Dissertations / Theses: 'Tomates – Moyens de défense'

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Odobasic, Preradov Andreja. "Effets du benzothiadiazole sur l'induction des mécanismes de défense chez la tomate (Solanum lycopersicum): une étude protéomique comparative." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25525/25525.pdf.

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Coqueret, Victoire. "How do plants defend themselves? : Study of the Tomato - Tuta absoluta pathosystem in interaction with nitrogen fertilization." Thesis, Université de Lorraine, 2017. http://www.theses.fr/2017LORR0234.

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Abstract:

L’identification des réponses écophysiologiques des plantes est un préalable pour améliorer les défenses naturelles des plantes et réduire l’usage d’intrants chimiques dans les cultures. Les réponses des plantes vis-à-vis d’une agression herbivore fait intervenir des mécanismes de résistance et de tolérance. Les réponses à une agression d’une larve mineuse sont peu documentées contrairement aux insectes piqueurs ou broyeurs. L’objectif de ma thèse a été de caractériser les traits de réponse de la tomate vis-à-vis de Tuta absoluta afin de déterminer les réponses locales et systémiques en termes de composés solubles et volatils. Nous avons regardé les réponses de la tomate soumise à deux niveaux contrastés de la disponibilité en azote, sachant que l’azote est un levier sur lequel il est possible de s’appuyer pour modifier le niveau de défense des plantes. Nous avons travaillé sur la tomate, une solanacée cultivée en hydroponie et sujette à un ravageur Tuta absoluta. Notre stratégie de recherche s’est portée sur l’identification et la quantification des composés de défense solubles et volatils, et sur la détermination du pouvoir nutritionnel des tissus foliaires. Nous avons montré que la plante de tomate met en place une résistance induite par l’herbivore se traduisant par une augmentation de la concentration en acide chlorogénique, caffeoyl putrescine et tomatine localement au niveau de la zone parasitée et / ou de manière systémique dans les autres compartiments foliaires non infestés. Le rôle de ces molécules dans la défense de la tomate vis-à-vis de Tuta absoluta doit encore être confirmé. Nous avons montré aussi que la tomate met en place une défense indirecte contre Tuta absoluta, basée sur l’émission de composés volatils au voisinage des plantes. Nous avons identifié plusieurs nouveaux COVs synthétisés lors de l’herbivorie par Tuta absoluta (m-cymène, menthatriène, ß-cis-ocimène, ß-phellandrène, terpinolène, ß−caryophyllène, humulène). Parmi tous les COVs que nous avons identifiés, certains sont connus pour être émis en plus grande quantité lors d’une attaque herbivore et jouer un rôle dans l’attraction des insectes prédateurs ou la répulsion des femelles pondeuses. Ainsi, leur élicitation semble générique de l’herbivorie et pas spécifique de Tuta absoluta. La spécificité des interactions tomate - Tuta absoluta pourrait être renforcée par des analyses plus poussées en métabolomique, transcriptomique (expression de gènes RNAseq) et en s’intéressant aux voies de signalisation induite. Contrairement à ce qui était attendu, nos résultats montrent peu d’effets de la limitation en azote sur les réponses observées. Néanmoins, comme ce qui a été démontré précédemment, la limitation azotée impacte le développement larvaire. Mes travaux ont permis de renforcer l’hypothèse "trophique" du ralentissement du développement larvaire par la limitation en azote. Ainsi, la stœchiométrie du bol alimentaire est fortement modifiée et les larves doivent consommer plus de matières pour acquérir l’azote nécessaire à leur développement. Néanmoins nous ne pouvons pas écarter l’hypothèse "composés de défense". En effet, nous avons montré que les concentrations en composés phénoliques et tomatine et des émissions de COVs supposés être impliqués dans la défense constitutive, sont plus fortes en cas d’une limitation en azote. La diversité et la complémentarité des expérimentations permettront aux données acquises d’alimenter un modèle de fonctionnement de la plante agressée qui pourrait comporter une fonction de défense réactive à la nutrition azotée
The identification of ecophysiological responses of plants is a prerequisite for improving the natural defences of plants and reducing the use of chemical inputs in crops. Plant responses to herbivorous attack involve defence and tolerance mechanisms. Plant responses to a leafminer larva are pourly documented, in contrast to chewing and piercing insects. The objective of my Ph.D. was to characterize the tomato trait responses to Tuta absoluta herbivory in order to determine the local and systemic responses in terms of soluble and volatile compounds. We looked at the responses of tomatoes subjected to two contrasting levels of nitrogen availability, knowing that nitrogen is a lever to promote the basal plant defence level. We worked on tomato, a Solanaceae, grown in hydroponics and subjected to Tuta absoluta. Our research strategy has focused on identifying and quantifying soluble and volatile defence compounds and determining the nutritional value of foliar tissues. We have shown that tomatoes establish an induced- resistance against the herbivore, which results in a concentration increase of chlorogenic acid, caffeoyl putrescine and tomatine locally at the level of the parasite zone and / or systemically in the others non-infested foliar compartments. The defence role of these molecules on Tuta absoluta has yet to be confirmed. We have also shown that tomatoes set up an indirect defence against Tuta absoluta, based on the emission of volatile compounds in the vicinity of plants. We have identified several new herbivore-induced VOCs (m-cymene, menthatriene, ß-cis-ocimene, ß-phellandrene, terpinolene, ß−caryophyllene, humulene). Some of the identified VOCs are known to be emitted in greater quantities during a herbivorous attack and to play a role in attracting predatory insects or repelling egg-laying females. Thus, their elicitation seems generic to herbivory and not specific to Tuta absoluta. The specificity of tomato - Tuta absoluta interactions could be enhanced by further analysis in metabolomics, transcriptomics (expression of RNAseq genes) and by investigating the induced signaling pathways. Contrary to what was expected, our results show little effect of the nitrogen limitation on the observed responses. Nevertheless, as demonstrated previously, nitrogen restriction affects larval development. My work has reinforced the “trophic“ hypothesis of slowing larval development by a limited nitrogen availability. Thus, the stoichiometry of the food bowl is highly modified and the larvae have to consume more material to acquire the nitrogen necessary for their development. Nevertheless, we can not exclude the hypothesis “compounds of defence“. Indeed, we have shown that the concentrations of phenolic compounds and tomatine and of the VOC emission supposed to be involved in the constitutive defence are increased in the case of nitrogen limitation. The diversity and complementarity of the experiments will allow the acquired data to feed a functional model of the attacked plant. This model might include plant nitrogen regimes as a reactive plant defence factor

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Maouche, Samia. "Les moyens de défense contre les OPA hostiles." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCB231.

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Abstract:

Opérations particulièrement complexes, les offres publiques d'acquisition ne cessent de faire parler d'elles, plus particulièrement lorsqu'elles présentent un caractère hostile pour la société visée. De nombreux efforts législatifs ont été mis en œuvre en vue d'encadrer les OPA et de lutter contre les prises de contrôle rampantes. L'analyse du droit positif permet de mettre en lumière ces différents efforts ainsi que leur mise en œuvre à travers diverses techniques par les sociétés visées. Ces dernières ont par ailleurs développé un certain nombre de mécanismes de défense anti-OPA particulièrement efficaces, mais se révélant le plus souvent insuffisants face à l'ingéniosité dont peut faire preuve l'initiateur. Le droit positif montre ainsi ses limites face à des pratiques qui ne cessent d'évoluer. L'analyse prospective du droit anti-OPA permet d'observer les nouvelles mutations que subit le droit positif au regard des nouveaux enjeux économiques. Elle permet également d'envisager de nouveaux modes d'appréhension des OPA hostiles. Il est ainsi possible d'observer que le gouvernement d'entreprise prend une place considérable dans la vie des sociétés cotées. De même, la montée en puissance de la régulation et l'interventionnisme de l’État sont de plus en plus marqués ; et les salariés s'impliquent de plus en plus dans la gestion de l'entreprise. L'ensemble de ces paramètres marquent un glissement progressif vers une réorganisation du mode de fonctionnement des sociétés, ce qui a amené au développement du soft law, un droit à la frontière du droit positif et des pratiques des sociétés. Le soft law constitue à ce titre une approche inédite des OPA hostiles, dont l'analyse permet de cerner les apports liés à la mutation du droit positif et d'envisager l'émergence de nouveaux moyens de défense. Celui-ci doit toutefois demeurer complémentaire au cadre législatif et réglementaire existant
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Fournier, Ceresa Sophie. "Les moyens de défense contre les offres publiques d'achats-offres publiques d'échanges." Paris 1, 1988. http://www.theses.fr/1988PA010288.

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Abstract:

La vague recente de dereglementation a mis en evidence la vulnerabilite des societes francaises face aux offres publiques inamicales. L'adoption de moyens de defense, dont certains s'inspirent des techniques americaines, doit cependant se faire dans le respect de la legitimite et de la legalite. Une telle exigence doit etre satisfaite tant pour les moyens de defense fondes sur la protection du capital -controle des actionnaires et acquisition des titres- que pour ceux fondes sur la protection du "controle" - rendre l'acquisition moins profitable, "liberer" le controle du capital -. Il apparait que cette exigence de legitimite et de legalite n'est pas toujours satisfaite. Certaines lacunes de la reglementation subsistent, permettant des exces tant dans les defenses que dans les attaques. L'elaboration d'un droit des prises de controle contestees n'est peut etre donc pas encore acheve
The recent deregulation wave pointed out the french companies weakness when confronted to hostile takeover bids. Though defensive tactics adoption among which some are inspired by american strategies must be achieved in the respect of legitimity and legality. Such a requirement should be satisfied for the defensive ploys based on protection of the capital - shareholders control and shares acquisitions - as well as for those based on protection of the "control" - make the takeover less valuable and "free" the control from the capital. This requirement is not always satisfied. Some loopholes in french regulation allow excesses in defenses and in agressions. Therefore contested takeovers rules are not completed

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Royer, Mathilde. "Étude des relations entre croissance, concentrations en métabolites primaires et secondaires et disponibilité en ressources chez la tomate avec ou sans bioagresseurs." Thesis, Université de Lorraine, 2013. http://www.theses.fr/2013LORR0058/document.

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Abstract:

Dans un contexte de limitation de l'utilisation des pesticides, une voie de recherche prometteuse porte sur le déterminisme environnemental actionnant les mécanismes de défense de la plante, entre autres, la production de métabolites secondaires. L'objectif de mon travail de thèse a été d'étudier le compromis entre croissance et défense (métabolisme primaire vs. secondaire) dans les tissus de la plante saine ou attaquée par différents bioagresseurs, sous différentes conditions de disponibilité en ressources. Pour cela, nous avons mesuré différents paramètres de croissance, les ratios C/N des tissus, les concentrations en principaux métabolites primaires (glucides simples, amidon) et en composés de défense (acide chlorogénique, rutine, kaempferol-rutinoside et tomatine) dans différents organes de tomate en culture hydroponique en serre ou phytotron. Nous avons observé que les variations des ratios C/N total et de ressources sont positivement corrélées à celles de nombreux composés de défense quelle que soit leur composition en N et C. De plus, nous avons montré qu'en présence d'un bioagresseur, les concentrations des composés primaires et secondaires ne suivent pas la même évolution selon leur nature. La synthèse de caffeoyl putrescine est fortement induite lors de l'attaque par P. syringae alors que la concentration en acide chlorogénique est diminuée. L'inoculation de P. syringae réduit les concentrations en glucose et fructose alors que P. corrugata stimule leur synthèse. Enfin, nous avons observé qu'une faible disponibilité en azote altère le développement de P. syringae, P. corrugata et Tuta absoluta mais favorise le développement de Botrytis cinerea. Nos résultats ont montré que le ratio C/N est un indicateur fiable du compromis croissance/défense dans le cas d'une plante saine. Dans le cas d'une plante attaquée, la répartition des ressources entre les différents métabolites varie en fonction du bioagresseur. Et chaque bioagresseur réagit de façon différente aux variations de disponibilité en azote de la plante. La maîtrise des conditions de culture apparaît comme un levier agronomique pertinent pour raisonner la lutte contre les bioagresseurs même s'il est difficile d'appliquer des règles générales sur l'interaction plante/environnement/bioagresseurs
Nowadays, limiting the use of pesticides is mandatory. A promising way for research deals with the environmental determinism of plant defence mechanisms, among others, production of secondary metabolites. The aim of my PhD work was to study the trade-off between growth and defence (primary vs. secondary metabolism) in healthy plant tissues or attacked by different pests, under different conditions of resources availabilities. We measured different growth parameters, C:N ratios of tissue, concentrations of main primary metabolites (simple carbohydrates, starch) and defence metabolites (chlorogenic acid, rutin, kaempferol-rutinoside and tomatine) on healthy or attacked tomato plant grown in hydroponic culture in greenhouse or phytotron. We observed that variations of total and resources C:N ratios were positively correlated to that of several defence compounds whatever their composition in carbon and nitrogen. Moreover, we showed that, during pests attack, concentrations of primary and secondary metabolites did not follow the same evolution, depending on their nature. Caffeoyl putrescine synthesis was strongly induced by P. syringae inoculation whereas chlorogenic acid concentration decreased. Inoculation of P. syringae induced a strong decrease of concentration of glucose and fructose whereas inoculation of P. corrugata enhanced their synthesis. We observed that a low N availability alters the development of P. syringae, P. corrugata and Tuta absoluta but promotes the development of B. cinerea. Our results showed that C:N ratio is a reliable indicator of the trade-off between growth and defence in the case of healthy plant. In attacked plant, the resources allocation between different metabolites varies with pests. And each pests reacts specifically to changes of N availability for the plant. Control of culture conditions appears to be a relevant agronomic tool to monitor the control of pests even if it is difficult to apply general rules to the interaction plant/environment/pests

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Forges, Marine. "Les rayonnements UV-C : un moyen de lutte pour stimuler les défenses du fraisier et de la tomate en cours de culture et améliorer la qualité / conservation des fruits après récolte." Thesis, Avignon, 2018. http://www.theses.fr/2018AVIG0700/document.

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Abstract:

Certains champignons sont très dommageables pour les plantes mais aussi pour la conservation après récolte des produits végétaux. Les restrictions réglementaires concernant l’utilisation des fongicides nécessitent de trouver des solutions alternatives. L'amélioration de la résistance des plantes en utilisant des méthodes physiques, comme les rayonnements UV, peut présenter une alternative prometteuse en association avec d’autres méthodes dans le cadre d’une protection intégrée des cultures. L'objectif de cette thèse a été d’étudier l’effet des rayonnements UV-C sur la sensibilité des plantes aux agents pathogènes. Les rayonnements UV-C ont été appliqués durant la culture, seuls ou en combinaison à des agents de biocontrôle, ou en post-récolte. Les expérimentations ont été menées sur deux espèces végétales : le fraisier et la tomate.Sur fraisier, des traitements UV-C à une dose de 1,70 kJ/m² entraînent une diminution systématique d'environ 20 % de la sensibilité des feuilles à Botrytis cinerea et diminuent jusqu’à 50 % le nombre de feuilles attaquées par Podosphaera aphanis, l’agent causal de l’oïdium. Chez la tomate, la protection des feuilles contre B. cinerea atteint 43 % avec une dose d’UV-C cumulée de 4,0 kJ/m². Ces mêmes traitements UV-C appliqués sur fruits réduisent la sensibilité des fraises vis-à-vis de Rhizopus de 75 % mais aucun effet n’est observé vis-à-vis de B. cinerea. Au contraire, sur fruits de tomate, la sensibilité est diminuée d'environ 63 % contre cet agent pathogène. Parallèlement, des tests biochimiques et gustatifs suggèrent que la qualité des fruits n’est pas significativement améliorée ni altérée par les expositions UV-C. Malgré un effet germicide marqué des rayonnements UV-C sur feuilles de fraisiers, aucun effet bénéfique de l’application de ces rayonnements sur le niveau d’efficacité d’agents de lutte biologique n’a été mis en évidence.Nos observations sont encourageantes pour envisager une utilisation de cette méthode dans un schéma de protection intégrée des cultures. Cependant, une compréhension claire de la façon dont les rayonnements UV-C sont perçus par les plantes et traduits en mécanismes de défense est nécessaire avant que leur utilisation ne soit recommandée sur le terrain
Some fungi are very damaging during plant cultivation and also in post-harvest storage of products. Regulatory restrictions on fungicide use require alternative solutions. Improving plant resistance using physical methods, such as aplication of UV radiation, can be a promising alternative in association with other methods as part of an integrated pest management strategy. The objective of the present thesis was to study the effect of UV-C aplication on the sensitivity of plants to fungal pathogens. UV-C radiation was applied during plant cultivation, alone or in combination with biocontrol agents, or in post-harvest. Experiments were conducted on two plant species: strawberry and tomato.On strawberry plants, UV-C treatments at 1.70 kJ/m² result in a systematic 20 % decrease in leaves sensitivity to Botrytis cinerea and in a reduction by up to 50 % of the number of leaves infected by Podosphaera aphanis, the causal agent of powdery mildew. In tomato, leaves protection against B. cinerea reaches 43 % with a cumulative dose of 4.0 kJ/m². UV-C treatments applied on fruits reduce the strawberry sensitivity to Rhizopus by 75 % but no effect is observed against B. cinerea. On the contrary, sensitivity against B. cinerea is reduced by 63 % on tomato fruit. Biochemical and taste tests suggest that fruit quality is not significantly improved or altered by UV-C treatment. Despite a marked germicidal effect of UV-C radiation on strawberry leaves, it has no significant effect on the protective efficacy of biocontrol agents.Our observations are encouraging to consider the use of this tool in an integrated crop protection scheme. However, a clear understanding of how UV-C radiations are perceived by plants and their translation into defense mechanisms is necessary before their use is recommended in the field

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Etienne, Philippe. "Régulation de l'expression du gène tcI7, codant une sous-unité β1 de protéasome, au cours de la mise en place des réactions de défense des plantes." Dijon, 2001. http://www.theses.fr/2001DIJOS027.

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Abstract:

La compréhension des mécanismes naturels de défense des plantes représente un enjeu majeur pour la mise au point de méthodes alternatives à la lutte chimique, pour la protection des cultures. Dans ce contexte, nous avions précédemment isolé, par "diffential display", des gènes, dont le gène tc17, activés par un éliciteur protéique de réactions de défense, la cryptogéine. Le gène tc17 code une sous-unité b 1 de protéasome : le protéasome 20S est un complexe multicatalytique à activité protéasique composé de 28 sous-unités (14a et 14b) connu chez les animaux, pour intervenir dans de nombreux processus cellulaires, dont les mécanismes immunitaires. Au cours de ce travail de thèse, nous nous sommes principalement intéressés à l'étude de la régulation de l'expression du gène tc17, au cours de la mise en place des mécanismes de défense des plantes. Ainsi, à partir de différents modèles d'étude, nous avons mis en évidence une corrélation étroite entre l'accumulation rapide des transcrits du gène tc17 et la mise en place des mécanismes de défense, en particulier l'établissement de la résistance systémique acquise. Le clonage, par "marche sur le gène par PCR", du promoteur putatif de ce gène a montré la présence de nombreuses séquences régulatrices par des stimuli variés dont l'acide salicylique et le peroxyde d'hydrogène, ce que nous avons confirmé par Northerm-blot. Parallèlement, nous avons montré qu'au cours de la mise en place des mécanismes de défense, l'accumulation des transcrits du gène tc17 était corrélée à un accumulation de la protéine correspondante. Tous ces résultats suggèrent que le gène tc17 est impliqué dans la mise en place des réactions de défense et plus particulièrement de la résistance systémique acquise. Le clonage et l'étude de la régulation de gènes codant d'autres sous-unités de protéasome 20S de tabac en réponse à la cryptogéine, nous a permis de montrer que les sous-défense b1, a3 et a6 du protéasome étaient différentiellement induites au cours de la mise en place des mécanisme de défense. . .

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Jaouannet, Maëlle. "Caractérisation fonctionnelle d'effecteurs du nématode phytoparasite Meloidogyne incognita participant au succès de l'infection et à la suppression des défenses de l'hôte." Nice, 2011. http://www.theses.fr/2011NICE4096.

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Abstract:

Les nématodes à galle, Meloidogyne sp. , phytoparasites biotrophes obligatoires, ont la particularité de maintenir une interaction compatible avec leur hôte durant plusieurs semaines et d’induire la différentiation de cellules parenchymateuses en cellules nourricières leur permettant d’assurer croissance et reproduction. L’interaction plante-Meloidogyne incognita, dont le génome a été récemment séquencé, est un modèle particulièrement intéressant pour comprendre le succès du parasitisme. Les effecteurs du parasitisme, molécules injectées dans le tissu végétal par le stylet du nématode participent au succès du parasitisme. J’ai identifié trois nouveaux effecteurs de M. Incognita spécifiquement exprimés dans les phases précoces de l’interaction. Parmi eux, deux sont des gènes pionniers sans homologue dans les bases de données publiques et un code une métallopeptidase putative. J’ai observé que les deux gènes pionniers, nommés EFF14 et EFF25, étaient adressés dans des compartiments cellulaires différents, respectivement le noyau et le cytoplasme, après expression hétérologue en cellule végétale. L’analyse fonctionnelle d’EFF14 et de la calréticuline Mi-CRT protéine sécrétée dans l’apoplasme du site nourricier, a montré que ces deux effecteurs sont capables de réprimer les défenses basales de la plante. Mon hypothèse est que Mi-CRT agit sur les signaux calciques tandis que EFF14 agit dans le noyau des cellules végétales pour réprimer les défenses de la plante. Il apparaît donc que le nématode sécrète une panoplie d’effecteurs ayant des cibles différentes et agissant dans des compartiments subcellulaires différents pour maintenir son interaction avec la plante
Root-knot nematodes (RKN), Meloidogyne sp. , are obligate biotrophic parasites that maintain a compatible interaction with their host during the 5-8 weeks and induce the differentiation of parenchyma root cells into hypertrophied and polynucleated feeding cells that provide the nematode with the nutrients necessary for development and reproduction. The interaction plant-Meloidogyne incognita, whose genome was recently sequenced, provides a fascinating model for studying fundamental aspects of parasitism success. The nematode effectors produced in the esophageal glands and secreted via the stylet in the plant tissues play a major role in this interaction. I identified in M. Incognita three new effectors specifically expressed during the early steps of the interaction. Among them, two are encoded by pioneer genes with no homolog in databanks and one is a putative metallopeptidase. The two pioneer effectors EFF14 and EFF25 localized respectively in the nucleus and the cytoplasm of tobacco cells after heterologous expression. The calreticulin Mi-CRT, an effector previously identified in the group, is secreted in the apoplasm of giant cells. In this work, the functional analysis of EFF14 and Mi-CRT showed that the two effectors are able to suppress plant basal defenses. The current hypothesis is that Mi-CRT is modulating calcium signaling in the apoplasm whereas EFF14 is active in the nucleus for plant defense suppression. This work provides the first demonstration that a nematode effector is targeted to the nucleus of infected cells and the first functional characterization of plant defense suppression by nematode effectors. This work shows that a panel of effectors active in different compartments of plant cells contributes to the success of infection

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Octave, Stéphane. "Eutypiose de la vigne : caractérisation et effets physiologiques de composés protéiques toxiques excrétés par le champignon pathogène Eutypa lata : application à l'élaboration d'un test de diagnostic de la maladie." Poitiers, 2005. http://www.theses.fr/2005POIT2314.

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Abstract:

L'eutypiose est due au champignon Eutypa lata qui colonise le xylème. Le champignon induit des perturbations dans les flux hydriques de la plante mais émet également des toxines. La caractérisation de composés protéiques de haute masse moléculaire constitue l'objectif de ce travail développé selon deux axes: la mise au point d'un test immunologique de diagnostic et l'étude de l'implication éventuelle de ces composés dans le développement de la maladie. Les travaux ont permis d'obtenir des anticorps spécifiques pour développer une méthode de détection de l'infection par Eutypa lata par la technique des empreintes sur membrane et de détecter in-planta Eutypa lata par immunolocalisation. Des analyses physiologiques ont mis en évidence le caractère toxique des composés testés. Ils agissent sur de nombreux organites et dégradent les parois. Ces perturbations provoquent une baisse du potentiel énergétique de la cellule qui se manifeste par une inhibition de l'absorption des nutriments
Eutypa dieback is caused by Eutypa lata which colonises xylem by pruning wounds. The fungus triggers water fluxes modifications but toxins are also excreted and carried through the plant. Among these toxins, high molecular weight compounds of polypeptidic nature have been isolated. This work is focused on these proteins according to directions: development of an immunoassay diagnosis of Eutypa dieback and analysis of the involvement of these proteins in disease development. Specific antibodies were raised against theses proteins and used to reveal infection by the Dot-Blot method and detect in-situ Eutypa lata by immunolocalization. Physiological studies evidence a toxic effect of fungal proteins on plant cell leading to cell death by acting on various organelles and damaging plant cell wall. They act by modifications in ions fluxes, triggering a membrane depolarisation resulting in an impairment of energetic fueling in the cell, leading to an inhibition of nutriment absorption

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Jahyny, Benoît. "Histoire naturelle du genre de fourmis néotropical Thaumatomyrmex Mayr 1887 (Artropoda, Insecta, Hymenoptera, Formicidae, Ponerinae, Thaumatomyrmecini)." Paris 13, 2010. http://www.theses.fr/2010PA132002.

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Abstract:

Toutes les espèces de fourmis sont eusociales, cela implique notamment la division du travail reproducteur entre femelles reproductrices et d’autres plus ou moins stériles. Certaines espèces, telles plusieurs du genre Thaumatomyrmex, ont subi une réversion du stade hautement eusocial vers le stade primitivement eusocial où aucune différence morphologique n’existe entre les femelles qui se reproduisent et les autres. Chez ces espèces de Thaumatomyrmex qui se reproduisent exclusivement par gamergates (femelles de morphotype ouvrière fécondées et pondeuses), les femelles sont totipotentes comportementalement et reproductivement. Plusieurs gamergates peuvent cohabiter dans le même nid. La régulation de la reproduction et de la division du travail a été difficile à déterminer. Les Thaumatomyrmex occupent quasiment tous les biomes néotropicaux, vivent dans des milieux autant secs qu’humides, du niveau de la mer à 2000m d’altitude. Leur régime alimentaire peu commun est spécialisé sur les Penicillata dont elles réutilisent la défense physique basée sur les trichomes crochus, afin de construire une défense passive dissuasive. Ce comportement est unique. Cette défense leur permet d’utiliser au mieux les structures creuses dans le milieu et notamment des sites de nidification peu exploités par d’autres fourmis telles les coquilles d’escargot. Il leur permet surtout de diminuer la pression exercée par les prédateurs, compétiteurs et parasites. Cette défense combinée à une capacité de production de descendants par femelle qui favorise les petits nids, aurait pour conséquence une sélection orientée vers la diminution de la taille des sociétés, voire la suppression du comportement social. Cette prédiction est vérifiée pour la première fois grâce aux Thaumatomyrmex qui forment les plus petits nids connus chez les Formicidae avec moins de quatre femelles en moyenne. Toutes ces caractéristiques les amènent aux confins de la subsocialité, voire à la réversion vers le stade solitaire
All ant species are eusocial and thus exhibit a reproductive division of labour between fertile and more or less sterile individuals. Some species, such as several of the genus Thaumatomyrmex, have reverted from being highly eusocial to a primitively eusocial state where no morphological differences exist between reproductive and non-reproductive females. In Thaumatomyrmex species where reproduction exclusively stems from gamergates (mated and laying worker-like females), all females are reproductively and behaviourally totipotent. Several gamergates can coexist in the same nest. The regulation of reproduction and division of labour was hard to determine. Thaumatomyrmex species occupy almost all neotropical biomes, living as much in humid as dry habitats, and from sea-level to 2000m. Their very unusual specialised diet consists of Penicillata, whose hooked trichomes are reused as a deterring passive defence: this behaviour is unique. This defence allows them to take better advantage of hollow structures present in the habitat and underused by other ant species, such as snail shells. It mostly greatly reduces pressures associated with predation, parasites and competition. This defence behaviour, combined with a per female fertility promoting small nests, seems to select for a reduction in the size of societies, or even to a suppression of social behaviour. This theoretical prediction is thus for the first time evidenced in Thaumatomyrmex, where the smallest nest size ever recorder in Formicidae (less than four females on average) can be found. All these characteristics bring them to the fringes of subsociality, or even to a unique reversion to become solitary

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Dhondt, Sandrine. "Mécanismes de défense des plantes contre les agents pathogènes : caractérisation de lipide acyle hydrolases induites lors de la réaction d'hypersensibilité - relation avec les signaux de défense de type oxylipines." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2001. http://www.theses.fr/2001STR13164.

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Teplitsky, Céline. "Sensibilité des défenses induites à différentes modalités de prédation : cas des têtards d'anoures." Lyon 1, 2003. http://www.theses.fr/2003LYO10009.

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Abstract:

La variabilité de l'environnement (spatiale ou temporelle) nécessite que les organismes développent des adaptations telles que sélection de l'habitat, polymorphisme génétique, hétéroblastie ou encore plasticité phénotypique. La gamme de la variabilité nécessite de développer différents phénotypes et la fréquence de variabilité détermine quelle est la réponse la plus adaptée. Lorsque l'échelle de variation de l'environnement est inférieure à la durée de vie de l'organisme et supérieure à ses capacités de dispersion, une réponse plastique sera avantagée. La théorie prévoit que plus l'environnement est variable (en termes de gamme de variation ou de fréquence de variation), plus la réponse plastique devrait être importante, soit en termes d'intensité de réponse soit en termes de nombre de traits impliqués. La variabilité des interactions biotiques constitue un cadre idéal pour tester cette prédiction. Le cas de réponses plastiques à la prédation a été particulièrement bien étudié, sous le terme de défenses induites. Le but de cette thèse a été d'étudier l'impact de la variabilité de la présence de prédateurs (en termes de type de prédateurs ou de densité de prédateurs) sur les défenses induites des têtards d'anoures (Rana dalmatina, R. Ridibunda et H. Arborea). Je me suis principalement intéressée à un prédateur actif (épinoche, Gasterosteus aculeatus) que j'ai également comparé aux prédateurs de type "à l'affût" (Aeshne, Aeshna sp. ). Les principaux résultats sont: (1)La fréquence de variabilité de l'environnement joue sur le nombre de traits impliqués dans la réponse. (2)La gamme de variation de l'environnement joue sur le degré de plasticité par le biais (1) de la densité de prédateurs qui résulte en un investissement plus important dans les défenses et (2) du type de prédateur qui sélectionne des défenses spécifiques à un mode d'attaque du fait de mécanismes de réponses différents. En réponse à un prédateur actif, les têtards développent une musculature plus importante, qui permet une vitesse de fuite plus élevée. En réponse à un prédateur a l'affût, les têtards développent une nageoire plus haute, ce qui est supposé provoquer un effet de leurre. (3)Lorsque les deux types de prédateurs sont simultanément présents, les têtards répondent hiérarchiquement en développant la réponse spécifique adaptée au prédateur le plus dangereux (ici l'Aeshne). (4)Les réponses induites par les prédateurs actifs présentent un bénéfice. En présence directe de prédateurs, la survie des têtards ayant une musculature plus importante est plus élevée. (5)Les coûts des défenses s'expriment par une diminution du taux de croissance. Cette étude contribue à démontrer la sensibilité des réponse plastiques à la fréquence et la gamme de variations de l'environnement et suggère que des facteurs autre que la prédation (e. G. Structure de l'habitat, quantité de nourriture, perturbation anthropiques) peuvent jouer sur le développement des défenses induites.

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François, Julie. "Purification, identification et analyse fonctionnelle de protéines de transfert de lipides (LTP) secrétées par des cellules embryogènes de Vigne (Vitis vinifera) de la lignée 41B." Poitiers, 2005. http://www.theses.fr/2005POIT2355.

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Abstract:

Les LTP non spécifiques des végétaux sont capables in vitro de transférer des lipides entre deux membranes. Elles seraient impliquées dans des processus physiologiques tels que l'embryogenèse ou la réponse aux stress. Cinq LTP ont été purifiées à partir du milieu de culture de cellules de Vigne. Les masses moléculaires, les séquences peptidiques des 5 VvLTP et les ADNc correspondant à VvLTP3 et 4 ont été obtenus. Le maximum de production de VvLTP par les cellules 41 B peut être corrélé avec le passage des embryons du stade globulaire au stade cœur. Une surproduction de l'ensemble des VvLTP étudiées est observée dans les cellules 41B surexprimant VvLTP1. Les embryons issus de ces cellules ne présentent pas de cotylédons et un épiderme désorganisé : les LTP auraient donc une fonction in vivo durant l'embryogenèse. La capacité de VvLTP à fixer l'acide jasmonique a été mise en évidence et le complexe, infiltré dans des plantules de Vigne induit une protection vis-à-vis de Botrytis cinerea
Non-specific lipid transfer proteins are characterized by their ability to transfer lipids between membranes, in vitro. They are believed to be involved in physiological processes such as embryogenesis or plant defense responses to stresses but their in vivo function is still controversial. Five LTP isoforms produced by 41B embryogenic cells have been purified. Amino-acid sequences and two cDNA corresponding to VvLTP3 and 4 were obtained. The maximum of production of VvLTP can be correlated with the embryo transition from globular to heart stage. Overexpression of VvLTP1 in 41B cells leads to an overproduction of all VvLTP. Somatic embryos induced from thess transgenic cells have no cotyledons and display an unorganised epidermic layer : VvLTP could play an in vivo function during embryogenesis. Another part of this work study the interaction of VvLTP with jasmonic acid. Infiltration of VvLTP4/JA complex in grapevine leaves induces protection of plantlets against Botrytis cinerea

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Hugot, Karine. "Mécanismes de défense des plantes et acquisition de résistance aux champignons pathogènes : caractérisation d'effecteurs apoplastiques et étude du mode d'action de la RNase NE." Nice, 2000. http://www.theses.fr/2000NICE5480.

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Abstract:

Chez le tabac, la résistance systémique acquise (SAR) peut être induite par une application exogène d'élicitines, une famille d'éliciteurs protéiques sécrétés par les champignons du genre Phytophthora. Dans ces conditions, le tabac est résistant à l'agent du chancre du collet, Phytophthora parasitica. Par ailleurs, durant le développement du tabac, une transition de la sensibilité vers la résistance à l'infection est observée. Les feuilles acquièrent une résistance à Phytophthora parasitica lorsque la plante passe de l'état végétatif à l'état floral. L'apparition de cette résistance n'implique pas une étape d'induction préalable par un stimulus exogène comme dans le cas de la SAR. Nous avons montré que la résistance acquise au cours du développement est corrélée à l'activation de mécanismes de défense. Nous recherchons les effecteurs des mécanismes de défense des plantes en utilisant ces deux modèles, la SAR et la résistance ontogénique. La résistance ontogénique compterait différentes composantes qui contrôlent à la fois l'initiation de l'infection et la colonisation par P. Parasitica. Nous avons mis en évidence une activité cytotoxique contre les zoospores du champignon, présente dans le compartiment extracellulaire. (. . . ) Des résultats antérieurs (. . . ) suggéraient l'implication d'activités RNases dans l'état de résistance associé à la SAR. À l'origine de ces activités, (. . . ) la RNase NE extracellulaire dont le gène est induit en réponse à l'inoculation par P. Parasitica. (. . . )

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Derckel, Jean-Paul. "Mécanismes de défense de la vigne (vitis vinifera L. ) contre Botrytis cinerea : caractérisation de chitinases et de ß-1,3-glucanases." Reims, 1997. http://www.theses.fr/1997REIMS018.

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Abstract:

Nous avons etudie les mecanismes de defense de la vigne contre botrytis cinerea et caracterise les chitinases et les -1,3-glucanases. Dans un premier temps, nous avons mis en evidence une activite chitinase dans tous les tissus de la vigne : racines, sarments, feuilles et baies. Cette activite est importante dans les baies (10 fois superieure a celle des autres tissus). Dans la vigne, 13 isoformes de chitinase dont 9 acides et 4 basiques sont constitutives. Elles sont inductibles par la dechirure et par l'acide salicylique. Cinq isoformes induites dans les feuilles sont constitutives des autres tissus etudies. Une sonde homologue a un fragment de gene de chitinase de vigne a ete realisee pour etudier la regulation de son induction. Dans un deuxieme temps, l'activite des chitinases et des -1,3-glucanases dans les baies de raisin a ete etudiee au cours du murissement. L'activite chitinase, absente au cours des premiers stades de developpement de la baie, augmente tout au long du murissement pour atteindre un etat stationnaire a maturation des baies. A contrario, aucune activite -1,3-glucanase n'a ete detectee dans les baies. L'induction de deux isoformes, chv 5 et chv 11 est responsable de l'augmentation de l'activite chitinase dans les baies. Le traitement des baies par la dechirure et par l'acide salicylique induit les activites chitinases et -1,3-glucanases. La chv 5 purifiee possede une activite anti-botrytis (inhibition de la germination des conidies). La chv 5 a ete sequencee, elle appartient a la classe iv des chitinases. Dans un troisieme temps, nous avons etudie l'induction differentielle des mecanismes de defense de la vigne contre b. Cinerea. Deux souches t4 et t8 de b. Cinerea on ete selectionnees pour leur agressivite differente face a la vigne. Les feuilles infectees par la souche la moins agressive (souche t4) montre une induction importante des mecanismes de defense (chitinases, -1,3-glucanases et metabolites secondaires). La souche la plus agressive (souche t8) induit tres peu ces mecanismes de defense avec pour consequence une necrose des tissus. En conclusion les chitinases et les -1,3-glucanases sont impliquees dans les mecanismes de defense de la vigne contre b. Cinerea.

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Tavernier, Marie-Laure. "Production, purification et caractérisation d’oligoglucuronates éliciteurs des réactions de défenses [sic] chez la vigne." Amiens, 2008. http://www.theses.fr/2008AMIE0126.

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Abstract:

Les travaux de doctorat ont porté sur la dégradation enzymatique d’un homopolymère d’acides glucuroniques liés en b(1,4) et partiellement acétylé en position C2 et/ou C3 : le glucuronane. Ce polysaccharide, assimilable à une cellulose anionique, a fait l’objet de nombreux développements pour ses propriétés biologiques notamment lorsqu’il est utilisé sous des formes oligosaccharidiques. L’identification récente d’une glucuronane lyase excrétée par une souche fongique a été le point de départ de ce travail de thèse qui a consisté à mettre en oeuvre cet outil dans des procédés destinés à générer différentes familles d’oligoglucuronanes. Pour cela, après transfert du procédé de production du glucuronane à l’échelle pilote (bioréacteur de 300 L) afin d’avoir à disposition un stock suffisant de polymère, la purification de la glucuronane lyase a été entreprise. L’enzyme a été ensuite mise en oeuvre dans des réacteurs enzymatiques sous forme libre et immobilisée et différents mélanges d’oligoglucuronanes ont pu être obtenus. Dans un second temps, l’utilisation de techniques chromatographiques originales (recul d’ionisation et ion pairing) a conduit à l’obtention d’oligosaccharides acides purs en mode semi-préparatif et à leur caractérisation structurale fine (RMN 1H, 13C et MS). Ces différents lots de composés ont enfin été testés avec succès à l’état natif ou après modification chimique (sulfatation) comme éliciteur des réactions de défense de la vigne
The enzymatic degradation of glucuronan, a homopolymer composed of b-D-(1,4)-glucopyranosyluronic residues variably acetylated at C3 and/or C2 position, was studied. This linear polysaccharide, comparable to anionic cellulose, and its oligosaccharidic by-products have shown many biological properties. The recent identification of a fungal glucuronan lyase was the beginning of this PhD. This enzyme was used in several processes in order to generate different oligoglucuronan pools. First, a scale-up of the glucuronan production to the pilot scale (300 L bioreactor) has been successfully undertaken. Secondly, the glucuronan lyase has been purified and studied in enzymatic reactors containing the free or the immobilized shape. By the mean of these processes, different oligoglucuronan pools have been recovered. Furthermore, thanks to novel chromatographic techniques such as back ionisation and ion-pairing, pure acidic oligosaccharides have been recovered at the semi-preparative scale. Afterwards, their chemical structure has been confirmed using NMR spectroscopy and mass spectrometry. All of these oligoglucuronan pools have been tested as elicitors of vineyard defence response, some of them being beforehand chemically sulfated

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Lee, Sung-Man. "La sécurité de la Corée du Sud : la menace et les moyens d'une petite puissance." Paris 1, 1996. http://www.theses.fr/1996PA010257.

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Abstract:

Dans la société internationale, concurrentielle favorable aux puissants, quelle est la stratégie pour défendre les intérêts vitaux de la Corée du sud, laquelle n'appartient pas au groupe des puissants, et qui n'a pas garde son indépendance pour bâtir sa propre stratégie et la développer ? Dans un pays péninsulaire comme la Corée du sud, entouré de puissants voisins, la sécurité de l'état par les efforts diplomatiques est très importante. Le renforcement de la capacite de protection comme unique moyen, n'est pas suffisant pour sa défense nationale. Pourtant, la stratégie de sécurité nationale soulève au fond la question de la défense indépendante, car l'objectif dernier de la politique de sécurité revient à assumer la défense indépendante. Nous avons donc proposé un modèle coréen de stratégie militaire, "la stratégie de survie du peuple coréen" qui signifie la stratégie activement défensive centrée sur la diplomatie. Cette stratégie est présentée en suivant trois étapes : la stratégie de dissuasion, la stratégie de défense, et la stratégie de survie. Notre étude cherche, en analysant la situation de sécurité coréenne, à exposer la particularité de celle-ci. Et elle vise, en clarifiant et en recomposant les théories de stratégies connues, à établir une stratégie pour la survie de la Corée du sud et de la péninsules coréenne réunifiée, appropriée aux circonstances particulières coréennes
In the competitive international society which favors the powerful, what is the strategy of security to defend the vital interests of south korea, a country which does not belong to the group of the powerful, and which has not kept its independence to build its own strategy and to develop it ? In a peninsular country like south korea, surrounded by powerful neighbors, the security of the state through diplomatic efforts is very important. The strengthening of the capacity of protection as a unique means is not sufficient for its national defense. Nevertheless, the national security strategy poses on the whole, the question of the independent defense, because the last objective of the policy of security is tantamount to assume the independent security. We have therefore proposed a korean model of military strategy, "the strategy of survival of the koran people" which means the actively defensive strategy centered on diplomacy. This strategy is presented following three steps : the strategy of dissuasion, the strategy of defense and the strategy of survival. Our study seeks, by analyzing korea's security situation, to expose the particularity of this situation. And it aims, by clarifying and recomposing the known strategy theories, to establish a strategy for the survival of south korea and the reunified peninsula, a strategy appropriated to korean particular circumstances

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Masséna, Floriane. "La prescription extinctive des moyens de défense, aux origines de la maxime Quæ temporalia sunt ad agendum perpetua sunt ad excipiendum." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASH010.

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Abstract:

En établissant la perpétuité de l’exception de nullité à l’article 1185 du code civil dans sa nouvelle rédaction issue de la réforme du droit des obligations de 2016, le législateur a partiellement codifié la maxime Quæ temporalia sunt ad agendum perpetua sunt ad excipiendum. La question de la durée des autres moyens de défense n’a en revanche pas été résolue par la réforme. Les débats qui ont cours depuis le milieu du XXe siècle quant à la pertinence d’un principe de perpétuité des moyens de défense demeurent donc d’actualité. Ses partisans invoquent la maxime Quæ temporalia, ses racines anciennes, et sa constance au fil des siècles. Ses détracteurs invoquent au contraire la prétendue caducité de la maxime Quæ temporalia, laquelle aurait été implicitement abrogée par le code civil de 1804. L’étude historique de cette maxime permet de mieux en saisir la cause, le contexte et les motifs à l’origine de son élaboration et, à travers les évolutions de son régime juridique, d’enrichir et de renouveler le débat tenant à son opportunité en droit positif. D’origine plus probablement médiévale que romaine, la maxime Quæ temporalia vise, en offrant un privilège à la partie faible du procès, à assurer l’équité au cours de l’instance. Cette volonté de protéger le défendeur se retrouve à chaque époque et se traduit par de régulières réaffirmations et extensions du principe de perpétuité des moyens de défense. Le quasi vide juridique qui caractérise l’histoire de cette maxime invite à s’intéresser par ailleurs à la place des sources subsidiaires du droit dans le système français, y compris après l’œuvre codificatrice napoléonienne
The article 1185 of the civil code has been modified by the 2016 reform. Since then, this text decides that the exception based on nullity is perpetual. Therefore, part of the maxim Quæ temporalia sunt ad agendum perpetua sunt ad excipiendum is now included in the law. However, the duration of the other defences has not been fixed by the law.Since the middle of the XXth century, a debate about the existence of a principle of perpetuity of all defences takes place. Jurists who agree with this principle invoke the maxim Quæ temporalia, its old roots, and his continuity throughout centuries. At the opposite side, Jurists who disagree consider that this maxim has been abrogated in 1804. An historical study of the maxim helps understanding its cause, the context of its creation and its evolutions. These informations renew the debate concerning its incorporation into positive law.The maxim must have been created during medieval period. By offering a privilege ot the weakest party, the maxim seeks equity. As the will to protect the defendant is constant in time, the maxim has been reaffirmed and extended regularly through centuries.As there are really few texts about the duration of denfences, the maxim also leeds to study the importance of secondary sources of law, even after the XIXth century codification work

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Afoufa-Bastien, Damien. "Etude de l'expression de gènes codant pour des transporteurs de sucres et de l'activité de transport au cours d'une interaction Vigne (Vitis vinifera)/champignons pathogènes." Poitiers, 2010. http://theses.edel.univ-poitiers.fr/theses/2010/Afoufa-Bastien-Damien/2010-Afoufa-Bastien-Damien-These.pdf.

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Abstract:

Chez les plantes supérieures, la distribution des sucres au sein des cellules est assurée par des protéines membranaires appelées transporteurs. Plusieurs études montrent qu'en plus de leur implication dans le développement, celles-ci ont un rôle au cours des interactions plantes/pathogènes. Le génome de la vigne a permis d'identifier 69 séquences de transporteurs de sucres ainsi que 6 séquences d'intervases chez cette espèce. Le profil d'expression de ces différents gènes a été étudié dans plusieurs oragnaes ainsi qu'en réponse à une contrainte biotique. L’infection de feuilles par Botrytis cinerea a induit une surexpression du transporteur d’hexoses VvHT5 et de l’invertase pariétale VvcwINV1. L’induction des gènes de défense VvPR3 et VvBIG8. 1 et la production de resvératrol ont également été mises en évidence. Une suspension cellulaire de vigne cv Chardonnay a été initiée. L’infection des cellules par B. Cinerea a induit une surexpression de 3 gènes de transporteurs d’hexoses, VvHT1, -5, -13 , ainsi que de l’invertase pariétale VvcwINV1. L’induction de ces 4 gènes a également été observée en réponse à trois éliciteurs fongiques. Parallèlement à l’induction de ces gènes de transporteurs de sucres, une augmentation de l’influx de glucose a été mesurée dans les cellules élicitées. Ces données indiquent que les transporteurs d’hexoses et les invertases de vigne sont impliqués dans la mise en place des mécanismes de défense lors d’une infection par le champignon nécrotrophe B. Cinerea ou lors d’une élicitation. La surexpression de certains gènes de transporteurs de sucres et/ou d’invertases dans des plantules de vigne pourrait démontrer leur rôle dans les phénomènes de tolérance
In higher plants, the distribution of sugars within cells is occurring by membrane proteins called transporters. Several studies describe that parallel to their implication in development, the sugar transporters have a role in plant/pathogen interactions. The availability of the genome of Vitis vinifera offered the opportunity to identify 69 sugar transporter and 6 invertase sequences in this species. The expression profile of these different genes has been studied in several organs as well as in response to a biotic stress. In plant leaves, the infection by Botrytis cinerea led to an up-regulation of the VvBIG8. 1 and production of the phytoalexin resveratrol were also detected. To strengthen the results obtained with plants, a cell suspension culture of grapvine cv Chardonnay was etablished. Infection of the grapevine cells by B. Cinerea led to the induction of 3 hexose transporter genes VvHTI, 5, 13 as well as cell wall invertase gene VvcwINV1. The induction of these 4 genes was also observed in response to three fungal elicitors. Parallel to the induction of these sugar transporter genes, an increase in the glucose transport activity was noted in elicited cells. Taken together, these data indicate that grapevine hexose transporters and cell wall invertases are involved in the implementation of the defense mechanisms during an infection by the necrotrophic fungus B. Cinerea or an elicitation by fungal elicitors. The overexpression of some sugar transporter and invertase genes in grapevine plants could demonstrate their role in tolerance mechanisms

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Burcklen, Michel. "Peroxygénase végétale : Double localisation d'une oxygénase originale." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. http://www.theses.fr/2005STR13184.

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Abstract:

L'intérêt pour le métabolisme et les rôles physiologiques des oxylipines s'est accru ces dernières années puisque ces composés semblent être impliqués dans les phénomènes d'infection. Chez la plante, les phytooxylipines dérivent essentiellement de l'acide linoléique (C18:2) et de l'acide linolénique (C18:3) par la voie de la lipoxygénase. Les hydroperoxydes formés par la lipoxygénase sont rapidement métabolisés en composés physiologiquement actifs, sous l'action de CYP74s et d'une peroxygénase (PXG). Cette enzyme, qui catalyse des réactions d'oxydation, est une hémoprotéine membranaire, unique par son mécanisme catalytique puisqu'elle ne présente aucune homologie de séquence avec des oxydases. Métabolisant aussi bien des hydroperoxydes d'acides gras, substrats de CYP74, que l'eau oxygénée, substrat des peroxydases, j'ai recherché les caractéristiques moléculaires qui confèrent son originalité à la peroygénase en identifiant le mode de coordination de son hème. J'ai pu montrer que chez AtPXG1, ce groupement prosthétique n'était pas lié par l'intermédiaire d'une cystéine comme chez les CYP74s, mais à un résidu histidine. Ces résultats, obtenus par mutagenèse dirigée et confirmés par RPE identifient chez AtPXG1 un hème dont le fer est coordonné via un résidu histidine. J'ai montré que les différentes isoformes possédaient des spécificités de réactions différentes. Afin d'apporter des éléments réponses aux rôles physiologiques de la peroxygénase, j'ai localisé, par fusion à la GFP, AtPXG1 et AtPXG3 dans le réticulum endoplasmique et les oléosomes, des organites constitués d'un noyau de lipides neutres entourés d'une monocouche phospholipidique et protéique. J'ai montré qu'une signature de type FFAT ciblait la peroxygénase vers le RE et qu'une signature de type DXE permettait son export du RE vers les oléosomes. Cet export serait dépendant de la protéine Sar1, un élément du complexe COPII qui permet l'export des protéines du réticulum vers l'appareil de Golgi
During the last decade, increasing interest in oxygenated fatty acids, collectively named oxylipins, has been generated as these metabolites are considered to be involved in infection. In plants, oxylipins mainly derive from linole(n)ic acid via the lipoxygenase pathway. Fatty acids hydroperoxyds produced by lipoxygenase are rapidly metabolised in a variety of physiologically active derivatives by CYP74s and by peroxygénase (PXG). This later membrane bound hemoprotein catalyses reaction of oxydation by a mechanism which seems to be quite unique and surprisingly, it do not presents any homology with presently known oxidases. Peroxygenase is able to metabolise fatty acid hydroperoxyds (CYP74's substrate) as good as hydrogen peroxyd (peroxydase's substrate), raising questions about peroxygenase original mechanism origin which I try to characterize in studying the mode of linking of the heme iron. By site-directed mutagenesis experiments on AtPXG1, I found that the heme was not coordinated by cysteine residues like in CYP74s but to a histidine residue like in peroxydases. These results were confirmed by EPR, identifying an heme in which iron is coordinated via an histidine residue. In a second time, I have demonstrated that different isoforms differ from each other by various reactions specificity. In order to find some answer concerning plant peroxygénase physiological function, I have localized, by GFP fused strategy, AtPXG1 and AtPXG3 isoforms in endoplasmic reticulum and in lipid bodies, which are organelles constituted by a neutral lipid core surrounded by a proteic and phospholipid monolayer. I demonstrated that an FFAT motif was responsible of peroxygénase targeting to reticulum and that a DXE motif permit its export from RE to lipid bodies. First experiment round seems to demonstrate that this export is dependant from Sar1, an element of COPII complex, responsible of protein export from RE to Golgi apparatus

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Magnin-Robert, Maryline. "Protection de la vigne contre Botrytis cinerea et stimulation des mécanismes de défense à l’aide de bactéries issues du vignoble champenois." Reims, 2007. http://theses.univ-reims.fr/exl-doc/GED00000725.pdf.

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Abstract:

Le développement de nouvelles alternatives à la lutte chimique contre Botrytis cinerea chez la vigne, notamment par recours à l’utilisation des bactéries issues du vignoble champenois fait l’objet de cette thèse. Ces bactéries, isolées de la rhizosphère et de différents organes de vignes non contaminées, sont deux Acinetobacter lwoffii PTA-113 et PTA-152, une Bacillus subtilis PTA-271, deux Pantoea agglomerans PTA-AF1 et PTA-AF2 ainsi que deux Pseudomonas fluorescens PTA-268 et PTA-CT2. Les expériences réalisées de manière principale en conditions du vignoble, font apparaître que ces bactéries appliquées en souches pures ou en mélanges de souches sont capables d’induire des réactions de défense chez la vigne matérialisées par une stimulation des activités de chitinase et β-1,3-glucanase dans les feuilles et les baies de vigne. Ces réactions typiques de défense sont variables selon la souche, les combinaisons de souches et leur mode d’application, et sont pour la plupart associées à une protection des différents organes de la vigne contre Botrytis cinerea. Les souches les plus actives sont représentées par les A. Lwoffi, P. Fluorescens et P. Agglomerans PTA-AF1 chez les feuilles et P. Agglomerans PTA-AF1 et PTA-AF2 chez les baies. L’association des deux P. Agglomerans (AF1+AF2) ou encore P. Agglomerans en présence de B. Subtilis ou d’A. Lwoffi se traduit aussi par une protection significative contre B. Cinerea, ne dépassant pas celle obtenue en présence des bactéries individuelles
The development of new alternatives to chemicals against Botrytis cinerea in grapevine, especially by using bacteria originated from Champagne vineyard is the objective of this thesis. These bacteria isolated from the rhizosphere and from different healthy grapevine organs, are two Acinetobacter lwoffii PTA-113 and PTA-152, a Bacillus subtilis PTA-271, two Pantoea agglomerans PTA-AF1 and PTA-AF2 and two Pseudomonas fluorescens PTA-268 and PTA-CT2. Experiments performed mainly in vineyard demonstrated that these bacteria applied individually or in combination are able to induce defence reactions in grapevine as evidenced by a stimulation of chitinase and β-1,3-glucanase activities in leaves and berries. The intensity of these defence reactions is dependent on bacterial strain, combination of bacteria and their application method. They are associated to an induced protection of both organs against Botrytis cinerea. The most active strains are A. Lwoffi, P. Fluorescens and P. Agglomerans PTA-AF1 in leaves and P. Agglomerans PTA-AF1 and PTA-AF2 in berries. The combination of two P. Agglomerans (AF1+AF2) or P. Agglomerans with B. Subtilis or with A. Lwoffi also lead to a significant protection against B. Cinerea, which is not higher than that obtained with individual bacteria

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El-Turk, Joumana. "Contribution a l'étude des réactions de défense chez la luzerne : analyse de l'expression des peroxydases lors d'interactions avec des bactéries pathogènes et symbiotique." Compiègne, 1994. http://www.theses.fr/1994COMPD760.

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Abstract:

Chez la luzerne, deux systèmes feuille/bactérie ont été définis : une interaction incompatible avec Pseudomonas syringae pv. Pisi, et une interaction compatible avec Xanthomonas campestris pv. Alfalfae, qui est le pathogène naturel de la luzerne. L'expression des gènes de peroxydases a été étudiée dans ces deux systèmes afin de déterminer leur rôle et leur implication lors des réactions de défense chez la luzerne. Cinq clones, prx1, prx5, prx8, prx14 et prx15 ont été isolés d'une banque d'ADNc préparée à partir des ARNm extraits de feuilles infectées par P. Syringae. La comparaison de leurs séquences a montré que le clone prx15 était significativement différent des autres clones prx1, prx5, prx8 et prx14. De plus, seuls ces derniers présentent une séquence en C-terminal qui pourrait avoir un rôle dans l'adressage vacuolaire. L'infection des feuilles par P. Syringae pv. Pisi, conduit à une accumulation des différents transcrits, avec cependant des cinétiques variables. L'accumulation des ARNm des prx1, prx5 et prx15 est assez rapide alors qu'elle est plus lente pour le prx14. L'étude de la localisation de l'expression des messagers par rapport au site d'infection a montré que les prx1, 5 et 14 ont une expression de type systémique localisée alors que le prx15 a une expression de type systémique généralisée. Ces résultats ont été comparés à ceux obtenus après traitement des feuilles avec Xanthomonas campestris pv. Alfalfae ou après blessure. Il est apparu des différences dans les cinétiques et/ou dans les niveaux d'accumulation des différents transcrits. Pour compléter ces travaux nous avons abordé l'étude de la réponse du système racinaire à un traitement par le facteur de nodulation NodRm-IV(C16:2,S), modèle pour l'analyse des étapes précoces de l'interaction symbiotique. Nous avons suivi l'expression du gène prx15 dans ce système ; cependant dans nos conditions expérimentales, nous n'avons pas détecté d'accumulation du messager correspondant
In alfalfa, two types of interactions between leaves and bacteria were defined: one, an incompatible interaction with Pseudomonas syringae pv. Pisi, and the other, a compatible interaction with Xanthomonas campestris pv. Alfalfae which is a natural pathogen of alfalfa. The gene expression pattern of peroxydases was studied in these two types of interactions in order to determine their role and their involvement in defense reactions of alfalfa. Five clones, prxl, prx5, prx8, prx14 and prx15, were isolated from a cDNA library prepared from mRNA of P. Syringae-infected leaves. Sequence comparison showed that the clone prx15 is significantly different from the other four. Moreover, prxl5 lacks the C-terminal sequence for vacuolar targeting that is present in the others. Infections of leaves by P. Syringae pv. Pisi led to an accumulation of different transcripts with different kinetics. The accumulation of prxl, prx5 and prxl5 mRNAs was quite rapid compared to prxl4 mRNA. The localization of the messages relative to the site of infection showed that prxl, 5 and 15 have local systemic while prxl5 has general systemic expression. These results were compared to these obtained after treatment of the leaves with Xanthomonas campestris pv. Alfalfae or after wounding. Differences in the kinetics and/or the level of the different transcripts were observed. Finally, we have initiated the study of the response of the root system to treatment by the nodulation factor NodRm-IV (C16:2,S), which serves as a model for the analysis of the early steps in the symbiotic interaction. We followed the expression of prx15 in this system. In the experimental conditions used, we found no accumulation of the prx15 message following this treatment

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Gouzerh, Guillaume. "Caractérisation fonctionnelle de glycérolipases de type "patatine" induites lors de la réaction d'hypersensibilité chez le tabac : Recherche de leur implication dans la biosynthèse d'oxylipines." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2004. http://www.theses.fr/2004STR13022.

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Abstract:

La libération d'acides gras à partir des lipides membranaires est à l'origine de la synthèse d'une variété de signaux et composants antimicrobiens impliqués dans les réponses de défense chez les plantes. Des travaux antérieurs au laboratoire ont conduit à l'isolement de trois cDNAs de feuille de tabac (NtPAT1, NtPAT2 et NtPAT3) similaires au gène codant la patatine, une protéine majeure du tubercule de pomme de terre qui possède une activité lipide acyle hydrolase (LAH) faible. Ces gènes sont rapidement induits lors de la réaction hypersensible (HR) au virus de la mosaïque du tabac (VMT), cette induction précédant l'accumulation de jasmonates. Une étude détaillée de la régulation des gènes NtPAT a montré qu'ils sont également induits par la bactérie E. Carotovora et le champignon B. Cinerea. Le traitement de feuilles par la β-mégaspermine, un éliciteur de mort cellulaire, induit fortement les gènes NtPAT dans la zone infiltrée avant l'apparition de la nécrose puis, plus tardivement, dans la zone périphérique. Dans les tissus infiltrés, l'expression de ces gènes est également associée à la production de jasmonates. Par ailleurs, les gènes NtPAT sont corégulés avec des gènes codant des enzymes du métabolisme des oxylipines comme la 9-LOX, l'α-DOX, la DES et des hydroxylases d'acides gras de type P450s. Ceci suggère l'implication des protéines NtPAT dans la libération d'acides gras permettant d'alimenter différentes branches du métabolisme des oxylipines. Pour chaque inducteur, l'expression des gènes NtPAT a lieu avec un profil parallèle à l'apparition d'une activité phospholipase A2Dans les feuilles traitées à la β-mégaspermine, elle est également corrélée à la dégradation de phospholipides, de galactolipides et est concomitante à l'accumulation d'acides gras libres. Notre hypothèse est que ces activités sont dues principalement aux protéines NtPAT. En effet, la production des protéines recombinantes NtPAT1 et NtPAT3 chez E. Coli a permis de montrer que ces enzymes possédaient une très forte activité LAH. Tout d'abord décrites comme des PLA2, elles sont en fait capables de déacyler les positions sn-1 et sn-2 de phospholipides comme de galactolipides. Elles sont par contre inactives sur les triglycérides. Bien que fortement actives sur les galactolipides, des données préliminaires, obtenues par immunolocalisation et expression de fusions à la GFP, suggèrent que les enzymes NtPAT sont cytoplasmiques. Au vu de la corrélation stricte entre l'apparition des protéines NtPAT et la dégradation massive de galactolipides pendant la HR, une hypothèse est que ces protéines sont capables d'hydrolyser l'enveloppe externe des chloroplastes à partir du cytoplasme. Cette hypothèse devra être validée par l'étude du profil métabolique de plantes incapables de produire les protéines NtPAT. De telles plantes sont actuellement en cours d'étude. Des plantes transgéniques exprimant constitutivement NtPAT3 ont également été obtenues. Celles-ci présentent une résistance accrue au VMT, ce qui conforte l'hypothèse d'un rôle des protéines NtPAT dans la résistance aux agents pathogènes
The release of fatty acids from membrane lipids is at the origin of the biosynthesis of an array of signals and antimicrobial derivatives in plant defense. The enzymes catalyzing this hydrolytic step are poorly characterized. Previous work done in our laboratory has led to the isolation of three tobacco genes (NtPAT1, NtPAT2 and NtPAT3) related to the patatin, a major protein from the potato tuber that displays weak lipolytic activity. These genes are rapidly induced during the hypersensitive response (HR) to tobacco mosaic virus, in advance to jasmonate accumulation. A detailed study of the regulation of NtPAT genes showed that these genes are also induced after infection by the bacterium E. Carotovora and the fungi B. Cinerea. The treatment with β-megaspermin, a cell death-inducing protein elicitor also induced NtPAT genes which are then rapidly expressed in the infiltrated zone before the appearance of necrosis and in the surrounding area with some delay. In the infiltrated tissue, NtPAT gene expression is associated with the accumulation of the two jasmonates, OPDA and JA. In elicitor treated leaves, NtPAT gene are corregulated with several genes encoding proteins involved in oxylipin metabolism such as 9-LOX, α-DOX, DES and some P450s fatty acid hydroxylases. This suggests that NtPAT proteins are involved in providing fatty acids for different oxylipins biosynthetic pathways. In each challenge, NtPAT gene expression also appears with a profile parallel to the appearance of PLA2 activity. In β-megaspermin treated leaves it is also correlated with the degradation of phospholipids and galactolipids, and the accumulation of free fatty acids. We hypothesised that NtPAT proteins are mostly responsible for these activities. Indeed, recombinant expression in E. Coli showed that NtPAT1 and NtPAT3 encode proteins with huge lipolytic activity. First described as PLA2, NtPAT proteins are in fact able to cleave both sn-1 and sn-2 positions of phospholipids and galactolipids, but are completely inactive on storage triglycerides. Although they are strongly active on galactolipids, the preliminary results we obtained on the sub-cellular localization of NtPAT, using both immunolocalization and GFP fusion proteins, suggest that these proteins are cytosolic. As galactolipids are only present in the chloroplasts and NtPAT proteins are expressed while the massive galactolipid consumption occurs during the HR, one hypothesis is that these proteins are able to hydrolyze the chloroplastic outer membrane starting from the cytosol. Fatty acids released in this case could supply the chloroplastic 13-LOX pathway but may also supply the cytoplasmic 9-LOX pathway as can do fatty acids released from other membranes. This hypothesis will only be validated by metabolic profiling of transgenic plants depleted in NtPAT proteins. Such plants are currently being studied. Transgenic plants overexpressing NtPAT3 have also been obtained. These plants display increased resistance to tobacco mosaic virus reinforcing the involvement of NtPAT proteins in resistance against pathogens

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Ghannam, Ahmed. "Identification et caractérisation fonctionnelle de gènes impliqués dans l'induction et la régulation de la réaction hypersensible et la résistance locale acquise chez la tabac." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. http://www.theses.fr/2005STR13164.

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Abstract:

La réaction d’hypersensibilité (HR) est l’un des mécanismes de défense les plus efficaces dont dispose la plante pour lutter contre l’attaque par des agents pathogènes. Phénotypiquement, la HR correspond à la mort programmée des cellules percevant l’infection. Dans les cellules adjacentes, on observe une forte induction de réponses de défense. Cette zone correspond à la part vivante de la HR, que nous appelons résistance locale acquise ou LAR en références aux travaux de Ross au début des années 1960. HR et LAR participent ensembles au confinement de l’infection au site d’attaque. Alors que la HR est induite par des signaux exogènes issus de l’agent pathogène, la LAR est induite par des signaux endogènes libérés par les cellules en état de HR. Ainsi, les gènes inducteurs du phénomène LAR, dont aucun n’était connu, présentent un patron d’expression spécifique de la HR. Le premier objectif de ma thèse a été de mettre en œuvre une stratégie permettant de selectionner des gènes potentiellement impliqués dans l’induction du phénomène LAR. Un criblage par Differential Display Reverse Transcript Polymerase Chain Reaction a permis de sélectionner 24 ESTs (expressed sequence tag), parmi 5000 à 10000 transcripts analysés, présentant une expression spécifique au cours de la HR induite par infiltration d’élicitine dans les feuilles de tabac. Le deuxième objectif de ma thèse a été de mettre en œuvre une analyse fonctionnelle de gain et de perte de fonction pour tester le rôle potentiel dans la mise en place du phénomène LAR de trois gènes parmi les vingt quatre issus du crible. J’ai pu montrer que, parmi les 3 gènes, l’extinction par Virus-Induced Gene Silencing du gène NtRING1, codant une E3 ligase putative à domaine RING, retarde la mise en place de la HR et l’induction de gènes de défense. Parmi les cinq gènes issus du crible et analysés fonctionnellement jusqu’à présent, NtRING1 et NtLRP1 semblent impliqués dans l’exécution de la HR
The hypersensitive response (HR) is one of the most efficient plant defense mechanisms against pathogens. Phenotypically, the HR corresponds to the lesions developing at the infection sites. In the narrow zone surrounding the cells undergoing the HR cell death, a strong activation of defense responses occurs contributing to a local, highly inhospitable environment for the invading pathogen. This latter phenomenon was called localized acquired resistance (LAR). It corresponds to the living component of the HR. Whereas the HR is induced by exogenous signals issuing from the pathogen, LAR is triggerred by endogenous signals issuing from the plant cells undergoing the HR. Consequently, the genes inducing LAR, whose none are known yet, should be characterized by a HR-specific expression profile. The first part of this work consisted in the set-up of a strategy aimed to isolated such latter genes. A screening by Differential Display Reverse Transcript Polymerase Chain Reaction allowed to isolate 24 ESTs (expressed sequence tag) with such an expression profile. A second part of the work consisted in the functional characterization, by loss- and gain-of-function experiements, of 3 genes issuing from that screen. Among the three genes, silencing by Virus-Induced Gene Silencing of NtRING1, encoding a putative E3 ligase with a RING-finger motive delays the HR in tobacco induced by ß-megaspemin, a well as the expression of different defense-related genes. Among the 5 genes issuing from the screen and so far analyzed at the fonctional level, NtRING1 and NtLRP1 appeared involved in the execution of the HR

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Jacques, Alban. "Caractérisation fonctionnelle du gène NtLRP1 du tabac : Un régulateur négatif de la mort hypersensible." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2005. http://www.theses.fr/2005STR13125.

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Abstract:

La réaction d’hypersensibilité (HR) est l’un des mécanismes de défense les plus efficaces dont dispose la plante pour lutter contre l’attaque d’agents pathogènes. Phénotypiquement, la HR correspond au suicide des cellules situées au niveau du site d’infection. Dans les cellules adjacentes, on observe une forte induction de toute une batterie de gènes de défense. Cette zone correspond à la résistance locale acquise (LAR). Ce phénomène est intimement lié à la HR. Il ne peut y avoir de LAR sans HR. Les phénomènes HR et LAR empêchent la propagation de l’agent pathogène. Des gènes potentiellement impliqués dans l’induction du phénomène LAR doivent avoir une expression HR-spécifique. Des gènes ayant ce type de profil d’expression peuvent être aussi impliqués dans l’induction et l’exécution de la HR. L’objectif de ce travail a été la caractérisation fonctionnelle du gène candidat NtLRP1, présentant une expression HR spécifique, dans l’induction du phénomène LAR et l’exécution de la HR par des approches perte et gain de fonction. Le gène NtLRP1 a été obtenu par un crible permettant la sélection d’ESTs (expressed sequence tag) présentant des expressions HR-spécifiques. Ce gène code une protéine de type LRP (leucine-rich protein) présentant un peptide signal, un domaine leucine zipper (LZ), un domaine riche en leucines (LRR) ainsi qu’un domaine riche en proline. Nous avons montré que le gène présente une expression HR-spécique indépendamment de l’inducteur (viral, bactérien ou éliciteur fongique). La protéine NtLRP1 couplée à la GFP (green fluorescent protein) est localisée au niveau du réticulum endoplasmique. Nous avons montré que l’extinction de l’expression de ce gène n’altère pas la mise en place des phénomènes HR et LAR. La modification de la mise en place du phénomène HR lors d’une surexpression du gène NtLRP1, révèle que celui-ci jouerait un rôle de régulateur négatif du phénomène HR
The hypersensitive reaction (HR) is one of the most efficient plant defense mecanisms against pathogens. Phenotypicelly, HR correspond to the suicide of cells in the infection site. In the area directly around the HR, an high induction of defense genes is observed. This phenomenon was called localized acquired resistance (LAR). LAR is tightly connected to the HR. The HR involves the induction of LAR. HR and LAR phenomenons restrict pathogen propagation. Genes potentially implicated in the induction of LAR must have HR specific pattern of expression. Genes with that kind of induction profile could also play a role in the execution of the HR. Objective of that work was to functionally characterize the candidate gene NtLRP1, with HR-specific pattern of expression, in the induction and the regulation of HR and LAR phenomenon by loss and gain-of-function approaches. NtLRP1 was selected from a screen described to isolate EST (expressed sequence tag) with HR specific expression. This gene encode a leucine-rich protein (LRP). This protein contains a signal peptide, a leucine zipper (LZ) domain, a leucine-rich repeat domain (LRR) and a proline rich region. We show that NtLRP1 gene present an HR specific expression independently of the HR inducer (virus, bacteria or fungal elicitor). NtLRP1 protein coupled with GFP (green fluorescent protein) localizes in the endoplasmic reticulum. Loss-of-function experiments revealed that extinction of NtLRP1 expression does not affect HR and LAR phenomenons. Gain-of-function experiments by transient overexpression of NtLRP1 affect the HR suggesting that NtLRP1 could play a role as a modulator of the hypersensitive cell death

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Fortin, Élise. "Rôle du facteur de transcription MYB14 dans la réponse de défense chez l'épinette blanche." Thesis, Université Laval, 2012. http://www.theses.ulaval.ca/2012/28731/28731.pdf.

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Abstract:

Lors d’une blessure chez l’épinette blanche, le facteur de transcription MYB14 et certains gènes de la voie de biosynthèse des isoprénoïdes (voie MVA) sont surexprimés. De plus, des plantules d’épinette blanche transgéniques surexprimant le gène PtMYB14 accumulent elles aussi des transcrits de gènes faisant partie de la voie MVA. Ainsi, MYB14 pourrait être un régulateur transcriptionnel potentiel de cette voie métabolique (Bedon et al. 2010). Ce mémoire cible la régulation potentielle du gène de la 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthétase (HMGS), une enzyme de la voie MVA, par MYB14. Nous avons 1) isolé et caractérisé la région promotrice de Hmgs, 2) testé si MYB14 se lie directement au site découvert dans ce promoteur et 3) vérifié si MYB14 peut influencer positivement la transcription de Hmgs. Ce projet de maîtrise a permis de découvrir une nouvelle fonction pour un facteur de transcription de la famille des R2R3-MYB soit la régulation de la voie de biosynthèse des isoprénoïdes.

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Bouliteau, Pascale. "Etude de la production des parasiticéines par différents isolats de Phytophthora parasitica et de leur relation avec le pouvoir pathogène sur tabac." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO10228.

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Abstract:

Plusieurs especes de phytophthora non pathogenes sur tabac, secretent dans leur milieu de culture des proteines de bas poids moleculaire (10 kda) appelees elicitines. Elles comportent toutes 98 acides amines et ont un fort degre d'homologie de sequence entre elles. Ces proteines activent les mecanismes de defense chez le tabac (accumulation de phytoalexines, pr-proteines,), induisent des necroses foliaires ainsi qu'une protection vis-a-vis d'une inoculation ulterieure par le pathogene phytophthora parasitica variete nicotianae (ppn) responsable de la maladie du black shank. Jusqu'a present l'hypothese etait que l'absence de production d'elicitine conditionne la pathogenie sur tabac. Au cours de notre travail, nous avons isole et purifie, a partir du filtrat de culture de l'isolat 310 de phytophthora parasitica variete nicotianae provenant d'australie et faiblement pathogene sur tabac, une elicitine appelee parasiticeine, montrant ainsi que l'hypothese initiale ne se confirme pas puisque cet isolat 310 peut parasiter le tabac et excreter une elicitine. Par ailleurs, nous avons purifie et analyse le filtrat de culture de deux isolats fortement pathogenes sur tabac (isolats 183 et 308 de ppn) afin de definir si ces derneirs produisent peu ou pas d'elicitine. Nos resultats permettent de supposer la presence de parasiticeine a l'etat de traces ; nous avons aussi isole et purifie, a partir de ces deux souches, une proteine de masse moleculaire (11 kda) tres voisine d'une elicitine et une glycoproteine (16 kda) presentant toutes deux 100% d'homologie au niveau de la sequence n-terminal. Ces molecules pourraient etre de bons outils pour etudier la relation entre la synthese de capsidiol et l'alcalinisation du milieu extracellulaire observees apres elicitation des cellules de tabac en culture

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Faurie, Bertrand. "Stimulation des défenses naturelles de la vigne par le méthyle jasmonate et l'ethéphon : mécanismes d'action du méthyle jasmonate." Bordeaux 2, 2008. http://www.theses.fr/2008BOR21590.

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Abstract:

La stimulation des défenses naturelles des plantes par des molécules élicitrices est une nouvelle approche phytosanitaire, respectueuse de l'environnement et de la santé humaine. Chez la vigne, des travaux ont montré que le méthyle jasmonate (MeJA) induisait, sur boutures foliaires et au vignoble, une forte résistance de la plante au champignon pathogène, Erysiphe necator, l'oidium. Cet accroissement de la résistance de la plante est dû à l'activation des mécanismes de défense par le MeJA, tels que l'expression des gènes codant les protéines de défense, ou les enzymes impliquées dans la voie de biosynthèse des stilbènes, phytoalexines de la vigne. Selon les mêmes mécanismes, l'éthylène, employé sous forme d'éthéphon, possède un effet phytoprotecteur contre l'oidium, sur boutures foliaires. Cependant, nous n'avons pas observé d'amélioration par l'éthéphon de la résistance induite par le MeJA. En présence de ce dernier, l'éthéphon présente bien un effet synergique sur la production des stilbènes, mais également un fort effet inhibiteur sur l'induction des gènes de défenses codant les protéines de défenses, ce qui doit expliquer l'effet observé du cotraitement sur la résistance à l'oidium. La compréhension des mécanismes impliqués dans la transmission des signaux éliciteurs permettra d'identifier des molécules aptes à induire les défenses naturelles des plantes et ainsi améliorer leur résistance aux stress biotiques et abiotiques. Pour cela, nous avons déterminé quels étaient les principaux partenaires moléculaires (Ca2+, kinases, phosphatases,. . . . ) impliqués dans la transmission du signal MeJA lors de l'induction des mécanismes de défense des suspensions cellulaires de vigne
Grapevine, Vitis vinifera, is susceptible to many pathogens, causing massive damages, yield losses and wine quality. The intensive use of phytochemicals is now incompatible with health and respect of the environment. Alternative strategies have been developed, including stimulation of plant natural defenses based on elicitor treatment. Methyl jasmonate is recognized to be one of these elicitors, including, in the vineyard, an improvement of the resistance to Erysiphe necator, also known as powdery mildew. Ethylene treatment, based on the use of ethephon, had been studied and experiments done on grapevine foliar cuttings have shown that it was also able to trigger resistance to E. Necator. In each case, elicitor treatment was shown to induce defense-related genes expressions and implicated in stilbenes metabolism, which are the main grapevine phytoalexins. We didn't obtain an increased resistance to the fungus by adding ethephon to MeJA-treated foliar cuttings, although stilbens and related genes were synergistically induced. Ethephon addition to MeJA treatment also induced high inhibitions of defense-related genes, which may explain the lack of resistance observed for MeJA/ethephon treatment. Elicitor signal transduction to the nucleus, leading to the activation of plant defense mechanisms is a new way to improve this strategy and develop better elicitor for the future. We have demonstrated that various molecular partners are implicated in MeJA signal transduction, like calcium influx, proteins reversible phosphorylation and reactive oxygen species synthesis

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Martinez, Thomas. "Les oomycètes microorganismes pathogènes de plantes : une nouvelle source de protéines pour l'utilisation des polymères lignocellulosiques." Thesis, Toulouse 3, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU30104.

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Abstract:

Les oomycètes représentent un groupe de microorganismes eucaryotes filamenteux distincts phylogénétiquement des champignons incluant de nombreuses espèces phytopathogènes. CBEL est une glycoprotéine pariétale de Phytophthora parasitica constituée d'une répétition de deux régions séparées par un linker. Chaque région protéique est constituée d'un domaine protéique de liaison à la cellulose (CBM1) et un motif PAN /Apple impliqué dans des interactions protéines-protéines ou protéines-polysaccharides. Cette étude doctorale porte sur la caractérisation de la protéine CBEL et plus particulièrement de ses CBM1s ainsi que sur l'évaluation et optimisation du potentiel de cette protéine à : (i) stimuler les défenses naturelles des plantes (ii) augmenter l'activité de glycosides hydrolases. Dans la première partie de ce travail doctoral différents tests visant à reproduire un traitement éliciteur externe sur plante entière ont pour cela été développés. Ces tests ont permis de mettre en évidence que formulée en présence de surfactants CBEL est capable d'induire diverses réponses de défense chez A. thaliana. Une production en masse de cette protéine a été réalisée dans la levure Pichia pastoris et la bactérie Escherichia coli dans l'optique d'une future application agronomique. Les protéines recombinantes CBELcol et CBELpic produite dans ces différents systèmes d'expression présentent des profils de glycosylation différents de celui de la protéine native CBELnat. Alors que ces protéines semblent se lier de manière identique à la cellulose les différents tests d'élicitation développés au cours de ce travail mettent en évidence des variations dans leur activité élicitrice suggérant que la nature des résidus glucidiques présents sur cette glycoprotéine peut avoir un impact sur sa capacité induire des réponses de défenses en application externe. Lors de la deuxième partie de ce travail de thèse la capacité de CBEL à interagir avec différents substrats cellulosiques a été caractérisée. Les résultats obtenus ont permis de montrer que CBEL se lie avec une haute affinité à la cellulose cristalline avicel et que la présence de CBM1 fonctionnels est nécessaire à cette interaction. De manière intéressante, le CBM1-1 et CBM1-2 ne semblent pas contribuer de manière égale à cette interaction. Par ailleurs la laison de CBEL à la cellulose induit des perturbations structurales sur le substrat et permet d'améliorer l'activité de la xylanase XynB de Talaromyces versatilis sur paille de blé. En outre une xylanase chimère possédant dans sa séquence le CBM1-1 de CBEL possède également une activité augmentée sur paille blé. L'ensemble de ces résultats met en évidence le potentiel de CBEL et de son CBM1-1 pour l'amélioration de l'activité de glycoside hydrolases utilisables par exemple en bioraffinerie. En dernier lieu un travail de caractérisation structurale de la protéine CBEL a également été entamé au cours de cette étude. L'enveloppe de la protéine CBEL en solution à notamment été déterminée par SAXS (Small Angle X-ray Scattering) et un modèle 3D de cette protéine a été obtenu
Oomycetes are fungal like microorganisms evolutionary distinct from true fungi that include pathogens of plants. CBEL is a cell wall glycoprotein isolated from the oomycete Phytophthora parasitica that is composed of two distinct regions linked by a threonine/proline rich linker. Each region owns a cellulose binding module (CBM1) and a PAN-Apple domain involved in protein-protein or proteins-polysaccharides interactions. Since CBEL is able to induce defense responses in numerous plant species, its use for the development of products able to protect crops has been envisaged. For this purpose we analysed the effect of an external CBEL treatment on plants. We found that in the presence of surfactants CBEL is able to induce cytosolic calcium changes, defense gene expression, and cell death on A. thaliana. CBEL application for crop protection requires the development of economically reliable production processes. In the case of proteinaceous elicitors, an attractive strategy to obtain large amount of elicitors is to express them in heterologous hosts such as bacteria or yeasts. CBELcol and CBELpic were produced respectively in E. coli and in P. pastoris. CBELcol is unglycosylated whereas CBELpic displays a glycosylation profile distinct from the native protein (CBELnat). We found that all these proteins are able to bind crystalline cellulose. On the other side we found that the elicitor activity of CBELpic is distinct from CBELnat and CBELcol suggesting that the glycosylation on CBEL can have an impact on its ability to induce plant defense responses after external treatment on A. thaliana. In the second part of this work the two CBMs (1-1 and 1-2) that form part of CBEL have been submitted to detailed characterization, first to better quantify their interaction with cellulose and second to determine whether these CBMs can be useful for biotechnological applications, such as biomass hydrolysis. A variety of biophysical techniques were used to study the interaction of the CBMs with various substrates and the data obtained clearly indicate that CBEL's CBM1-1 exhibits much greater cellulose binding ability than CBM1-2. Engineering of the family 11 xylanase from Talaromyces versatilis (TvXynB), an enzyme that naturally bears a family 1 CBM, has produced two variants. The first one lacks a CBM, whereas the second contains the CBEL CBM1-1 in the place of the natural CBM1. The study of these enzymes has revealed that wild type TvXynB binds to cellulose, probably via its CBM1, and that the substitution of its CBM by oomycetal CBM1-1 does not affect its activity on this substrate. Moreover, the presence of CBEL during the hydrolysis of wheat straw actually potentiates the action of TvXynB, a result that is consistent with the hypothesis that CBM1-1 can alter cellulose surface fibres rather like some other members of CBM family 1

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Paris, Franck. "Modification chimique de la laminarine en vue d’améliorer son efficacité d’inducteur de résistance contre le mildiou de la vigne. Importance et caractérisation de la biodisponibilité foliaire." Rennes, Ecole nationale supérieure de chimie, 2015. http://www.theses.fr/2015ENCR0029.

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Abstract:

Dans l’optique de diminuer les quantités de fongicides de synthèse actuellement appliquées dans la lutte contre le mildiou de la vigne, la stimulation des défenses végétales par l’application de SDP (stimulateurs de défense des plantes) semble être une alternative intéressante. Cette stratégie repose sur l’induction de mécanismes de défense chez la plante suite à la reconnaissance d’éliciteurs par les récepteurs PRR (Pattern- Recognition Receptors) situés sur la membrane plasmique des cellules végétales. Les éliciteurs sont généralement des motifs moléculaires associés aux microbes (MAMP) comme la laminarine, β-(1→3)-glucane extrait de l’algue brune Laminaria digitata. La protection engendrée par un traitement foliaire de laminarine contre le mildiou reste cependant trop aléatoire pour qu’elle puisse être utilisée en l’état au vignoble. Nous avons supposé que ce manque d’efficacité pouvait être dû à une mauvaise pénétration du polysaccharide à travers la cuticule foliaire, hydrophobe, conduisant ainsi à un manque de biodisponibilité de la laminarine in planta et incidemment à une faible quantité d’éliciteur atteignant ses cibles cellulaires. Cette étude met notamment en lumière i- l’importance de l’utilisation d’un adjuvant de pénétration approprié ainsi que iil’importance, de la face foliaire d’application du traitement pour améliorer le taux de pénétration de la laminarine et par conséquent son efficacité de protection. Pour la première fois, nous révélons que la pénétration de composés saccharidiques s’effectue majoritairement par les stomates, présents uniquement à la face inférieure de la feuille de vigne. De manière originale, la synthèse de laminarines de différents degrés d’hydrophobicité nous a permis de remarquer que cette voie semble être prépondérante quelle que soit la nature du polysaccharide. Nos résultats indiquent également que certaines modifications chimiques de la laminarine permettent d’améliorer son efficacité de protection, mais que cette augmentation est en partie due non pas à une amélioration de la biodisponibilité de la molécule mais plus par l’apparition d’un effet fongicide direct vis-à-vis du pathogène
In order to decrease the amount of chemical fungicides to control grapevine downy mildew, an attractive alternative is the use of resistance inducers to activate plant defences. This strategy implies the detection of highly conserved molecular patterns called MAMPs (Microbe Associated Molecular Pattern) by PRR (Pattern-Recognition Receptors) located on the plant cell plasma membranes. Laminarin, a β-(1→3)-glucan extracted from the brown algae Laminaria digitata is a MAMP, known to elicit defence reactions in grapevine. However, protection provided against downy mildew by foliar treatment of laminarin remains inconsistent for its use in vineyard. We hypothesized that this insufficient efficacy was mainly due to a poor penetration of the polysaccharide through the hydrophobic leaf cuticle leading to a lack of in planta bioavailability. Thus only a small amount of resistance inducer could reach its cellular targets. This study highlights the importance i- of using a suitable penetration enhancer and ii- of treating the lower leaf surface to increase laminarin penetration rates and consequently its efficacy in grapevine. For the first time, we show that the penetration of saccharides mainly occur via stomata, only located on the lower surface of grapevine leaves. Moreover, the synthesis of chemically modified laminarins with various degrees of hydrophobicity allows us to show that this penetration pathway seems to be preponderant regardless of the polysaccharide modification. Our results also indicate that certain chemical modifications of laminarin lead to an increase in its efficacy but that this increase is probably due to fungicide properties against the pathogen instead of a better bioavailability

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Roeder, Vincent. "Recherche et étude de marqueurs moléculaires de la réponse au stress chez l'algue brune Laminaria digitata." Rennes 1, 2006. http://hal.upmc.fr/tel-01115470.

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Abstract:

Afin d'identifier des marqueurs moléculaires de la réponse au stress et des gènes impliqués dans la synthèse de la paroi cellulaire chez l'algue brune Laminaria digitata, 1985 EST issus de protoplastes (cellules isolées et stressées) ont été générées. Un quart de ces EST mannuronane-C5-épimérases (ManC5), seraient impliquées dans la synthèse de la paroi. La production de protoplastes entraînant la libération d'oligoguluronates et mimant ainsi l'attaque par un pathogène, la technique d'hybridation soustractive sur des sporophytes élicités a permis d'identifier des gènes plus spécifiques au stress (heat shock proteins, glutathion S-transférases) ou à la défense (thiorédoxine péroxydases, 6-phosphogluconate déshydrogénase, glucose 6-phosphate déshydrogénase). De plus, nous avons mesuré des variations d'expression pour quatre ManC5 par PCR quantitative chez les protoplastes et des sporophytes élicités.

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Camps, Céline. "Etude transcriptomique de la réponse de la vigne (Vitis vinifera cv. Cabernet Sauvignon) au champignon ascomycète vasculaire Eutypa lata, responsable de l' eutypiose." Poitiers, 2008. http://theses.edel.univ-poitiers.fr/theses/2008/Camps-Celine/2008-Camps-Celine-These.pdf.

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Abstract:

Trois conditions expérimentales, in vitro, en serre et au vignoble, ont été utilisées pour produire des plantes saines et des plantes infectées par Eutypa lata. Chaque échantillon a été caractérisé par la notation des symptômes, le ré-isolement des champignons présents dans les parties lignifiées, et l' identification formelle du mycélium d'Eutypa lata par PCR. Cette caractérisation a permis de distinguer les plantes infectées avec symptômes (S+R+), des plantes infectées sans symptômes (S-R+), et des plantes saines (S-R-). L' expression de 15000 gènes de Vigne a été analysée à partir des feuilles de ces plantes grâce à des puces à ADN. La comparaison entre les plantes S+R+ et S-R- a révélé que 44% des gènes différentiellement exprimés et communs entre au moins 2 des 3 conditions sont déjà connus pour intervenir au cours d'une interaction plante/champignon, et que 21% des gènes sur-exprimés chez les plantes S+R+ sont impliqués dans des fonctions de défense. La comparaison entre les plantes S-R+ et S-R-, en serre et au vignoble, a permis l’identification de 17 gènes potentiellement utilisablespour le développement d' un outil de diagnostic précoce et non destructif. L'analyse combinée des résultats obtenus pour les comparaisons S+R+/S-R-, S-R+/S-R- et S+R+/S-R+, en serre et/ou au vignoble, a permis l'identification des gènes plus spécifiquement associés à la réponse à l'infection, à l'absence de symptômes ou à la présence de symptômes. Les profils d'expression de plusieurs gènes candidats ont été confirmés par RT-PCR et complétés avec les analyses de feuilles de vignes infectées par d'autres champignons pathogènes
Three growth conditions, in vitro, in greenhouse and in vineyards, were used to produce control plants and plants infected with Eutypa lata. Each sample was characterised by the symptom notation, the re-isolation of the fungus located in the lignified parts, and the formal identification of Eutypa lata mycelium by PCR. The characterisation led to the identification of three types of plants: infected and showing symptoms (S+R+), infected and showing no symptoms (S-R+) and healthy (S-R-). Microarray analysis on leaf samples from these plants enabled the following of the transcriptomic expression of 15000 grapevine genes. The comparison between S+R+ and S-R- plants showed that 44% of the genes differentially expressed and common to at least two of the three growth conditions are known to be involved in plant/fungus interaction and that 21% of the over-expressed genes in the plants S+R+ are involved in defense functions. The comparison between S-R+ and S-R- plants, in greenhouse and in vineyards, enabled to identify 17 genes potentially useful for the development of of an early and non-destructive diagnosis tool. The combined analysis of microarray data obtained for the comparisons S+R+/S-R-, S-R+/S-R-, and S+R+/S-R+, in greenhouse and/or in vineyard, led to the identification of genes that may be more specifically associated with the response to infection, or with the absence or presence of symptoms. The expression profiles of several candidate genes were confirmed by RT-PCR and completed by the analyses of leaves from grapevines infected with other fungal pathogens

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Hervé, Cécile. "Bases moléculaires de la réponse au stress et à la défense chez l'algue rouge Chondrus crispus et caractérisation d'une nouvelle classe de glutathion S-transférases." Rennes 1, 2006. http://hal.upmc.fr/tel-01115423.

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Abstract:

Des analyses de bases de données de génomes et de banques d'ADNc d'algues rouges et de diatomées, ont permis d'identifier des séquences présentant des similitudes avec les NADPH oxydases, enzymes impliquées dans la génération du burst oxydatif. L'analyse des profils d'expression du gène de l'algue rouge Chondrus crispus a montré qu'il était induit au cours de l'infection de l'algue par Achrochaete operculata, et par des traitements à l'atrazine et au méthyle jasmonate. Plusieurs gènes présentant un intérêt dans le cadre de l'étude des réponses au stress et à la défense chez l'algue ont été identifiés : bromoperoxydases, myéloperoxydases, cytochromes P450, peroxiredoxines, glutathion S-transférases (GST). L'analyse des profils d'expression de trois gènes de GST, à montré leur forte induction par des oxylipines dont le méthyle jasmonate. Deux de ces séquences sont très proches des GST de la classe sigma qui comprend des enzymes ayant une activité prostaglandine synthase.

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Petit, Anne-Noëlle. "Effets de fongicides anti-Botrytis sur les organes végétatifs et reproducteurs de la vigne." Reims, 2008. http://theses.univ-reims.fr/exl-doc/GED00000827.pdf.

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Abstract:

Au vignoble, l’utilisation de fongicides est indispensable pour lutter contre la pourriture grise, causée par le pathogène Botrytis cinerea. L’application de fongicides anti-Botrytis est recommandée à trois stades de développement de la vigne : fin floraison (stade A), fermeture de la grappe (stade B) et début véraison (stade C). Parmi ces fongicides, le fludioxonil et le fenhexamid, qui appartiennent à des familles chimiques différentes, sont couramment utilisés. Dans un objectif de limitation d’emploi des pesticides, il est nécessaire de mieux connaître les effets de ces produits sur la physiologie de la plante. L’impact de ces fongicides anti-Botrytis a donc été évalué à la fois sur les organes végétatifs et reproducteurs de la vigne. En effet, les organes végétatifs, par leur activité photosynthétique, assurent la nutrition nécessaire à la croissance de la plante. Concernant les organes reproducteurs, leur développement va déterminer le rendement. La photosynthèse a donc été utilisée comme paramètre physiologique afin d’étudier le stress provoqué par les fongicides sur les organes végétatifs. Les réponses de défense ont également été évaluées puisque le stress chimique, généré par les traitements anti-Botrytis, pourrait activer ces réponses. Concernant les effets des fongicides sur les organes reproducteurs, des facteurs pouvant influencer leur efficacité ont été évalués : (i) le stade de traitement, (ii) le mode d’action du fongicide, (iii) la pression de sélection exercée par les fongicides sur le pathogène et enfin (iv) les réponses de défense de la vigne
In the vineyard, the use of fungicides is necessary to control grey mould caused by the phytopathogenic Botrytis cinerea. Three applications of botryticides are recommended: at the end of flowering (stage A), at bunch closure (stage B), and at the beginning of berry ripening (stage C). Fludioxonil and fenhexamid belong to two different chemical classes and are commonly used as botryticides. To reduce pesticide use, it’s necessary to improve the knowledge about chemical effects on plant physiology. Therefore, effects of these botryticides have been evaluated on grapevine vegetative and reproductive organs. Indeed, photosynthesis performed in vegetative organs provides the energy and structural substrates for plant growth. Considering reproductive organs, their development is related to the yield. Therefore, the photosynthesis was used as a physiological parameter to study stress caused by fungicides on vegetative organs. Plant defense responses have also been analysed because chemical stress induced by botryticides could activate these responses. Considering the fungicide effects on reproductive organs, various factors which could influence their efficacy were followed: (i) treatment stage, (ii) fungicide mode of action, (iii) selection pressure exerted by fungicides on B. Cinerea and (iv) grapevine defense responses

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Vourc'h, Gwenaël. "Interactions entre plantes longévives et grands mammifères : défense chimique du thuya géant et herbivorie par le cerf-à-queue-noire en Colombie Britannique (Canada)." Montpellier 2, 2001. http://www.theses.fr/2001MON20189.

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Grondin, Josée. "Effet de phytohormones sur les réactions de défense de l'érable à sucre (Acer saccharum Marsh.) suite à l'entaillage et à d'autres types de blessure mécanique." Thesis, Université Laval, 2004. http://www.theses.ulaval.ca/2004/21571/21571.pdf.

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Abstract:

L’exploitation de l’érable à sucre (Acer saccharum) pour la production de sirop est d’une grande importance économique et sociale au Québec. Cependant, l’entaillage cause une blessure à l’arbre et celui-ci réagit, entre autres, en formant des murs de compartimentage qui vont limiter le développement du bois coloré improductif. Dans le but de mieux comprendre les mécanismes du compartimentage, des érables matures ont été entaillés et traités avec divers régulateurs de croissance (les acides jasmonique, abscissique et salicylique, l’éthylène, le thidiazuron (une cytokinine) et la bétaïne) pouvant jouer des rôles importants lors de l’induction de ces mécanismes. Des analyses de volume de bois coloré ont révélé que son développement semble influencé par l’application de lanoline. De plus, une blessure fraîche traitée avec la lanoline réagira fortement en limitant la progression de la colonne de bois coloré. Nos données montrent aussi que les volumes de bois coloré suite à l’utilisation de petites entailles sont moins importants que ceux apparaissant suite à l’entaillage conventionnel. Les murs du compartimentage ne semblent pas être influencés par l’application de lanoline mélangée ou non aux régulateurs de croissance. Les 3000 échantillons prélevés à divers endroits autour et dans la zone affectée par l’entaille ont permis de découvrir des caractéristiques nouvelles sur le compartimentage. Une zone d’autofluorescence jaune révélée sous illumination bleue se trouve accolée aux murs 3 et 4. Cette fluorescence contribue particulièrement à rendre les murs 3 plus complets. Cependant, la nature chimique de cette fluorescence n’a pas pu être précisée par les tests utilisés. Une expérience avec des boutures d’érable ayant subi des blessures mécaniques révèle que la bétaïne et le thidiazuron ont des effets sur le compartimentage. De plus, contrairement aux attentes, la lanoline semble nuire à la fermeture des blessures. En définitive, cette étude aura permis de recueillir des observations inédites sur le compartimentage ainsi que d’entrevoir des possibilités intéressantes quant à la stimulation de cet important mécanisme de défense chez l’arbre à l’aide des phytohormones.

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Belhadj, Assia. "Stimulation des défenses naturelles de la vigne par le méthyl jasmonate : impact sur la biosynthèse des polyphénols et sur la résistance aux champignons." Bordeaux 2, 2005. http://www.theses.fr/2005BOR21272.

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Abstract:

L'application de molécules signaux appelées éliciteurs entraîne la stimulation des défenses naturelles des plantes. Dans le but d'améliorer la résistance de la Vigne (Vitis vinifera) vis-à-vis des champignons pathogènes, cette plante a été traitée par des éliciteurs exogènes d'origine naturelle : le méthyl jasmonate (MeJA) et l'éthylène (ET). Des cultures cellulaires de Gamay Fréaux, des boutures foliaires de Cabernet Sauvignon ainsi que des plants de vigne (Cabernet Sauvignon, Merlot) répondent à l'élicitation par une accumulation des transcrits codant des protéines de défense (PR) et par la production de phytoalexines, molécules à activité anti-microbienne. Des expériences de protection sur boutures foliaires ainsi qu'au vignoble ont condirmé l'activité élicitrice de ces molécules aboutissant à une augmentation de la tolérance des plants traités face à l'oïdium et au mildiou. Dans une stratégie de protection de la Vigne, le MeJA et l'ET sont donc des éliciteurs efficaces
Plant treatment with signaling molecules named elicitors leads to the stimulation of their natural defence mechanisms. In order to improve grapevine (Vitis vinifera) tolerance against fungal pathogens, this plant was treated with natural exogenous elicitors : methyl jasmonate (MeJA) and ethylene (ET). Gamay Fréaux cell suspensions, Cabernet Sauvignon foliar cuttings and grapevine plants (Cabernet Sauvignon and Merlot) react to elicitation with an accumulation of transcripts coding pathogenesis-related proteins and with the production of phytoalexins (antimicrobial compounds). Protection tests on grapevine foliar cuttings and in vineyard confirm eliciting activity of these compounds by triggering enhanced plant tolerance against powdery and downy mildews. These experiments revealed that MeJA and ET act as efficient elicitors in a strategy of grapevine protection

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Morel, Arry. "Etude du rôle lors de l'infection et sur la défense des plantes hôtes des effecteurs de type III RipH1,2,3 et RipAX2 de Ralstonia pseudosolanacearum." Thesis, Toulouse, INPT, 2018. http://www.theses.fr/2018INPT0134.

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Abstract:

Le système de sécrétion de type III est un des déterminants majeurs de la pathogénicité de Ralstonia pseudosolanacearum qui lui permet d’injecter des effecteurs de type III (les « Rip », « Ralstonia Injected Protein ») directement dans les cellules des plantes hôtes. Les effecteurs RipH1, RipH2 et RipH3 sont des effecteurs de type III conservés dans la plupart des souches séquencées. Au cours de ma thèse, le rôle de ces effecteurs RipH lors de l’infection de différentes plantes a été étudié en prenant comme point d’entrée les protéines de tomates avec lesquelles ces effecteurs interagissent. Un criblage par double hybride dans la levure a permis d’identifier 19 de ces protéines « cibles » de tomate. Des méthodes de génétique inverse ont ensuite été utilisées pour chercher le rôle des orthologues de ces protéines dans différentes plantes modèles lors de l’infection par Ralstonia pseudosolanacearum. Du VIGS chez Nicotiana benthamiana a permis de mettre en évidence l’implication des orthologues de la protéine TOM3 : la multiplication bactérienne est moins importante dans les feuilles lorsque l’expression de ces gènes est diminuée. Dans Arabidopsis thaliana, des mutants d’un gène orthologue de la cible TOM9, décrit comme jouant entre autres un rôle dans la remodélisation de la chromatine, est plus résistant à l’infection par R. pseudosolanacearum. Dans un deuxième chapitre correspondant à un article publié, le rôle de l’effecteur RipAX2 a été étudié dans la résistance des aubergines AG91-25. La présence de cet effecteur dans la souche GMI1000 est nécessaire à l’établissement de la résistance de cette variété dans laquelle le locus de résistance EBWR9 a été mis en évidence. L’ajout de RipAX2 dans la souche PSS4, une souche pathogène de AG91-25 qui ne possède pas cet effecteur naturellement, la rend non pathogène. De plus, le motif protéique putatif « zincbinding » qui est décrit comme nécessaire pour l’induction de réponses de défense chez l’espèce proche de l’aubergine Solanum torvum n’est pas nécessaire pour la résistance de AG91-25. Enfin, la conservation de l’effecteur RipAX2 dans les différentes souches du complexe d’espèces de Ralstonia solanacearum a été étudiée pour évaluer l’efficacité potentielle de cette source de résistance contre différentes souches
One of the major virulence determinants of plant pathogenic Ralstonia species is the type III secretion system that enables it to inject proteins (also called “Ralstonia Injected Proteins” or Rip) into the host cells. The RipH1,2,3 type III effectors are conserved in different strains of the Ralstonia solanacearum species complex. The role of these effectors during infection has been studied, taking as an entry point the tomato proteins they interact with. Using yeast-two-hybrid screenings we have identified 19 tomato targets of these three RipH. Reverse genetics methods have then been used to study the role of orthologous genes of these targets in other model plants. Virus induced gene silencing in Nicotiana benthamiana showed that the orthologous genes of TOM3 were involved in plant response to Ralstonia pseudosolanacearum, as the bacterial multiplication was diminished in plants silenced for these genes. In Arabidopsis thaliana, mutants of the TOM9 orthologous gene which is described as involved in chromatin remodelisation were more tolerant to infection. In a second chapter corresponding to a published article, the role of RipAX2 has been studied. This effector triggers specific resistance in AG9125 eggplant which carry the major resistance locus EBWR9. This eggplant accession AG9125 is resistant to the wild type R. pseudosolanacearum strain GMI1000, while a ripAX2 defective mutant of this strain can cause wilt. The addition of ripAX2 from GMI1000 to the naturally pathogenic strain PSS4 suppresses its pathogenicity, demonstrating that RipAX2 causes AG9125 resistance. Moreover, a zinc binding motif described as necessary to induce defenses on the eggplant wild relative Solanum torvum upon RipAX2 recognition is not necessary for AG91-25 resistance. The conservation of RipAX2 has been studied in the different strains of the bacteria in order to determine the potential of this resistance source against various strains for breeding

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Kati, Djamel Edine. "Mécanismes de défense chez les végétaux et notion d'élicitation : cas de Cucumis melo et d'un Stimulateur des Défenses Naturelles le «FEN560»." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20007.

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Abstract:

Nos travaux de recherches de thèse portent sur une étude comparative entre le déclanchement des mécanismes de défense in planta de la plante de melon après élicitation biotique, et un traitement avec un produit ayant des propriétés de Stimulateur des Défenses Naturelles (SDN). Le pathosystème étudié est Cucumis melo - Fusarium Oxysporum melonis. L'éliciteur abiotique SDN utilisé codé FEN560 est un extrait de graines de fenugrec (Trigonella foenum-graecum). Les principaux travaux sont : 1) L'analyse des activités enzymatiques relatives au stress et caractérisation d'enzymes PR. 2) L'étude des métabolites du métabolisme secondaire, notamment la production l'accumulation des composés organiques volatiles (COV). 3) Une étude de l'expression de gènes candidats impliqués dans la production de ces PR-protéines et/ou dans les voie de signalisation est aussi entreprise ; Les principaux résultats se traduisent par (i) une précocité et intensité de l'induction des activités enzymatiques étudiées pour les deux variétés et pour les organes d'un même plant (ii) Le priming est généralement observé au niveau du site de la seconde élicitation (infection FOM) avec une induction remarquable des PR-protéines. (iii) L'élicitation est Systémique, car l'induction se transmet mais à moindre intensité sur les intervalles de temps étudiés. (iv) L'augmentation de l'émission des COV coïncide avec l'induction de la LOX. Il est aussi noté l'émission de nouvelles molécules connus par leurs propriétés antibiotique ou répulsive des insectes herbivores ou attractive des prédateurs d'insectes herbivores. Les résultats sur les expressions des gènes candidats sont corrélés avec les activités enzymatiques et la production des composés organiques. Il en est ressorti que l'induction de la résistance par le traitement par pulvérisation de FEN560 est similaire au phénomène de « primig » dans la résistance systémique induite
This work is a comparative study between defense mechanisms in melon plant induced by biotic elicitor and treatment by plant extract having simulative proprieties of plant defense mechanisms. The studied pathosystème is Cucumis melo - Fusarium oxysporum fsp melonis. The used plant extract elicitor is named FEN560, it is from fenugreek seeds (Trigonella foenum-graecum). The main works were: 1) Analysis of the enzymatic activities relating to the stress and characterization of PR-proteins sch as peroxidases and chitinases. The lipoxygenase (LOX), the key enzyme of oxylipins biosynthesis and phenylalanine ammonia-lyase, the key enzyme of the phenylpropanoids pathway, were also studyed. 2) The study of the metabolites of the secondary metabolism, in particular accumulation of volatile organic compounds (VOC). 3) A study of expression candidate genes implied in the production of Pr-proteins and the induced resistance pathways is also undertaken. The main results: (i) precocity and intensity of enzymatic activities induction for the two varieties after inoculation of pretreated plants (ii) the priming is generally observed in the site of the second elicitation with a remarkable induction of PR-proteins. (iii) The elicitation induced by FEN560 is systemic; because induction is transmitted between roots and shoots (iv) The modification of VOC emissions coincides with the induction of the LOX activity. It is also noticed the emission of new molecules known for their antibiotic properties or repulsive of the insects herbivorous or attractive of predatory of herbivorous insects. The results on the genes candidates' expression are in general correlated with the enzymatic activities and the production of the volatile organic compounds through LOX activity. In brief, the induction of resistance by the treatment by FEN560 is similar to the phenomenon of "primig" in induced systemic resistance

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Bordiec, Sophie. "Interaction entre la vigne (Vitis vinifera L. ) et une bactérie PGPR, Burkholderia phytofirmans souche PsJN : mécanismes de défense impliqués lors de la perception de la bactérie par la plante, et lors de l’établissement de la protection contre le froid et la pourriture grise." Reims, 2010. http://theses.univ-reims.fr/sciences/2010REIMS030.pdf.

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Abstract:

Burkholderia phytofirmans souche PsJN (bactérie de type PGPR) est capable de coloniser le système racinaire de la vigne et de diffuser dans la plante. Au cours de mes travaux de recherche, nous avons tout d’abord montré que la bactérie est perçue par les cellules de vigne, cette perception induisant des réponses de défense. Par ailleurs, l’interaction entre la souche PsJN et la vigne confère à la plante une protection vis-à-vis de Botrytis cinerea et d’une exposition à 4°C. Afin de mieux caractériser cette protection, nous avons analysé la mise en place de composés de défense en réponse à ces deux stress dans des vitroplants entièrement colonisés par la bactérie. Les plants bactérisés montrent une tolérance envers le froid. Cette protection est associée à la potentialisation de l’expression de gènes impliqués dans les réponses de défense, une accumulation de proline, ainsi qu’une activation plus rapide des systèmes de détoxification de l’H2O2 et des aldéhydes. Par ailleurs, il a été démontré que la souche PsJN protège la vigne contre B. Cinerea. L’étude de l’expression de plusieurs gènes de défense n’a pu révéler la potentialisation de leurs expressions. Par contre, cette protection a été associée à une accumulation plus importante de phytoalexines. Ces travaux démontrent donc que la relation bénéfique qui s’établit entre la vigne et la souche PsJN, se manifeste par une protection contre le froid ou B. Cinerea via le phénomène de potentialisation. Cependant, la présence de la bactérie localement semble être un facteur déterminant pour l’établissement de la résistance dans la mesure où aucune protection contre ces stress n’a été obtenue en condition systémique
The PGPR Burkholderia phytofirmans strain PsJN is able to colonize grapevine roots and to diffuse to leaves, inflorescences and berries. The present work aimed to better characterize this interaction. Firstly, our results showed that interaction between grapevine cell suspensions and this bacterium induced plant defense responses. This demonstrated that strain PsJN was locally recognized by the plant cells, which triggered plant immunity modifications. Interaction between grapevine and strain PsJN also confers to the plant a protection against Botrytis cinerea and cold stress (4°C). In order to better characterize this protection, induced defense responses were analyzed in fully bacterized plantlets submitted to these stress. The bacterium induced a protection against cold stress. This protection is correlated with priming of some stress-related gene expressions, an accumulation of proline, and a faster activation of H2O2 and aldehyde scavenging systems. Moreover, it was demonstrated that B. Phytofirmans strain PsJN protects grapevine against B. Cinerea. Analysis of defense-related gene expressions showed no priming of their expressions. Nevertheless, the observed protection was correlated with a higher phytoalexin accumulation. Thus, this work demonstrated that the beneficial relationship between grapevine and strain PsJN induced a protection against cold exposure (4°C) or B. Cinerea attacks, which was correlated with priming phenomenon. Nevertheless, preliminary studies showed that the presence of strain PsJN locally seemed to be an important factor for resistance establishment, since no protection against these stresses was observed in a systemic context

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Grosjean, Kevin. "Microdomaines ordonnés de la membrane plasmique végétale : caractérisation et rôle dans la signalisation associée à la défense." Thesis, Dijon, 2015. http://www.theses.fr/2015DIJOS089/document.

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Abstract:

Au cours de ces dernières années, des études ont montré l’existence d’une compartimentation latéraledes composants de la membrane plasmique végétale, de manière analogue à ce qui avait été montréchez les animaux et les levures. L’objectif de cette thèse était d’apporter de nouveaux éléments decaractérisation de cette compartimentation (propriétés physiques de domaines particuliers, mécanismesde mise en place de ces domaines, de contrôle de leur taille, etc…) et d’étudier son rôle dans laphysiologie de la cellule végétale.Le développement d’une méthodologie de microscopie confocale spectrale couplée à l’utilisationd’une sonde environnementale a permis d’apporter la première description à l'échellesubmicrométrique de l’organisation du plasmalemme en territoires aux propriétés physiquesdifférentiées. Ces domaines coexistent au sein de la membrane plasmique de cellules en suspension,comme à celle de membranes artificielles composées de lipides modèles ou de lipides de membranescellulaires, de vésicules géantes constituées de membrane plasmique purifiée, ou de protoplastes.Cependant, les différences de l’organisation latérale observées chez ces différentes membranes ontpermis de montrer l’importance des phytostérols qui seraient, par le biais d'interactions spécifiquesavec d’autres lipides végétaux tels que les GIPCs, des composés essentiels pour la formation locale dedomaines lipidiques ordonnés. La grande diversité des lipides végétaux organiserait ainsi lacompartimentation de la membrane plasmique permettant la ségrégation dynamique des composantsmembranaires. Si les stérols augmentent de manière importante le degré de compaction de la bicouche,les protéines le diminuent. Le cytosquelette et la paroi ne semblent, quant à eux, modifier ni laprésence, ni l’organisation des domaines ordonnés de la membrane plasmique. Nous avons égalementmontré que l’organisation de ces domaines évolue transitoirement lors des étapes précoces de lacascade de signalisation induite par des réactions de défense. De fait, nous avons identifié desmodifications des propriétés physiques globales et de l’organisation fine de la membrane provoquéespar différents éliciteurs de réactions de défense, dont la cryptogéine, une protéine sécrétée parl’oomycète Phytophthora cryptogea. Nous avons montré que ces modifications sont un élémentgénérique de la signalisation de défense, sous la dépendance de phénomènes de phosphorylation, leburst oxydatif étant également une étape clé de l’augmentation du degré d’ordre observé dans lesphases précoces de cette signalisation. La cryptogéine, qui présente une aptitude singulière pour piégerles stérols, a également montré une capacité spécifique à augmenter la fluidité membranaire, ceparamètre pouvant contrôler l’intensité de la cascade de signalisation, mesurée par la production deformes actives d’oxygène.Ces résultats ouvrent de nouvelles perspectives dans la compréhension des interactions cellule-élicitineet apportent un nouvel éclairage sur le rôle des lipides végétaux dans l’organisation latérale de lamembrane plasmique végétale et positionne la dynamique membranaire comme un élément designalisation de défense des plantes
Recent studies have shown the existence of lateral sub-compartmentalization of plant plasmamembrane similar to that of animal cells and yeasts. The aim of this thesis was to provide newelements to characterize this compartmentalization (physical properties of specific domains,mechanisms of their formation, determination of their size, etc...) and to study its role in thephysiology of plant cells.The development spectral confocal microscopy coupled with the use of an environment-sensitiveprobe enabled to obtain the first description at the submicron scale of plasma membrane organizationinto domains exhibiting various physical properties. These domains coexist at the plasma membranesurface of tobacco suspension cells as well as the membrane of vesicles composed of models lipids orcell plasma membrane lipids, purified plasma membrane vesicles, and protoplasts. However,differences in the lateral organization observed in these membranes have shown the importance ofphytosterols which are, through specific interactions with neighboring plant lipids such as GIPCs,essential for local formation of ordered domains. The huge diversity of plant lipids drives thecompartmentalization of the plasma membrane allowing the dynamic segregation of membranecomponents. Sterols greatly increase membrane order, whereas proteins tends to decrease it.Cytoskeleton and cell wall do alter neither presence nor organization of ordered domains of the plasmamembrane. We have also shown that the organization of these domains is transiently modified duringthe early stages of defense signaling cascade. In fact, we have identified changes in overall physicalproperties and fine lateral organization of the membrane caused by various elicitors of defensereactions, including cryptogein, a protein secreted by the oomycete Phytophthora cryptogea. We haveshown that these changes are a generic element of defense signaling cascade and depend onphosphorylation processes; oxidative burst being also a major actor of the control of the increase ofmembrane order observed during the very early stages of the signalling process. Cryptogein, whichexhibits the particular ability to trap sterols, also showed a specific capacity to increase membranefluidity and amplify the intensity of the signalling cascade, as measured by the production of reactiveoxygen species.These results open new perspectives in the understanding of cell-elicitin interactions and provide anew view on the central role of sterol composition in the lateral organization of plant plasmamembrane. They also identify membrane dynamics as a new player in the signalling cascade occurringduring plant defense

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Pierron, Romain. "Esca et vigne : compréhension des mécanismes de défense précoces du bois de la vigne Vitis vinifera L. suite à la maladie, colonisation des champignons in planta et proposition de moyens de lutte pour une viticulture durable." Phd thesis, Toulouse, INPT, 2015. http://oatao.univ-toulouse.fr/14651/1/Pierron.pdf.

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Abstract:

L’esca est une maladie du bois de la vigne complexe et mal connue, contre laquelle aucun moyen de lutte efficace n’existe à ce jour. Ce travail s’est concentré sur les interactions précoces entre Vitis vinifera L. et les champignons associés au « young esca » P. chlamydospora et P. aleophilum dans deux types de tissus lignifiés : l’entre-nœud et le nœud (modèle plaie de taille). La colonisation 6 et 12 semaines après traitement des souches transformées P. aleophilum::gfp7 et P. chlamydospora::gfp1 a été observée. Les deux espèces coloniseraient différents tissus dans les premières semaines suivant l’infection. Les fibres du xylème constitueraient un tissu essentiel lors de l’interaction précoce entre P. aleophilum et la vigne, tandis que P. chlamydospora::gfp1 a seulement colonisé les vaisseaux du xylème après 12 semaines. Le bois de la vigne présenterait des réponses spécifiques à la présence de P. aleophilum 6 semaines après traitement, puis générales à la blessure 12 semaines après traitement, en microscopie. L’hypothèse de la spécificité de la réponse induite dans le bois de la vigne par ces deux espèces a été confirmée en étudiant l’expression de 11 gènes associés à la défense 10 h, 24 h, 48 h et 120 hpi. La réponse précoce du bois de la vigne serait spécifique suivant l’identité des pathogènes. Les tissus de l’entre-nœud ont été induits différemment par la blessure par rapport aux tissus dans la région nodale. Un modèle pour le criblage d’agents de biocontrôle ou d’éliciteurs contre l’esca en quelques mois en conditions de laboratoire a permis le développement d’un moyen de lutte durable et novateur, l’eau ozonée. L’eau ozonée présente des propriétés sporicides remarquables contre P. aleophilum in vitro. In planta l’application d’eau ozonée sur une blessure infectée en modèle plaie de taille a réduit de moitié la quantité de mycélium capable de se développer dans le bois 9 semaines après inoculation.

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Nivault, Aurelia. "Diversité et traits d’histoire de vie des Botryosphaeriaceae et évaluation du potentiel de défense de différents cultivars de Vitis." Thesis, Bordeaux, 2017. http://www.theses.fr/2017BORD0811/document.

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Abstract:

Vitis vinifera L. représente l’une des cultures les plus répandues dans les pays producteurs de vin, laquelle est soumise à de nombreuses contraintes environnementales pouvant favoriser l’émergence des maladies de dépérissement du bois (MDB). La famille des Botryosphaeriaceae est responsable du Botryosphaeria dieback, provoquant des chancres et des nécroses qui conduisent à une dépréciation de la qualité du vin, voire à la mort des ceps. Les méthodes de lutte sont peu efficaces. Sept espèces sont retrouvées dans le vignoble français dont B. dothidea, D. intermedia, D. mutila, D. seriata, Do. viticola, N. parvum et L. viticola. Nous avons étudié différents traits d’histoire de vie de ces agents pathogènes : (i) leur agressivité in planta, (ii) leur adaptation à des contraintes environnementales (e.g. température, fongicides), (iii) la présence de mycovirus, pour acquérir des connaissances sur leur pouvoir adaptatif face aux contraintes environnementales et expliquer la variabilité de leur agressivité. En complément, l’évaluation de la sensibilité de cultivars de Vitis face à une infection par N. parvum et D. seriata a été réalisée, et le potentiel de défenses de différents cépages (Ugni Blanc, Cabernet-Sauvignon et Merlot) a été étudié. L’ensemble des travaux menés ont permis de révéler des espèces très agressives telles que N. parvum et L. viticola par rapport à D. seriata, lors d’inoculations en serre sur des boutures. Les températures optimales de croissance déterminées montrent que certaines espèces (ex. Lasidiplodia spp.) sont mieux adaptées à des températures élevées (33°C). Par ailleurs, la sensibilité de 65 souches et génotypes a été testée pour 9 fongicides avec des modes d’action différents (inhibiteurs de la respiration mitochondriale, de la biosynthèse des stérols, du cytosquelette, multi-sites, etc.). De nombreuses espèces sont peu ou pas sensibles à certains de ces fongicides et des souches résistantes ont été trouvées avec un facteur de résistance pouvant atteindre plus de 1000. D’autre part, la détection de mycovirus au sein des 65 isolats a permis d’identifier la présence de 6 mycovirus, dont Neofusicoccum luteum mitovirus 1 et Neofusicoccum luteum fusavirus 1. L’évaluation du potentiel de défense des trois cultivars Vitis face à une infection par N. parvum et D. seriata a montré des réponses différentes entre cépages et en fonction de l’agent pathogène. In fine, des analyses croisant les différents traits d’histoire de vie et les interactions plante-pathogènes ont été faites, et l’ensemble des résultats nous a fourni de nouvelles pistes d’étude pour lutter contre ces agents pathogènes
Vitis vinifera L. is largely cultivated in countries producing wine but an increase in grapevine trunk diseases (GTDs) have been observed due to the attack of several fungal pathogens including those belonging to the Botryosphaeriaceae family (Botryosphaeria dieback). Seven species were isolated in the French vineyards B. dothidea, D. intermedia, D. mutila, D. seriata, Do. viticola, N. parvum and L. viticola. Nowadays, no efficient products are available to control these diseases. Studying, different life traits of 65 strains of different genotypes of the Botryosphaeriaceae’s family, known to have members displaying different aggressiveness, would lead to a better understanding of these wood pathogens. Their in planta aggressiveness, their adaptation towards environmental pressures (temperature, fungicides), and the detection of mycoviruses were carried out. In order to have a better comprehension of the interaction within the plant, the expression analysis of genes involved in the plant defense were assayed upon 3 cultivars (Cabernet Sauvignon, Merlot, and Ugni-Blanc) but also on two species (N. parvum and D. seriata). L. viticola, and N. parvum, were shown to be more aggressive than D. seriata and. L. viticola is more adapted to higher temperature (33°C). Moreover, the strains tested with 9 different fungicides (mitochondrial respiratory, sterol biosynthesis, cytoskeleton or multisite inhibitors, etc.) showed lower sensitivity within some species, (with a resistance factor reaching a 1000). In addition, at least 6 mycoviruses were characterized. Amongst them, two mycoviruses were isolated from a N. luteum strain and were fully sequenced (Neofusicoccum luteum mitovirus 1 and Neofusicoccum luteum fusavirus 1). The three cultivars infected with either N. parvum or D. seriata showed different gene responses between themselves but also between the different strains inoculated. These different studies are giving us more information upon these Botryospheriaceae fungi, to find out new efficient or complementary methods in order to control GTDs

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Adam, Thibaud. "Etude de l'implication de l'endocytose à clathrine dans les réactions de défense déclenchées par la cryptogéine chez le tabac." Thesis, Dijon, 2012. http://www.theses.fr/2012DIJOS019.

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Abstract:

La cryptogéine est un éliciteur protéique des réactions de défense chez le tabac sécrété par l’oomycète Phytophthora cryptogea. Son interaction avec un récepteur encore non identifié de la membrane plasmique déclenche une cascade d’événements de signalisation qui conduisent à une reprogrammation génique, à la diffusion d’un signal conférant une résistance systémique et, ultimement, à la mort des cellules directement exposées à cet éliciteur. Notre équipe avait précédemment mis en évidence une stimulation de la formation de vésicules d’endocytose quelques minutes après l’élicitation. Des études de microscopie électronique et d’inhibition pharmacologique avaient permis d’émettre l’hypothèse que cette endocytose était dépendante de la clathrine (CME). Ce processus essentiel des cellules eucaryotes concoure au maintien de l’homéostasie du plasmalemme. L’endocytose joue également deux rôles aux effets antagonistes lorsqu’elle est induite par un stimulus de l’environnement. Elle permet d’une part la production d’endosomes de signalisation qui vont délivrer le stimulus au cœur de la cellule, et assure d’autre part la désensibilisation de la membrane afin de préparer la cellule à percevoir d’autres stimuli.Mon travail de thèse avait pour objectif de confirmer que l’endocytose induite après traitement de cellules de tabac par la cryptogéine est bien dépendante de la clathrine et d’essayer de déterminer si elle est impliquée, directement ou indirectement, dans la transduction du signal d’élicitation et dans le développement des réactions de défense. Afin de visualiser in vivo la dynamique endocytaire, j’ai établi une suspension cellulaire de tabac exprimant une chaine légère de clathrine fusionnée à la GFP. La caractérisation de cette suspension par des approches biochimiques et par microscopie a confirmé l’induction d’une endocytose dépendante de la clathrine suite à l’élicitation par la cryptogéine. J’ai également développé une stratégie d’inhibition de la CME faisant appel à l’expression d’une version tronquée de la CHC, appelée hub, dont la propriété est d’empêcher la formation du manteau de clathrine à la membrane plasmique. La caractérisation d’une lignée cellulaire co-exprimant le marqueur d’endocytose GFP-CLC et le hub a montré qu’il était possible d’empêcher l’endocytose à clathrine induite par la cryptogéine sans altérer de façon significative l’endocytose constitutive. L’utilisation de cette stratégie d’inhibition sélective a ainsi démontré que des événements précoces induits à la membrane plasmique par la cryptogéine, telles l’alcalinisation du milieu extracellulaire et la production de formes actives de l’oxygène, ne sont pas dépendants de la CME. L’impact de l’invalidation de l’endocytose induite sur le déclenchement des réponses tardives a été étudié sur des cellules en suspension et sur des plants de tabac. Mes travaux ont révélé que l’endocytose contribuait de façon réduite à la reprogrammation du transcriptome et au déclenchement de la mort cellulaire programmée. Des travaux préliminaires effectués sur des plantes exposées à divers pathogènes du tabac ont montré que l’expression du hub affecte la sensibilité des plantes à certains de ces pathogènes. L’ensemble de ces travaux ouvrent la voie à une étude plus intégrative du rôle de l’endocytose dans l’interaction tabac-cryptogéine
Cryptogein, a protein secreted by the oomycete Phytophthora cryptogea, is an elicitor of defense reaction in tobacco. Cryptogein binding to an unidentified receptor of the plasma membrane triggers a signaling cascade that leads to changes in gene expression, production of a systemic acquired resistance signal, and cell death. Our lab previously reported a stimulation of endocytosis a few minutes after elicitation. Electron microscopy and pharmacological studies evidenced that this endocytosis is clathrin-mediated. Clathrin-mediated endocytosis (CME) is a fundamental eukaryotic cell process that ensures plasma membrane homeostasis. It also plays two antagonistic roles in extracellular signal transduction either by producing endosomes that convey the signal into the heart of the cell, or by downregulating plasma membrane receptors to attenuate cellular responsiveness and prepare the cell for subsequent signals.The aim of my thesis was to confirm clathrin dependence of cryptogein-induced endocytosis and to find out whether endocytosis is involved in cryptogein signaling and defense reactions. I established a tobacco cell suspension expressing clathrin light chain fused to GFP to follow CME in living cells. Biochemical and microscopic characterization of the cell suspension confirmed that cryptogein-induced endocytosis is clathrin-mediated. I also developed a dominant-negative strategy to inhibit CME by expressing a truncated form of clathrin heavy chain, the hub domain, which prevents clathrin-coated pit formation at the plasma membrane. Characterization of a cell line co-expressing GFP-CLC and the hub domain showed that it is possible to hinder cryptogein-induced CME without significantly altering constitutive endocytosis. This selective inhibition strategy revealed that cryptogein-induced early signaling events such as alkalinisation of the extracellular medium and reactive oxygen species production are CME-independent.Consequences of induced-CME inhibition on later responses to cryptogein were studied in cell suspension and in tobacco plants. My results showed that endocytosis contributes in a minor way to transcriptome reprogramming and cell death induction. Moreover, preliminary results suggested that hub expression increases the plant’s sensitivity to several pathogens. Altogether these results open up the prospect of addressing the role of CME during tobacco-cryptogein interaction in a more integrative view

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Bouscaut, Jérôme. "Diversité des systèmes de défenses induites de la vigne et efficacité sur le mildiou et l'oïdium." Bordeaux 2, 2005. http://www.theses.fr/2005BOR21263.

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Abstract:

Les principaux pathogènes de la vigne, Erysiphe necator et Plasmopara viticola, deux parasites biotrophes stricts, nécessitent une lutte chimique systématique afin de contenir leur développement épidémique. En absence de méthodes standardisées afin d'évaluer l'efficacité d'inducteurs des défenses de la Vigne sur le développement des pathogènes, une méthodologie spécifique à chaque pathogène a été définie. Mes études montrent que Plasmopara viticola est plus sensible que Erysiphe necator à une élicitation extemporanée des défenses de la Vigne par un stimulateur, à l'exception du milsana®. De plus, la diversité de l'oidium intergroupe montre que les souches de biotype B sont plus sensibles aux défenses de la plante que les souches de biotype A. Des analyses biochimiques d'extraits de polyphénols de feuilles de Vigne stimulées et/ou inoculées, ont conduit à l'identification de trois molécules, pouvant tenir lieu de marqueur d'état de défense de la Vigne : la catéchine, la transastringine et un acide aminé. En réponse à une stimulation de boutures foliaires par du BTH, l'induction de l'expression des gènes, inhérents aux voies de défenses et de biosynthèse des anthocyanes, se déroulent, localement, en moins de 24 heures. Néammoins, 48 heures sont nécessaires à l'activation du gène PR1, gène marqueur de la résistance systémique acquise de plante. Ainsi, les variabilités intra et interspécifiques des pathogènes, aussi bien que les réponses spécifiques de la Vigne face aux différents stimulateurs (BTH, pK2, fosétyl), sont autant de paramètres à prendre en compte pour le développement de l'utilisation de stimulateurs des défenses naturelles de la Vigne
The major pathogens of grape, Erysiphe necator and Plasmopara viticola, are biotrophic microorganisms against which the protection of vineyards relies on an intensive use of fungicides. No standardised methods are available to assess the effectiveness of inducers of grapevine defences on pâthogen development. A methodology, specific for each pathogen, has thus been developed. The results show that Plasmopara viticola is more sensitive than Erysiphe necator to a direct elicitation of grapevine's defences, except in the case of milsana®. Moreover, intergroup diversity of the powdery mildew shows that strains belonging to biotype B are more sensitive that strains of the biotype A. Biochemical analyses of polyphenolic extracts of stimulated and/or inoculated leaves have led to the identification of three compounds that can potentially be associated with the state of defence of the grapevine : catechin, trans-astringin and amino acid. In response to the stimulation of two-month-old grapevine plants by acibenzolar-S-methyl, the induction of the expression of genes takes place locally in less than 24 hours. A period of 48 hours is however necessary for the activation of PR1, an acquired systemic resistance gene marker. All biological, biochemical, and molecular analyses indicate that to the grapevine response is specific to each elicitor. The different results obtained indicate that both the intra and inter-variability of pathogens, and the specific responses of grapevine to different inducers (BTH, fosetyl-aluminium), are factors that must be considered for a better development of the use of grapevine defence stimulators

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Lebon, Audrey. "La compensation dans les interactions plantes-insectes : modélisation, simulation et expérimentation." Thesis, Montpellier 2, 2014. http://www.theses.fr/2014MON20161/document.

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Abstract:

La résistance et la tolérance, c'est à dire la capacité de la plante à supporter la présence des ravageurs, sont deux moyens dont usent les plantes pour se défendre. La tolérance est fortement liée à un processus de compensation qui est une réponse positive des plantes à la présence des ravageurs (en terme de reproduction et/ou de croissance). Dans le but d'apporter de nouvelles pistes de réflexion dans le domaine des interactions plantes-insectes, nous avons conduit trois études différentes sur la compensation chez les plantes. Dans la première, nous avons développé un modèle mathématique générique, dont l'étude a mis en évidence l'existence de paramètres seuils qui déterminent la co-existence ou non de différents types d'équilibres de compensation. La seconde étude, expérimentale, visait à tester l'hypothèse de compensation chez la tomate en réponse à la mineuse de la tomate, Tuta absoluta. Dans notre expérience, le cultivar de tomate a présenté des tendances à la compensation pour deux niveaux d'infestation, et à la sur-compensation reproductive en cas de faible infestation. Enfin, toujours dans le cas de la tomate et T. absoluta, les derniers développements s'appuient sur un modèle informatique de type « Structure-Fonction ». Ce modèle a permis de tester et visualiser différentes situations (dates et positionnements de l'attaque) sur une représentation plus réaliste de la plante. Pour conclure, nous avons mis en évidence que la compensation peut avoir un impact important sur l'efficacité des stratégies de protection des cultures et qu'elle doit être prise en compte dans le développement de ces dernières
Resistance and tolerance, which is the ability of plants to endure a pest attack, are two different aspects of plants defenses. Tolerance is strongly linked to a compensation process which is a positive response of plants to the presence of pests (in terms of reproduction and / or growth). In order to bring new knowledges in the field of plants-insects interactions, we conducted three different studies on compensation in plants. In the first one, we developed a generic mathematical model, whose the study revealed the existence of threshold parameters that determine the co-existence or not of different types of compensation equilibria. The second study, which was experimental, aimed to test the hypothesis of a compensation response in tomato undet the attack of the tomato leafminer, Tuta absoluta. In our experiment, the tomato cultivar presented trends in compensation for two levels of infestation, and trend of reproductive overcompensation for low infestation. Finally, our last study is based on a "Structure-Function" computer model, still on the case of tomato and T. absoluta. This model was used to test and visualize different situations (dates and positions of the attack) on a more realistic representation of the plant. In conclusion, we have shown that compensation may have a significant impact on the effectiveness of strategies for crop protection and must be taken into account in their development

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Benchekroun, Mohammed Nabil. "La résistance pléiotropique aux médicaments anticancéreux : intervention des radicaux libres, de leurs produits de peroxydation et des moyens de défense antiradicalaire dans le mode d'action de la doxorubicine et dans la résistance des cellules tumorales à cet anticancéreux." Bordeaux 2, 1991. http://www.theses.fr/1991BOR22027.

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Abstract:

Le premier mécanisme identifie de résistance cellulaire aux anthracyclines a été la multidrug-résistance liée a la surproduction d'une glycoprotéine membranaire, produit du gèneMDR 1, capable de chasser activement le médicament hors de la cellule. Or ce simple mécanisme ne peut expliquer à lui seul les phénomènes de résistance cellulaire. Toutefois, d'autres mécanismes de résistance aux anthracyclines sont susceptibles d'exister. La doxorubicine et d'autres anticancéreux sont à l'origine de radicaux libres après réduction mono électronique. Nous avons évalué l'importance des moyens de protection développes par les cellules pour lutter contre ces radicaux libres. Le glutathion joue un rôle important dans la résistance de lignées étudiées; une hyperactivité de la glutathion peroxydase due à l'hyper expression de son gène nous parait concourir à la résistance de la lignée ce 0,5E (glioblastome). Nous avons évalué la peroxydation lipidique sous l'effet de la doxorubicine, dans des cellules tumorales, entières et vivantes. Nous avons pu mettre en évidence l'existence de cette peroxydation dans toutes les lignées sensibles, sauf la lignée htc (hépatome); cette peroxydation n'a pas lieu dans les cellules résistantes à la doxorubicine, à l'exception des cellules de la lignée A1 M1,5 (hépatome). Nous soulignons le fait que cette peroxydation n'a été observée qu'après un délai de 24 h entre le contact avec le médicament et l'apparition du produit de peroxydation. Il existe une corrélation entre peroxydations et activité glutathion peroxydase

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Akuesson, Ernest Tonawa. "Les exceptions de procédure dans le procès civil." Thesis, Paris 1, 2016. http://www.theses.fr/2016PA01D005/document.

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Abstract:

La fausse qualification de «moyen de défense» attribuée par tradition à l'exception de procédure a conduit le législateur à la soumettre à un régime totalement incohérent et inadapté. L'illustration en est donné par l'échec constaté de l'exclusivité de compétence attribuée au juge de la mise état sur les exceptions de procédure, échec se matérialisant par les nombreuses dérogations que ne cesse d'apporter la jurisprudence à leur régime. Elle se traduit aussi par la quasi-impossibilité pour le demandeur à l'action principale de s'en prévaloir, ce en totale contradiction avec l'esprit des textes. Cette incohérence est illustrée enfin par les confusions opportunistes entre exception de procédure, fin de non-recevoir, incident et défense au fond. L'exception de procédure n'est pas un moyen de défense mais une demande incidente relative à la marche de la procédure qui en termes d'ordre logique doit être examinée par préalable au fond. Elle n'intéresse donc que les rapports procéduraux c'est-à-dire l'instance dont l'ouverture et la conduite aux termes des articles 1 et 2 du Code de procédure civile appartiennent aux parties. La classification et le régime des exceptions de procédure doivent en tenir compte. Il faut donc distinguer les exceptions de procédure opposées à l'ouverture de l'instance de celles qui sont opposées à sa continuation. Seules les premières doivent relever de la compétence exclusive du juge de la mise en état de qui on doit réussir à faire un véritable juge de l'introduction de l'instance. Les exceptions de procédure opposées à la continuation, par contre, doivent pouvoir être proposées au fur et à mesure de leur survenance ou de leur révélation sauf la possibilité pour le juge de les écarter ou de prononcer des condamnations pécuniaires à l'encontre de la partie qui se serait abstenue dans une intention dilatoire ou abusive de les soulever plus tôt
The false qualification of "defense" awarded by tradition to the procedural objection led the legislator to submit it to a totally inconsistent and unsuitable regime. The illustration is given by the failure noticed by the exclusivity of competence awarded to the judge of the enabled on the procedural objections, failure materializing by the numerous dispensations which the jurisprudence continues bringing to their regime. It is also translated by the quasi-impossibility for the applicant in the main action to claim it in whole contradiction with the spirit of Law. This incoherence is finally illustrated by the opportunist confusions between procedural objection, refusal of the action's receving, incident and defense in fact. The procedural objection is not a defense but an incidental request relative to the step of the procedure which in term of logical order must be examined by prerequisite in fact. It thus interests only the procedural relationships that is to say the instance which the opening and the conduct (driving) in compliance with the articles 1 and 2 of the Code of civil procedure belong to the parties. The classification and the regime of the procedural objections have to take it into account. It is thus necessary to distinguish the procedural objections on the contrary to the opening of the authority of those who are set against its continuation. Only the first ones have to be a matter of the exclusive competence of the judge of the enabled of whom we have to manage to make a real judge of the introduction of the instance. The procedural objections opposed to the continuation, on the other hand, must be able to be suggested according to their emergence or to their revelation except the possibility for the judge ruling out them or pronouncing pecuniary condemnations against the party which would have abstained in a delaying or unfair intention to raise them earlier

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Picard, Karine. "Lutte biologique par Pythium oligandrum en culture hors-sol : dynamique des populations, antagonisme et rôle d’une protéine dans l’induction de résistance chez la tomate." Brest, 2000. http://www.theses.fr/2000BRES0001.

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Abstract:

Depuis quelques années, le monde agricole s’oriente vers une agriculture durable et raisonnée afin de préserver l’environnement et améliorer la sécurité alimentaire en développant le concept de protection biologique intégrée (prophylaxie/lutte biologique). Dans ce contexte, nous avons initié une étude sur le potentiel de P. Oligandrum comme agent de lutte biologique en cultures hors-sol de tomates. Notre objectif était de vérifier la capacité de P. Oligandrum à coloniser le système racinaire des plants de tomates et de préciser les relations établies entre cet antagoniste, la plante et certains micro-organismes de la rhizosphère. Les résultats de cette étude mettent en évidence que P. Oligandrum est capable de coloniser le rhizoplan des plants de tomates et démontre que la dynamique des populations de cet antagoniste varie en fonction du nombre d’apport de l’inoculum et du système de culture mais ne semble pas influencée par la variété de tomates. L’apport de P. Oligandrum diminue la réceptivité des plantes aux agents pathogènes tels que Pythiuni spp. Et F. O. R. L. Et est susceptible de se traduire en fin de saison par une augmentation du rendement. Cet antagoniste semble agir principalement en induisant des réactions de défense chez la plante. Effectivement, il est observé chez des plants traités avec P. Oligandrum et infectés avec F. O. R. L. , la formation de barrières chimiques au niveau des vaisseaux du xylème qui limitent la pénétration de F. O. R. L. Afin de préciser la séquence des événements impliqués dans l’interaction entre P. Oligandrum et certains champignons du sol dont P. Parasitica, une étude ultrastructurale et cytochimique a été réalisée. Elle démontre la vulnérabilité des Oomycètes à P. Oligandrum qui se traduit, chez le champignon hôte, par des altérations cytoplasmiques associées à la mise en place de barrières structurales (phénomène rarement observé chez les champignons). Lors de cette interaction, plusieurs mécanismes d’action sont mis en oeuvre par P oligandrum mycoparasitisme, antibiose et induction de réaction de défense. Ces résultats démontrent la complexité des interactions entre les champignons et mettent en évidence que P. Oligandrum comme chez les plantes est capable d’induire des réactions de défense chez les champignons. Une molécule élicitrice, appelée oligandrine, a été isolée du filtrat de culture de P. Oligandrum. Cette protéine possède des propriétés biochimiques et moléculaires à la fois semblables aux élicitines et aux pythines mais également différentes. L’oligandrine par ses propriétés particulières au niveau biochimique et moléculaire constitue une nouvelle famille d’élicitines. Appliquée au sommet d'une tige décapitée, l’oligandrine est capable de migrer dans la plante par les vaisseaux du xylème et d’induire une protection contre P. Parasitica. La stratégie de défense élaborée par les plants de tomate traités à l’oligandrine en réponse à une infection de P. Parasitica se fait en 2 étapes; (i) activation des réponses ayant un effet direct sur le champignon ; (ii) induction des barrières structurales au niveau du site de pénétration du champignon. Cependant, les réactions de défense induite chez la tomate par l’oligandrine sont différentes que lorsque la plante est inoculée avec P. Oligandrum. Ceci révèle que l’oligandrine n’est pas la seule molécule impliquée dans l’induction de résistance observée chez la tomate lors d’un traitement par P. Oligandrum. Néanmoins, l’innocuité de l’oligandrine sur plante en fait donc un candidat de choix pour comprendre la mise en place de la résistance naturelle des plantes à leurs agresseurs. L’utilisation de cette protéine comme inducteur de réactions de défenses peut être envisagée à l’avenir.

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Larronde, Fabienne. "Régulation de la biosynthèse des anthocyanes et des stilbènes par les sucres et le méthyl jasmonate chez Vitis vinifera : induction des défenses naturelles de la vigne." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR28796.

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Dissertations / Theses on the topic 'Tomates – Moyens de défense'

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