouveau plasmide de poids moléculaire inférieur à ceux initialement présents. Grâce à l'utilisation des techniques d'hybridation DNA/DNA, nous avons montré que le DNA des plasmides indigènes de la souche parentale est toujours présent chez les clones transformés. Non visualisable sous une forme plasmidique, suite au transfert génétique, il a vraisemblablement été intégré dans le chromosome. L'analyse des petits plasmides apparus chez les souches transformées indique qu'ils ne proviennent pas du plasmide moyen de la souche initiale mais qu'ils pourraient s'être constitués à partir du DNA transformant. L'infection de plantules de luzerne par des clones transformés a conduit à l'obtention de clones ayant réacquis à la fois les caractères phénotypiques de la souche initiale ainsi que les plasmides présents chez les bactéries avant la transformation. L'intégration des plasmides dans le chromosome a été confirmée.
28
JAN, SOPHIE. "Croissance et production de biolymeres par rhizobium meliloti m5n1 : effect de l'environnement." Amiens, 1995. http://www.theses.fr/1995AMIE0102.
Full textAbstract:
Ce travail permet d'evaluer le role du microenvironnement sur la physiologie d'une souche de rhizobium meliloti, symbiote de la luzerne (alfalfa). Trois systemes de culture sont utilises : cellules en suspension, cellules immobilisees dans une matrice polysaccharidique (-carraghenane) et cellules adsorbees sur un support solide (mousse de polyurethane). En complement des techniques microbiologiques classiques permettant l'etude de la croissance des cellules (denombrement des cellules viables, mesures de biomasse et de densite optique), differentes techniques d'analyse sont mises en uvre pour l'etude de la phase stationnaire : la spectroscopie de resonance magnetique nucleaire (rmn) et la cytometrie en flux (cf) sont utilisees pour la detection et le dosage du poly-3-hydroxybutyrate (phb). Une technique plus conventionnelle est utilisee en complement : la chromatographie en phase gazeuse (cpg). La nature des exopolysaccharides (eps) produits par les cellules dans les differents systemes de culture est determinee par spectroscopie de rmn et par chromatographie liquide haute performance (hplc). Les contenus en adn et en proteines sont etudies par cf. En presence de fructose, on note la production simultanee d'eps et de phb par les cellules libres et immobilisees, au cours de la phase stationnaire. Les cellules incluses dans le gel polysaccharidique montrent cependant des contenus inferieurs en phb et en proteines. Ces phenomenes peuvent etre lies aux problemes de transfert de masse au sein du support. Par ailleurs, ces travaux montrent les fortes capacites d'adsorption des cellules sur un support solide. Le processus d'adsorption peut etre decompose en deux etapes, la premiere permettant la primo-adhesion des cellules au support et la seconde permettant leur adhesion definitive. Cette deuxieme etape met en jeu la production d'exostructures.
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Infante, Herrera Diógenes José. "Étude de fonctions symbiotiques codées par le mégaplasmide pSym de Rhizobium meliloti." Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112129.
Full textAbstract:
Chez Rhizobiummeliloti, le partenaire symbiotique de la luzerne, les gènes impliqués dans la reconnaissance et l'infection de l'hôte (gènes nod) et les gènes de structure de la nitrogénase (gènes nifHDK) sont portés par un Mégaplasmide de 1500 Kb, le pSym. Une région de 300 Kb du pSym qui porte les gènes nifHDK et les gènes nod ont été clonée dans un vecteur transmissible, le RP4. Le plasmide hybride ainsi obtenu a été utilisé pour mutagéniser à l'aide du transposon Tn7 la région correspondante du pSym. Nous avons montré que cette région de 300 Kb porte un site dans lequel le Tn7 s'insère à très haute fréquence chez Escherichia coli. Le sous-clonage d'un fragment de 9,2 Kb portant ce point-chaud dans le vecteur RP4 nous a permis de démontrer l'influence de l'hôte sur la fréquence de transposition du Tn7 : la fréquence d'insertion dans le point-chaud chez R. Meliloti est de plusieurs ordres de grandeur inférieure à celle chez E. Coli. Ceci confirme que la fréquence de transposition dépend du contexte cellulaire. Malgré l'existence de ce point-chaud, la mutagenèse par transposon a permis de mettre en évidence un groupe de gènes fix situés à 200 Kb de nifKDH. Grâce à l'utilisation de délétions, nous avons démontré qu'entre ces gènes fix et les gènes nod distants de 160 Kb environ il n'y a pas de gènes symbiotiques. L'utilisation de délétions site-dirigées et la mutagenèse par transposon nous a permis de trouver la frontière gauche de ce cluster fix. La répartition des gènes symbiotiques sur le pSym est donc tout à fait irrégulière, des "clusters" de gènes symbiotiques étant séparés par des régions silencieuses<br>In R. Meliloti, the symbiotic partner of alfalfa, involved in host recognition and inffection (nod genes) and. Nitrogenase (nif) are carried by pSym a 1500 Kb megaplasmid. A 300 Kb region of pSym wich carries the nod genes as well as nifHDK was cloned on a RP4, a trasmissible vectar. The hybrid plasmid thus obtained was used to mutagenize the homologus region of pSym by inserting the transposon Tn7 into the cloned region in E. Coli and then introducing the mutated fragment by homologus recombination. This allowed us to show that the 300 Kb pSym region carries a hat spot for Tn7 insertion in E. Coli. We subcloned a 9 Kb fragment carrying this hat spot in the RP4 vector. This allowed us to demonstrate the influence of the host and the transposition frequency of Tn7. The insertion frequency in the host spot in R. Melilotiis several orders of magnitude lower than in E. Coli. This confirm that the transposition frequency of a transposon in a given DNA is strongly dependent and the cellular contex. In spite of the presence of this hot spot, Tn7 mutagenesis led to the discovery of a cluster of fix genes 200 Kb distant from nifHDK. The use of large deletions allowed us to show that there are no symbiotic genes between this new fix cluster and the nod genes which are about 160 Kb distant. Furthermore using site directed deletion or transposon mutagenesis we could determine the left border of the new fix cluster. Then the symbiotic genes presents in the pSym megaplasmid are clustered
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Daveran, Marie-Line. "Structure et transcription des genes de fixation de l'azote de rhizobium meliloti." Toulouse 3, 1988. http://www.theses.fr/1988TOU30001.
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Infante, Herrera Diogenes José. "Etude de fonctions symbiotiques codées par le megaplasmide pSym de Rhizobium meliloti." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37606125f.
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Daveran, Marie-Line. "Structure et transcription des gènes de fixation de l'azote de Rhizobium meliloti." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37612936j.
Full text
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Arcondéguy, Tania. "Régulation de l'assimilation de l'azote chez le symbiote de la luzerne, Rhizobium meliloti." Toulouse 3, 1996. http://www.theses.fr/1996TOU30189.
Full textAbstract:
Rhizobium est capable d'induire sur les racines de legumineuses de veritables organes vegetaux au sein desquels les bacteries reduisent l'azote atmospherique en ion ammonium grace au complexe enzymatique nitrogenase. Lors de cette symbiose, rhizobium envahit le cytoplasme des cellules hotes et se differencie en bacteroide fixateur d'azote. En echange de substrats carbones, cet organelle produit l'ammoniac, normalement assimile par les glutamine-synthetases nodulaires. L'harmonie de ce systeme repose en particulier sur la regulation des fonctions anaboliques du bacteroide qui, lors de sa differenciation de bacterie en bacteroide, passe d'un etat d'assimilation de l'azote vers un etat d'export de l'azote. Le controle du metabolisme azote chez les bacteries met en jeu un regulateur central code par le gene glnb, la proteine p#i#i. Selon le modele qui a ete developpe chez les enterobacteries, la proteine p#i#i est modifiee par uridylylation en fonction du statut azote de la cellule. Cette proteine controle l'activite de la glutamine synthetase (gs) au niveau genetique et metabolique. Au niveau genetique, la proteine p#i#i regule l'expression du gene de la gs, glna, par l'intermediaire de l'activateur transcriptionnel ntrc. Au niveau metabolique, la proteine p#i#i regule l'activite de la gs en modulant son adenylylation. Rhizobium meliloti possede trois glutamine-synthetases, gsi, gsii et gsiii. La proteine gsi homologue de la gs des enterobacteries est la seule gs de rhizobium exprimee en symbiose. Au cours de cette these, nous avons etudie la regulation de l'activite de la gsi et le role de la proteine p#i39i dans la symbiose entre rhizobium meliloti et la luzerne. En culture pure, les mutants glnb sont severement alteres au niveau du metabolisme azote: deregulation de l'adenylylation de la gsi et de l'expression du gene glnii codant pour la gsii. De plus, les mutants glnb sont fortement affectes dans leur phenotype symbiotique. Ils entrainent un retard de nodulation associe a un defaut d'infection. Bien que les nodules formes contiennent un niveau eleve de nitrogenase, les plantes presentent une carence azotee manifeste. Cette carence s'accompagne d'une forte accumulation d'amidon dans la zone de fixation du nodule, symptome d'une perturbation de l'equilibre carbone/azote dans les cellules vegetales. Une cible connue de la proteine p#i#i chez les enterobacteries est l'adenylylation de la gs. Nous avons teste le role de l'adenylylation de la gsi de rhizobium meliloti en symbiose, par la construction d'une souche dont la gsi n'est pas adenylylable. Nous pensions qu'un tel mutant perturberait le flux d'azote du bacteroide vers la plante. Contrairement a cette attente, ce mutant presente un phenotype symbiotique nod#+ fix#+ de type sauvage. Ce phenotype s'explique par une faible activite gsi dans les bacteroides. L'effet de la proteine p#i#i sur la symbiose est donc du a d'autres effets. Une hypothese serait que la proteine p#i#i regule l'expression ou l'activite d'un transporteur d'ammoniac bacteroidien dont la presence serait indispensable a la nutrition azotee de la plante-hote
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Cai, Guo Qin 1966. "Molecular genetic analysis of acetoacetate metabolism in Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2001. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=37876.
Full textAbstract:
Many bacteria accumulate carbon stores as poly-3-hydroxybutyrate (PHB) when growth is limited but carbon availability is not. This stored carbon can then be utilized during conditions of limited carbon availability. The net PHB accumulation in the cell is dependent on the balance between PHB synthesis and degradation. Sinorhizobium meliloti accumulates PHB in the free-living stage but not in the symbiotic stage. The physiological role of the PHB cycle in S. meliloti is unknown. As a first step to understand the genetics of PHB degradation, transposon-generated mutants that were not able to use PHB degradation intermediates, such as 3-hydroxybutyrate and acetoacetate, as a sole carbon source, were isolated. Genetic mapping revealed that there were at least three chromosomal loci involved in acetoacetate metabolism. Identification of these three loci determined that in S. meliloti: (1) acetoacetyl-CoA synthetase (AcsA), encoded by acsA2 gene, rather than the enzyme acetoacetate:succinyl-CoA transferase, is the enzyme that catalyzes activation of acetoacetate to acetoacetyl-CoA; (2) PHB synthase, encoded by phbC, is required for acetoacetate utilization; (3) a putative transporter protein encoding gene, aau-3, may also be involved in acetoacetate metabolism. acsA2 and aau-3 were 78% linked in co-transduction, while phbC was mapped to somewhere else on the chromosome. Biochemical analysis revealed that acsA2::Tn5 mutants lacked AcsA activity but not acetoacetate:succinyl-CoA transferase activity, while phbC::Tn5 maintained similar level of AcsA activity as wild type in vitro. PHB was absent in the phbC mutant.<br>One transposon-generated mutant, age-1, showed enhanced growth rate on acetoacetate medium. Genetic mapping and transductional analysis indicated that the location of the mutation in age-1 is tightly linked to acsA2. Fine mapping with PCR and DNA sequence techniques showed that Tn5 in age-1 was located at 132 by upstream of the putative translation start site of acsA2. Gene expression analysis indicated that age-1 insertion results in elevated transcription of acsA2. Thus enhanced growth rate on acetoacetate was due to the increased gene expression. acsA2 transcription was induced by acetoacetate and 3-hydroxybutyrate, and repressed by glucose and acetate.<br>All mutants formed root nodules that fixed nitrogen with varying decrease of impairment. Acetoacetate metabolism and the PHB degradation are not essential for symbiosis.
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D'Aoust, Frédéric. "Characterization of the nod and sdh operons in the legume symbionts Bradyrhizobium japonicum and Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2005. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=100341.
Full textAbstract:
This study was undertaken to characterize the nod and sdh operons of Bradyrhizobium japonicum and Sinorhizobium meliloti. Ten putative B. japonicum mutants with altered nod gene induction characteristics were isolated by screening mutants for genistein-independent nod gene expression. The mutants were found to have higher nodY expression than the wild-type in the presence of genistein. The increased sensitivity of all mutants to genistein was more apparent under suboptimal inducer concentration (0.1muM) and/or temperature (15°C). The expression of nodY gene induction was determined for five strains (Bj30050, 53, 56, 57, 58) under different temperature and inducer conditions. These five strains were also found to produce more lipochitooligosaccharide than the wild-type, at both 25°C and 15°C. Three of the ten mutant strains (including Bj30056 and 57) were unable to fix nitrogen with soybeans grown at optimal temperatures. Based on nodY gene expression and symbiotic phenotype the B. japonicum mutants were classified into three groups.<br>A molecular genetic approach was taken to investigate the regulation of expression of succinate dehydrogenase (SDH) in S. meliloti. The sdhCDAB genes encoding SDH were shown by RT-PCR to be co-transcribed and thus constitute an operon. The transcriptional start site and putative promoter region of the first gene in the operon, sdhC , were identified by 5'-RACE and DNA sequence analysis. Transcriptional lacZ fusions to sdhC indicated that expression of the operon is regulated by carbon source in the growth medium but not by growth phase. The highest expression of the sdh operon was observed in cells grown with acetate, arabinose and glutamate, as sole carbon sources, and the lowest expression was observed in cells grown with glucose and pyruvate as sole carbon sources.<br>Also presented is the isolation and characterization of the first defined sdh mutant in a rhizobial species. The mutants helped demonstrate that the total lack of SDH activity would be lethal to S. meliloti cells. Symbiotic phenotype of the mutants indicated that SDH is required for N2-fixation.
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Syska, Camille. "Les systèmes Toxine-Antitoxine VapBC : des régulateurs de la symbiose fixatrice d'azote Rhizobium-Légumineuse." Electronic Thesis or Diss., Université Côte d'Azur, 2020. http://theses.univ-cotedazur.fr/2020COAZ6029.
Full textAbstract:
Lors de la symbiose fixatrice d’azote entre la légumineuse modèle Medicago truncatula et la rhizobiacée Sinorhizobium meliloti, les bactéries, différenciées en bactéroïdes dans la nodosité, réduisent l’azote atmosphérique (N2) en ammoniac (NH3), directement assimilable par la plante. En contrepartie, la plante fournit à son symbiote une niche écologique et des substrats carbonés. Tout au long de l’interaction, la bactérie est confrontée à des microenvironnements changeants depuis la vie libre dans le sol, l’infection et l’invasion des cellules végétales, la différenciation en bactéroïde fixateur et finalement la rupture symbiotique. Afin de mieux comprendre les mécanismes d‘adaptation rapide développés par S. meliloti lors de la symbiose, nous nous sommes intéressées au rôle des systèmes Toxine-Antitoxine (TA) bactériens de type VapBC dans ce processus. Ces modules, composés d’une toxine et de son antitoxine apparentée, sont associés chez les bactéries pathogènes à la réponse aux stress et à l’adaptation à la vie intracellulaire. La toxine, de par son activité RNase site-spécifique, permet une inhibition globale ou partielle de la traduction. Chez S. meliloti, 11 systèmes VapBC chromosomiques putatifs ont été identifiés et deux seulement (VapC4 et VapC5) ont été caractérisés en interaction symbiotique. Au cours de cette thèse, nous avons tout d’abord démontré, par une approche de validation fonctionnelle, que les neuf systèmes VapBC prédits sont des modules Toxine/Antitoxine. Puis, afin d’évaluer le rôle de chaque système dans la symbiose, des mutants d’invalidation du gène de la toxine VapC ont été construits et analysés en interaction avec M. truncatula. Trois mutants (vapC3, vapC7 et vapC10) présentent, à 6 semaines post-inoculation, une amélioration de la capacité fixatrice d’azote des nodosités par rapport au sauvage. Les mutants vapC3 et vapC7 présentent également un nombre et une taille de nodosités supérieurs. Ces mutants, en augmentant l’apport azoté global de la plante, conduisent à une augmentation du rendement végétal. Le mutant vapC10, quant à lui, présente une amélioration de la viabilité bactérienne associée à une sénescence retardée, sans amélioration du rendement végétal en raison d’un nombre inférieur de nodosités par plante. Ainsi, nous démontrons que la bactérie, par l’intermédiaire des systèmes VapBC, participe à la régulation de l’interaction symbiotique. Les toxines VapC3 et VapC7, dans un contexte sauvage, limitent la prolifération et/ou l’infection bactérienne tandis que la toxine VapC10 diminue la viabilité bactéroïdienne. Afin d’identifier les cibles moléculaires des ribonucléases VapC7 et VapC10, nous avons développé une analyse de MORE RNA-seq (Mapping by Overexpression of an RNase in E. coli). Cette technique permet de déterminer, par leur extrémité 5’, les ARN clivés après surexpression chez E. coli des toxines de S. meliloti. Les toxines VapC7 et VapC10, clivent respectivement l’ARNtfMet et deux ARNtSer d’E. coli permettant ainsi, une inhibition globale ou partielle de la traduction. Des ARNt homologues ont été identifiés chez S. meliloti par analyse bio-informatique. Il en résulte que le gène spécifiant l’ARNtfMet initiateur de la traduction, jusqu’alors non formellement identifié chez S. meliloti, serait présent en trois copies sur les trois loci rrn chromosomiques. En conclusion, les toxines VapC7 et VapC10 de S. meliloti sont des tRNAses impliquées dans la reprogrammation métabolique de S. meliloti lors de la symbiose et intervenant dans la régulation de l’interaction symbiotique, probablement en réponse aux besoins azotés, énergétiques et spécifiques de sa plante hôte<br>During the nitrogen-fixing symbiosis between the model legume Medicago truncatula and the rhizobiaceae Sinorhizobium meliloti, bacteria, differentiated into bacteroids within the nodule, reduce atmospheric nitrogen (N2) into ammonia (NH3), directly available by the plant. In exchange, the plant provides to its symbiont an ecological niche and carbohydrate substrates. Throughout the interaction, bacteria are faced with changing microenvironments from the soil free-living, the infection, the invasion of plant cells, the fixing-bacteroid differentiation and lastly the symbiotic rupture.To better understand the fast adaptation mechanisms developed by S. meliloti during the symbiosis, we were interested in the role of bacterial Toxin-Antitoxin (TA) systems in this process. These systems that are composed of a toxin and its cognate antitoxin, are associated with pathogenic bacteria to stress response and intracellular lifestyle adaptation. Through its site-specific RNase activity, the toxin allows a global or partial inhibition of the translation. In S. meliloti, 11 putative chromosomic VapBC systems have been identified and only two (VapC4 et VapC5) have been characterized in symbiotic interaction. During this PhD, using a functional validation approach, we have first demonstrated that the nine predicted VapBC systems are Toxin/Antitoxin modules. Then, to assess the role of each system in the symbiosis, mutants were constructed by the invalidation of the VapC toxin gene and analyzed in interaction with M. truncatula. Three mutants (vapC3, vapC7 et vapC10) show, at 6 weeks post-inoculation, a nitrogen fixation capacity improved within the nodules compared to the wild type. The vapC3 and vapC7 mutants also display a higher number and size of nodules. By increasing the global nitrogen supply of the plant, these mutants lead to an improved plant yield. The vapC10 mutant, for its part, enhances bacterial viability associated to a delayed senescence, without a plant yield improvement due to a lower number of nodules per plant. Hence, we have demonstrated that bacteria, through VapBC systems, take part in the symbiotic interaction regulation. While VapC3 and VapC7 toxins limit the bacterial proliferation and/or infection in a wild type context, VapC10 toxin decreases bacteroid viability.Then, to identify molecular targets of VapC7 and VapC10 ribonucleases, we have developed a MORE RNA-seq analysis (Mapping by Overexpression of an RNase in E. coli). This technic allows to determine, by their 5’-end, cleaved RNA after the S. meliloti toxins overexpression in E. coli. The VapC7 and VapC10 toxine, cleave respectively tRNAfMet et two tARNSer in E. coli, therefore allowing, a global o partial inhibition of translation. Homologous tRNA have been identified in S. meliloti by a bioinformatic analysis. As a result, the gene specifying the initiator tRNAfMet of translation, until now not formally identified in S. meliloti, would be present in three copies in the three chromosomic rrn loci. In conclusion, the VapC7 and VapC10 toxins are tRNAses involved in the metabolic reprogrammation of S. meliloti during the symbiosis and taking place in the symbiotic interaction regulation, probably in response to energy and specific nitrogen needs of its host plant
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Riepl, Hubert. "NMR-spektroskopische Charakterisierung des Responsregulators CheY2 aus Sinorhizobium meliloti." kostenfrei, 2004. http://www.opus-bayern.de/uni-regensburg/volltexte/2004/225/.
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Collins, Jessica M. "FixI and FixI2: Homologous proteins with unique functions in Sinorhizobium meliloti." Digital WPI, 2014. https://digitalcommons.wpi.edu/etd-theses/177.
Full textAbstract:
Cu+-ATPases are transmembrane enzymes that couple the efflux of cytoplasmic Cu+ to the hydrolysis of ATP. It is well established that Cu+-ATPases control cytoplasmic Cu+ levels. However, bacterial genomes, particularly those of symbiotic/pathogenic organisms, contain multiple copies of genes encoding Cu+-ATPases, challenging the idea of a singular role for these enzymes. Our lab has demonstrated that one of the two Cu+-ATPases in Pseudomonas aeruginosa, a FixI-type ATPase, has an alternative role, most likely Cu+ loading of cytochrome c oxidase (Cox). To further study alternative roles of Cu+-ATPases, we study the symbiont Sinorhizobium meliloti. Rhizobia are soil-dwelling bacteria that interact with legumes, forming plant root nodules that actively fix N2. The S. meliloti genome contains five Cu+-ATPases, two of which are FixI-type. Both of these enzymes, termed FixI1 and FixI2, are downstream of Cox operons. We hypothesized that the presence of multiple FixI-type ATPases was not an example of redundancy, but rather is an evolutionary adaptation that allows rhizobia to survive under the wide variety of adverse conditions faced during early infection and establishment of symbiosis. Towards this goal, this work focused on examining the effects of mutation of each ATPase on both free-living bacteria and on the ability of rhizobia to establish an effective symbiosis with its host legume. Each of these mutants presents a different phenotype at varying points of the nodulation process, and only the fixI2 mutation produces a respiratory-deficient phenotype during aerobic growth. These results are consistent with our hypothesis that the two proteins have non-redundant physiological functions. Understanding the factors that contribute to an effective symbiosis is beneficial, since N2 fixation in legumes is important to both agriculture and industry.
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Maoui, Kamel-Ridha. "Etude génétique des plasmides de Rhizobium meliloti : transfert, réarrangement génétiques, implication dans le métabolisme intermédiaire." Lille 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LIL10036.
Full text
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Geddes, Barney. "Characterization of genetic loci for carbon metabolism and competition for nodule occupancy in Sinorhizobium meliloti." Microbiology, 2010. http://hdl.handle.net/1993/23724.
Full textAbstract:
In agriculture nitrogen fixation by rhizobial inocula is an environmentally and economically beneficial alternative to synthetic fertilization. The effectiveness of rhizobial inocula can be limited by the inability of inoculum strains to compete with indigenous strains for nodule occupancy. Sinorhizobium meliloti fixes nitrogen in a complex symbiotic relationship with legume hosts including the agriculturally important forage Medicago sativa and the model legume Medicago truncatula. The ability to utilize organic compounds has emerged as an important trait for competitiveness for nodule occupancy in S. meliloti and other rhizobia. This thesis describes the use of bacterial genetics to characterize two carbon metabolism loci in S. meliloti. A genetic locus for erythritol catabolism was characterized and shown to encode an ABC transporter that is required for the catabolism of erythritol, adonitol and L-arabitol, as well as the genes for the catabolism of these three polyols. The ability to utilize erythritol was not necessary for the ability to compete for nodule occupancy in S. meliloti, in contrast to Rhizobium leguminosarum. A genetic locus that encodes components of the De Ley-Doudoroff pathway of galactose catabolism was identified and also characterized. The inability to catabolize galactose resulted in an increased ability to compete for nodule occupancy in S. meliloti. Evidence is presented that is consistent with the hypothesis that increased competitiveness resulted from enhanced production of the symbiotic exopolysaccharide succinoglycan. Inferences are drawn that contribute to the broader understanding of rhizobium-legume symbiosis.<br>October 2014
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Hornez, Jean-Pierre. "L'utilisation du glucose et du fructose chez Rhizobium meliloti : dégradation, transport et régulations." Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10059.
Full text
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Debelle, Frédéric. "Etude de genes de rhizobium meliloti controlant la nodulation specifique de medicago sativa." Toulouse 3, 1988. http://www.theses.fr/1988TOU30194.
Full textAbstract:
La mutagenese par le transposon tn5 d'un fragment de 30 kb du megaplasmide psym de r. Meliloti, a permis de mettre en evidence 3 regions portant des genes de nodulation dont on etudie les proteines correspondantes. Le transfert a r. Trifolii d'un plasmide portant les genes nodfeg et nodh de r. Meliloti rend la souche hybride capable de noduler la luzerne mais inapte a noduler le trefle
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Pau-Roblot, Corinne. "Etude structurale par RMN de polysaccharides excrétés par des souches de Rhizobium meliloti." Amiens, 1996. http://www.theses.fr/1996AMIE0103.
Full textAbstract:
Ce travail porte sur l'étude par résonance magnétique nucléaire (RMN) d'exopolysaccharides (EPS) excrétés par différentes souches de Rhizobium meliloti M5N1. L'EPS produit par la souche de R. Meliloti M5N1 CS est constitué de résidus acide glucuronique liés en béta 1,4 partiellement acétylés en position 2,3 et/ou 2,3. Le degré de substitution ainsi que la répartition et la proportion des différentes acétylations ont été déterminés. L'addition de différents sels dans le milieu de culture montre qu'une forte concentration en ions magnésium induit la production d'un EPS principalement 2,3-di-0-acétylé alors qu'il est 3-0-acétylé lorsqu'il est produit dans un milieu sans ajout de magnésium. Cet EPS présente des ensembles de résidus non acétylés notés NAc(2), des ensembles de résidus 3-0-acétylés. Il contient d'autres résidus non acétylés notés NAc(1') placés avant et après les résidus 3-0-acétylés et avant les résidus 2,3-di-0-acétylés et des résidus non acétylés notés NAc(1) placés avant et après les résidus 2-0-acétylés et après les résidus 2,3-di-0-acétylés. Nous avons amélioré une méthode de dosage colorimétrique de cet EPS en tenant compte des interférences dues au milieu de culture ainsi qu'une méthode de dosage du poly-3-hydroxybutyrate (PHB) par chromatographie en phase gazeuse (CPG) et RMN. L'étude de l'EPS produit par la souche de R. Meliloti M5N1 T1 montre qu'il est constitué de glucose et d'acide glucuronique uniquement. Cet EPS ne possède pas de substituant. Le glucose porte les liaisons glycosidiques en béta sur les positions 1 et 4 et l'acide glucuronique en béta sur les positions 1 et 3
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Ramsey, N. Bruce (Norman Bruce) Carleton University Dissertation Biology. "The rhizobium meliloti JJ1c10 host-range gene nodH : physical, genetic and biochemical analysis." Ottawa, 1990.
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Hornez, Jean-Pierre. "L'Utilisation du glucose et du fructose chez Rhizobium meliloti dégradation, transport et régulations /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37605963z.
Full text
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Debelle, Frédéric. "Etude de gènes de Rhizobium meliloti contrôlant la nodulation spécifique de Medicago sativa." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37613006c.
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Eguae, Samuel Iyamu. "Pyrimidine nucleotide metabolism in Rhizobium meliloti: purification of aspartate transcarbamoylase from a pyrimidine auxotroph." Thesis, University of North Texas, 1990. https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc332674/.
Full textAbstract:
Rhizobium aspartate transcarbamoylase (ATCase; EC 2.1.3.2) was previously believed to be similar to the Pseudomonas ATCase which has been studied extensively. To facilitate the study of the Rhizobium ATCase a pyrimidine-requiring mutant of R. meliloti was isolated and used in the purification of the enzyme.
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Capela, Delphine. "Analyse structurale du chromosome de Sinorhizobium meliloti souche 1021." Toulouse 3, 2000. http://www.theses.fr/2000TOU30111.
Full text
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Steven, Blaire. "Regulation and expression of the mdh-sucCDAB operon of Sinorhizobium meliloti." Thesis, McGill University, 2003. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=80880.
Full textAbstract:
The genes encoding malate dehydrogenase (mdh), succinyl-CoA synthetase (sucCD), and subunits of 2-oxoglutarate dehydrogenase (sucAB) constitute an operon in the order mdh-sucCDAB in Sinorhizobium meliloti. Regulation of the operon was studied using beta-galactosidase gene fusions. Expression of the operon was assayed in response to the carbon source provided, and over the growth of the culture. A promoter upstream of the mdh gene was identified, and although the promoter was active in S. meliloti it was not expressed in Escherichia coli. It was demonstrated that the role of 2-oxoglutarate dehydrogenase (OGD) is minimal in symbiosis, as nodules with no OGD activity formed nodules able to fix nitrogen. Alfalfa plants inoculated with strains of S. meliloti carrying extra-chromosomal copies of the mdh gene did not show any increase in shoot dry weight compared to plants inoculated with the wild-type strain.
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PICHON, MAGALIE. "Le gene mtenod12 : marqueur moleculaire des stades precoces de l'interaction symbiotique rhizobium meliloti/medicago." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA112126.
Full textAbstract:
Pour etudier les reponses les plus precoces des legumineuses au cours de l'interaction symbiotique medicago/r. Meliloti, nous avons clone et caracterise le gene mtenod12 de medicago truncatula. Ce gene code pour une noduline precoce composee d'unites pentapeptidiques repetees contenant deux prolines. Par des experiences d'hybridation in situ nous avons montre que ce gene est exprime dans les nodules fixateurs d'azote au niveau des cellules qui sont en cours d'envahissement par les bacteries. Les arnm de mtenod12 ont aussi detectes une region du nodule dont les cellules se preparent a l'infection que nous avons appele zone de preinfection. L'etude de l'expression de la fusion pmtenod12-gusa dans des luzernes transgeniques de m. Varia a2 indique que ce gene est transcrit a differentes etapes de l'ontogenese nodulaire. Dans un nodule mature l'activite gus est detectee dans les cellules des zones d'infection (zone ii) et de preinfection. La localisation de cette activite gus est donc correlee a la distribution des arnm de mtenod12 determinee par hybridation in situ. A un stade plus precoce de l'ontogenese nodulaire, nous avons mis en evidence que le gene chimerique mtenod12-gusa etait actif dans les cellules du primordium nodulaire qui se developpera ulterieurement en nodule fixateur d'azote. De facon interessante l'activite gus est aussi detectee dans les cellules corticales a l'origine des nodules qui se forment spontanement chez certaines luzernes en absence de bacteries. Nous avons enfin suivi l'expression de mtenod12-gusa dans les stades les plus precoces de l'interaction symbiotique. Il apparait que le gene chimerique est transcrit 3 a 6 heures apres inoculation par r. Meliloti dans les cellules epidermiques en cours de differenciation proches de l'extremite racinaire. Quarante-huit heures apres inoculation le gene mtenod12-gusa n'est plus transcrit dans la majorite de ces cellules epidermiques en revanche, son expression est tres elevee dans les points d'infection qui ont ete inities. L'expression precoce de mtenod12 dans la zone racinaire qui sera ulterieurement infectee, suggere que la synthese de cette noduline precoce intervient dans la preparation des poils absorbants a l'infection. Cette reponse tres precoce de la plante indique que le gene mtenod12 est un bon marqueur moleculaire pour etudier les echanges de signaux entre les deux partenaires qui se deroulent dans les premieres heures de l'interaction. Nous avons montre que les lipo-oligosaccharides sulfates produits par la souche de r. Meliloti (facteurs nodrm) etaient capables de declencher l'expression du gene mtenod12-gusa deux heures apres leur addition dans les cellules epidermiques en differenciation de l'extremite racinaire. Ces resultats suggerent que la reconnaissance des facteurs nodrm precedent l'etape de differenciation des cellules epidermiques en poils absorbants ulterieurement sensibles a l'infection. Ces resultats montrent que les plantes transgeniques sont un outil de choix pour etudier les relations structures-fonctions des facteurs nod, surtout en ce qui concerne la reconnaissance et la specificite de ces molecules