Dissertations / Theses on the topic 'Santé des arbres'

La phyllosphère est l’habitat fourni par la partie foliaire des plantes. De nombreuses espèces microbiennes - pathogènes, saprophytes ou mutualistes des plantes - peuplent cet environnement. Ce compartiment microbien influence donc la dynamique et la structure des communautés végétales. L’objectif principal de cette thèse était d’étudier les effets potentiels du changement climatique sur la structure des assemblages fongiques de la phyllosphère des arbres forestiers, et sur la niche écologique des espèces fongiques pathogènes des arbres forestiers. Nous avons pour cela utilisé deux approches, i) l’étude de gradients altitudinaux et ii) la construction de modèles de niche bioclimatique.Les assemblages fongiques de la phyllosphère des arbres forestiers étant encore peu connus, nous avons dans un premier temps décrit leur diversité et quantifié leur variabilité spatiale à l’échelle d’une parcelle forestière.Nos résultats montrent que la phyllosphère d’un arbre forestier abrite quelques centaines d’espèces fongiques, avec quelques espèces dominantes et beaucoup d’espèces rares. Les facteurs structurant ces assemblages incluent à la fois des facteurs abiotiques et biotiques : la température apparaît comme la variable climatique la plus explicative le long d’un gradient altitudinal ; à l’échelle d’une parcelle, la proximité génétique entre arbres est plus déterminante que leur distance géographique.L’analyse des modèles de niche des champignons pathogènes forestiers à l’échelle de la France met en évidence des limitations climatiques, les pluies estivales étant une variable explicative importante.Toutefois, plusieurs espèces introduites occupent déjà la plus grande part de la distribution de leur hôte,sans limitation apparente par le climat. Les effets du changement climatique sur la plupart des pathogènes s’exerceront d’abord indirectement par des effets dépressifs très importants sur l’abondance de leurs arbres-hôtes. Seuls les pathogènes adaptés au biotope méditerranéen verraient leur impact s’accroitre
Phyllosphere is the habitat provided by the leaves of living plants. Many microbial species -pathogens, saprophytes or mutualists of plants - inhabit this environment. These microbes therefore influence the dynamics and structure of plant communities. The main objective was to study the potential effects of climate change on the structure of phyllosphere fungal assemblages, and on the ecological niche of pathogenic fungal species of forest trees. We used two approaches, i) the study of altitudinal gradients and ii) the construction of bioclimatic niche models. Since phyllosphere fungal assemblages of forest trees are still poorly known, we first described their diversity and quantified their spatial variability at the scale of a forest stand.Our results show that the phyllosphere of a forest tree houses hundreds of fungal species, with few dominant species and many rare species. Factors structuring these assemblages include both abiotic and biotic factors: the temperature appears as the most explanatory variable along an elevation algradient. At the scale of a forest stand, the genetic proximity between trees is more important than the geographic distance. Analysis of the bioclimatic niche models of pathogenic fungi forest at the French scale highlights some climatic limitations, and the summer rainfall is an important explanatory variable. However, many introduced species already occupy the distribution of their host, without apparent climatic limitation. The effects of climate change on most pathogens will be exercised indirectly by very important depressive effects on the abundance of their host trees. Only pathogens adapted to the Mediterranean biotope would increase their impact

Démarche d’ingénierie écologique en santé des plantes : gestion des couvre-sol des vergers pour lutter contre les bactérioses des arbres fruitiers provoquées par Pseudomonas syringaeIdentifier les réservoirs et sources d’inoculum des agents phytopathogènes est un enjeu majeur en pathologie végétale. Les systèmes agricoles pérennes, tels que les vergers, sont soumis aux attaques de nombreux ravageurs et agents microbiens pathogènes. P. syringae, agent phytopathogène responsable de l’émergence de maladies des arbres fruitiers, dont la récente épidémie du chancre bactérien du kiwi causée P. syringae pv. actinidiae (Psa), représente un enjeu économique important au niveau mondial. En France, les moyens de lutte sont constitués de traitements cupriques et de gestes préventifs visant à réduire la propagation de la bactérie au sein et entre les vergers. Avec la prise de conscience de la nécessité de la conservation de l’environnement par les consommateurs et producteurs, les méthodes de cultures actuelles ont tendances à s’orienter vers celles de l’agroécologie et l’usage de l’ingénierie écologique au service de la santé des plantes. En verger, la gestion des communautés de plantes des couvre-sols donne de bons résultats dans la lutte conte certaines espèces de ravageurs, tels que les arthropodes herbivores, mais les effets sur les communautés de microorganismes pathogènes restent inexplorés. Les plantes couvre-sol et adventices des vergers hébergent d’abondantes communautés de P. syringae, cependant le rôle de ces couverts végétaux dans l’émergence des maladies des arbres fruitiers reste incompris. Par conséquent, les travaux de recherche presentés ici focalisent sur l’étude simultanée des communautés de P. syringae associées aux plantes couvre-sol et aux arbres fruitiers de trois vergers d’abricotiers et de quatre vergers de kiwis du département de la Drôme, sud-est de la France, choisis pour leur état sanitaire (sain, malade ou émergence de la maladie), ainsi que des pratiques de gestion du couvre-sol différentes (sol nu, enherbement des inter-rangs, enherbement des inter rangs et rangs des arbres). En l’absence d’outils permettant une identification rapide et une affiliation à l’un des 13 phylogroupes actuellement décris pour l’espèce P. syringae, l’étude du génome complet d’une cinquantaine de souches de P. syringae a permis la mise au point de marqueurs moléculaires capables d’identifier 9 des 13 phylogroupes. L’étude des communautés de P. syringae hébergées par les couvre-sols végétaux montre un effet de la composition des communautés des plantes couvre-sol sur l’abondance et la structure des communautés de P. syringae. La présence de Prunella vulgaris, une plante de la famille des Lamiaceae, est corrélée avec une diminution de l’abondance des P. syringae. La reproductibilité de ce résultat est actuellement en cours d’investigation dans une parcelle expérimentale. Cependant, les résultats préliminaires montrent une absence d’effet de P. vulgaris sur l’abondance de P. syringae. L’étude simultanée des communautés de P. syringae des couvre-sols végétaux et des arbres fruitiers montre que des échanges se font entre les deux compartiments en raison de la présence de souches génétiquement proches. Chez le kiwi, lorsque Psa est présent il coexiste toujours avec d’autres P. syringae, soulevant la question des interactions entre ces souches et leur rôle dans l’émergence de la maladie. Enfin, les résultats mettent en avant un potentiel antagonisme entre les phylogroupes 1 et 2
Process of ecological engineering in plant health: study of the role of orchard ground cover plants in the emergence of fruit tree diseases caused by Pseudomonas syringaeIdentification of reservoirs and inoculum sources of plant pathogenic microorganisms is a major issue in plant pathology. Perennial agricultural systems, such as orchards, are exposed to many pests and pathogenic microorganisms. P. syringae, a phytopathogenic bacterium responsible for the emergence of diseases of fruit trees, including the recent outbreak of bacterial canker of kiwifruit caused P. syringae pv. actinidiae (Psa), represent an important economic issue worldwide. In France, means of control of bacterial canker consist of copper treatments and preventive measures in order to reduce the spread of bacteria within and between orchards. With the awareness for environmental conservation by consumers and producers, current cultivation methods tend to be progressively replaced by more agroecological ones and the use of ecological engineering to improve plant health. Ecological engineering of orchard ground cover plant communities provides good results for the control of orchard pests, such as herbivorous arthropods, but the effects on pathogenic microbial communities remains unexplored. The ground cover plants and orchard weeds host abundant P. syringae communities, however the role of ground covers in the emergence of fruit tree diseases remains ignored. Therefore, the research presented here is focused on the simultaneous study of P. syringae communities associated with ground covers and fruit trees from three apricot and four kiwifruit orchards of Drôme county, southeastern France, chosen for their health status (healthy, diseased, or disease emergence), as well as different ground cover management practices (bare soil, ground cover in inter-rows, ground cover in inter-rows and tree rows). In the absence of tools for rapid identification and affiliation to one of 13 currently described phylogroups for the P. syringae species, the screening of whole genomes of more than fifty P. syringae strains has allowed the development of specific molecular markers able to identify 9 of the 13 phylogroups. Results show that ground cover P. syringae community abundances and structures are correlated to plant community composition. The presence of Prunella vulgaris, a plant of the Lamiaceae family, is correlated to a decrease in the P. syringae abundances. Reproducibility of this result is currently under investigation in an experimental field. However, preliminary results from the experimental field show that the presence of P. vulgaris in 1-year-old ground covers is not correlated to a decrease in P. syringae abundances. Simultaneous study of ground cover and fruit tree P. syringae communities highlight bacterial exchanges between these two compartments because of the presence of genetically correlated strains in both of them. When present, Psa coexist with other P. syringae, raising the question of the interaction between these strains and their role in the emergence of the disease. Finally, the results highlight a potential antagonism between phylogroups 1 and 2

Un questionnaire adaptatif fournit une mesure valide de la qualité de vie des patients et réduit le nombre d'items à remplir. Cette approche est dépendante des modèles utilisés, basés sur des hypothèses parfois non vérifiables. Nous proposons une approche alternative basée sur les arbres de décision. Cette approche n'est basée sur aucune hypothèse et requiert moins de temps de calcul pour l'administration des items. Nous présentons différentes simulations qui démontrent la pertinence de notre approche. Nous présentons une méthode de classification non supervisée appelée CUBT. CUBT comprend trois étapes pour obtenir une partition optimale d'un jeu de données. La première étape construit un arbre en divisant récursivement le jeu de données. La deuxième étape regroupe les paires de noeuds terminaux de l'arbre. La troisième étape agrège des nœuds terminaux qui ne sont pas issus de la même division. Différentes simulations sont présentés pour comparer CUBT avec d'autres approches. Nous définissons également des heuristiques concernant le choix des paramètres de CUBT. CUBT identifie les variables qui sont actives dans la construction de l'arbre. Cependant, bien que certaines variables peuvent être sans importance, elles peuvent être compétitives pour les variables actives. Il est essentiel de classer les variables en fonction d'un score d'importance pour déterminer leur pertinence dans un modèle donné. Nous présentons une méthode pour mesurer l'importance des variables basée sur CUBT et les divisions binaires compétitives pour définir un score d'importance des variables. Nous analysons l'efficacité et la stabilité de ce nouvel indice, en le comparant à d'autres méthodes
An adaptive test provides a valid measure of quality of life of patients and reduces the number of items to be filled. This approach is dependent on the models used, sometimes based on unverifiable assumptions. We propose an alternative approach based on decision trees. This approach is not based on any assumptions and requires less calculation time for item administration. We present different simulations that demonstrate the relevance of our approach.We present an unsupervised classification method called CUBT. CUBT includes three steps to obtain an optimal partition of a data set. The first step grows a tree by recursively dividing the data set. The second step groups together the pairs of terminal nodes of the tree. The third step aggregates terminal nodes that do not come from the same split. Different simulations are presented to compare CUBT with other approaches. We also define heuristics for the choice of CUBT parameters.CUBT identifies the variables that are active in the construction of the tree. However, although some variables may be irrelevant, they may be competitive for the active variables. It is essential to rank the variables according to an importance score to determine their relevance in a given model. We present a method to measure the importance of variables based on CUBT and competitive binary splis to define a score of variable importance. We analyze the efficiency and stability of this new index, comparing it with other methods

Ces dernières décennies, la baisse des précipitations estivales en région méditerranéenne associée à l’augmentation des températures a provoqué une diminution de la vitalité des espèces arborées. En raison de sa forte sensibilité à la sécheresse et de sa présence en limite sud de son aire de répartition, les taux de défoliation et de mortalité observés chez le sapin pectiné (Abies alba Mill.) en Provence sont importants. Mais la forte variabilité spatiale de la mortalité au sein et entre les placettes indique que les facteurs qui causent la mortalité sont multiples, complexes et peuvent différer selon l’échelle spatiale étudiée.A partir de placettes situées le long de gradients altitudinaux et topographiques localisées dans trois massifs provençaux (Mont Ventoux, forêt domaniale de l’Issole et forêt de Vésubie), nous avons estimé la variabilité spatiale de la mortalité du sapin et l’avons relié aux variables environnementales et endogènes de l’arbre responsables de son mauvais état sanitaire. L’impact des conditions climatiques, édaphiques, biotiques et des caractéristiques de l’arbre et du peuplement a d’abord été estimé sur la croissance des sapins, puis sur la probabilité de mortalité.Les capacités de rétention en eau des sols semblent avoir un rôle prépondérant sur la croissance et sur la mortalité du sapin par comparaison avec les effets de l’altitude ou des conditions climatiques, ce qui est confirmé par les simulations d’un modèle de fonctionnement basé sur les processus. Les taux de mortalité sont d’autant plus élevés que différents agents biotiques sont présents et abondants. Contrairement aux hypothèses de départ, le processus de mortalité ne semble pas être complètement connecté à celui de dépérissement évalué par l’estimation des dommages au niveau du houppier. De plus si dans certaines conditions les arbres morts sont ceuxdont la croissance radiale était la plus faible au cours de leur vie, dans d’autres cas ce sont ceux qui montrent une forte croissance dans les stades juvéniles. Des modèles statistiques de prédiction de mortalité ont été conçus et révèlent la nécessité de prendre en compte la pente de l’évolution de la croissance des dernières années et les variables de croissance relative. Si le sapin est mal adapté aux futures conditions environnementales, il est néanmoins peu probable qu’il disparaisse complètement des massifs provençaux
During last decades, the decrease in summer rainfalls and temperatures rising causeddecline in vitality of several woody species in the Mediterranean area. Due to its high sensitivity to drought and its location at the southern part of its distribution range, high defoliation and mortality rates are observed on silver fir (Abies alba Mill.) in Provence. But the large spatial heterogeneity in mortality, within and between, plots indicates that the factors inducing tree mortality are numerous, complex and can differ between studied spatial scales. Using several plots located along altitudinal and topographic gradients on three mountains in Provence (Mont Ventoux, forêt domaniale de l’Issole and forêt de Vésubie), we estimated the spatial variability of silver fir mortality and related it to environmental and endogenous variables which caused crown damages. The impact of climatic, edaphic and biotic conditions and of tree and stand characteristics was assessed on silver fir growth and on the probability of mortality. Soil water capacities seem to have predominant effect of growth and mortality compared with altitudinal or climatic variability effects. This was confirmed by simulations of silver fir functioning using a process-based model. Mortality rates are all the more important since numerous and diverse biotic agents are present. Contrary to initial hypotheses, the mortalityprocess seems not to be always linked with the declining one which is assessed by crown damages estimations. In addition, if in some cases dead trees are those with the lowest growth rates during lifetime, in other cases, dead trees showed high growth rates during the juvenile phase. Statistical models were produced in order to predict mortality and highlight the need to use radial growth trends during last years and relative growth variables at this aim. If silver fir is maladapted to futures environmental conditions, its disappearance of the mountains in Provence is not likely

Nesta dissertação realizamos uma análise quantitativa da distribuição geográfica das espécies arbóreas do estado de Santa Catarina de forma a investigar suas ocorrências e pontos de riqueza no estado, examinando os fatores bióticos e geográficos que podem influenciar nessa distribuição, bem como as áreas mais importantes para conservação. Noprimeiro capítulo, Esforço amostral e riqueza de espécies das angiospermas e gimnospermas arbóreas de Santa Catarina, Brasil, avaliamos as áreas de maior riqueza no estado de Santa Catarina, e a suficiência amostral desse estado. Utilizamos o estimador Chao 2.No segundo capítulo,Variáveis climáticas e espaciais predizem a distribuição de espécies arbóreas em um gradiente fisionômico na Floresta Atlântica sul, Brasil?,o principal objetivo foi investigar a variação na composição da flora arbórea correlacionada com 28 variáveis ambientais e geográficas na Floresta Atlântica Subtropical catarinense. Efetuamos análises de agrupamento, ordenação, regressão e partição de variância. O terceiro capítulo,Distribuição geográfica de espécies arbóreas em trecho da Mata Atlântica Sul, Brasil: restrição por fatores abióticos e consequências para a conservação da biodiversidade, investigamos a distribuição real e potencial das espécies arbóreas do estado de Santa Catarina e sua possível área de distribuição na América do Sul. Realizamos análises de espécies indicadoras e modelos de distribuição potencial usando o algoritmo Maxent. Nossos resultados evidenciaram a elevada heterogeneidade ambiental encontrada no estado de Santa Catarina e a importância das variáveis de temperatura e altitude nos padrões florísticos das espécies arbóreas do estado. A maioria das espéciesapresenta distribuição restrita e reduzida adequabilidade climática para maior parte da América do Sul. Muitas das espécies estudadas são adaptadas a condições ambientais específicas, ressaltando a necessidade de se preservar essa região. A Floresta Pluvial Perenifólia foi a mais rica em espécies. Porém,as ecounidades menos amostradas, como, por exemplo, as Nanoflorestas Costeira e Nebular necessitam de novos esforços amostrais. Assim, a presente Dissertação gerou informações essenciais para o conhecimento sobre a distribuição de espécies ao longo de um gradiente fitofisionômico da Floresta Atlântica Subtropical, as quais podem ser utilizadas no direcionamento de futuras pesquisas e de esforços voltados à conservação da biodiversidade nessa região.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
The objectives of this study were: to review literature on the concepts of plant phenology, focusing on tree phenology work performed in the state of Rio Grande do Sul, Brazil, in chapter I follow the vegetative and reproductive phenology of 20 species native tree of the state of Rio Grande do Sul - RS existing at the Botanical Garden of the Universidade Federal de Santa Maria - UFSM and associating the phenological events observed with the astronomical and meteorological variables (day length) and Chapter II, set up a schedule using phenological phenophases of twenty different native species of Rio Grande do Sul - RS. The plant phenology is an ecological study that accompanies the repetitive events of plants for a minimum period of one year. Generally, the data are divided into vegetative growth stages: mature leaves, leaf fall and flushing, and reproduction: flowering (flower buds and flowering) and fruit (green fruit / immature and mature fruit), and gain more importance when related to meteorological variables and climatic conditions. The twenty species selected were: Lithraea molleoides (Vell.) Engler, Schinus terebinthifolius Raddi, Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, Cordia americana (L.) Gottschling & J.S.Mill., Sebastiania commersoniana (Baill.) L.B. SM. & Downs, Albizia niopoides (Benth) Killip ex, Enterolobium contortisiliquun (Vell.) Morong, Inga uruguensis Hook. & Arn., Parapiptadenia rigida (Benth.) Brenan, Luehea divaricata Mart., Myrsine coriacea (Sw.) R.Br. ex Roem. & Schult., Blepharocalyx salicifolius (Kunth) O. Berg, Eugenia uniflora L., Myrciaria tenella (DC.) O.Berg., Prunus myrtifolia (L.) Urb., Zanthoxylum rhoifolium Lam., Helietta apiculata Benth., Casearia sylvestris Sw., Allophylus edulis (A. St.-Hil., Cambess. & A. Juss.) Radlk. e Cupania vernalis Cambess. The methodology was based on direct observations and biweekly during the period of the August/2010 agosto/2011. The stages of budding, leaf fall, flowering (anthesis and button) and fruit (green fruit / immature and mature fruit) were observed in 4-10 randomly selected individuals for each species. The stages were associated with meteorological variables (precipitation and air temperature) and variable astronomical (day length) obtained from the Meteorological Station of UFSM. Data analysis was performed using the phenological activity index (presence / absence) and the Index of Fournier. Based on the results, schedules were developed vegetative and reproductive phenology (flowering and fruiting). In vegetative phenology was observed that the budding was constant throughout the observation period, the leaf fall, more pronounced in autumn and winter, and mature leaves with full photosynthetic capacity peaked in spring and summer and in winter with a reduction of almost 50%. In the largest reproductive phenology of flowering peaks were observed in spring and early summer and fruiting occurred mainly in summer and early fall. The length of day and air temperature correlated significantly with both clones, however, these were not significant with the rainfall. Thus, the results of the vegetative and reproductive phenological calendars of tree species were similar to those mentioned in the literature.
Os objetivos, neste trabalho, foram: realizar uma revisão bibliográfica sobre os conceitos da fenologia vegetal, com enfoque em trabalhos de fenologia arbórea realizados no estado do Rio Grande do Sul, Brasil; no capítulo I, acompanhar a fenologia vegetativa e reprodutiva de 20 espécies arbóreas nativas do estado do Rio Grande do Sul RS existentes no Jardim Botânico da Universidade Federal de Santa Maria - UFSM e associar os eventos fenológicos observados com as variáveis meteorológicos e astronômica (comprimento do dia); e capítulo II, montar um calendário fenológico utilizando as fenofases das vinte diferentes espécies arbóreas nativas do estado do Rio Grande do Sul - RS. A fenologia vegetal é um estudo ecológico que acompanha os eventos repetitivos das plantas por um tempo mínimo de um ano. Geralmente, os dados fenológicos são divididos em vegetativos: folhas maduras, queda foliar e brotamento; e reprodutivos: floração (botão floral e antese) e frutificação (fruto verde/imaturo e fruto maduro), e ganham mais importância, quando relacionados com variáveis meteorológicas e climatológicas. A vinte espécies selecionadas, foram: Lithraea molleoides (Vell.) Engler, Schinus terebinthifolius Raddi, Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, Cordia americana (L.) Gottschling & J.S.Mill., Sebastiania commersoniana (Baill.) L.B. SM. & Downs, Albizia niopoides (Benth) Killip ex, Enterolobium contortisiliquun (Vell.) Morong, Inga uruguensis Hook. & Arn., Parapiptadenia rigida (Benth.) Brenan, Luehea divaricata Mart., Myrsine coriacea (Sw.) R.Br. ex Roem. & Schult., Blepharocalyx salicifolius (Kunth) O. Berg, Eugenia uniflora L., Myrciaria tenella (DC.) O.Berg., Prunus myrtifolia (L.) Urb., Zanthoxylum rhoifolium Lam., Helietta apiculata Benth., Casearia sylvestris Sw., Allophylus edulis (A. St.-Hil., Cambess. & A. Juss.) Radlk. e Cupania vernalis Cambess. A metodologia utilizada foi a de observações diretas e quinzenais, no período de agosto/2010 a agosto/2011. As fenofases de brotamento, queda foliar, floração (botão e antese) e frutificação (fruto verde/imaturo e fruto maduro) foram observadas em 4-10 indivíduos selecionados aleatoriamente para cada espécie. As fenofases foram associadas com variáveis meteorológicas (precipitação pluviométrica e temperatura do ar) e variável astronômica (comprimento do dia) obtidos na Estação Meteorológica da UFSM. A análise dos dados foi realizada através do índice de atividade fenológica (ausência/presença) e do Índice de Fournier. Com base nos resultados, foram elaborados calendários fenológicos vegetativo e reprodutivo (floração e frutificação). Na fenologia vegetativa observou-se que o brotamento foi constante em todo tempo de observação; a queda foliar, mais acentuada no outono e inverno; e as folhas maduras com plena capacidade fotossintética apresentaram picos na primavera e verão e com uma redução no inverno de quase 50%. Na fenologia reprodutiva os maiores picos de floração foram observados na primavera e início do verão e a frutificação ocorreu principalmente no verão e início do outono. O comprimento do dia e a temperatura do ar correlacionam-se significativamente com as fenofases, entretanto, estas não foram significativas com a precipitação pluviométrica. Assim, os resultados dos calendários fenológicos vegetativo e reprodutivo das espécies arbóreas foram semelhantes àqueles mencionados na literatura.

La santé reproductive de l'homme est un indicateur de la santé générale de celui-ci. Elle est également intimement liée aux expositions de l'environnement et du milieu de vie. Aujourd'hui, on observe une baisse séculaire de la qualité du sperme et une augmentation des pathologies et malformations de l'appareil reproducteur masculin. L'objectif de ce travail est d'étudier la santé reproductive de l'homme d'un point de vue épidémiologique et par le biais de différents outils statistiques. Nous nous sommes intéressés à l'incidence et aux facteurs de risque du cancer du testicule. Ensuite, nous avons étudié le parcours thérapeutique d'une population d'hommes ayant consulté pour infécondité masculine en analysant la relation entre leurs paramètres du sperme et leurs investigations andrologiques, ainsi que l'issue de leur projet parental. Enfin, l'événement naissance a été analysé en tenant compte de son délai de réalisation en utilisant des modèles de durées de vie incluant la censure à droite : modèles de Cox et arbres de survie. En y associant des techniques de sélection stable de variables (stepwise, pénalisation de type L1, bootstrap) les performances prédictives de ces méthodes ainsi que leur capacité à fournir aux cliniciens un modèle facilement interprétable ont été comparées. Dans le sud de la France, l'incidence du cancer du testicule a doublé au cours des 20 dernières années. L'effet cohorte de naissance, c'est-à-dire l'effet générationnel, suggère un effet délétère des expositions environnementales sur la santé reproductive de l'homme. Toutefois, aucune exposition du milieu de vie de l'homme durant sa vie adulte ne semble être un facteur de risque potentiel de survenue du cancer du testicule, suggérant l'hypothèse d'une exposition à des perturbateurs endocriniens in utero. Actuellement, la responsabilité de l'homme dans des difficultés à concevoir représente 50% des causes d'infertilité. La prise en charge de l'homme est donc essentielle. Dans notre cohorte de couples consultant pour des problèmes d'infertilité, un examen andrologique anormal est observé chez 85% des partenaires masculins. Une relation significative est observée entre l'examen de sperme et l'examen andrologique, suggérant la nécessité de pratiquer des investigations cliniques afin d'identifier les causes d'infertilité masculine. Finalement, un couple sur deux réussit à avoir un enfant. Et l'âge des hommes de plus de 35 ans apparaît comme un facteur de risque majeur, ce qui devrait encourager les couples à entamer leur projet parental le plus tôt possible. En prenant en compte la composante temporelle dans l'issue reproductive de ces couples inféconds, les modèles de durée de vie obtenus sont très souvent instables du fait du grand nombre de covariables. Nous avons intégré des techniques de rééchantillonnage à des approches de sélection de variables. Bien que l'approche Random Survival Forests soit la meilleure en qualité de prévision, ses résultats ne sont pas facilement interprétables. Concernant les autres méthodes, les résultats diffèrent selon la taille de l'échantillon. L'algorithme stepwise intégré au modèle de Cox ne converge pas si le nombre d'événements est trop faible. L'approche qui consiste à choisir la meilleure division en bootstrappant l'échantillon à chaque noeud lors de la construction d'un arbre de survie ne paraît pas avoir une meilleure capacité prédictive qu'un simple arbre de survie quand l'échantillon est suffisamment grand. Finalement, le modèle de Cox avec une sélection de variables par pénalisation de type L1 donne un bon compromis entre facilité d'interprétation et prévision dans le cas de petits échantillons
Male reproductive health is an indicator of his overall health. It is also closely linked to environmental exposures and living habits. Nowadays, surveillance of male fertility shows a secular decline in sperm quality and increased disease and malformations of the male reproductive tract. The objective of this work is to study the male reproductive health in an epidemiologic aspect and through various statistical tools. Initially, we were interested in the pathology of testicular cancer, its incidence and its risk factors. Then, we studied the population of men consulting for male infertility, their andrological examination, their therapeutic care and their parenthood project. Finally, the birth event was analyzed through survival models: the Cox model and the survival trees. We compared different methods of stable selection variables (the stepwise bootstrapped and the bootstrap penalisation L1 method based on Cox model, and the bootstrap node-level stabilization method and random survival forests) in order to obtain a final model easy to interpret and which improve prediction. In South of France, the incidence of testicular cancer doubled over the past 20 years. The birth cohort effect, i. E. The generational effect, suggests a hypothesis of a deleterious effect of environmental exposure on male reproductive health. However, the living environment of man during his adult life does not seem to be a potential risk factor for testicular cancer, suggesting hypothesis of exposure to endocrine disruptors in utero. The responsibility of man for difficulties in conceiving represents 50% of cases of infertility, making the management of male infertility essential. In our cohort, 85% of male partners presented an abnormal clinical examination (either a medical history or the presence of an anomaly in andrological examination). Finally, one in two couples who consulted for male infertility successfully had a child. The age of men over 35 appears to be a major risk factor, which should encourage couples to start their parenthood project earlier. Taking into account the survival time in the reproductive outcome of these infertile couples, the inclusion of large numbers of covariates gives models often unstable. We associated the bootstrap method to variables selection approaches. Although the method of Random Survival Forests is the best in the prediction performance, the results are not easily interpretable. Results are different according to the size of the sample. Based on the Cox model, the stepwise algorithm is inappropriate when the number of events is too small. The bootstrap node-level stabilization method does not seem better in prediction performance than a simple survival tree (difficulty to prune the tree). Finally, the Cox model based on selection variables with the penalisation L1 method seems a good compromise between interpretation and prediction

Made available in DSpace on 2017-07-10T14:38:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Darlene.pdf: 3027621 bytes, checksum: d1ab315db089fef09b4be9add2730696 (MD5) Previous issue date: 2012-03-01
Resumo do Cap. 1 - A fragmentação de ambientes florestais naturais, oriunda do desmatamento, causa efeitos de borda, ilhas de vegetação, desabriga espécies, aumenta a endogâmia e pode causar até a extinção de espécies. Embora o Paraná, nos últimos anos, tenha reduzido 19 % da taxa anual de desmatamento e possua um número crescente de áreas de preservação, sua vegetação encontra-se fragmentada e pouco conhecida. O levantamento da diversidade florística de espécies arbóreas na Reserva Particular do Patrimônio Natural (RPPN) Fazenda Santa Maria, localizada no município de Santa Terezinha de Itaipu - PR visa conhecer a florística e a fitossociologia da área e comparar com áreas de mesma formação vegetacional. Para isso, foram implantadas 10 parcelas semipermanentes de 400 m2, incluindo na amostragem indivíduos com circunferência na altura do peito (CAP) igual ou superior a 15 cm. Os indivíduos coletados foram identificados através de bibliografia especializada e comparados com material de herbários. Foram encontradas 73 espécies, distribuídas em 61 gêneros e 34 famílias. Fabaceae foi a família com maior riqueza, sendo representada por 14 espécies. Meliaceae foi a segunda maior riqueza, com seis espécies. Em contraste, 23,53 % das famílias foram representadas por apenas uma espécie e um único indivíduo. As espécies mais abundantes foram Euterpe edulis Mart. (Arecaceae), com 124 indivíduos e Chrysophyllum gonocarpum (Mart. & Eichler ex Miq.) Engl. (Sapotaceae) com 33 e Sorocea bonplandii (Bail) W.C.Burger et al. (Moraceae) com 29 representantes. A maioria das espécies encontradas é secundária tardia e climácica, evidenciando que a RPPN encontra-se em estádio secundário a clímax de sucessão.

Au cours des dernières décennies, la détérioration de la santé des forêts a entraîné des épidémies fréquentes des ravageurs et pathogènes. Ces phénomènes menacent la capacité des forêts à fournir des biens et services écosystémiques à la société. Il est donc nécessaire de maintenir la santé des arbres et de réduire les effets des parasites et des agents pathogènes. Cette thèse considère trois problèmes de gestion du point de vue économique : l'invasion actuelle, l'invasion attendue d'un agent pathogène, et les attaques d'un parasite endémique. À partir de ces trois problèmes de gestion, la thèse vise à évaluer les impacts des ravageurs et des pathogènes forestiers et à informer sur la manière dont les ressources peuvent être réparties de façon optimale pour assurer la fourniture de biens et de services par la forêt à long terme.Les invasions biotiques ont un impact sur les prix des produits du bois du fait des chocs d'approvisionnement qui, à leur tour, influencent les choix de gestion forestière. Ceci permet d'introduire des effets de réaction entre les dynamiques écologiques et de marché. Le premier article vise à évaluer ces impacts en combinant un modèle d’équilibre partiel avec des modèles de diffusion spatiale et de mortalité, calibrés pour représenter le dépérissement du Frêne en France (causé par le pathogène Hymenoscyphus fraxineus). Les résultats montrent que les impacts dépendent généralement de la distribution des ressources, de la propagation du pathogène et de la structure du marché. On observe que les choix d’adaptation des gestionnaires forestiers (c'est-à-dire les choix de régénération et de récolte) sont une composante non négligeable de la perte de volume totale.Le deuxième article est axé sur la surveillance et le contrôle d’une invasion attendue. La surveillance et la détection précoce des espèces envahissantes sont importantes pour atténuer les dommages et réduire les coûts de contrôle. Dans le cas où plusieurs propriétaires sont concernés, l’effort de surveillance des propriétaires plus proches du point d'introduction n’est pas optimal, car il ne prend pas en compte les effets négatifs de l'invasion dans les propriétés voisines. Grâce à un jeu différentiel, combiné à un modèle épidémiologique, nous avons calculé la solution non coopérative et coopérative. Nous avons conçu un paiement monétaire pour soutenir la coopération en fonction d'une décomposition intertemporelle du système de négociation de Nash. Les résultats nous montrent que ce paiement garantit que l’accord entre les deux propriétaires est crédible et incitatif. Le modèle est calibré pour l’éventuelle invasion du nématode du pin (Bursaphelenchus xylophilus) dans le Massif Landais.L'objectif principal du troisième article est d'adapter la gestion forestière aux perturbations biotiques et abiotiques. On combine le modèle classique de Faustmann avec un modèle dynamique de population de ravageurs et un modèle de tempête pour calculer l'âge de coupe optimale et le bénéfice actualisé en séquence infinie (BASI) pour différents scénarios de perturbations. Le modèle est appliqué aux dégâts de la chenille processionnaire du pin (Thaumetopoea pityocampa) dans les Landes. Nos résultats ont montré que les tempêtes ont tendance à réduire l'âge optimal de la récolte, alors que le parasite tend à l'augmenter. Les éclaircies augmentent la rentabilité et constituent une stratégie de couverture efficace contre les deux risques. Dans le troisième article, nous avons introduit une règle de décision cut-or-keep pour modéliser le problème du propriétaire forestier après une tempête. Ces implications en termes de gestion sont étudiées plus en détail dans le quatrième article. Notre règle de décision conduit à des gains plus élevés (dans environ 75% des cas) qu’en suivant la règle, généralement utilisée en économie, qui consiste à couper et à replanter les arbres survivants indépendamment du niveau de dégâts
In recent decades, the deterioration of forest health resulted in frequent pests’ outbreaks and the diffuse pathogens’ presence. These phenomena threaten forests’ ability to supply ecosystem goods and services to the society. It is therefore necessary to maintain tree health and reduce pest’s and pathogen’s impacts. This thesis approaches three management problems from an economic perspective such as the current invasion and the incumbent invasion of a forest pathogen as well as the outbreaks of a native pest. Starting from these three pest and pathogen management problems, the thesis aims at assessing the impacts of forest pests and pathogens and, secondly, informing how resources can be optimally allocated for assuring the long-term provision of good and services.Pest and pathogens invasions have an impact on the prices of wood products via supply shocks, which, in turn, influence forest management choices, thus introducing feedback effects between market and ecological dynamics at a large scale. The first paper aims at evaluating these impacts by combining a recursive partial equilibrium model with spatial-explicit pathogen-spread and pathogen-induced mortality models calibrated to represent the ash dieback in France (caused by the pathogen Hymenoscyphus fraxineus). Results showed that impacts are not homogeneous across regions and generally depend on the resource distribution, pathogen spread and market structure. We observed that the behavioural adaptation of forest managers (i.e., regeneration and harvesting choices) is a non-negligible component of the total standing volume loss.The second paper focusses on monitoring and control of an incumbent invasion. Monitoring and early detection of invasive species is important to mitigate the damages and reduce the control costs. However, when multiple decision-makers are involved, the monitoring effort of frontier landowners (landowners closer to the introduction point) is suboptimal because it does not consider the negative impacts of the invasion spreading to neighbouring properties. Through a two-player differential game combined with an epidemiological compartmental model, we computed the non-cooperative and the cooperative solution. We designed a monetary payment to sustain cooperation based on an intertemporal decomposition of the Nash bargaining scheme. We showed that this payment assured time-consistent outcomes, meaning that the ex-ante agreement between the two landowners was credible and self-enforcing. The model was calibrated for the possible invasion of the pine wilt nematode (Bursaphelenchus xylophilus) in south-western France.In the last two papers, the analysis is downscaled from the landscape level to the stand level and concentrates on a native defoliator pest. The main objective of the third paper is to adapt forest management to biotic and abiotic disturbances. The classic Faustmann model was combined with a pest population model and a windstorm model to compute the optimal rotation age and the land expectation value (LEV) for different disturbances scenarios. The model was calibrated for maritime pine (Pinus pinaster) plantations in south-western France and Pine Processionary Moth (PPM, Thaumetopoea pityocampa) cyclical outbreaks. Our results showed that storms tend to reduce the optimal harvest age, whereas PPM tends to increase it. Overall, the impact of PPM on the rotation length prevails and, here, risks increase rather than decrease the optimal rotation length. Thinnings increased profitability and constitute an effective hedging strategy against both risks. In the third paper, we introduced a cut-or-keep decision rule to model the forest owner problem after a storm event. Its economic and management implications are further investigated in the fourth paper. Unlike previous economic studies which assumed clearing and replanting regardless of the level of damages, the cut-or-keep condition led to higher payoffs in roughly 75% of the cases

Resumo: O presente estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade e estrutura das sinúsias arbóreo/arbustiva e epifítica em um segmento de Floresta Ombrófila Densa Submontana, em paisagem de encosta, a partir de margem de ribeirão, nos limites do Parque Nacional da Serra do Itajaí - PNSI, no município de Blumenau/SC. Realizou-se a contextualização pedossequencial da encosta, ao longo da qual foram instaladas 33 parcelas de 100 m2 cada, amostrando-se todos indivíduos com perímetro a altura do peito maior ou igual a 15 cm. Foram calculados os parâmetros fitossociológicos e o índice de diversidade, assim como elaborada a curva de rarefação de espécies para comparar com outros levantamentos fitossociológicos da região. Para o estudo florístico da sinúsia epifítica, foram amostrados os epífitos ao longo de uma trilha (1.500 m) e nas parcelas do levantamento da vegetação arbórea (3.300 m2). As espécies epifíticas foram classificadas de acordo com sua relação com os forófitos em holoepífitos (característico, facultativo ou acidental) ou hemiepífitos (primário ou secundário). Para o levantamento fitossociológico dos epífitos foi analisado um forófito por parcela do levantamento arbóreo, totalizando 33 forófitos. Os forófitos foram divididos em três zonas ecológicas: fuste, copa interna e copa externa. Em cada zona ecológica foram registradas todas as espécies epifíticas, para calcular o valor de importância e elaborar curva de rarefação para comparar riqueza entre as zonas ecológicas do forófito. Foram amostrados 114 espécies, 72 gêneros e 36 famílias, representadas principalmente por Myrtaceae, Lauraceae e Rubiaceae. A densidade foi de 2.367 ind./ha e a dominância foi de 38,33 m2/ha. O índice de diversidade Shannon (H') foi elevado (4,13 nats/ind) e a riqueza específica foi mais elevada quando comparados com outros fragmentos da região. Fatores como movimento dos solos refletido nas características dos pedons deve exercer influência nesta característica comunitária, afetando também o porte médio dos indivíduos que tende ao decréscimo no terço superior da encosta. No levantamento florístico epifítico, foram registradas 158 espécies e morfoespécies, pertencentes a 76 gêneros e 23 famílias, sendo representadas principalmente por Orchidaceae, Bromeliaceae e Polypodiaceae. A categoria ecológica predominante foi dos holoepífitos característicos (83,5%). No levantamento fitossociológico foram registradas 131 espécies e morfoespécies (82,4% das espécies do levantamento florístico). As espécies com maior valor de importância foram Serpocaulon catharinae (Polypodiaceae), Vriesea vagans (Bromeliaceae) e Codonanthe devosiana (Gesneriaceae). Na copa interna foi registrado o maior número de espécies epifíticas (103) e no fuste o maior número de espécies exclusivas (25). A curva de rarefação apresentou diferença entre riqueza da copa interna e externa. Obteve-se correlação positiva entre a riqueza epifítica e os forófitos com maior diâmetro e maior inclinação. A área de pesquisa possui grande diversidade vegetacional que pode estar vinculada às características geopedológicas, as quais estão refletidas na estrutura da vegetação arbórea/arbustiva e esta, por sua vez, esta diretamente relacionada com a comunidade epifítica.

Orientador: Alexander Christian Vibrans.
Co-orientador: Pedro Higuchi.
Dissertação (mestrado) - Universidade Regional de Blumenau, Centro de Ciências Tecnológicas, Programa de Pós-Graduação de Engenharia Florestal.

Made available in DSpace on 2016-12-12T20:12:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGEF14MA021.pdf: 206259 bytes, checksum: bd7faaf217079dcff33f702a472c2892 (MD5) Previous issue date: 2014-06-10
Currently, several strategies have been employed in forest restoration process, being monitoring and evaluation of the restored areas key steps to verify if the practices actually allowed the recovery of the ecosystem. The objective of the study was to evaluate forest restoration by verifying the establishment of woody vegetation in a degraded APP in Pouso Redondo, SC, six years after sapling plantation and protection of the area. In the first chapter, the changing in tree species richness was determined; and in the second chapter, the structure of the adult and juvenile component was compared. For this, a census was conducted to inventory the adult trees (dbh ≥ 5 cm), being the area subdivided in 82 100 m2 plots, where all trees were identified and measured (dbh and height). For the survey of juvenile tree species (trees higher than 1 m height and dbh < 5 cm), the plots were subdivided in 25 m2 sub-plots, where all individuals were identified and measured (height). The variation in richness that occurred due to natural establishment of new species was obtained using the list of species initially planted. The dispersal syndromes and regeneration guilds were determined for the found species. The analyze of the floristic-structural composition of adult and juvenile components were conducted through NMDS (Nonmetric Multidimensional Scaling), phytosociological estimatives of components and distribution of individuals in diametric and height classes. A total of 918 individuals belonging to 73 species were found. From this list, 48 species 48 does not correspond to those that were planted in 2007. Most species were classified as zoocoric (71.2%) and light demanding species (54.8%). Both component showed segretation in the ordination produced by the NMDS. In the phytosociological analysis, Baccharis semiserrata DC. and Casearia sylvestris Sw. presented the highest IV (importance value) and (NRI) (natural regeneration index), respectively. The adult distribution of individuals in diametric classes showed an inverted j pattern and the distribution of adults and juveniles in height classes indicated a greater number of individuals in smaller classes. We conclude that after six years, the process of restoration was characterized by the trend of richness increment and tree species turnover where initial species are being replaced by late successional ones, indicating the relevance of natural regeneration mechanism. The results suggest that the study area is found in an initial stage of ecological succession process, without impeditive factors for the establishment of juvenile individuals, that suggest an elevated resilience for vegetation re-establishment
Atualmente inúmeras estratégias têm sido aplicadas no processo de restauração florestal, sendo que o monitoramento e a avaliação das áreas restauradas são etapas fundamentais para verificar se as práticas adotadas realmente possibilitaram a recuperação do ecossistema. Assim, o objetivo do trabalho foi avaliar a restauração florestal por meio da verificação do estabelecimento da vegetação arbórea em uma APP degradada em Pouso Redondo, SC, seis anos após o plantio de mudas e proteção da área. No primeiro capítulo foram determinadas as mudanças de riqueza de espécie, e no segundo capítulo objetivou-se comparar a estrutura do componente arbóreo adulto e jovem dessa floresta. Para isso, foi realizado um censo para inventariar as árvores adultas (DAP ≥ 5 cm), sendo a área dividida em 82 parcelas de 100 m2 cada, onde as árvores foram identificadas e mensuradas (DAP e altura). Para o inventário das árvores jovens (indivíduos arbóreos com mais de 1m de altura e DAP < 5 cm), as parcelas foram divididas em sub-parcelas de 25 m2, nas quais todos os indivíduos foram identificados e mensurados (altura). A partir da relação das espécies plantadas inicialmente, foi quantificado a variação da riqueza que ocorreu por meio do estabelecimento natural de novas espécies. Foram determinadas as síndromes de dispersão de propágulos e as guildas de regeneração das espécies encontradas. A composição florístico-estrutural dos componentes adulto e jovem foi analisada por meio de uma NMDS (Nonmetric Multidimensional Scaling), pelas estimativas fitossociológicas dos componentes e pelas distribuições dos diâmetros e alturas. Foram encontrados 918 indivíduos pertencentes a 73 espécies, sendo que 48 não correspondem àquelas que foram plantadas em 2007. A maioria das espécies encontradas foi classificada como zoocórica (71,2%) e clímax exigente de luz (54,8%). Os dois componentes apresentaram segregação na ordenação produzida pela NMDS,. Na análise fitossociológica, foram encontradas Baccharis semiserrata DC. e Casearia sylvestris Sw. como as espécies com maiores VI (valor de importância) e IRN (índice de regeneração natural), respectivamente. A distribuição diamétrica do componente adulto demonstrou padrão J invertido e a distribuição em altura dos componentes adulto e jovem obteve maior número de indivíduos nas classes menores. Conclui-se que após seis anos, o processo de restauração foi caracterizado pela tendência do aumento da riqueza e da substituição de espécies iniciais por tardias, indicando a relevância do mecanismo de regeneração natural. Os resultados sugerem que a área de estudo encontra-se em processo de sucessão ecológica em estágio inicial, sem fatores impeditivos para o estabelecimento de indivíduos jovens, o que sugere elevada resiliência para o restabelecimento da vegetação

Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais.
Aproximadamente um terço do território de Santa Catarina é coberto por remanescentes florestais, restritos muitas vezes a fragmentos menores que 50 hectares. Esta situação é agravada pela qualidade destes fragmentos que, com apenas 5% de florestas primárias, encontram-se em progressivo processo de sucessão. Na região sul do Brasil se concentram as maiores e principais reservas carboníferas do país. A explotação do carvão mineral praticada em épocas passadas no sul do estado de Santa Catarina deixou enorme passivo ambiental, com efeitos agravados pela poluição das águas, do solo e do ar. Em Urussanga, a maioria dos rios que atravessa o município, sofreu os efeitos da poluição afetando tanto a qualidade das águas como a vegetação de entorno. Este estudo se propôs a realizar levantamento florístico e estrutural da mata ciliar ao longo da bacia hidrográfica do rio Urussanga, considerando os diferentes estágios sucessionais da vegetação. Foi utilizado o método de parcelas distribuídas ao longo dos rios Maior (14 parcelas), Carvão (14), América (4), Deserto (8), Caeté (6), Salto (8) e Urussanga (4) que atravessam o município de Urussanga. Foram traçadas em cada ponto de amostragem duas parcelas de 10 m x 10 m, sendo a primeira distante um metro da margem do rio e a segunda distante 10 m a partir do final da primeira parcela, para registro dos indivíduos arbóreos e arborescentes com diâmetro a altura do peito (DAP) maior ou igual a 5 cm. Visando o levantamento do componente regenerante da floresta, cada parcela de 10 x 10 m foi dividida em 25 subparcelas de 2 m x 2 m, sendo cinco destas selecionadas por sorteio e amostrados os indivíduos com altura entre 0,2 m e DAP < 5 cm . Para a caracterização dos estágios sucessionais, propostos para este estudo, considerou-se a soma da densidade relativa das espécies de início de sucessão (pioneiras e secundárias iniciais) presentes nas duas parcelas amostradas : quando superior a 60%, as unidades amostrais foram consideradas em estágio inicial de sucessão ecológica (INI); entre 30% e 60% em estágio médio (MED) e inferior a 30% consideradas em estágio avançado de sucessão ecológica (AVA). Para comprovar a validade da classificação das unidades amostrais, foi realizada Análise de Variância Multivariada Permutacional (100000 permutações), considerando como fator preditivo os três estágios de sucessão propostos e a matriz de espécies/unidades amostrais; como fonte de variação secundária foi utilizada a distância da margem do rio. Para indicação de espécies potenciais para recuperação de áreas degradadas foi criado um índice potencial para recuperação, produzindo-se uma matriz onde o numeral 1 representa as características menos favoráveis para restauração e 2 as mais favoráveis, elencando-se quatro fatores: velocidade de crescimento da planta, dimensão da copa, densidade foliar e persistência das folhas na planta. Foram amostradas 60 espécies no estágio INI, 86 no MED e 73 no AVA, estando representadas pelos maiores valores de importância, por estágio sucessional, Alchorneatriplinervia (Spreng.) Müll. Arg., Hieronyma alchorneoides Allemão, Euterpe edulis Mart., respectivamente. Houve diferença significativa entre os estágios sucessionais, ocorrendo maior diferenciação entre os estágios médio e avançado. A composição da comunidade não foi afetada pela distância da margem do corpo d'água (fator distância do rio) possivelmente por não sofrer influência de inundações periódicas, pois os rios se apresentam encaixados.

Made available in DSpace on 2016-12-12T20:12:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGEF15MA042.pdf: 1375553 bytes, checksum: f93a1c6bfaca22be5ac8fae40f160f3c (MD5) Previous issue date: 2015-06-16
The present dissertation aimed to understand the functional, phylogenetic and the floristic-structural organization of the tree component, along a topographic gradient in a forest in Upper Uruguay River region. Information of this nature is critical for the definition of conservation plans, since it allows inferences about the ecological strategies of species to occupy different environmental conditions. For this, 50 10 × 20 m permanent plots were allocated along different topographic sectors (lower, middle, upper), where all individual tree species with circumference at breast height (cbh) equal to or greater than 15.7 cm had the cbh measured, the height estimated and the botanical identity determined. For the 20 most abundant species, the following functional traits were determined: basic wood density, maximum potential height, leaf area, specific leaf area,leaves lifespan, regeneration and dispersal guilds. The floristic-structural organization was analyzed through Shannon (H ) and Pielou (J) Indices, NMDS (Non-metric Multidimensional Scaling), Permutational Multivariate Analysis of Variance (PERMANOVA), Indicator Species Analyzes and contingency table. The functional traits were analyzed by Rao Q Index and community weight means values for plots (CWM). The phylogenetic structure was 18 determined by Mean Pairwise Distance analysis and K statistic of phylogenetic signal. The functional and phylogenetic structures were compared among sectors by Analysis of Variance, for normal distributions, or Kruskal-Wallis, for non-normal distributions, followed by post hoc tests. The results demonstrated that the tree component showed floristic-structural and ecological strategies variations in function of topographic sectors. The taxonomic, functional and phylogenetic diversity was lower in the lower sector, with predominance of trees with low wood density, large leaves, with smaller values of specific leaf area, than sectors situated at upper positions in the terrain. It was concluded that the topography represented an important source of heterogeneity of the tree component in small spatial scale. The capacity of species occupy different sectors in relief was influenced by their functional traits, reflecting different ecological strategies, which are partly phylogenetically conserved
A presente dissertação teve como principal objetivo entender a organização florística-estrutural, funcional e filogenética do componente arbóreo, ao longo de um gradiente topográfico, em uma floresta na região do Alto Rio Uruguai. Informações desta natureza são fundamentais para a definição de planos de conservação, uma vez que permitem inferências sobre as estratégias ecológicas das espécies para se desenvolverem em condições ambientais distintas.Para isto, foram alocadas 50 parcelas permanentes de 10 × 20m, ao longo de diferentes setores topográficos (inferior, intermediário e superior), onde todos os indivíduos arbóreos com circunferência na altura do peito (CAP) maior ou igual a 15,7 cm, tiveram a CAP medida, a altura estimada e identidade botânica determinada. Para as 20 espécies mais abundantes, foram determinados os seguintes atributos funcionais: densidade básica da madeira, altura máxima potencial, área foliar, área foliar específica, regime de renovação foliar, guildas de regeneração e de dispersão.A organização florística-estrutural foi analisada por meio dos índices de Shannon (H ) e de Pielou (J), NMDS (Escalonamento Multidimensional Não-métrico), Análise de Variância Multivariada Permutacional (PERMANOVA), Análise de Espécies Indicadoras e tabela de contingência. Os atributos funcionais foram analisados por meio do índice de Rao Q e os valores médios dos atributos ponderados para comunidade em cada parcela (CWM). A estrutura filogenética foi determinada por meio da análise de Mean Pairwise Distance (MPD) e pela estatística K para sinal filogenético de atributos funcionais. As estruturas funcional e filogenética foram comparadas entre setores por meio de Análise de Variância, para distribuição normal, ou Kruskal-Wallis, para distribuições não-normais, com testes post hoc.Os resultados demonstraram que o componente arbóreo apresentou variações florísticas-estruturais e de estratégias ecológicas em função dos setores topográficos. A diversidade taxonômica, funcional e filogenética foi menor no Setor inferior, que apresentou a predominância indivíduos com baixa densidade da madeira, folhas maiores e com menor área foliar específica, em relação as posições mais elevadas no relevo. Conclui-se que a topografia representou uma importante fonte de heterogeneidade do componente arbóreo em pequena escala espacial. A capacidade das espécies ocuparem diferentes setores no relevo foi influenciada por seus atributos funcionais, refletindo diferentes estratégias ecológicas, que, em parte são filogeneticamente conservadas

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduaçaõ em Biologia Vegetal.
Made available in DSpace on 2012-10-20T08:33:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 190703.pdf: 331034 bytes, checksum: 81e829c2cb9387b10d73e29262c009f3 (MD5)
A conservação da Floresta Atlântica supõe o conhecimento tanto da comunidade como da autoecologia das espécies que a compõem. Alguns dos primeiros trabalhos que tratam da Floresta Atlântica remontam do início do século XX. Mais tarde outras pesquisas foram desenvolvidas, tendo como pano de fundo a malária e a ecologia do mosquito transmissor no Sul do Brasil. Dentro deste contexto o Parque Botânico do Morro Baú, Ilhota/SC, faz parte da história e da paisagem, local onde este estudo foi realizado. O objetivo deste trabalho foi ampliar o conhecimento sobre a dinâmica de uma comunidade de Floresta Ombrófila Densa através da avaliação de parâmetros de auto-ecologia das espécies arbóreas. Foi estabelecida uma transecção de 10 x 1000m, onde a cota altimétrica varia 372/489m, com topografia bastante acidentada. Todos os indivíduos arbóreos com diâmetro a altura do peito (DAP) igual ou superior a 5cm foram mensurados, etiquetados e colhido uma amostra vegetal para posterior identificação. Foram identificadas 135 espécies, distribuídas nas zonações Encosta íngreme com 60 espécies, Pico de morro 67, Encosta suave 112 e Fundo de vale 65; das quais 72 foram classificadas como Higrófilas, 42 Indiferentes e 21 Xerófilas. Quanto aos Grupos de densidade registrou-se como Muito Comum 1 espécie, Comum 14, Pouco Comum 40, Esparso 34 e Muito Esparso 46. Dentro dos grupos ecológicos, 60 foram incluídas como climácica, oportunista 61, pioneira de clareira 12 e pioneira edáfica 2. Quanto à estratégia de regeneração foi registrado 102 espécies com banco de plântulas e 33 com banco de sementes. Considerando-se o porte, 55 são Macrofanerófitas, 73 Mesofanerófitas e 7 Nanofanerófitas. A floração mostrou sazonalidade com picos de produção nos meses de verão com média de 49,25 (dp.18,25) espécies/mês. A frutificação denotou comportamento de pouca variação sazonal com 41,5 (dp.4,60) espécies/mês. Os frutos foram enquadrados em cinco categorias funcionais: bacóide 52, drupóide 48, capsulóide 28, samaróide 4 e vagem indeiscente 3. A caracterização das espécies dentro das síndromes de polinização demonstrou predomínio da zoofilia (129 espécies) e o da anemofilia (06). Quanto ao número de sementes de cada fruto: 106 espécies 1-5 sementes, 15 com 6-13, 6 com 15-30 e 8 com 50-125. Classificando-as segundo o volume, 85 espécies pertencem ao grupo 0,002-0,999 cm3 dos frutos, 19 espécies > 10 cm3. Quanto ao número de sementes, observou-se: Unisseminadas 37 espécies, 2-4 sementes 66, 5-10, 10 e > 10, 22. No conjunto, ficou evidente a grande especificidade de adaptações de cada uma das espécies, tendendo a comunidade a possuir elevados níveis de interação com a fauna, principalmente através dos fenômenos de polinização e dispersão de suas sementes. Este trabalho mostrou a necessidade de estudos mais detalhados em campo, sobre cada uma das espécies como condição imprescindível para ações de conservação e manejo das comunidades florestais da Floresta Ombrófila Densa.

Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais.
Contomastix lacertoides é um teiídeo de hábitos diurnos que ocorre em ambientes de campo e restinga no sul do Brasil. No presente estudo, foram analisados dados da ecologia da espécie em um ambiente de restinga arbustivo-arbórea, em Jaguaruna, sul de Santa Catarina, contemplando três dimensões de nicho: temporal, espacial e trófico e investigamos a influência de fatores ambientais locais na ecologia da espécie. O estudo ocorreu entre julho de 2015 e setembro de 2016, com amostragens mensais realizadas durante quatro a cinco dias consecutivos. As coletas de dados sobre a atividade da espécie foram realizadas com busca ativa, enquanto dados sobre a dieta foram obtidos através de exemplares capturados manualmente ou com uso de armadilhas de queda (pitfall traps with drift fence) e coleta de presas disponíveis no ambiente. Contomastix lacertoides esteve ativo ao longo de todo ano, não diferindo sazonalmente. A espécie foi influenciada mais fortemente pela radiação do que pela temperatura. O uso de micro-hábitats diferiu entre espécimes juvenis e adultos, onde adultos utilizaram o folhiço no bordo das moitas de vegetação com frequência superior aos outros micro-hábitats, enquanto juvenis utilizaram a areia nua com maior frequência do que adultos. A dieta da espécie foi composta principalmente por aranhas. A frequência, importância e volume dos itens consumidos diferiu entre juvenis e adultos e entre as estações. Não houve correlação entre a dieta e a frequência ou abundância dos recursos alimentares disponíveis no ambiente. No entanto, a dieta da espécie esteve positivamente correlacionada com a massa das presas disponíveis. A espécie apresentou dimorfismo sexual no tamanho e espécimes maiores apresentaram maiores tamanhos de cauda. A atividade anual da espécie, o uso de micro-hábitat e a composição da dieta registradas diferem parcialmente da literatura, sugerindo que estes aspectos estão sujeitos a variações locais dos recursos térmicos, espaciais e tróficos disponíveis no ambiente.

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Made available in DSpace on 2017-04-03T18:51:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 paulooswaldogarcia.pdf: 7631640 bytes, checksum: 323589981d539c20fc366715afa07f10 (MD5) Previous issue date: 2007-05-07
CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Os distúrbios antrópicos como a atividade cafeeira na Zona da Mata de Minas Gerais foram os principais fatores responsáveis pela eliminação da cobertura vegetal. Com a redução dessas pressões em Juiz de Fora houve a regeneração dos ecossistemas florestais, principalmente, das florestas secundárias. A Reserva Biológica Municipal Santa Cândida, localizada no município de Juiz de Fora (21º41’20’’S e 43º20’40’’W), na Zona da Mata mineira, é um remanescente de floresta secundária com uma área estimada de 113,3 ha, cuja composição da flora arbórea ainda é desconhecida. O presente trabalho objetivou (a) caracterizar a composição florística e a estrutura da vegetação em diferentes trechos da reserva, (b) estabelecer a similaridade entre estes e (c) entre a reserva e outras áreas inventariadas em Minas Gerais. Para isso, foram estabelecidas 84 parcelas distribuídas em trechos de interior (Int-1, Int-2, Int-3) e borda (Bor-1, Bor-2, Bor-3) do fragmento, totalizando uma área amostral de 0,84 ha. Foram amostrados todos os indivíduos com circunferência a 1,30 m do solo (CAP) maior ou igual a 15 cm. No total, foram registrados 1.968 indivíduos, pertencentes a 52 famílias, 113 gêneros e 176 espécies. O índice de diversidade de Shannon-Wiener (H’) para a reserva foi de 4,298 e a equabilidade de Pielou (J’) foi igual a 0,83. Fabaceae (quanto à riqueza específica) Lauraceae, Meliaceae e Euphorbiaceae (tanto para riqueza de espécies quanto para abundância) apresentaram uma menor representatividade nos trechos de borda, sugerindo uma baixa tolerância a condições ambientais e bióticas mais severas. Por outro lado, Moraceae e Erytrhoxylaceae apresentaram uma maior representatividade nesses trechos. Cupania ludowigii, Piptadenia gonoacantha, Myrcia splendens, Apuleia leiocarpa e Guapira venosa se destacaram, juntamente com a categoria de mortas pelo valor de importância. Das espécies arbóreas presentes na reserva, 24 não tinham registro de ocorrência para o subdomínio do Vale do Paraíba do Sul e, destas, 9 não foram citadas para o estado de Minas Gerais. Aproximadamente 41% das plantas amostradas apresentaram altura entre 6,1 m e 10 m, com ampla variação de altura, com as emergentes apresentando até 36 m. Quanto às classes de circunferência, houve uma concentração de indivíduos nas menores classes, assegurando a regeneração do dossel pela reposição das plantas mortas. Não houve diferenças entre os índices de diversidade de Shannon-Wiener entre os trechos, porém as áreas de interior apresentaram uma riqueza de espécies observada maior. Os trechos Int-1 e Int-2 apresentaram a maior similaridade florística (58,6%), proporcionando a formação de um grupo através da análise de agrupamento, no entanto, a heterogeneidade entre a composição dos trechos dificultou a formação de outros grupos. Essa dissimilaridade vii ocasionou a separação clara de três trechos na reserva por meio da análise de correspondência distendida (DCA), divididos principalmente em decorrência dos trechos de borda Bor-1 e Bor-2. As análises estatísticas revelaram existir diferença significativa entre parte dos trechos de interior e as áreas de borda nos parâmetros de densidade absoluta, número de espécies por parcela e distribuição de freqüência de indivíduos por classes de circunferência e altura. Na reserva, há um predomínio de espécies secundárias iniciais e tardias em detrimento de espécies pioneiras. Porém, a maior abundância do grupo das secundárias iniciais influenciou o valor obtido para o índice sucessional (IS=2,11), indicando que a comunidade florestal encontra-se em estádio sucessional intermediário. Contudo, nos trechos de borda (Bor-1, Bor-2) o índice sucessional foi inferior a 2, o que sugere um estádio menos avançado da sucessão, face à maior abundância de espécies pioneiras e poucas espécies tardias. Desse modo, a caracterização da composição e da estrutura arbórea revelou uma grande diversidade florística, e ressalta a necessidade da implantação de atividades de manejo que assegurem a integridade da unidade de conservação, em função das condições diferenciadas entre os trechos e seu entorno.
The anthropogenic disturbances as coffee plantation in the Zona da Mata of Minas Gerais were main factors to the elimination of the vegetal coverage. After the reduction human activities in Juiz de Fora, there was the recovery of degraded ecosystem, resulting on secondary forests. The Biological Reserve Santa Cândida, situated in Juiz de Fora county (21º41' 20''' 40' S and 43º20' W), Zona da Mata of Minas Gerais, is a remnant secondary forest fragment with an area of 113,3 ha, whose tree community composition is still unknown. This study had as its aim (a) characterize the foristic composition and the structure of the vegetation in different areas in Biological Reserve Santa Cândida, (b) compare the floristic composition in internal and edge stands in the forest fragment through similarity coefficient, (c) test by cluster analysis the floristic composition among tree community sampled in Biological Reserve Santa Cândida and other surveys in Minas Gerais State. The phytosociological survey was made by 84 plots laid on the edge (Bor-1, Bor-2, Bor-3) and internal (Int-1, Int-2, Int-3) stands, resulting in 0,84 ha sampled area. All trees with circumference at breast height ≥ 15 cm were identified and measured (circumference and height). The survey registered 1.968 trees, distributed in 176 species, 113 genera and 52 families. The values of the Shannon-Wiener index (H') and equability respectively were 4,298 and 0,83. The families Fabaceae, Lauraceae, Meliaceae and Euphorbiaceae, as in species richness as abundance, were less common in edge stands, suggesting low tolerance in hardest biotic and abiotic conditions. Differently, Moraceae and Erytrhoxylaceae showed significant increase in species and individuals amount in the edge stands. In the case of sampled death plants and the species Cupania ludowigii, Piptadenia gonoacantha, Myrcia splendens, Apuleia leiocarpa e Guapira venosa were registered highest importance values in reserve. Some 24 trees species sampled in this study were not registered with distribution in Valley of South Paraíba and 9 species presented new occurrence in Minas Gerais State. Approximately 41% of the sampled individuals had height values between 6,1 m and 10 m with wide range in height class distribution and emergent layer reaching 36 m. The analysis of size class distribution demonstrated a concentration of individuals in the lesser size class, which may assure the canopy regeneration by replacement of the death plants. There wasn’t significant difference between Shannon-Wiener index between stands, but the internal stands showed highest observed species richness. The Int-1 and Int-2 stands had highest value to similarity coefficient (58,6%), which promoted the gathering of their floristic compositions through cluster analysis. However the different floristic compositions among other stands hindered the observation of other groups. This floristic ix heterogeneity in the Biological Reserve Santa Cândida tree community produced clear separation of three of six stands by detrended correspondence analysis (DCA) and resulting ordination analysis was directly influenced by tree species presents in edge stands Bor-1 and Bor-2. The statistical analysis demonstrated significant difference in the parameters density, number of species by plot, size class distributions and height class distributions between internal and edge stands. The ecological group analysis in this survey showed predominance of early and late secondary in detriment of pioneer species. The abundance of early secondary species affected the successional index value in the forest community (SI=2,11), indicating that forest community is intermediate successional stage. However, in the edge stands (Bor-1, Bor-2) the successional index values were about 2, due to an increase in the abundance of pioneer and a decrease in late secondary species, suggesting an initial stage in successional process. Therefore, the tree community composition and structure gained in this survey characterized a mosaic in the forest fragment and made the implantation of conservation activities in bordering stands evident to assure the integrity of the unit of conservation.

Submitted by Filipe dos Santos (fsantos@pucsp.br) on 2017-09-28T12:41:38Z No. of bitstreams: 1 Verónica Andrea Peralta Meléndez Molina.pdf: 4005665 bytes, checksum: 1745d2821a62a27c7737cb28ad457130 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-09-28T12:41:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Verónica Andrea Peralta Meléndez Molina.pdf: 4005665 bytes, checksum: 1745d2821a62a27c7737cb28ad457130 (MD5) Previous issue date: 2017-09-12
This project reflects about the use of educational videos as a learning tool in Flipped Classroom and discusses what applications and strategies can be used with this new methodology for better use, both the student and the teacher. In our analysis, the use of this methodology allows construction of a significant learning with more dynamism and autonomy, improving the use of the proposed activities and topics in the classroom. In this research, we will also point out how using video in Flipped Classroom makes classes with less extensive explanations possible, direct and objective, when recorded on video that can be accessed by students through mobile devices, desktop computers and Ipads. Class time is released for use in other learning activities such as individual exercises or in pairs, discussion, projects or group work, having the teacher available in the classroom to act as mediator. The research noted the use of the videos in Flipped Classrooms in ‘Colégio Arbos’, in Santo André, and tried to understand if this tool helped in building meaningful learning and how it helped. The research methodology that was used was the case study. The teachers answered a questionnaire and the dice studies were performed through content analysis of Bardin
Este projeto tem como objetivo a utilização dos vídeos educacionais como ferramenta de aprendizagem na Sala de Aula Invertida e abordaremos sobre quais aplicativos e estratégias podem ser usados com esse novo modelo pedagógico para que haja um bom aproveitamento, tanto por parte do aluno, quanto por parte do professor. Na nossa análise, o uso dessa ferramenta metodológica possibilita a construção de uma aprendizagem significativa, dinâmica e autônoma, o que evidencia uma melhora no aproveitamento das atividades e temáticas propostas em sala de aula. Nesta pesquisa, apontamos como o uso do vídeo na Aula Invertida viabiliza aulas com explicações menos extensas, diretas e objetivas; quando gravadas em vídeo, que podem ser acessados pelos alunos por meio de seus dispositivos móveis, computadores de mesa e Ipads. Dessa forma o tempo de sala de aula é liberado para ser aplicado em outras atividades de aprendizagem como, por exemplo, exercícios individuais ou em duplas, discussões, projetos ou trabalhos em grupo, tendo o professor tempo disponível em sala para atuar como mediador. A pesquisa observa o uso dos vídeos na Sala de Aula Invertida no Colégio Arbos, de Santo André, e tenta entender se e como o uso do vídeo na Sala de Aula Invertida auxilia na construção do ensino aprendizagem

Made available in DSpace on 2017-07-10T14:38:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thais Regina.pdf: 7142284 bytes, checksum: 2477288921627880d68c3803d0b9746f (MD5) Previous issue date: 2013-02-15
Leguminosae Juss. is the third largest family of Angiosperms, comprising 727 genera and 19,325 species. Due the great N2 fixation in the soil, this family represents one of the leading families in floristic, phytosociological studies and recovery projects of degraded areas. However, some of these species have dormancy, which hinders germination. Such species variety can lead to difficulties in identification, particularly in sterile sample collection. Therefore this study aimed to develop a list with field tips, systematic identification keys and an illustrated guide, addressing the major vegetative diagnostic features of Leguminosae arboreal of Corredor de Biodiversidade Santa Maria, PR; as well as evaluate the germination test and treatments to overcome Seed dormancy of 10 Mimosa bimucronata (DC.) Kuntze. Samples have been collected in different areas of the Corridor. Legumes collected were photographed, recording morphological and vegetative stem rhytidome, staining the inner bark and / or sapwood, presence of gum shape of the leaflets, the presence of spines, glands, hairiness, and when present, flower and fruit. The samples were identified and housed into the Herbario da Universidade Estadual do Oeste do Paraná. For breaking dormancy were tested different treatment and also performed curve soaking to these seeds. Was prepared with a list of 29 tips field Leguminosae species found in the study area, which were made for one dichotomous key and a guide with plates illustrating the main diagnostic vegetative characteristics in order to assist in the identification of species of Leguminosae present in West of Paraná. The treatments with higher germination percentage and better germination speed were: immersion in sulfuric acid (10 min); soaking in acetone for 15 min, cutting the integument and immersion in water at 80oC (cooling in 24 hours), being the latter the most indicated. But all are efficient to overcome dormancy of M. bimucronata by increasing the percentage of germinated seeds and germination rate
Leguminosae é a terceira maior família de Angiospermas, compreendendo 727 gêneros e 19.325 espécies, representando uma das principais famílias em estudos florísticos e fitossociológicos. Tal riqueza pode ocasionar dificuldades na identificação, principalmente em coletas de amostras estéreis. O objetivo do presente estudo foi elaborar um guia ilustrado com dicas de campo, bem como uma chave de identificação abordando as principais características vegetativas diagnósticas das Leguminosae arbóreas do Corredor de Biodiversidade Santa Maria, o qual une a Faixa de Proteção do Lago de Itaipu ao Parque Nacional do Iguaçu. O corredor que reúne vários remanescentes de Floresta Estacional Semidecidual do sudoeste do Paraná e áreas reflorestadas. Foram coletadas amostras em diferentes áreas do corredor, sendo três remanescentes florestais (Parque Nacional do Iguaçu, Reserva Legal da Fazenda São José, Reserva Particular do Patrimônio Natural da Fazenda Santa Maria e matas ciliares do rio Bonito), e duas áreas reflorestadas (Faixa Seca e Faixa de Proteção do Lago de Itaipu). As leguminosas coletadas foram fotografadas ainda em campo, com câmera semiprofissional, registrando aspectos morfológicos vegetativos como tronco, ritidoma, coloração da casca interna e/ou alburno, presença de exsudato, formato dos folíolos, presença de acúleos, glândulas, pilosidade e, quando presentes, estruturas reprodutivas. As amostras foram identificadas e adicionadas ao Herbário da Universidade Estadual do Oeste do Paraná. Foram encontradas 29 espécies de Leguminosae, para as quais foram elaborados um guia com pranchas, ilustrando as principais características vegetativas diagnósticas, bem como uma chave dicotômica, a fim de auxiliar na identificação das espécies de Leguminosae presentes no sudoeste do Paraná. Características do tronco como ritidoma, casca interna e/ou alburno, formato e coloração dos folíolos, presença de exsudado, acúleos, pilosidade ou glândulas foram de grande valia em campo, pois permitiram a identificação das espécies de Leguminosae do Corredor de Biodiversidade Santa Maria

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-26T12:59:21Z No. of bitstreams: 1 Jose Fragoso da Silva Junior.pdf: 1120298 bytes, checksum: 87c84dddb76b274029fbd85ebfa173c3 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-08-26T12:59:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Fragoso da Silva Junior.pdf: 1120298 bytes, checksum: 87c84dddb76b274029fbd85ebfa173c3 (MD5) Previous issue date: 2004-11-26
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
The present work aims to establish a support to the dynamic of arboreous species in a remanent of Atlantic Forest in Cabo de Santo Agostinho, PE, therefore, contributing to the floristic and phytosociologic knowledge of remanent Forest of Zona da Mata in Pernambuco. The Reserva Ecológica (RESEC) de Gurjaú is located in the rural area Cabo de Santo Agostinho town (08º10’00’’ – 08º15’00’’ S of South latitude and 35º02’30’’ – 35º05’00’’ W) of West longitude). RESEC’s area is 1.077,10 ha. The annual average rain precipitation is 2.400mm and the temperature is 24,7ºC . The vegetation is a Dense Ombrofilous Forest. The samples made were 40, sistematically with an area of 250m² were sistematically made, with a total area of 1,0 ha, 25m apart from one another. All the individual adult samples at DBH ≥ 15cm and for the regeneration study DBH < 15 cm. That survey led to the identification of 112 arboreous species in 31 botanic families, among those Moraceae and Myrtaceae were of a greater number. These species produced a diversity index of Shannon e Weaver (H’) of 3,91 nats/individuos. The Red List of Threatened Plants of IUCN (The World Conservation Union) in “Vulnerable” category. The diametrical distribution showed a pattern typical of inequian, i.e., a curve in the shape of an inverted “J”, which is expected for a secondary forest in initial succession phases. The regeneration presented 909 individuals belonging to 33 families, the Annona glabra was most distinguished with 83 individuals in the three height classes (NRC). In general the Reserva Ecológica de Gurjaú is developing its successional process in an efficient way and efficiently assuringthe phytophysionomy for the Dense Ombrofilous Forest in the State of Pernambuco. Those studies are of a great importance sustainably preserving and conserving the remanining Rain Forest resources
O presente trabalho teve como objetivo estabelecer uma base para estudo da dinâmica das espécies florestais arbóreas em um remanescente de Floresta Atlântica na Reserva Ecológica (RESEC) de Gurjaú, PE, contribuindo, assim, para o conhecimento florístico e fitossociológico dos remanescentes florestais da Zona da Mata de Pernambuco. A Reserva Ecológica de Gurjaú está localizada na zona rural do município do Cabo de Santo Agostinho (08º10’00’’ –08º15’00’’ de latitude Sul e 35º02’30’’ – 35º05’00’’ de longitude Oeste). No total, a RESEC ocupa uma área de 1.077,10 ha. A precipitação média anual é em torno de 2.400 mm e a temperatura é de 24,7ºC. A vegetação é de Floresta Ombrófila Densa. Foram instaladas sistematicamente 40 parcelas de 250 m², totalizando uma área de 1,0 ha, distando 25 m uma da outra. Foram amostrados todos os indivíduos arbóreos na fase adulta com CAP ≥ 15 cm e para o estudo da regeneração CAP < 15 cm. O levantamento efetuado permitiu a identificação de 112 espécies arbóreas, distribuídas em 31 famílias botânicas, das quais Moraceae e Myrtaceae contribuíram com maior número de espécies. Estas espécies, produziram um índice de diversidade de Shannon e Weaver (H’) de 3,91 nats/indivíduos. Foram constatadas a presença de quatro espécies, Chrysophyllum splendens Spreg, Ficus mexiae Standl., Myrcia grandiflora O. Berg e Trichilia silvatica C.DC. na lista da flora oficialmente ameaçada de extinção (Red List of Thretned Plants) da IUCN (The World Conservation Union) na categoria “Vulnerável”. A distribuição diamétricaapresentada se mostrou em forma geométrica decrescente (“J” invertido). Esta configuração é prevista para uma floresta ineqüiânea secundária em estágios iniciais de sucessão. A regeneração apresentou 909 indivíduos, pertencentes a 33 famílias. A Annona glabra foi a espécie que mais se destacou, com 83 indivíduos, presente nas três classes de altura (RNC). De modo geral, a Reserva Ecológica de Gurjaú está desenvolvendo seu processo sucessional de forma eficiente e garantindo a fitofisionomia para Floresta Ombrofila Densa no Estado de Pernambuco. Estes estudos são de grande importância na preservação e conservação dos recursos remanescentes da Floresta Tropical.

Made available in DSpace on 2016-12-12T20:12:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGEF15MA043.pdf: 302159 bytes, checksum: 356c59259d1f7d46382f6efeff6b11e4 (MD5) Previous issue date: 2015-05-29
This dissertation aimed to investigate the influence of spatial structure and environmental variables on floristic-structural organization of the tree component in an Araucaria Forest, in Santa Catarina. For this, 48 200 m2 sampling units were allocated in a forest remnant, located in an alluvial plain along Caveiras river, in the municipality of Lages, SC. All trees within sampling units with diameter at breast height, measured at 1.30 m above the ground (dbh), equal to or greater than 5 cm were measured and identified. The environmental variables measured in each sampling units were: water table level, chemical and physical soil properties, topography, canopy cover and environmental impacts. The spatial variables were determined using the analysis of principal coordinates of neighbour matrices (PCNM), through the geographic coordinates from each sampling units. The data were analyzed through Mantel Correlogram, Variation Partitioning, Redundancy Analysis (RDA s) and correlation tests. A total of 1,462 individuals, belong to 66 species, were sampled. Together, the environmental and spatial variables explained 24,13% of total variation, with the largest part (15,22%) being spatially structured. The most significant environmental variables were topography (maximum elevation difference) and fertility (bases sum and P). It is possible to conclude that the tree component is organized as a floristic-structural gradient. Futhermore, the results suggest that the inundation regime and the presence of flood prone areas were relevant for micro-habitats definition, that influenced the distribution of species
A presente dissertação teve como objetivo investigar a influência da estruturação espacial e de variáveis ambientais sobre a organização florístico-estrutural do componente arbóreo em uma Floresta Ombrófila Mista Aluvial, em Santa Catarina. Para isso, foram alocadas 48 unidades amostrais de 200 m2 no remanescente, localizado em uma planície aluvial nas margens do rio Caveiras em Lages, SC. Todos os indivíduos dentro das unidades amostrais com diâmetro na altura do peito, medido a 1,30 m do solo (DAP), igual ou superior a 5 cm foram mensurados e identificados. Foram mensuradas as variáveis ambientais em cada uma das unidades amostrais: nível freático, propriedades químicas e físicas nos solos, topografia, cobertura do dossel e impactos ambientais. As variáveis espaciais foram determinadas por meio da análise de Coordenadas Principais de Matrizes Vizinhas (PCNM), a partir das coordenadas geográficas de cada unidade amostral. Os dados foram analisados por meio de Correlograma de Mantel, Particionamento da Variância, Análises de Redundância (RDA s) e testes de correlação. Foram amostrados 1.462 indivíduos pertencentes a 66 espécies. Conjuntamente, as variáveis ambientais e espaciais explicaram 24,13% da variação total, sendo que a maior parte (15,22%) encontrou-se espacialmente estruturada. Das variáveis ambientais, a topografia (desnível máximo) e a fertilidade do solo (soma de bases e P) foram as mais significativas. Conclui-se que o componente arbóreo está organizado na forma de um gradiente florístico-estrutural. Ainda, os resultados sugerem que o regime de inundação do rio e a presença de zonas de maior encharcamento do solo foram relevantes na definição de micro-habitats, que influenciaram na distribuição das espécies

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2017-12-11T12:45:44Z No. of bitstreams: 1 PGEF16MA067.pdf: 68542 bytes, checksum: 23aa33dada350b049cf9be80cf0294d9 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-12-11T12:45:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGEF16MA067.pdf: 68542 bytes, checksum: 23aa33dada350b049cf9be80cf0294d9 (MD5) Previous issue date: 2016-06-24
FAPESC
Uniedu
This dissertation aimed to identify the impact of reservoir filling of a hydroeletric power station on the floristic-structural compostion of the tree component in ecotonal fragment between Mixed Ombrophilous Forest and Deciduous Forest, located in the municipality of São José de Cerrito, SC. Two survey were conducted: in the first and second year after the reservoir water filling. For this, 48, 200 m2, plots were allocated through stratified systematic sampling, in three sectors: bottom (sector 1), adjacent to the reservoir, middle slope and upper slope. The trees within plots with circumference at breast height (cbh) ≥ 15,7 cm were identified and measured (cbh), and, in the second evaluation year, the dead trees were counted and recruits incorporated to survey. In each plot, the following environmental variables were obtained: edaphic, topographic and environmental impact. The data were analyzed by phytosociological estimates, demographic dynamics, multivariate analysis and modelling techniques. In the first year, the high number of dead trees (second greatest value of relative importance in community: 9.59%) stood out, with a significantly great number in the sector 1 (p < 0,05), which could be associated to the proximity to water reservoir. The dynamics demonstrated stability in richness and individuals number, whereas there were differences among sectors, with sector 1 presenting greater basal area loss (2.51%.year-1) than others. There was a weak relation between dynamics and evaluated environmental variables, indicating that the trees development is mostly associated to non-evaluated variables, such as reservoir influence. Thus, the present study indicates that the first effects of reservoir can be observed two years after the process of water filling
A presente dissertação objetivou identificar o impacto do enchimento do reservatório de uma Usina Hidreletrica (UHE) na composição florístico-estrutural do componente arbóreo de um fragmento em ecótono entre Floresta Ombrófila Mista e Floresta Estacional Decidual localizado no município de São José do Cerrito, SC. Foram realizadas duas avaliações: no primeiro e no segundo ano após o enchimento do reservatório. Para isso, foram alocadas 48 parcelas de 200 m² cada, de forma estratificada-sistemática, em três setores do fragmento: adjacente às margens do reservatório (setor 1), meio da encosta e topo da encosta. Os indivíduos arbóreos dentro das parcelas com circunferência a altura do peito (CAP) ≥ 15,7 cm foram identificados e mensurados (CAP), sendo que, no segundo ano de avaliação, os indivíduos mortos foram quantificados e os recrutas incorporados ao levantamento. Em cada parcela, foram mensuradas as variáveis ambientais: características edáficas, topográficas, de luminosidade e de impacto ambiental. Os dados foram analisados por estimativas fitossociológicas, cálculos de dinâmica, análises multivariadas e técnicas de modelagem. Destaca-se, no primeiro ano, o elevado número de indivíduos mortos (segundo maior valor de importância na comunidade: 9,59%), sendo significativamente maior no setor 1 (p < 0,05), o que pode estar associada à maior proximidade com a lâmina d’água. A dinâmica apresentou estabilidade na riqueza e em número de indivíduos, porém, entre os setores houve distinções, sendo o setor 1 caracterizado pela maior taxa de perda em área basal (2,51%.ano-1). Houve pouca relação das taxas de dinâmica com as variáveis ambientais analisadas, indicando que a maior influência encontrada sobre o desenvolvimento das árvores está associada a variáveis não utilizadas nas análises, como a influência do reservatório. Assim, o presente estudo indica que, dois anos após o enchimento do reservatório, foi possível perceber os primeiros efeitos do enchimento do lago da hidrelétrica na comunidade arbórea

Made available in DSpace on 2016-12-06T17:42:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV15DA013.pdf: 15037964 bytes, checksum: 47abd4c0a1804357ba3a6efa2cc693f5 (MD5) Previous issue date: 2015-02-20
The Mixed Ombrophylous Forest (MOF) belongs to the Atlantic Forest Bioma and it is a forest formation rich in endemic vegetation species. It occurs mostly in South Brazil. This study aimed to survey the floristic composition, structure and environmental effects of the anthropization on the shrub-arboreal community in Complexo Serra da Farofa State Natural Patrimony Particular Reservation Plot VI in the Municipality of Rio Rufino, Santa Catarina State. The floristic survey of species of all habitats was done in all the area within a period of the 24 months (2011/2013) and in plots of 60 x 20m which were installed from the antique roads towards the interior of the forest fragment. The plots were splitted at each 10m which made possible to measure the gradient-edge (0-30m) and interior (30-60m). Were assessed the environmental variables: temperature (ºC), air relative humidity (%),covering canopy (%), diameter at breast height (DBH), higher or equal to 05 cm at 1.30 m height, total height (m) of all the live arboreal individuals, number of individuals and identification of species. The data were analyzed through the Mann-Withney Test, nonparametric multivariate variance analysis (NPMANOVA), non-metric multidimensional scaling analysis (NMDS), where the vectors of the significant environmental variables (p ≤ 0.01) were plotted a posteriori, besides the analysis of the indicator species. The floristic-structure groups were partitioned due to their higher or lower anthropization.The floristic survey registered 178 genus, 82 families and 269 species.Were listed 90 herbaceous species, 85 arboreous species, 43 shrub, 22 epiphytes and 29 lianas and or climbing vine plants. Sequently, the data of phytosociology of the area showed the structural profile of woody component which resulted in 1,365 individuals belonging to 72 species, distributed in 48 genus and 27 families. The mostly of the families sampled (54,84%) was represented by only one specie which points out a high diversity in the area. The species with higher Importance Value (IV) were Clethra scabra Pers, Sapium glandulosum (L.) Morong, Drimys angustifolia Miers, Lamanonia ternata Vell e Myrceugenia myrcioides (Cambess.) O. Berg.. The diversity indexes of Shannon and the Pielou were 3.11 and 0.73, respectively showing a high diversity and equity in distribuition of individuals per species. Were observed significant differences between the sectors, but not between the edge and the interior of the plots inside the sectors.The data surveyed through this study infer the existence of a diverse forest remaining with a presence of endemic and extinction threatened species. Due to the great ecologic importance to the fauna, flora and production of water in the region, this remaining must be considered as High Conservation Value Area (HCVA) and it must be protected and conserved. The heterogeneity of vegetation observed in the environment reinforces the importance of these places as environments in full process of environmental self-recovery and thus as places considered for the conservation of in situ of native vegetation species in environment of Upper Montane Mixed Ombrophylous Forest
A Floresta Ombrófila Mista (FOM) pertence ao Bioma Mata Atlântica e trata-se de uma formação florestal rica em espécies vegetais endêmicas, ocorrente preferencialmente na região Sul do Brasil. O trabalho teve como objetivo conhecer a composição florística, a estrutura e os efeitos ambientais da antropização na comunidade arbustivo-arbórea na Reserva Particular do Patrimônio Natural Estadual Complexo Serra da Farofa (Bloco VI) no município de Rio Rufino, Santa Catarina. O levantamento florístico de espécies de todos os hábitos foi realizado em toda a área em um período de 24 meses (2011/2013) e em parcelas de 60 x 20m que foram instaladas a partir de estradas antigas adentrando ao fragmento florestal. As parcelas foram subdivididas a cada 10m, o que possibilitou medir os gradientes borda (0-30m) e interior (30-60m). Foram avaliadas as variáveis ambientais: temperatura (ºC) e umidade relativa do ar (%), densidade de copas (%), diâmetro a altura do peito (DAP), maior ou igual a 05 cm a 1,30 m de altura, altura total (m) de todos os indivíduos arbóreos vivos, número de indivíduos e identificação das espécies. Os dados foram analisados por meio do teste de Mann-Withney, análise de variância multivariada não-paramétrica (NPMANOVA), escalonamento multidimensional não-métrico (NMDS), em que os vetores das variáveis ambientais significativas (p ≤ 0,01) foram plotados a posteriori, além de análise de espécies indicadoras. Os grupos florístico-estruturais foram particionados em função da maior ou menor antropização. O levantamento florístico realizado registrou 82 famílias, 178 gêneros e 269 espécies. Foram listadas 90 espécies de ervas, 85 de arbóreas, 43 de arbustivas, 22 de epífitas e 29 lianas e/ou trepadeiras. Os dados fitossociológicos da área serviram para demonstrar o perfil estrutural do componente lenhoso, que resultou em 1365 indivíduos pertencentes a 72 espécies, reunidas em 48 gêneros e 27 famílias. A maioria das famílias amostradas (54,84%) é representada por apenas uma espécie o que indica elevada diversidade na área. As espécies com maiores Índices de Valor de Importância (IV) foram Clethra scabra Pers, Sapium glandulosum (L.) Morong, Drimys angustifolia Miers, Lamanonia ternata Vell e Myrceugenia myrcioides (Cambess.) O. Berg.. Os índices de diversidade de Shannon e de Pielou foram 3,11 e 0,73 respectivamente, demonstrando alta diversidade e equidade na distribuição dos indivíduos por espécie. Foram observadas diferenças significativas entre os setores, mas não entre a borda e o interior das parcelas dentro dos setores. Os dados levantados neste estudo indicam um remanescente florestal com presença de espécies endêmicas e ameaçadas de extinção. Devido a grande importância ecológica para a fauna, flora e produção de água na região, este remanescente deve ser considerado uma Área de Alto Valor de Conservação (AAVC) e deve ser protegido e conservado. A heterogeneidade da vegetação observada no ambiente reforça a importância destes locais como ambientes em pleno processo de restauração ambiental e desta forma, locais para conservação in situ de espécies vegetais nativas em ambiente de FOM Altomontana

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-12-02Bitstream added on 2014-06-13T20:28:08Z : No. of bitstreams: 1 silva_sa_me_jabo.pdf: 356551 bytes, checksum: ed430c61f171d6517913b79b49cbb75e (MD5)
Funep
Este estudo objetivou avaliar a estrutura da comunidade arbórea resultante da regeneração de cerrado em um povoamento abandonado de Eucalyptus grandis e a sua similaridade com a vegetação natural adjacente na fazenda Cara Preta, município de Santa Rita do Passa Quatro, SP (21°34' S e 47°34' W), com o uso da fitossociologia. Para isso foi feita a caracterização do estrato arbóreo de cerrado em três trechos (N1, N2 e N3) de regeneração natural em um povoamento de E. grandis abandonado por 17 anos e em três trechos (APP1, APP2 e APP3) de área de preservação permanente ribeirinha. Os dois trechos se localizam em um Neossolo Quartzarênico e estão distantes 200 m um do outro. Foram alocadas 10 parcelas de 10 m x 10 m em cada um dos trechos, onde foram amostrados todos os indivíduos arbóreos com DAP 5,0 cm. Nas comunidades N1, N2 e N3 foram registrados 391 indivíduos arbóreos pertencentes a 41 espécies, distribuídas em 38 gêneros e 17 famílias e nas comunidades APP1, APP2 e APP3 foram registrados 278 indivíduos arbóreos pertencentes a 36 espécies, distribuídos em 35 gêneros e 21 famílias. As duas espécies mais importantes foram Copaifera langsdorffii e Pterodon emarginatus com indivíduos distribuídos em todas as comunidades. O povoamento de E. grandis possibilitou a ocorrência da regeneração natural de espécies do cerrado. A vegetação natural ribeirinha possui cerca de 60% das espécies comuns ao bioma Cerrado e Floresta Tropical Estacional Semidecidual, com características de cerradão. Os valores de diversidade e eqüabilidade de espécies foram maiores nas três comunidades de regeneração em povoamento de eucalipto do que nas comunidades de vegetação natural ribeirinha. A regeneração no povoamento de eucalipto apresentou pequena similaridade com a vegetação natural.
This study aimed evaluate the arboreal community structure from savannah regeneration in an abandoned Eucalyptus grandis population and its similarity with natural vegetation in Cara Preta farm, Santa Rita do Passa Quatro city, SP (21° 34’ S and 47° 34’ W), using phytosociology. To this a characterization of arboreal stratum of savannah was done in three parts (N1, N2, and N3) of natural E. grandis plantation regeneration abandoned for 17 years and in three natural streamlet populations with a permanent preservation function (APP1, APP2 and APP3), located in Quartzpsamment Soil 200 m distance between them. Ten plots of 10 m x 10 m were located in each part. Individual trees having diameter at breast height (DBH) 5 cm were sampled in with plot. In the N1, N2, and N3 populations were registered 391 individuals belonging to 41 species, distributed in 38 genders, and 17 families. In the APP1, APP2, and APP3 populations were registered 278 arboreal individuals belonging to 36 species, distributed in 35 genders and 21 families. Related to de species, the Fabaceae was the richest. Both Copaifera langsdorffii and Pterodon emarginatus were the most important species having individuals distributed in all located plots. The E. grandis population allowed an efficient secondary succession of savannah. The natural vegetation included 60% of the common species of savannah and semidecidual tropical forest. The diversity and equability values of species were higher in the natural regeneration of abandoned E. grandis plantation than in the natural streamlet populations. The E. grandis regeneration presented small similarity with a natural streamlet population.

Orientador: Sérgio Valiengo Valeri
Banca: Rinaldo César de Paula
Banca: Miguel Luiz Menezes Freitas
Resumo: Este estudo objetivou avaliar a estrutura da comunidade arbórea resultante da regeneração de cerrado em um povoamento abandonado de Eucalyptus grandis e a sua similaridade com a vegetação natural adjacente na fazenda Cara Preta, município de Santa Rita do Passa Quatro, SP (21°34' S e 47°34' W), com o uso da fitossociologia. Para isso foi feita a caracterização do estrato arbóreo de cerrado em três trechos (N1, N2 e N3) de regeneração natural em um povoamento de E. grandis abandonado por 17 anos e em três trechos (APP1, APP2 e APP3) de área de preservação permanente ribeirinha. Os dois trechos se localizam em um Neossolo Quartzarênico e estão distantes 200 m um do outro. Foram alocadas 10 parcelas de 10 m x 10 m em cada um dos trechos, onde foram amostrados todos os indivíduos arbóreos com DAP 5,0 cm. Nas comunidades N1, N2 e N3 foram registrados 391 indivíduos arbóreos pertencentes a 41 espécies, distribuídas em 38 gêneros e 17 famílias e nas comunidades APP1, APP2 e APP3 foram registrados 278 indivíduos arbóreos pertencentes a 36 espécies, distribuídos em 35 gêneros e 21 famílias. As duas espécies mais importantes foram Copaifera langsdorffii e Pterodon emarginatus com indivíduos distribuídos em todas as comunidades. O povoamento de E. grandis possibilitou a ocorrência da regeneração natural de espécies do cerrado. A vegetação natural ribeirinha possui cerca de 60% das espécies comuns ao bioma Cerrado e Floresta Tropical Estacional Semidecidual, com características de cerradão. Os valores de diversidade e eqüabilidade de espécies foram maiores nas três comunidades de regeneração em povoamento de eucalipto do que nas comunidades de vegetação natural ribeirinha. A regeneração no povoamento de eucalipto apresentou pequena similaridade com a vegetação natural.
Abstract: This study aimed evaluate the arboreal community structure from savannah regeneration in an abandoned Eucalyptus grandis population and its similarity with natural vegetation in Cara Preta farm, Santa Rita do Passa Quatro city, SP (21° 34' S and 47° 34' W), using phytosociology. To this a characterization of arboreal stratum of savannah was done in three parts (N1, N2, and N3) of natural E. grandis plantation regeneration abandoned for 17 years and in three natural streamlet populations with a permanent preservation function (APP1, APP2 and APP3), located in Quartzpsamment Soil 200 m distance between them. Ten plots of 10 m x 10 m were located in each part. Individual trees having diameter at breast height (DBH) 5 cm were sampled in with plot. In the N1, N2, and N3 populations were registered 391 individuals belonging to 41 species, distributed in 38 genders, and 17 families. In the APP1, APP2, and APP3 populations were registered 278 arboreal individuals belonging to 36 species, distributed in 35 genders and 21 families. Related to de species, the Fabaceae was the richest. Both Copaifera langsdorffii and Pterodon emarginatus were the most important species having individuals distributed in all located plots. The E. grandis population allowed an efficient secondary succession of savannah. The natural vegetation included 60% of the common species of savannah and semidecidual tropical forest. The diversity and equability values of species were higher in the natural regeneration of abandoned E. grandis plantation than in the natural streamlet populations. The E. grandis regeneration presented small similarity with a natural streamlet population.
Mestre

Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense – UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais.
A meso e macrofauna edáfica são responsáveis por um dos processos de ciclagem de nutrientes de maior importância para o equilíbrio do ecossistema terrestre. Uma das principais relações que ocorrem neste ambiente é a interação entre organismos do solo e as plantas, esta última sendo responsável por disponibilizar através das folhas mortas um recurso alimentar, ou servindo de abrigo para a meso e macrofauna edáfica. Na região sul de Santa Catarina, muitas áreas foram exauridas ao máximo com o objetivo de extrair carvão mineral. A legislação brasileira obriga a recuperação dessas áreas mineradas e o monitoramento da fauna e da flora. Neste processo, uma das principais etapas após a recomposição do solo é a introdução de espécies arbóreoarbustivas pioneiras nessas áreas, contudo, estudos relacionados à interação entre as plantas introduzidas e os organismos que se alimentarão das folhas mortas são pouco explorados. Assim sendo, este trabalho teve por objetivo através do uso de litter bags identificar os organismos da meso e macrofauna edáfica que colonizaram duas espécies de plantas arbóreas que foram mais utilizadas na revegetação das áreas de estudo, a Senna multijuga e Schinus terebinthifolius, bem como avaliar a taxa de degradação do folhiço dessas duas espécies vegetais em três áreas com diferentes estádios sucessionais de regeneração nos munícipios de Treviso (A1 e A2) e Lauro Müller (A3), SC. Para os testes foram utilizados um total de 32 litter bags (16 por espécie vegetal) por área de estudo, onde foram divididos em quatro blocos ao longo de um transecto. As amostragens foram realizadas durante 15, 30, 60 e 120 dias, onde um litter bag de cada espécie/bloco foi removido aleatoriamente. A análise do Decaimento Exponencial Simples (DES) com o uso do MLG mostrou que as folhas de S. terebinthifolius apresentou maior tendência de degradação em relação a espécie S. multijuga. A espécie vegetal com maior riqueza da macrofauna edáfica foi S. multijuga, principalmente na A3 nos tempos amostrais mais tardios (60 e 120 dias). A correlação linear simples indicou que a taxa de degradação foliar de S. terebinthifolius foi fortemente associada ao aumento da riqueza de táxons nas três áreas amostradas. A área que obteve a maior riqueza de indivíduos foi a A3, sendo esta a área com o estádio mais avançado de regeneração. A espécie vegetal que teve maior abundância amostrada foi S. multijuga (N = 4.258), e 2.467 indivíduos na S. terebinthifolius. Os organismos que representaram 50% da macrofauna levantada e que estiveram presentes em todas áreas foram Acari, Collembola, Hymenoptera (Formicidae) e Araneae.

Le noyer cendré (Juglans cinerea) a un statut d'espèce en voie de disparition au Canada depuis 2003 dû à la forte mortalité causée par un champignon pathogène, le chancre du noyer cendré (Sirococcus clavigignenti-juglandacearum). Cette étude vise à localiser les peuplements forestiers renfermant des noyers cendrés en forêt privée dans les Cantons-de-l'Est, afin de déterminer si l'espèce se retrouve dans plusieurs types de milieux et de communautés végétales. En deuxième lieu, il s'agit d'évaluer si l'état de santé du noyer diffère dans les types de milieux où il se trouve. La composition végétale (arbres et herbacées) et les facteurs écologiques (édaphiques et caractéristiques de sites) ont été évalués dans 35 parcelles (400 m2) comprenant des noyers, ainsi que dans 55 parcelles sans noyer localisées dans des milieux différents ou similaires aux parcelles comprenant des noyers. Une analyse canonique des correspondances a permis de séparer les peuplements échantillonnés en 4 types de milieux, soit les plaines de débordement, les milieux mésiques riches ayant beaucoup de calcium dans le sol (+Ca), les milieux mésiques riches ayant moins de calcium dans le sol (-Ca) et les milieux mésiques pauvres. L'état de santé des noyers a été évalué (circonférence du tronc affectée et pourcentage de mort en cime). Les noyers sont plus sévèrement affectés par le chancre dans les plaines de débordement (30%) que dans les forêts mésiques (11 %). La mort en cime montre le même patron; dans les plaines de débordement, 24% des noyers présentent une mort en cime élevée (plus de 50% de branches mortes) comparativement à seulement 5% des noyers des forêts feuillues mésiques. D'après ces résultats, d'éventuelles plantations d'enrichissement ou de réintroduction auraient avantage à être réalisées dans les milieux mésiques riches (+Ca), là où la croissance du noyer est comparable à la croissance en plaine de débordement, mais où la maladie y est moins importante. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Juglans cinerea, espèce en voie de disparition, pathogène exotique, plaines de débordement, forêts mésiques riches, forêts privées.

La scoliose idiopathique de l’adolescent (SIA) est une déformation tri-dimensionelle du rachis. Son traitement comprend l’observation, l’utilisation de corsets pour limiter sa progression ou la chirurgie pour corriger la déformation squelettique et cesser sa progression. Le traitement chirurgical reste controversé au niveau des indications, mais aussi de la chirurgie à entreprendre. Malgré la présence de classifications pour guider le traitement de la SIA, une variabilité dans la stratégie opératoire intra et inter-observateur a été décrite dans la littérature. Cette variabilité s’accentue d’autant plus avec l’évolution des techniques chirurgicales et de l’instrumentation disponible. L’avancement de la technologie et son intégration dans le milieu médical a mené à l’utilisation d’algorithmes d’intelligence artificielle informatiques pour aider la classification et l’évaluation tridimensionnelle de la scoliose. Certains algorithmes ont démontré être efficace pour diminuer la variabilité dans la classification de la scoliose et pour guider le traitement. L’objectif général de cette thèse est de développer une application utilisant des outils d’intelligence artificielle pour intégrer les données d’un nouveau patient et les évidences disponibles dans la littérature pour guider le traitement chirurgical de la SIA. Pour cela une revue de la littérature sur les applications existantes dans l’évaluation de la SIA fut entreprise pour rassembler les éléments qui permettraient la mise en place d’une application efficace et acceptée dans le milieu clinique. Cette revue de la littérature nous a permis de réaliser que l’existence de “black box” dans les applications développées est une limitation pour l’intégration clinique ou la justification basée sur les évidence est essentielle. Dans une première étude nous avons développé un arbre décisionnel de classification de la scoliose idiopathique basé sur la classification de Lenke qui est la plus communément utilisée de nos jours mais a été critiquée pour sa complexité et la variabilité inter et intra-observateur. Cet arbre décisionnel a démontré qu’il permet d’augmenter la précision de classification proportionnellement au temps passé à classifier et ce indépendamment du niveau de connaissance sur la SIA. Dans une deuxième étude, un algorithme de stratégies chirurgicales basé sur des règles extraites de la littérature a été développé pour guider les chirurgiens dans la sélection de l’approche et les niveaux de fusion pour la SIA. Lorsque cet algorithme est appliqué à une large base de donnée de 1556 cas de SIA, il est capable de proposer une stratégie opératoire similaire à celle d’un chirurgien expert dans prêt de 70% des cas. Cette étude a confirmé la possibilité d’extraire des stratégies opératoires valides à l’aide d’un arbre décisionnel utilisant des règles extraites de la littérature. Dans une troisième étude, la classification de 1776 patients avec la SIA à l’aide d’une carte de Kohonen, un type de réseaux de neurone a permis de démontrer qu’il existe des scoliose typiques (scoliose à courbes uniques ou double thoracique) pour lesquelles la variabilité dans le traitement chirurgical varie peu des recommandations par la classification de Lenke tandis que les scolioses a courbes multiples ou tangentielles à deux groupes de courbes typiques étaient celles avec le plus de variation dans la stratégie opératoire. Finalement, une plateforme logicielle a été développée intégrant chacune des études ci-dessus. Cette interface logicielle permet l’entrée de données radiologiques pour un patient scoliotique, classifie la SIA à l’aide de l’arbre décisionnel de classification et suggère une approche chirurgicale basée sur l’arbre décisionnel de stratégies opératoires. Une analyse de la correction post-opératoire obtenue démontre une tendance, bien que non-statistiquement significative, à une meilleure balance chez les patients opérés suivant la stratégie recommandée par la plateforme logicielle que ceux aillant un traitement différent. Les études exposées dans cette thèse soulignent que l’utilisation d’algorithmes d’intelligence artificielle dans la classification et l’élaboration de stratégies opératoires de la SIA peuvent être intégrées dans une plateforme logicielle et pourraient assister les chirurgiens dans leur planification préopératoire.
Adolescent idiopathic scoliosis (AIS) is a three-dimensional deformity of the spine. Management of AIS includes conservative treatment with observation, the use of braces to limit its progression or surgery to correct the deformity and cease its progression. Surgical treatment of AIS remains controversial with respect to not only indications but also surgical strategy. Despite the existence of classifications to guide AIS treatment, intra- and inter-observer variability in surgical strategy has been described in the literature. Technological advances and their integration into the medical field have led to the use of artificial intelligence (AI) algorithms to assist with AIS classification and three-dimensional evaluation. With the evolution of surgical techniques and instrumentation, it is probable that the intra- and inter-observer variability could increase. However, some AI algorithms have shown the potential to lower variability in classification and guide treatment. The overall objective of this thesis was to develop software using AI tools that has the capacity to integrate AIS patient data and available evidence from the literature to guide AIS surgical treatment. To do so, a literature review on existing computer applications developed with regards to AIS evaluation and management was undertaken to gather all the elements that would lead to usable software in the clinical setting. This review highlighted the fact that many applications use a non-descript “black box” between input and output, which limits clinical integration where management based on evidence is essential. In the first study, we developed a decision tree to classify AIS based on the Lenke scheme. The Lenke scheme was popular in the past, but has recently been criticized for its complexity leading to intra and inter-observer variability. The resultant decision tree demonstrated an ability to increase classification accuracy in proportion to the time spent classifying. Importantly, this increase in accuracy was independently of previous knowledge about AIS. In the second study, a surgical strategy rule-based algorithm was developed using rules extracted from the literature to guide surgeons in the selection of the approach and levels of fusion for AIS. When this rule-based algorithm was tested against a database of 1,556 AIS cases, it was able to output a surgical strategy similar to the one undertaken by an expert surgeon in 70% of cases. This study confirmed the ability of a rule-based algorithm based on the literature to output valid surgical strategies. In the third study, classification of 1,776 AIS patients was undertaken using Kohonen Self-Organizing-Maps (SOM), which is a kind of neural network that demonstrates there are typical AIS curve types (i.e: single curves and double thoracic curves) for which there is little variability in surgical treatment when compared to the recommendations from the Lenke scheme. Other curve types (i.e: multiple curves or in transition zones between typical curves) have much greater variability in surgical strategy. Finally, a software platform integrating all the above studies was developed. The interface of this software platform allows for: 1) the input of AIS patient radiographic measurements; 2) classification of the curve type using the decision tree; 3) output of surgical strategy options based on rules extracted from the literature. A comparison of surgical correction obtained by patients receiving surgical treatment suggested by the software showed a tendency to obtain better balance -though non-statistically significant - than those who were treated differently from the surgical strategies outputted by the software. Overall, studies from this thesis suggest that the use of AI algorithms in the classification and selection of surgical strategies for AIS can be integrated in a software platform that could assist the surgeon in the planning of appropriate surgical treatment.

Les revues de littérature sont couramment employées en sciences de la santé pour justifier et interpréter les résultats d’un ensemble d’études. Elles permettent également aux chercheurs, praticiens et décideurs de demeurer à jour sur les connaissances. Les revues dites systématiques mixtes produisent un bilan des meilleures études portant sur un même sujet tout en considérant l’ensemble des méthodes de recherche quantitatives et qualitatives. Leur production est ralentie par la prolifération des publications dans les bases de données bibliographiques et la présence accentuée de travaux non scientifiques comme les éditoriaux et les textes d’opinion. Notamment, l’étape d’identification des études pertinentes pour l’élaboration de telles revues s’avère laborieuse et requiert un temps considérable. Traditionnellement, le triage s’effectue en utilisant un ensemble de règles établies manuellement. Dans cette étude, nous explorons la possibilité d’utiliser la classification automatique pour exécuter cette tâche. La famille d’algorithmes ayant été considérée dans le comparatif de ce travail regroupe les arbres de décision, la classification naïve bayésienne, la méthode des k plus proches voisins, les machines à vecteurs de support ainsi que les approches par votes. Différentes méthodes de combinaison de caractéristiques exploitant les termes numériques, les symboles ainsi que les synonymes ont été comparés. La pertinence des concepts issus d’un méta-thésaurus a également été mesurée. En exploitant les résumés et les titres d’approximativement 10 000 références, les forêts d’arbres de décision admettent le plus haut taux de succès (88.76%), suivies par les machines à vecteurs de support (86.94%). L’efficacité de ces approches devance la performance des filtres booléens conçus pour les bases de données bibliographiques. Toutefois, une sélection judicieuse des entrées de la collection d’entraînement est cruciale pour pallier l’instabilité du modèle final et la disparité des méthodologies quantitatives et qualitatives des études scientifiques existantes.
The interest of health researchers and policy-makers in literature reviews has continued to increase over the years. Mixed studies reviews are highly valued since they combine results from the best available studies on various topics while considering quantitative, qualitative and mixed research methods. These reviews can be used for several purposes such as justifying, designing and interpreting results of primary studies. Due to the proliferation of published papers and the growing number of nonempirical works such as editorials and opinion letters, screening records for mixed studies reviews is time consuming. Traditionally, reviewers are required to manually identify potential relevant studies. In order to facilitate this process, a comparison of different automated text classification methods was conducted in order to determine the most effective and robust approach to facilitate systematic mixed studies reviews. The group of algorithms considered in this study combined decision trees, naive Bayes classifiers, k-nearest neighbours, support vector machines and voting approaches. Statistical techniques were applied to assess the relevancy of multiple features according to a predefined dataset. The benefits of feature combination for numerical terms, synonyms and mathematical symbols were also measured. Furthermore, concepts extracted from a metathesaurus were used as additional features in order to improve the training process. Using the titles and abstracts of approximately 10,000 entries, decision trees perform the best with an accuracy of 88.76%, followed by support vector machine (86.94%). The final model based on decision trees relies on linear interpolation and a group of concepts extracted from a metathesaurus. This approach outperforms the mixed filters commonly used with bibliographic databases like MEDLINE. However, references chosen for training must be selected judiciously in order to address the model instability and the disparity of quantitative and qualitative study designs.

Les chutes chez les personnes âgées représentent un problème majeur. Il n’est donc pas étonnant que l’identification des facteurs qui en accroissent le risque ait mobilisé autant d’attention. Les aînés plus fragiles ayant besoin de soutien pour vivre dans la communauté sont néanmoins demeurés le parent pauvre de la recherche, bien que, plus récemment, les autorités québécoises en aient fait une cible d’intervention prioritaire. Les études d’observation prospectives sont particulièrement indiquées pour étudier les facteurs de risque de chutes chez les personnes âgées. Leur identification optimale est cependant compliquée par le fait que l’exposition aux facteurs de risque peut varier au cours du suivi et qu’un même individu peut subir plus d’un événement. Il y a 20 ans, des chercheurs ont tenté de sensibiliser leurs homologues à cet égard, mais leurs efforts sont demeurés vains. On continue aujourd’hui à faire peu de cas de ces considérations, se concentrant sur la proportion des personnes ayant fait une chute ou sur le temps écoulé jusqu’à la première chute. On écarte du coup une quantité importante d’information pertinente. Dans cette thèse, nous examinons les méthodes en usage et nous proposons une extension du modèle de risques de Cox. Nous illustrons cette méthode par une étude des facteurs de risque susceptibles d’être associés à des chutes parmi un groupe de 959 personnes âgées ayant eu recours aux services publics de soutien à domicile. Nous comparons les résultats obtenus avec la méthode de Wei, Lin et Weissfeld à ceux obtenus avec d’autres méthodes, dont la régression logistique conventionnelle, la régression logistique groupée, la régression binomiale négative et la régression d’Andersen et Gill. L’investigation est caractérisée par des prises de mesures répétées des facteurs de risque au domicile des participants et par des relances téléphoniques mensuelles visant à documenter la survenue des chutes. Les facteurs d’exposition étudiés, qu’ils soient fixes ou variables dans le temps, comprennent les caractéristiques sociodémographiques, l’indice de masse corporelle, le risque nutritionnel, la consommation d’alcool, les dangers de l’environnement domiciliaire, la démarche et l’équilibre, et la consommation de médicaments. La quasi-totalité (99,6 %) des usagers présentaient au moins un facteur à haut risque. L’exposition à des risques multiples était répandue, avec une moyenne de 2,7 facteurs à haut risque distincts par participant. Les facteurs statistiquement associés au risque de chutes incluent le sexe masculin, les tranches d’âge inférieures, l’histoire de chutes antérieures, un bas score à l’échelle d’équilibre de Berg, un faible indice de masse corporelle, la consommation de médicaments de type benzodiazépine, le nombre de dangers présents au domicile et le fait de vivre dans une résidence privée pour personnes âgées. Nos résultats révèlent cependant que les méthodes courantes d’analyse des facteurs de risque de chutes – et, dans certains cas, de chutes nécessitant un recours médical – créent des biais appréciables. Les biais pour les mesures d’association considérées proviennent de la manière dont l’exposition et le résultat sont mesurés et définis de même que de la manière dont les méthodes statistiques d’analyse en tiennent compte. Une dernière partie, tout aussi innovante que distincte de par la nature des outils statistiques utilisés, complète l’ouvrage. Nous y identifions des profils d’aînés à risque de devenir des chuteurs récurrents, soit ceux chez qui au moins deux chutes sont survenues dans les six mois suivant leur évaluation initiale. Une analyse par arbre de régression et de classification couplée à une analyse de survie a révélé l’existence de cinq profils distinctifs, dont le risque relatif varie de 0,7 à 5,1. Vivre dans une résidence pour aînés, avoir des antécédents de chutes multiples ou des troubles de l’équilibre et consommer de l’alcool sont les principaux facteurs associés à une probabilité accrue de chuter précocement et de devenir un chuteur récurrent. Qu’il s’agisse d’activité de dépistage des facteurs de risque de chutes ou de la population ciblée, cette thèse s’inscrit dans une perspective de gain de connaissances sur un thème hautement d’actualité en santé publique. Nous encourageons les chercheurs intéressés par l’identification des facteurs de risque de chutes chez les personnes âgées à recourir à la méthode statistique de Wei, Lin et Weissfeld car elle tient compte des expositions variables dans le temps et des événements récurrents. Davantage de recherches seront par ailleurs nécessaires pour déterminer le choix du meilleur test de dépistage pour un facteur de risque donné chez cette clientèle.
Falls in the elderly represent a major problem. It is therefore not surprising that the identification of factors that may increase the risk of falls has received much attention. Frailer seniors who need support to live in the community remained nonetheless poorly documented, although more recently, the Québec authorities have given high priority to interventions that target this population. Risk factors for falls are usually identified by observational prospective studies. Their optimal identification is however complicated by the fact that exposure may vary during the follow-up, and that an individual may experience more than one event. Twenty years ago, some researchers attempted to sensitize their peers in this respect, but their efforts were vain. Researchers continue today to neglect these considerations and to use improper statistical techniques, focusing on the proportion of fallers or the time to first fall. In doing so, we discard a significant amount of relevant information. In this thesis, we review the existing methods and propose a Cox hazards extension. We apply it in the study of potential fall-risk factors associated with 959 community-dwelling seniors using home-care services. Finally, we compare the results of the proposed Wei, Lin, & Weissfeld (WLW) method with those of several other techniques, notably the conventional logistic regression, the pooled logistic regression, the negative binomial regression and the Andersen & Gill regression. At baseline and every six months thereafter, participants were visited at home in order to ascertain information about potential risk factors. Falls were monitored by use of a calendar and monthly phone calls. Baseline exposure variables and updated time-varying exposures include socio-demographic characteristics, BMI, nutritional risk, gait and balance, alcohol consumption, home hazards, and medications. Almost all (99.6%) of participants showed at least one high risk factor. Exposure to multiple risks was frequent, with an average of 2.7 different high-risk factors per participant. The risk factors significantly associated to the risk of falling include male sex, age, history of falling, Berg balance score, BMI, use of benzodiazepines, number of home hazards and residential facility for seniors. Results demonstrate that the usual methods of analyzing risk factors for falling (any sort of fall as well as those leading to medical consultations) are inappropriate, as they produce considerable biases relative to the WLW model using time-dependent covariates. Bias for the considered effect measures comes from the manner in which the observed data (both measured exposures and health outcomes) was measured and defined as well as the way in which the statistical analysis took into account this information. An additional part of the thesis was undertaken to identify risk profiles of subjects regarding the recurrence of falling, defined as participants who reported at least two falls within six months of initial assessment at entry in the study. A classification and regression tree analysis classified the population into five groups differing in risk of recurrent falling, based on history of falls in the three months prior to the initial interview, Berg balance score, type of housing, and usual alcohol consumption in the six months preceding study entry. The relative risks varied from 0.7 to 5.1. A subsequent survival analysis showed that the length of time before becoming a recurrent faller varies among risk profiles. This thesis discusses highly topical subjects about a target population and a fall-risk screening activity which are priorities in the public health sector in Québec. We encourage researchers interested in the identification of risk of falls among the elderly to use the statistical method of Wei, Lin and Weissfeld because it takes into account updated time-varying exposures and multiple events. More research will be necessary to determine the best screening test for a given risk-factor in this setting and population.