Dissertations / Theses on the topic 'Taxonomia (Biologia)'

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-07-14T14:49:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertacao Ludimila (completa).pdf: 4542374 bytes, checksum: ae089eb3590a6dac6965ff1e1218a752 (MD5)
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CAPEs
Corvoheteromeyenia Ezcurra de Drago, 1979 é um gênero endêmico da Região Neotropical, criado para albergar: C. australis (Bonetto & Ezcurra de Drago, 1966) e C. heterosclera (Ezcurra de Drago, 1974). No entanto, devido à confusão na descrição original de C. australis e C. heterosclera, não era clara a distinção entre as espécies. Adicionalmente, o material tipo dessas espécies não foi depositado nas coleções indicadas nos trabalhos originais. Sendo assim, no intuito de elucidar o status específico destes materiais, o presente trabalho apresenta a revisão do gênero e a designação dos neótipos. Um total de 41 espécimes foram analisados e identificados como sendo Corvoheteromeyenia. Baseado na bibliografia e no material examinado foi realizada a redescrição das espécies C. australis e C. heterosclera. A microsclera acantóxea foi apontada como o caráter distintivo entre ambas as espécies, presente apenas em C. heterosclera. Além destas duas espécies, foi descrita C. sanidastosclera Pinheiro, Silva & Calheira, no prelo, que difere das demais por apresentar apenas gemosclera sanidáster. Este trabalho também testou se a fisiologia da eclosão da gêmula poderia influenciar na distribuição das esponjas de águas continentais. Até o presente, apenas a morfologia gemular estava sendo considerados para entender o padrão de distribuição das espécies. Neste trabalho, escolhemos duas espécies (Heteromeyenia cristalina Batista, Volkmer-Ribeiro & Melão, 2007 e Radiospongilla inesi Nicacio & Pinheiro, 2011) para testar se a distribuição da espécie está associada à capacidade de eclosão da gêmula em diferentes tipos de ambientes. Cinco tratamentos foram realizados (T): T1 (água do local da coleta das esponjas); T2 (água do Rio Pirangi); T3 (água da Lagoa Araraquara); T4 (água mineral) e T5 (T1 + gêmulas dessecadas). Para cada tratamento, foram utilizadas 30 gêmulas com três réplicas. As gêmulas foram observadas diariamente, durante 30 dias. Para a análise dos dados foi realizada ANOVA e teste Tukey. O resultado apresentou que as gêmulas de ambas as espécies submetidas ao T3 não eclodiram, provavelmente em virtude da maior condutividade da água. Houve diferença significativa entre os tratamentos (T1, T2, T4) e entre as espécies (F2;12=77,2). A comparação entre T1 e T5 apresentou diferença entre os tratamentos e as espécies (F1;8=27,5), com alta significância para ambos resultados (P<0.001). Foi constatado que R. inesi apresentou um percentual de eclosão elevado nos tratamentos analisados, enquanto que H. cristalina, teve percentual de eclosão elevado apenas na água de sua própria localidade de coleta. Adicionalmente foi observado o desenvolvimento de esponjas em ambas as espécies.
Corvoheteromeyenia Ezcurra de Drago, 1979 is endemic from the Neotropical Region and was created to comprise C. australis (Bonetto & Ezcurra de Drago, 1966) and C. heterosclera (Ezcurra de Drago, 1974). However, due to confusion in the original description of C. australis and C. heterosclera, the distinction between them was not well-established. Additionally, the type material from these species was not deposited in the collections indicated at the original descriptions. Thus, in order to elucidate their specific status, this paper presents a review of the genus and the designation of both neotypes. A total of 41 specimens were analyzed and identified as belonging to Corvoheteromeyenia. Based on the literature and additional specimens, the redescription of C. australis and C. heterosclera is presented. The microsclera acanthoxea was stated as the distinctive character of both, present only in C. heterosclera. Corvoheteromeyenia sanidastosclera Pinheiro, Silva & Calheira, in press, was also described and is distinct from congeners by the presence of gemmoscleres sanidaster. This study also tested whether the physiology of gemmules hatching could affect the distribution of freshwater sponges. Until the present, only the morphology of the gemmule was being considered to understand the pattern of distribution of species. In this work we choose two species (Heteromeyenia cristalina Batista, Volkmer-Ribeiro & Melão, 2007 e Radiospongilla inesi Nicacio & Pinheiro, 2011) to test whether the distribution is associated with the capacity of gemmules hatching in different environments. Five treatments were done (T): T1 (water of sponges site collected); T2 (Pirangi River water); T3 (Araraquara Pond water); T4 (mineral water) and T5 (T1 + drying gemmules). For each treatment 30 gemmules with three replicates were used. The gemmules were observed daily during 30 days. Data analysis was performed using ANOVA and Tukey test. Results showed that gemmules from both species submitted to T3 have not hatched, probably due to its higher conductivity. There was a significant difference between treatments (T1, T2, T4) and between species (F2, 12 = 77.2). Comparison between T1 and T5 showed differences between treatments and species (F1, 8 = 27.5), with high significance for both results (P <0.001). It was found that R. inesi presented a high percentage of hatching at all treatments while H. cristalina had high percentage of hatching only at treatment with water from its natural habitat. Additionally, the development of sponges was observed from both species.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014.
Made available in DSpace on 2015-02-05T21:19:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328456.pdf: 1966427 bytes, checksum: 77c8c494fb6f3bed0000a38e7d9c2cef (MD5) Previous issue date: 2014
Amauroderma é um gênero de macrofungos poliporoides de Ganodermataceae caracterizado por apresentar basidiomas sésseis a estipitados, com coloração em diferentes tons de marrom, sistema hifal dimítico, basidiósporos globosos, elipsoides a oblongos, hialinos a amarelados e com dupla parede, onde o endósporo é ornamentado (uma espécie apresenta endósporo liso). O gênero está distribuído em regiões tropicais e subtropicais, geralmente associados a raízes de árvores vivas ou mortas, mas também ocorrendo em troncos mortos. Apesar de bem delimitado morfologicamente, nenhuma análise filogenética do gênero foi realizada até o momento e suas relações em Ganodermataceae são assumidas por apenas três espécies. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos e filogenéticos sobre Amauroderma, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestrurais) bem como filogenéticas moleculares. Ao todo, foram revisados 144 espécimes (coletas e coleções de herbário), representando 17 espécies de Amauroderma e cinco de gêneros relacionados. Dentre estes, duas novas espécies são propostas, Amauroderma calcitum Ad int. com morfologia intermediária a A. partitum e A. calcigenum, e A. opacaespitosa Ad int., caracterizada por apresentar hábito cespitoso, basidiomas opacos com contexto marrom, sem linhas e esporos amplamente elipsoides. Também é proposta a sinonimização de A. omphalodes em A. camerarium, bem como são apresentados novos registros para o domínio fitogeográfico do Cerrado e para a Argentina. Por fim, é apresentada uma filogenia (ITS, LSU e ITS+LSU) com a proposição de um gênero novo (Foraminisporus Ad int.) e uma nova combinação (F. sprucei Ad int.), caracterizados por apresentar colunas endospóricas ocas, sendo esta uma sinapomorfia dos táxons. Ainda, Amauroderma é considerado um táxon polifilético. A partir dos resultados apresentados aqui, nota-se a eminente possibilidade de novidades científicas, tanto a nível específico quanto a nível genérico, bem como a necessidade de estudos que envolvam análises morfológicas (macro, micro e ultraestrutural) e moleculares com múltiplos marcadores.

Abstract : Amauroderma is a polypore macrofungi genus oin theGanodermataceae characterized by sessile to stipitate basidiomata, dimitic hyphal system, and globose, ellipsoid to oblong, hyaline to yellowish, double-walled basidiospores with ornamented endospore (one species presents smooth endospore). Amauroderma occurs in tropical and sub-tropical regions, usually associated with roots of living or dead trees, also occurring in dead trunks. Despite its well morphological circumscription Amauroderma is phylogenetically understudied and its relationship in Ganodermataceae is based on few species. A taxonomic and phylogenetic approach of Amauroderma is presented, based on morphological (macro, micro and ultrastructure) and molecular analysis. Around 144 specimens (collections and herbarium material), representing 17 species of Amauroderma and five of related genera were studied. Two new species are proposed, Amauroderma calcitum Ad int. with intermediate morphology of A. partitum and A. calcigenum, and A. opacaespitosa Ad int., characterized by caespitose habbit, dull basidiomata with brown context without bands and broadly ellipsoid basidiospores. Furthermore, the synonym of A. omphalodes in A. camerarium is also proposed, as well as new records for Brazilian Cerrado and for Argentina. Finally, in a preliminary phylogenetic point of view Amauroderma is considered polyphyletic. Considering the results presented here is possible to observed that there are many scientific novelties among the Ganodermataceae (specific and generic level) and some of them are possible to see only using a detailed morphology combined with molecular studies.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015.
Made available in DSpace on 2016-04-19T04:12:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337932.pdf: 2390116 bytes, checksum: 30038e57b21fee52eab77f33b1446cb0 (MD5) Previous issue date: 2015
Ophiocordyceps representa o maior e mais variado táxon de Ophiocordycipitaceae, tanto morfologico quanto ecologicamente. Ophiocordyceps dipterigena foi descrito por Berkeley e Broome (Cordyceps dipterigena), em 1875, a partir de um material coletado em uma mosca adulta no Sri Lanka (Ceilão). Atualmente o táxon, apresentando distribuição pantropical, é caráterizado morfologicamente pelos estromas filiformes, capitados, marrom alaranjados a amarelados, região fértil terminal, hemisférica e bem definida. Apresenta uma ampla variedade de hospedeiros (moscas adultas) e atualmente possui seis sinônimos heterotípicos. Apesar das evidências de um complexo taxonômico, nenhum estudo mais aprofundado (morfológico e molecular) foi realizado com este táxon até o momento. Este trabalho apresenta aspectos taxonômicos, ecológicos e filogenéticos sobre O. dipterigena, a partir de análises morfológicas (macro, micro e ultraestruturais) e de biologia molecular. Ao todo, foram revisados 84 materiais parasitas de moscas adultas de espécimes morfologicamente e ecologicamente próxima de O. dipterigena. Uma filogenia (ITS) do complexo O. dipterigena é apresentada, assim como uma discussão geral sobre diferentes possíveis novos táxons existentes. Novos caráteres relevantes para a interpretação de hipóteses de espécies são apresentados. O nome Cordyceps muscicola é resgatado da sinonímia de O. dipterigena sendo caráterizada por parasitar moscas grandes, geralmente aderidas na superfície abaxial, mas sempre com micélio recobrindo todo hospedeiro, até o momento ocorrente na Floresta Ombrófila Densa do território Catarinense. Além da lectotipificação do desenho do protólogo de C. muscicola e da epitipificação de um espécime da localidade do tipo (Blumenau) a espécie é combinada em Ophiocordyceps, O. muscicola. Outras três espécies (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 e sp. 3), que se diferenciam no complexo O. dipterigena, são apresentadas, são caráterizadas pela combinação de caráteres morfológicos e ecológicos. Outras possíveis espécies novas são discutidas. Este trabalho demonstra uma grande diversidade no complexo O. dipterigena e prevê o elevado potencial de revelar uma diversidade maior ainda com pesquisas futuras.

Abstract : Ophiocordyceps is the largest and most varied taxon of Ophiocordycipitaceae, both morphologically and ecologically. Ophiocordyceps dipterigena was described by Berkeley and Broome (as Cordyceps dipterigena) in 1875 from material collected on an adult fly in Sri Lanka (Ceylon). Currently, the taxon presents pantropical distribution and is morphologically characterized by having filiform, capitate, orange-brown to yellowish stromata and a terminal, hemispheric, well defined fertile region. Ophiocordyceps dipterigena occurs on a wide variety of hosts (adult flies) and currently has six heterotypic synonyms. Despite the evidence of a possible taxonomic complex, no detailed investigation into the possibility of cryptic species has yet been conducted. This work offers the first comprehensive taxonomic, ecological and phylogenetic treatment of the O. dipterigena complex, supported by morphological and molecular analyses. In all, eighty-five collections morphologically and ecologically related to O. dipterigena were examined. A phylogeny (ITS) of the O. dipterigena complex is presented, as well as a general discussion on potentially new taxa in the complex. New characters relevant to the interpretation of species hypotheses are presented. The name Cordyceps muscicola is recovered from synonymy with O. dipterigena, characterized by a thoroughly myceliated host which often adheres to the abaxial surface of leaves, until the moment occurring in the Ombrophilous Dense Forest territory of Santa Catarina. In addition to the lectotypification of the protologue drawing of C. muscicola and epityfication of a specimen from the type locality (Atlantic rainforest of Blumenau), the species is recombined in Ophiocordyceps as O. muscicola. Three additional species are described (Ophiocordyceps sp. 1, sp. 2 and sp. 3) which differ in the O. dipterigena complex on the basis of morphological and ecological characters. Other possible new species are discussed. This work demonstrates both a greater diversity within O. dipterigena complex than previously considered, and forecasts the high potential for revealing greater diversity with further research.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-10T21:21:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Fernando Cezar Sebastião Silva Júnior.pdf: 1756808 bytes, checksum: b289bb06ecff8d7fced8a0598a5d9354 (MD5)
Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-17T18:14:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Fernando Cezar Sebastião Silva Júnior.pdf: 1756808 bytes, checksum: b289bb06ecff8d7fced8a0598a5d9354 (MD5)
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CNPq
O gênero Gymnopilus foi descrito por P. Karsten (1980), posteriormente foi incluído na família Strophariaceae por suas espécies serem lignícolas e por apresentar estirilpironas, mais recentemente esse pigmento também foi encontrado em Pholiota P. Kumm em estudos de Biologia molecular. Singer (1986) incluiu este gênero em Cortinariaceae por conta da ornamentação do esporo. As espécies do gênero possuem como características píleos coloridos, himenóforo lamelado e cor marrom–ferrugínea, estipe amarelo, os esporos são ferrugíneo–méleos sob microscópio, com parede dupla e ornamentados, trama da lamela regular e geralmente apresentando queilocistídios. A ‘Lista de Espécies da Flora do Brasil’ cita a ocorrência de apenas 11 espécies do gênero no país. O objetivo deste trabalho é ampliar o conhecimento do gênero Gymnopilus para região Nordeste do Brasil, sua distribuição e riqueza. As coletas foram realizadas em seis áreas da região Nordeste do Brasil. O checklist das espécies encontradas no Brasil foi feito a partir de artigos e livros contendo registros de coleta do gênero. Foi encontrada uma nova espécie para o gênero, Gymnopilus purpureograminicola, em João Pessoa–PB. Novos registros de Gymnopilus sp.1 são apresentados na RPPN Fazenda Almas, e Gymnopilus aff. dilepis na Área de Proteção Ambiental da Serra de Ibiapaba–Ceará e Gymnopilus sp.2 para Recife–PE. O trabalho traz ainda um checklist contendo as 24 espécies do gênero encontradas no Brasil, com breve descrição e estados onde foram coletadas.
The Gymnopilus genus was described by P. Karsten (1980). Which was included in the Strophariaceae family, their species are lignicolous and presents styrylpyrones, more recently this pigment was also found in Pholiota P. Kumm in molecular biology studies. Singer (1986) included this genus under Cortinariaceae due to the spore ornamentation. The Cortinariaceae belonging to the family was later proposed its inclusion in Strophariaceae to present styrylpyrones and proximity to Pholiota in molecular biology studies. The species of the genus have as characteristics colored pileus, lamellar hymenium in rusty-brown and stipe yellow color, the spores are rufous-meleos under microscope, double and ornate wall, plot regular slide and generally presenting cheilocystidia. The 'Flora Species List of Brazil' mentions the occurrence of only 11 species of the genus in the country. The objective of this study is to increase knowledge of Gymnopilus genus to northeastern Brazil, its distribution and wealth. Samples were collected in six areas of the Northeast region of Brazil. The checklist of the species found was made from articles and books containing the genus collection records. A new species have been found for the genus, Gymnopilus purpureograminicola in João Pessoa-PB. New records of Gymnopilus sp.1 are presented in RPPN Fazenda Almas, and Gymnopilus aff. dilepis in the Área de Proteção Ambiental of Serra de Ibiapaba-Ceará and Gymnopilus sp.2 to Recife-PE. The work also contains a checklist incorporate 24 species of the genus found in Brazil, with a brief description and states where they were collected.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014.
Made available in DSpace on 2014-08-06T18:08:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326354.pdf: 3198757 bytes, checksum: 56434bf89de770ca5875a57e0d968a3d (MD5) Previous issue date: 2014
O conhecimento sobre os fungos boletoides nas regiões tropicais e subtropicais do hemisfério sul ainda é bastante limitado, havendo escassez de dados acerca da diversidade e distribuição dos mesmos. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento de Boletaceae foram estudados materiais coletados em diferentes regiões do Brasil. Quatorze táxons foram identificados em cinco gêneros (Austroboletus, Boletellus, Chalciporus, Fistulinella e Tylopilus), sendo que sete são espécies novas: F. alboaurantiaca (RN), F. conduruensis (BA), F. rhytidocystidiata (ES), T. dimorphicus (AM), T. nigrostipitatus (PB), T. pygmaeus (BA) e T. versiformis (PB). Tylopilus balloui foi registrado pela primeira vez para o Brasil. Fistulinella cinereoalba foi registrada pela primeira vez para o Brasil. Chalciporus trinitensis var. amazonicus foi registrado pela primeira vez para o Espírito Santo e A. festivus é o primeiro registro para Santa Catarina. Boletellus ananas e B. cf. lepidospora foram recoletados nas florestas brasileiras. Para todos os táxons são apresentadas fotografias dos basidiomas, descrições macro e micromorfológicas com ilustrações e microscopia eletrônica de varredura (MEV) dos basidiosporos. Os resultados mostraram uma diversidade pouco conhecida de Boletaceae nas florestas brasileiras e uma indicação de que ainda há mais novidades para a ciência no que diz respeito a essa família. O incremento no conhecimento dos táxons de Boletaceae e a importância ecológica da família devido à associação com plantas hospedeiras dá subsídios importantes para planos de conservação em áreas onde esses táxons ocorrem.

Abstract : Knowledge about boletoid fungi in tropical and subtropical regions of the southern hemisphere is still quite limited and few data regarding their diversity and distribution are available. In order to contribute to the knowledge of the diversity of Boletaceae, specimens from different regions of Brazil were studied. A total of 14 taxa belonging to five genera (Austroboletus, Boletellus, Chalciporus, Fistulinella and Tylopilus) have been identified, from which seven are new species: F. alboaurantiaca (RN), F. conduruensis (BA), F. rhytidocystidiata (ES), T. dimorphicus (AM), T. nigrostipitatus (PB), T. pygmaeus (BA), and T. versiformis (PB). Tylopilus balloui was registered for the first time for Brasil. Fistulinella cinereoalba was registered for the first time for Brazil. Chalciporus trinitensis var. amazonicus was registered for the first time for Espírito Santo, and A. festivus is a new record for Santa Catarina. Boletellus ananas and B. cf. lepidospora were recollected in the Brazilian forests. Photographs of the basidiomes, fully macro and microscopic descriptions with illustrations, and Scanning Electron Microscopy (SEM) of the basidiospores are presented for each species. The results showed that the diversity of Boletaceae in Brazilian forests is still not very well known and indicates that there are more new species for science to be described. The increase in the knowledge about the Boletaceae and the ecological importance of the family due to the association with plants provides data to build conservation plans in areas where these taxa grow.

Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2018-10-01T14:15:53Z No. of bitstreams: 2 Gabrielle_ Jorge_ de_Melo.pdf: 13456496 bytes, checksum: a90317641899c1b7ad2615d20cece8a6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Despite the large volume of knowledge available on Coleoptera, Scirtidae is a family that still lacks taxonomic, biological and ecological studies. The objectives of this work were to obtain taxonomic and biological information on immatures and adults of Scirtidae, in the state of Amazonas. Three genera of this family (Contacyphon Gozis, Ora Clark and Scirtes Illiger) were recorded for the first time in the brazilian Amazon, and three species: Ora bivittata Pic, 1922, Ora depressa (Fabricuis, 1801) and Ora semibrunnea Pic, 1922. In addition, nine morphotypes (eight from Scirtes and one from Contacyphon) were identified, it was not possible to identify the species or to determine if these morphotypes represent new species for Science because the descriptions of the species are incomplete and because it is impossible to examine the species types of these genera. All morphotypes were described and, for the majority, larvae were associated with adults by breeding under laboratory conditions. Biological and habitat information of each species / morphotype were obtained; lasvas were collected in streams and temporary pools (associated with foliage), lakes (associated with macrophytes, submerged trunks and kinon) and phytotelmatas (bromeliads, wild-banana, bracts and fallen palm leaves). Information on the geographical distribution of the species was presented and maps of distribution of the species / morphotypes in the state of Amazonas were elaborated. Larva and pupae of O. semibrunnea were first described and biological information about this species with the first aquatic pupa record in the genus were presented.
Apesar do grande volume de conhecimento disponível sobre Coleoptera, Scirtidae ainda é uma família que carece de estudos taxonômicos, biológicos e ecológicos. Os objetivos deste trabalho foram obter informações taxonômicas e biológicas sobre imaturos e adultos de Scirtidae, no estado do Amazonas. Foram registrados pela primeira vez na Amazônia brasileira, três gêneros dessa família (Contacyphon Gozis, Ora Clark e Scirtes Illiger) e três espécies: Ora bivittata Pic, 1922, Ora depressa (Fabricuis, 1801) e Ora semibrunnea Pic, 1922. Adicionalmente, nove morfótipos (oito de Scirtes e um de Contacyphon) foram identificados, não foi possível identificar as espécies ou determinar se esses morfótipos representam novas espécies para a ciência pelo fato das descrições das espécies serem incompletas e pela impossibilidade de examinar os tipos de espécies desses gêneros. Todos os morfótipos foram descritos e, para a maioria, larva foi associada aos adultos por meio de criação em condições de laboratório. Informações biológicas e sobre o habitat de cada espécie/morfótipo foram obtidas; lasvas foram coletadas em igarapés e poças temporárias (associdas ao folhiço), lagos (associadas à macrófitas, troncos submersos e kínon) e fitotelmatas (bromélias, bananeiras-bravas-do-mato, brácteas e folhas de palmeira caídas). Informações sobre a distribuição geográfica das espécies foram apresentadas e mapas de distribuição das espécies/morfótipos no estado do Amazonas foram elaborados. Larva e pupa de O. semibrunnea foram descritas pela primeira vez e, informações biológicas sobre essa espécie, com o primeiro registro de pupa aquática no gênero, foram apresentadas.

BONNET, N. Y. K. Filogenia e taxonomia de phlebobranchia (tunicata: ascidiacea). 2016. 312 f. Tese (Doutorado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016.
Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2017-03-07T12:53:50Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_nykbonnet.pdf: 7185500 bytes, checksum: a3707f3bf943223fec9fda91599873ea (MD5)
Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2017-04-24T15:50:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_nykbonnet.pdf: 7185500 bytes, checksum: a3707f3bf943223fec9fda91599873ea (MD5)
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Phlebobranchia, one of the three orders of Ascidiacea, is characterized by its simple oral tentacles, pharynx not folded, and gonads associated with the digestory tube. Despite being the less speciose order, species of Phlebobranchia can be found all around the world, from shallow water to the deep-sea, and it has the largest morphological ected and redescribed. Five new species were detected (one of Ascidiidae, published in the last year, and four of Perophoridae, manuscript in progress), and there are five morphotypes unidentified.
Phlebobranchia é uma das três ordens de Ascidiacea, sendo caracterizada pela presença de tentáculos orais simples, faringe sem pregas e gônadas associadas ao trato digestório. Presente ao redor do mundo inteiro e nas mais variadas profundidades, é a ordem com menor número de espécies descritas, porém é também a que apresenta maior variabilidade morfológica. Para muitas espécies as descrições existentes são muito sucintas o que frequentemente ocasiona equívocos taxonômicos. Assim, com o objetivo de revisarr a taxonomia do grupo foram redescritas 62 espécies de cinco famílias de Phlebobranchia. Foram encontradas cinco espécies novas (uma de Ascidiidae, já publicada, e quatro de Perophoridae, com o manuscrito em preparação), além de cinco morfotipos que não puderam ainda ser identificados.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2015
Made available in DSpace on 2016-02-09T03:15:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337161.pdf: 1491998 bytes, checksum: 63fd33c3720b988200a0202995d42f61 (MD5) Previous issue date: 2015
Os fungos entomopatógenos (Hypocreales, Ascomycota), conhecidos de modo geral como Cordyceps s.l., utilizam diferentes espécies de artrópodes como hospedeiros, onde desenvolvem parte do seu ciclo de vida. São responsáveis pelo equilíbrio de populações de insetos, contaminam os insetos hospedeiros e utilizam seus corpos como substrato para a produção de estruturas reprodutivas sexuais e ou assexuais. Os estudos sobre Cordyceps s.l. no Brasil são antigos ou escassos para uma diversidade potencialmente grande. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento desses fungos no Brasil e na região Neotropical, foram estudados aspectos sobre ecologia, morfologia e molecular de Cordyceps s.l. com foco em um táxon em especial, pertencente ao gênero Ophiocordyceps. Ophiocordyceps nutans (Pat.) G.H. Sung, J.M. Sung, Hywel-Jones & Spatafora é morfologicamente caracterizado por apresentar estipe filiforme, preto, com a região fértil bem delimitada, intumescida, vermelha. Foi descrita a partir de espécimes do Japão e é comumente encontrado na Coréia em meio à serapilheira, parasitando obrigatoriamente insetos da ordem Hemiptera. No Brasil espécimes morfologicamente relacionados vêm sendo coletados, parasitando a mesma ordem de insetos, e sendo assim previamente determinados como o táxon asiático, O. nutans. A fim de confirmar se o táxon que ocorre no Brasil representa a mesma espécie coletada no Japão foram coletados mais de 100 espécimes com morfologia semelhante a O. nutans. Foram realizadas análises morfológicas e moleculares, bem como a obtenção de culturas, os dados ecológicos também foram considerados neste estudo. No capítulo 1, são apresentadas evidências de que o táxon corresponda a um complexo de espécies crípticas, composto por duas linhagens Asiáticas e uma linhagem Neotropical. No capítulo 2, com base na filogenia gerada a partir de sequências ITS de DNA ribossomal, provenientes de espécimes Asiáticos e Brasileiros, foram observadas as três linhagens mencionadas, sendo, por tanto, proposta a espécie nova, Ophiocordyceps neonutans sp. nov. ad int. No capítulo 3 é apresentada uma possível nova espécie de Ophiocordyceps, que parasita insetos da ordem Hemiptera, no entanto da subordem Homoptera. Os peritécios ovoides e os esporos fusoides são as principais características diagnósticas desta espécie. Por fim, considerando o apresentado, os registros de O. nutans para o resto do mundo precisam ser revisados. Além disso, novas coletas e análises moleculares (multiloci) deste complexo se fazem necessárias, principalmente considerando as evidências ecológicas (hospedeiro e distribuição geográfica) para o entendimento das linhagens como espécies a serem descritas.

Abstract : The entomopathogenic fungi (Hypocreales, Ascomycota), broadly known as Cordyceps s.l, use different arthropod species as hosts, where they develop part of their life cycle. Responsible for the balance of insect populations, they infect specific hosts contaminating their bodies using it as a substrate for production of sexual or asexual reproductive structures. Under the research project MICOLAB / UFSC which aims to contribute to the knowledge of these fungi in Brazil and in the Neotropics were studied aspects of ecology, morphology and molecular in Cordyceps s.l. focusing on a taxon in particular belonging to Ophiocordyceps genre. Ophiocordyceps nutans (Pat.) G.H. Sung, J.M. Sung, Hywel-Jones & Spatafora 2007 is morphologically characterized by having threadlike stipe, black, with a fertile region well delimited swollen, red. It was described from Japan specimens and is commonly found in Korea amid the leaf litter, necessarily parasite insects of the order Hemiptera. In Brazil morphologically related specimens have been collected, parasitizing the same order of insects, so they were predetermined as the Asian taxon, O. nutans. In order to confirm if the taxon that occurs in Brazil is the same species collected in Japan, were collected in Brazilian field expeditions more than 100 specimens with similar morphology to O. nutans. Morphological and molecular analyzes were performed, as well as obtaining cultures, ecological data were also considered in this study. In Chapter 1, evidence were presented that the taxon corresponds to a complex of cryptic species, composed of 2 Asian lineages and one geographically distinct Neotropical lineage of Ophiocordyceps nutans. In chapter 2, based on the phylogeny generated from ribosomal DNA ITS sequences, from Asian and Brazilian specimens. Three distinct lineages were observed, and was proposed a new species. Ophiocordyceps neonutans sp. nov. Ad int. parasitizing Pentatomidae (Hemiptera) in Brazilian territory. Chapter 3 presents a possible new species of Ophiocordyceps that parasitizes insects of the Hemiptera order, however in the suborder Homoptera. Perithecia ovoid and fusiform spores are the main diagnostic features of this species. Finally, considering the presented, O. nutans records for the rest of the world need to be reviewed. In addition, new collections and molecular analyzes (multiloci) of this complex are necessary, especially considering the ecological evidence (Host and geographical distribution) to understand the lineages as species to be described.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-01T15:58:22Z No. of bitstreams: 1 Josilene Maria de Sousa.pdf: 1022089 bytes, checksum: eed582de535358db614efdecfa57d6d1 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-12-01T15:58:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Josilene Maria de Sousa.pdf: 1022089 bytes, checksum: eed582de535358db614efdecfa57d6d1 (MD5) Previous issue date: 2008-02-04
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
The family Annonaceae Juss. is composed by more than 120 genera and 2000 species, from the tropical regions of America, Asia and Africa. Many of these species are edible; the genus Annona is the most cultivated. Phytophagous and predators mites are commonly found in Annonaceae, however in Brazil few reports of the mites are associated with this family. This study aimed to assess the diversity mite species in Annonaceae in Northeastern Brazil and Pará state, as well as its population dynamic in the state of Pernambuco. It also aimed to evaluate the biology of Tetranychus mexicanus (McGregor) identified as phytophagous species more frequent and abundant in that state. The following families were found associated with Annonaceae: Acaridae, Bdellidae, Cheyletidae, Cunaxidae, Eriophyidae, Phytoseiidae, Stigmaeidae, Tarsonemidae, Tetranychidae, Tenuipalpidae and Tydeidae. Brevipalpus phoenicis (Geijskes), Tetranychus mexicanus (McGregor) and Tenuipalpus annonae De Leon apparently can cause damage to fruits and leaves of Annonaceae. Among the predators found the greatest richness ofspecies was found the family Phytoseiidae. T. mexicanus showed better development, survival, as well as net rate of reproduction in Annona muricata L. (soursop), but this species is usually prefer feed and by eggs in Annonaceae in which it was reared. The family Tydeidae presented the greatest abundance in all Annonaceae studied. Genera Afrotydeus, Homeopronematus, Lorryia,Parapronematus and Tetranychus in Annona coriaceae L. (araticum); Lorryia, Pronematus, Oligonychus and Tenuipalpus in Annona squamosa L. (sweetsop); Afrotydeus, Agistemus, Homeopronematus, Lorryia and Tetranychus in soursop were very abundant, very common, constant and dominant. There was no difference in the amount of mites collected in the Annonaceae studied in relation to the dry and rainy season, except for the family Tetranychidae in sweetsop, Phytoseiidae in A. coriaceae and Tetranychidae and Phytoseiidae in soursop.
A família Annonaceae Juss. é constituída de mais de 120 gêneros e 2000 espécies, originárias das regiões tropicais da América, Ásia e África. Muitas dessas espécies são comestíveis, sendo as do gênero Annona as mais cultivadas. Os ácaros fitófagos e predadores são comumente encontrados em anonáceas, entretanto no Brasil são poucos os relatos de ácaros associados a esta família. Este trabalho teve como objetivo avaliar a diversidade de espécies de ácaros em Annonaceae no Nordeste do Brasil e Estado do Pará, assim como sua dinâmica populacional no Estado de Pernambuco, além de estudar a biologia de Tetranychus mexicanus (McGregor) identificada como a espécie fitófaga mais freqüente e abundante naquele estado. Foram encontradas as famílias Acaridae, Bdellidae, Cheyletidae, Cunaxidae, Eriophyidae, Phytoseiidae, Stigmaeidae, Tarsonemidae, Tetranychidae, Tenuipalpidae e Tydeidae associadas a Annonaceae. As espécies Brevipalpus phoenicis (Geijskes), Tetranychus mexicanus (McGregor) e Tenuipalpus annonae De Leon aparentemente podem causar injúrias em frutos e folhas deanonáceas. Dentre os predadores encontrados a maior riqueza de espécies foi da família Phytoseiidae. T. mexicanus apresentou melhor desenvolvimento, sobrevivência, assim como taxa líquida de reprodução em Annona muricata L. (graviola), contudo este tetraniquídeo preferiu normalmente se alimentar e ovipositar na Annonaceae na qual foi criado. A família Tydeidaeapresentou a maior abundância em todas as anonáceas estudadas. Os gêneros Afrotydeus, Homeopronematus, Lorryia, Parapronematus e Tetranychus em araticum; Lorryia, Pronematus, Oligonychus e Tenuipalpus em pinha; Afrotydeus, Agistemus, Homeopronematus, Lorryia e Tetranychus em graviola foram considerados muito abundantes, muito frequentes, constantes e dominantes. Não houve diferença na quantidade de ácaros coletados nas Annonaceae estudadas em relação à estação seca e chuvosa, exceto para a família Tetranychidae em pinha, Phytoseiidae em araticum e Tetranychidae e Phytoseiidae em graviola.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2014.
Made available in DSpace on 2015-02-05T20:15:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328522.pdf: 2738107 bytes, checksum: 9f21f8b68a0f0a8694cbc8a277f6992c (MD5) Previous issue date: 2014
As algas calcárias apresentam características que tornam o grupo um dos mais difíceis de realizar um estudo taxonômico dentre as algas vermelhas. Devido sua ampla plasticidade fenotípica decorrente de suas adaptações aos diferentes ambientes em que vivem, a sua morfologia externa não pode ser utilizada como caractere taxonômico. As referências sobre algas calcárias epífitas em macroalgas não calcárias são extremamente raras. Diante da escassez de estudos com essas algas, o presente estudo teve como objetivo avaliar a biodiversidade ficológica das coralíneas crostosas epifíticas em diferentes algas hospedeiras através de técnicas apropriadas e avançadas para a descrição e identificação dos taxa. As coletas foram realizadas na região entre marés e no infralitoral superior, utilizando mergulho livre. Os táxons identificados contabilizam quatro no nível de espécie, e uma unidade taxonômica pertencente ao gênero Hidrolithon (Foslie) Foslie, do qual não foi possível a determinação de táxon específico por conta da ausência das características diagnósticas. Dentre os identificados destacaram-se as espécies epífitas em Sargassum sp., Vidalia sp. e Padina sp.: Pneophyllum fragile Kützing; Em Pterocladiella capilacea (S.G.Gmelin) Santelices & Hommersand: Titanoderma pustulatum (J.V.Lamouroux) e Melobesia membranacea (Esper) Lamouroux; e sobre Laurencia sp., M. rosanoffi (Foslie) Lemoine, sendo esta uma adição para a flora do Oceano Atlântico. Considerando a importância dessas algas no contexto atual de mudanças ambientais e acidificação dos oceanos, as adições para a flora local e para a biodiversidade marinha do Atlântico sul, preenche a lacuna que este referido grupo representava. Destaca-se ainda a necessidade de se intensificar os esforços de estudos taxonômicos do grupo utilizando ferramentas morfoanatômicas e moleculares em diferentes regiões e ambientes para que estas algas sejam finalmente descritas de maneira ampla e sistemática para o nosso litoral.

Abstract : Among the red algae, the calcareous algae have characteristics that make the group one of the most difficult on which to conduct a taxonomic study. Due to its wide phenotypic plasticity, a result of their adaptation to different environments in which they live, their external morphology cannot be used as a taxonomic character. The data for epiphytic coralline algae in non-calcareous macroalgae are extremely rare. Given the scarcity of studies with these group, this research aimed to assess the phycological biodiversity of crusty epiphytic coralline algae in different hosts through appropriate and advanced techniques for the description and identification of the taxa. The collections were made in the intertidal and upper subtidal using free diving. The taxa identified account four species, and one taxonomic unit belonging to the genus Hidrolithon (Foslie) Foslie, for which it was not possible to determine species due to the absence of diagnostic features. Among the taxa growing on Sargassum sp., Vidalia sp. and Padina sp were Pneophyllum fragile Kützing ; on Pterocladiella capilacea (SGGmelin) Santelices & Hommersand: Titanoderma pustulatum (JVLamouroux) and Melobesia membranacea (Esper) Lamouroux , and on Laurencia sp , the epiphytic M. rosanoffi (Foslie) Lemoine, being this last one an addition to the flora of the Atlantic Ocean. Considering the importance of these algae in the current context of environmental change and ocean acidification, the additions to the local flora and marine biodiversity of the Southern Atlantic fills the gap that this group represented. The importance reinforces the gap that this group represented. Another highlight is the need to intensify research efforts involving taxonomic group studies using morphological, anatomic and molecular tools in different regions and environments, and so this group can be finally describe along our coast.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-10-15Bitstream added on 2014-06-13T19:25:17Z : No. of bitstreams: 1 yokota_l_dr_rcla.pdf: 2270400 bytes, checksum: ee009c38f75c673fe46f760c6c991d31 (MD5)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
O objetivo do presente estudo foi estudar a estrutura populacional, biologia reprodutiva e dieta dos exemplares identificados como Gymnura micrura capturados na região de Caiçara do Norte (RN), além de definir sua correta identidade taxonômica através de uma comparação com exemplares provenientes de outras localidades dentro de sua suposta área de ocorrência no Atlântico Oeste. A revisão da família Gymnuridae no Brasil é realizada. Os exemplares foram obtidos através do acompanhamento da pesca artesanal na região de Caiçara do Norte (RN) durante o período de agosto de 2007 a julho de 2008. Visitas a coleções foram realizadas para análise do material comparativo. A espécie em questão trata-se realmente de Gymnura micrura (BLOCH & SCHNEIDER, 1801), ocorrendo da costa norte dos Estados Unidos ao sul do Brasil (Paraná). No Brasil ocorrem dois representantes da família Gymnuridae: Gymnura micrura e Gymnura altavela. A terceira espécie que ocorreria no Brasil, G. hirundo, é proposta como um sinônimo júnior de G. altavela. São apresentadas evidências contra a validade do gênero Aetoplatea, sendo que a família seria representada apenas por um gênero (Gymnura). Na população estudada indivíduos maiores tendem a ocupar águas mais profundas e entre os jovens parece existir uma leve tendência à segregação sexual por profundidade, com os machos ocupando águas ligeiramente mais profundas. O tamanho de primeira maturação dos machos e fêmeas foi estimado em 275 e 410 mm de largura do disco (LD) respectivamente, enquanto o tamanho de nascimento foi estimado entre 135 e 175 mm LD. A fecundidade uterina foi estimada em 3,8±1,3 embriões, e foi significativamente correlacionada com a LD das fêmeas. É proposta uma reprodução contínua ao longo do ano sem qualquer sincronismo em nível populacional. A dieta foi constituída basicamente de teleósteos...
The purpose of the present thesis was to study the population structure, reproductive biology and diet of the specimens identified as Gymnura micrura from Caiçara do Norte-RN (Northeast Brazil), and to define their correct taxonomic identity by comparing them with specimens from other regions within their supposed area of occurrence at the Western Atlantic. A review of the family Gymnuridae in Brazil was carried out. The specimens were obtained by monitoring the artisanal fisheries in the region of Caiçara do Norte (RN) during the period from August 2007 to July 2008. Visits to scientific collections were made for analysis of comparative material. The species studied was confirmed to be Gymnura micrura (BLOCH & SCHNEIDER, 1801), which occurs from the northern coast of the United States to southern Brazil (Paraná State). In Brazil there are two species of the family Gymnuridae: Gymnura micrura and Gymnura altavela. The third species known as occurring in Brazil, G. hirundo, is proposed as a junior-synonym of G. altavela. Evidence against the validity of genus Aetoplatea is presented, so the family Gymnuridae should be represented by only one genus (Gymnura). In the population studied larger individuals tend to occupy deeper waters and among the young individuals there seems to exist a slight tendency for sexual segregation by depth, with males occupying slightly deeper waters. Mean sizes at maturity were 275 mm disc width (DW) in males and 410 mm DW in females. Size at birth was 135 – 175 mm DW. The uterine fecundity was assessed in 3.8±1.3 embryos, and was significantly correlated with female DW. It is proposed that in the study area breeding occurs throughout the year with no population synchronism. The diet consisted mainly of teleosts (IA = 99.5 %), with the predominance of one species (Pomadasys corvinaeformis). The graphical ecological analysis characterizes... (Complete abstract click electronic access below)

Resumo: O objetivo do presente estudo foi estudar a estrutura populacional, biologia reprodutiva e dieta dos exemplares identificados como Gymnura micrura capturados na região de Caiçara do Norte (RN), além de definir sua correta identidade taxonômica através de uma comparação com exemplares provenientes de outras localidades dentro de sua suposta área de ocorrência no Atlântico Oeste. A revisão da família Gymnuridae no Brasil é realizada. Os exemplares foram obtidos através do acompanhamento da pesca artesanal na região de Caiçara do Norte (RN) durante o período de agosto de 2007 a julho de 2008. Visitas a coleções foram realizadas para análise do material comparativo. A espécie em questão trata-se realmente de Gymnura micrura (BLOCH & SCHNEIDER, 1801), ocorrendo da costa norte dos Estados Unidos ao sul do Brasil (Paraná). No Brasil ocorrem dois representantes da família Gymnuridae: Gymnura micrura e Gymnura altavela. A terceira espécie que ocorreria no Brasil, G. hirundo, é proposta como um sinônimo júnior de G. altavela. São apresentadas evidências contra a validade do gênero Aetoplatea, sendo que a família seria representada apenas por um gênero (Gymnura). Na população estudada indivíduos maiores tendem a ocupar águas mais profundas e entre os jovens parece existir uma leve tendência à segregação sexual por profundidade, com os machos ocupando águas ligeiramente mais profundas. O tamanho de primeira maturação dos machos e fêmeas foi estimado em 275 e 410 mm de largura do disco (LD) respectivamente, enquanto o tamanho de nascimento foi estimado entre 135 e 175 mm LD. A fecundidade uterina foi estimada em 3,8±1,3 embriões, e foi significativamente correlacionada com a LD das fêmeas. É proposta uma reprodução contínua ao longo do ano sem qualquer sincronismo em nível populacional. A dieta foi constituída basicamente de teleósteos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: The purpose of the present thesis was to study the population structure, reproductive biology and diet of the specimens identified as Gymnura micrura from Caiçara do Norte-RN (Northeast Brazil), and to define their correct taxonomic identity by comparing them with specimens from other regions within their supposed area of occurrence at the Western Atlantic. A review of the family Gymnuridae in Brazil was carried out. The specimens were obtained by monitoring the artisanal fisheries in the region of Caiçara do Norte (RN) during the period from August 2007 to July 2008. Visits to scientific collections were made for analysis of comparative material. The species studied was confirmed to be Gymnura micrura (BLOCH & SCHNEIDER, 1801), which occurs from the northern coast of the United States to southern Brazil (Paraná State). In Brazil there are two species of the family Gymnuridae: Gymnura micrura and Gymnura altavela. The third species known as occurring in Brazil, G. hirundo, is proposed as a junior-synonym of G. altavela. Evidence against the validity of genus Aetoplatea is presented, so the family Gymnuridae should be represented by only one genus (Gymnura). In the population studied larger individuals tend to occupy deeper waters and among the young individuals there seems to exist a slight tendency for sexual segregation by depth, with males occupying slightly deeper waters. Mean sizes at maturity were 275 mm disc width (DW) in males and 410 mm DW in females. Size at birth was 135 - 175 mm DW. The uterine fecundity was assessed in 3.8±1.3 embryos, and was significantly correlated with female DW. It is proposed that in the study area breeding occurs throughout the year with no population synchronism. The diet consisted mainly of teleosts (IA = 99.5 %), with the predominance of one species (Pomadasys corvinaeformis). The graphical ecological analysis characterizes... (Complete abstract click electronic access below)
Orientador: Roberto Goitein
Coorientador: Rosângela Paula Lessa
Coorientador: Ricardo de Souza Rosa
Banca: Otto Bismarck Fazzano Gadig
Banca: Patricia Charvet
Banca: Getulio Rinson Filho
Banca: June Ferraz Dias
Doutor

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-11-28T14:48:35Z No. of bitstreams: 1 Marta Gomes Camara de Araujo.pdf: 581232 bytes, checksum: e0172bb1a0b3a81f16f9a8fde15e2f6a (MD5)
Made available in DSpace on 2016-11-28T14:48:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marta Gomes Camara de Araujo.pdf: 581232 bytes, checksum: e0172bb1a0b3a81f16f9a8fde15e2f6a (MD5) Previous issue date: 2007-07-02
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
This paper describes for the first time immature stages of Cynea diluta (Herrich-Schaffer). The specimens have been collected in plants of Alpinia purpurata (Zingiberaceae) locale knew as Panamá that grow naturally in the campus Dois Irmãos of the Federal Rural University of Pernambuco (UFRPE) and in private properties in Recife, Pernambuco. The external morphology of the immature stages of the representatives of the Hesperiidae Family is still little known. The morphologic aspects are the main characters used in the taxonomic identification, including the chaetotaxy of the head, thorax and abdomen, have been described in details. Characteristics as coloration and biometry of eggs, larval and pupal besides some bionomic aspects have been studied and used as well.
Este trabalho descreve os estágios imaturos de Cynea diluta (Herrich-Schaffer) (Lepidoptera: Hesperiidae: Hesperiinae). Os espécimes foram coletados em plantas de Alpinia purpurata (Viell Schum) (Zingiberaceae) conhecidas vulgarmente como Panamá, ocorrentes no município de Recife no Campus Dois Irmãos da Universidade Federal Rural de Pernambuco e em propriedades particulares. Aspectos morfológicos são os principais utilizados na identificação taxonômica, incluindo a quetotaxia da cabeça, tórax e abdome. Foram abordados caracteres como coloração do tegumento, manchas, biometria dos ovos, larvas e pupa além de aspectos bionômicos.

La présente Thèse représente une importante contribution à la connaissance de l’ultrastructure de la spermiogenèse et du spermatozoïde des Digènes. Nous présentons des nouvelles données spermatologiques concernant huit espèces appartenant à sept familles et superfamilles de Digènes. Ils s’agissent de Brachycoelium salamandrae (Gorgoderoidea : Brachycoeliidae), Diplodiscus subclavatus (Paramphistomoidea : Diplodiscidae), Elstia stossichianum et Wardula capitellata (Microscaphidioidea : Mesometridae), Euryhelmis squamula (Opisthorchioidea : Heterophyidae), Mediogonimus jourdanei (Microphalloidea : Prosthogonimidae), Robphildollfusium fractum (Lepocreadioidea : Gyliauchenidae), et Rubenstrema exasperatum (Plagiorchioidea : Omphalometridae). Les résultats obtenus sur la spermiogenèse et/ou le spermatozoïde sont comparés avec le reste de Digènes. De plus, nous discutons de l’importance de certains caractères ultrastructuraux pour une meilleure compréhension des relations phylogénétiques chez les Digènes. La spermiogenèse chez les Digènes est assez homogène. Cependant, il y a certains aspects comme la variabilité du nombre de bandes du corps intercentriolaire et l’angle de rotation flagellaire qui méritent une attention particulière. Concernant le spermatozoïde, nous avons proposé, après une analyse précise des données spermatologiques disponibles, sept modèles de spermatozoïde chez les Digènes. Les caractères du spermatozoïde les plus utiles pour l’établissement de ces modèles sont : (a) le type d’axonème/es (patron 9+‘1’ des Trepaxonemata, 9+‘1’ spécial et 9+0), (b) l’extrémité antérieure du spermatozoïde (avec un ou deux axonèmes), (c) la présence/absence de l’association « expansion latérale+ornementations externes+microtubules corticaux » ou « ornementations externes+microtubules corticaux », (d) la présence ou l’absence d’ornementations externes et leur localisation sur le spermatozoïde, (e) le patron des microtubules corticaux parallèles, absents ou disposés en un ou deux champs, et (f) le caractère terminal dans l’extrémité postérieure du spermatozoïde (noyau, axonème ou microtubules corticaux). D’autres caractères comme les corps épineux ou les boutons cytoplasmiques ornementés peuvent avoir une importance particulière pour certains taxons. La récente description des corps épineux suppose une reconsidération de certaines études anciennes où ces structures peuvent être mal interprétés ou considérés comme des artéfacts. Les boutons cytoplasmiques ornementes sont un nouveau caractère trouvé chez les Mesometridae (E. stossichianum et W. capitellata). Les spermatozoïdes des espèces étudiées dans cette thèse appartiennent aux modèles 1, 2 ou 3. Le modèle 1, caractérisé par la présence de l’association « expansion latérale+ornementations externes+microtubules corticaux », est présent chez Diplodiscus subclavatus, Elstia stossichianum et Wardula capitellata. De plus, la plupart des Echinostomatoidea, Paramphistomoidea et Pronocephaloidea présentent ce modèle. Le modèle 2 est caractérisé par l’association « ornementations externes+microtubules corticaux » et par une extrémité postérieure du spermatozoïde contenant le noyau. Il est présent chez Brachycoelium salamandrae, Robphildollfusium fractum et Rubenstrema exasperatum. Finalement, Euryhelmis squamula et Mediogonimus jourdanei présentent un spermatozoïde du modèle 3 comme chez certains Opisthorchioidea et certaines familles telles que les Allocreadiidae, Deropristidae, Lepocreadiidae et Troglotrematidae. Le modèle 3 diffère du modèle 2 par l’extrémité postérieure contenant un axonème. Le modèle 4 est similaire aux modèles 2 et 3, mais l’extrémité postérieure contient seulement des microtubules corticaux. Il est présent chez les Opecoelidae et Opistholebetidae. Le modèle 5 exhibe un seul champ (ventral) de microtubules corticaux et ne présente pas l’association « ornementations externes+microtubules corticaux ». Il est observé chez les Faustulidae, Hemiuridae et les Lecithasteridae. Le modèle 6 est observé chez les schistosomes. Ils présentent un spermatozoïde aberrant, non filiforme, avec un seul axonème du type 9+‘1’ spécial. Finalement, le modèle 7, caractérisé par la présence d’axonèmes du type 9+0 et par l’absence de microtubules corticaux, est établit seulement pour Didymozoon sp.
The present Thesis represents a contribution to the knowledge about the ultrastructure of spermiogenesis and of the mature spermatozoon of digeneans. We present for the first time spermatological data concerning eight species belonging to seven families and superfamilies: Brachycoelium salamandrae (Gorgoderoidea: Brachycoeliidae), Diplodiscus subclavatus (Paramphistomoidea: Diplodiscidae), Elstia stossichianum and Wardula capitellata (Microscaphidioidea: Mesometridae), Euryhelmis squamula (Opisthorchioidea: Heterophyidae), Mediogonimus jourdanei (Microphalloidea: Prosthogonimidae), Robphildollphusium fractum (Lepocreadioidea: Gyliauchenidae), and Rubenstrema exasperatum (Plagiorchioidea: Omphalometridae). A global analysis of the spermatological characteristics of these species and those already described in the Digenea, allow us to establish seven sperm models within digeneans. The importance of several ultrastructural characteristics, combined with the proposed models are discussed in order to contribute to a better understanding of digenean phylogenetic relationships.

Orientador : Graziela Maciel Barroso
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-17T14:09:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tozzi_AnaMariaGoulartdeAzevedo_D.pdf: 29116244 bytes, checksum: 5e74052c64445e4b69c175c46774e334 (MD5) Previous issue date: 1989
Resumo: O presente trabalha consiste de estudos taxonômicos dos gêneros Lonchocarpus Kunth e Deguelia Aubl. para o Brasil. O gênero Deguelia compreendendo as espécies americanas anteriormente incluídas em Derris Lour.. Millettia Wight & Arn. e Lonchocarpus subg. Phacelanthus Pittier. No conceito aqui adotado, estes gêneros mostram-se como grupos naturais, que são separados principalmente pela estrutura da inflorescência, permitindo uma classificação estável para o complexo Para o gênero Lonchocarpus foram reconhecidas 23 espécies, 3 das quais ainda não descritas na literatura (L. grandiflorus, L. bahianus e L. Montanus). Para o gênero Deguelia foram registradas 17 espécies, das quais 3 novas (D. glaucífolía, D. hatschbachii e D. duckeana), e 1 variedade ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: It is presented a taxonomic revision of the genera Lonchocarpus Kunth and Deguelia Aubl. in Brazil. The genus Desuelia comprising the american species formerly included in Derris Lour., Millettia Wight & Arn. and Lonchocarpus subg. Phacelanthus Pittier. These genera as here defined are considered as natural groups, distinguished from each other mainly by the characteristics of the infIorescence. For the genus Lonchocarpus 23 species are recognized, 3 of which are new (L. grandiflorus, L. bahianus and L. montanus). For the genus Deguelia 17 species are recognized, 3 of which are new (D. glaucifolia, D. hatschbachii and D. duckeana), and 1 variety ¿ Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Ciências Biológicas

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6089.pdf: 2493882 bytes, checksum: b18fa0ec5dde486ef33533f0babf7c86 (MD5) Previous issue date: 2014-03-26
Universidade Federal de Sao Carlos
The fall armyworm Spodoptera frugiperda (SMITH, 1797) is a voracious pest of numerous crops of economic importance throughout the New World. In Brazil, their larvae can be attacked by several species of parasitic wasps, which are candidate to biological control agents against this pest. Surveying the parasitoid fauna on S. frugiperda in maize throughout Brazil two very morphological similar species of Campoletis are found. To ensure the efficiency of the biological control works, the knowledge about the taxonomy of the species related is necessary. Campoletis specimens emerged from Spodoptera frugiperda were studied mofologically and molecularly, in order to solve taxonomic problems among C. sonorensis (CAMERON, 1886) and C. flavicincta (ASHMEAD,1890). The samples came from three regions of Brazil: Santa Maria, RS; Ribeirão Preto, SP; Sete Lagoas, MG. Pictures from the type material of the two species were studied, besides the original descriptions of them. A possible sinonimy is indicated between the both species, for which the name C. sonorensis will be used based on the priority law for species names. A redescription is made to Campoletis sonorensis from Brazil, using morphological characters and DNA Barcoding.
Spodoptera frugiperda (SMITH, 1797) é uma praga voraz de diversas culturas de importância econômica no Novo Mundo. No Brasil, suas larvas podem ser atacadas por diversas espécies de vespas parasitóides que são candidatos a agentes de controle biológico contra essa praga. Pesquisando os parasitóides da fauna de Spodoptera frugiperda em cultivos de milho no Brasil, duas espécies do gênero Campoletis, muito similares morfologicamente, foram encontradas. Para garantir a eficiência dos trabalhos de controle biológico, é de grande importância o conhecimento taxonômico das espécies relacionadas. Exemplares de Campoletis emergidos de Spodoptera frugiperda foram estudados morfológica e molecularmente, a fim de resolver os problemas taxonômicos existentes entre as espécies C. sonorensis (CAMERON, 1886) e C. flavicincta (ASHMEAD,1890). Os exemplares foram provenientes de três regiões do Brasil: Santa Maria, RS; Ribeirão Preto, SP; Sete Lagoas, MG. Fotos de material tipo das duas espécies foram estudadas, além das suas descrições originais. Os resultados indicam uma possível sinonímia entre as duas espécies, para a qual será usado o nome C. sonorensis com base na lei da prioridade para o nome das espécies. Apresentamos uma redescrição para Campoletis sonorensis usando caracteres morfológicos e de DNA Barcoding.

Coptotermes (Isoptera: Rhinotermitidae) é um gênero de grande importância econômica que, no sudeste do Brasil, é responsável pela maioria dos estragos em materiais celulósicos. Nenhum estudo taxonômico havia sido feito anteriormente, para as espécies das Américas e, até o momento, apenas cinco espécies eram conhecidas na região. Este gênero, com distribuição pantropical, apresenta cerca de 80 espécies descritas no mundo e, por ser um grupo grande e bastante diversificado, existe uma carência de trabalhos de revisão taxonômica e a identificação das espécies é, freqüentemente, uma tarefa difícil. No presente trabalho, foi feito o estudo taxonômico do gênero Coptotermes, nas Américas. Além das cinco espécies conhecidas, C. havilandi, C. formosanus, C. testaceus, C. crassus e C. niger, reconheço agora 13 novos táxons, que apresento aqui como espécies novas. Juntamente com as descrições, acrescentei dados de morfometria, desenhos esquemáticos, imagens de microscopia eletrônica de varredura, mapas com a distribuição geográfica e chaves de identificação de todas as espécies, com exceção de C. niger, pois não pude examinar os tipos, nem identificar qualquer amostra, com certeza, como sendo desta espécie. Achei preferível manter tal nome e a descrição traduzida de SNYDER (1922), mas não posso afirmar que se trata de uma boa espécie por falta de dados. Apesar da grande quantidade de material estudado (730 amostras), grandes áreas geográficas, em especial a região norte e nordeste do Brasil e outros países da América do Sul, ainda carecem de material representativo. Com a realização de coletas mais extensivas, acredito que este número possa duplicar. Foi dada ênfase no estudo de Coptotermes havilandi, principal praga de madeiras do sudeste brasileiro. Para esta espécie, foi feito o estudo da biologia das colônias iniciais, observando-se o comportamento pós-revoada, escolha do substrato de nidificação, taxa de sobrevivência das colônias, tempo de pré-postura, período de incubação dos ovos, tempo de duração e taxa de mortalidade entre os instares dos operários, muda e porcentagem da casta de soldados, número e viabilidade de indivíduos por colônia e rejeição das câmaras de criação, pelos reprodutores. Os resultados do estudo da biologia evidenciam a grande plasticidade de C. havilandi, no estabelecimento de novas colônias, em diversos tipos de substratos, até mesmo nos considerados pouco propícios e, também, sem a necessidade de contato com o solo. Também foi feito o estudo da fenologia das revoadas desta espécie, na cidade de São Paulo, destacando a sazonalidade e horário das revoadas, assim como razão sexual dos alados. Sua capacidade de fazer revoadas esporádicas, fora do período de pico (entre agosto e outubro), durante quase todo o ano, além de sua ampla distribuição horária, evidenciam a alta plasticidade de C. havilandi na dispersão dos indivíduos e a grande capacidade reprodutiva da espécie, com a produção de alados durante quase o ano inteiro. Por último, foi feita a descrição do ninho desta espécie, que mostrou um padrão semelhante a outras descrições feitas previamente, para esta e outras espécies do gênero.
Coptotermes (Isoptera: Rhinotermitidae) is a genus economically important, responsible for most of the damage to wood in southeastern Brazil. No taxonomic study on American species is available, and so far only five species have been described in the Americas. Coptotermes has a pantropical distribution, with approximately 80 species described worldwide. Taxonomic reviews for this genus are scarse and the identification of species of this diversified group is often difficult. This work is a taxonomic study of the genus Coptotermes in the Americas. In addition to the five described species, C. havilandi, C. formosanus, C. testaceus, C. crassus and C. niger, I describe thirteen new taxa that are presented as new species. Together with the descriptions of species I include morphometric data, schematic drawings, scanning electron microscopy pictures, maps of the distribution of each species and an identification key for all species except C. niger, for which I could not examine the types neither identify samples with certainty. Therefore, I chose rather to retain the name and description given by SNYDER (1922), although I cannot show that it is actually a good species. Despite the high number of samples analyzed (730) representative data from big geographical areas, especially north and northeastern Brazil and the other countries of South America are still lacking. More extensive collects in these areas potentially can double the number of the known Coptotermes species in the Americas. I focused on the study of C. havilandi, which is the main pest of wood in southeastern Brazil. The biology of incipient colonies has been studied, recording post-swarming behavior, nest choice, survival rate of colonies, duration of pre-oviposition, incubation time for eggs, each instar’s duration, death rate between worker instars, moulting and proportion of soldiers, number and viability of individuals per colony, and rejection from reproductive chambers by the reproductives. The study of the biology shows the high plasticity of C. havilandi to founding colonies in different types of substrates, including some considered as poorly suitable and some lacking contact with the soil. The study of the phenology of swarms in São Paulo city reveals the seasonality and timing of swarms, as well as the sexual ratio of alates. The capacity to produce sporadic dispersal flights (i.e. out of the peak period from August to October) almost year round and during a large part of the day demonstrate the high plasticity of C. havilandi in its dispersal habit and high reproductive capacity. Finally, I describe the nest of C. havilandi, showing a similar pattern to previous descriptions for this and other species of the genus.

A recente proposta de uma nova classe de Cnidaria, Staurozoa, contribuiu para um melhor conhecimento sobre o grupo. Entretanto, os dados e hipóteses sobre a evolução, taxonomia, biologia e ecologia de Staurozoa ainda são limitados, especialmente com relação às espécies do hemisfério Sul. O objetivo deste estudo é: (1) rever caracteres tradicionalmente utilizados na taxonomia do gênero Haliclystus (alguns deles amplamente utilizados na taxonomia de Staurozoa em geral), (2) abordar questões relacionadas à ontogenia e ao ciclo de vida desses animais e (3) discutir e revisar homologias de Staurozoa e de outras classes de Medusozoa, subsidiando inferências evolutivas para o grupo. A espécie Haliclystus antarcticus foi utilizada como um modelo para Staurozoa em geral a fim de atingir os objetivos propostos. Contribuições para o conhecimento sobre a biologia e taxonomia do grupo provieram de estudos histomorfológicos e da redescrição de H. antarcticus. Dados moleculares, morfológicos e ecológicos foram utilizados em inferências sobre a ontogenia e o ciclo de vida de H. antarcticus. Discussões sobre homologias e ciclo de vida de outros Medusozoa provieram de dados histomorfológicos. As principais consequências do nosso estudo são: (a) os espécimes provenientes do Chile foram identificados erroneamente como H. auricula, e devem ser classificados como H. antarcticus; (b) muitos caracteres tradicionalmente utilizados na taxonomia do grupo são variáveis (intraespecificamente e ontogeneticamente) ou são interpretados incorretamente; (c) dados moleculares suportam a identificação da espécie Microhydrula limopsicola (Limnomedusae, Hydrozoa) como um estágio da vida de H. antarcticus, o que esclarece o ciclo de vida e a morfologia do grupo; (d) o significado evolutivo de alguns caracteres morfológicos e do ciclo de vida da classe Staurozoa foram revisados e discutidos em uma perspectiva mais ampla entre os Medusozoa.
The recent proposal of a new class of Cnidaria, Staurozoa, has contributed to a better knowledge on the group. However, data and hypotheses on evolution, taxonomy, biology, and ecology of Staurozoa are still limited, especially concerning species of the Southern Hemisphere. The aim of this study is: (1) to review characters traditionally adopted in the taxonomy of the genus Haliclystus (some of them widely used for Staurozoa taxonomy in general), (2) to address issues concerning the ontogeny and life history of these animals, and (3) to discuss and review homologies of Staurozoa and other classes of Medusozoa, subsidizing evolutionary inferences for the group. The species Haliclystus antarcticus was used as a model for Staurozoa in general in order to achieve the proposed goals. Contributions to the knowledge on the biology and taxonomy of the group came from histomorphological studies and the redescription of H. antarcticus. Molecular, morphological, and ecological data were used in inferences concerning the ontogeny and life cycle of H. antarcticus. Discussions on homologies and life cycle of other Medusozoa also came from histomorphological data. The main consequences of our studies are: (a) specimens from Chile were misidentified as H. auricula, and they should be assigned to H. antarcticus; (b) many characters traditionally adopted in the taxonomy of the group were demonstrated to be either variable or incorrectly interpreted; (c) molecular data have supported the assignment of the Hydrozoa Limnomedusae species Microhydrula limopsicola as a phase of the life cycle of H. antarcticus, what shed light on the understanding of the life cycle of the group and its morphology; (d) the evolutionary meaning of some morphological and life cycle characters in the class Staurozoa were reviewed and discussed in a broader perspective among the Medusozoa.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-10-08T20:04:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Fernanda Oliveira Silva.pdf: 4672072 bytes, checksum: d8d6d7a4d0ad4c8fce632f324f7bf82f (MD5)
Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-11-23T18:03:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Fernanda Oliveira Silva.pdf: 4672072 bytes, checksum: d8d6d7a4d0ad4c8fce632f324f7bf82f (MD5)
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CAPES
Ouratea Aubl. é o gênero mais diverso da família Ochnaceae possuindo cerca de 200 espécies distribuídas nas regiões tropicais e subtropicais do novo mundo. No Brasil ocorrem cerca 120 espécies, sendo 38 destas presentes na região Nordeste. O objetivo desse estudo foi realizar tratamento taxonômico de Ouratea na porção norte da Floresta Atlântica costeira, compreendendo do sul da Bahia até o norte do Rio Grande do Norte, visando conhecer a diversidade e distribuição do gênero na região. Para tanto, foram realizadas coletas botânicas e levantamento dos espécimes de Ouratea depositados nos herbários ALCB, ASE, CEPEC, EAN, HST, HUEFS, IPA, JPB, MAC, PEUFR, UFP e UFRN, o que permitiu os estudos morfológicos em amostras frescas e fixadas. As espécies foram descritas e ilustradas e uma chave para identificação das mesmas foi elaborada. Foram reconhecidas 20 espécies: O. bahiensis Sastre, O. cearensis (Tiegh.) Sastre, O. crassa Tiegh., O. conduplicata (Klotzsch) Engl., O. cuspidata, (A.St.-Hil.) Engl., O. fieldingiana (Gardner) Engl., O. gigantophylla (Erhard) Engl., O. hexasperma (A.St.-Hil.) Baill., O. longipes Sastre, O. palmata Ule, O. papulosa Sastre, O. parvifolia (A.St.-Hil.) Engl., O. platicaulis Sastre, O. polygyna Engl., O. pycnostachys (Mart.) Engl., O. rotundifolia (Gardner) Engl., O. salicifolia (A.St.-Hil. & Tul.) Engl., O. subscandes (Planch.) Engl. e O. venulata (Tiegh.) Sastre. Uma nova espécie para ciência foi descrita e ilustrada. Além disso, como consequência deste estudo, foi possível fazer uma lista comentada da família Ochnaceae para o Nordeste Oriental, que resultou na referência de 23 espécies, pertencentes a quatro gêneros de Ochnaceae s.l.: Elvsia DC. (1 espécie), Ouratea (15 spp.), Quiina Aubl. (4 spp.) e Sauvagesia L. (3 spp.), e um tratamento de Ochnaceae para a Flora do estado de Sergipe, sendo esta representada por 2 gêneros: Ouratea (7 espécies) e Sauvagesia (3 spp.). Os resultados permitiram ampliar a o conhecimento sobre as Ouratea e a família Ochnaceae na região Nordeste do Brasil.
Ouratea Aubl. is the most diverse genus of Ochnaceae s.s, with about 200 species distributed in tropical and subtropical regions of the new world. In Brazil occur approximately 120 species, of wich 38 occur in the Northeas. The aim of this study was to conduct a taxonomic treatment of Ouratea in the northern part of the coastal Atlantic forest, comprising a region from southern Bahia to the North of Rio Grande do Norte, to know he diversity and distribution of the genus in the region. For this purpose, we made botanical collections and surveys of specimens deposited in the herbaria ALCB, ASE, CEPEC, EAN, HST, HUEFS, IPA, JPB, MAC, PEUFR, UFP and UFRN, which allowed morphological studies with fresh and fixed material. The species were described and illustrated and a key for their identification was provided 20 species were recognized: O. bahiensis Sastre, O. cearensis (Tiegh.) Sastre, O. crassa Tiegh., O. conduplicata Engl., O. cuspidata, (A.St.-Hil.) Engl., O. fieldingiana (Gardner) Engl., O. gigantophylla (Erhard) Engl., O. hexasperma (A.St.-Hil.) Baill., O. longipes Sastre, O. palmata Ule, O. papulasa Sastre, O. parvifolia (A.St.-Hil.) Engl., O. platicaulis Sastre, O. polygyna Engl., O. pycnostachys (Mart.) Engl., O. rotundifolia (Gardner) Engl., O. salicifolia (A.St.-Hil. & Tul.) Engl., O. subscandes (Planch.) Engl. and O. venulata (Tiegh.) Sastre. One new species was described and illustrated. Also, as a consequence of this study, a cheklist of Ochnaceae for the Eastern part of Northeastern Brazil is presented, refering the occurrence of 23 species belonging to four genera: Elvasia DC. (1species), Ouratea (15), Quiina Aubl. (4) and Sauvagesia L. (3), and also a treatment of Ochnaceae for the Flora of the state of Sergipe presenting two genera: Ouratea (7 species) and Sauvagesia (3). The results increased the knowledge of Ouratea and Ochnaceae in the region.

Mestrado em Tradução Especializada
O projecto consiste na tradução de textos extraídos de um guia relativo à descrição das espécies de peixes da Ria de Aveiro, incluindo também as chaves das espécies traduzidas, de forma a facilitar o conhecimento das características principais de cada espécie e permitindo saber o que a define. O primeiro capítulo apresenta o projecto de biologia marinha. O segundo capítulo alude a uma base teórica que serve de fundamento ao trabalho de tradução, no qual existe uma breve introdução ao aparecimento da tradução e à sua importância no ensino, uma reflexão crítica acerca dos problemas da tradução geral e uma reflexão crítica acerca dos problemas específicos da tradução. O último refere-se aos textos científicos e literários.
It consists in a translation of texts from a guide about the specie’s description of the existing fishes in Ria de Aveiro, including the keys of the translated species, in a way that give us knowledge of the principal characteristics of species and that permit us to know what defines it. The first chapter presents the project of Marine biology. The second one refers to a theory basis to the translation’s work, in which appears a brief introduction to the beginning of the translation and the value of the translation in the school, a critical reflection about the general translation and its problems and about the specific problems of this one. The last one talks about the scientific and literary texts.

Orientador : Hermogenes de Freitas Leitão Filho
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-17T13:39:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tamashiro_JorgeYoshio_M.pdf: 8636620 bytes, checksum: 21c10d72ed032e6ba8772407338fadda (MD5) Previous issue date: 1989
Resumo: O gênero Piptadeinia Benth. S. l. possui distribuição pantropical. BRENAN (1995) propôs a divisão deste gênero em outros 8 no Brasil ocorrem 6: Goldmania, Newtonia, Anadenanthera, Piptadenia, Parapiptadenia e Pseudopiptadenia e destes paneas o primeiro não foi constatado no presente trabalho. Foram estudadas 18 espécies na região Sul-Sudeste. O estudo da arquitetura foliar mostrou-se eficiente para as espécies observadas. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: The genus Piptadenia Benth. S. l. has paantropical distribution. Brenan (1955) proposed division of this genera into others 8 and in Brazil occur 6: Goldmania, Newtonia, Anadenanthera, Piptadenia, Parapiptadenia and Pseudopiptadenia and of this only the first ween1t report in this work 18 species were studied from South-Southeast. The study of foliar architecture showed efficient for the species observed. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Mestrado
Mestre em Ciências Biológicas

La présente Thèse constitue une contribution à la connaissance de l’ultrastructure de la spermiogenèse et du spermatozoïde chez les Cestodes. Nous y présentons de nouvelles données spermatologiques ultrastructurales d’espèces appartenant à six ordres différents : Acanthobothrium crassicolle Wedl, 1855 (Tetraphyllidea), Aporhynchus menezesi Noever et al., 2010 (Trypanorhyncha), Barsonella lafoni de Chambrier et al., 2009 (Proteocephalidea), Clestobothrium crassiceps (Rudolphi, 1819) (Bothriocephalidea), Echinobothrium euterpes (Neifar et al., 2001) (Diphyllidea) et Molluscotaenia crassiscolex (von Linstow, 1890) (Cyclophyllidea). Les résultats obtenus sur la spermiogenèse et le spermatozoïde sont comparés avec ceux de Cestodes déjà étudiés, spécialement avec ceux appartenant aux ordres objet de notre étude. Enfin, nous discutons sur l’utilité des différents caractères spermatologiques ultrastructuraux en Taxonomie, Systématique et Phylogénie. L’étude spermatologique de Clestobothrium crassiceps constitue le premier travail fait sur le genre Clestobothrium et la onzième espèce de l’ordre Bothriocephalidea récemment créé. Les résultats obtenus sont comparés avec ceux des autres espèces de cet ordre, mais aussi avec ceux des Diphyllobothriidea, l’autre ordre créé à partir de l’ancien ordre des Pseudophyllidea. Concernant la spermiogenèse, les caractères les plus intéressants sont le type II de spermiogenèse et le corps intercentriolaire très réduit. On peut remarquer aussi le type II de spermatozoïde qui présente un anneau de microtubules corticaux, probablement une autapomorphie pour les Bothriocephalidea. L’étude ultrastructurale du Diphyllidea Echinobothrium euterpes montre la formation de deux flagelles de longueur différente. Dans les stades avancés de la spermiogenèse, après la fusion proximodistale, l’axonème court disparaît pour donner naissance à un spermatozoïde présentant un seul axonème. La spermiogenèse est du type I et le spermatozoïde correspond au type IV. Autres caractères intéressants chez les Diphyllidea sont la forte réduction ou absence de microtubules corticaux et la présence de masses denses associées aux centrioles dans la zone de différentiation. Ce dernier caractère peut être une synapomorphie pour les espèces de cet ordre. Aporhynchus menezesi présente un type I de spermiogenèse et un type I de spermatozoïde. Notre étude apporte les premières données chez la superfamille des Gymnorhynchoidea. Nous confirmons chez les Trypanorhyncha l’absence de corps en crête et la présence d’un arc de microtubules corticaux dans le spermatozoïde. L’étude de Acanthobothrium crassicolle est le troisième dans ce genre et confirme le type I de spermiogenèse et le type II de spermatozoïde. Ce type de spermatozoïde constitue la plus importante différence entre les onchobothriidés et les phyllobothriidés. Nous confirmons aussi la présence d’un arc de microtubules corticaux. Cependant, il est observé une hétérogénéité au niveau du corps intercentriolaire chez les Tetraphyllidea-Onchobothriidae. Barsonella lafoni est la septième espèce de l’ordre Proteocephalidea dont l’ultrastructure du spermatozoïde est analysée. Elle montre le patron I pour la spermiogenèse et aussi pour le spermatozoïde. Ces résultats sont concordants avec ceux des autres espèces étudiées, sauf Sandonella sandoni. Un corps intercentriolaire réduit et un arc de microtubules corticaux sont des caractères constamment présents chez les proteocephalidés étudiés. Chez B. lafoni nous avons décrit pour la première fois la présence d’un matériel dense aux électrons dans la zone de différentiation pendant les stades initiaux de la spermiogenèse. Il s’agit d’un caractère typique des ordres basaux des Eucestoda. Finalement, Molluscotaenia crassiscolex suit le type IV de spermiogenèse et son spermatozoïde est du type VI. Ces deux patrons coïncident chez les autres dilepididés étudiés. La morphologie particulière du corps en crête est le caractère le plus intéressant. Il est partiellement détaché dans sa partie moyenne. Nos résultats sont comparés avec les Dilepididae s.l.
The present Thesis constitutes a contribution to the knowledge of ultrastructure of spermiogenesis and the spermatozoon of cestodes. New spermatological data concerning species belonging to six orders of Eucestoda are presented. These species are Clestobothrium crassiceps (Rudolphi, 1819) (Bothriocephalidea), Echinobothrium euterpes (Neifar et al., 2001) (Diphyllidea), Aporhynchus menezesi Noever et al., 2010 (Trypanorhyncha), Acanthobothrium crassicolle Wedl, 1855 (Tetraphyllidea), Barsonella lafoni de Chambrier et al., 2009 (Proteocephalidea), and Molluscotaenia crassiscolex (von Linstow, 1890) (Cyclophyllidea). The obtained results on spermiogenesis and the spermatozoon are compared with the available data on the remaining eucestodes, particularly with the orders discussed in the present study. Moreover, the usefulness of different spermatological characters for Taxonomy, Systematics and Phylogeny is discussed.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-21Bitstream added on 2014-06-13T18:47:11Z : No. of bitstreams: 1 borges_m_dr_rcla.pdf: 2628207 bytes, checksum: 40dbe735f136f584dd31579f48cda251 (MD5)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
O presente trabalho aborda a taxonomia, distribuição batimétrica e biologia reprodutiva da classe Ophiuroidea. O material utilizado é procedente dos programas Biodiversidade Bêntica Marinha no Estado de São Paulo- BIOTA/FAPESP-Bentos Marinho, Avaliação do Potencial Sustentável dos Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva- REVIZEE/Score Sul-Bentos e Utilização Racional dos Ecossistemas Costeiros da Região Tropical Brasileira: Estado de São Paulo- INTEGRADO/Subprojeto Bentos. A área de coleta abrange os Estados do Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Os ofiuróides foram amostrados na região entremarés de praias arenosas, costões rochosos e fauna associada a algas, na plataforma e talude continental, até cerca de 800 m de profundidade, com maior riqueza de espécies na região da plataforma continental. Ao todo foram analisados 28.942 ofiuróides pertencentes a 39 espécies e 8 famílias. Amphiuridae foi a família mais representativa, principalmente na região da plataforma interna, seguida por Ophiuridae, que ocorreu principalmente em áreas de maior profundidade. Quatro espécies representam novos registros para o Brasil, Amphiodia trychna, Ophiochiton ternispinus, Ophiura (Ophiuroglypha) clemens e Ophiomusium eburneum. Ophiomusium acuferum, Ophiactis lymani e Ophiactis savignyi foram redescritas e discutidas esclarecendo equívocos de identificação. O estudo da distribuição batimétrica das espécies mostrou que os padrões observados são semelhantes aos descritos na literatura e estas foram agrupadas de acordo com os ambientes e faixas batimétricas em que ocorrem. A análise histológica das gônadas de Ophioderma januarii permitiu definir o padrão reprodutivo da espécie, a qual é gonocorística, reproduz-se durante todo ano, apresenta um aumento na atividade gonadal nos meses mais quentes e tipo de desenvolvimento lecitotrófico.
The present work approached the taxonomy, bathymetric distribution and reproductive biology of the Class Ophiuroidea. All material used came from three projects: Biodiversidade Bêntica Marinha no Estado de São Paulo- BIOTA/FAPESP-Bentos Marinho, Avaliação do Potencial Sustentável dos Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva- REVIZEE/Score Sul-Bentos and Utilização Racional dos Ecossistemas Costeiros da Região Tropical Brasileira: Estado de São Paulo- INTEGRADO/Subprojeto Bentos. Study area enclosed the Brazilian States of Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Ophiuroids were sampled from sandy beaches, sea shores and seaweed as associated fauna, continental shelf and continental slope (until ca. 800 m depth). It was analyzed 28.942 ophiuroids from 39 species and 8 families, and the highest species richness occurred on the continental shelf. Amphiuridae was the most representative family, mainly on the internal continental shelf, followed by Ophiuridae, which mainly occurred in greater depth areas. Four species are new registers to Brazil, Amphiodia trychna, Ophiochiton ternispinus, Ophiura (Ophiuroglypha) clemens and Ophiomusium eburneum. Ophiomusium acuferum, Ophiactis lymani and Ophiactis savignyi were redescribed and discussed, clarifying identification mistakes. The study of the bathymetric distribution of the species showed that the observed patterns were very similar to that described in other studies, and species were grouped according to the environment and bathymetric zones in which they occurred. The reproductive pattern of the gonochoric Ophioderma januarii was described by gonadal histological analysis; this species, that has a lecitotrophic development, reproduced continuously, with a gonadal activity increase during warmer months.

Orientador: Antonia Cecilia Zacagnini Amaral
Banca: Ana Maria Gouveia Monteiro
Banca: Érica Verônica Pardo
Banca: Tânia Márcia Costa
Banca: Fosca Pedini Leite
Resumo: O presente trabalho aborda a taxonomia, distribuição batimétrica e biologia reprodutiva da classe Ophiuroidea. O material utilizado é procedente dos programas "Biodiversidade Bêntica Marinha no Estado de São Paulo"- BIOTA/FAPESP-Bentos Marinho, "Avaliação do Potencial Sustentável dos Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva"- REVIZEE/Score Sul-Bentos e "Utilização Racional dos Ecossistemas Costeiros da Região Tropical Brasileira: Estado de São Paulo"- INTEGRADO/Subprojeto Bentos. A área de coleta abrange os Estados do Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Os ofiuróides foram amostrados na região entremarés de praias arenosas, costões rochosos e fauna associada a algas, na plataforma e talude continental, até cerca de 800 m de profundidade, com maior riqueza de espécies na região da plataforma continental. Ao todo foram analisados 28.942 ofiuróides pertencentes a 39 espécies e 8 famílias. Amphiuridae foi a família mais representativa, principalmente na região da plataforma interna, seguida por Ophiuridae, que ocorreu principalmente em áreas de maior profundidade. Quatro espécies representam novos registros para o Brasil, Amphiodia trychna, Ophiochiton ternispinus, Ophiura (Ophiuroglypha) clemens e Ophiomusium eburneum. Ophiomusium acuferum, Ophiactis lymani e Ophiactis savignyi foram redescritas e discutidas esclarecendo equívocos de identificação. O estudo da distribuição batimétrica das espécies mostrou que os padrões observados são semelhantes aos descritos na literatura e estas foram agrupadas de acordo com os ambientes e faixas batimétricas em que ocorrem. A análise histológica das gônadas de Ophioderma januarii permitiu definir o padrão reprodutivo da espécie, a qual é gonocorística, reproduz-se durante todo ano, apresenta um aumento na atividade gonadal nos meses mais quentes e tipo de desenvolvimento lecitotrófico
Abstract: The present work approached the taxonomy, bathymetric distribution and reproductive biology of the Class Ophiuroidea. All material used came from three projects: "Biodiversidade Bêntica Marinha no Estado de São Paulo"- BIOTA/FAPESP-Bentos Marinho, "Avaliação do Potencial Sustentável dos Recursos Vivos da Zona Econômica Exclusiva"- REVIZEE/Score Sul-Bentos and "Utilização Racional dos Ecossistemas Costeiros da Região Tropical Brasileira: Estado de São Paulo"- INTEGRADO/Subprojeto Bentos. Study area enclosed the Brazilian States of Rio de Janeiro, São Paulo, Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul. Ophiuroids were sampled from sandy beaches, sea shores and seaweed as associated fauna, continental shelf and continental slope (until ca. 800 m depth). It was analyzed 28.942 ophiuroids from 39 species and 8 families, and the highest species richness occurred on the continental shelf. Amphiuridae was the most representative family, mainly on the internal continental shelf, followed by Ophiuridae, which mainly occurred in greater depth areas. Four species are new registers to Brazil, Amphiodia trychna, Ophiochiton ternispinus, Ophiura (Ophiuroglypha) clemens and Ophiomusium eburneum. Ophiomusium acuferum, Ophiactis lymani and Ophiactis savignyi were redescribed and discussed, clarifying identification mistakes. The study of the bathymetric distribution of the species showed that the observed patterns were very similar to that described in other studies, and species were grouped according to the environment and bathymetric zones in which they occurred. The reproductive pattern of the gonochoric Ophioderma januarii was described by gonadal histological analysis; this species, that has a lecitotrophic development, reproduced continuously, with a gonadal activity increase during warmer months
Doutor

Submitted by isabela.moljf@hotmail.com (isabela.moljf@hotmail.com) on 2018-08-06T15:04:45Z No. of bitstreams: 0
Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-08-06T15:07:55Z (GMT) No. of bitstreams: 0
Made available in DSpace on 2018-08-06T15:07:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2016-03-17
Os parasitos do gênero Trypanosoma são descritos em uma ampla variedade de espécies de peixes. Devido ao pleomorfismo destes protozoários e à rara especificidade quanto ao hospedeiro vertebrado, muitas das espécies descritas podem ter sua validade contestada. Visando contribuir para o conhecimento dos tripanossomas de peixes que circulam no Brasil, este estudo apresenta a caracterização morfológica e morfométrica das formas tripomastigotas sanguíneas encontradas em cascudos Hypostomus affinis e Hypostomus luetkeni, de duas localidades no estado de Minas Gerais, aliada ao seu isolamento e manutenção em meios de cultura. A infecção por tripanossomas foi detectada em 100% de H. affinis e em 84,6% de H. luetkeni amostrados, com uma tendência no registro das parasitemias mais elevadas nos hospedeiros menores. As análises morfológicas permitiram o agrupamento dos tripomastigotas sanguíneos em quatro morfotipos distintos, sendo que dois aparentemente não apresentam semelhanças a nenhum outro tripanossoma de peixe já descrito no Brasil. O isolamento in vitro dos parasitos foi possível nos três meios bifásicos testados, enquanto a manutenção dos mesmos pôde ser realizada apenas no meio hiposmótico. O tempo necessário para observação dos primeiros epimastigotas in vitro diferiu entre as duas localidades. As formas evolutivas observadas por exame direto das culturas foram “esferomastigotas”, epimastigotas e tripomastigotas sendo o processo de multiplicação, caracterizado como divisão binária. A sequência de duplicação das organelas seguiu tanto o padrão registrado para tripanossomas de peixes de água doce, com segregação do cinetoplasto anterior à do núcleo, quanto de água salgada, com o núcleo se multiplicando anteriormente ao cinetoplasto. Ao final do processo de divisão puderam ser gerados dois tripomastigotas, dois epimastigotas ou um tripomastigota e um epimastigota. Os isolados deste trabalho apresentaram características in vitro distintas da única espécie isolada no Brasil, especialmente no que se refere às características fisiológicas e à ordem de divisão das organelas, sugerindo que eles possam pertencer a espécies distintas, o que só poderá ser confirmado por análises moleculares.
Parasites of the Trypanosoma genus have been described in a great number of fish species. Due to the pleomorphism presented by these protozoans and the rare specificity related to the vertebrate host, a lot of described species can have their validity questioned. Aiming to contribute with the knowledge about Brazilian fish trypanosomes, this study provides morphological and morphometric characterization of blood trypomastigotes from Hypostomus affinis and Hypostomus luetkeni collected in two sites of Minas Gerais state, along with their culture isolation and maintenance. The trypanosome infections were detected in 100% of H. affinis and 84,6% of H. luetkeni, showing a tendency of highest parasitemias on smaller hosts. The morphological analyses have allowed the distinction of four morphotypes, two of wich are possibly not related with any fish trypanosome species previously described in Brazil. The in vitro isolation of parasites was achieved in three biphasic media that were tested; however, their maintenance was possible only in the hyposmotic medium. The time required for the observation of first in vitro epimastigotes was different for each sampling site. The culture forms observed were spheromastigote-like, epimastigote and trypomastigote, and that latest two have showed a binary fission multiplication process. The multiplication sequence of cell organelles has followed the typical pattern of freshwater fish trypanosomes, with kinetoplast division starting before nucleus division, and also the salt water trypanosomes arrangement, with nucleus multiplication occurring previously to the kinetoplast. As result of the division process were generated two trypomastigotes, two epimastigotes, or one trypomastigote and one epimastigote. The trypanosomes isolates described here have showed in vitro features distinct from those of single trypanosome species isolated in Brazil, nominally: their physiological characteristics related to the medium growth and the division sequence of cell organelles. Altogether, these results can suggest that these trypanosomes could belong to different species; however, this hypothesis can only be confirmed by molecular analysis.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-02Bitstream added on 2014-06-13T20:49:36Z : No. of bitstreams: 1 capusso_gl_me_sjrp.pdf: 363056 bytes, checksum: a37d5259fb716bbb012c889820a1c4b8 (MD5)
O gênero Artibeus é composto atualmente de três subgêneros, sendo um subgênero usado para as maiores formas e os outros dois para as menores formas do grupo. O nível de parentesco entre as espécies do gênero é ainda alvo de muitas controvérsias. Nesse estudo foram analisados 187 indivíduos de quatro espécies de pequenos Artibeus brasileiros em quatro instituições diferentes, com o objetivo de separá-los, morfológica, morfometrica e biogeograficamente. Os animais foram examinados, através da retirada de 13 medidas corporais e 11 cranianas, com relação a sua distribuição geográfica e com eventuais características morfológicas; o teste estatístico multivariado, nos mostrou uma clara separação entre duas das quatro espécies em questão, sendo A. concolor a maior e a A. anderseni a menor delas; características morfológicas, como a coloração na borda e na região inferior da orelha, variação na coloração ventral e variação no número de molares inferiores resultaram em mais diferenças entre as espécies do estudo, inclusive separando as duas espécies sobrepostas nas análises quantitativas. Assim, as quatro espécies do trabalho são separadas com confiança e uma chave de identificação para esses animais é fornecida.
The genus Artibeus is composed of three subgenera: Artibeus is larger in size but Dermanura and Koopmania are smaller in size. The relationships between the species are unstable, which has resulted in much systematic controversy. In this study, we analyzed 187 specimens of the four species of small-sized Artibeus found in Brazil and deposited in four different institutions. Individuals were morphometrically examined by recording measurements of 11 external and 13 cranial characters to assess morphological and geographic variation. The multivariate analysis resulted in distinct difference between two of the four species with A. concolor the largest and A. anderseni the smallest in size. Morphological characters, such as coloration of the edge and inferior region of the ears, variation in ventral coloration and number of lower molars, enabled the differentiation of the two overlapping species in the quantitative analysis. The four species can be separated with certainty and a key for their identification is provided.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013.
Made available in DSpace on 2013-12-06T00:08:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 319753.pdf: 1321186 bytes, checksum: 340974d0e6666e16b102c1f24db09682 (MD5) Previous issue date: 2013
Políporos é um dos principais grupos de fungos decompositores de madeira, contudo, o conhecimento sobre sua diversidade ainda é escasso. Em Santa Catarina, a sinopse sobre a diversidade dos macromicetos apresenta 247 espécies de fungos, destas, 143 são poliporoides, principalmente da região insular. Para a continuidade e o avanço do conhecimento sobre a diversidade de fungos poliporoides que ocorrem na Mata Atlântica de Santa Catarina, foram estudados aspectos sobre a ecologia de comunidades fúngicas, particularmente de uma área pouco explorada, bem como um complexo taxonômico que ocorre na região. Primeiramente foi avaliada e caracterizada a comunidade de políporos em uma área de Floresta Ombrófila Densa do Parque Nacional da Serra do Itajaí, em termos de riqueza, abundância e funcionalidade. Entre os 152 espécimes coletados 58 espécies foram identificadas. Polyporus dictyopus, Perenniporia martia e Fuscoporia walhbergii foram as espécies dominantes. Com base nas frequências relativas nos diferentes tipos e substratos foram encontrados cinco grupos funcionais, dos quais dois formados por Phylloporia spathulata (em raízes vivas no solo) e Phylloporia chrysita (em lianas vivas) e os outros três constituídos por espécies saprofíticas, sendo cada grupo caracterizado pela presença de uma das espécies dominantes citadas. Finalmente, Phellinus piptadeniae é apresentada como um complexo taxonômico, em processo de especiação, a partir de evidências ecológicas (hospedeiro e distribuição geográfica) e filogenéticas.

Abstract : Polypores is one of the most important groups of wood-decay fungi; however, its diversity knowledge is still scarce. In Santa Catarina state, a synopsis of macrofungi diversity presented 247 species, of which 143 are polypores, mainly from insular region. In order to continue and improve the knowledge about the diversity of polypores, wich are occurring in the Atlantic Forest of Santa Catarina, ecological aspects of fungal communities were studied, in an unexplored area, as well as a complex taxonomy that occurs in the region. Firstly, was described the community of wood-decaying polypores in the Atlantic Rain Forest of Parque Nacional da Serra do Itajai, characterizing the community in terms of richness, abundance and functionality. Among 152 specimens collected 58 species were identified. Polyporus dictyopus, Perenniporia martia and Fuscoporia walhbergii were the dominant species. Based on the relative frequency in the different types of substrates where five functional groups were recognized. Two of them were formed by Phylloporia spathulata (on live roots in the ground) and Phylloporia chrysita (on live trunks); and three other functional groups, consisting of saprophytic species, each of them was characterized by the presence of one of the dominant species. Finally, Phellinus piptadeniae is presented as a taxonomic complex, in a speciation process, evidenced by the existence of two phylogenetic and ecological (host and geographic distribution) lineages.

Ácaros da família Ascidae sensu Lindquist e Evans, 1965 são encontrados em vários habitats, principalmente em folhedo, produtos armazenados e flores. Eles são mais conhecidos por seu hábito predatório, alimentando-se de ácaros, outros pequenos artrópodes e nematóides, mas muitas espécies também são conhecidas por se alimentarem de fungos, pólen e néctar, sendo algumas ainda relatadas em associação com baratas e traças. Uma vez que essas espécies apresentam potencial no controle de pragas no solo, sobre plantas ou em produtos armazenados, considera-se conveniente o estudo detalhado de sua taxonomia, fundamental para o desenvolvimento subsequente de estudos biológicos e ecológicos que possibilitem a utilização desses ácaros no controle de pragas. Este trabalho objetivou listar as espécies de Ascidae sensu Lindquist e Evans, 1965 descritas em todo o mundo, elaborar uma chave para auxiliar na separação dos gêneros desta família, identificar espécies disponíveis na coleção de referência de ácaros da ESALQ além de descrever espécies novas encontradas, redescrever a espécie Lasioseius floridensis Berlese de importância no controle biológico de praga, bem como avaliar o potencial dessa espécie no controle do ácaro branco. Um total de 901 espécies válidas pertencentes a 40 gêneros foi mencionado na lista de espécies de Ascidae sensu Lindquist e Evans (1965) e uma chave dicotômica foi elaborada para a separação dos gêneros dessa família. Duas espécies novas, uma de Blattisocius Keegan e outra de Proctolaelaps Berlese, foram descritas. A primeira foi coletada em associação com Tyrophagus putrescentiae (Schrank) (Acaridae) em ração comercial para cães, em Charqueada, enquanto a segunda foi coletada de flores de Heliconia angusta Vellozo, em Registro, ambas no Estado de São Paulo. Blattisocius keegani Fox e Lasioseius floridensis Berlese foram redescritas com base em exemplares coletados de Gerbera sp. (Asteraceae) no Estado de São Paulo. Uma chave para a separação das espécies de Blattisocius de todo o mundo foi elaborada. A biologia de L. floridensis foi estudada, por sua importância potencial como agente de controle biológico. Neste estudo, observou-se a possível limitação do efeito deste predador sob condições de baixa umidade. A diversidade de espécies de Ascidae sensu Lindquist e Evans (1965) foi estudada em flores tropicais em diversos pontos do Brasil. No total, 23 espécies, pertencentes a Asca Heyden, Cheiroseius Berlese, Iphidozercon Berlese, Lasioseius, Proctolaelaps e Tropicoseius Baker e Yunker foram identificadas; os maiores números de exemplares examinados pertencem às espécies Proctolaelaps n.sp 1 e Tropicoseius venezuelensis Baker e Yunker. A dinâmica populacional de ácaros desta família foi estudada em Piracicaba, determinando-se que a espécie mais comum foi T. venezuelensis, e que os maiores níveis populacionais destes ácaros ocorreram no final de um ano e início do ano seguinte.
Mites of the family Ascidae sensu Lindquist and Evans (1965) are found in various habitats, especially in litter, stored products and flowers. They are best known for their predatory habits on mites, other small arthropods and nematodes, but many are also known to feed on fungi, pollen and nectar, and some have been reported in association with cockroaches and moths. Given the potential of this mite group in the control of pests in the soil, on plants or stored products, detailed studies on their taxonomy are warranted. These studies can help further development of biological and ecological studies to enable their use in control pest. The aim of the present study was to list the world species of Ascidae sensu Lindquist and Evans (1965), to develop a dichotomous key to assist in the separation of the genera of the family, identify species deposited in the mite reference collection of ESALQ and describe new species found in the study, redescribe a species of Lasioseius Berlese of possible importance in biological control of pests, and to evaluate the potential of this species in the control of the broad mite, Polyphagortarsonemus latus (Banks) (Tarsonemidae). A total of 901 valid species belonging to 40 genera were cited in the species list and a dichotomous key was developed for the separation of the genera of this family. Two new species, one of Blattisocius and another of Proctolaelaps, were described. The former was collected in association with Tyrophagus putrescentiae (Schrank) (Acaridae) on a commercial dog food, in Charqueada, while the latter was collected from flowers of Heliconia angusta Vellozo, in Registro, both in the State of Sao Paulo. Blattisocius keegani Fox and Lasioseius floridensis Berlese were redescribed based on specimens collected from Gerbera sp. (Asteraceae) in the State of Sao Paulo. A key to the separation of world species of Blattisocius was prepared. The biology of L. floridensis was studied for its potential importance as a biological control agent. The possible limitation of this predator under low humidity was determined in the study. The diversity of Ascidae sensu Lindquist and Evans (1965) species was studied in tropical flowers in various parts of Brazil. A total of 23 species belonging to Asca, Cheiroseius, Iphidozercon, Lasioseius, Proctolaelaps and Tropicoseius were identified, the largest numbers of specimens referring to Proctolaelaps n.sp and Tropicoseius venezuelensis Baker and Yunker. The population dynamics of mites of this family was studied in Piracicaba, determining that the prevalent species was T. venezuelensis, and that the highest population level of the mite species occurred at the end of one year and the beginning of the following year.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia Vegetal.
Made available in DSpace on 2012-10-21T10:04:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 203280.pdf: 195363417 bytes, checksum: d4ae2cd433c0faa70e32f11307f4465f (MD5)
O trabalho em pauta tem como objetivo ampliar o conhecimento lignitafoflorístico do Permiano da Bacia do Paraná, em Santa Catarina, através do estudo taxonômico de lenhos oriundos do Planalto de Canoinhas, norte do Estado. Para isso foram realizadas seis viagens

Submitted by Lucas Henrique De Almeida null (lucasalmeida768@yahoo.com.br) on 2018-03-08T16:03:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Final FInal.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5)
Approved for entry into archive by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-03-08T18:09:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 almeida_lh_me_assis.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5)
Made available in DSpace on 2018-03-08T18:09:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 almeida_lh_me_assis.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5) Previous issue date: 2018-02-28
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
Plecoptera compreende uma ordem de insetos aquáticos com aproximadamente 3500 espécies conhecidas, sendo distribuídas em 16 famílias. No Brasil são registradas apenas duas famílias, sendo Gripopterygidae e Perlidae. Neste trabalho foram estudadas as espécies de Perlidae da Serra de Paranapiacaba, incluindo os Parques Estaduais Carlos Botelho (PECB), Intervales (PEI) e Turístico do Alto Ribeira (PETAR), Estado de São Paulo. Com o objetivo de integrar o conhecimento taxonômico ao molecular, obtendo identificações de adultos e a associação adulto-ninfa utilizando DNA Barcode. Foram registradas 14 espécies, sendo Anacroneuria representado por nove espécies: A. boraceiensis, A. debilis, A. fiorentini, A. flintorum, A. iporanga, A. itajaimirim, A. polita, A. subcostalis e A. tupi. Kempnyia por quatro espécies: K. auberti, K. colossica, K. flava e K. neotropica. Macrogynoplax por apenas uma espécie: M. veneranda. Foram realizados dois novos registros (Anacroneuria debilis e A. fiorentini), duas descrições de imaturos (A. flintorum e A. tupi) e uma sinonimização (Kempnyia petersorum). Adicionalmente, é fornecida uma chave de identificação de adultos da região.
Plecoptera comprises an order of aquatic insects with aproximately 3500 species, distributed in 16 families. In Brazil, only two families are recorded, being Gripopterygidae and Perlidae. In this work, were studied the species of Perlidae from Paranapiacaba mountains, including the Carlos Botelho State Park (PECB), Intervales State Park (PEI), and Alto Ribeira Tourist State Park (PETAR), São Paulo State. With the objective of integrating the taxonomic knowledge to the molecular, obtaining identifications of adults and the adult-nymph association using the DNA Barcode. Were recorded fourteen species, being Anacroneuria represented by nine species: A. boraceiensis, A. debilis, A. fiorentini, A. flintorum, A. iporanga, A. itajaimirim, A. polita, A. subcostalis and A. tupi. Kempnyia by four species: K. auberti, K. colossica, K. flava and K. neotropica. Macrogynoplax by only one species: M. veneranda. Were made two new records (Anacroneuria debilis and A. fiorentini), two descriptions of nymphs (A. flintorum and A. tupi), and one synonymization (Kempnyia petersorum). In addition, a key is provided for the identification of adults from the region
FAPESP: 2015/22008-9

Orientador: Graziela Maciel Barroso
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-17T23:11:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peixoto_ArianeLuna_D.pdf: 27089899 bytes, checksum: 97abc06f93c3dd583dd2d71102ed0a5e (MD5) Previous issue date: 1987
Resumo: O tratamento taxonômico aqui dado ao gênero Mollinedia configura-o como compreendendo 72 espécies de árvores ou arbustos ocorrentes em ecossistemas florestais, predominantemente como integrante do sub-bosque e mais raramente como árvore dos estratos superiores. As espécies estão distribuídas em três áreas distintas: Sul do México e América Central (11 espécies), Norte da América do Sul (24 espécies) e Nordestes, Sudeste e Sul do Brasil (37 espécies). O gênero é distinto dos demais da tribo Mollinedieae ocorrentes na região Neotropical por apresentar os lobos do cálice aproximadamente do mesmo comprimento do receptáculo hipantoide, nos demais gêneros da tribo os lobos são maiores ou menores do que o receptáculo. A análise de cerca de 1500 duplicatas de espécies do gênero, associada a observação de campo, evidenciou a estreita relação que existe entre os membros de Mollinedia e a dificuldade na delimitação dos taxons, sendo necessária a associação de caracteres vegetais e florais para defini-los. É apresentada uma chave para identificação dos gêneros Neotropicais de Mollinedia. Para cada espécie é dada a sinonimia, a descrição, distribuição geográfica e habitats ocupados, nomes comuns (quando pertinentes) e espécimes estudadas. São apresentados dados sobre a biologia floral, a utilidade econômica e o número de cromossomos de algumas espécies. Neste trabalho seis novas espécies são descritas e 16 binômios são propostos como novos sinônimos. M. ovata Ruiz et Pavon é escolhido como espécie tipo para o gênero
Abstract: The taxonomic given to the genus Mollinedia comprises 72 species. These species include trees and shrubs occuring in forest ecossystems, more frequently represented in the undestory with occasional individuals reaching the canopy level. Geographic distribution of the Mollinedia species includes three areas: Southern Mexico America (11 species), Northern South America (24 species) and Northeastern, Southeastern and Southern Brazil (37 species). Mollinedia can be distinguished from the other genera of the Mollinedieae tribe that occur in the Neotropical Region its calyx length being equal to the hypanthoid receptacle length; in all other genera the calyx is shorter or longer. A study of 1500 herbarium specimes and associated field observations showed a close affinity among the Mollinedia species, and stressed the difficulty in seeting species limits. This was made possible by the use of vegetative and floral features. A key for identification of Neotropical Mollinedieae genera is presented as well as for Mollinedia species. Synonymy, description, distribution, habitat, vernacular names and herbarium specimes are presented for each species. Floral biology was studied for some species and economic uses and chromosome number registerd for others. Six new species are described and 16 are regarded as new synonyms. M. ovata Ruiz et Pavon is chooser as the type species of the genus Mollinedia
Doutorado
Doutor em Cencias Biologicas

Orientador: George John Shepherd
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-05T09:40:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vitta_FabioAugusto_D.pdf: 17609872 bytes, checksum: cf817a5c1eafb5f015046181c424903d (MD5) Previous issue date: 2005
Resumo: Este trabalho constitui-se de três capítulos relacionados à taxonomia e a morfologia dos gêneros Cryptangium Schrad. ex Nees e Lagenocarpus Nees (Cyperaceae: Cryptangieae). Ambos os gêneros apresentam distribuição exclusivament neotropical. O Capítulo 1 referente à anatomia e morfologia dos frutos, elaborado com base em estudo de microscopia óptica e eletrônica de varredura, mostrou que nos gêneros em estudo a chamada "frutificação" é, na verdade, um aquênio do tipo comumente encontrado em Cyperaceae. O estudo dos frutos revelou características morfoanatômicas importantes para o reestabelecimento de Cryptangium e a delimitação de ambos os gêneros, além de importantes caracteres utlizados na delimitação específica. No Capítulo 2 foram examinadas populações naturais de Lagenocarpus rigidus e L. tenuifolius, de difícil delimitação, bem como os morfotipos intra-específicos, definidos pela coloração das lâminas foliares e brácteas. A análise morfométrica de 133 indivíduos em 17 populações de ambas espécies mostrou que estas são distintas entre si, e que os morfotipos intra-específicos existentes, facilmente distinguíveis na natureza, apresentam correlações morfológicas e anatômicas, reveladas também por estudo anatômico de lâminas foliares. Ainda neste capítulo, é mostrado um estudo fenológico, realizado na Serra do Cipó em Minas Gerais, que se extendeu por 14 meses e envolveu 240 indivíduos de 24 populações. Tal estudo revelou, entre outras coisas, que os morfotipos intra-específicos de L. rigidus apresentam, entre si, uma clara distinção nos padrões de floração e frutificação O estudo taxonômico no Capítulo 3 foi feito com base em material examinado em 39 herbários, coletas em campo e acompanhamento de populações naturais. No trabalho são aceitos como distintos os gêneros Cryptangium e Lagenocarpus, com base em dados apresentados no Capítulos 1 e em dados apresentados no próprio Capítulo 3. Foram aceitas a existência de 14 espécies, sendo duas novas para a ciência, e duas subespécies de Cryptangium e 12 espécies e duas subespécies de Lagenocarpus. Todas as espécies foram descritas, ilustradas e comentadas, além de serem apresentados mapas de distribuição geográfica das mesmas
Abstract: This study is composed of three chapters related to the morphology and the taxonomy of Cryptangium Schrad. ex Nees and Lagenocarpus Nees (Cyperaceae: Cryptangieae). In Chapter 1 a study carried out using optical and scanning microscopy revealed that the so called "fructification" is in fact a typical achene characteristic for the family. The study showed important morphoanatomical features for the re-establishment of Cryptangium and for species delimitation. In Chapter 2 we examined natural populations of Lagenocarpus rigidus and L. tenuifolius and as well their infraspecific morphotypes which were defined by leaf and bract coloration. A morphometric study using 133 plants from 17 populations showed that the two species are distinct and the morphotypes are correlated to morphological and anatomical features. This chapter also presents a phenological study using 240 plants from 24 populations carried out in the Serra do Cipó region in Minas Gerais state. The phenological study showed clear differences in the seasonal patterns of flowering and fruiting between the infraspecific morphotypes of L. rigidus. For the taxonomic study in Chapter 3 material from 39 herbaria and collected in the field by the author was examined. The genus Cryptangium Schrad. ex Nees and Lagenocarpus Nees are accepted as distinct based on data presented in chapters 1 and 3. For Cryptangium 14 species including two ones and two subespecies are accepted. For Lagenocarpus 12 species and two subsepecies are accepted. Descriptions, illustrations and comments were presented, as well maps on the geographic distribution of the species
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Biologia Vegetal

SANTOS, Elaiza Rodrigues da, também é conhecida em citações bibliográficas por: ROCHA, Elaiza Rodrigues da
Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-08T17:05:32Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Elaiza Rodrigues da Rocha Santos.pdf: 3614351 bytes, checksum: 2e856076082db309f1dc8c3b37fb732d (MD5)
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CNPq
Myxomycetes são microrganismos eucariontes, aclorofilados, cujo ciclo de vida inclui uma fase móvel, amebóide ou plasmodial, e uma fase fixa, esporulante. Abrangem ca. de 900 espécies, distribuídas em regiões tropicais, subtropicais, temperadas e frias. O gênero Arcyria Wigg. (Trichiaceae, Trichiales, Myxogastromycetidae) compreende 50 espécies, das quais 20 têm registros para os Neotrópicos e 17 para o Brasil. No presente trabalho, atualizou-se a lista das espécies de Arcyria com ocorrência conhecida para os Neotrópicos (1828-2015) e efetuou-se o estudo das espécies ocorrentes no Nordeste do Brasil. Foram revisadas as coleções dos Herbários Geraldo Mariz (UFP), Pe. Camile Torrend (URM) e Dárdano de Andrade Lima (IPA), sediados em Recife, Pernambuco, e Lauro Pires Xavier (JPB), em João Pessoa, Paraíba; estabeleceu-se o nível de conservação de todas as exsicatas do gênero procedentes dos nove estados do Nordeste do Brasil e as informações contidas nas etiquetas de cada espécime foram compiladas para formação de banco de dados taxonômicos e ecológicos. Foram elaboradas chave de identificação, descrições e ilustrações das 18espécies registradas na Região Nordeste. O gênero está bem representado na região, com 85,7% das espécies conhecidas para os Neotrópicos. Distribui-se nos nove estados, desde as florestas úmidas costeiras até o semi-árido do agreste e sertão, incluindo brejos de altitude (4°02’ a 15°08’ S e 34°51’ a 42º19’ W). A Floresta Ombrófila Densa é o tipo de ambiente com maior riqueza de espécies (16). Arcyria cinerea e A. denudata têm ampla distribuição, boa representatividade nos herbários e estão presentes em quase todos ostipos de vegetação, incluindo manguezais; A. insignis ocorre também em tabuleiros costeiros, caatinga arbustivo-arbórea e manchas de cerrado; A. cinerea, A. denudata, A. globosa e A. insgnis foram registradas em Floresta Pré-Amazônica, estando também presente em Floresta Ombrófila Densa, de Terras Baixas e Sub-montana. As outras espécies são raras ou pouco comuns e ocorrem nas florestas úmidas costeiras. Uma lista atualizada registrou 22 espécies do gênero Arcyriapara os Neotrópicos entre 1828-2015, incluindo o primeiro registro de A. incarnata(Pers. ex JF Gmel. Pers) e A. obvelata (Oeder) Onsberg para a Nicarágua, e A. obvelata para as Bahamas. Arcyria marginoundulata Nann.-Bremek. & Yamamoto, coletada no estado de Pernambuco, é referida pela primeira vez para Região Neotropical.
Myxomycetes are eukaryotic microorganisms that lack chlorophyl, whose life cycle includes a mobile plasmodial phase and a sessile amoeboid phase, the latter producing spores. It includes circa 900 species, distributed in tropical, subtropical, temperate and cold regions. Arcyria Wigg. (Trichiaceae, Trichiales, Myxogastromycetidae) includes 50 species, of which 20 have been recorded in the Neotropics and 17 in Brazil. In this work, the list of all known Arcyria species occurring in the Neotropics was updated (1828-2015), and the species of this genus occurring in the Northeast of Brazil were studied. The collections of Geraldo Mariz Herbarium (UFP), Pe. Camile Torrend (URM) and Dárdano de Andrade Lima (IPA), located in Recife, Pernambuco, and Lauro Pires Xavier (JPB), located in João Pessoa, Paraíba, were reviewed; the conservation status of all exsicatti was established, including material coming from the nine states of Northeasten Brazil, and the information on each label was compiled in order to elaborate a taxonomic and ecological database. Identification key, descriptions and illustrations of the recorded 18 species were elaborated. The genus is well represented in the Neotropics, with 85.7% of the known species ocurring in the region. It occurs in the nine states of Northeastern Brazil, from coastal rainforests to the semi-arid Agreste and Sertão zones, including Caatinga enclaves moist forests (4° 02' to 15° 08' S and 34° 51' to 42º 19' W). Ombrophilous Dense Lowland Forests had the highest species richness (16). Arcyria cinerea and A. denudata are widely distributed, well represented in Herbaria and are present in almost all studied types of vegetation, including mangroves; A. insignis occurs in coastal plains, Caatinga, coastal tabuleiros and Cerrado; A. cinerea, A. denudata, A. globosa and A. insgnis were registered in "pre-Amazon" forests, and are also present in evergreen, lowlands and submontane forests. The other species are rare or uncommon and occur mainly in coastal rainforests. An up to date list of the 21 Arcyria species recorded in the Neotropics between 1828-2015 is presented, including the first record of A. incarnata(Pers. ex JF Gmel. Pers) and A. obvelata (Oeder) Onsberg to Nicaragua, and A. obvelata to the Bahamas. Arcyria marginoundulata Nann.-Bremek. & Yamamoto, collected in Pernambuco state, is recorded for the first time in the Neotropics.

Orientador: Gilberto José de Moraes
Resumo: Em diversos países, muitas empresas têm investido valores significativos na viabilização do uso do controle biológico de pragas, em função da demanda do mercado por produtos alimentícios saudáveis, livres de resíduos químicos. O uso de ácaros predadores tem crescido significativamente nos últimos anos principalmente com ácaros das famílias Phytoseiidae, Laelapidae e Macrochelidae, no entanto outras famílias como Ascidae, Blattisociidae e Melicharidae têm demonstrado bons resultados em laboratório no controle de pragas. Dentro da linha de trabalho priorizada pelas instituições em que o presente trabalho foi conduzido (FCAV/UNESP e ESALQ/USP), o objetivo deste trabalho foi conhecer a fauna de ácaros das famílias Ascidae, Blattisociidae e Melicharidae nas diferentes regiões do Brasil e estabelecer bases de dados sobre a ocorrência destes no Globo Terrestre. Espécimes disponíveis na Coleção de Referência de Ácaros da ESALQ/USP e coletados pelo autor deste documento foram analisados e identificados, descrevendo-se três espécies novas para a ciência e redescrevendose uma espécie (Leioseius basis Karg, 1994). Foram também criadas bases de dados sobre a distribuição de ácaros destas três famílias e sobre os substratos em que foram encontrados, para disponibilização "on-line". No total, foram examinados 1657 exemplares, de 76 espécies de 19 gêneros. Vinte e seis espécies e três dos gêneros encontrados eram novos para a ciência e destes taxa, três espécies novas (uma... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: In several countries, many companies have invested significant amounts in making viable the use of biological control of pest organisms, due to the demand for healthy food products, free of chemical residues. The use of predatory mites have grown significantly in recent years especially with mites Phytoseiidae families, and Laelapidae Macrochelidae, however other families like Ascidae, Blattisociidae Melicharidae and have shown good results in the laboratory to control pests. In line the research priorities of the institutions in which this work was conducted (FCAV/UNESP and ESALQ/USP), the objective of this work was to investigate the mite fauna of the families Ascidae, Blattisociidae and Melicharidae in different regions of Brazil and to establish databases on the world occurrence and substrates of these mites. Specimens available at ESALQ/USP Mite Reference Collection and specimens collected by the author of this document were analyzed and identified, describing three species new to science and redescribing a species (Leioseius basis Karg, 1994). The work also involved the establishment of databases on the distribution of mites of these three families and on substrates that have been found, for online availability. In total, 1657 specimens from 76 species of 19 genera were examined. Six species and three genera found were new to science and from these taxa, three new species (one Leioseius and two Cheiroseius) were described. Two dichotomous taxonomic key... (Complete abstract click electronic access below)
Doutor

Orientador: Marlies Sazima
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-04T22:48:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pansarin_EmersonRicardo_D.pdf: 5740977 bytes, checksum: b8a38716f8e2e6697ba77e6ff49e8303 (MD5) Previous issue date: 2005
Resumo: Neste trabalho foi realizada a revisão taxonômica, o estudo químico e micromorfológico das ceras epicuticulares, bem como estudados os processos de polinização e os polinizadores de representantes sul-americanos do gênero Cleistes. Foi, também, elaborada uma hipótese filogenética da subtribo Pogoniinae com base em caracteres morfológicos e moleculares, através do seqüenciamento das regiões ITS (nrDNA), e rps16 e trnL-F (cpDNA). O gênero Cleistes apresenta 17 espécies distribuídas entre as Américas Central e do Sul, ocorrendo principalmente em regiões de cerrado do Brasil central. Três dessas espécies foram descritas durante a elaboração do presente trabalho e estão aqui apresentadas. Através do estudo da hipótese filogenética de Pogoniinae foi verificado que essa subtribo apresenta dois clados bem sustentados. Um clado é norte-americano-asiático, e inclui os gêneros Pogonia, Isotria e as espécies norte-americanas de Cleistes. O outro é centro-sul-americano e inclui as espécies de Cleistes distribuídas entre as Américas Central e do Sul. Com o desenvolvimento do presente estudo, incluindo a maioria das espécies de Cleistes nas análises, pode ser demonstrado que esse gênero é parafilético, concordando com os dados publicados por Cameron & Chase (1999). As espécies norte-americanas de Cleistes estão mais relacionadas com os gêneros norte-americano-asiáticos Isotria e Pogonia do que com as espécies centro-sul-americanas de Cleistes. A subtribo Pogoniinae também é parafilética. O saprofítico gênero Pogoniopsis está mais relacionado com representantes dos gêneros Galeola e Cyrtosia (Galeolinae) do que com os demais gêneros pertencentes à subtribo Pogoniinae. Duckeella, um gênero endêmico da Amazônia e irmão das Pogoniinae, não apresenta os caracteres sinapomórficos que define essa subtribo, devendo ser transferido para a subtribo Duckeellinae. Espécies de Cleistes apresentam micromorfologia das ceras epicuticulares existentes nas folhas variando desde lisas, com grânulos, ou até formando placas. As ceras epicuticulares de Cleistes são constituídas principalmente por álcoois, ácidos e ésteres. A composição química das ceras epicuticulares das folhas de espécies de Cleistes é muito variável entre espécies, podendo ser usada na delimitação específica dentro do gênero. Espécies de Cleistes, assim como as demais Pogoniinae, são polinizadas principalmente por abelhas, embora C. libonii apresente beija-flores do gênero Phaethornis como co-polinizadores. Espécies sul-americanas de Cleistes apresentam picos de floração, em que todos os botões maduros de cada planta abrem simultaneamente no mesmo dia. As flores das espécies estudadas são pouco duráveis (geralmente um dia), e oferecem néctar aos polinizadores. O néctar é produzido em nectários glandulares da base do labelo das flores. Para os gêneros norte-americano-asiáticos esses nectários estão ausentes e as abelhas são atraídas às flores por engano. Esse estudo sustenta a hipótese de evolução de flores de engano para flores de néctar
Abstract: The taxonomic revision, the micromorphological and chemical study of the epicuticular waxes, as well as the pollination processes and pollinators of the genus Cleistes were reported. A phylogenetic inference within Cleistes and among genera of subtribe Pogoniinae was also established, based on morphology and nrDNA (ITS) and cpDNA (trnL-F and rps16) sequence data, and using maximum parsimony. The genus Cleistes includes 17 species distributed among Central and South America, occurring mainly in ¿cerrado¿ areas of Central Brazil. Three of these species are new and were described in the present study. The phylogenetic study of Pogoniinae showed that this subtribe presents two well-supported clades. One clade is North-American-Asiatic and includes the genera Isotria, Pogonia and the North-American species of Cleistes. The other clade is Central-South-American and includes the species of Cleistes occurring in Central and South America. The genus Cleistes, in agreement to Cameron & Chase (1999), is paraphyletic. The North American species of Cleistes are more related to the North American-Asiatic genera Isotria and Pogonia than to the remaining species of Cleistes. The subtribe Pogoniinae is also paraphyletic. The saprophytic genus Pogoniopsis is more related with Galeola and Cyrtosia (Galeolinae) than to the remaining genera currently recognized within subtribe Pogoniinae. The Amazonian genus Duckeella, sister of all remainder of Pogoniinae, lacks the synapomorphic characters that define this subtribe, and should be transferred to the subtribe Duckeellinae. Species of the genus Cleistes present micromorphology of the epicuticular waxes of the leaves varying from a singular film to forming granules or platelets. The epicuticular waxes in Cleistes are constituted mainly by alcohols, acids and esters. The chemical compounds of epicuticular waxes of Cleistes were very variable among species, and may be used for specific delimitation within the genus. Species of Cleistes, as for remaining Pogoniinae, are pollinated mainly by bees, although C. libonii is co-pollinated by hermit hummingbirds. The South American species of Cleistes presents flowering peaks, in which all mature buds of each plant flowering simultaneously on the same day. The studied species produced short-lived flowers (generally one day), which offer nectar as reward produced by two nectariferous glands on the basis of the lip. For the North American-Asiatic genera these nectariferous glands are absent and the floral visitors are attracted by deceit. This study supports the evolution of deceptive flowers to nectar flowers
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Biologia Vegetal

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6480.pdf: 1713092 bytes, checksum: 7682b21d5ab678d6b42870e1ac14451b (MD5) Previous issue date: 2014-10-27
Universidade Federal de Sao Carlos
Physalaemus is the largest genus, with regard to number of species, of the subfamily Leiuperinae, the taxonomy of which has been the subject of recent studies due to the high intraspecific and low interspecific variation within the group, with patterns of variation possibly related to geographic distribution. The Physalaemus albifrons species was first collected by Johann Baptiste von Spix in 1824, and its type locality is the "Province of Bahia", even though it is distributed from Maranhão to Minas Gerais, in regions characterized by the Caatinga morphoclimatic zone in areas of transition with the Cerrado. Due to the variation in the dorsal pattern found in Physalaemus albifrons, authors have put foward the hypothesis of the species being included in a species complex, meaning there would be more species registered under a single common name. Based on this, 98 individuals were studied, associated with each sampled location by means of analysis of morphological and morphometric characters, thus redescribing the species. Physalaemus albifrons presents four intrapopulational dorsal coloration patterns, varying from homogeneously spotless; longitudinal and irregular linear dark spots; as well as dark spots in an omega-like pattern. The second tubercle next to the tibiotarsal articulation, the absence of inguinal glands and the snout-vent length from 18,1 mm to 33,8mm proved to be diagnostic features in order to differentiate Physalaemus.albifrons from other species of the genus. This species, which may also be described as being average-sized for this genus, with the head greater in width than in length; and the snout subelliptical in dorsal view. The populations presents morphological variation as to the distinction of the tympanic ring which might be visible in some individuals and indistinguishable in others, leading to the definition of two morphological groups which are unified through canonical discriminant analysis, therefore discarding the possible characterization of the species complex in Physalaemus albifrons.
Physalaemus é o maior gênero em número de espécies da subfamília Leiuperinae, cuja taxonomia tem sido alvo de recentes estudos devido à elevada variação intraespecífica e baixa variação interespecífica apresentada pelo grupo, com padrões de variação possivelmente relacionados com a distribuição geográfica. A espécie Physalaemus albifrons foi coletada pela primeira vez por Johann Baptiste von Spix em 1824 e a localidade tipo registrada é Província da Bahia , contudo está distribuída desde o Maranhão até Minas Gerais, em regiões caracterizadas pelo domínio morfoclimático da Caatinga em áreas de transição com o Cerrado. Devido à variação no padrão de desenhos dorsais apresentada por Physalaemus albifrons, autores levantam a hipótese de a espécie estar incluída em um complexo de espécies, ou seja, haveriam mais espécies registradas sob um mesmo nome. Baseando-se nisto, 98 exemplares foram estudados, associados a cada localidade amostrada, analisando-se caracteres morfológicos e morfométricos, redescrevendo-se a espécie. Physalaemus albifrons apresenta quatro padrões intrapopulacionais de coloração dorsal, variando de homogêneo sem manchas, com manchas escuras lineares longitudinais e irregulares e também com manchas escuras em padrão de ômega. O segundo tubérculo presente próximo da articulação tíbio-tarsal, a ausência de glândulas inguinais e o comprimento rostro cloacal de 18,1-33,8 mm se mostraram características diagnósticas para diferenciar Physalaemus albifrons das demais espécies do gênero. Esta espécie, podendo ainda ser descrita como de tamanho médio para este gênero, com a cabeça mais larga do que longa e o focinho subelíptico em vista dorsal. As populações apresentam variação morfológica quanto à distinção do aro timpânico, que pode ser visível em alguns exemplares e indistinguível em outros, definindo-se dois grupos morfológicos unificados através da análise de discriminante canônica, descartando-se, assim, a possibilidade de caracterização do complexo de espécies em Physalaemus albifrons.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseWMS.pdf: 7109972 bytes, checksum: 8f02b270f0ce729f9b0496bbd61eb1ae (MD5) Previous issue date: 2003-07-30
Universidade Federal de Minas Gerais
In the present work, the diversity of the Copepoda Cyclopoida from Sao Paulo State was studied. Samples of zooplankton were collected along with water samples were collected in 22 Hydrographic Management Units (UHGRH) of the State. Different environments, such as Reservoirs, Ponds, and Rivers were sampled totalizing 207 water bodies. All of them were positioned by using GPS. Samples of zooplankton were collected using net with 68µm of mesh size. Vertical hauls were performed in limnetic zone, while in littoral zone horizontal hauls and bucket were used. The plankton samples were preserved in formaldehyde 4%. Identifications of Cyclopoida were achieved using adult females forms. The data thus obtained were submitted to the SinBiota World Web Site where Geographical distribution of Cyclopoida was plotted to the map of the Sao Paulo State using the geographic coordinates obtained from GPS. It was compared the biodiversity and abundance of Cyclopoida in Reservoirs with different trophic degrees located in the Basins of rivers Tietê, Ribeira do Iguape, and Grande. ITS 2 sequence of DNA of the Cyclopoida was obtained for the following species: Thermcyclops decipiens, Thermocyclops inversus, Mesocyclops ogunnus and Mesocyclops longisetus longisetus. Number of chromosomes Mesocyclops longisetus longisetus was counted and a chromatin diminution observed. New Cyclopoida species, Thermocyclops n. sp., was first described and five species, Acanthocyclops robustus, Eucyclops elegans, Eucyclops cf. prinophorus, Microcyclops alius, and Mesocyclops aspericornis, were newly registered in the São Paulo State. With this, there are now 10 genera and 26 species recorded in the Sao Paulo State. A key to genres and species in the São Paulo State was proposed based on morphological differences, including draws from the anatomical characteristics which are important for taxonomy. It was proved that species identified earlier in the São Paulo State as Mesocyclops kieferi and Mesocyclops brasilianus were actually confused with species Mesocyclops ogunnus and Mesocyclops meridianus, respectively. It was found that Pacyclops fimbriatus, recorded earlier in the Broa Reservoir, is actually Pacyclops chiltoni inhabiting Sao Paulo water bodies. Thermocyclops decipiens was found to be the most broadly distributed species of the Cyclopoid recorded in 20 of 22 hydrographic units followed by Mesocyclops longisetus longisetus recorded in 16 units and Thermocyclops mintus, Mesocyclops ogunnus and Mesocyclops meridianus recorded in 15 units. Based on our observations, we concluded that, in contrast to the common opinion, highly eutrophicated Reservoirs present the highest species richness and distribution equitability as compared to oligotrophic ones. It was found that Acanthocyclops robustus, Mesocyclops ogunnus, and Thermocyclops inversus present the high abundance in eutrophic systems, along with Thermocyclops decipiens. On the other hand, Thermocyclops n. sp., as well as Thermocyclops minutus, have presented the high abundance in systems less eutrophicated streams. We found that the newly described species Thermocyclops n. sp is distributed specifically in the Basins of Ribeira do Iguape and Paraíba do Sul. ITS 2 sequence of DNA varied greatly between different species, while no significantly variation was observed between specimens of the same species. Mesocyclops longisetus longisetus was found to possess 2n = 14 chromosomes and presented the chromatin diminution in 4th egg cleavage. The present study clearly shows that the exhaustive study of the biodiversity needs the use complex approaches as taxonomy, ecology and genetics. This work is part of Biota/FAPESP program, the virtual institute of biodiversity.
Com o objetivo de conhecer a biodiversidade de Copepoda Cyclopoida do Estado de São Paulo foi realizado coletas de água em suas 22 unidades hidrográficas de gerenciamento de recursos hídricos (UHGRH). As coletas foram realizadas em diversos sistemas incluído represas, lagoas e rios, totalizando 207 corpos de água e todos georeferenciados com GPS. As amostras de Cyclopoida foram coletadas com rede de 68 µm de poro em arrastos verticais na zona limnética e coletados com equipamentos apropriados na região litorânea. As amostras foram preservadas em formol 4%. A identificação das espécies de Cyclopoida foi realizada analisando as fêmeas adultas. A distribuição das espécies foi realizada por submissão dos dados georreferenciados para plataforma do SinBiota/FAPESP. A biodiversidade e abundância das espécies em reservatórios de diferentes graus de trofia foi realizado para as represas do Rio Tietê, da Unidade Ribeira do Iguape e da Unidade Pardo Grande. Foi realizado pela primeira vez no Brasil a extração e sequenciamento do DNA de Cyclopoida. Foi seqüenciado o DNA do ITS 2 das espécies: Thermocyclops decipiens, Thermocyclops inversus, Mesocyclops ogunnus e Mesocyclops longisetus longisetus. Foi realizado também pela primeira vez no Brazil a citogenética para Cyclopoida, sendo utilizada a espécie Mesocyclops longisetus longisetus. Foi registrado para o Estado de São Paulo mais 6 espécies, sendo uma espécie nova Thermocyclops n. sp. e 5 novos registros, Acanthocyclops robustus, Eucyclops elegans, Eucyclops cf. prinophorus, Microcyclops alius e Mesocyclops aspericornis. Totalizando para o Estado de São Paulo 10 gêneros e 26 espécies. Com base nas diferenças morfológicas foi elaborado uma chave de identificação para gêneros e espécies do Estado de São Paulo com ilustrações das partes anatômicas de interesse. Foi constatado que as espécies Mesocyclops ogunnus e Mesocyclops meridianus são respectivamente M. kieferi e M. brasilianus anteriormente identificadas no Estado de São Paulo. Do gênero Paracyclops a espécie P. chiltoni encontrada nos corpos de água do Estado é a mesma encontrada na represa do Broa identificada como P. fimbiratus. As espécies mais amplamente distribuídas nas 22 UHGRHs foi Thermocyclops decipiens presente em 20 UHGRH seguida por Mesocyclops longisetus longisetus presente em 16 UHGRHs e Thermvocyclops minutus, Mesocyclops ogunnus, Mesocyclops meridianus e com presença em 15 UHGRHs. As represas mais eutrofizadas apresentaram uma maior riqueza e densidades similares de distribuição das espécies de Cyclopoida do que as represas menos eutrofizadas. As espécies Thermocyclops decipiens, Mesocyclops ogunnus, Acantocyclops robustus e Thermocyclops inversus foram mais abundantes em sistemas eutrofizados enquanto que as espéices Thermocyclops minutus e Thermocyclops n. sp. apresentaram maior abundância nos sistemas menos eutrofizados. A espécie Thermocyclops igaupensis n.sp. teve sua distribuição geográfica restrita as Unidades Ribeira do Iguape e Paraíba do Sul. As seqüências do DNA do ITS2 apresentou alta variação entre as diferentes espécies e baixa ou nenhuma variação entre as mesmas espécies. A análise citogenética feita na espécie Mesocyclops longisetus longisetus mostrou que a espécie possui 2n = 14 cromossomos e apresenta perda de cromatina a partir da 4a clivagem do ovo. Os estudos mostraram que a biodiversidade é melhor conhecida se estudada em diversos aspectos tais como taxonômico, ecológico e genético. Esta tese fez parte do Programa BIOTA/FAPESP o instituto virtual da biodiversidade.

Doutoramento em Biologia
The study of the Portuguese Hydrozoa fauna has been abandoned for more than half a century, except for the Azores archipelago. One of the main aims of this Ph.D. project was to contribute new hydrozoan records leading to a more accurate perception of the actual hydrozoan diversity found in Portuguese waters, including the archipelagos of Azores and Madeira, and neighbouring geographical areas, for habitats ranging from the deep sea to the intertidal. Shallow water hydroids from several Portuguese marine regions (including the Gorringe Bank) were sampled by scuba-diving. Deep-water hydroids, from the Azores, Madeira, Gulf of Cadiz and Alboran Sea, were collected by researchers of different institutions during several oceanographic campaigns. Occasional hydroid sampling by scuba-diving was performed in the UK, Malta and Spain. Over 300 hydroid species were identified and about 600 sequences of the hydrozoan ‘DNA barcode’ 16S mRNA were generated. The families Sertulariidae, Plumulariidae, Lafoeidae, Hebellidae, Aglaopheniidae, Campanulinidae, Halopterididae, Kirchenpaueriidae, Haleciidae and Eudendriidae, were studied in greater detail. About 350 16S sequences were generated for these taxa, allowing phylogenetic, phylogeographic and evolutionary inferences, and also more accurate taxonomic identifications. Phylogenetic analyses integrated molecular and morphological characters. Subsequent results revealed: particularly high levels of cryptic biodiversity, polyphyly in many taxonomic groups, pairs of species that were synonymous, the identity of several varieties as valid species, and highlighted phylogeographic associations of hydroids in deep and shallow-water areas of the NE Atlantic and W Mediterranean. It was proved that many (but not all) marine hydroid species with supposedly widespread vertical and/or horizontal geographical distributions, correspond in fact to complexes of cryptic taxa. This study further revealed that, in the NE Atlantic, shallow environments sustain higher hydrozoan diversity and abundance, but the importance of bathyal habitats as a source of phylogenetic diversity was also revealed. The Azorean seamounts were shown to be particularly important in the segregation of populations of hydroids with reduced dispersive potential. The bathyal habitats of the Gulf of Cadiz proved to harbour a considerably high number of cryptic species, which may mainly be a consequence of habitat heterogeneity and convergence of various water masses in the Gulf. The main causes proposed for speciation and population divergence of hydroids were: species population size, dispersal mechanisms and plasticity to inhabit different environmental conditions, but also the influence of oceanic currents (and its properties), habitat heterogeneity, climate change and continental drift. Higher phylogenetic resolution obtained for the family Plumulariidae revealed particularly that glacial cycles likely facilitated population divergence, ultimately speciation, and also faunal evolutionary transitions from deep to shallow waters.
O estudo da fauna Portuguesa de Hydrozoa estava abandonado há mais de meio século, exceto para o arquipélago dos Açores. Um dos principais objetivos do projecto de doutoramento foi contribuir com novos registos de hidrozoários para uma perceção mais precisa da diversidade real de hidrozoários de águas Portuguesas, incluindo os arquipélagos dos Açores e Madeira, e áreas geográficas próximas, para habitats compreendidos entre o mar profundo e o nível intertidal. Hidrários de águas superficiais de diversas regiões marinhas Portuguesas (incluindo o Banco Gorringe) foram amostradas por mergulho com escafandro autónomo. Hidrários do mar profundo, dos Açores, Madeira, Golfo de Cádis e Mar de Alboran, foram colhidos por investigadores de diferentes instituições durante variadas campanhas oceanográficas. Foi efetuada amostragem esporádica de hidrários por mergulho com escafandro autónomo no Reino Unido, Malta e Espanha. Foram identificadas mais de 300 espécies de hidrários e foram geradas cerca de 600 sequências do ‘DNA barcode’ de hidrozoários 16S mRNA. As families Sertulariidae, Plumulariidae, Lafoeidae, Hebellidae, Aglaopheniidae, Campanulinidae, Halopterididae, Kirchenpaueriidae, Haleciidae e Eudendriidae, foram estudadas em detalhe. Foram geradas cerca de 350 sequências do marcador genético 16S para esses taxa, com a finalidade de providenciar inferências filogenéticas, filogeográficas e evolucionárias, e também identificações taxonómicas mais precisas. As análises filogenéticas moleculares foram integradas com carateres morfológicos. Os resultados subsequentes revelaram: níveis particularmente elevados de biodiversidade críptica, polifilia em muitos grupos taxonómicos, pares de espécies que eram sinónimas, a identidade de diversas variedades como espécies válidas, e evidenciaram associações filogeográficas de hidrários em águas superficiais e profundas do Atlântico nordeste e Mediterrâneo oeste. Provou-se que muitas (mas não todas) espécies de hidrários marinhos com distribuição geográfica supostamente ampla vertical e/ou horizontalmente, de fato correspondem a complexos de taxa cripticos. Este estudo também revelou, que no Atlântico nordeste, os ambientes de águas costeiras sustêm maior diversidade e abundância de hidrozoários, mas a importância dos ambientes batiais como fonte de diversidade filogenética foi também revelada. As montanhas submarinas dos Açores revelaram ser importantes na segregação de populaçoes de hidrários com potencial dispersivo reduzido. Os habitats batiais do Golfo de Cádiz provaram suster um número considerávelmente grande de espécimes cripticas, o que poderá ser consequência da heterogeneidade de habitats e convergência de variadas massas de água no Golfo. As principais causas propostas para a especiação e divergência populacional dos hidrários foram: as dimensões das populações de espécies, os mecanismos de dispersão e plasticidade que permita os hidrários habitarem diferentes condições ambientais, mas também a influência das correntes oceânicas (e suas propriedades), heterogeneidade dos habitats, alterações climáticas e deriva continental. A alta resolução filogenética obtida para a família Plumulariidae revelou particularmente que ciclos glaciais poderão ter facilitado divergência de populações, ultimamente especiação, e também transições evolucionárias faunísticas de águas profundas para superficiais.

Orientador: Reinaldo Monteiro
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-20T18:45:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RighiGomes_MariaJudithIsmael_M.pdf: 9505624 bytes, checksum: 730a2c5368ab34adecb64e25e123629f (MD5) Previous issue date: 1995
Resumo: O presente trabalho consiste em estudos taxonõmicos das espécies dos grupos "Virgata" e "Quadrifaria" de Paspalum L. ocorrentes no Brasil. O trabalho realizado com material vivo, mantido em canteiros e material herborizado apresenta descrições detalhadas, mapas de distribuição geográfica, estudos anatõmicos das lâminas foliares de suas espécies e uma análise numérica através da técnica de agrupamento entre as espécies envolvidas. O grupo "Virgata", representado por Paspalum virgatum, P. commune, P. conspersum, P. regnellii, P. rufum e P. wettsteinii e o grupo "Quadrifaria¿, composto por P. quadrifarium, P. intermedium, P. densum, P. millegrana, P. durifolium, P. brunneum, P. usteri, P. plenum, P. coryphaeum, P. exaltatum e P. haummanii estão bem representados no Brasil, com seu maior número de espécies nas regiões Sul, Sudeste e Centro-Oeste. As características utilizadas para o reconhecimento dos grupos são relacionadas ao porte, inflorescências piramidais ou quadrangulares e a coloração do antécio que pode ser amarelada ou castanha. Para as espécies as características mais úteis são da estrutura das espiguetas e de suas partes. Os estudos anatõmicos puderam fornecer dados sobre espécies ainda não descritas anatomicamente e ampliar as descrições já existentes, ainda que não tenham sido utilizados na delimitação taxonõmica das espécies e dos grupos por ela formados. A análise numérica foi útil para avaliar os grupos "Virgata" e "Quadrifaria" já que pôde abranger toda a variabilidade encontrada na análise do material. A sobreposição de tipos mostrada pelos fenogramas aponta para o fato de que a ausência de limites claros e definidos os torna inconsistentes e questiona sua posição como grupos naturais. Apesar disto, mostrou um agrupamento claro em um complexo formado por Paspalum coryphaeum, P. quadrifarium, P. brunneum e P. usteri incluídas no grupo "Quadrifaria", caracterizadas por plantas mais frágeis. Como um primeiro passo na identificação de espécies altamente relacionadas consideramos a validade dos grupos "Virgata" e "Quadrifaria", enquanto apresentamos uma visão crítica de seus limites
Abstract: The present work consists of taxonomic studies with the "Virgata" and "Quadrifaria" groups of Paspalum L. represented by their species in Brazil. The study was realized with living specimens mantained in experimental gardens and herbarium material and offers detailed descriptions, distribuition maps, leaf blade anatomy and numerical analysis though grouping techniques. The "Virgata" group represented by Paspalum viragtum, P. commúne, P. conspersum, P. regnellii, P. rufum e P. wettsteini and the "Quadrifaria" group compoused by P. quadrifarium, P.intermedium, P. densum, P. millegrana,P. durifolium, P. brunneum, P. usteri,P. plenum, P. coryphaeum, P. exaltatum e P. haummanii are well represented in Brazil, with their greatest number of speciesin South, South-West and Middle-West regions. The caracters utilized for recognition of the groups are related to the habit, piramidal or quadrangular inflorescence and to anthecium colour which can be yellowish or brown. The spikelet structure and parts are the most important and diagnostic features at the species leveI. The anatomic studies furnished informations about species not yet described anatomically and also used to amplify the existent descriptions, although they were not emploied in the taxonomic delimitacion of the species and their groups. The numerical analysis allowed an evaluation of the "Virgata" and "Quadrifaria" groups because they enclosed all the variability found in the analysis of the material. The superposition of the types phenograms indicates that the absence of the clear limits show inconsistency and question the position of the natural groups. Despite this fact they show a defined grouping for the complex formed by P. coryphaeum. P. quadrifarium, P. brunneum e P. usteri enclosed in ¿Quadrifaria" group, and characterized by fragiles plants. As a first step in the identification of highly related species, the "Virgata" and ¿Quadrifaria" groups are taken as valid, although a critical view of their limits is here introduced.
Mestrado
Mestre em Biologia Vegetal

Doutoramento em Biologia
A família Nephtyidae é uma das mais frequentes em habitats costeiros e marinhos de todo o mundo. São organismos errantes típicos de sedimentos arenosos e lodosos, ocorrendo frequentemente no domínio costeiro até 100 m de profundidade, e mais raramente em profundidades batiais e abissais. As primeiras espécies descritas foram o Nephtys caeca (Fabricius, 1780) e o N. ciliata (O. F. Müller, 1789), ambas atribuídas inicialmente ao género Nereis e posteriormente transferidas para o género Nephtys por Savigny, em 1818. A família Nephtyidae foi criada em 1851 por Grube para o género Nephtys Cuvier, 1817. No âmbito desta tese é feito um estudo taxonómico e filogenético da família Nephtyidae. O estudo filogenético inclui dados morfológicos e moleculares de 24 taxa representantes dos cinco géneros da família, Nephtys Cuvier, 1817, Aglaophamus Kinberg, 1866, Micronephthys (Friedrich, 1939), Inermonephtys Fauchald, 1967 e Dentinephtys Imajima e Takeda, 1987. A análise evidenciou dois grandes grupos correspondentes aos dois principais géneros, Aglaophamus e Nephtys. Duas espécies do género Nephtys (N. pulchra e N. australiensis) são transferidas para o género Aglaophamus, e consequentemente são propostas novas diagnoses para os géneros. O género Dentinephtys é sinonimizado com Nephtys e um novo género, Bipalponephtys, é descrito para acomodar as espécies Nephtys cornuta, N. danida e Micronephthys neotena. As relações filogenéticas entre os géneros são discutidas. Do estudo taxonómico resultou a revisão da família Nephtyidae para o Sul da Europa (entre o Canal da Mancha e o Mediterrâneo), com a descrição de uma nova espécie, Inermonephtys foretmontardoi. A espécie Micronephthys maryae é sinonimizada com M. stammeri. Para cada espécie são incluídas notas sobre a sua ecologia bem como a distribuição geográfica e batimétrica. São propostas novas diagnoses para os géneros do Sul da Europa bem como uma chave de identificação taxonómica para as espécies desta região. Após uma exaustiva revisão bibliográfica da família, e da observação de material museológico relativo a 44 espécies, foi compilada uma lista completa para a família de 128 espécies, distribuídas por cinco géneros (57 Nephtys, 53 Aglaophamus, sete Micronephthys, oito Inermonephtys e três Bipalponephtys), na qual são incluídas sinonímias e considerações taxonómicas para cada espécie. A espécie Nephtys serrata é sinonimizada com N. serratifolia. São apresentados as distribuições geográficas e batimétricas das diferentes espécies e notas sobre o seu habitat. São também incluídas tabelas de identificação com as principais características taxonómicas das espécies. O valor diagnóstico dos caracteres morfológicos é discutido. Vários problemas taxonómicos são realçados, indicando a necessidade de revisões adicionais para 23 espécies. Este trabalho realça a existência de vários problemas taxonómicos e filogenéticos dentro da família Nephtyidae, podendo ser considerado como a base para estudos futuros. Análises filogenéticas adicionais incluindo dados morfológicos e moleculares de um maior número de espécies vão certamente conduzir a uma melhor avaliação do estatuto e relações entre os géneros dentro da família.
Nephtyidae is a benthic polychaete family found in almost all marine habitats around the world. They are motile burrowers and typical inhabitants of sandy and muddy sediments that are most often found from the intertidal to about 100 m depth, although they can also occur at bathyal and abyssal depths. The first species being described were Nephtys caeca (Fabricius, 1780) and N. ciliata (O. F. Müller, 1789) both initially referred to Nereis and later transferred to Nephtys by Savigny, in 1818. The family Nephtyidae was erected in 1851 by Grube for the genus Nephtys Cuvier, 1817. Within this thesis the family Nephtyidae is studied in both taxonomic and phylogenetic perspectives. A combined morphological-molecular study was done based on 24 nephtyid taxa belonging to the five genera of the family, Nephtys Cuvier, 1817, Aglaophamus Kinberg, 1866, Micronephthys (Friedrich, 1939), Inermonephtys Fauchald, 1967 and Dentinephtys Imajima and Takeda, 1987. The results revealed two well-supported major clades, corresponding in part to the two main genera of the family, Aglaophamus and Nephtys. Two species previously assigned to the genus Nephtys (N. pulchra and N. australiensis) were proved to belong to the genus Aglaophamus and therefore new diagnoses for the genera are provided. The genus Dentinephtys is synonymized with Nephtys and a new genus, Bipalponephtys, is described to include the species Nephtys cornuta, N. danida and Micronephthys neotena. The phylogenetic relationships between the genera are further discussed. Within the taxonomic account, a family revision for the southern European fauna (from English channel to the Mediterranean) is provided, with the erection of a new species, Inermonephtys foretmontardoi. The species Micronephthys maryae is synonymized with M. stammeri. Information about geographical and bathymetrical distribution as well as habitat is included for each species. New diagnoses are provided for southern European genera and a key to all species from the region is included. After revising the available bibliography and some museological material representing 44 species, a complete list of 128 presently accepted species of the family Nephtyidae is compiled, ascribed to five genera (57 Nephtys, 53 Aglaophamus, seven Micronephthys, eight Inermonephtys and three Bipalponephtys). The list includes synonymies and taxonomic remarks for each species. The species Nephtys serrata is synonymized with N. serratifolia. The geographical and bathymetrical distribution of the different species is presented as well as ecological notes. Tables with the main diagnostic characters are also included. The diagnostic value of each morphological character is discussed. Several taxonomical problems become apparent from this study, indicating that further revisions are still in need for 23 species. The taxonomical and phylogenetic issues of the family Nephtyidae raised in this study may be considered a base for future research. Further phylogenetic analyses including morphological and molecular data of more taxa is required and will certainly lead to a better evaluation of the status and relationships of all genera within the family.
FCT - SFRH/BD/16563/2004

The general outline of this thesis was to assess the potential of the Mediterranean water masses to transport deep-sea fauna towards the Atlantic Ocean. By examining the effects that the bathyal water mases moving from the Eastern Mediterranean basin towards the Northeastern Atlantic Ocean may have on the relationships of the deep-water sponge fauna, a case study is provided. Prior to using the sponge fauna as a deep-water biogeographic tool, new collections of deep-sea sponges needed to be conducted in order to increase the faunal resolution at the two most important transitional areas across the bathyal trajectory from the Eastern Mediterranean to the Atlantic, the Strait of Gibraltar and the Strait of Sicily, which remained poorly studied. In this context, the specific objectives of this thesis were as it follows: 1. To complete the previous limited knowledge on the deep-water sponge fauna at key transition areas along the trajectory of the bathyal water mases. 1.1. To provide the missing qualitative and quantitative knowledge of the bathyal sponge fauna at the most Eastern-Atlantic side of the Strait of Gibraltar, focusing on a mud volcano system at the Gulf of Cádiz that spans the entire range of bathyal depths. 1.2. To underpin the qualitative knowledge of the deep-water sponge fauna at the most Western-Mediterranean side of the Strait of Gibraltar, focusing on the deep shelf and upper slope of the Alboran Island. 1.3. To underpin the qualitative knowledge of the deep-water sponge fauna at the Eastern-Mediterranean side of the Strait of Sicily, focusing on the deep shelf and slope of the Maltese Islands. 1.4. To put into practice basic genetic techniques to aid in the identification of species that remain unresolvable through the classical phenetic approach, providing an example case for a more integrative sponge taxonomy. 2. To assess the effects of local environmental variables on the qualitative and quantitative distribution of abundances of the sponges across a complete bathymetric bathyal range, focussing on the mud volcanoes of the Gulf of Cádiz as a case study. 3. To examine the affinities of the deep-water sponge fauna across the trajectory of the bathyal water masses running from the Eastern Mediterranean to the Northeastern Atlantic.

Com a rápida e desorganizada expansão humana o processo de eutrofização do complexo Billings está acelerado, afetando a dinâmica das comunidades aquáticas, em particular a fitoplanctônica. Uma das conseqüências da eutrofização são as florações de cianobactérias. Dentre os 150 gêneros de Cyanobacteria, cerca de 40 são produtores de toxinas (cianotoxinas). O reservatório Billings abrange áreas de 7 municípios e localiza-se a oeste da cidade de São Paulo, a 23º 47\' S e 46º e 40\' W, e a uma altitude de 746m. Seus usos incluem saneamento, geração de energia elétrica, lazer e abastecimento público. Este trabalho tem como objetivos principais: a) efetuar análises em duas coletas (época chuvosa e época seca) das varáveis físicas, químicas e biológicas da água em três pontos no complexo Billings e em três profundidades (superfície, meio e fundo) (Capítulo II), b) Identificar e quantificar a comunidade de cianobactérias em cada um dos pontos e relacionar a riqueza e abundância com a qualidade das águas (Capítulo II) e c) Analisar qualitativamente as cianobactérias presentes, com uso de técnicas de biologia molecular, incluindo polimorfismo genético (Capítulo III); d) Comparar os dados obtidos com as análises qualitativas tradicionais com os dados das análises moleculares, associados à diferentes amostragens e em épocas do ano distintas (Cápitulo IV). As concentrações de clorofila-a, fósforo total e oxigênio dissolvido não estão em conformidade com a resolução CONAMA nº357 para corpos hídricos classe II na maioria das amostras dos pontos analisados. As florações fitoplanctônicas, foram presentes neste estudo na represa Billings, apresentando altos biovolumes de cianobactérias (20568,5 µm3/mL no Ponto 1 em fevereiro de 2012) e de outros organismos fitoplanctônicos como os dinoflagelados (1000544 µm3/mL no Ponto 2 em fevereiro de 2012). Foram observadas florações do dinoflagelado Ceratium furcoides e da cianobactéria Microcystis aeruginosa em agosto e fevereiro, respectivamente, levando a preocupações com relação às condições tróficas do reservatório e aos potenciais prejuízos que estas espécies podem causar. O reservatório foi classificado entre supereutrófico e hipereutrófico, indicando forte degradação da qualidade das águas nos pontos amostrados. As análises moleculares não foram satisfatórias para a caracterização molecular das cianobactérias, pois as enzimas utilizadas para a digestão do DNA extraído e amplificado não encontraram o sítio para clivagem, sendo as adequações das reações e a utilização de outras enzimas as próximas etapas deste trabalho
With the rapid expansion and disorganized human process of eutrophication complex Billings is accelerated, affecting the dynamics of aquatic communities, particularly the phytoplankton. One consequence of eutrophication are cyanobacterial blooms. Among the 150 genera of Cyanobacteria, about 40 are producers of toxins (cyanotoxins). The Billings reservoir covers seven counties and areas located west of the city of São Paulo, at 23 º 47 \'S and 46 º 40\' W, at an altitude of 746m. Its uses include sanitation, power generation, recreation and public supply. This work has as main objectives: a) conduct analyzes in two samples (wet season and dry season) variables of the physical, chemical and biological characteristics of water at three points in the complex Billings and three depths (surface, middle and bottom) (Chapter II ), b) Identify and quantify the community of cyanobacteria in each of the points and relate the richness and abundance with water quality (Chapter II) and c) analyze qualitatively the cyanobacteria present, using molecular biology techniques, including genetic polymorphism (Chapter III); d) Compare the data obtained with the traditional qualitative analyzes with data from molecular analyzes, associated with different samples and different seasons (Chapter IV). The concentrations of chlorophyll-a, total phosphorus and dissolved oxygen are not in accordance with the Resolution CONAMA 357 for class II water bodies in most of the samples analyzed points. The phytoplankton blooms were present in this study in the Billings, showing high biovolumes cyanobacterial (20,568.5 μ m3/mL at Point 1 in February 2012) and other organisms as phytoplankton dinoflagellates (1000544 μ m3/mL at Point 2 in February 2012). Were observed blooms of the dinoflagellate Ceratium furcoides and the cyanobacterium Microcystis aeruginosa in August and February, respectively, leading to concerns in relation to trophic conditions of the reservoir and the potential damage that these species can cause. The reservoir was ranked among supereutrophic and hypertrophic, indicating strong degradation of water quality in the sampled points. Molecular analyzes were not satisfactory for the molecular characterization of cyanobacteria, as the enzymes used for digestion of DNA extracted and amplified not find the site for cleavage, and the adequacy of the reactions and the use of other enzymes the next steps of this work

Orientador: Renato Eugênio da Silva Diniz
Banca: Ana Maria de Andrade Caldeira
Banca: Denise de Freitas
Resumo: A presente dissertação teve como propósito investigar como os professores de Biologia compreendem, organizam e ensinam a Sistemática e a Taxonomia Biológica na disciplina de Biologia da rede estadual no município de São Carlos - SP. Para tanto, partimos da hipótese que os conteúdos de Biologia são trabalhados de modo memorístico e fragmentado e que o ensino dos conteúdos trazidos pela Sistemática e Taxonomia durante os anos do Ensino Médio podem ser norteadores e necessários para que haja a contextualização e compreensão das demais áreas que a Biologia contempla, entre elas a Zoologia, a Botânica, Evolução e de todo o conhecimento biológico. Desse modo, o objetivo geral desta pesquisa é verificar como se dá a organização, o entendimento e o trabalho em sala de aula, referentes ao ensino de Sistemática e de Taxonomia, a partir da perspectiva de professores efetivos da rede estadual de ensino do município de São Carlos, interior do estado de São Paulo. No que se diz respeito aos capítulos teóricos deste estudo, buscou-se tecer algumas considerações acerca do histórico da Sistemática e Taxonomia Biológica como áreas que trazem conteúdos e temas que são considerados como saberes clássicos. Além disso, uma discussão sobre alguns aspectos relevantes do ensino de Biologia e do ensino de Sistemática e Taxonomia durante os anos que compreendem o Ensino Médio também foram executadas, bem como um breve levantamento sobre as pesquisas que estão ocorrendo em relação ao ensino das áreas es... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: This thesis aims to investigate how the biology teachers understand, organize and teach Systematic and Biological taxonomy in biology courses of the state in São Carlos - SP. The starting point was the hypothesis that the Biology contents are worked memoristic and piecemeal and that the teaching of content brought by Systematics and Taxonomy during the years of high school can be guiding and necessary for there to contextualization and understanding of other areas that includes biology, including Zoology, Botany, Evolution and all the biological knowledge. Thus, the objective of this research is to see how is the organization, understanding and work in the classroom for the teaching of Systematics and Taxonomy, from the perspective of effective teachers teaching of the state of the city of San Carlos, upstate São Paulo. As regards the theoretical chapters of this study, we attempted to make a few remarks about the history of Systematic and Biological Taxonomy as areas that bring content and themes that are regarded as classics knowledge. In addition, a discussion of some relevant aspects of teaching Biology and Systematics of education and Taxonomy for years to understand the high school were also performed, as well as a brief survey of the research taking place in relation to the teaching of the areas studied this dissertation. To this end, this qualitative research, with the participation of fifteen effective teachers of Biology, who first answered a questionnaire that incl... (Complete abstract click electronic access below)
Mestre

Os chamados ‘complexos de espécies’ são definidos como grupos de organismos que compartilham características morfológicas muito semelhantes. Os complexos de espécies representam um problema para os sistemas de classificação baseados apenas em caracteres morfológicos, uma vez que os critérios para delimitação de espécies são subjetivos e, por isso, variam de acordo com cada taxonomista. O complexo integrifolia, que reúne diversos taxa com características florais muito semelhantes à espécie Petunia integrifolia (Hook.) Schinz & Thell, é um exemplo dessa problemática taxonômica. A determinação de espécies dentro desse complexo, baseada apenas em caracteres morfométricos, é até hoje ainda muito controversa. Nesse trabalho, os espaçadores internos transcritos do DNA nuclear ribossomal (ITS1 e ITS2) e dois espaçadores intergênicos (trnS-trnG e psbA-trnH) do DNA plastidial (cpDNA) foram seqüenciados em 69 indivíduos pertencentes a cinco entidades taxonômicas do complexo integrifolia na tentativa de entender sua história evolutiva e melhor contribuir para a correta delimitação das espécies. Análises populacionais e filogeográficas dos três marcadores do cpDNA mostraram que apenas a entidade taxonômica descrita como Petunia interior pode ser considerada uma espécie distinta de Petunia integrifolia. As outras quatro entidades taxonômicas estão divididas em duas linhagens genéticas independentes e alopátricas, que surgiram mais ou menos na mesma época após um evento de diminuição populacional seguido de rápida expansão. Uma dessas linhagens está localizada na planície costeira do Rio Grande do Sul e Santa Catarina, enquanto a outra linhagem se distribui na porção continental do RS ao oeste da Lagoa dos Patos. Análises morfométricas mais detalhadas mostram que essas duas linhagens genéticas podem ser distinguidas taxonomicamente e, portanto, são definidas como duas subespécies de Petunia integrifolia. Há indícios de que um processo de especiação por adaptação a dois ambientes distintos (alta salinidade na planície costeira e baixa salinidade na porção continental) esteja envolvido na divergência dessas duas linhagens. No entanto, para confirmar essa hipótese, são necessários estudos adicionais.
“Species complex” are usually defined as group of species that are morphologically very similar and consequently are very difficult to distinguish. Species complexes, therefore, represent a serious problem to the classification systems based only in morphological characters, the criteria used to delimit species being subjective. The integrifolia complex, that congregates taxa with floral characteristics very similar to Petunia integrifolia (Hook.) Schinz & Thell, it is an example of this taxonomic challenge. The determination of the species inside of this complex, based only in morphometric characters, it is still very controversial. In this work, the internal transcribed spacers of the ribosomal nuclear DNA (ITS1 and ITS2) and two intergenic spacers (trnS-trnG and psbAtrnH) of the plastidial DNA (cpDNA) had been sequenced in 69 individuals pertaining to five taxonomic entities of the integrifolia complex, in the attempt to understand its evolutionary history and contribute to the better delimitation of the species. Populational and phylogeographic analyses of the three markers and of cpDNA had shown that only the taxonomic entity described as Petunia interior can be considered a distinct species of Petunia integrifolia. The four other taxonomic entities are divided in two independent and allopatric lineages, that diversified almost simultaneously after an event of population bottleneck followed by a fast expansion. One of these lineages is located in the coastal plain of the Rio Grande do Sul and Santa Catarina states, while to other lineage it’s distributed in the continental region of the Rio Grande do Sul to the west of the Lagoa dos Patos. Detailed morphometric analyses shown that these two lineages can be taxonomically distinguished and therefore, they may be considered as two subspecies of Petunia integrifolia. Some findings suggest that a process of adaptation to these two distinct environments (high salinity in the coastal plain and low salinity in the continental region) may be involved in the divergence of the two lineages. Additional studies are required to test this hypothesis.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-04T20:04:17Z No. of bitstreams: 2 Tese_Ulisses Gaspar Neiss.pdf: 19676969 bytes, checksum: 63e95c70fb3513945e8d4caf9a0b39d5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5)
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Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM
Odonata has a high diversity of species in tropical regions; however, major gaps in knowledge still exist in many biomes, including the Amazon rainforest. Most studies of Odonata in the Neotropics focus on adults. Thus, the taxonomy and biology of the immature forms are still little known: less than one-third of the species recorded from Brazil have their larvae described. The objective of this study was to increase knowledge of the taxonomy, distribution and biology of Odonata, with emphasis on larval stages in the Central Amazon. During the years 2008 and 2009 collections were made in approximate 150 well preserved streams to obtain adults and larvae in different localities and municipalities in the Amazonas State: Manacapuru, Manaus, Novo Airão, Presidente Figueiredo, Rio Preto da Eva, and the areas of environmental protection Reserva Florestal Ducke (Manaus), Reserva Biológica do Uatumã (Presidente Figueiredo) and Parque Estadual Serra do Aracá (Barcelos). The larvae were used for breeding under laboratory conditions. Identification of adults and associated larvae resulted in 175 species in 77 genera, 15 families already reported in Brazil, with 41 new records for the state of Amazonas, of which 22 were new for the country. Dimeragrion Calvert (Megapodagrionidae) is recorded for the first time in Brazil through the D. percubitale Calvert, collected in the region of the tepuis in Serra do Aracá (1115 m.a.s.l). Three new species are described, including a new genus (Coenagrionidae gen. nov. sp. nov.; Erythrodiplax sp. nov. and Gynacantha sp. nov.) from adults emerging under laboratory conditions. Thirteen last-instar larvae, hitherto unknown, are also described: Macrothemis rupicola Rácenis; Mecistogaster lucretia (Drury); Megapodagrion megalopus (Selys); Misagria divergens De Marmels; Mnesarete astrape De Marmels; Mnesarete cupraea (Selys); Orthemis attenuata (Erichson); Palaemnema brasiliensis Machado; Perilestes solutus Williamson and Williamson; Psaironeura tenuissima (Selys); Staurophlebia wayana Geijskes; Uracis siemensi Kirby and Zenithoptera lanei Santos. Keys are also provided for identification of families and genera of last-instar larvae known in the state of Amazonas and, when possible, for Brazil (except Libellulidae). Analysis of stomach contents of 992 larvae of Odonata, through dissecting the anterior intestine, collected from different substrates in streams located in the Reserva Ducke and Reserva Uatumã, showed that Chironomidae was the most abundant prey (38.4%) and was also the most frequent (41%), followed by Baetidae (13.6% and 17.8%), Leptophlebiidae (8.8% and 12%), Trichoptera (11.5% and 14.4%), Oligochaeta (5.2% and 6.7%), Simuliidae (4% and 4.7%) and Acarina (4.1% and 4.9%).
Odonata apresenta alta diversidade de espécies nas regiões tropicais, no entanto, ainda há grandes lacunas de conhecimento em muitos biomas, incluindo a floresta Amazônica. A maioria dos estudos realizados com Odonata na região Neotropical tem como foco os adultos, dessa forma, a taxonomia e biologia das formas imaturas permanecem pouco conhecidas, menos de 1/3 das espécies registradas para o Brasil tem suas larvas descritas. O objetivo deste trabalho foi incrementar o conhecimento sobre a taxonomia, distribuição e biologia de Odonata, com ênfase nos estágios larvais, na Amazônia Central. Para isso, durante os anos de 2008 e 2009 foram realizadas coletas em aproximadamente 150 igarapés preservados para obtenção de adultos e larvas para criação em condições de laboratório, em diversas localidades e municípios do Estado do Amazonas: Manacapuru, Manaus, Novo Airão, Presidente Figueiredo, Rio Preto da Eva, incluindo as áreas de proteção ambiental Reserva Florestal Ducke (Manaus), Reserva Biológica do Uatumã (Presidente Figueiredo) e Parque Estadual Serra do Aracá (Barcelos). A identificação dos adultos e larvas associadas resultou em 175 espécies distribuídas em 77 gêneros, incluídos nas 15 famílias ocorrentes no Brasil, com 41 novos registros para o Estado do Amazonas, sendo 22 registros novos para o Brasil. Dimeragrion Calvert (Megapodagrionidae) é registrado pela primeira vez no Brasil, através de D. percubitale Calvert, coletada na região dos tepuis na Serra do Aracá (1.115 m alt.). Três espécies novas são descritas, incluindo um novo gênero (Coenagrionidae gen. nov. sp. nov.; Erythrodiplax sp. nov. e Gynacantha sp. nov.) a partir de adultos emergidos em condições de laboratório. Treze larvas de último estádio, até então desconhecidas, também são descritas: Macrothemis rupicola Rácenis; Mecistogaster lucretia (Drury); Megapodagrion megalopus (Selys); Misagria divergens De Marmels; Mnesarete astrape De Marmels; Mnesarete cupraea (Selys); Orthemis attenuata (Erichson); Palaemnema brasiliensis Machado; Perilestes solutus Williamson e Williamson; Psaironeura tenuissima (Selys); Staurophlebia wayana Geijskes; Uracis siemensi Kirby e Zenithoptera lanei Santos. Chaves para identificar família e gênero de larvas de último estádio conhecidas para o Estado do Amazonas e quando possível para o Brasil (exceto Libellulidae), também são propostas. A análise do conteúdo estomacal de 992 larvas de Odonata, realizada através da dissecção do intestino anterior, coletadas em diferentes substratos localizados em igarapés da Reserva Ducke e Reserva do Uatumã, revelou que Chironomidae foi a presa mais abundante (38,4%) e frequente (41%), seguido por Baetidae (13,6% e 17,8%), Leptophlebiidae (8,8% e 12%), Trichoptera (11,5% e 14,4%), Oligochaeta (5,2% e 6,7%), Simuliidae (4% e 4,7%) e Acarina (4,1% e 4,9%).

The most clinically relevant species of the Acinetobacter genus are comprised within the Acinetobacter baumannii group (Ab group, i. e. A. baumannii, Acinetobacter nosocomialis, Acinetobacter pittii, Acinetobacter seifertii and A. pittii-like/A. dijskhoorniae). Among these species A. baumannii is the most prevalent and usually shows multidrug resistance. This, and the fact that the Ab group species cannot be distinguished by phenotypic methods, has led to the misidentification of the species of the Ab group as A. baumannii in the clinical settings. Nevertheless, in the last years the incidence of the other species of the Ab group has risen, partly due to the use of molecular techniques and mass spectrometry tools. This thesis has characterised, using both genotypic (rpoB-based and MLSA phylogenetic analyses, and whole genome sequence analysis) and phenotypic (carbon utilisation assays and MALDI-TOF MS) techniques, a group of strains mainly recovered from human samples that represents a new bacterial species within the Ab group for which the name of Acinetobacter dijkshoorniae has been proposed. The genome of the type strain of the novel species has been sequenced and the identification of the species of the Ab group by MALDI-TOF MS has been optimised, since the novel species (A. dijkshoorniae and A. seifertii) could not be identified by this technique prior to this study. MALDI-TOF MS was shown to be rapid and accurate in the discrimination of all the species of the Ab group, indicating its suitability for the implementation of this technique in the clinical settings. In addition, the use of MALDI- TOF MS allowed the identification of members of the Ab group in market meat from Peru, leading to the first identification of A. dijkshoorniae from food and in South America. We also evaluated the differences among the species of the Ab group beyond those at the taxonomic level and found that while A. baumannii still presents the higher rates of antimicrobial resistance, this species and A. nosocomialis, which usually are more prevalent in our hospitals and have worst outcomes, showed a minor pathogenicity in terms of biofilm formation and virulence in the Caenorhabditis elegans infection model. In contrast, A. pittii, A. seifertii and A. dijkshoorniae presented a higher pathogenicity in the phenotypes studied. This data suggests the emergence of the non-baumannii species of the Ab group as well as different degrees of adaptation to the human host and the need of studying them as distinct entities. The rise on the antimicrobial resistance of A. baumannii has drastically reduced the therapeutic options left to treat infections caused by this pathogen. In view of the lack of effective antimicrobial drugs there is an urgent need for novel therapeutic approaches. In order to find novel targets for the development of antimicrobial drugs against A. baumannii, we evaluated the dual role of transport-related proteins in antimicrobial resistance and virulence using a transposon mutant strain collection derived from the A. baumannii AB5075 strain. The antimicrobial susceptibility of the mutant strains was compared against the wild- type strain and led to the identification of novel antimicrobial substrates for known efflux pumps and uncharacterised transport-related proteins which seem to participate in the transport of antibiotics across membranes. The evaluation of the virulence in the Galleria mellonella infection model also identified transport-related proteins putatively involved in the virulence of A. baumannii. This results are still preliminary but show the dual role of transport- related proteins in the antimicrobial resistance and pathogenicity of A. baumannii and open a new line of research that might help to gain further knowledge about the virulence of this pathogen while finding novel targets for the development of new antimicrobial drugs against A. baumannii.
Dentro del género Acinetobacter, las especies del grupo Acinetobacter baumannii (Ab) (i. e. A. baumannii, Acinetobacter nosocomialis, Acinetobacter pittii y Acinetobacter seifertii y A. pittii-like/A. dijskhoorniae) destacan por su gran relevancia clínica, siendo A. baumannii el patógeno del grupo Ab de mayor importancia debido a su frecuente aislamiento y su usual fenotipo de multirresistencia. Esto, sumado a que las especies del grupo Ab son indistinguibles a nivel fenotípico, ha conllevado que habitualmente hayan sido erróneamente identificadas en el ámbito clínico como A. baumannii. Sin embargo, en los últimos años se ha observado un aumento en la incidencia de las otras especies del grupo Ab, en parte gracias a las técnicas moleculares, que han revolucionado la taxonomía de este género, y también al uso de la espectrometría de masas MALDI-ToF (EM MALDI-TOF). Este estudio proporciona las pruebas fenotípicas y genotípicas que respaldan la delineación de una nueva especie dentro del grupo Ab, para la cual se ha propuesto el nombre de Acinetobacter dijkshoorniae. El genoma de la cepa tipo de esta nueva especie ha sido secuenciado, y se ha puesto a punto la identificación mediante EM MALDI-TOF de los nuevos miembros del grupo Ab (A. dijkshoorniae y A. seifertii) así como ha sido optimizado para el resto de especies del grupo. Rasgos como la formación de biofilm o la virulencia en el modelo animal de Caenhorabditis elegans muestran que A. baumannii, junto con A. nosocomialis, presentan menor potencial patogénico que las otras especies del grupo Ab, y que A. dijkshoorniae es especialmente virulenta. Estos datos sugieren diferentes niveles de adaptación al ámbito hospitalario, y remarca la necesidad de identificar y estudiar las especies del grupo Ab individualmente. Además, a nivel de susceptibilidad antimicrobiana, A. baumannii sigue siendo la especie que presenta mayores tasas de resistencia. Finalmente, hemos hallado nuevas proteínas implicadas en el transporte de membrana que, de manera preliminar, parecen participar en la resistencia a antibióticos y virulencia de A. baumannii, y cuya caracterización podría aportar nuevas dianas para el desarrollo de fármacos antimicrobianos para tratar las infecciones causadas por A. baumannii multirresistente.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2012.
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Arachis é um gênero composto de plantas anuais a perenes, com distribuição natural na América do Sul. O gênero abrange plantas herbáceas com flores em geral amarelas e frutos que se desenvolvem no subsolo. Tem como destaque A. hypogaea, o amendoim cultivado, amplamente explorado. O objetivo deste estudo foi ampliar o conhecimento da estrutura floral das espécies de Arachis e seu eventual vínculo com distintos modos de reprodução mostrados por tais espécies, na busca de informação para o estabelecimento de estratégias de conservação in situ e ex situ das mesmas. Neste trabalho, foram avaliadas seções dos ovários da maioria das espécies silvestres, verificando o número de óvulos, além da morfologia do estilete e estigma das mesmas. Foram utilizados 69 acessos, abrangendo 58 espécies das nove seções do gênero, para a análise morfológica e preparo de ilustrações. Observações diretas de visitantes florais foram feitas em seis espécies, em ambientes urbanos distintos. O trabalho permitiu o enriquecimento de descrições inéditas das estruturas florais de diversas espécies, o reconhecimento da presença e distribuição dos tricomas e papilas na superfície estigmática e também o número de óvulos no ovário, além de comparações entre espécies quanto ao estado dos caracteres apresentados. Por isso, poderá apoiar a discriminação das espécies e dar subsídios a estudos futuros sobre as mesmas, incluindo o realinhamento das seções taxonômicas atualmente consideradas. As espécies da seção Heteranthae já eram reconhecidas por apresentarem simultaneamente flores normais e reduzidas, mas este caráter não é exclusivo da seção. As observações enfatizaram indícios de similaridade entre espécies das seções Heteranthae e Extranervosae, com as quais, surpreendentemente, A. burkartii, da seção Rhizomatosae compartilha diversas peculiaridades morfológicas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT
The genus Arachis encompasses annual as well as perennial species and is naturally distributed in five South American countries. It gathers herbaceous plants usually with yellow flowers, which give rise to underground fruits. Its most outstanding member is A. hypogaea, the cultivated peanut, a widely explored species. This work aimed at increasing the knowledge on the floral structure of wild Arachis species and on its eventual association to breeding strategies presented by distinct species, searching for fundamental information towards the establishment of in situ and ex situ conservation strategies. Ovary sections have been observed from most wild Arachis species, checking the number of ovules, as well as the morphology of style and stigmas of the same. Seventy accessions of 63 species, representing all nine taxonomic sections of the genus were utilized for the morphological analyses and preparation of illustrations. Direct observation of flower visitors of six species were conducted in distinct urban environments. This work allowed for the improvement of descriptions of flower structures of several species, the recognition of the presence and distribution of papillae and trichomes in the stigmatic surface, and also the number of ovules in the ovary, besides inter-specific comparisons concerning the states of characters shown. So, it will help in the discrimination between species, and will provide data for future studies of the same, including a potential realignment of the present taxonomic sections. Species of sect. Heteranthae have been recognized for simultaneously presenting normal and reduced flowers, but this character is not exclusive to this section. The observations stressed evidences of similarity between species of the sections Heteranthae and Extranervosae, with which, quite surprisingly, A. burkartii, of sect. Rhizomatosae shares several morphological peculiarities.

Doutoramento em Biologia
Apesar da fauna de mamíferos Neotropicais ser uma das mais ricas do mundo, o nosso conhecimento sobre os limites de espécies, distribuições geográficas e relações filogenéticas está ainda agora no seu início. As áreas de transição entre os dois maiores biomas da América do Sul, o Cerrado e a Amazónia, são ainda menos conhecidas. Até ao momento, escassos estudos focaram os pequenos mamíferos destas áreas. Destes estudos, apenas dois apresentam dados taxonómicos e de distribuição geográfica de uma lista de espécies reduzida e, nenhum é focado nos processos evolutivos que conduziram à diversidade destas áreas. O presente trabalho tem como objectivo aumentar o conhecimento básico sobre a diversidade do médio Rio Araguaia, na região central do Brasil, através da amostragem e análise de espécies de pequenos mamíferos, integrando um intenso trabalho de campo, de laboratório e de museu. Desta forma, um total de 22 espécies é registado para o médio Araguaia. De entre estas espécies, descreve-se uma espécie nova de Rhipidomys, regista-se uma espécie não descrita de Thrichomys e uma potencial nova forma de Oligoryzomys, e também se apresenta uma diagnose emendada do obscuro Oecomys cleberi. Para cada espécie, são também descritas as suas características morfológicas e resumem-se os seus aspectos de distribuição geográfica e história natural. Para os quatro géneros acima referidos, são apresentadas as análises filogenéticas que permitem a identificação das espécies. Adicionalmente, os princípios da filogeografia são aplicados para estudar os padrões da distribuição geográfica da diversidade genética de três roedores sigmodontíneos e seis marsupiais didelphídeos. Os resultados obtidos demonstram que o Rio Araguaia forma uma barreira geográfica para espécies especialistas em florestas não-alagáveis; por outro lado, espécies generalistas apresentam partilha de haplótipos em ambas as margens do rio. Argumentamos também que os refúgios florestais e os gradientes poderão ter tido um papel importante para moldar a estrutura genética de populações de pequenos mamíferos no Brasil central. Em suma, os resultados apresentados corroboram a proposição de que a diversidade Neotropical não poderá ser explicada através de um único modelo de especiação e que estes não são mutuamente exclusivos. O entendimento integral dos processos ecológicos e históricos que deram origem à fauna Neotropical, assim como a continuidade de estudos sistemáticos, depende da realização de novas amostragens e consequente enriquecimento dos museus com colecções apropriadas.
Despite of Neotropical mammalian fauna being one of the richest fauna of the world, the knowledge of species boundaries, geographic distributions, and phylogenetic relationships is only now beginning to be understood. The transitional areas between the two major biomes of South America, the Cerrado and Amazonian Rainforest, are even less known. Only few studies focusing on small mammals have been conducted in these areas, and from those only two studies present data on taxonomy and geographic distribution of a reduced species list, and none is focused on the evolutionary processes that leaded to its diversity. The present work aims to increase the basic knowledge of the mid-Araguaia River diversity by surveying and describing small mammal species using an integrative approach of intensive field, laboratory and museum work. Twenty-two species are reported to this area, from which a new species of Rhipidomys is described, an undescribed species of Thrichomys and a potentially new form of Oligoryzomys are recorded, and an emended diagnosis of the elusive Oecomys cleberi is given. We also describe the morphological traits, and summarize aspects of geographic distribution and natural history for every species. Mitochondrial phylogenetic analyses that allow species identification are also presented for the four genera referred above. Furthermore, principles of phylogeography are used to study patterns of geographical distribution of the genetic diversity of three sigmodontine rodents and six didelphid marsupials. The results show that the Araguaia River is a barrier to upland forest specialists, while more generalist species present haplotype sharing across the river. We also argue that forested refuges and gradients may have had an important role in shaping the genetic structure of small mammal populations in central Brazil. These findings reinforce the statement that no single model of speciation will explain the diversity of Neotropics and that the models are not mutually exclusive. Further sampling effort and proper collections will continue to enrich museums to carry on systematic studies and to address new phylogeographic studies in order to understand the ecological and historical events that shaped the Neotropical fauna.
FCT/FSE - SFRH/BD/24767/2005

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ieda Schleger.pdf: 2652464 bytes, checksum: d6b5e5be7baa4e50ef5c5874a9a4189d (MD5) Previous issue date: 2016-02-19
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
The family Characidae (Characiformes) is the most diverse in number of species among Neotropical fish. Many genera of this family, for no to present evidence of monophyly, are considered Incertae Sedis, such as Astyanax. This genus of fish groups popularly known as lambari, comprises 155 valid species. Astyanax serratus is considered endemic of the Iguaçu River, where is largely distributed. Astyanax laticeps occurs in coastal basins of the coastal region of Uruguay, south and southeast Brazil. These species are morphologically similar and are included in the complex A. scabripinnis. The purpose of this study was to determine A. serratus and A. laticeps are the same species in synonymy, or form distinct evolutionary units, but cryptic. Therefore, was used morphometric analysis, including measurements of body proportions relative to length of the body and of the head, counting number of teeth, cusps and fins. Cytogenetic analysis consisted in chromosome preparations conventional Giemsa staining, localization of constitutive heterochromatin by C-banding method, detection of nucleolar organizer regions (NORs) by impregnation with silver nitrate (Ag-NORs) and fluorescent in situ hybridization using DNA probes ribosomal (rDNA) 5S and 18S. The sequences used as DNA barcode, were obtained by partial amplification of cytochrome c oxidase I (COI) gene and the genetic distance calculated by the method of Kimura 2-parameters (K2P). The results of morphometric analysis revealed pre-jaw with two series of teeth, presence of hooks on anal and pelvic fins of males, elongated body with a humeral spot with narrow anteroventral extension in both species. Cytogenetic showed the same diploid number of 50 chromosomes, including the first pair of large metacentric chromosomes in relation to the others complements, the same karyotype formula (4m + 24sm + 6st + 16a) and even fundamental number (84). The markings of 5S rDNA coincide in the centromeric region of chromosome 19 pair and were evidenced multiple sites of 18S rDNA, located in the telomeric regions of the chromosomes in both species analyzed. The Ag-NORs showed to be coincident with 18S sites in most cases. The distribution of constitutive heterochromatin blocks occurred preferentially in the centromeric and terminals regions of chromosomes, coincident with the location of ribosomal sites and Ag-NORs in telomeric regions. The analysis of DNA barcode through the COI gene revealed an interspecific genetic divergence to 0.2%, a rate below the threshold considered for the separation of fish species (2%). These different levels of analysis suggest that A. serratus and A. laticeps are synonymous species, increasing the occurrence of A. laticeps for the Iguaçu River basin and enhancing the hypothesis of fauna sharing, caused by tectonic activities of crystalline shield. The interspecifc variations found in the mapping of constitutive heterochromatin, Ag-NORs and 18S rDNA are common in Astyanax and derived of events no robertsonian, while the differences may reflect the vicariant process, with geographic isolation of watersheds and gene flow restriction among the population of the Iguaçu River and coastal populations.
A Família Characidae (Characiformes) é a mais diversa em número de espécies entre os peixes neotropicais. Muitos gêneros dessa Família, por não apresentarem evidências de monofiletismo, são considerados como Incertae Sedis, como é o caso de Astyanax. Este gênero agrupa peixes popularmente conhecidos como lambaris, sendo composto por 155 espécies válidas. Astyanax serratus é considerada endêmica do Rio Iguaçu, onde está amplamente distribuída. Astyanax laticeps ocorre nas bacias costeiras da região litorânea do Uruguai, sul e sudeste brasileiro. Estas espécies são morfologicamente semelhantes e estão incluídas no complexo Astyanax scabripinnis. O objetivo do presente estudo foi verificar se A. serratus e A. laticeps constituem uma mesma espécie, em sinonímia, ou formam unidades evolutivas distintas, mas crípticas. Assim, foi empregada análise morfométrica, incluindo medições das proporções corporais em relação ao comprimento do corpo e da cabeça, contagem do número de dentes, cúspides e de raios nas nadadeiras. A análise citogenética consistiu em preparações cromossômicas com coloração convencional por Giemsa, localização de heterocromatina constitutiva pelo método de bandamento C, detecção das regiões organizadoras de nucléolos por impregnação com nitrato de prata (Ag-RONs) e hibridação in situ fluorescente com sondas de DNA ribossomal (rDNA) 5S e 18S. As sequências utilizadas como DNA barcode foram obtidas através da amplificação parcial do gene citocromo c oxidase I e a distância genética calculada pelo método Kimura 2 Parâmetros (K2P). Os resultados da análise morfométrica revelaram pré-maxilar com duas séries de dentes, presença de ganchos nas nadadeiras anal e pélvicas de machos, corpo alongado, com uma mancha umeral com prolongamento anteroventral estreito em ambas as espécies. A citogenética evidenciou mesmo número diplóide, de 50 cromossomos, incluindo o primeiro par de cromossomos metacêntricos de grande porte em relação aos demais do complemento, mesma fórmula cariotípica (4m + 24sm + 6st + 16a) e mesmo número fundamental (84). As marcações de rDNA 5S coincidiram na região centromérica do par cromossômico 19 e foram evidenciados sítios múltiplos de rDNA 18S, localizados nas regiões teloméricas dos cromossomos em ambas as espécies analisadas. As Ag-RONs mostraram-se coincidentes com os sítios de 18S na maioria dos casos. A distribuição dos blocos de heterocromatina constitutiva ocorreu preferencialmente nas regiões centroméricas e terminais dos cromossomos, coincidentes com a maioria dos sítios ribossomais e das Ag-RONs nas regiões teloméricas. A análise do DNA barcode através do gene COI revelou uma divergência genética interespecífica de 0,2%, índice abaixo do considerado limiar para a separação de espécies de peixes (2%). Estes diferentes níveis de análise sugerem que A. serratus e A. laticeps são espécies sinônimas, ampliando a ocorrência de A. laticeps para a bacia do Rio Iguaçu e reforçando a hipótese de compartilhamento de fauna, provocado pelas atividades tectônicas do escudo cristalino. As variações interespecíficas encontradas no mapeamento de heterocromatina constitutiva, Ag-RONs e rDNA 18S são comuns em Astyanax e derivam de eventos não robertsonianos, mas também podem refletir um processo de vicariância, com o isolamento geográfico das bacias hidrográficas e restrição de fluxo gênico entre a população do rio Iguaçu e populações litorâneas.

El present treball parteix de la base d'estudi dels exemplars de la Família Triglidae capturats dintre del Programa de Recerca anomenat Fundaments for the Restructuration of the Demersal Fisheries in the Pacific Mexican Coast finançat per la Comunitat Europea. En el seu inici, i a manca de més informació, hom considerà seriosament la possibilitat de l'estudi taxonòmic de les espècies d'aquesta família com a matèria interessant d'anàlisi. Amb aquesta decisió, donàvem per fet que la sistemàtica del grup a nivell supra-específic era clara i, a més, que el grup, és a dir, la família Triglidae, estava clarament assentada dins l'organització del Regne Animal. Amb aquesta idea inicial, hom començà a triar i conservar mostres de lluernes per a llur estudi posterior a terra. Amb aquest material obtingut en aigües del Pacífic oriental, afegit a les mostres conservades a les Col•leccions Biològiques de Referència (CBR) de l'Institut de Ciències del Mar (ICM), creguérem disposar d'un bon punt de sortida per a un treball d'aquestes característiques. La revisió inicial dels exemplars conservats a les nostres col•leccions i dels que amablement rebérem en préstec d'algunes institucions de tot el món, juntament amb l'estudi i anàlisi bibliogràfics, no feu altre cosa que aprofundir la sensació que teníem de confusió general a l'hora de classificar els peixos de la família. Sorprenentment, fins i tot els treballs publicats recentment palesaven aquest fet i alguns dels autors llegits demanaven explícitament una revisió global de certs taxa supra-específics, fins i tot a nivell de la família. Per altra banda, ens adonàrem que quasi tota la bibliografia utilitzada per a la identificació de les mostres tenia un fort biaix geogràfic, fent necessari conèixer l'àrea de captura dels individus per tal de poder utilitzar la clau escaient. A més a més, els caràcters utilitzats per a la descripció de grups eren sovint incomparables (com si dues parts del món s'ignoressin), no tant sols entre diferents autors ans també entre dues espècies descrites en el mateix treball. Segons això, no ens va caldre gaire temps ni llegir gaires treballs per veure que la nostra concepció inicial d'harmonia i estabilitat sistemàtica de la família era força equivocada i, com més informació rebíem, més difícil se'ns feia esbrinar què podia donar-se per bo i on calia aprofundir per mirar de clarificar. Totes aquestes circumstàncies preliminars podran donar una idea d'un sentiment més o menys estès entre els investigadors embrancats en la família: la situació taxonòmica i sistemàtica és caòtica. Aquesta crua sentència, amb paraules diferents segons l'autor, es fa palesa llegint alguns dels treballs generals sobre la família i taxa superiors. També ens adonàrem dels diversos parers sobre quins taxa havien d'assignar-se a la família Triglidae, depenent de l'ictiòleg que opinava, i que tampoc la imatge inicial que ens havíem fet d’aquesta família, definida de la manera que hom veurà més endavant, podia considerar-se vàlida. Alguns d'aquells investigadors pensaven que la família Triglidae és clarament diferent de l’anomenada família Peristediidae, mentre d'altres escrigueren que ambdós taxa havien de considerar-se una única família Triglidae, en qualsevol cas subdividit en dues subfamílies: Triglinae i Peristediinae. Hi havia qui, fins i tot (alguns dels antics), hi feia entrar espècies que pertanyen a famílies absolutament diferents com, per exemple, Cottidae. Per recomanació d'autors amb més base filogenètica de la que nosaltres disposàvem, prenguérem la decisió de considerar el que per alguns eren les famílies Triglidae i Peristediidae com a una unitat englobada en la família Triglidae. Fou aleshores quan decidirem modificar el rumb inicial de la recerca per tal d'enfocar-lo vers una revisió supra-específica, al nostre albir molt més necessària que l’específica per tal de sistematitzar globalment la família: des de la definició d'aquesta fins el nivell de subgènere, deixant per més endavant la clarificació de la situació de les espècies un cop creguéssim organitzada aquella. Amb aquesta fita final i la idea de trobar descripcions curtes però clares dels diferents taxa amb trets vàlids per a qualsevol espècie en qualsevol lloc del món, endegàrem la tasca que hom ara presenta. Enguany, creiem haver arribat al moment de fer una proposta d'organització a nivell supra-específic de la família Triglidae, que no pretén altra cosa que intentar acostar-se subjectivament a la classificació natural del grup. En el capítol ANTECEDENTS, per una banda, hom fa un repàs de les diverses situacions que poden trobar-se en la bibliografia de caire taxonòmic de la família. Hom palesa, de forma molt resumida, algunes de les incongruències que poden trobar s'hi i que, pel lector no avesat en el tema, poden dur a confusió i a una necessitat de revisió amb detall per tal d'esbrinar la part correcta dels treballs. Per altra banda, en el mateix capítol, hom fa una exposició sobre la posició sistemàtica de la família Triglidae en base a una sèrie de treballs seleccionats des de la publicació de la desena edició del treball de Linné (1758). Amb aquestes revisions hom palesa la situació, esmentada més amunt, de que fins i tot no està clara la sistemàtica de l'Ordre Scorpaeniformes al que pertany la família estudiada. Finalment, en els ANTECEDENTS i dintre de l'apartat anomenat CRONOLOGIA DE LES DESCRIPCIONS, hom descriu i comenta els diferents taxa de rang comprés entre el familiar i el subgenèric descrits tanmateix des del treball de Linné (1758). Amb això hom pretén informar al lector de la confusió intra-familiar pel que fa a la definició de taxa i al diferent ús que de cadascun d'ells s'ha anat fent al llarg de la història de la ictiologia moderna. En el capítol dedicat a la METODOLOGIA, hom cita les espècies estudiades i llur procedència geogràfica, per tal de donar al lector una indicació de l'abast de la informació que hom disposa per a la realització de l'estudi. La part més extensa, però, del conjunt d'aquest capítol es dedica a la descripció de les variables morfomètriques i merístiques utilitzades al llarg dels anys de realització del treball. Amb això es fa la proposta d'estandardització de les esmentades variables amb la finalitat d'assolir la uniformització de la presa de dades per part dels investigadors dedicats a l'estudi de la família. Finalment, i dins del mateix capítol, es defineixen les bases d'utilització dels mètodes de taxonomia numèrica emprats com a eina complementària per a la definició dels diferents grups tractats en aquest estudi. En qualsevol cas, cal tenir en compte que, malgrat la potència d'algunes tècniques de taxonomia numèrica, aquesta metodologia no s'ha emprat en cap moment com a mètode definitori de les característiques dels diferents taxa tractats amb més detall en el capítol de RESULTATS, ans sempre ha estat prioritària, en cas de divergències clares, la visió humana del problema. El capítol 5 fa referència als RESULTATS tot i que bona part de l'anomenat ANTECEDENTS conté dades que podrien incloure's en el primer i que no s'ha fet per tal de mantenir un fil conductor que facilités la comprensió cronològica de la situació i ajudés a veure els resultats. En aquest capítol, i partint de la base d’una única família sense divisions preestablertes, hom va fent separacions en base a caràcters bàsicament merístics partint del nivell de família fins arribar al nivell subgenèric. Un cop clarificada la separació en dos o més grups del conjunt de partida, hom en dóna els trets diferenciadors i s'hi inclouen, finalment, les diverses espècies que compleixen les característiques citades. A partir d'ací, tot i que es mantenen per raons d'estabilitat de la nomenclatura els noms de la immensa majoria de taxa, aquests són redefinits en base als caràcters definitoris emprats per a la separació. Per necessitats ineludibles, al nostre parer, només un taxon de nivell subgenèric ha estat anomenat com a nou. Amb tot això, hom arriba a la conclusió que la Família Triglidae està estructurada com una unitat sistemàtica i que inclou dues Subfamílies (Peristedioninae i Triglinae), cinc Tribus (Gargariscini, Peristedionini, Prionotini, Pterygotriglini i Triglini), nou Gèneres (Gargariscus, Heminodus, Peristedion, Satyrichthys, Prionotus, Pterygotrigla, Uradia, Lepidotrigla i Trigla) i setze Subgèneres (Heminodus, Paraheminodus, Bellator, Prionotus, Bovitrigla, Dixiphichthys, Otohime, Pterygotrigla, Lepidotrigla, Pectorisquamis subgen. nov., Paratrigla Aspitrigla, Chelidonichthys, Eutrigla, Trigla i Trigloporus). Part important d'aquest treball consisteix en la INTRODUCCIÓ A LA BIOGEOGRAFIA DE LA FAMÍLIA TRIGLIDAE. Certament, aquesta és la primera aproximació a nivell mundial que hom fa de la distribució geogràfica de la família arreu del món. Aquest capítol s'il•lustra amb la inclusió de mapes, partint de la base de les àrees de pesca de FAO, per a cadascun dels taxa tractats en el capítol de RESULTATS, de tal manera que pot veure's la localització d'aquells en els diferents mars i oceans del planeta. Aquesta introducció biogeogràfica intenta explicar-se mitjançant una HIPÒTESI DE RADIACIÓ a partir de l'hipotètic punt d'origen en el Pangea i durant el període Triàsic. Aquest capítol es complementa amb un llistat de les diferents espècies que hom pot trobar en cadascuna de les àrees geogràfiques del món. Deixant de banda les CONCLUSIONS, part de les quals s'han inclòs de forma implícita en aquest RESUM, el capítol de BIBLIOGRAFIA clou la present memòria de Tesi Doctoral. En aquest s'han inclòs, a banda dels treballs citats en el text, tota una sèrie de treballs de caire taxonòmic sobre la família Triglidae i que, malgrat no ésser exhaustiu, sí que representa la major part del que s'ha publicat en temps de la ictiologia moderna.
This work arises from the study of the specimens of the Family Triglidae collected during the research program named Fundaments for the Restructuration of the Demersal Fisheries in the Pacific Mexican Coast which was financed by the European Commission. Initially, and with the information available at that time, we seriously considered the possibility of the taxonomic study of the species of this family as an interesting subject for analysis. By making this decision we were accepting beforehand that the systematics of this group at a supraspecific level was clear and that of the group itself, the family Triglidae, was also precisely defined and settled within the organisation of the Animal Kingdom. Having this initial idea in mind, we began to choose and preserve many samples of gurnards for their later study on land. With these specimens collected in waters of the Eastern Pacific ocean plus those preserved in the Biological Reference Collections (CBR) of the Institut de Ciències del Mar (ICM) at Barcelona, we believed to have a good starting point to face the work in mind. The initial revision of the specimens preserved in our collections and those kindly loaned by research institutions from all around the world combined with the study and analysis of the literature rapidly increased our feeling of a general confusion on the classification of the species of the family. Surprisingly, even recent papers shared this feeling of ours and some of the authors explicitly claimed for a global revision of several supraspecific taxa, even at a family level. On the other side, we realised that almost all literature used for the identification of the samples had a noticeable geographical bias, making thus necessary to know the capture area to use the proper key. Additionally, the characters used in the description of taxonomic groups were often incomparable (as two parts of the world were ignoring each other), not only between different authors but also between two different species described in the same article. After that, we did not need too much time and read too many papers to realise that our initial concept of systematic harmony and stability of this family was quite wrong and the more information we gathered more difficult was to choose what could be considered as valid and where should we focus in an intent to clarify the situation. All these preliminary circumstances afford evidences of a rather common feeling among the taxonomists engaged in the study of this family: the taxonomic and systematic situation is chaotic. This crude sentence, differently worded depending on the author, is understood when reading some of the general works on this family and higher taxa. We could also read and receive the different opinions, depending on the ichthyologist, on which taxa should be assigned to the family Triglidae and that neither the initial picture we made of it, defined as is explained in this memoir, could be considered as valid. Some of these researchers thought that the family Triglidae is clearly distinguished from the family Peristediidae, while others wrote that both taxa should be considered as a single family Triglidae eventually splitted into two subfamilies: Triglinae and Peristediinae. Even some of the older authors included species in Triglidae which actually belong to families absolutely different as Cottidae. Following the recommendation of authors with a deeper phylogenetic background that ours we made the decision of considering the (for some authors) families Triglidae and Peristediidae as a single family Triglidae. It was at that time when we decided to modify the original objective of our research to focus it on a supraspecific revision which, in our opinion, seemed to be much more necessary than the specific with the aim of globally systematize the family Triglidae: from its definition down to the subgeneric level, leaving the species clarification for later works once the systematics of the family is clarified. With this new final goal in mind and the commitment of giving short but clear descriptions of the supraspecific taxa by using valid common characters for any species anywhere in the world, we began the task now delivered. Today, we believe to have reached the point to make a proposal on the organisation of the family Triglidae at a supraspecific level which pretends to contribute with a subjective approach to the natural classification of this group. In the chapter ANTECEDENTS (BACKGROUND) a revision of the different situations found in the taxonomic literature of the family is done. In a very brief way, some of the inconsistencies are presented. Those inconsistencies may confuse the student and thus make necessary a more detailed reading to find out the correct part of the works for those not familiar with the matter. On the other side and in the same chapter, it is presented the systematic position of the family based on the revision of the major works since Linnaeus (1758). The situation above mentioned can be clearly seen when discussing those revisions where even is uncertain the systematics of the Order Scorpaeniformes to which the family Triglidae is assigned. Finally, in the chapter BACKGROUND and under the section named CRONOLOGIA DE LES DESCRIPCIONS (CHRONOLOGY OF DESCRIPTIONS) the different taxa between the family and the subgenera described up-to-date since Linnaeus (1758) are explained and commented. This intends to reveal the intra-familiar confusion regarding the taxa definition and the different usage throughout the years in modern ichthyology. In the chapter devoted to METODOLOGIA (METHODOLOGY) the species studied and their geographical origin are listed to make a picture of the amount of information used in the present study. The largest part, however, of this chapter is devoted to the description of the morphological and meristic variables used in this work. This is also a proposal on the standardization of those variables with the aim of its use by as many ichthyologists of this family as possible. In this chapter too, the use of the methods of numerical taxonomy are described which are used as a complementary tool for the definition of the different groups treated in this study. In any case, besides the power of some of these techniques of numerical taxonomy, this methodology has never been used as the final argument to define the characters of the different taxa treated in detail in the chapter RESULTATS (RESULTS) as the human point of view has always been considered as the primary when clear diverging conclusions have been reached by any of those two means. Chapter 5 deals with the RESULTS although part of the content of the BACKGROUND could be also included in the former. The information has been structured into chapters in such a way that the reader can follow a chronological path of the overall situation and thus the results of the study be easier understood. In this fifth chapter, and starting from the concept of a single family without predefined divisions, this taxon is splitted into groups mostly using meristic characters beginning at the family level and going down until the subgenus. Once a starting group is separated into two or more units, its differentiating features are given and the species accomplishing them are assigned to it. For stability reasons most taxa names are maintained although these are redefined based on the differentiating features found and used in the separation of groups. Due to unavoidable reasons, only a new taxon of subgenus rank has been described. After the completion of the study we reach the conclusion that the Family Triglidae is structured as a systematic unit including two Subfamilies (Peristedioninae and Triglinae), five Tribes (Gargariscini, Peristedionini, Prionotini, Pterygotriglini and Triglini), nine Genera (Gargariscus, Heminodus, Peristedion, Satyrichthys, Prionotus, Pterygotrigla, Uradia, Lepidotrigla and Trigla) and sixteen Subgenera (Heminodus, Paraheminodus, Bellator, Prionotus, Bovitrigla, Dixiphichthys, Otohime, Pterygotrigla, Lepidotrigla, Pectorisquamis subgen. nov., Paratrigla Aspitrigla, Chelidonichthys, Eutrigla, Trigla and Trigloporus). An important part of this work is the INTRODUCCIÓ A LA BIOGEOGRAFIA DE LA FAMÍLIA TRIGLIDAE (INTRODUCTION TO THE BIOGEOGRAPHY OF THE FAMILY TRIGLIDAE). Indeed this is the first world-wide approach to the geographical distribution of the family. This chapter is built by maps of the FAO fishing areas for each of the taxa given in the RESULTS in such a way that the reader can graphically see the distribution of any group in the oceans and seas of the Earth. We try to explain this introduction to the biogeographic distribution by means of a radiation hypothesis located in the Pangea of the Triassic period. This chapter is complemented with a list of the different species that can be found in each of the geographical areas of the world. Besides the CONCLUSIONS which implicitly have been cited in this abstract, this Ph.D. manuscript is finished with a chapter on the LITERATURE. In it not only the works cited in the body of the text have been listed but also a series of taxonomic papers on the family Triglidae that, although not exhaustive, are the majority of the papers published by modern ichthyologist.