Dissertations / Theses: 'Signalisation par les RCPG'

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Rollin, Simon. "Modulation de la signalisation du récepteur du facteur d'activation plaquettaire par SOCS3." Thèse, Université de Sherbrooke, 2009. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4296.

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Abstract:

Le facteur d'activation plaquettaire (PAF) est un puissant médiateur pro-inflammatoire impliqué dans des processus physiologiques et pathologiques.Le PAF exerce ses effets suite à la liaison à son récepteur, le récepteur du PAF (PAFR), qui est un récepteur à sept domaines transmembranaires et couplé aux protéines G (RCPG). La signalisation du PAFR est en partie médiée par les protéines G et implique principalement des sous-unités G[indice inférieur [alpha]i] et G[indice inférieur [alpha]q] dans plusieurs types cellulaires.Le PAFR peut également activer des effecteurs variés : des canaux ioniques, des phospholipases (PLA[indice inférieur 2], PLC, PLD), ainsi que plusieurs kinases (PKC, PI3K et MAPK). Nous avons récemment démontré que le PAFR peut activer de façon indépendante des protéines G la voie des Janus kinase (JAK) et des Signal Transducers and Activators of Transcription (STAT). JAK2, TYK2 et STAT1, 2, 3 et 5 sont ainsi activés dans la lignée cellulaire myéloïde humaine MonoMac1. Les SOCS sont une famille de protéines qui régulent négativement la signalisation des cytokines et qui ont récemment été démontrés comme impliqués dans la signalisation de certains RCPG dont le CXCR4 (récepteur de chimiokine 4 de la famille des C-X-C) et l'AT1 (récepteur de l'angiotensine II). Une stimulation au PAF induit de manière transcriptionnelle l'accumulation de l'ARNm de la protéine suppressors of cytokine signalling 3 (SOCS3) dans les monocytes humains et la lignée cellulaire MonoMac1, mais ne l'induit pas dans les cellules endothéliales de veines de cordons ombilicaux humain (HUVEC). En plus d'une augmentation de l'ARNm de SOCS3, une augmentation de la protéine SOCS3 est également observée suivant une stimulation au PAF. Premièrement, nous voulions déterminer l'importance de SOCS3 dans la signalisation du PAFR à l'aide de différentes lignées cellulaires (HEK293, COS7, MonoMac1) et diverses techniques de biologie cellulaire. Ensuite, nous désirions évaluer l'impact des différents domaines de SOCS3 dans ces fonctions par des approches de biologie moléculaire. Finalement, nous avons évalué le/s rôle/s de SOCS3 sur différents aspects fonctionnels pro-inflammatoires du PAF (Voies signalisation, adhésion cellulaires, etc.). Nous démontrons dans la présente thèse que SOCS3 module la signalisation du PAFR en plus de présenter certains aspects moléculaires entourant la relation entre le PAFR, TYK2 et SOCS3. Les présents travaux démontrent que SOCS3 peut être recruté de façon transitoire à la seconde boucle intracellulaire et la queue cytoplasmique du PAFR. Son domaine kinase inhibitory region (KIR) semble être requis pour le recrutement induit au PAFR, alors que son domaine SOCS box semble être impliqué dans le recrutement basal. Suivant une stimulation au PAF, SOCS3 est phosphorylé sur un/des résidus tyrosine. Cette modification est sous le contrôle essentiel de TYK2, alors que son mutant K930I (kinase inactive) ne le fait pas. SOCS3 joue un rôle très important dans la modulation des voies de signalisation du PAFR ainsi que sur certains effets biologiques de celui-ci. Ces actions se révèlent être également très spécifiques : SOCS3 ne module pas la voie de G[indice inférieur [alpha]q] (IP3 ), mais module la migration et également l'adhésion cellulaire induite par le PAF. SOCS3 ne module pas la phosphorylation des STAT 1, 3 et 5 induite par le PAF, mais module négativement la voie de TYK2 (activation du promoteur du PAFR) et la phosphorylation des STAT 1, 3 et 5 induite par l'OSM. SOCS3 ne module pas la voie des JNK MAPK, prolonge la voie des ERK MAPK et module négativement l'activation précoce de la voie de p38 MAPK. Enfin, SOCS3 joue un rôle de modulation négative dans la transcription induite par le PAF des promoteurs du PAFR, de l'IL-6 et de l'IL-8. En conclusion, cette thèse propose de nouveaux mécanismes par lesquels SOCS3 module certains aspects de la signalisation et effets biologiques du PAF et de son PAFR. Comme le PAF est impliqué dans plusieurs phénomènes à caractères inflammatoires, le travail présenté ici a porté son attention sur plusieurs aspects pro-inflammatoires du PAF plutôt que sur une pathologie en particulier, ce qui permettra de mieux comprendre divers aspects liant le PAFR, la kinase TYK2 et SOCS3.

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Mailhac, Camille. "Développement d’outils pour l'étude de la signalisation médiée par les récepteurs couplés aux protéines G, basés sur l'utilisation d'anticorps à domaine unique de lama." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0405.

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Abstract:

L'objectif principal de ma thèse était de développer de nouvelles technologies et des outils pour l’étude de l’activation des récepteurs couplés aux protéines G (GPCR).À la surface de la cellule se trouve une multitude de récepteurs qui jouent un rôle critique dans la communication cellule-cellule, dont les GPCR, une famille de récepteur utilisant les protéines G intracellulaires pour transmettre leurs signaux. Le ciblage de ces récepteurs à des fins thérapeutique est innovant et très prometteur. Mais à ce jour seuls quelques médicaments ciblant les GPCR ont été mis sur le marché, en partie en raison d'un manque d'outils permettant le suivi de leur action sur les cellules natives.L’objectif de cette thèse est donc de développer des tests simples pour suivre l’activation de n’importe quel GPCR. Pour développer ce type de test, nous avons décidé d'utiliser des fragments d'anticorps appelés nanobodies. Les anticorps sont des protéines du sang produites en réponse à un antigène spécifique qui sont capable de le neutraliser. Les nanobodies correspondent au domaine variable de certains anticorps de camélidés. En raison de leur faible taille (13 kDa) et de leur site de liaison à l'antigène réduit, les nanobodies se lient souvent à des cavités et présentent une grande sensibilité aux changements de conformation de l'antigène The main objective of my thesis was to develop technologies and tools to study activation of G protein-coupled receptors (GPCRs).The cell surface is displaying a multitude of receptors, who play critical roles in cell-cell communication. Among them, GPCRs represent a large family relying on the use of intracellular G proteins for their signaling. Targeting these receptors for therapies is very promising and innovative. So far, only few new drugs have been put on the market, partly due to a lack of tools enabling the follow-up of their action on native cells.The aim of this thesis is thus to develop simple assays to study activation of any GPCRs. To develop this kind of test, we used antibody fragments called nanobodies. Antibodies are blood protein produced in response to and counteracting a specific antigen. Nanobodies correspond to antibody fragments derived from the variable domain of a special class of camelid antibodies. Because of their small size (13 kDa) and reduced antigen binding site, nanobodies often bind cavities and show a high sensitivity to antigen conformational changes

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Carrat, Gaëlle. "La voie de signalisation ERK1/2 couplée au récepteur 5-HT4 et sa régulation par GRK5." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20187/document.

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Abstract:

Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) peuvent activer des voies de signalisation indépendantes des protéines G. Cependant, la régulation de ces voies, et en particulier leur désensibilisation, est peu connue. Le récepteur de la sérotonine de type 4 (R-5-HT4) est un RCPG exprimé dans le cerveau et les organes périphériques. Il est impliqué dans des fonctions physiologiques importantes comme la mémoire, l'apprentissage, la prise de nourriture, le contrôle respiratoire et la mobilité gastro-intestinale. Le R-5-HT4 est couplé à la protéine Gs. De plus, il active la voie Src/ERK1/2, indépendamment des protéines G et des β-arrestines.Nous avons montré que GRK5, physiquement associé à la région C-terminale (C-ter) du R-5-HT4 inhibait la voie Src/ERK1/2 couplée au récepteur, mais pas la voie Gs. Ce résultat a été observé dans la lignée de cellules HEK-293 mais aussi dans des neurones de collicules en culture. Cette inhibition nécessite deux séquences d'évènements : l'association de la β-arrestine1 à une région riche en sérines et thréonines, localisée dans le domaine C-ter du récepteur et la phosphorylation par GRK5, de la β-arrestine1 (en sérine 412) liée au récepteur. La β-arrestine1 phosphorylée empêche l'activation de Src, constitutivement liée au récepteur, nécessaire à l'activation d'ERK1/2. Ceci constitue la première démonstration que la phosphorylation d'une β-arrestine par une GRK régule la signalisation indépendante des protéines G. En plus de ces résultats, nous avons démontré que l'activation d'ERK1/2 par le R-5-HT4, indépendante des β-arrestines, implique la libération d'un ligand induite par une métalloprotéase, conduisant à la transactivation d'un autre récepteur. Par une approche protéomique, nous avons également identifiés plusieurs partenaires potentiels du R-5-HT4. L'étude de ces partenaires pourrait apporter un éclairage supplémentaire sur les voies de signalisation du récepteur et leur régulation G protein-coupled receptors (GPCRs) have been found to trigger G protein-independent signalling. However, the regulation of G protein-independent pathways, especially their desensitization, is poorly characterized.The 5-Hydroxytryptamine 4 receptor (5-HT4R) is a GPCR widely expressed in the brain and at the periphery. It is implicated in important physiological functions such as memory, cognition, feeding, respiratory control and gastrointestinal motility. 5-HT4R couples to the Gs/cAMP/PKA pathway. Moreover, this receptor can activate a Src/ERK pathway independently of both G proteins and β-arrestins.Here, we show that the G protein-independent 5-HT4R-operated Src/ERK pathway, but not the Gs pathway, is inhibited by GPCR kinase 5 (GRK5), physically associated with the proximal region of receptor C-terminus, in both HEK-293 cells and colliculi neurons. This inhibition requires two sequences of events: the association of β-arrestin1 to a phosphorylated serine/threonine cluster located within the receptor C-terminal domain and the phosphorylation by GRK5 of β-arrestin1 (at Ser 412) bound to the receptor. Phosphorylated β-arrestin1 prevents in turn activation of Src constitutively bound to 5-HT4R, a necessary step in receptor-stimulated ERK signalling. This is the first demonstration that β-arrestin phosphorylation by a GRK regulates G protein-independent signalling.In addition to these results, we also demonstrated that the β-arrestin-independent activation of ERK1/2 by the 5-HT4R involves a metalloprotease-dependant ectodomain shedding and transactivation of another receptor. By a proteomic approach, we also identified several potential partners of the 5-HT4R. Study of these proteins may provide a better understanding of 5-HT4R signalling and his regulation

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Cabana, Jérôme. "Étude des déterminants structuraux de l'activation des voies de signalisation de la protéine G[indice inférieur q/11] et des β-arrestines par le récepteur de type 1 à l'angiotensine II". Thèse, Université de Sherbrooke, 2015. http://hdl.handle.net/11143/7706.

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Abstract:

Résumé : La signalisation biaisée représente la capacité des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) d'engager des voies de signalisation distinctes avec des efficacités variables selon le ligand utilisé ou la mutation dans le récepteur. Un meilleur contrôle des voies activées ou inhibées par des médicaments pourrait permettre de réduire leurs effets indésirables. Malheureusement, les mécanismes structuraux impliqués dans la transmission du signal à travers la membrane plasmique par l'entremise des RCPG sont peu connus, ce qui limite le développement rationnel de nouvelles molécules ciblant des voies de signalisation particulières. Le récepteur de type 1 à l'angiotensine II (AT[indice inférieur 1]), un RCPG de classe A prototypique, peut activer différents effecteurs suite à sa stimulation par le ligand endogène angiotensine II (AngII), incluant la protéine G[indice inférieur q/11] et les β-arrestines. Il est suggéré que l'activation de ces deux voies de signalisation peut être associée à des conformations différentes du récepteur AT[indice inférieur 1]. Pour vérifier cette hypothèse, nous avons utilisé des simulations de dynamique moléculaire afin d'explorer les interactions et les mouvements qui définissent le paysage conformationnel du récepteur AT[indice inférieur 1]. De plus, nous avons vérifié comment était modifié le paysage conformationnel par des mutations (N111G, N111W et D74N) et des ligands (AngII et [Sar[indice supérieur 1], Ile[indice supérieur 8]]AngII) ayant des profils signalétiques différents pour la voie de la protéine G[indice inférieur q/11] et la voie des β-arrestines. Les résultats obtenus nous éclairent sur le rôle d'un réseau de ponts hydrogène entre des résidus polaires conservés au coeur du récepteur dont font partie les résidus N111[indice supérieur 3.35] et D74[indice supérieur 2.50]. Les résultats révèlent la présence d'un groupe de résidus hydrophobes juste au-dessus du réseau de ponts hydrogène et adjacent à la pochette de liaison du récepteur qui semble important pour la stabilisation de l'état inactif du récepteur ainsi que pour son activation par un ligand. Dans l'ensemble, les résultats suggèrent que l'activation de la voie de la protéine G[indice inférieur q/11] est associée avec une transition conformationnelle spécifique stabilisée par l'agoniste alors que l'activation de la voie des β-arrestines est associée à une stabilisation de l'état de repos du récepteur. Abstract: Biased signaling represents the ability of G protein-coupled receptors to engage distinct pathways with various efficacies depending on the ligand used or on mutations in the receptor. Having better control over the signaling pathways activated or inhibited by drugs could lead to fewer undesirable effects. Unfortunately, the structural mechanisms involved in the transmission of signal across the cell membrane through the receptors are poorly understood, which limits the rational development of new molecules targetting specific signaling pathways. The angiotensin-II type 1 (AT[subscript 1]) receptor, a prototypical class A G protein-coupled receptor, can activate various effectors upon stimulation with the endogenous ligand angiotensin-II (AngII), including the G[subscript q/11] protein and β-arrestins. It is believed that the activation of those two pathways can be associated with distinct conformations of the AT[subscript 1] receptor. To verify this hypothesis, microseconds of molecular dynamics simulations were computed to explore interactions and movements that define the conformational landscape of the AT[subscript 1] receptor. We have also verified how this conformational landscape is modified by mutations (N111G, N111W, D74N) and ligands (AngII, [Sar[superscript 1]Ile[superscript 8]]AngII) that have different signaling properties on the G[subscript q/11] pathway and the β-arrestin pathway. The results provide a better understanding of the role of a hydrogen bond network formed of conserved polar residues in the receptor core which include residues N111[superscript 3.35] and D74[superscript 2.50]. The results also reveal the existence of a cluster of hydrophobic residues located right above the hydrogen bonds network and adjacent to the binding pocket that appears important for the stabilization of the ground state of the receptor as well as its ligand-induced activation. As a whole, the results suggest that activation of the G[supbscript q/11] pathway is associated with a specific conformational transition stabilized by the agonist, whereas the activation of the β-arrestin pathway is linked to the stabilization of the ground state of the receptor.

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Duchene, Johan. "Le récepteur B2 de la bradykinine : exemple d'un RCPG utilisant de nouvelles voies de signalisation dites alternatives." Toulouse 3, 2003. http://www.theses.fr/2003TOU30143.

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Hyvert, Yann. "Signalisation par les récepteurs Toll chez la Drosophile." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2007. http://www.theses.fr/2007STR13184.

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Abstract:

Les TLR de mammifère jouent un rôle dans la défense immunitaire en activant et régulant la réponse immunitaire. Chez la drosophile, Toll est le seul membre de la famille de 9 récepteurs Toll qui a été caractérisé comme un récepteur qui régule la réponse immunitaire de la drosophile suite à une infection fongique ou par les bactéries à Gram-positif. Peu de choses étaient connues sur les autres récepteurs de la famille : 18W à Toll-9. Ce travail de thèse a porté sur quatre aspects de l’immunobiologie de ces récepteurs. Il a été montré que le prodomaine de Spätzle joue un rôle important dans l’activation du récepteur Toll. L’étude du récepteur Toll-5 indique qu’il n’est pas un co-récepteur de Toll et Toll-9. On a également caractérisé un nouvel adaptateur de la voie Toll, Weckle. Toll-9 présente des similarités de séquence avec les TLR de mammifère qui a un rôle dans la défense épithéliale de l’intestin. Enfin on a tenté de caractériser les voies signalisation activées par 18W et Toll-8 Mammalian TLRs play an important role in the immune defence by activating and regulating the immune response. In Drosophila, Toll is the only member of the Toll receptors family, which has been characterized as a regulator of the immune response in Drosophila after infection by fungi or Gram-positive bacteria. For the other members 18W to Toll-9 little is known about their function. This work presents four aspects of the immunobioloy of those receptors. It as been shown that the prodomain of the cytokine Spätzle has an important and unexpective role in the activation of the Toll receptor. The study of Toll-5 shows that it does not interact with Toll or with Toll-9. The work on the characterization of Weckle, a new component of the Toll pathway, is presented. Toll-9 presents sequence similarities with the mammalian TLRs. It has been shown that it plays a role in the epithelial defence of the midgut. The study of the signalling pathways activated by 18W and Toll-8 is also described

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Perkovska, Sanja. "Mécanismes moléculaires de la signalisation et du trafic des récepteurs V1b et V2 de la vasopressine." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20022.

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Abstract:

Mécanismes moléculaires de la signalisation et du trafic des récepteurs V1b et V2 de la vasopressine L'arginine-vasopressine (AVP) est une hormone neurohypophysaire induisant la libération d'ACTH des cellules corticotropes pituitaires et un effet rénal antidiurétique via respectivement les récepteurs V1b et V2 (V1bR et V2R). Peu de choses sont connues concernant les mécanismes moléculaires de la signalisation et du trafic du V1bR. Parallèlement, le fonctionnement du V2R est bien mieux décrit. Cependant, d'un point de vue physiopathologique, la plupart des mutations naturelles du V2R conduisent à la rétention intracellulaire du récepteur qui devient incapable d'interagir avec l'AVP et promouvoir la réabsorption d'eau. Cette rétention conduit à une maladie rénale, le diabète insipide néphrogénique congénital (DINc). De nouvelles stratégies thérapeutiques focalisées sur le trafic des récepteurs séquestrés doivent donc être développées. Dans une partie plus fondamentale, nous avons étudié les mécanismes moléculaires impliqués dans la signalisation et le trafic du récepteur V1b tels qu'internalisation, recyclage et désensibilisation. Nous avons démontré en utilisant des cellules KO pour les arrestines, qu'après activation par l'AVP, V1bR internalise fortement dans la cellule par un mécanisme arrestine-dépendant. En utilisant une approche biophysique de BRET, nous avons corroboré ces résultats par la visualisation d'une interaction directe récepteur-arrestine AVP-dépendante impliquant principalement la partie C-terminale du récepteur. Les substitutions des sérines 368, 371, 373, 374 de l'extrêmité C-terminale en alanines (sites putatifs pour GRK) n'affectent pas les processi d'internalization/recyclage du V1b-R, ni son interaction avec l'arrestine. Des chimères V1bR-V2R formées par échange de leurs séquences C-terminales nous ont permis de corréler une interaction faible et transitoire du V1bR et de l'arrestine avec son recyclage rapide (récepteur de classe A), ainsi qu'une interaction forte et prolongée du V2R avec l'arrestine et son recyclage lent (récepteur de classe B). Contrairement au phénomène d'internalisation, le processus de désensibilisation ne semble pas impliquer la partie C-terminale du récepteur V1b, ni la proline 9 de la boucle i2 du récepteur car des modifications de ces 2 domaines n'affectent pas ce processus. De plus, la désensibilisation peut se produire en l'absence d'internalisation. La désensibilisation et l'internalisation du récepteur V1b semblent constituer deux phénomènes indépendants. Nous avons aussi démontré que le V1bR pouvait former non seulement des homodimères mais aussi des hétérodimères avec V2R. Dans l'hétérodimère, l'AVP et l'agoniste sélectif du V1bR humain d[Cha4]AVP produisent des effets différents vis-à-vis de l'interaction récepteur-arrestine et d'une augmentation de calcium, nous conduisant à déduire que la voie Ca2+ nécessiterait l'activation d'un seul protomère alors que le recrutement de l'arrestine nécessiterait l'activation des deux. De plus, V1bR interagit non seulement avec Gq mais aussi avec Gs, selon la nature du ligand et de la localisation du récepteur dans des compartiments spécialisés de la membrane plasmique. En vue d'une application thérapeutique potentielle pour le DINc, nous avons pu développer et caractériser de nouveaux agonistes pharmacochaperones capables de rapatrier et activer certains mutants DINc du V2R. De plus, ces agonistes de la voie Gs sont des ligands biaisés puisqu'ils sont antagonistes de la voie arrestine. Ces nouvelles pharmacochaperones agonistes biaisées permettant une durée d'action potentielle plus longue, offrent de nouvelles perspectives pour les patients atteints de DINc Molecular mechanisms of trafficking and signalling of V1b and V2 vasopressin receptors Arginine-vasopressin (AVP) is a neurohypophysial hormone inducing ACTH release from corticotroph cells in the pituitary and antidiuretic effect in the kidney via the V1b and V2 receptors (V1bR and V2R), respectively. Little is known on molecular mechanisms mediating V1bR trafficking and signalling. In parallel, much more information is available about V2R functioning. Nevertheless, from a pathophysiological point of view, most of the natural V2R mutations lead to intracellular retention of the receptor which is unable to interact with AVP and promote water reabsorption, leading to the congenital nephrogenic diabetes insipidus (cNDI) renal disease. New therapeutic strategies focused on trafficking of the sequestered mutants must be developed. In a more fundamental part, we studied the molecular mechanisms implicated in the signalling and trafficking of the V1bR such as internalization, recycling and desensitization. We demonstrated using arrestin KO cells that under AVP stimulation, V1bR strongly internalizes into the cells by an arrestin-dependent mechanism. Using BRET biophysical approach, we corroborated these results by demonstrating a specific AVP-induced direct V1bR-arrestin interaction which involves principally the V1bR C-terminus. Alanine substitutions of the C-terminal serines 368, 371, 373, 374 corresponding to putative GRK sites, did not affect the internalization/recycling processes of V1bR nor its interaction with arrestin. Chimeric V1b-V2 receptors for which the C-termini have been exchanged, allowed us to correlate a weak, transient interaction with arrestin to the rapid recycling of V1bR (class A receptors), and a strong, long-lasting arrestin interaction with the slow recycling of V2R (class B receptors). On the contrary, nor the C-terminal part of V1bR, neither proline 9 in i2 loop were involved in desensitization since modifications in these two domains did not affect this process. Moreover, desensitization occurs in the absence of internalization. V1bR internalization and desensitization constitute two independent processes. Subsequently, we demonstrated that V1bR is able to form not only homodimers but also heterodimers with V2R. Upon binding to the heterodimer, AVP and the selective hV1bR agonist d[Cha4]AVP have different outcomes on receptor-arrestin interaction and Ca2+ release, suggesting that V1bR-induced Ca2+ increase could need only one activated protomer whereas arrestin recruitment would need two. Moreover, V1bR was shown to signal through Gq and interestingly also through Gs protein, depending on the nature of the ligand and on the receptor localization within specialized compartments of the plasma membrane. Having in mind a potential therapeutic application for cNDI, we were able to develop and characterize new agonist pharmacochaperones able to rescue and activate a set of cNDI mutants of the V2R. Moreover, we demonstrated their biased character, consisting in arrestin-related antagonistic properties. These biased pharmacochaperones ligands having a potential long-lasting antidiuretic effect, offer new perspectives for cNDI patients

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Ferry, Xavier. "Signalisation de l'activation des mastocytes par les sécrétagogues basiques." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2002. http://www.theses.fr/2002STR13111.

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Yazbeck, Nathalie. "Contrôle de l’immunité antitumorale par la signalisation de SQSTM1." Thesis, Université Côte d'Azur (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018AZUR4072.

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Abstract:

La dernière décennie a connu une révolution dans le traitement du cancer en s'éloignant des médicaments conventionnels qui ciblent directement la tumeur (comme les chimiothérapies et les thérapies moléculaires ciblées) au profit des immunothérapies, et en particulier les inhibiteurs des "checkpoint" immunitaires. Ces immunothérapies libèrent sélectivement le système immunitaire de l'hôte contre la tumeur et ont démontré une rémission durable sans précédent chez des patients atteints de cancers que l'on croyait incurables, comme le mélanome métastatique, le carcinome rénal métastatique et les stades avancés du cancer du poumon non à petites cellules. Cependant, plus de la moitié des patients ne répondent pas à ces traitements, et sont donc contraints à recevoir d’autres traitements potentiellement toxiques et coûteux. Face aux résultats prometteurs des immunothérapies anti‐PD1/PD‐L1, la recherche de nouvelles cibles/marqueurs moléculaires permettant d'améliorer l'efficacité et de permettre un traitement personnalisé s'est intensifiée. Nos travaux portent sur l’étude de la protéine Sequestosome 1 (SQSTM1/p62) qui est un substrat de l'autophagie sélective et une plateforme de signalisation impliquée dans l’agressivité tumorale. Nous mettons en évidence l’implication de SQSTM1/p62 dans l'inflammation tumorale et dans l’évasion immunitaire et ceci grâce à la stabilisation du messager de PD‐L1. Nous observons que la surexpression tumorale de SQSTM1/p62 caractérise les tumeurs infiltrées et immunosuppressives qui répondent le mieux aux anti‐PD1/PD‐L1. Ainsi, nous proposons SQSTM1/p62 en tant que biomarqueur potentiel et cible thérapeutique pour améliorer la stratification des patients susceptibles de répondre aux immunothérapies The past decade has witnessed a new revolution in cancer treatment by shifting away from the conventional drugs that directly target the tumor (such as chemotherapies and molecular targeted therapies) towards immune‐based therapies, and in particular the so‐called immune checkpoint inhibitors. These immunotherapies selectively release the host immune system against the tumor and have shown unprecedented durable remission for patients with cancers that were thought incurable such as metastatic melanoma, metastatic renal cell carcinoma and late stages of non‐small cell lung cancer. However, more than half of the patients fail to respond to these treatments and are therefore forced to receive other potentially toxic and costly treatments. In this era of promising anti‐PD1/PD‐L1 immunotherapies, the quest for reliable molecular markers/therapeutic targets that would enhance the effectiveness and allow a personalized adaptation of the treatments has intensified. In our work we focus on the scaffold protein and autophagy adaptor Sequestosome 1 (SQSTM1/p62), and we show that it is required for tumor inflammation and immune evasion. We find that SQSTM1/p62 tumor overexpression characterizes infiltrated and immunosuppressive tumors and predicts for response to anti‐PD1/PD‐L1 therapies. Thus, we propose SQSTM1/p62 as a potential biomarker and a therapeutic target to improve the stratification of patients to immunotherapies

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Quintin, Justine. "Organisation de la chromatine et signalisation par les oestrogènes." Thesis, Rennes 1, 2013. http://www.theses.fr/2013REN1S074/document.

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En réponse à son environnement composé de signaux endogènes et exogènes, une cellule doit pouvoir adapter son transcriptome, et cela à travers une modulation fine de l'expression de ses gènes. Les mécanismes permettant une telle adaptation reposent sur de multiples paramètres, entre autre l'organisation du génome, que ce soit au niveau de sa séquence primaire ou de son organisation au sein de la chromatine qui est un support pour l'intégration de nombreuses informations (structurelles et épigénétiques). De plus, l'organisation tridimensionnelle du noyau cellulaire apporte des contraintes physiques et fonctionnelles qui contribuent également à ces régulations. Afin de comprendre comment toutes ces informations peuvent être intégrées lorsqu'un signal régule la transcription d'un ensemble de gènes colinéaires («cluster» de gènes), nos études se sont focalisées sur la description et dissection des mécanismes impliqués dans la régulation coordonnées de gènes œstrogéno-dépendant par le récepteur aux œstrogènes (ER) et ses facteurs pionniers (FOXA1, FOXA2 et GATAs) dans des cellules cancéreuses d'origine mammaire. Dans ce cadre, nous nous sommes plus particulièrement intéressés au cluster TFF, situé sur le bras long du chromosome 21, incluant le gène modèle TFF1, en utilisant des techniques d'analyse à grande échelle (ChIP-chip, ChIP-seq, 4C et analyses transcriptomiques) A given cell has to be able to adapt its fate and homeostasis in response to endogenous and exogenous signals. This adaptation occurs through finely tuned regulations of genes' expressions leading to the variation of their transcriptomes. Multiple parameters have to be integrated in order to provide such mechanisms of regulation. First, the primary sequence of the genome and its organization into chromatin are major regulatory components that harbor genetic, structural and epigenetic information. Second, the three-dimensional organization of the genome into the nucleus brings both physical and functional constraints that also contribute towards these regulatory processes. Here, we engaged a work aiming to understand and dissect how these several levels of information are integrated during the transcriptional regulation of colinear genes (cluster of genes) by the same signal. We took as a model the coordinated regulation of the estrogen-sensitive TFF cluster driven by the estrogen receptor (ER) and its pioneering factors (FOXA1, FOXA2 and GATAs) in mammary cancer cells. This cluster is located within the long arm of the chromosome 21, and contains the gene model termed TFF1. We used large-scale methods (ChIP-chip, ChIP-seq, 4C and microarray transcriptomic analyses) to decipher these dynamic mechanisms

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Quoyer, Julie. "Identification de nouvelles cibles thérapeutiques pour préserver la masse fonctionnelle des cellules bêta pancréatiques au cours du diabète de type 2." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20141.

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Abstract:

Les cellules β pancréatiques synthétisent et sécrètent l'insuline, unique hormone hypoglycémiante de l'organisme. Ces cellules jouent donc un rôle central dans l'apparition du diabète. Aussi, préserver leur masse fonctionnelle est essentiel. Les Récepteurs Couplés aux Protéines G (RCPG) du Glucagon Like Peptide-1 (GLP-1) ou du Pituitary Adenylate Cyclase Activating Polypeptide (PACAP) sont considérés comme des cibles thérapeutiques potentielles car ils régulent la fonction et la survie des cellules β. La dissection des mécanismes moléculaires liant ces récepteurs à leurs effets biologiques est de grande importance. Nous avons montré que le PACAP et le GLP-1 activaient les ERK1/2 (Extracellular signal-Regulated protein Kinases 1/2), cruciales pour la fonction et la survie, de manière dépendante de l'AMPc/PKA et de la β-arrestine 1 (β-arr 1), une protéine d'échafaudage moléculaire. Le PACAP seul induit l'activation rapide et transitoire des kinases via la voie AMPc/PKA et la protéine c-Src. En revanche, il potentialise l'activation des ERK1/2 induite par le glucose à long terme de manière dépendante de la β-arr 1, augmentant alors l'expression de la protéine IRS-2 (Insulin Receptor Substrate-2), connue pour réguler la masse cellulaire. Le GLP-1 active les ERK1/2 de manière bimodale. Leur activation à long terme, strictement dépendante de la β-arr 1, induit la phosphorylation et l'inactivation de la protéine pro-apoptotique Bad, médiant alors les effets anti-apoptotiques de l'hormone. Ces voies de signalisation, dépendantes de la β-arr 1, constituent une cible thérapeutique potentielle susceptible de réguler la masse fonctionnelle des cellules β

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Cartier, Andréane. "Étude du rôle de WDR36 dans la signalisation de l'isoforme bêta du récepteur du thromboxane A[indice inférieur 2] (TPß)." Thèse, Université de Sherbrooke, 2014. http://hdl.handle.net/11143/6661.

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Abstract:

Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPGs) forment la plus grande famille de récepteurs membranaires. Ils transmettent vers l’intérieur de la cellule des signaux extracellulaires d’une grande diversité physiologique. Les différentes classes de RCPGs induisent l'activation de nombreuses voies de signalisation par une multitude de seconds messagers. Le type cellulaire, le contexte du stimulus ainsi que les complexes multiprotéiques recrutés à la membrane plasmique influencent le niveau de spécialisation du signal induit. Le récepteur du thromboxane A? (TP) est exprimé sous deux isoformes, issues d’un épissage alternatif. Les deux isoformes étant régulées différemment au niveau de la signalisation et de la désensibilisation. Dans ce contexte, il est important d’étudier les protéines qui interagissent spécifiquement avec l’une ou l’autre de ces isoformes. Un criblage par double-hybride chez la levure a permis d’identifier une nouvelle protéine d'interaction pour l’isoforme ß de TP (TPß), WDR36 (WD repeat protein 36), une protéine dont la fonction est inconnue. Dans une première étude, nous démontrons que WDR36 interagit directement avec TPß, et que cette interaction est modulée en cellule par la stimulation du récepteur. TP? active la production d’inositol phosphate, qui est augmentée par WDR36. Cette régulation est supportée par l’interaction de WDR36 avec deux effecteurs de la signalisation de TPß, soit G?q et PLCß2. La présence de WDR36 accentue l’interaction entre G?q et PLCß2, et l’interaction entre WDR36 et PLCß2 est modulée par la stimulation de TPß. L'étude des différents mutants de WDR36 associés au glaucome montre qu’ils affectent différemment la production d'inositol triphosphate induite par TPß, comparativement à la protéine de type sauvage. Finalement, nous illustrons que WDR36 induit une activation accrue de ERK1/2 suite à la stimulation de TPß. Ces résultats suggèrent que WDR36 agit à titre de protéine d’échafaudage, servant à favoriser la signalisation de TPß en rapprochant dans un complexe multi-protéique le récepteur TPß et ses effecteurs G?q et PLCß2. Pour faire suite à cette étude, nous avons investigué le rôle de WDR36 dans l'activation de la voie des MAPKs produite par l'activation de TPß. Nous démontrons que WDR36 augmente l’activation de ERK1/2, mais pas de p38 ou JNK. L’activation progresse via la cascade PLCß-PKC-c-Raf-MEK1/2-ERK1/2. L’interaction entre WDR36 et les membres de cette cascade est présente de façon basale et est modulée par la stimulation de TPß. L’expression de WDR36 semble également être importante pour l’interaction c-Raf-ERK1/2 et MEK1/2-ERK1/2. Ces résultats suggèrent que WDR36 assemble un complexe multi-protéique facilitant la phosphorylation et l’activation de ERK1/2. Cette phosphorylation accrue se traduit par une augmentation de la translocation nucléaire de ERK1/2 activées, de la production de c-Fos et de la prolifération cellulaire. Finalement, l’effet positif de WDR36 sur l’activation de ERK1/2 peut également être observé suite à une stimulation des cellules avec des facteurs de croissance retrouvés dans le sérum. Ces deux études supportent un modèle dans lequel WDR36 agit à titre de protéine d'échafaudage dans la signalisation du récepteur TPß en rapprochant ce dernier de ses effecteurs G?q et PLCß2, et en réunissant les membres de la voie d'activation de ERK1/2. Cette caractérisation des rôles de WDR36 est d’autant plus importante, puisque différents variants de WDR36 sont maintenant associés à différents cancers. À cet égard, WDR36 pourrait représenter une nouvelle cible thérapeutique dans la recherche sur le cancer. [symboles non conformes]

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Taboubi, Salma. "Régulation de la migration des kératinocytes par la signalisation purinergique." Aix-Marseille 1, 2009. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2009AIX11007.pdf.

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Abstract:

L’épiderme est un tissu stratifié, majoritairement constitué de kératinocytes et constitue la première barrière de l’organisme contre les agressions extérieures. En cas de blessure cutanée, plusieurs des voies de signalisations sont déclenchées dans le but de rétablir l’homéostasie de l’épiderme. Parmi ces différentes voies de signalisation intervenant dans le contrôle de l’homéostasie de l’épiderme, la voie des PI3K occupe une place de choix en régulant la migration et la prolifération des kératinocytes. Dans ce travail de thèse, nous avons examiné la régulation des PI3K par les nucléotides extracellulaires, agissant via les récepteurs purinergiques. Nous avons pu montré que l’activation de la signalisation purinergique inhibe l’isoforme p110α de la PI3K, ce qui a pour effet d’affecter la morphologie et diminuer la vitesse de migration des kératinocytes. La découverte de cette nouvelle voie de signalisation permettra de mieux comprendre la migration des kératinocytes, un phénomène important dans le physiologie cutanée.

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Larochelle, Antoine. "Signalisation par les récepteurs toll-like dans un contexte d'excitotoxicité." Master's thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25218.

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Abstract:

L’excitotoxicité est un processus pathologique responsable de la mort neuronale dans plusieurs désordres neurologiques. La mort des neurones par excitotoxicité libère dans le milieu extracellulaire des molécules capables d’activer les microglies adjacentes aux sites lésés. L’activation du système immunitaire suite à une blessure cérébrale est généralement vue comme nocive pour les neurones. Les récepteurs toll-like (TLR) font partie des principaux récepteurs responsables de la reconnaissance des dommages cérébraux après une lésion excitotoxique. Les résultats de ce mémoire démontrent qu’un préconditionnement induit par l’injection systémique d’un ligand TLR2 ou TLR4 permet d’augmenter la survie neuronale face à une lésion excitotoxique. La neuroprotection est dépendante de la signalisation MyD88 et est associée avec une activation microgliale bénéfique. Des souris chimériques pour les cellules de la moelle osseuse ont révélé que la signalisation MyD88 au niveau des cellules résidentes du système nerveux central joue un rôle favorable dans la survie neuronale contre l’excitotoxicité. Excitotoxicity is a pathological process responsible for the death of neurons as observed in multiple neurological disorders. This process releases danger signals in the extracellular space that alert and activate surrounding microglial cells. Immune system activation following acute brain injury is often considered detrimental, contributing to further neuronal damage. Toll-like receptors (TLR) are among the main receptors that recognize cell damage and initiate an inflammatory response following cell damage. The study presented in this report shows that a systemic injection of a TLR2 or TLR4 agonist induces a state of preconditioning that increases neuron survival against acute excitotoxicity. The neuroprotective effects are associated with a beneficial activation of microglial cells and depend upon MyD88 signaling. Furthermore, bone marrow chimeric mice revealed that MyD88 signaling in cells of the central nervous system has a protective effect against excitotoxicity.

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Zanin, Natacha. "Role de STAM dans la régulation endosomale de la signalisation JAK/STAT induite par les IFNs." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS047.

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Abstract:

La première implication des récepteurs aux interférons de type 1 (IFNAR1) dans le contrôle de la voie Jak/STAT induite par les IFNs a été établie par mon laboratoire il y a une dizaine d'années (Marchetti et al., 2006). Une des questions fondamentales était alors de déterminer comment et pourquoi l'endocytose des IFNARs pouvait contrôler la voie Jak/STAT. Deux acteurs clés du tri endosomal ont attiré notre attention : Hrs (Hepatocyte growth factor-Regulated tyrosine kinase Substrate) et STAM (Signal Transducing Adaptor Molecule). Ces deux protéines constituent le complexe ESCRT-0 (Endosomal Sorting Complexes Required for Transport-0) les localisant, de manière idéale, à l'interface entre signalisation cellulaire et trafic membranaire.La combinaison de la biologie moléculaire et cellulaire, de la biochimie et de la microscopie à fluorescence, nous a permis d'établir que STAM s'associe au complexe IFNAR1 à la membrane plasmique afin d'y exercer son effet inhibiteur sur la signalisation Jak/STAT. Cette inhibition est levée lorsqu'IFNAR est libéré dans l'endosome et qu'il peut ainsi être recruté par Hrs sous la dépendance de l'IFN-α. En nous basant sur des expériences de déplétion par shRNA ou d'inhibition pharmacologique, nous avons identifié PTP1B (Protein Tyrosine Phosphatase 1B) en tant qu'activateur de la voie Jak/STAT induite par les IFNs. Le blocage sélectif de l'endocytose d'IFNAR par déplétion de clathrin, nous a permis de montrer que l'activation de PTP1B est inhibée à la membrane plasmique. Cela a été confirmé par des expériences d'interaction protéine-protéine (Proximity Ligation Assay) indiquant que STAM est constitutivement associé à IFNAR1, tandis que l'interaction entre IFNAR1 et Hrs a seulement lieu à l'endosome.Ainsi, nos résultats permettent d'établir un modèle dans lequel, à la membrane plasmique, STAM est un frein permanent à la signalisation Jak/STAT, qui est levé après l'endocytose d'IFNAR et sa libération dans l'endosome de tri. De plus, nous avons montré que l'interaction Hrs/STAM dans l'endosome précoce permet de différencier, de manière sélective, l'activation de la signalisation Jak/STAT médiée par l'IFN-α ou l'IFN-β A decade ago, my laboratory established the first role of type I IFNs receptor (IFNAR) endocytosis in the control of Jak/STAT signaling induced by type 1 IFNs (Marchetti et al., 2006). A salient question is now to elucidate why and how IFNAR endocytosis could control the Jak/STAT pathway. Two key players of endosomal sorting retained our interest: Hrs (Hepatocyte growth factor-Regulated tyrosine kinase Substrate) and STAM (Signal Transducing Adaptor Molecule). These two classical components of the ESCRT-0 (Endosomal Sorting Complexes Required for Transport-0) complex were ideally placed at the interface between signaling and membrane trafficking. By using a combination of molecular and cellular biology, biochemistry, and fluorescent microscopy, we could establish that STAM binds to the IFNAR complex at the plasma membrane to exert an inhibitory effect on Jak/STAT signaling. This inhibition is removed when IFNAR is delivered to the sorting endosome by interacting with Hrs upon IFN-α stimulation. Based on shRNA down-expression and pharmacological inhibition, we further involve the PTP1B (Protein Tyrosine Phosphatase 1B) as it activates Jak/STAT signaling upon IFN stimulation. We could also show that PTP1B activation is inhibited by STAM at the plasma membrane from experiments where IFNAR endocytosis was blocked by siRNA-mediated clathrin down-expression. This was further confirmed by protein-protein interaction experiments (Proximity Ligation Assay) showing that STAM was constitutively associated with IFNAR1, whereas the interaction between IFNAR1 and Hrs occured only at the sorting endosome. Our results therefore allow to draw a model where STAM is a constitutive handbrake on Jak/STAT signaling at the plasma membrane that is released after IFNAR endocytosis and delivery to the sorting endosome. We further show that Hrs/STAM interaction at the early endosome allows to selectively distinguish the activation of Jak/STAT signaling mediated by IFN-α or IFN-β

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Séror, Claire. "Etude des voies de signalisation induites par l'enveloppe du VIH-1." Paris 11, 2010. http://www.theses.fr/2010PA11T028.

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Faisy, Christophe. "Hyperréactivité bronchique provoquée par les β2-agonistes : mécanismes de signalisation intracellulaire". Paris 5, 2005. http://www.theses.fr/2005PA05S006.

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Abstract:

Ce travail montre qu'une incubation prolongée des bronches humaines isolées en présence de fénotérol à dose pharmacologique induit une hyperréactivité bronchique à l'endotheline-1. Ce phénomène intéresse trois éléments clés de l'hyperréactivité bronchique : la cellule musculaire lisse, les fibres neurosensorielles et la cellule épithéliale. Nous avons mis en évidence, en utilisant des techniques d'immuno-histochimie et de biologie moléculaire, que l'exposition prolongée au fénotérol induit la synthèse des récepteurs de l'endothéline-1 et celle de leur ARN méssager au niveau de l'épithélium du tonus musculaire bronchique. Nous avons également montré que l'hyperréactivité dépend d'une cascade d'évènements intracellulaires impliquant la stimulation des récepteurs vanilloïdes présents sur les fibres neurosensorielles ainsi que l'activation du NF-kB, du système des MAP-kinases et des protéines kinases C Our result show that chronic fenoterol exposure induces hyperresponsiveness top endothelin-1 in human isolated bronchi. This effect involves three crucial factors implied in airways responsiveness : the epithelial cells, the sensory nerves, and the airway smooth muscle cells. Our immunohistochemical and biomolecular findings reveal that fenoterol-induced sensitisation of human isolated bronchi involves epithelial endothelin-1 receptors synthesis, which suggests perturbation of the epithelial regulation of airway smooth muscle contraction in response to endothelin-1. In addition, we highlighted the intracellular signalling pathways implied in fenoterol-sensitisation including sensory nerves by vanniloid receptors stimulation, and NF-kB, MAP-Kinases and protein kinases C activation

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PELICANO, LUIS. "Modulation de la voie de signalisation des interferons par l'acide retinoique." Paris 6, 1998. http://www.theses.fr/1998PA066278.

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Abstract:

Les ifn, essentiellement connus pour leur activite antivirale, possedent egalement des effets antiproliferatifs, immunoregulateurs et differenciants dont les proprietes ont ete utilisees dans le traitement de la tricholeucocytose. L'acide retinoique (atra) est utilise dans l'induction de remissions chez des patients atteints de leucemie aigue promyelocytaire (lam3) et pour l'acne grave. Ces donnees ont conduit a tester l'effet de la combinaison des deux sur differentes lignees cellulaires. Les effets biologiques observes lors d'un traitement combine ont ete superieurs par rapport aux monotraitements dans des lignees d'origine diverse (myeloide, renale, uterine, mammaire). Afin de comprendre les bases de la cooperation entre ifn et atra, nous avons analyse les mecanismes moleculaires potentiellement impliques. L'etude sur deux lignees cellulaires (hl-60, wish) a montre que le niveau de l'activite 2-5 synthetase (2-5oas), pml, sp100, pkr est accru en presence d'atra. L'atra seul induit un effet antiproliferatif et un effet antiviral vis-a-vis du vsv. Un double traitement est accompagne d'un effet cooperatif sur les trois phenomenes. L'utilisation d'anticorps anti-ifn a permis de montrer que l'arta induit la secretion d'ifn-. Les donnees publiees suggerent qu'irf-1, un candidat au role d'inducteur d'ifn, est directement induit par l'atra. Nous avons donc etudie le promoteur d'irf-1. Un site gas est decrit et un site potentiel de reponse a l'atra a ete localise en amont du site gas. Nos resultats suggerent que le site gas est suffisant pour expliquer l'effet de l'atra sur le promoteur d'irf-1. Des experiences de retards sur gel montrent que le pretraitement a l'atra augmente la fixation de complexes stat 1 sur un site gas. Cela s'explique par l'induction de stat 1 par l'atra. Par ailleurs, nous avons montre que la proteine pml, impliquee dans la translocation t(15 ; 17) qui fusionne une partie de son gene avec celui du recepteur aux retinoides rar, est inductible par les ifn. Le gene chimere pml/rar est sous le controle du promoteur de pml, et donc inductible par les ifn. Cette donnee permet de mettre en garde contre un traitement combine atra/ifn dans le cas particulier de la lam3, soulignant ainsi le role complementaire des test cliniques et des etudes in vitro.

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Abraham, Nicolas. "L’antisynapse : un pôle de signalisation précoce et transitoire déclenché par l’adhésion." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCB057/document.

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Abstract:

La synapse immunologique est une structure qui se forme à l’interface entre un lymphocyte T et une cellule présentatrice d’antigène lors de la reconnaissant d’un antigène étranger spécifique. Cette plate‑forme est actuellement considérée comme le lieu d’où est déclenchée la cascade de signalisation moléculaire conduisant à l’activation lymphocytaire. Les travaux présentés dans ce manuscrit décrivent un autre pôle de signalisation localisé sur le lymphocyte T, à l’opposé de la zone de contact. Ce pôle a été nommé antisynapse. On peut détecter cette structure dans la première minute avant le contact, avant l’apparition de la synapse immunologique. Elle contient les composants classiquement décrit à la synapse immunologique. Sa formation est indépendante de la reconnaissance d’antigène et déclenchée par l’adhésion entre les cellules. Plusieurs fonctions potentielles sont étudiés, l’antisynapse agit notamment comme un réservoir de molécules qui sont transférées à la synapse immune de manière dépendante des microtubules. L’antisynapse peut également être considérée comment une pre-synapse déclenchée avant la reconnaissance d’antigène The immunological synapse forms at the interface between a T cell and an antigen-presenting cell after foreign antigen recognition. The immunological synapse is considered to be the site where the signaling cascade leading to T lymphocyte activation is triggered. In this manuscript, we show that another signaling region can be detected before formation of the synapse at the opposite pole of the T cell. This pole has been named antisynapse. This structure appears during the first minute after the contact forms, is transient and contains all the classic components that have been previously described at the immunological synapse. Its formation is independent of antigen recognition but is driven by adhesion itself. Some potentials functions à discussed here, it constitutes a reservoir of signaling molecules that are potentially ready to be sent to the immunological synapse through a microtubule-dependent pathway. The antisynapse can thus be considered as a pre-synapse that is triggered independently of antigen recognition

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CALLEJA, VERONIQUE. "Modulation par l'adhesion cellulaire et l'ampc des voies de signalisation stimulees par les facteurs de croissance." Nice, 1999. http://www.theses.fr/1999NICE5344.

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Abstract:

La phosphorylation de fak est modulee par l'adhesion cellulaire et par les recepteurs a activite tyrosine kinase. Elle interagit avec des proteines de signalisation comme src, la pi3-kinase, ou grb2 connues pour etre stimulees apres activation de ces recepteurs. Nous avons tout d'abord etudie l'interrelation entre l'adhesion cellulaire et la voie de signalisation des recepteurs de l'insuline et l'igf-1 sur la regulation de fak. Nous avons montre que l'insuline et l'igf-1 induisent la dephosphorylation de fak dans des cellules adherentes, alors que fak est un substrat des recepteurs de l'insuline et de l'igf-1 dans les cellules en suspension. Ceci suggere que des variations d'activation de fak dependantes du contexte cellulaire, de l'etat d'activation des cellules ou du stade de developpement embryonnaire, induiraient des effets biologiques differents voir opposes. Nous avons ensuite etudie la regulation de la pi 3-kinase et determine le site principal d'interaction de fak avec ses sous-unites p85 et p55 p i k. Ce nouveau site, la tyrosine 950, serait un site d'autophosphorylation, se trouvant dans un domaine yxxm. L'expression, du mutant de fak phe-950, induit une perte de l'activite pi3-kinase associee a fak, une diminution de la pkb totale et de l'adhesion des cellules, indiquant que la liaison de fak a la pi3-kinase jouerait un role fondamental dans l'adhesion stimulee par fak. Dans une seconde partie, nous avons etudie le role du second messager ampc au niveau de la regulation de la voie d'activation des erks stimulee par differents facteurs de croissance. Nous avons confirme que l'activation des erks peut etre modulee par l'ampc en fonction du type cellulaire mais qu'elle depend aussi de la nature du recepteur tyrosine kinase implique dans l'activation. De plus, l'effet de l'ampc sur la proliferation et la differenciation cellulaire ne dependrait pas totalement de la modulation de l'activite erk.

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Chaligné, Ronan. "Signalisation par le récepteur de la thrombopoïétine et syndromes myéloprolifératifs non-LMC." Paris 11, 2009. http://www.theses.fr/2009PA11T053.

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Lachaud, Christophe. "Mort cellulaire induite par les sphingolipides et signalisation calcique chez les végétaux." Toulouse 3, 2010. http://thesesups.ups-tlse.fr/1152/.

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En réponse à une attaque des plantes par un microorganisme pathogène, les LCBs (« sphingoïd Long Chain Bases ») participent à la mise en place d'une mort cellulaire programmée (PCD). Cependant, peu de connaissances existent sur les mécanismes de signalisation des LCBs chez les plantes. Dans ce contexte, les relations croisées entre calcium et ROS (Reactive Oxygen Species) dans la PCD induite par les LCBs ont été étudiées chez les cellules de tabac BY-2. Ainsi, le calcium cytosolique contrôlerait à la fois la PCD et une voie de défense basale impliquant les ROS, tandis que le calcium nucléaire contrôlerait uniquement la PCD. De plus, une phosphorylation des protéines 14-3-3 et des modifications de leurs protéines cibles ont été démontrées chez Arabidopsis thaliana en réponse aux LCBs. En parallèle, une perte d'interaction dépendante du calcium entre CPK3 et les 14-3-3s a été mise en évidence et CPK3 a été identifiée comme la protéine kinase responsable de la phosphorylation des 14-3-3s LCBs (Long Chain Bases) are involved in Programmed Cell Death (PCD) induced during plant-microorganism interactions. However, little is known about the mechanisms involved in LCB signaling in plants. In the present work, study of crosstalks between calcium and ROS (Reactive Oxygen Species) in tobacco BY-2 cells showed that cytosolic calcium controls both PCD and basal defence processes involving ROS, whereas nuclear calcium only controls PCD. Moreover, LCBs induce 14-3-3 phosphorylation on serine 58 and modifications of 14-3-3 targets including CPK3 in Arabidopsis thaliana cells. Interestingly, the LCB treatment leads to a calcium-dependent disruption of the CPK3/14-3-3 complex. Finally, CPK3 was identified as a kinase able to phosphorylate 14-3-3s in response to LCBs

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Docquier, Aurélie. "Rôle du corégulateur transcriptionnel RIP140 dans la signalisation par les facteurs E2Fs." Thesis, Montpellier 1, 2010. http://www.theses.fr/2010MON1T018.

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Abstract:

Le contrôle du cycle cellulaire, processus fondamental pour la prolifération cellulaire, est souvent altéré au cours de la tumorigenèse. Les facteurs de transcription E2Fs sont des régulateurs majeurs de l'expression de gènes impliqués dans le cycle cellulaire, la réplication de l'ADN, la mort cellulaire programmée ou encore la différenciation cellulaire. La famille des facteurs E2Fs contient des membres qui agissent comme activateurs ou répresseurs de la transcription et dont l'activité est régulée par un grand nombre de corégulateurs transcriptionnels, incluant notamment les protéines à poche pRb, p107, p130. RIP140 (Receptor Interacting Protein of 140kDa) a été identifié comme un corépresseur de nombreux récepteurs nucléaires, une autre grande famille de facteurs de transcription qui, pour certains, régulent positivement l'expression du gène RIP140.Ce travail de thèse a permis d'identifier RIP140 comme un nouveau répresseur de l'activité transcriptionnelle du facteur E2F1, dans des expériences de transfection transitoire ainsi que sur l'expression de gènes endogènes. Nous avons également montré que l'expression ectopique de RIP140 bloque la progression des cellules dans le cycle cellulaire. Dans les cancers du sein, le niveau d'expression de RIP140 présente une corrélation inverse avec celui de différents gènes cibles des facteurs E2Fs et semble discriminer les tumeurs luminales des tumeurs basales. Nous avons également démontré que le niveau d'ARNm RIP140 est régulé au cours du cycle cellulaire et que le promoteur du gène RIP140 est une cible directe des facteurs E2Fs. Cette régulation implique des sites de liaison des facteurs E2Fs et Sp1 de la région proximale du promoteur. La régulation de ce gène par E2F1 a également été observée au cours du processus de différenciation adipocytaire en utilisant un modèle murin E2F1-/-.En conclusion, ce travail a permis d'identifier RIP140 comme un nouvel acteur de la voie de signalisation par les facteurs E2Fs Cell cycle control, a fundamental process which controls cell proliferation, is frequently altered during tumorigenesis. The E2F transcription factors are central regulators of target gene expression involved in cell cycle regulation, DNA replication, apoptosis and differentiation. The E2F transcription factors family encompasses members which act as activators or repressors. Their activities are regulated by a large number of transcriptional coregulators, including in particular the pocket proteins pRb, p107, p130.The transcription coregulator RIP140 (Receptor Interacting Protein of 140kDa) has been identified as a partner of numerous nuclear receptors, another important transcription factor family. Some of these nuclear receptors positively regulate RIP140 gene expression.This work identified RIP140 as a new repressor of E2F1 transcriptional activity, both in transient transfection experiments and on the expression of endogenous target genes. We also showed that ectopic expression of RIP140 blocks cell cycle progression. In breast cancers, the level of RIP140 expression is inversely correlated with various target genes of E2Fs factors and seems to discriminate luminal from basal tumors. We also demonstrated that the RIP140 mRNA expression is regulated during cell cycle and that the RIP140 promoter is a direct target of E2F transcription factors. This regulation involves both E2F and Sp1 binding sites in the proximal region of the RIP140 promoter. The regulation of the RIP140 gene by E2F1 was also observed during adipocyte differentiation using an E2F1-/- mouse model.In conclusion, this study identified RIP140 as a new regulator of the E2F signalling pathway and as a novel E2F1 target gene. These results open new perspectives concerning the roles that this transcriptional coregulator might play in the control of cell proliferation and tumorigenesis

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St-Pierre, David. "Mécanismes de signalisation d’AT1R médiés par des analogues cycliques de l’angiotensine II." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2017. http://hdl.handle.net/11143/11091.

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Abstract:

L'angiotensine II (Ang II) joue un rôle important dans la régulation du système cardiovasculaire par l’activation de plusieurs voies de signalisation. L’activation de ces voies passe par le récepteur de l'angiotensine II de type 1 (AT1R). Ce récepteur fait partie de la famille des récepteurs couplés aux protéines G (GPCRs). De plus, il est maintenant connu que certains ligands peuvent lier le récepteur et induire une conformation qui permet d'activer certaines voies de signalisation tout en n’étant pas favorable à l'activation d'autres voies. Il est alors question de sélectivité fonctionnelle, aussi appelée signalisation biaisée. Ainsi, avec cette approche, il est possible de cibler les voies qui produiront les effets thérapeutiques désirés sans toutefois activer les voies qui seraient responsables des effets indésirables. Nous avons émis l’hypothèse que de cycliser des ligands va restreindre les conformations possibles lors du couplage avec AT1R et induire un agonisme biaisé. Ainsi, des analogues cycliques de l’AngII substitués aux positions 3 et 5 par des cystéines et des homocystéines ont été synthétisés: [Sar1Hcy3,5]AngII, [Sar1Cys3Hcy5]AngII et [Sar1Cys3,5]AngII. D’abord, la capacité de ces analogues cycliques à activer la voie Gq a été évaluée par la mesure de la production des inositol phosphates. Puis, la capacité à activer les voies G12, le recrutement des β-arrestines (1 et 2) ainsi que l’activation de ERK1/2 a également été évaluée. Nos travaux ont montré que l’analogue cyclique [Sar1Hcy3,5]AngII a une puissance et une efficacité maximales sur toutes les voies testées à l'exception de la voie Gq. Des simulations de dynamique moléculaire ont été effectuées pour nous permettre de comprendre comment la conformation du ligand influence la structure d’AT1R et donc l’activation des différentes voies de signalisation. Les simulations en dynamique moléculaire ont montré que la barrière énergétique associée à l'insertion du résidu Phe8 de l’AngII dans le coeur hydrophobe d'AT1R est augmentée avec [Sar1Hcy3,5]AngII, pouvant expliquer que cet analogue active moins bien la voie Gq. D’autres analogues cyclisés aux positions 3 et 5 de l’AngII ont été synthétisés; [Sar1Hcy3Ile4Hcy5]AngII, [Sar1Hcy3,5Ile8]AngII et [Sar1Hcy3Cys5]AngII. Leur capacité à activer les voies Gq, ERK1/2 et le recrutement des β-arrestines (1 et 2) a été évaluée. L’analogue [Sar1Hcy3Cys5]AngII semblait bien activer la voie ERK1/2, mais pas les voies G12 et β-arrestines. Ces résultats suggèrent que le fait de contraindre les mouvements des déterminants moléculaires d’un ligand en introduisant des structures cycliques peut entraîner un biais dans la signalisation en stabilisant différentes structures du récepteur. Abstract: Angiotensin II (Ang II) has an important role in the regulation of the cardiovascular system by its ability to activate several signaling pathways. The activation of these pathways occurs via the angiotensin II receptor type 1 (AT1R). This receptor belongs to the family of G protein-coupled receptors (GPCRs). Moreover, it is now known that certain ligands can bind to the receptor and induce a conformation that allow the activation of certain signaling pathways while not promoting the activation of other pathways. This concept is known as functional selectivity or biased signaling. With this approach, it is possible to target the signaling pathways that produce the desired therapeutic effects rather than activating the pathways responsible for adverse effects. We hypothesized that cyclizing ligands would restrict possible conformations when coupled with AT1R and induce biased agonism. Thus, cyclic AngII analogs substituted at positions 3 and 5 by cysteines and homocysteines were synthesized: [Sar1Hcy3,5]AngII, [Sar1Cys3Hcy5]AngII and [Sar1Cys3,5]AngII. First, the ability of these cyclic analogs to activate the Gq pathway was measured by the inositol phosphates production. Then, the G12 pathway activation, β-arrestin (1 and 2) recruitment and the ability of these analogs to activate the ERK1/2 pathway was evaluated. Our work has shown that [Sar1Hcy3,5]AngII has maximum potency and efficacy on all of the evaluated pathways, except for the Gq pathway. Molecular dynamic simulations were used to understand how a distinct ligand conformation influences the AT1R structure and the activation of signaling pathways. These studies have shown that the energy barrier associated with the insertion of the Phe8residue of AngII within the hydrophobic core of AT1R is increased with [Sar1Hcy3,5]AngII, possibly explaining why this analog is less potent in activating the Gq pathway. Other analogues cyclized at positions 3 and 5 of AngII were synthesized; [Sar1Hcy3Ile4Hcy5]AngII, [Sar1Hcy3,5Ile8]AngII and [Sar1Hcy3Cys5]AngII. Their ability to activate Gq, ERK1/2 and recruitment of β-arrestins (1 and 2) was evaluated. The analog [Sar1Hcy3Cys5]AngII appeared to activate the ERK1/2 pathway but not the G12 and β-arrestin pathways. These results suggest that constraining the movements of molecular determinants of a ligand by introducing cyclic structures can lead to a signaling bias by stabilizing different structures of the receptor.

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Chaix, Amandine. "Les spécificités de la signalisation oncogénique par rapport à la signalisation physiologique : le modèle de KIT, un récepteur à activité tyrosine kinase." Thesis, Aix-Marseille 2, 2010. http://www.theses.fr/2010AIX22079/document.

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Abstract:

Le système de communication SCF/KIT est impliqué dans le développement et l’homéostasie de plusieurs lignages cellulaires. Des dysfonctionnements de la voie sont à l’origine de pathologies affectant ces compartiments. En particulier, des mutations gain-de-fonction, qui entraînent l’activation constitutive du récepteur à activité tyrosine kinase KIT, sont responsables de néoplasies chez l’homme.L’objectif des travaux réalisés durant cette thèse était d’étudier certaines spécificités de la signalisation de formes oncogéniques de KIT, ceci dans le modèle du mastocyte transformé par l’oncogène KIT-D816V. Cette étude a été menée au niveau proximal sur le récepteur lui-même ainsi qu’au niveau distal sur la voie STAT ,une des voies de signalisation spécifiquement activée de manière constitutive par le récepteur mutant.Au niveau proximal, nous avons pu montrer que le motif dityrosine Y568-Y570situé dans le domaine juxtamembranaire de hKIT est une plateforme majeure de recrutement des effecteurs de la signalisation intracellulaire avec au moins 15partenaires différents recrutées. Par ailleurs l’étude de modèles cellulaires dans des analyses liées aux fonctions physiologiques du récepteur réalisés in vitro et in vivo ont révélé que le site est impliqué dans la régulation négative du signal transformant issu de l’oncogène KIT-D816.Au niveau distal, nous avons analysé les mécanismes de phosphorylation des protéines STAT1, -3 et -5 ainsi que l’importance fonctionnelle de leur activation dans la transformation dépendante de KIT-D816. Nous avons ainsi étudié la contribution de différentes kinases dans les phosphorylations activatrices des STATs sur tyrosine et serine. Nos résultats suggèrent que seul STAT5 a une activité transcriptionnelle dans nos modèles suggérant une implication potentielle non canonique des STAT1et -3 dans la transformation dépendante de KIT-D816.L’ensemble de nos travaux contribue à une meilleure compréhension des mécanismes de l’oncogenèse dépendante de KIT-D816, un point critique dans le développement raisonné de thérapeutiques anticancéreuses ciblées The receptor tyrosine kinase KIT and its ligand, the stem cell factor (SCF), are implicated both in the development and the homeostasis of multiple cell lineages. Dysfunctions in the KIT/SCF pathway are involved in several pathologies affecting these compartments. In particular, gain-of-function mutations that lead to constitutive activation of the receptor KIT are found in human neoplasia.The purpose of this thesis project was to investigate some differences between normal and oncogenic signalling of KIT receptor using mast cells transformed by the KIT-D816 oncogene as a model. This question was analysed at aproximal level on the oncogenic receptor itself and at a more distal level on the STAT signal transduction pathway, which is specifically and constitutively activated by theKIT-D816 mutant.At the proximal level, we show that the juxtamembrane dityrosine motif Y568-Y570 of KIT is the major platform of recruitment of intracellular signalling partnerswith more than 15 interactors found in mast cells. Furthermore, the analysis ofcellular models in both in vitro and in vivo assays related to KIT physiological functions has revealed the negative role of the motif in KIT-D816-mediated cell transformation. At the distal level, we have analysed the mechanisms of phosphorylation ofSTAT1, -3 and -5 proteins and the functional relevance of their activation in KITD816-mediated transformation. We describe the contribution of different kinases inthe phosphorylation of STATs on both serine and tyrosine residues. Our results suggest that only STAT5 is transcriptionaly active whereas STAT1 and STAT3 are not, suggesting a non conventional implication of their activation in celltransformation. Our work contributes to a better understanding of the mechanisms of KITD816-mediated oncogenesis and could be used to improve the rational developmentof new targeted cancer therapies

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Tissier-Rible, Frédérique. "Oncogenèse corticosurrénalienne : Approche par la voie de signalisation Wnt/ß-caténine et par l'expression de cycline E." Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05D055.

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Abstract:

Les tumeurs corticosurrénaliennes (TCS) sont rares et les anomalies moléculaires qui les caractérisent sont peu connues. Notre travail a visé à étudier dans la tumorigenèse corticosurrénalienne sporadique de l'adulte (hors adénomes de Conn), deux axes impliqués dans la prolifération cellulaire dont le rôle est bien connu dans d'autres tumeurs, d'une part la voie de signalisation Wnt/ß-caténine et d'autre part cycline E, impliquée dans la transition G1/S du cycle cellulaire.

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Tranchant, Thibaud. "Variants A189V et N680S du récepteur humain de l'hormone folliculo-stimulante (FSH) : caractérisation fonctionnelle et implications cliniques." Thesis, Tours, 2011. http://www.theses.fr/2011TOUR3307.

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Abstract:

La FSH est une hormone qui joue un rôle central dans la fonction de reproduction. De ce fait, elle est utilisée en assistance médicale à la procréation (AMP) afin de recruter un pool de follicules et de l’amener jusqu'à l'ovulation. La FSH agit sur un récepteur spécifique (RFSH) qui active des voies de signalisation par l'intermédiaire des protéines G et des β-arrestines. L'étude in vitro d’un mutant et de variants du RFSH décrits chez l’homme nous a permis de mettre en évidence différents mécanismes conduisant à des biais de signalisation de ce récepteur. Ces altérations génétiques, en modifiant l'équilibre qui existe entre les différentes voies de signalisation activées par le RFSH, conduisent à des manifestations cliniques. En parallèle, nous avons mené une étude clinique sur le polymorphisme N680S du RFSH, qui nous a permis de confirmer et de prolonger les résultats de la littérature tout en corrélant les résultats obtenus in vitro à la signalisation des récepteurs N680 et S680. L’ensemble de nos résultats ouvre des perspectives pour le développement de nouvelles stratégies en AMP FSH is a hormone which is centrally involved in reproduction. For this reason, FSH is extensively used in in vitro fertilization (IVF) to recruit and lead a pool of follicle to ovulation. FSH acts on its cognate receptor (FSHR) which activates signaling pathways through the canonical G-protein pathways as well as through β-arrestin-dependent transduction mechanisms. In vitro studies of a mutant and of variants of the FSHR identified in patients allowed us to highlight different mechanisms leading to bias in the signaling pathways triggered by this receptor. These genetic alterations, by modifying the equilibrium that exists between the different signaling pathways activated by the FSHR, lead to clinical consequences. In parallel, we have carried out a clinical study centered on the N680S polymorphism of the FSHR. Our results confirm and extend previous studies from the literature while correlating the results we obtained in vitro with the functional consequences of the N680S polymorphism of the FSHR. Together, our results open new avenues for developing new strategies in IVF

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Prince, Stéphan. "Détection et reconnaissance de panneaux de signalisation routière par utilisation des groupements perceptuels." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1998. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp04/mq33741.pdf.

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Popa-Nita, Oana. "Voies de signalisation activées par les cristaux d'urate monosodique dans les neutrophiles humains." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25672/25672.pdf.

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Aponte, Emilie. "Régulation de la signalisation de Src par son domaine N-terminal intrinsèquement désordonné." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTT095.

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Abstract:

La tyrosine kinase cytoplasmique Src est un régulateur essentiel de la croissance et de l’adhésion cellulaires induites par de nombreux stimuli extracellulaires, dont les facteurs de croissance et certains composants de la matrice extracellulaire. La dérégulation de son activité catalytique lui confère des propriétés oncogéniques importantes conduisant à la formation de tumeurs agressives chez l’Homme. La plupart des connaissances actuelles sur sa régulation catalytique repose sur des données structurales de cristallographie qui ont révélé l’importance des interactions intramoléculaires SH2 et SH3-dépendantes dans le contrôle des conformations ouvertes et actives de Src. Les domaines SH3, SH2 et kinase de Src sont associés au domaine SH4 N-terminal d'ancrage à la membrane plasmique via un domaine unique (DU) flexible. Le rôle du DU dans la régulation de Src reste obscur car il est intrinsèquement désordonné et par conséquent, cette région n'a pas été incluse dans les analyses structurales originelles. L'analyse par RMN de l'extrémité N-terminale de Src a révélé une conformation partiellement structurée du DU par le contact de séquences peptidiques spécifiques avec les lipides membranaires et le domaine SH3 (Perez et al, 2013; Maffei et al, 2015). De plus, cette interaction est régulée par phosphorylation des Ser69 et Ser75 localisées à proximité de ce domaine. L’objectif de ma thèse était d’adresser la relevance biologique de ces données structurales en me focalisant sur le rôle d’une partie du DU identifiée comme importante par RMN. J’ai montré que l’inactivation de cette région par des mutations perte de fonction, diminue fortement la signalisation de Src dans les cellules non transformées humaines ainsi que ses propriétés tumorales dans les cellules cancéreuses colorectales métastatiques révélant la pertinence biomédicale du système. Des analyses de protéomique m’ont permis de révéler un mécanisme original par lequel cette région contrôle la capacité de Src à phosphoryler ses substrats. En conclusion, ces données confirment un rôle important du DU sur l'activité et la signalisation de Src et révèlent un rôle critique des domaines désordonnés dans les tumeurs chez l’Homme. L’inhibition de cette région unique par de petites molécules devrait conduire à de nouvelles stratégies thérapeutiques dans le cancer The membrane-anchored non-receptor tyrosine kinase Src is involved in numerous signal transduction pathways and hyperactive Src is a potent oncogene and driver of human metastasis. Most of our knowledge on Src kinase regulation relies on structural data, which revealed SH2 and SH3-dependent intramolecular interactions to control active conformations of the protein. The kinase, SH3 and SH2 domains of Src are attached to the membrane-anchored SH4 domain through the flexible unique domain (UD). The role of this UD remains obscure due to its intrinsically disordered properties for which reason it was not included in original structural analyses. Interestingly, membrane-associated intrinsic disordered domains are more prevalent among signaling and cancer-related proteins and they are thought to play critical roles in human disease. NMR analysis of Src N-terminus in the presence of lipids revealed a partially structured conformation of the UD through the contact of a small peptide sequence with membrane lipids and the SH3 domain of the protein (Perez et al, 2013; Maffei et al, 2015). This interaction was regulated by phosphorylation of Ser69 and Ser75 surrounded this central region. The aim of my thesis project was to assess the biological relevance of this structural data. Interestingly, I showed that expression of Src mutants with UD loss of function drastically affected Src activity and signaling in human non-transformed cells as well as Src oncogenic properties in metastatic colorectal cancer cells. This highlights the biomedical relevance of the system. Further proteomic analysis revealed an unsuspected mechanism by which this region controls the Src capacity to phosphorylate specific substrates involved in cancer cell activity. These data support a previously unrecognized important role of the UD on Src activity and signaling and reveals a critical role of intrinsic disordered domains in the regulation of kinase signaling in human disease. Targeting this unique region by small molecules may be of therapeutic value in human cancer

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Jouannet, Stéphanie. "Compartimentation membranaire d’ADAM10 par les tétraspanines : conséquences pour la voie de signalisation NOTCH." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA11T066/document.

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Abstract:

Il est maintenant reconnu que la ségrégation latérale des composants de la membrane plasmique, ou compartimentation membranaire, joue un rôle important dans la régulation de la fonction de nombreuses protéines membranaires. Les tétraspanines constituent une famille de protéines intégrales à quatre régions transmembranaires possédant une capacité unique à s’associer entre elles et avec des nombreuses autres molécules de surface pour former un réseau d'interactions moléculaires, le « tetraspanins web ». Il a été proposé que via l’organisation de ce réseau, les tétraspanines joueraient un rôle dans la compartimentation membranaire des protéines auxquelles elles s’associent. Elles jouent également un rôle dans la compartimentation cellulaire en contrôlant le trafic de certaines des protéines associées. Le laboratoire a précédemment démontré que six tétraspanines conservées (Tspan5, 10, 14, 15, 17 et 33) de la sous-Famille des TspanC8 (caractérisées par la présence de huit cystéines dans le grand domaine extracellulaire) interagissent directement avec la métalloprotéase ADAM10 et régulent sa sortie du réticulum endoplasmique. Cette protéase ancrée à la membrane est responsable du clivage protéolytique de l'ectodomaine de diverses molécules de surface et est indispensable pour l'activation de la voie de signalisation NOTCH. Nous démontrons que Tspan5 et Tspan14 sont des régulateurs positifs de la voie de signalisation Notch et que Tspan15 est un régulateur négatif, agissant en amont de la γ-Sécrétase. Cette régulation négative est associée à un changement d’environnement membranaire ainsi qu’à une dynamique différente d’ADAM10 comme le montre un suivi de la protéase à l’échelle de la molécule unique. Par ailleurs, l’analyse par spectrométrie de masse quantitative a montré que la capacité d’ADAM10 à s’associer à des composants connus du réseau de tétraspanines était influencée par son interaction avec ces tétraspanines. Enfin, nous avons identifié une région de la cellule enrichie en CD9 qui contenait également ADAM10 lorsque Tspan5 est exprimée, mais ce n’est pas le cas avec Tspan15. Cette étude démontre que les différentes TspanC8 influencent différemment la capacité d’ADAM10 à cliver certains de ses substrats et illustre la capacité des tétraspanines à réguler l’activité de leurs protéines partenaires en contrôlant leur compartimentation membranaire It is now recognized that the lateral segregation of components of the plasma membrane or membrane compartmentalization, play an important role in the regulation of many membrane proteins functions. Tetraspanins are a family of integral membrane proteins with four transmembrane domains with a unique ability to associate with one another and with many other surface molecules to organize a molecular interactions network, the “tetraspanins web”. It was suggested that via the organization of this network, the tetraspanin play a role in membrane compartmentalization of proteins to which they associate. Tetraspanins also play a role in cellular compartmentalization by controlling the trafficking of some associated proteins. In the lab, it has been shown that six conserved tetraspanin (Tspan5, 10, 14, 15, 17 et 33) of the TspanC8 subgroup (characterized by the presence of eight cysteines in the large extracellular domain) interact directly with the metalloproteinase ADAM10 et mediates its exit from the endoplasmic reticulum. This membrane-Anchored metalloprotease mediated ectodomain shedding of various integral molecules and is essential for Notch signaling pathway activation. We demonstrate that both Tspan5 and Tspan14 are positive regulators of Notch signaling pathway, whereas Tspan15 appears as negative regulator, acting in upstream γ-Secretase. This downregulation is associated with a modification of membrane environment as well as different dynamics of ADAM10, as shown by monitoring of protease using single molecule tracking. Furthermore, quantitative mass spectrometry analysis revealed that ADAM10 ability to associate with known components of “tetraspanin web” was influenced by its interaction with these tetraspanins. Finally, we have identified a CD9 enriched cell area which also contained ADAM10 when Tspan5 is expressed but not with Tspan15.This study demonstrates that different TspanC8 influence differently the ADAM10 ability to cleave some of its substrates and illustrate the ability of tetraspanins to regulate the activity of their proteins partners by controlling their membrane compartmentalization

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Ahr, Barbara. "Rôles des motifs cytoplasmiques de CXCR4 dans la signalisation induite par SDF-1." Montpellier 1, 2005. http://www.theses.fr/2005MON1T009.

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Abstract:

LE RECEPTEUR AUX CHIMIOKINES CXCR4 APPARTIENT A LA FAMILLE DES RECEPTEURS COUPLES AUX PROTEINES G HETEROTRIMERIQUES (RCPGs). LE SEUL LIGAND NATUREL QUI LUI SOIT ACTUELLEMENT CONNU EST LA CHIMIOKINE SDF-1. CXCR4 EST PAR AILLEURS UN CORECEPTEUR MAJEUR DU VIH-1 AYANT UN TROPISME POUR LES LIGNEES CELLULAIRES T. LES VIRUS X4, A TROPISME POUR LES LIGNEES T, APPARAISSENT AU COURS DE L'EVOLUTION DE LA PATHOLOGIE, ET CETTE EMERGENCE EST ASSOCIEE A UNE FORTE DEPLETION DES LYMPHOCYTES T CD4+, QUI SERAIT DUE, EN PARTIE AU MOINS, A DES PHENOMENES D'APOPOSE DES LYMPHOCYTES T NON INFECTES. AVANT MON ARRIVEE AU LABORATOIRE, UNE PARTIE DE LA CASCADE APOPTOTIQUE ACTIVEE LORS DE L'INTERACTION DES GLYCOPROTEINES D'ENVELOPPE PRESENTEES A LA SURFACE DES CELLULES, AVEC CXCR4, AVAIT ETE MISE EN EVIDENCE. IL AVAIT NOTAMMENT ETE MONTRE QUE CETTE APOPTOSE INDUIT LA DEPOLARISATION DE LA MEMBRANE MITOCHONDRIALE, LE RELARGAGE DE CYTOCHROME C DE LA MITOCHONDRIE VERS LE CYTOSOL, ET L'ACTIVATION DES CASPASES 9 ET 3. IL NOUS PARAISSAIT ALORS INTERESSANT DE CARACTERISER CETTE CASCADE DE SIGNALISATION PLUS EN AMONT, ET DE DETERMINER LE ROLE JOUE PAR LES DOMAINES CYTOPLASMIQUES DE CXCR4 DANS LES VOIES DE SIGNALISATION INDUITES PAR CE RECEPTEUR EN SITUATION PHYSIOLOGIQUE. AFIN DE REPONDRE A CETTE PROBLEMATIQUE, NOUS AVONS CONSTRUIT DES MUTANTS DE CHACUN DES DOMAINES CYTOPLASMIQUES DE CXCR4. NOUS AVONS AINSI MIS EN EVIDENCE QUE, APRES LIAISON DE SDF-1, SEULE LA TROISIEME BOUCLE INTRACELLULAIRE DE CXCR4 EST REQUISE POUR L'OBSERVATION DES SIGNAUX DEPENDANTS DES PROTEINES Gi, MAIS QUE CETTE BOUCLE N'A AUCUN ROLE DANS L'INTERNALISATION DU RECEPTEUR, SIGNAL STRICTMENT DEPENDANT DE LA PARTIE C-TERMINALE DE CXCR4. NOUS AVONS EGALEMENT DETERMINE QUE LE CHIMIOTACTISME EST UN EVENEMENT PLUS COMPLEXE QUI IMPLIQUE LES DEUXIEME ET TROISIEME BOUCLES CYTOPLASMIQUES DE CXCR4 AINSI QUE SON DOMAINE C-TERMINAL. GRACE AUX MUTANTS DES DOMAINES CYTOPLASMIQUES DE CXCR4, ET AVEC DES MUTANTS PONCTUELS DES TYROSINES CYTOPLASMIQUES, NOUS AVONS ENSUITE DETERMINE QUE, APRES ACTIVATION PAR SDF-1, LA PARTIE N-TERMINALE DE LA TROISIEME BOUCLE CYTOPLASMIQUE DE CXCR4 EST IMPLIQUEE DANS LA PHOSPHORYLATION DE JAK2, ET QUE LA TYROSINE 157 EST RESPONSABLE DE L'ACTIVATION DE STAT3. A PLUS LONG TERME, CE TRAVAIL POURRAIT PERMETTRE DE DISSOCIER AU NIVEAU FONDAMENTAL LES SIGNAUX INDUITS PAR CXCR4 APRES LIAISON DE SDF-1 DE CEUX INDUITS APRES INTERACTION DES GLYCOPROTEINES D'ENVELOPPE DU VIH-1, ET AINSI POUVOIR APPORTER DE NOUVELLES PERSPECTIVES DE TRAITEMENT EN INHIBANT L'APOPTOSE DEPENDANTE DU VIRUS SANS INTERFERER AVEC LE ROLE PHYSIOLOGIQUE DE CXCR4.

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Boislevé, Fanny. "Voies de signalisation activées par les molécules sensibilisantes dans les cellules dentritiques humaines." Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA114813.

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Abstract:

L'objectif de cette thèse a été de mettre en évidence les voies de signalisation impliquées dans la maturation des cellules dendritiques induite par les haptènes. Nous avons étudié l'effet de deux haptènes, le Dinitrochlorobenzène (DNCB) et le nickel (NiSO4), sur la maturation des cellules dendritiques humaines différenciées à partir de précurseurs CD34+ issus de sang de cordon ombilical. Au cours de ce travail, nous avons mis en évidence l'implication des trois MAPK, p38 MAPK, JNK et ERK, dans l'expression de CD83, marqueur spécifique des cellules dendritiques matures, dans l'expression de la molécule de co-stimulation CD86 et dans l'expression du récepteur aux chimiokines CCR7. Nos résultats suggèrent que la maturation des cellules dendritiques provoquée par le DNCB est dépendante du TNF-α, alors que celle induite par le Nickel est en partie indépendante de la sécrétion de cette cytokine The aim of this study was to elucidate the signalling pathways involved in dentritic cell (DC) maturation induced by haptens. We tested the effects of two haptens, Dinitrochlorobenzene (DNCB) and nickel sulfate (NiSO4) on DC differentiated from cord blood CD34+ cells. Our results show that the MAPK, p38MAPK, JNK and ERK, participate to DC maturation induced by these haptens particulary for the expression of the specific maturation marker, CD83, the costimulation molecule, CD86, and the chemokine receptor, CCR7. Our results also suggested that DC maturation induced by DNCB is dependent

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Matakiadis, Theodoros. "Caractérisation physiologique et génétique de la signalisation par le nitrate chez arabidopsis thaliana." Paris 11, 2008. http://www.theses.fr/2008PA112320.

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Abstract:

Le nitrate en plus de son rôle de source d’azote pour les plantes joue un rôle de signalisation dans beaucoup de processus développemntaux chez les plantes et au niveau moléculaire contrôle l’expression de nombreux gènes intervenant dans différentes voies métaboliques. Dans cette thèse deux approches ont été développées pour étudier la signalisation par le nitrate chez Arabidopsis thaliana. Dans une première partie nous avons caractérisé un mutant potentiel de signalisation par le nitrate. Un criblage basé sur l’utilisation du gène rapporteur de la luciférase en fusion transcriptionnelle avec le gène de nitrite réductase foliaire NII1 de tabac a permis d’isoler le mutant 14. 5sep. Il surexprime le gène endogène de nitrite réductase lorsqu’il est cultivé sur un milieu contenant du nitrate ou à base de glutamine ainsi que les gènes NIA codant pour la nitrate réductase (NR) mais présente une activité NR réduite. Il est chlorotique et son développement est retardé par rapport à des plantes contrôles. Nous avons identifié par clonage positionnel la mutation affectant le mutant 14. 5sep et confirmé au niveau génétique que ce mutant était allélique au mutant fry2-1. La caractérisation physiologique et transcriptomique du mutant 14. 5sep a permis de confirmer qu’il présentait certains traits déjà décrits auparavant pour le mutant fry2-1. Nos analyses transcriptomiques ont aussi confirmé l’importance du gène FRY2 dans la régulation de l’expression de nombreux gènes répondant à des stress biotiques ou abiotiques. Ces données soulignent ainsi les interconnexions possibles entre le stress, le métabolisme azoté et la signalisation par le nitrate. La deuxième approche s’est focalisée sur l’étude de l’effet du nitrate sur la dormance des graines d’Arabidopsis. Nous avons montré que le nitrate levait la dormance des graines d’Arabidopsis (Col-0) en réduisant leur teneur en acide abscissique (ABA). Le nitrate présent dans le milieu de germination (nitrate exogène) réduisait la teneur en ABA dans les graines imbibées ou dans les graines sèches lorsqu’il est fourni aux plantes-mères lors du développement des graines (nitrate endogène). Des analyses transcriptomiques de graines traitées au nitrate ont montré que le gène CYP707A2 impliqué dans la dégradation de l’ABA était induit par le nitrate exogène. L’analyse physiologique du mutant cyp707a2-1 a montré que contrairement aux graines sauvages il n’y a pas de baisse de la teneur en ABA dans ces graines mutantes en réponse au nitrate exogène et endogène. Nous avons ainsi montré le rôle central du gène CYP707A2 dans le contrôle par le nitrate des teneurs des graines en ABA au cours du développement de la graine et pendant la germination. Finalement nous présenterons quelques données préliminaires sur l’effet de la nutrition azotée des plantes-mères sur la composition des graines. Nous avons pu mettre en évidence des composés dont l’accumulation dans les graines semble répondre à une signalisation ou à un effet nutritionnel du nitrate Nitrate in addition to its role as nitrogen source has also a role as a signalling molecule controlling several aspects of plant development as well as regulating genes involved in nitrate assimilation and plant growth. In this study two different approaches were used to investigate the role of nitrate as signal in Arabidopsis thaliana. The 14. 5sep mutant was isolated on the over-expression of the endogenous NII gene both on nitrate and glutamine in a screen based on the expression of the Luc gene. 14. 5sep mutant present a slower development and a chlorotic phenotype compared to control plants. The mutant also, over-expressed the NIA genes, but displayed lower total nitrate reductase activity than wild type. Fine mapping showed that 14. 5sep is mutated in FRY2 gene, a stress responsive gene. Further characterization of this mutant by physiological and transcriptomic analysis took place, confirming partly some of the traits described in previous studies for the fry2-1 mutant. The second approach is based on the study of nitrate effect on A. Thaliana seeds dormancy. We found that nitrate releases seed dormancy in A. Thaliana Col-0 seeds by reducing abscisic acid (ABA) levels. Nitrate led to lower levels of ABA in imbibed seeds when included in the germination media, but also in dry seeds when provided to mother plant nutrition. Transcriptomic analyses showed that the expression of the ABA-catabolic gene CYP707A2 was regulated by exogenous nitrate. The use of cyp707a2-1 mutant, which failed to reduce ABA levels in response to both exogenous and endogenous nitrate, provided information underlining the central role of the CYP707A2 gene in the nitrate controlled ABA levels during seed development and germination

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GALLET, CAROLE. "Activation et signalisation induite par les isoformes du recepteur de thromboxane a 2." Paris 7, 2000. http://www.theses.fr/2000PA077087.

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Abstract:

Le thromboxane a 2 (txa 2), metabolite de l'acide arachidonique, est majoritairement produit par les plaquettes sanguines activees. C'est un vasoconstricteur et un bronchoconstricteur ainsi qu'un puissant agregant plaquettaire. Les effets anti-thrombotiques decrits pour l'aspirine sont essentiellement dus a l'inhibition de la formation de ce compose. Le txa 2 exerce ces effets biologiques via des recepteurs a sept domaines transmembranaires couples aux proteines g. Deux isoformes de recepteur tp et tp ont ete mises en evidence a ce jour. Nous nous sommes interesses a la signalisation induite par ces recepteurs. Dans les plaquettes sanguines, contenant des recepteurs tp de haute et basse affinite, nous avons mis en evidence une nouvelle voie de signalisation induite par les recepteurs de haute affinite. Cette voie conduit a l'activation de la tyrosine kinase syk. Et a la phosphorylation de la cortactine, une proteine du cytosquelette, accompagnant le changement de forme. D'autre part, nous avons montre que l'agregation induite par le txa 2 necessite la stimulation concomitante de recepteurs tp couples a gq et de recepteurs couples a gi tel le recepteur p2t a c de l'adp, un autre agregant plaquettaire. En outre, nous avons mis en evidence pour la premiere fois la transactivation des recepteurs de facteur de croissance egf necessaire a l'activation des mapkinases erk par les deux isoformes du recepteur tp, dans un systeme de surexpression ainsi que dans les cellules musculaires lisses vasculaires humaines. La tyrosine kinase src est impliquee dans l'activation de erk par les deux isoformes, tandis que les pkc semblent jouer un role plus important pour tp. En conclusion, ce travail a permis d'apporter de nouvelles connaissances liees a la signalisation des recepteurs tp et a demontre l'importance de leurs interactions avec les autres recepteurs environnants pour permettre une signalisation cellulaire.

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GAUTREAU, ALEXIS. "Regulations des fonctions de morphogenese et de signalisation de l'ezrine par les phosphorylations." Paris 11, 1999. http://www.theses.fr/1999PA112333.

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Abstract:

L'ezrine est une proteine permettant la liaison des microfilaments d'actine a la membrane plasmique. L'ezrine est aussi un substrat de kinases. Deux residus, la tyrosine 145 et la tyrosine 353 sont phosphoryles par le recepteur a l'egf. La phosphorylation de la threonine 567 du domaine c-terminal a ete proposee pour activer la liaison de l'ezrine au cytosquelette. Nous avons recherche le role de ces phosphorylations in vivo en produisant l'ezrine, sauvage ou mutee au niveau de ces sites de phosphorylation, dans les cellules epitheliales llc-pk1 derivees du tubule proximal renal. Dans des conditions de differenciation en tubules reminiscents de leur origine, les cellules produisant l'ezrine y145f sont incapables de proliferer, alors que les cellules produisant l'ezrine y353f sont incapables de survivre et activent un programme d'apoptose. La voie de signalisation de survie activee par la phosphorylation de la y353 de l'ezrine est la voie pi 3-kinase/akt. L'ezrine se lie a la pi 3-kinase, grace a deux sites d'interaction sur la sous-unite regulatrice, p85. Le domaine n-terminal de l'ezrine recrute la pi 3-kinase et la y353 phosphorylee interagit avec le domaine c-terminal sh2 de la p85, ce qui permet l'activation de la pi 3-kinase. L'ezrine t567a non phosphorylable est incapable de s'associer au cytosquelette d'actine alors que l'ezrine t567d pseudo-activee induit de nombreuses structures membranaires aberrantes. Cette activite morphogenetique est liee a une absence d'oligomeres d'ezrine t567d dans la fraction membranaire. De plus, l'ezrine t567a inactive est capable de former des oligomeres a la membrane plasmique. Ces resultats suggerent un nouveau modele d'activation de l'ezrine ou les oligomeres ne representent pas la forme active liee au cytosquelette, mais plutot une forme intermediaire recrutee a la membrane plasmique. La phosphorylation de la t567 induit une transition des oligomeres en monomeres lies au cytosquelette.

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MAULON, FERAILLE LAURENCE. "Caracerisation des voies de signalisation induites par la thrombine dans les cellules jurkat." Nice, 1999. http://www.theses.fr/1999NICE5364.

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Abstract:

Les proteases a serine representent une famille d'enzymes impliquee de longue date dans les processus de degradation proteique et plus recemment dans la regulation de la signalisation intracellulaire. Cette derniere fonction est liee notamment a la presence a la surface de nombreux types cellulaires de recepteurs specifiques actives par proteolyse. Ce sont des recepteurs a sept domaines transmembranaires couples aux proteines g (rcpg), dont le mecanisme d'activation se fait par coupure. La thrombine module au moins deux voies de signalisation intracellulaire necessitant des proteines g, gi inhibitrice de l'adenylate cyclase et gq activatrice d'une phospholipase c. L'activation de ces systemes genere des seconds messagers, l'inositol-1,4,5 trisphosphate (ip3) et le diacylglycerol (dag), impliques respectivement dans la mobilisation intracellulaire de calcium et l'activation de la proteine kinase c. Nous avons recemment montre l'existence de recepteur de la thrombine et de la trypsine a la surface de la lignee leucemique t humaine jurkat et des lymphocytes t du sang peripherique. Nous avons disseque les evenements moleculaires induit par la thrombine et son agonsite peptidique dans les lymphocytes t. Tous deux, induisent une augmentation de l'activite des trois voies mapk : erk, p38 mapk et jnk. L'activation des p38 mapk est dependante des src kinases alors que l'activation des erks est non seulement dependante des src kinases mais egalement des pkcs. Nous avons identifie une isoforme particuliere, pkc, necessaire a la stimulation des erks induite par la thrombine. Nous avons montre par ailleurs que la proteine csk etait impliquee positivement dans l'activation des erks. Notre travail a egalement mis en evidence une interdependance entre le recepteur t et le recepteur de la thrombine. En effet, la proteine p56lck, element necessaire a la signalisation via le recepteur, exerce un controle negatif sur la liberation de calcium et l'activation de p38 mapk induite par la thrombine dans les cellules jurkat. En conclusion, nous avons caracterise certains des elements impliques positivement ou negativement dans la signalisation induite par le recepteur de la thrombine dans les cellules jurkat. Cette etude devrait contribuer a une meilleure comprehension des mecanismes de transduction du signal par cette famille originale de recepteurs et permettra d'apprehender son role physiologique et pathologique.

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Mazel, Claude. "Evaluation des performances par simulations : application aux canaux de signalisation de systèmes radiotéléphoniques." Grenoble INPG, 1988. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00327272.

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Abstract:

Le sujet de cette thèse est l'évaluation par simulation des performances des systèmes radiotelephoniques. En première partie, on présente les différentes techniques d'accès multiple. En deuxième partie, on applique une méthode de modélisation en deux phases inspirée des techniques d'agrégation à un réseau radiotelephonique cellulaire. La dernière partie concerne l'évaluation des performances d'un algorithme de contrôle des retransmissions dont l'intérêt est de prendre en compte le phénomène de capture

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Hercor, Mélanie. "Régulation des réponses immunes humorales par la voie de signalisation IL-6 / STAT3." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2015. https://dipot.ulb.ac.be/dspace/bitstream/2013/222305/4/TheseMH.pdf.

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Abstract:

L’aide fournie aux lymphocytes B par les lymphocytes T CD4+ est cruciale pour une réponse humorale de qualité. Les lymphocytes T helper folliculaires (Tfh) jouent un rôle majeur dans l’aide apportée aux lymphocytes B au sein des centres germinatifs et peu de choses sont connues sur la capacité d’aide des autres populations de cellules T CD4+. Le but de notre étude est d’évaluer la capacité d’aide aux lymphocytes B des lymphocytes T helper de type 2 (Th2), une population considérée, à l’origine, comme responsable de l’aide apportée aux lymphocytes B in vivo ainsi que d’analyser le rôle de l’axe IL6 / STAT3 dans la différenciation des lymphocytes Tfh et leur plasticité phénotypique. Nous montrons que les lymphocytes Th2 co-expriment des formes actives des facteurs de transcription STAT6 et STAT3 et que l’expression de STAT3 est requise pour la fonction d’aide aux lymphocytes B des lymphocytes Th2. Nous avons également pu montrer que la voie de signalisation IL-6 / STAT3 durant le développement des lymphocytes Tfh s’oppose à l’expression des gènes associés au programme de différenciation Th2. Option Biologie moléculaire du Doctorat en Sciences info:eu-repo/semantics/nonPublished

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Bernard, Florent. "La voie de signalisation activée par les acides aminés extracellulaires chez Saccharomyces cerevisiae." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2001. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211613.

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Coquet, Jean. "Étude exhaustive de voies de signalisation de grande taille par clustering des trajectoires et caractérisation par analyse sémantique." Thesis, Rennes 1, 2017. http://www.theses.fr/2017REN1S073/document.

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Abstract:

Les voies de signalisation décrivent les réponses d'une cellule à des stimuli externes. Elles sont primordiales dans les processus biologiques tels que la différentiation, la prolifération ou encore l'apoptose. La biologie des systèmes tentent d'étudier ces voies de façon exhaustive à partir de modèles statistiques ou dynamiques. Le nombre de solutions expliquant un phénomène biologique (par exemple la réaction d'une cellule à un stimulus) peut être très élevé dans le cas de grands modèles. Cette thèse propose, dans un premier temps, différentes stratégies de regroupement de ces solutions à partir de méthodes de clustering et d'analyse de concepts formels. Puis elle présente la caractérisation de ces regroupements à partir de web sémantique. Ces stratégies ont été appliquées au réseau de signalisation du TGF-beta, un stimulus extra-cellulaire jouant un rôle important dans le développement du cancer, ce qui a permis d'identifier cinq grands groupes de trajectoires participant chacun à des processus biologiques différents. Dans un second temps, cette thèse se confronte au problème de conversion des données hétérogènes provenant de différentes bases dans un formalisme unique afin de pouvoir généraliser l'étude précédente. Elle propose une stratégie permettant de regrouper les différents réseaux de signalisation provenant d'une base de données en un modèle unique et ainsi permettant de calculer toutes les trajectoires de signalisation d'un stimulus Signaling pathways describe the extern stimuli responses of a cell. They are indispensable in biological processes such as differentiation, proliferation or apoptosis. The Systems Biology tries to study exhaustively the signalling pathways using static or dynamic models. The number of solutions which explain a biological phenomenon (for example the stimulus reaction of cell) can be very high in large models. First, this thesis proposes some different strategies to group the solutions describing the stimulus signalling with clustering methods and Formal Concept Analysis. Then, it presents the cluster characterization with semantic web methods. Those strategies have been applied to the TGF-beta signaling network, an extracellular stimulus playing an important role in the cancer growing, which helped to identify 5 large groups of trajectories characterized by different biological processes. Next, this thesis confronts the problem of heterogeneous data translation from different bases to a unique formalism. The goal is to be able to generalize the previous study. It proposes a strategy to group signaling pathways of a database to an unique model, then to calculate every signaling trajectory of the stimulus

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Courilleau, Delphine. "Modulation de l'expression génique par le butyrate de sodium." Paris 11, 2000. http://www.theses.fr/2000PA11T027.

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Abstract:

Le butyrate de sodium, acide gras à quatre carbones, exerce à la fois une action antiproliférative et différenciatrice sur de nombreuses lignées cellulaires. Cette drogue agit par l'inhibition des histones désacétylases, aboutissant à des changements spécifiques de l'expression génique. Des travaux antérieurs au laboratoire ont montré que dans la lignée fibroblastique BP-A31, l’arrêt du cycle cellulaire en G1 induit par le butyrate est dépendant de la transcription. Dans ce contexte, nous avons cherché à identifier des cibles moléculaires du butyrate de sodium, impliquées dans ses effets antiprolifératifs. Par la technique de differential display, nous avons identifié l'ADNe B-indl (pour Butyrate induced 1) correspondant à un transcrit de 3 kb induit par le butyrate dans la lignée BP-A31. A l'aide de ce transcrit, en criblant une banque d'ADNe provenant de cerveau humain, nous avons obtenu l'homologue humain de B-indl qui code pour une nouvelle protéine de 370 acides aminés, nommée hB-indl. Nous avons observé que le butyrate active fortement le facteur transcriptionnel NF-kB, et que la surexpression de la protéine hB-indl augmente cette activation. Le facteur transcriptionnel NF-kB est également activé par les protéines de la famille Rho (RhoA, Racl et Cdc42). Nous avons exploré l'hypothèse selon laquelle B-indl interviendrait dans la voie de signalisation empruntée par ces GTPases. Nos résultats démontrent que hB-indl potentialise l'activité transcriptionnelle de NF-kB induite par la protéine Racl ainsi que l'activation de la kinase JNK (c-Jun N-terminal kinase) également induite par Racl. Nous concluons donc que la protéine hB-indl est un nouveau médiateur impliqué dans les voies de signalisation médiées par la protéine Racl. De plus, nous avons étudié l'effet du butyrate sur la progression cellulaire. D'une part, nous avons montré que dans la lignée BP-A31, le butyrate induit un arrêt du cycle cellulaire en phase Gl par une inhibition de la transcription du gène codant pour la cycline D1. D'autre part, nous avons observé que le butyrate de sodium inhibe la progression en phase G2 des cellules de cancer de sein MDA-MB-231. Cet arrêt en phase G2 est corrélé avec une augmentation du contenu cellulaire de la protéine P21Waf1 libre ou liée à la cycline A, avec une hypophosphorylation de la protéine de rétinoblastome, ainsi qu'avec une inhibition de l'expression des cyclines A et B1 et de la POLO-like kinase. Après l'élimination du butyrate, les cellules sont compétentes pour une nouvelle phase de synthèse d'ADN sans avoir au préalable accompli la mitose. Le butyrate de sodium est donc capable de perturber l'alternance de la réplication de l'ADN et de la mitose dans certains types cellulaires.

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Abadie, Guillaume. "Étude du trafic cytonucléaire de la β-arrestine 2 par une approche génétique". Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCB083.

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Triballeau-Hugounenq, Nicolas. "Découverte par criblage virtuel d'agonistes originaux des récepteurs sensibles aux acides α-aminés de la famille 3/C des RCPG". Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05S009.

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Poulin, Sébastien. "Modulation de l'expression du facteur angiogénique VEGF (vascular endothelial growth factor) par les cysteinyl-leucotriènes." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2010. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4007.

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Abstract:

Les cysteinyl-leucotriènes (cysLTs) ont des rôles majeurs dans la pathophysiologie de l'asthme et sont impliqués dans le remodelage des voies respiratoires, un processus caractérisé par plusieurs changements structuraux incluant entre autre [i.e. autres] la fibrogenèse et l'hyperplasie des cellules musculaires lisses. Dans cette étude, nous avons investigué le rôle potentiel des cysLTs dans la modulation du « vascular endothelial growth factor » (VEGF), un facteur de croissance connu pour être important dans une autre facette du remodelage, c'est-à-dire l'angiogenèse. Nous avons montré que le LTD[indice inférieur 4] induit l'expression du VEGF chez les monocytes humains et les cellules musculaires lisses bronchiques humaines avec une inhibition complète par un antagoniste spécifique du récepteur CysLT1. De plus, des cellules de reins embryonnaires humaines (HEK-293) transfectées d'une façon stable avec CysLT1 ont été utilisées pour étudier la régulation transcriptionnelle du promoteur du VEGF. La stimulation de ces cellules avec des cysLTs mène à l'activation du promoteur du VEGF d'une façon dépendante de la concentration et résistante à la Bordetella pertussis toxin (PTX). Aussi, il en résulte une augmentation de l'expression de l'ARNm et de la protéine du VEGF d'une façon dépendante du temps de stimulation. L'utilisation de mutants tronqués en 5' de la construction du promoteur du VEGF de type sauvage démontre que la région en amont de -90 Pb n'est pas requise pour sa régulation transcriptionnelle par les cysLTs. De plus, un prétraitement avec des inhibiteurs pharmacologiques des MAPKs suggère l'implication de JNK et ERK, mais pas de p38 dans l'activation du promoteur du VEGF par LTD[indice inférieur 4]. Également, l'inhibition partielle de l'activation du promoteur du VEGF via la surexpression des formes dominantes négatives des protéines JunD, FosB et Ras suggère un rôle actif pour le complexe AP-1. Cependant, puisqu'un mutant du promoteur avec des substitutions dans le site de liaison d'AP-1 maintient toujours sa transactivation par LTD[indice inférieur 4], le complexe AP-1 semble agir d'une façon indirecte. En fait, l'inhibition complète de l'activation du promoteur du VEGF et de l'augmentation subséquente de son ARNm par un prétraitement avec la mithramycine, un inhibiteur de la transcription Sp1-dépendante, suggère que AP-1 pourrait agir indirectement sur Sp1 pour la modulation du VEGF par les cysLTs. Par surcroît, des expériences utilisant un promoteur du VEGF (-123 +50 pb) avec tous ses sites Sp1 mutés (4) ont montré que ces régions étaient nécessaires à la transactivation du VEGF par LTD[indice inférieur 4]. Bref, nos résultats indiquent pour la première fois que les cysLTs peuvent activer transcriptionnellement la production du VEGF via le récepteur CysLT1, avec l'implication de JNK, ERK, AP-1 et Sp1. Ces résultats proposent que les cysLTs pourraient être importants dans le processus d'angiogenèse associé au remodelage des voies respiratoires et indiquent un possible bénéfice jusqu'à maintenant insoupçonné dans l'utilisation des antagonistes des récepteurs CysLT1 dans la prévention ou le traitement du remodelage dans l'asthme.

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Heitzler, Domitille. "Modélisation dynamique des mécanismes de signalisation cellulaire induits par l'hormone folliculo-stimulante et l'angiotensine." Phd thesis, Université François Rabelais - Tours, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00847767.

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Abstract:

La signalisation cellulaire induite par les r écepteurs à sept domaines transmembranaires (R7TM) contrôle les principales fonctions physiologiques humaines. Ces R7TMs sont cibles de m édicaments et initient de larges réseaux d'interactions. Nous avons modélisé dynamiquement les réseaux de signalisation du récepteur à l'hormone folliculo-stimulante (FSH) régulant la fonction de reproduction et du récepteur angiotensine, un R7TM modèle régulant la tension pour comprendre le fonctionnement de ces réseaux et prédire des données inaccessibles expérimentalement. Notre modélisation a utilisé des équations différentielles ordinaires, en assimilant une variable par espèce et un paramètre par constante cinétique. Les paramètres manquant ont été déterminés par optimisation paramétrique. Puis, nous avons d éveloppé un environnement afin de comparer plusieurs algorithmes d'optimisation et de créer une nouvelle méthode hybride plus performante et adaptée à la paramétrisation des réseaux de signalisation.

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Mazel, Claude. "Evaluation des performances par simulations application aux voies de signalisation des systèmes radio-téléphoniques /." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376161291.

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Fahem, Abdelaziz Guenounou Moncef Bellon Georges. "Elastokines et angiogenése : rôle de la MT1-MMP et signalisation intracellulaire mediée par Titre." S.n. : S.l, 2007. http://scdurca.univ-reims.fr/exl-doc/GED00000518.pdf.

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Sozzani-Vita, Patricia. "Modulation de l'hyperactivité oxydative des monocytes humains par l'interleukine-13 : voies de signalisation impliquées." Toulouse 3, 1996. http://www.theses.fr/1996TOU30049.

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Abstract:

L'interleukine-13 (il-13) est une cytokine produite par les lymphocytes t actives, recemment decouverte. Elle est consideree comme une cytokine anti-inflammatoire de par ses proprietes a inhiber la synthese des cytokines pro-inflammatoires dans les monocytes. Le but de notre travail de these a ete d'etudier l'effet de l'il-13 sur la production de radicaux libres oxygenes, une autre fonction importante des monocytes impliquee dans les processus inflammatoires ; dans ces travaux nous demontrons que l'il-13 module la production des radicaux libres oxygenes induite par un agoniste de la proteine kinase c (12-0-tetra decanoyl phorbol-13-acetate). A l'aide d'inhibiteurs metaboliques nous avons mis en evidence l'implication de differentes voies de signalisation (tyrosines kinases, phospholipase c, calcium et amp cyclique) dans la regulation de l'hyperactivite oxydative. L'etude de ces voies de signalisation nous a permis de conclure que l'il-13 induit (i) une phosphorylation sur residus tyrosine de plusieurs proteines, parmi lesquelles irs-1/4ps et phospholipase c gamma 1,(ii) une elevation rapide et transitoire des taux d'inositol tri-phosphate et de calcium intracellulaire et, (iii) une accumulation plus tardive d'amp cyclique dependante de la mobilisation des reserves de calcium intracytosoliques. Ces resultats nous ont permis de decrire pour la premiere fois, les evenements initiaux de signalisation de l'il-13 essentiels dans la modulation de la reponse oxydative des monocytes humains

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Guibert, Christelle. "Signalisation calcique dans les myocytes artériels pulmonaires : modulation par l'angiotensine II et l'ATP extracellulaire." Bordeaux 2, 1997. http://www.theses.fr/1997BOR28468.

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Dissertations / Theses on the topic 'Signalisation par les RCPG'

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