Academic literature on the topic 'Signaux d'adressage'

Chez les eucaryotes, la plupart des protéines sont transférées aux organelles par de nombreux signaux d'adressage. Les plastes, acquis par endosymbiose secondaire, possèdent des structures très complexes avec plus de deux membranes. Nous avons développé la méthode HECTAR qui prend en considération l'adressage complexe au plaste des hétérokontes par une approche hiérarchique avec plusieurs modules. Dans chaque module des méthodes de prédiction dédiées à la détection d'un signal d'adressage spécifique sont combinées par une machine à vecteur support. La localisation subcellulaire a été analysée pour des génomes des 37 organismes de quatre groupes d’eucaryotes. Les espèces multicellulaires chez les plantes et les champignons semblent avoir une plus grande quantité de protéines de chemin de sécrétion que les organismes unicellulaires dans les groupes correspondants. La proportion de protéines secrétées chez les métazoaires est la plus haute

Nous avons identifie un signal d'adressage basolateral dans une forme mutee (ps) du recepteur humain aux neurotrophines (hngfr). Ce signal est constitue d'une courte sequence cytoplasmique et est strictement dependant d'une tyrosine. Le hngfr est exprime sur la membrane apicale des cellules caco2 et mdck. La deletion de la majorite de son domaine cytoplasmique n'affecte pas la localisation apicale dans ces deux lignees cellulaires. Une forme soluble du hngfr est secretee dans le milieu basolateral par les cellules caco2 et dans le milieu apical par les cellules mdck. L'ancrage a la membrane de l'ectodomaine du hngfr par un groupement glycosylphosphatidylinositol conduit a une localisation apicale. La forme ps du hngfr est localisee au niveau de la membrane basolaterale pour les deux types cellulaires. La reduction du domaine cytoplasmique de la forme ps a 19 (ps321) ou a 13 (ps315) acides amines n'affecte pas la localisation basolaterale dans les cellules mdck. Dans les cellules caco2, la forme ps321 est exprimee au niveau des deux domaines membranaires alors que la forme ps315 est majoritairement basolaterale. Le remplacement de la seule tyrosine du domaine cytoplasmique de la forme ps315 par une alanine entraine une localisation apicale dans les deux types cellulaires. Alors que dans les cellules mdck le hngfr et ses formes mutees sont directement adressees du tgn a l'un ou l'autre des domaines de la membrane plasmique, les formes apicales du hngfr sont adressees de facon indirecte via la membrane basolaterale. Ces resultats suggerent que, dans les cellules mdck et caco2, le tri des proteines destinees a la membrane est effectue dans des compartiments distincts et/ou par une machinerie de tri intracellulaire differente mais que certains signaux peuvent toutefois conduire a une meme localisation au niveau de l'un des deux domaines de la membrane plasmique de ces deux types cellulaires

La membrane plasmique des cellules epitheliales est divisee en deux domaines distincts : le domaine apical et le domaine basolateral. L'adressage des proteines vers ces deux domaines est un mecanisme fondamental qui permet d'etablir et de maintenir la polarite cellulaire. Deux types de signaux participent a l'adressage apical des proteines : (1) les glycanes et (2) l'interaction du domaine transmembranaire avec des microdomaines enrichis en glycosphingolipides et cholesterol (les rafts). Nous avons caracterise les signaux d'adressage apical de la dipeptidyl peptidase iv (dpp iv/cd26), une proteine transmembranaire, dans deux types cellulaires : les cellules caco-2 et mdck. Nous avons montre qu'une forme soluble de la dpp iv est secretee principalement dans le milieu apical des cellules mdck et preferentiellement dans le milieu basolateral des cellules caco-2. L'inhibition d'une etape specifique de la glycosylation, la sialylation, entraine une modulation de la secretion apicale de la dpp iv dans les deux types cellulaires. Nos resultats montrent que la presence de sucres peripheriques (acide sialique) est utile pour l'efficacite de l'adressage apical de la dpp iv. Ces resultats suggeraient que le domaine transmembranaire de la dpp iv est implique dans son adressage vers la membrane apicale. Afin de verifier cette hypothese, nous avons transfecte les cellules caco-2 et mdck avec une construction codant pour une proteine constituee du domaine transmembranaire de la dpp iv couple a la gfp (une proteine autofluorescente). Nous avons montre que cette chimere est adressee vers la membrane apicale des cellules caco-2 et mdck, suggerant l'existence d'un signal d'adressage apical dans le domaine transmembranaire de la dpp iv. Par

Nous avons étudié le rôle in vivo des sous-unités du complexe cpSRP, qui est responsable de l'adressage intrachloroplastique des antennes photosynthétiques aux thylakoi͏̈des. Des analyses conduites in vitro sur la stoechiométrie du complexe étaient très controversées et la mise en évidence par la technique du double hybride de la dimérisation de cpSRP43 au sein du complexe de transit, tend à démontrer qu'in vivo, le complexe serait capable de prendre en charge deux molécules d'antennes photosynthétiques en association avec deux molécules de cpSRP54. L'analyse du double mutant ffc/chaos (cpSRP54-/cpSRP43-) a démontré que la voie cpSRP était la voie majeure d'import des antennes aux thylakoi͏̈des et que dans cette activité les sous-unités cpSRP43 et cpSRP54 avaient des fonctions indépendantes et additives. De plus, elles présentent des affinités différentes pour leur substrat. Ceci a été démontré in vivo dans le mutant chaos, qui a mis en évidence que seule la sous-unité cpSRP43 était requise pour l'accumulation des ELIPs (protéines apparentées aux antennes) au cours d'un stress photo-oxydant. Le mutant chaos a permis d'étudier le rôle protecteur des ELIPs au cours d'un stress. Il semble que la fonction des ELIPs soit destinée à la capture des chlorophylles libérées au cours des processus de dégradation photo-oxydative. L'analyse phénotypique du mutant cpftsy montre que cpFtsY (une autre sous-unité soluble du cpSRP) est nécessaire à l'insertion de toutes les antennes et à l'activité co-traductionnelle du cpSRP. Ln vivo sa fonction est beaucoup plus importante que celle des sous-unités cpSRP43 et cpSRP54. Des expériences de co-immunolocalisation et de Biacore suggèrent que cette sous-unité dissocie le complexe de transit à proximité des thylakoi͏̈des pour former un complexe intermédiaire dit de déchargement en association avec cpSRP43 uniquement. CpFtsY permettrait ainsi en interagissant avec le récepteur ALB3 et le substrat de transférer les antennes du complexe de transit aux thylakoi͏̈des<br>The purpose of this study was the in vivo analysis of cpSRP subunits, which are involved in the targeting of photosynthetic antennae (LHCPs) to thylakoid membranes. Ln vitro analysis of the transit complex stoechiometry was contested. We demonstrate in double hybrid system that cpSRP43 subunit was able to dimerize. Consequently, in vivo, the transit complex could perform the targeting of two molecules of the substrate in association with two molecules of cpSRP54. The analysis of the double mutant ffc/chaos (cpSRP54-/pSRP43-) demonstrated that the cpSRP pathway was the major import pathway destined to antennae targeting. Ln this post-translational function, both subunits are independent and additive. This has been confirmed in vivo in the chaos mutant, which demonstrated that only the cpSRP43 subunit was involved in the accumulation of ELIPs in response to photo-oxydative stress. ELIPs belong to the same family as the LHCPs. Chaos mutant has been used to determine ELIP function and permitted to show that these proteins were involved in the protection of chloroplast under stress conditions. Hence, ELIPs could be responsible of the capture of free chlorophyll liberated during photo-oxydative degradation of photosynthetic complexes. Phenotypical analysis of the cpftsy mutant shows that the cpFtsY subunit is more important in vivo than the two others. It is required by ail LHCP for insertion and acts in the cpSRP co-translational activity also. Co-immunolocalizations and BIAcore analysis demonstrated that cpFtsY was responsible of the transit complex dissociation in the vicinity of thylakoid membranes. CpFtsY forms a post-targeting complex in association with ALB3 and cpSRP43 during the LHCP transfer from the transit complex to thylakoids

Le système Tat (pour Twin Arginine Translocation) exporte des protéines repliées depuis le cytoplasme vers le périplasme des bactéries. L'adressage des protéines à exporter au système Tat repose sur une séquence signal spécifique amino terminale clivée après exportation. Chez le phytopathogène Dickeya dadantii, l'homologue de pectine lyase PnlH possède une séquence signal Tat qui assure son adressage au système Tat mais qui n'est pas clivée après exportation et ancre la protéine dans la membrane externe. Chez les protéobactéries, la majorité des protéines de membrane externe sont soit des lipoprotéines soit des protéines intégrales de membrane en tonneau β. L'adressage de ces protéines à la membrane externe repose sur des voies spécifiques du type de protéine : la voie Lol pour les lipoprotéines et la combinaison des chaperons périplasmiques SurA, Skp et DegP et du complexe de membrane externe Bam (β barrel assembly machinery) pour les protéines en tonneau β. Au cours de ce travail, l'étude de l'adressage de PnlH à la membrane externe a montré que SurA se liait à la séquence signal hydrophobe de PnlH pour la protéger de l'environnement hydrophile au cours de son transit dans le périplasme. La séquence signal de PnlH (41 acides aminés) porte l'intégralité de l'information nécessaire à son adressage à la membrane externe. La nature de l'information adressant les protéines au système Tat est bien connue et dans ce travail nous nous sommes efforcés d'identifier les informations requises pour les deux dernières étapes de l'adressage de PnlH à la membrane externe : la traversée du périplasme et l'insertion dans la membrane externe. La délétion d'une région conservée comprise entre les résidus 28 et 41 de la séquence signal de PnlH affecte l'adressage de cette dernière à la membrane externe. Des substitutions des acides aminés conservés de cette région ne semblent pas affecter l'adressage de PnlH, indiquant que l'information nécessaire à l'adressage de PnlH à la membrane externe après exportation ne réside pas dans la séquence en acides aminés de la séquence signal de PnlH. En revanche, nos données suggèrent que la présence d'une hélice α hydrophobe dans la séquence signal de PnlH est importante pour son adressage à la membrane externe. Cette observation est particulièrement intéressante puisqu'une telle structure est généralement considérée comme une caractéristique des protéines de membrane interne.