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Journal articles on the topic 'Synthèse de code'

Author: Grafiati

Published: 25 May 2024

Last updated: 31 July 2025

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1

Cerf-Hollender, Agnès. "Rapport de synthèse." Cahiers de la recherche sur les droits fondamentaux 22 (2024): 81–86. http://dx.doi.org/10.4000/12hpo.

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Abstract:

Le Code pénitentiaire est entré en vigueur le 1er mai 2022. Il présente essentiellement l’intérêt de rendre le droit pénitentiaire et les droits et libertés fondamentaux en prison plus lisibles et plus accessibles, regroupant des textes éparpillés auparavant dans le Code de procédure pénale, la loi pénitentiaire de 2009 et la loi sur le service public pénitentiaire de 1987. Il intègre aussi les apports récents en matière de travail en prison, issus de la loi pour la confiance dans l’institution judiciaire de 2021, et le recours en matière de conditions indignes de détention, issu de la loi du

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Pinto, José Emilio Nunes, and Matthieu de Boisséson. "Synthèse sur le Nouveau Droit de lArbitrage." Revista Brasileira de Arbitragem 8, Issue 32 (2011): 7–16. http://dx.doi.org/10.54648/rba2011050.

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Abstract:

ABSTRACT: The new decree that modifies the terms of the French Code of Civil Procedure regarding arbitration law was published in January 2011 and came into force in May 2011, representing significant changes to arbitration provisions. This article explains the new modifications in the main provisions that will affect the stages of arbitral proceedings, the drafting of the arbitration convention, the Arbitral Tribunal, and the execution of the award. The present article introduces as well the notion of the "juge d'appui", which in France is the President of the higher Court, and has the role o

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3

Boulanger, Marc. "Justice et absolutisme : la Grande Ordonnance d'août 1670." Revue d’histoire moderne et contemporaine 47, no. 1 (2000): 7–36. http://dx.doi.org/10.3406/rhmc.2000.1999.

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Abstract:

Nouveau Justinien, Louis XIV a chargé depuis 1665 une quarantaine de juristes confirmés de préparer un monumental ouvrage de synthèse, un code de procédure criminelle. Quelle place donner à l'être humain dans l'édifice pénal ? Comment réglementer la peine de mort ? quels privilèges judiciaires faut-il préserver ? Comment créer une administration irréprochable ? Déchirée entre tradition et modernité, la grande ordonnance criminelle d'août 1670 est le fruit de débats passionnés... Mais l'œuvre peut-elle suffire à répondre aux attentes d'une France saturée de violences, d'injustices et de crimina

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4

Boyé, Marc. "La géographie est-elle une science? Introduction aux problèmes de codification dans le traitement automatique de l’information géographique." Cahiers de géographie du Québec 14, no. 32 (2005): 157–69. http://dx.doi.org/10.7202/020907ar.

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Abstract:

Le présent article est à la fois une introduction épistémologique à la géographie et une approche sémantique du langage, fort complexe, qu'emploient les géographes. Son but est d'inviter à la réflexion sur les problèmes que pose la codification de l'information géographique pour un traitement automatique. Comme toutes les disciplines chargées de gérer et de présenter un « corps de savoir », la géographie est aujourd'hui confrontée à l'accumulation accélérée de la masse documentaire qu'elle utilise. Les éléments qui composent son corps de savoir viennent pour la plupart d'autres sciences et d'a

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5

Colas, Maxime, and Michel Deloizy. "Le Model Based Design pour l’apprentissage par conception guidée." J3eA 22 (2023): 1009. http://dx.doi.org/10.1051/j3ea/20231009.

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Abstract:

Cet article présente une démarche d’apprentissage par conception guidée reposant sur des techniques de prototypage rapide dans le domaine mécatronique. La pédagogie développée se veut intégrative et auto-contenue : elle ne nécessite pas de prérequis et apporte au fur et à mesure des besoins, l’ensemble des connaissances et compétences pluridisciplinaires nécessaires à la progression cohérente du projet de conception, tant d’un point de vue mécanique, programmation, qu’en termes de technique de contrôle-commande, le tout dans un volume horaire contraint. La ligne directrice employée vise à conf

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Gunputh, Rajendra Parsad. "Les limites d’adaptation-interprétation du Code civil français dans la synthèse du droit mixte mauricien - Coexistence et influence dans les Mascareignes." Revue internationale de droit comparé 60, no. 4 (2008): 885–925. http://dx.doi.org/10.3406/ridc.2008.19721.

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Popovici, Adrian. "Libres propos sur la culture juridique québécoise dans un monde qui rétrécit." McGill Law Journal 54, no. 2 (2009): 223–36. http://dx.doi.org/10.7202/038652ar.

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Abstract:

Résumé L’auteur appréhende la culture juridique québécoise par une brève présentation de ses caractéristiques, des grands thèmes qui la traversent, de ses institutions, de ses influences et de son évolution. Il retrace d’abord les origines hybrides du droit civil québécois, imprégné des traditions juridiques du droit civil et du common law, dont les règles ont longtemps été métissées par les jugements uniformisateurs du Comité judiciaire du Conseil privé et de la Cour suprême du Canada. L’élite intellectuelle du monde juridique québécois a toutefois contré ce phénomène en dénonçant cette unifo

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Boulanger, Marc. "Justice et absolutisme: la Grande Ordonnance criminelle d'août 1670." Revue d’histoire moderne & contemporaine 47-1, no. 1 (2000): 9–36. http://dx.doi.org/10.3917/rhmc.g2000.47n1.0009.

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Abstract:

Résumé Nouveau Justinien, Louis XIV a chargé depuis 1665 une quarantaine de juristes confirmés de préparer un monumental ouvrage de synthèse, un code de procédure criminelle. Quelle place donner à l'être humain dans l'édifice pénal ? Comment réglementer la peine de mort ? quels privilèges judiciaires faut-il préserver ? Comment créer une administration irréprochable ? Déchirée entre tradition et modernité, la grande ordonnance criminelle d'août 1670 est le fruit de débats passionnés... Mais l'oeuvre peut-elle suffire à répondre aux attentes d'une France saturée de violences, d'injustices et de

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Carayol, Cécile. "La Ligne rouge de Hans Zimmer. Matrice d’un « nouvel Hollywood » électro-minimaliste et contemplatif." Revue musicale OICRM 5, no. 2 (2018): 79–102. http://dx.doi.org/10.7202/1054148ar.

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Abstract:

À travers une étude comparative de plusieurs films au contexte narratif contemplatif comme La Ligne Rouge (Terrence Malick, 1998), partition-matrice qui a marqué une nette évolution dans l’esthétique zimmerienne, Hannibal (Ridley Scott, 2001), Da Vinci Code (de Ron Howard, 2006) « synthèse la plus raffinée des influences du minimalisme » (Berthomieu 2013, p. 698), jusqu’à des partitions que Hans Zimmer a composées pour Christopher Nolan comme Inception (2010) et Interstellar (2014), cet article montre de quelle manière Zimmer parvient pleinement à imposer un nouveau courant musical à Hollywood

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Hesketh, John E., and Stéphane Villette. "Intracellular trafficking of micronutrients: from gene regulation to nutrient requirements." Proceedings of the Nutrition Society 61, no. 4 (2002): 405–14. http://dx.doi.org/10.1079/pns2002176.

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Abstract:

RésuméLa distribution intracellulaire des micronutriments ainsi que leur absorption sont importantes pour les fonctions cellulaires. Dans certains cas la distribution des micronutriments ou des protéines associées est déterminée par des mécanismes liés à l'expression des gènes. La région 3' non traduite (3'UTR) de l'ARNm de la métallothioneine-1 détermine la localisation de ce message et, par conséquent, la localisation intracellulaire de la protéine qu'il code. En utilisant des cellules transfectées nous avons montré que la métallothioneine-1 est transportée vers le noyau ou elle exerce un rô

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Hadj Saleh, Abderrahmane. "Linguistique Et Phonétique Arabes** (1)." AL-Lisaniyyat 8, no. 1 (2003): 11–34. https://doi.org/10.61850/allj.v8i1.410.

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Abstract:

La théorie néo-khalilienne a pour point de départ la découverte, chez les plus anciens grammairiens arabes (VIIIe s.) d’une conception très originale que l’on ne retrouve chez les grammairiens arabes de basse époque que sous une forme tout à fait dénaturée (sauf exceptions). Ces anciens grammairiens et notamment al-Khal¢l Ibn Ahmed (VIIIe siècle) ont bien relevé la fonction essentielle du langage à savoir la communication mais ils se sont gardés d’en faire le principe explicatif exclusif des phénomènes linguistiques et ont donc soigneusement dis-tingué ce qui relève uniquement du communication

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Fekih-Mrissa, N., A. Sayeh, C. B. Cheikh, A. Oumaya, and S. Galleli. "Contribution de la mutation C677T dans la persistance des signes négatifs dans la schizophrénie en Tunisie." European Psychiatry 28, S2 (2013): 28. http://dx.doi.org/10.1016/j.eurpsy.2013.09.069.

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Abstract:

IntroductionLe trouble schizophrénique se subdivise, en signes positifs et négatifs. Les symptômes négatifs (S−) sont hétérogènes, reflétant à la fois les symptômes intrinsèques à la schizophrénie, des symptômes résultant d’une dépression concomitante ou distraction en raison des symptômes positifs. Récemment, certains facteurs de risque génétiques impliqués dans la persistance des (S−) sont étudiés, notamment la mutation C677T du gène MTHFR. Patients et méthodesNotre étude a porté sur 60 patients schizophrènes recrutés au service de psychiatrie à l’hôpital militaire principal d’instruction de

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Diesse, François. "La situation juridique de l’enfant à naître en droit français : entre pile et face." Question d’actualité en droit de la famille comparé 30, no. 4 (2014): 607–61. http://dx.doi.org/10.7202/1027762ar.

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Abstract:

Traditionnellement enfermé depuis le droit romain dans une fiction juridique qui fait de lui un être (humain!) à la fois juridiquement inexistant, faute de personnalité juridique, et paradoxalement apte à acquérir des droits, le sort de l’enfant conçu fait l’objet, en doctrine comme en jurisprudence, d’un chassé-croisé perpétuel entre catégories juridiques différentes et opposées. Face aux apories juridiques qu’engendre une telle situation et au traitement pour le moins « dégradant et inhumain » infligé à cet être au commencement de sa vie humaine, le présent article propose modestement, après

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Gauthier, Geneviève, Simonne Couture, and Christina St-Onge. "Jugement évaluatif : confrontation d’un modèle conceptuel à des données empiriques." Pédagogie Médicale 19, no. 1 (2018): 15–25. http://dx.doi.org/10.1051/pmed/2019002.

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Abstract:

Contexte : Le recours au jugement des évaluateurs est de plus en plus présent en contexte d’utilisation d’une approche de formation par compétences ; toutefois sa subjectivité a souvent été critiquée. Plus récemment, les perspectives variées des évaluateurs ont commencé à être traitées comme source d’information importante et les recherches sur le jugement évaluatif (rater cognition) se sont multipliées. Lors d’une synthèse d’études empiriques sur le sujet, Gauthier et al. ont proposé un modèle conceptuel englobant une série de résultats concourants. Objectif : Dans le cadre de cette étude à

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GEORGOUDI, Stella. "Vêtements et insignes des agents cultuels dans les cités grecques : une esquisse." Archimède. Archéologie et histoire ancienne Archimède n° 9 (December 2022): 79–98. http://dx.doi.org/10.47245/archimede.0009.ds1.14.

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Abstract:

Résumé L’article propose quelques réflexions sur l’habillage et les insignes du personnel cultuel dans les cités grecques, en mettant surtout l’accent sur les règles vestimentaires concernant les prêtres et les prêtresses. Il ne vise pas à une synthèse “encyclopédique” de ce sujet, mais à l’examen de certains thèmes qui, par le biais des habits, des attributs ou, plus généralement, de la parure des agents de culte, permettent de s’interroger principalement sur deux aspects : les relations qui se créent, voire la connivence qui s’établit parfois entre la puissance divine et ses serviteurs ; et,

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GEORGOUDI, Stella. "Vêtements et insignes des agents cultuels dans les cités grecques : une esquisse." Archimède. Archéologie et histoire ancienne Archimède n° 9 (December 2022): 79–98. http://dx.doi.org/10.47245/archimede.0009.ds1.08.

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Abstract:

Résumé L’article propose quelques réflexions sur l’habillage et les insignes du personnel cultuel dans les cités grecques, en mettant surtout l’accent sur les règles vestimentaires concernant les prêtres et les prêtresses. Il ne vise pas à une synthèse “encyclopédique” de ce sujet, mais à l’examen de certains thèmes qui, par le biais des habits, des attributs ou, plus généralement, de la parure des agents de culte, permettent de s’interroger principalement sur deux aspects : les relations qui se créent, voire la connivence qui s’établit parfois entre la puissance divine et ses serviteurs ; et,

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Thomassey, Jean-Paul. "La situation des ressources naturelles du Tchad." BOIS & FORETS DES TROPIQUES 228 (June 1, 1991): 49–62. https://doi.org/10.19182/bft1991.228.a19706.

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Abstract:

Les ressources naturelles du Tchad, pays enclavé au cœur de l'Afrique, ont été sévèrement affectées, au cours des deux dernières décennies, par deux phénomènes concomitants : une sécheresse prolongée, qui a débuté au début des années 1970, et l'état de guerre imposé par l'étranger. Ces deux phénomènes ont provoqué des migrations importantes de populations du Nord vers le Sud, mettant en péril les fragiles équilibres socio-écologiques de vastes régions. L'amélioration de la pluviométrie depuis 1987 et la paix retrouvée permettent cependant d 'espérer une reconstitution progressive de ces ressou

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Loke, Paxton, and Tiow-Suan Sim. "Molecular cloning, heterologous expression, and functional characterisation of a malate synthase gene fromStreptomyces coelicolorA3(2)." Canadian Journal of Microbiology 46, no. 8 (2000): 764–69. http://dx.doi.org/10.1139/w00-044.

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Abstract:

With the rapid generation of genetic information from the Streptomyces coelicolor genome project, deciphering the relevant gene products is critical for understanding the genetics of this model streptomycete. A putative malate synthase gene (aceB) from S. coelicolor A3(2) was identified by homology-based analysis, cloned by polymerase chain reaction, and fully sequenced on both strands. The putative malate synthase from S. coelicolor has an amino acid identity of 77% with the malate synthase of S. clavuligerus, and possesses an open reading frame which codes for a protein of 540 amino acids. I

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Prouvez, Valentine. "La mémoire « normative » : synthèse et réécriture du sens de l’expérience." Le Coq-héron N° 246, no. 3 (2021): 109–14. http://dx.doi.org/10.3917/cohe.246.0109.

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Maillé, Chantal. "La citoyenneté politique des femmes." Canadian Journal of Political Science 37, no. 3 (2004): 765–68. http://dx.doi.org/10.1017/s0008423904380108.

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Abstract:

La citoyenneté politique des femmes, Bérengère Marques-Pereira, Paris : Armand Colin, 2003, 215 pages.La littérature sur la citoyenneté politique des femmes s'enrichit d'une synthèse originale avec la publication de cet ouvrage. S'inspirant du droit, de la philosophie et des sciences politiques, l'étude se veut également comparative, et présente un regard croisé sur les parcours vers la citoyenneté des femmes en France, en Belgique et en Argentine. L'objectif que se donne l'auteure avec cet ouvrage est d'offrir, autour de la problématique de la citoyenneté, un outil de travail qui brosse un pa

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Amstutz, Ursula, Gisela Andrey-Zürcher, Dominic Suciu, Rolf Jaggi, Johannes Häberle, and Carlo R. Largiadèr. "Sequence Capture and Next-Generation Resequencing of Multiple Tagged Nucleic Acid Samples for Mutation Screening of Urea Cycle Disorders." Clinical Chemistry 57, no. 1 (2011): 102–11. http://dx.doi.org/10.1373/clinchem.2010.150706.

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Abstract:

BACKGROUND Molecular genetic testing is commonly used to confirm clinical diagnoses of inherited urea cycle disorders (UCDs); however, conventional mutation screenings encompassing only the coding regions of genes may not detect disease-causing mutations occurring in regulatory elements and introns. Microarray-based target enrichment and next-generation sequencing now allow more-comprehensive genetic screening. We applied this approach to UCDs and combined it with the use of DNA bar codes for more cost-effective, parallel analyses of multiple samples. METHODS We used sectored 2240-feature medi

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Baudouin, Patrick. "De l’Ukraine au Moyen-Orient : Un sursaut de la justice pénale internationale ?" Confluences Méditerranée N° 126, no. 3 (2023): 155–61. http://dx.doi.org/10.3917/come.126.0156.

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Abstract:

Patrick Baudouin propose une synthèse des principaux points discutés par les intervenants du colloque organisé par l’iReMMO au Sénat en février 2023, en rappelant les différentes formes de justice pénale internationale comme la CPI, les tribunaux ad hoc et les procédures relevant de la compétence universelle. Il insiste tout particulièrement sur les contradictions de la France qui se refuse à faire sauter les « verrous » de la loi du 9 août 2010 qui limitent considérablement les possibilités, pour les tribunaux français, de poursuivre les auteurs de crimes de guerre, de crimes contre l’humanit

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Zemkollari, Marilica, Markus Blaukopf, Reingard Grabherr та Erika Staudacher. "Expression and Characterisation of the First Snail-Derived UDP-Gal: Glycoprotein-N-acetylgalactosamine β-1,3-Galactosyltransferase (T-Synthase) from Biomphalaria glabrata". Molecules 28, № 2 (2023): 552. http://dx.doi.org/10.3390/molecules28020552.

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Abstract:

UDP-Gal: glycoprotein-N-acetylgalactosamine β-1,3-galactosyltransferase (T-synthase, EC 2.4.1.122) catalyses the transfer of the monosaccharide galactose from UDP-Gal to GalNAc-Ser/Thr, synthesizing the core 1 mucin type O-glycan. Such glycans play important biological roles in a number of recognition processes. The crucial role of these glycans is acknowledged for mammals, but a lot remains unknown regarding invertebrate and especially mollusc O-glycosylation. Although core O-glycans have been found in snails, no core 1 β-1,3-galactosyltransferase has been described so far. Here, the sequence

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Lippens-de Cerf, Marie-Noëlle. "La contention mécanique dans les hôpitaux généraux : prévention de fautes parfois mortelles et protection des droits fondamentaux du patient." Consilio manuque 50 e année, no. 3 (2023): 109–32. http://dx.doi.org/10.3917/coe.503.0109.

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Abstract:

La présente contribution établit une synthèse des éléments auxquels l’hôpital et le personnel soignant doivent être attentifs dans la mise en œuvre d’une contention, ensuite d’un examen du cadre légal, réglementaire et jurisprudentiel belge applicable à la contention en tant que moyen d’immobilisation des patients dans les hôpitaux généraux. L’objectif poursuivi est d’informer tant les prestataires de soins de santé que les praticiens du droit sur cette technique de contrainte et de les sensibiliser afin d’assurer un équilibre entre le devoir de sécurité et de surveillance du personnel soignan

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Arrazubi, V., J. Suárez, D. Guerrero, et al. "Prognostic significance of thymidylate synthase polymorphisms in rectal cancer patients treated with neoadjuvant chemoradiotherapy." Colorectal Disease 15, no. 4 (2013): 428–35. http://dx.doi.org/10.1111/codi.12009.

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MOULIN, Nicolas, and Roger ROY. "Synthèse des connaissances des Mantodea de Guyane." Naturae 2020, no. 2 (2020): 31–53. https://doi.org/10.5852/naturae2020a2.

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Abstract:

Cet article fait le point sur les connaissances des Mantes en Guyane. Il compile à la fois des données plus ou moins anciennes de la collection générale du bâtiment d'entomologie au Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN, Paris), ainsi que des données plus récentes provenant de la collection privée du premier auteur, des échantillonnages de la Société Entomologique Antilles-Guyane (SEAG) et des collectes provenant de la mission scientifique « La Planète Revisitée » dans le massif du Mitaraka, en 2015. L'ensemble des données (4424 spécimens) ont été saisies sous CardObs (INPN – Inventaire n

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Bangera, M. Gita, and Linda S. Thomashow. "Identification and Characterization of a Gene Cluster for Synthesis of the Polyketide Antibiotic 2,4-Diacetylphloroglucinol from Pseudomonas fluorescens Q2-87." Journal of Bacteriology 181, no. 10 (1999): 3155–63. http://dx.doi.org/10.1128/jb.181.10.3155-3163.1999.

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Abstract:

The polyketide metabolite 2,4-diacetylphloroglucinol (2,4-DAPG) is produced by many strains of fluorescent Pseudomonas spp. with biocontrol activity against soilborne fungal plant pathogens. Genes required for 2,4-DAPG synthesis by P. fluorescensQ2-87 are encoded by a 6.5-kb fragment of genomic DNA that can transfer production of 2,4-DAPG to 2,4-DAPG-nonproducing recipientPseudomonas strains. In this study the nucleotide sequence was determined for the 6.5-kb fragment and flanking regions of genomic DNA from strain Q2-87. Six open reading frames were identified, four of which (phlACBD) compris

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Cazzonelli, Christopher Ian, Antonino Salvatore Cavallaro, and José Ramón Botella. "Cloning and characterisation of ripening-induced ethylene biosynthetic genes from non-climacteric pineapple (Ananas comosus) fruits." Functional Plant Biology 25, no. 5 (1998): 513. http://dx.doi.org/10.1071/pp98013.

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Abstract:

To gain a better understanding of non-climacteric fruit ripening, pineapple was used as a model system to clone and characterise two ripening-inducible cDNAs coding for two enzymes of the ethylene biosynthetic pathway, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) synthase (acacc-1) and 1-aminocyclo-propane- 1-carboxylate oxidase (acaco-1) respectively. Due to the extreme acidity and high polyphenolic content of pineapple fruits, a method was optimised for the extraction of high quality RNA from fruit tissue. acacc-1 is a 1080 bp ACC synthase cDNA fragment encoding 360 amino acids including 10 of th

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Buckner, Brent, Phillip San Miguel, Diane Janick-Buckner, and Jeffrey L. Bennetzen. "The yl Gene of Maize Codes for Phytoene Synthase." Genetics 143, no. 1 (1996): 479–88. http://dx.doi.org/10.1093/genetics/143.1.479.

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Abstract:

Abstract The cloned yl locus of maize was sequenced and found to encode phytoene synthase. Different “wild-type” alleles of the locus were found to differ by the insertion of transposable elements in their promoter and polyA addition regions, and by the length of a CCA tandem repeat series, without any obvious effect on function of the gene. A dominant Yl (“wild-type”) allele was observed to be expressed at highest levels in the seedling but also in the embryo and endosperm. The Mu3 transposable element insertion responsible for a pastel allele of yl, which gives lowered levels of carotenoids

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Bacha, N., F. Mathieu, T. Liboz, and A. Lebrihi. "Polyketide synthase gene aolc35-12 controls the differential expression of ochratoxin A gene aoks1 in Aspergillus westerdijkiae." World Mycotoxin Journal 5, no. 2 (2012): 177–86. http://dx.doi.org/10.3920/wmj2011.1374.

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Abstract:

Ochratoxine A (OTA), a potential human carcinogen is produced by several species of Aspergillus and Penicillium, including Aspergillus westerdijkiae. In this study a putative polyketide synthase gene aolc35-12 has been partially cloned from A. westerdijkiae. The predicted amino acid sequence of the 3.22 kb clone was found to have a high degree of similarity to other previously identified polyketide synthase genes from various OTA-producing fungi including Aspergillus ochraceus, Aspergillus niger, Aspergillus carbonarius and Penicillium nordicum. The aolc35-12 gene was disrupted and inactivated

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Leuthner, Birgitta, та Johann Heider. "Anaerobic Toluene Catabolism of Thauera aromatica: the bbs Operon Codes for Enzymes of β Oxidation of the Intermediate Benzylsuccinate". Journal of Bacteriology 182, № 2 (2000): 272–77. http://dx.doi.org/10.1128/jb.182.2.272-277.2000.

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Abstract:

ABSTRACT The pathway of anaerobic toluene oxidation to benzoyl coenzyme A (benzoyl-CoA) consists of an initial reaction catalyzed by benzylsuccinate synthase, a glycyl radical enzyme adding the methyl group of toluene to the double bond of a fumarate cosubstrate, and a subsequent β-oxidation pathway of benzylsuccinate. Benzylsuccinate synthase has been studied in some detail, whereas the enzymes participating in β oxidation of benzylsuccinate are unknown. We have investigated these enzymes by analyzing substrate-induced proteins in toluene-grown cells. Toluene-induced proteins were identified

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Jauffret, Jean-Charles. "Gilbert Meynier, L’Algérie et la France, deux siècles d’histoire croisée. Essai de synthèse historique Paris : l’Harmattan (collection Bibliothèque de l’iReMMO, n° 28), 103 p., 12 euros." Confluences Méditerranée N° 103, no. 4 (2017): I. http://dx.doi.org/10.3917/come.103.0174a.

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Döring, Volker, and Philippe Marlière. "Reassigning Cysteine in the Genetic Code of Escherichia coli." Genetics 150, no. 2 (1998): 543–51. http://dx.doi.org/10.1093/genetics/150.2.543.

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Abstract:

Abstract We investigated directed deviations from the universal genetic code. Mutant tRNAs that incorporate cysteine at positions corresponding to the isoleucine AUU, AUC, and AUA and methionine AUG codons were introduced in Escherichia coli K12. Missense mutations at the cysteine catalytic site of thymidylate synthase were systematically crossed with synthetic suppressor tRNACys genes coexpressed from compatible plasmids. Strains harboring complementary codon/anticodon associations could be stably propagated as thymidine prototrophs. A plasmid-encoded tRNACys reading the codon AUA persisted f

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Song, Lei, and Xue Hong Zhang. "Accurate Localization of the Mobile Genomic Islands in Pseudomonas putida." Advanced Materials Research 518-523 (May 2012): 3–7. http://dx.doi.org/10.4028/www.scientific.net/amr.518-523.3.

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Abstract:

Pseudomonas putida is a safety gammaproteobacterium that plays an important role in bioremediation. Twenty nine mobile genomic islands were accurately localized in four strains of P. putida, six in P. putida F1, six in P. putida GB-1, nine in P. putida KT2440, and eight in P. putida W619, respectively. The integration sites include the tRNA gene, such as tRNAMet gene, tRNASer gene, tRNALeu gene, tRNAGly gene, tRNAThr gene, tRNACys gene, tRNAPro gene, and some structural genes, such as arsenate reductase gene, DNA mismatch repair protein MutS gene, thymidylate synthase gene, and 6-pyruvoyl tetr

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Fish, Jason E., Charles C. Matouk, Alisa Rachlis, et al. "The Expression of Endothelial Nitric-oxide Synthase Is Controlled by a Cell-specific Histone Code." Journal of Biological Chemistry 280, no. 26 (2005): 24824–38. http://dx.doi.org/10.1074/jbc.m502115200.

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Watanabe, Akira, Isao Fujii, Ushio Sankawa, María E. Mayorga, William E. Timberlake, and Yutaka Ebizuka. "Re-identification of Aspergillus nidulans wA gene to code for a polyketide synthase of naphthopyrone." Tetrahedron Letters 40, no. 1 (1999): 91–94. http://dx.doi.org/10.1016/s0040-4039(98)80027-0.

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Burger, G. "The enigmatic mitochondrial ORF ymf39 codes for ATP synthase chain b." Nucleic Acids Research 31, no. 9 (2003): 2353–60. http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkg326.

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Watanabe, Akira, Yuya Ono, Isao Fujii, et al. "Product identification of polyketide synthase coded by Aspergillus nidulans wA gene." Tetrahedron Letters 39, no. 42 (1998): 7733–36. http://dx.doi.org/10.1016/s0040-4039(98)01685-2.

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Lorio, Julio C., Demosthenis Chronis, and Hari B. Krishnan. "y4xP, an Open Reading Frame Located in a Type III Protein Secretion System Locus of Sinorhizobium fredii USDA257 and USDA191, Encodes Cysteine Synthase." Molecular Plant-Microbe Interactions® 19, no. 6 (2006): 635–43. http://dx.doi.org/10.1094/mpmi-19-0635.

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Abstract:

Sinorhizobium fredii USDA257, a soybean symbiont, exports several nodulation outer proteins (Nops) into the rhizo-sphere. These proteins, which are exported by a type III secretion system (TTSS), have a pivotal role in host-specific nodulation. The entire TTSS of S. fredii lies within a 31-kb region that includes conserved genes that code for secretion machinery proteins, Nops, and several open reading frames (ORF) of unknown function. Identifying the functions of these ORF is essential to understand fully the role of TTSS in nodulation. Here, we report the characterization of y4xP, an ORF of

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Gibreel, Amera, and Ola Sköld. "Sulfonamide Resistance in Clinical Isolates ofCampylobacter jejuni: Mutational Changes in the Chromosomal Dihydropteroate Synthase." Antimicrobial Agents and Chemotherapy 43, no. 9 (1999): 2156–60. http://dx.doi.org/10.1128/aac.43.9.2156.

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Abstract:

ABSTRACT The characterization of the genetic basis of sulfonamide resistance in Campylobacter jejuni was attempted. The resistance determinant from a sulfonamide-resistant strain of C. jejuni was cloned and was found to show 42% identity with thefolP gene (which codes for dihydropteroate synthase, the target of sulfonamides) of the related bacterium Helicobacter pylori. The sequences of the areas surrounding thefolP gene in C. jejuni showed similarity to those of the areas surrounding the corresponding gene in H. pylori. The folP gene of C. jejuni, which mediates the resistance, was observed t

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Safra, Modi, Ronit Nir, Daneyal Farouq, Ilya Vainberg Slutskin, and Schraga Schwartz. "TRUB1 is the predominant pseudouridine synthase acting on mammalian mRNA via a predictable and conserved code." Genome Research 27, no. 3 (2017): 393–406. http://dx.doi.org/10.1101/gr.207613.116.

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Thompson, Gregory A., William R. Hiatt, Daniel Facciotti, David M. Stalker, and Luca Comai. "Expression in Plants of a Bacterial Gene Coding for Glyphosate Resistance." Weed Science 35, S1 (1987): 19–23. http://dx.doi.org/10.1017/s0043174500060999.

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Abstract:

The target site of glyphosate [N-(phosphonomethyl)glycine] inhibition in plants and bacteria is 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate (EPSP) synthase. Our strategy for developing glyphosate-resistant crops has been to genetically engineer plants with a gene that codes for EPSP synthase with low sensitivity in glyphosate. We cloned such a gene from thearoAlocus of a glyphosate-resistant mutagenized strain ofSalmonella typhimurium.The enzyme encoded by this gene has a single amino acid change resulting in lower affinity for glyphosate and higher affinity for substrates than either plant or wild-typ

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McGaughey, Kathleen M., Linda J. Wheeler, John T. Moore, Gladys F. Maley, Frank Maley, and Christopher K. Mathews. "Protein-Protein Interactions Involving T4 Phage-coded Deoxycytidylate Deaminase and Thymidylate Synthase." Journal of Biological Chemistry 271, no. 38 (1996): 23037–42. http://dx.doi.org/10.1074/jbc.271.38.23037.

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Naser, Sabri M., Marc Vancanneyt, Bart Hoste, Cindy Snauwaert, and Jean Swings. "Lactobacillus cypricasei Lawson et al. 2001 is a later heterotypic synonym of Lactobacillus acidipiscis Tanasupawat et al. 2000." International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56, no. 7 (2006): 1681–83. http://dx.doi.org/10.1099/ijs.0.64229-0.

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Abstract:

The applicability of a multilocus sequence analysis (MLSA)-based identification system for lactobacilli was evaluated. Two housekeeping genes that code for the phenylalanyl-tRNA synthase α-subunit (pheS) and RNA polymerase α-subunit (rpoA) were sequenced and analysed for members of the Lactobacillus salivarius species group. The type strains of Lactobacillus acidipiscis and Lactobacillus cypricasei were investigated further using a third gene that encodes the α-subunit of ATP synthase (atpA). The MLSA data revealed close relatedness between L. acidipiscis and L. cypricasei, with 99.8–100 % phe

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Yu, Mingjing, Chao Dou, Yijun Gu, and Wei Cheng. "Crystallization and structure analysis of the core motif of the Pks13 acyltransferase domain from Mycobacterium tuberculosis." PeerJ 6 (May 7, 2018): e4728. http://dx.doi.org/10.7717/peerj.4728.

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Abstract:

Type I polyketide synthase 13 (Pks13) is involved in the final step of the biosynthesis of mycolic acid in Mycobacterium tuberculosis. Recent articles have reported that Pks13 is an essential enzyme in the mycolic acid biosynthesis pathway, and it has been deeply studied as a drug target in Tuberculosis. We report a high-resolution structure of the acyltransferase (AT) domain of Pks13 at 2.59 Å resolution. Structural comparison with the full-length AT domain (PDB code, 3TZW, and 3TZZ) reveals a different orientation of the C-terminal helix and rearrangement of some conserved residues.

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Safra, Modi, Ronit Nir, Daneyal Farouq, Ilya Vainberg Slutskin, and Schraga Schwartz. "Corrigendum: TRUB1 is the predominant pseudouridine synthase acting on mammalian mRNA via a predictable and conserved code." Genome Research 27, no. 8 (2017): 1460. http://dx.doi.org/10.1101/gr.225870.117.

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Gallegos-Garcia, Monica, Christopher P. L. Berry, Pablo Marchant, and Vicky Kalogera. "Binary Black Hole Formation with Detailed Modeling: Stable Mass Transfer Leads to Lower Merger Rates." Astrophysical Journal 922, no. 2 (2021): 110. http://dx.doi.org/10.3847/1538-4357/ac2610.

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Abstract:

Abstract Rapid binary population synthesis codes are often used to investigate the evolution of compact-object binaries. They typically rely on analytical fits of single-star evolutionary tracks and parameterized models for interactive phases of evolution (e.g., mass transfer on a thermal timescale, determination of dynamical instability, and common envelope) that are crucial to predict the fate of binaries. These processes can be more carefully implemented in stellar structure and evolution codes such as MESA. To assess the impact of such improvements, we compare binary black hole mergers as

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Franco, Leticia Veloso Ribeiro, Chen Hsien Su, and Alexander Tzagoloff. "Modular assembly of yeast mitochondrial ATP synthase and cytochrome oxidase." Biological Chemistry 401, no. 6-7 (2020): 835–53. http://dx.doi.org/10.1515/hsz-2020-0112.

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Abstract:

AbstractThe respiratory pathway of mitochondria is composed of four electron transfer complexes and the ATP synthase. In this article, we review evidence from studies of Saccharomyces cerevisiae that both ATP synthase and cytochrome oxidase (COX) are assembled from independent modules that correspond to structurally and functionally identifiable components of each complex. Biogenesis of the respiratory chain requires a coordinate and balanced expression of gene products that become partner subunits of the same complex, but are encoded in the two physically separated genomes. Current evidence i

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Saborido Basconcillo, Libia, Rahat Zaheer, Turlough M. Finan, and Brian E. McCarry. "Cyclopropane fatty acyl synthase in Sinorhizobium meliloti." Microbiology 155, no. 2 (2009): 373–85. http://dx.doi.org/10.1099/mic.0.022608-0.

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Abstract:

Cyclopropane fatty acyl synthases (CFA synthases) are enzymes that catalyse the addition of a methylene group across cis double bonds of monounsaturated fatty acyl chains in lipids. We have investigated the function of two putative genes, cfa1 and cfa2, proposed to code for CFA synthases in Sinorhizobium meliloti. Total fatty acid composition and fatty acid distributions within lipid classes for wild-type and cfa1 and cfa2 mutant strains grown under Pi starvation and in acidic culture conditions were obtained by GC/MS and by infusion ESI/MS/MS, respectively. For wild-type cells and the cfa1 mu

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Breinig, Sabine, Emile Schiltz, and Georg Fuchs. "Genes Involved in Anaerobic Metabolism of Phenol in the Bacterium Thauera aromatica." Journal of Bacteriology 182, no. 20 (2000): 5849–63. http://dx.doi.org/10.1128/jb.182.20.5849-5863.2000.

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Abstract:

ABSTRACT Genes involved in the anaerobic metabolism of phenol in the denitrifying bacterium Thauera aromatica have been studied. The first two committed steps in this metabolism appear to be phosphorylation of phenol to phenylphosphate by an unknown phosphoryl donor (“phenylphosphate synthase”) and subsequent carboxylation of phenylphosphate to 4-hydroxybenzoate under release of phosphate (“phenylphosphate carboxylase”). Both enzyme activities are strictly phenol induced. Two-dimensional gel electrophoresis allowed identification of several phenol-induced proteins. Based on N-terminal and inte

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