Academic literature on the topic 'Traits morphologiques'

RésuméVoici un survol des tendances depuis trente ans en syntaxe générative à propos des clitiques pronominaux. Perlmutter 1971 propose que des conditions de surface sont responsables de l’ordre interne des suites de clitiques et que l’absence de sujet obligatoire, en espagnol, serait liée à d’autres propriétés syntaxiques. Sont ensuite apparus : 1o les analyses par transformations ; 2o les débats entre déplacement et génération à la base, dus surtout aux données sur le redoublement clitique ; 3o l’étude de liens potentiels entre l’existence d’arguments nuls et les clitiques pronominaux, menant à des traitements morphologiques ; 4o l’application des travaux sur le rôle central des catégories fonctionnelles et des traits ; 5o les analyses de la structure interne des clitiques par la géométrie des traits et les variantes notationnelles des schèmes morphologiques sous forme de contraintes optimalistes hiérarchisées.

La diversité pomologique du figuier (Ficus carica L.) dans les oasis tunisiennes a été étudiée en utilisant les descripteurs morphologiques. Vingt et un cultivars de figuier originaires des oasis de Kébili, Tozeur et Gafsa ont été analysés et comparés. L'analyse de la variance, l'analyse en composantes principales et l'analyse canonique hiérarchique de caractères liés aux fruits montrent une grande diversité au sein des cultivars étudiés. L'étude de cette diversité de germoplasme du figuier permet de détecter des cas homonymes et synonymies. Certains d'entre eux ont été sélectionnés. Parmi les descripteurs de haut degré de discrimination celles relatifs aux dimensions des fruits, la couleur des fruits, etc. Certains traits morphologiques sont susceptibles d'être utilisés comme descripteurs pour la classification des cultivars de figuier en Tunisie.

Résumé À partir de tests linguistiques administrés dans le cadre d’une étude sociolinguistique, cette note de recherche décrit un certain nombre de traits phonologiques et morphologiques de l’inuktitut parlé par un échantillon d’adultes et d’enfants vivant à Iqaluit. La note démontre un degré de variation linguistique relativement élevé, surtout en ce qui concerne la morphologie.

En percevant les visages, l’humain a tendance à inférer les traits de personnalité de l’observé/e à partir des traits morphologiques de son visage. Ce type de premières impressions s’organise en 2 dimensions majeures : valence et domination. L’objectif de la présente étude était d’explorer la structure du construit de la domination chez les jeunes adultes français. Cinq sessions de brainstorming couplées avec la technique de juges ont permis d’identifier 64 traits inférés de visages et relatifs à la domination/soumission. Les traits ont été intégrés dans un questionnaire comportant une échelle de Likert. Les données de 191 participants ayant évalué la photographie d’un visage aléatoirement sélectionnée ont été soumises à l’analyse par composantes principales et l’analyse factorielle exploratoire. Les différentes solutions d’extraction de composants/facteurs sont comparées et évaluées pour leur viabilité.

Abstract Grenada is a Caribbean island with a volcanic origin and relatively low avian species diversity, which may result in location-specific evolutionary pressures and thus locally adapted populations. Despite this, the morphology of most of its avian species has not been described. The aim of this study was to identify differences in the morphology of resident land birds on Grenada compared with other island and mainland areas. We collected morphological measurements of Bananaquits (Coereba flaveola), Black-faced Grassquits (Melanospiza bicolor), Lesser Antillean Bullfinches (Loxigilla noctis), and Common Ground Doves (Columbina passerina) in the field between 2015 and 2017, which we compared with data available from other locations (Venezuela and 23 other Caribbean islands) collated from academic papers and researchers. The morphology of Grenadian populations of our focal species differed from other islands in numerous ways; for example, Common Ground Doves had shorter wings and longer tarsi, and Bananaquits had longer tarsi, than most other populations. These characteristics are consistent with adaptations for increased generalist foraging on Grenada. Grenadian birds are significantly different morphologically from the majority of both insular and mainland conspecifics, emphasizing the need for further research and for the conservation and management of Grenada’s avian community. Keywords ecological release, Grenada, island biogeography, land birds, morphology Resumen Rasgos morfológicos de cuatro especies de aves terrestres en Granada • Granada es una isla del Caribe de origen volcánico y con una diversidad de especies de aves relativamente baja, lo que puede resultar en presiones evolutivas sitio-específicas y, por tanto, en poblaciones adaptadas localmente. A pesar de ello, no se ha descrito la morfología de la mayoría de sus especies de aves. El objetivo de este estudio fue identificar diferencias morfológicas en las aves terrestres residentes de Granada en comparación con otras áreas insulares y continentales. Recolectamos medidas morfológicas de Coereba flaveola, Melanospiza bicolor, Loxigilla noctis y Columbina passerina en el campo, entre 2015 y 2017; las cuales comparamos con los datos disponibles de otras localidades (Venezuela y otras 23 islas del Caribe), obtenidos a partir de artículos académicos e investigadores. La morfología de las poblaciones granadinas de las cuatro especies focales se diferenció de las de otras islas en numerosos aspectos; por ejemplo, individuos de Columbina passerina tuvieron alas más cortas y tarsos más largos y los de Coereba flaveola tarsos más largos, que la mayoría de las otras poblaciones. Estas características son consistentes con adaptaciones para un forrajeo más generalista en Granada. Las aves de esta isla difieren significativamente desde el punto de vista morfológico a de la mayoría de sus conespecíficos insulares y continentales, lo que subraya la necesidad de seguir investigando y de conservar y manejar la comunidad de aves de Granada. Palabras clave aves terrestres, biogeografía de islas, Granada, liberación ecológica, morfología Résumé Caractéristiques morphologiques de quatre espèces d’oiseaux terrestres à la Grenade • La Grenade est une île caribéenne d’origine volcanique dont l’avifaune présente une diversité relativement faible, ce qui peut entraîner des pressions évolutives spécifiques à cette île et donc des adaptations locales des populations. Malgré cela, la morphologie de la plupart de ses espèces d’oiseaux n’a jamais été décrite. Le but de la présente étude était d’identifier des différences morphologiques entre les oiseaux terrestres sédentaires de la Grenade et ceux d’autres zones insulaires ou continentales. De 2015 à 2017, nous avons collecté sur le terrain des mesures morphologiques sur le Sucrier à ventre jaune (Coereba flaveola), le Sporophile cici (Melanospiza bicolor), le Sporophile rouge-gorge (Loxigilla noctis), et la Colombe à queue noire (Columbina passerina), que nous avons ensuite comparées aux données pour d’autres lieux (Venezuela et 23 autres îles de la Caraïbe) disponibles dans des articles universitaires et des publications scientifiques. La morphologie des populations grenadiennes des espèces étudiées différait de celle des oiseaux des autres îles à de nombreux égards. Ainsi, comparativement à la plupart des autres populations, les Colombes à queue noire présentaient des ailes plus courtes et des tarses plus longs, et les Sucriers à ventre jaune des tarses plus longs. Ces caractéristiques sont cohérentes avec des adaptations pour une recherche de nourriture plus généraliste sur la Grenade. Les oiseaux de la Grenade sont significativement différents sur le plan morphologique de la plupart de leurs congénères insulaires et continentaux, ce qui souligne la nécessité de poursuivre les recherches et d’assurer la conservation et la gestion de l’avifaune de l’île. Mots clés biogéographie insulaire, Grenade, morphologie, oiseaux terrestres, relachement écologique

Selection of high feed quality timothy (Phleum pratense L.) would be facilitated by the identification of morphological traits associated with quality. The objectives of this study were: (1) to evaluate the presence of genetic variability for morphological traits; (2) to evaluate the relationship between morphological and quality traits; and (3) to measure the association between whole plant and stem and leaf quality. The phenotypic correlations obtained between morphological traits and quality appeared unstable from year to year for most associations. However, canonical analysis has indicated the possibility to select genotypes with high feed value based on yield, stem number, tillering area and height. Timothy genotype quality appeared to be limited mainly by stem quality. Some morphological traits appeared valuable to be used in an independent culling level selection scheme. Key words: Timothy, morphology, quality, Phleum

Soixante-dix villes historiques en évolution apparaissent sur la Liste du patrimoine mondial de l'UNESCO. Chacune fait ici l'objet d'une courte étude qui la situe dans le temps et l'espace, en identifie les principaux repères tout comme l'originalité historiques et en décrit les traits morphologiques urbains essentiels. Les critères justifiant l'inscription de ces villes, selon les recommandations du Comité international des monuments et des sites auprès du Comité du patrimoine mondial de l'UNESCO, accompagnent les études.

Depuis 1991, quelque 50 villes ont été ajoutées à la Liste des villes du patrimoine mondial qui en compte aujourd'hui 123. Chacune de ces villes fait ici l'objet d'une courte étude qui la situe dans le temps et l'espace, en identifie les principaux repères historiques et en décrit les traits morphologiques urbains essentiels. Sont également évoqués les critères justifiant l'inscription de ces villes, selon les recommandations du Conseil international des monuments et des sites auprès du Centre du patrimoine mondial de l'UNESCO.

En se basant sur une analyse préalable des quelques centaines de lexèmes, le présent article essaie d’identifier les marques pertinentes des traits morphosyntaxiques dans la flexion substantivale roumaine et d’établir leur conditionnement morphonologique. Après avoir présenté les cadres généraux de la flexion du type réalisationnel, l’article se concentre sur les allomorphes affixaux, les morphèmes superposés et les alternants du radical flexionnel pour pouvoir conclure que les marques morphologiques principales sont les auxiliaires et les postfixes, à côté des marques secondaires – les désinences et les alternants du radical. Les marques les plus conditionnées par le contexte morphonologique sont les désinences.

ABSTRACT. Variation of specific morphological traits and ploidy level of five Aegilops L. species in Morocco.The genus Aegilops L. represents an important natural source of useful genes for wheat breeding, with particular emphasis on biotic and abiotic stress resistance. For successful crosses, the primarily step is to select appropriate Aegilops accessions. In this paper, we studied five Moroccan species of an Aegilops collection on the basis of spike structure and chromosome number. Twenty-eight specific morphological characters were used to differentiate the species. Statistical analyses, in particular the DFA, allowed the characterization of the genetic variability of the species; the two first standardized axes explained 96,2% of the total variability and 100% of the entities were classified within their own group. In addition, the dendrogram constructed using morphological data reveals a significant variability within and between species. Cytogenetic study revealed four species, A. geniculata Roth, A. triuncialis L., A. ventricosa Tausch and A.peregrina Maire & Weiller, to be tetraploid. However, A. neglecta Req. ex. Bertol., where only two accessions are represented in the collection, revealed to be hexaploid, and can then be classified as A. neglecta subsp. recta Chennav.Key words. Aegilops, Variation, Morphology, Ploidy, Morocco.RÉSUMÉ. Variation des caracteres morphologiques specificities et niveau de plordie de an(' espéces Aegilops L. au Maroc. Le genre Aegilops L. représente une importante source de genes, potentiellement utilisables dans Pamelioration des blés cultivés (Triticum spp.) notamment pour la resistance aux stress biotiques et abiotiques. Le choix des accessions Aegilops á employer, dans un programme d' hybridation interspécifique, necessite une caractérisation taxonomique et une evaluation préalables. L'objectif de ce travail a ete d'étudier des accessions, appartenant á 5 especes marocaines constituant une collection d'Aegilops, sur la base de caracteres morphologiques specifiques de l'épi et du niveau de ploYdie. La caractérisation phénotypique a été basée sur l'étude de 28 caracteres morphologiques qui discriminent entre les especes. Les resultats des analyses statistiques, en particulier de l'AFD, ont permis de caractériser la variabilite génetique de ces especes et ant donne un pourcentage d'appartenance á l'espece de 100%. Aussi, les deux premiers axes standardises expliquent 96,2% de la variabilité totale. Un demlrogramme a éte aussi construit, revelant une variabilite interspecifique. L'étude cytogenétique a révélé une tetraploYdie pour A. geniculata Roth, A. triuncialis L., A. ventricosa Tausch et A. peregrina Maire & Weiller. Quant á A. neglecta Req. ex. Bertol., une hexaploYdie a été mise en evidence pour les deux uniques accessions disponibles dans la collection, permettant de leur attribuer le nom A. neglecta subsp. recta Chennav.Mots clés. Aegilops, Variation, Morphologic, Plolidie, Maroc.

Les interactions entre espèces sont un moteur d'évolution. Nous montrons ici quels sont les traits morphologiques et biochimiques du trolle d'Europe qui ont évolué au cours de sa spécialisation (Trollius europaeus) vis-à-vis des mouches pollinisatrices et prédatrices de graines (Chiastocheta spp. ). La forme globulaire de la fleur est décisive dans l'attraction spécifique des chiastochètes. En comparaison avec une forme artificiellement ouverte, les fleurs globulaires, bien que souffrant plus de la prédation produisent plus de graines (4%), mais surtout elles exportent plus de pollen (85%). Un modèle de dynamique adaptative montre que l'évolution de la forme globulaire requiert non seulement une efficacité minimale de la pollinisation par les chiastochètes, par rapport à des pollinisateurs alternatifs qui ne consomment pas de graines, mais également une efficacité maximale : si les chiastochètes sont « trop » efficaces, en attirer beaucoup plutôt que quelques uns ne confère pas d'avantage. L'attraction des pollinisateurs se fait également par des signaux olfactifs. Plusieurs composés volatils émis par le trolle déclenchent une réponse électrophysiologique chez les chiastochètes (methyl salicylate, Z-jasmone, b-caryophyllene, germacrene D, E,E-a-farnesene, linalool). Des observations de visites de chiastochètes en conditions naturelles ont montré que la variabilité des composés volatils présents dans les fleurs expliquait une part de la variabilité des visites reçues par ces fleurs, en comparaison avec des traits morphologiques et pigmentaires. Les interactions entre une plante et des prédateurs de graines sont conflictuelles : la plante à intérêt à soustraire les graines de l'appétit des larves. Un glycoside du flavonoïde lutéoline, l'adonivernith, s'accumule dans les parois des carpelles lorsque les dégâts causés par les larves augmentent, avec comme conséquence une baisse de l'intensité de prédation. Les six espèces du genre Chiastocheta étudiées induisent et réagissent différemment à l'adonivernith, cette molécule pourrait donc être impliquée dans la radiation sympatrique du genre. Les traits impliqués dans la spécialisation du trolle sur les chiastochètes sont donc à la fois mutualistes (morphologie globulaire et composés volatils de la fleur) et antagonistes (défense chimique contre les larves). Les contradictions de cette mosaïque de traits sont un moteur d'évolution
Interactions between species are a major driving force in evolution. We show here which morphological and biochemical traits evolved during the specialisation of the European globeflower (Trollius europaeus) on seed-eating pollinator flies (Chiastocheta spp). The globular shape is a key factor in the specific attraction of chiastochetes. Globular flowers produce more seeds (4%, they suffer higher predation but are better pollinated) and moreover export more pollen (85%) than artificially open flowers. An adaptive dynamics model shows that the evolution of the globular shape requires a minimal pollination efficiency by chiastochetes relatively to alternative pollinators that do not eat seeds, but also a maximal efficiency: if the chiastochetes are “too” efficient, to attract a lot of them rather than a few confers no advantage. The attraction of pollinators is also mediated by olfactive signals. Several volatile compounds emitted by the globeflower trigger an electrophysiological response in chiastochetes (methyl salicylate, Z-jasmone, β-caryophyllene, germacrene D, E,E-α-farnesene, linalool). Field behavioural observations of chiastochetes visits have shown that the variability of the volatile compounds inside the flowers explains a part of the variability of the visits, together with morphological and pigmentation traits. Interactions between plants and seed predators are conflictual: the plants tend to reduce predation costs. A flavonoid close to luteolin, adonivernith, accumulates in the carpel walls when the damages caused by the larvae increase, leading to a reduction of predation intensity. The six Chiastocheta studied species have different exploitation patterns in the fruit, they induce and are affected by adonivernith in specific ways : this chemical defence could be involved in the sympatric speciation of the genus. The traits involved in the globeflower specialisation on chiastochetes are simultaneously mutualistic (globular floral morphology, floral colour and volatile compounds) and antagonistic (chemical defence against the larvae). The contradictions of this trait mosaic are a factor of evolution

La formation des neurites constitue une étape cruciale dans le processus de différenciation neuronale. Cependant, les mécanismes qui permettent de déterminer comment et à quelle position les neurites émergent sont toujours largement méconnus. Nous avons postulé qu'une marque moléculaire pouvait préfigurer la différenciation morphologique. Au cours de ma thèse, j'ai cherché à identifier de nouvelles molécules capables de s'accumuler aux sites d'initiation des neurites et d'en contrôler la protrusion. De manière intéressante, chez la levure, la marque moléculaire qui contrôle le site de protrusion du bourgeon a été caractérisée. Parmi les centaines de protéines contrôlant le site d'initiation chez la levure, les Septines constituent une famille de protéines bien conservée chez les vertébrés. Ces GTPases forment des filaments qui agissent comme barrière de diffusion ou « échafaudage » moléculaire. Au cours de ma thèse, je me suis donc intéressée au rôle des Septines lors de l'initiation axonale dans le modèle des neurones sensoriels de DRG chez l'embryon de poulet. Nous avons pu démontrer qu'aux stades précoces de leur développement, ces neurones formaient deux axones, un au pôle ventral et l'autre au pôle dorsal, indiquant que le nombre et la position des sites d'initiation des axones sont bien contrôlés dans ces neurones. Nous avons, ensuite, démontré que les Septines étaient bien exprimées dans les DRG aux stades précoces du développement. Mes analyses en vidéo-microscopie de la localisation de la septine 7 au cours de la différentiation des neurones de DRG montrent que les Septines s'accumulent au site d'émergence de l'axone, juste avant ou lors de sa formation. L'inhibition des Septines induite par une construction dominant-négative (DN) ou par ajout d'un inhibiteur pharmacologique bloque la formation des axones. De plus, cette inhibition entraine une modification précoce de la morphologie, qui se traduit par l'apparition de cellules multipolaires complexes et de cellules rondes sans prolongement suggérant que, conformément à notre hypothèse, les Septines sont impliquées dans l'initiation des neurites. L'ensemble de ces résultats montre que les Septines régulent la différenciation morphologique précoce des neurones sensoriels
Neurite formation is a crucial step of neuronal differentiation. However, the mechanisms that determine how and at which position neurites emerge in the soma are still poorly understood. We postulated that a molecular polarity could prefigure the morphological differentiation, with some molecules that could accumulate at the future site of axon initiation. Interestingly, such molecular polarity has been evidenced in the contest of yeast budding, with bud forming at specific position relatively to the previous bud site. Genome-wide screen identified hundreds of proteins that control bud site location. Among the vertebrate molecules homologous to those involved in budding site selection, we selected the Septins as promising candidates. These GTP-ases form filaments that act as diffusion barriers and molecular scaffolds. We investigated the contribution of Septins to axon initiation using the chick dorsal root ganglion (DRG) neurons as a model. Monitoring of cell morphology in nascent ganglia indicates that DRG neurons form a single axon at the ventral pole and a second one at the dorsal pole and that these axons seem to emerge directly after their last division. This suggests that two initiation sites are selected at opposite pole of the soma.We found that Septins homologous with those controlling budding are expressed in the early DRG developmental stages. My analyses by time-lapse video-microscopy showed that Septin7 accumulate at the site of axon emergence, just before or during its formation.We observed that a pharmacological inhibitor and a dominant-negative construct block axon formation both in vitro and in vivo respectively. Furthermore, blocking Septin function leads to the appearance of uncommon round or sea urchin-like neurons. Thus, Septins appear to regulate early step of morphological differentiation of DRG neurons, possibly by controlling axon initiation site selection

Le changement climatique est l'un des phénomènes les plus pertinents pour les écosystèmes aujourd'hui. Bien que ce soit un phénomène complexe qui affecte pratiquement tous les aspects du climat, l'augmentation de la température se distingue comme l'un des aspects les plus importants en raison de son impact direct sur tous les niveaux d'organisation des organismes. Bien que pratiquement toutes les formes de vie subissent déjà les conséquences de cette augmentation de la température, les invertébrés, en particulier les insectes tels que les fourmis, sont particulièrement susceptibles. Étant donné qu'ils ne peuvent pas réguler directement leur température corporelle, ils dépendent de la température ambiante pour réguler leur métabolisme.Les fourmis, l'un des groupes les plus importants d'insectes, sont présentes dans presque tous les environnements terrestres, occupant diverses niches écologiques et jouant un rôle fondamental dans la génération de services écosystémiques. Comprendre comment l'augmentation des températures mondiales affecte les populations de fourmis est crucial pour comprendre les stratégies qu'elles utilisent pour faire face au changement climatique.L'une des activités les plus significatives des fourmis est la bioturbation, qui implique la mobilisation des particules du sol et la modification de ses propriétés. Cette activité confère aux fourmis le rôle d'ingénieures de l'écosystème, car leurs actions modifient, maintiennent et même génèrent des habitats tant pour elles-mêmes que pour d'autres organismes.Bien que l'approche classique pour analyser la résistance à la température chez les fourmis se base sur la température critique maximale (CTmax), cette méthode se concentre uniquement sur les adaptations physiologiques sans tenir compte d'autres facteurs importants dans la détermination de la résistance. Cette thèse avait par objectif analyser la réponse des fourmis à l'augmentation de la température dans différents environnements, en observant des aspects cruciaux de leur biologie à plusieurs niveaux d'organisation.Au niveau de l'organisme, j'ai exploré la relation entre la CTmax et certains traits morphologiques fonctionnels dans des populations de divers environnements. J'ai étudié si le polymorphisme conférait un avantage en termes de résistance à la température. À l'échelle de la colonie, je me suis intéressé aux effets de différentes températures en surface et leurs impacts sur l'architecture des nids souterrains et le développement de la colonie dans une espèce d'environnement tempéré. Enfin, au niveau de la communauté, j'ai étudié la manière dont différentes conditions abiotiques, y compris l'humidité, modifient l'abondance, la richesse et la structure d'une communauté de fourmis dans un environnement tempéré, et comment cela se répercute sur leur activité de bioturbation.Cette approche intégrale a permis de développer un modèle d'analyse de la résistance à la température qui, autant que je le sache, n'a pas été proposé auparavant. Dans ce modèle, il est proposé que la résistance à la température, évaluée par la CTmax et/ou des traits morphologiques en tant qu'indicateurs, dépend de la capacité bioturbatrice et de la résilience de l'habitat. Selon ce modèle, les fourmis pourront maintenir leur résistance actuelle en augmentant leur activité bioturbatrice, en adaptant les nids aux températures lorsque l'environnement le permet. Cependant, cette capacité est limitée par la résilience du milieu, car on s'attend à ce que les environnements tempérés offrent davantage de niches potentielles pour les fourmis, tandis que dans les environnements xériques, les niches pourraient être encore plus rares qu'actuellement
Climate change is one of the most relevant phenomena for biodiversity today. Although it is a complex phenomenon that affects practically all aspects of the climate, the increase in temperature stands out as one of the most important aspects due to its direct impact on all levels of organism organization. Despite virtually all forms of life already experiencing the consequences of this temperature increase, invertebrates, especially insects such as ants, are particularly susceptible. Since they cannot directly regulate their body temperature, they depend on ambient temperature to regulate their metabolism.Ants, being one of the most important groups of insects, are present in almost all terrestrial environments, occupying various ecological niches and playing a fundamental role in generating ecosystem services. Understanding how the increase in global temperatures affects ant populations is crucial to comprehend the strategies they use to cope with climate change.One of the most significant activities of ants is bioturbation, involving the mobilization of soil particles and the modification of its properties. This activity gives ants the role of ecosystem engineers, as their actions modify, maintain, and even generate habitats for themselves and other organisms.Although the classical approach to analysing temperature resistance in ants relies on the analysis of the Critical Thermal Maximum (CTmax), this method focuses solely on physiological adaptations without considering other important factors in determining resistance. This thesis aimed to analyse the response of ants to temperature increase in different environments, observing crucial aspects of their biology at various levels of organization.At the organism level, I explored the relationship between CTmax and some morphological functional traits in populations from diverse environments. I investigated whether polymorphism conferred any advantage in terms of temperature resistance. At the colony scale, I examined the effects of different temperatures on the surface and their impacts on the architecture of underground nests and colony development in a species from a temperate environment. Finally, at the community level, I focused on how abiotic conditions, including humidity, modify the abundance, richness, and structure of an ant community in a temperate environment, and how this affects their bioturbation activity.This comprehensive approach allowed for the development of a model for analysing temperature resistance that, to the best of my knowledge, has not been proposed before. In this model, I suggest that temperature resistance, assessed by CTmax and/or morphological traits as indicators, depends on bioturbation capacity of ants and habitat resilience. According to this model, ants may maintain their current resistance by increasing their bioturbation activity, adapting nests to temperatures when the environment allows it. However, this capacity is limited by habitat resilience, as temperate environments are expected to offer more potential niches for ants, while in xeric environments, niches could be even scarcer than they are currently under increased temperatures

La phénoplasticité est un élément important du métabolisme, du développement et de l'évolution des plantes au sein de leur environnement. L'objectif de cette thèse a consisté à mieux comprendre sa signification écologique et son rôle dans la compétitivité des hydrophytes et en particulier de Ranunculus peltatus, espèce localement proliférante. Ses adaptations ont été étudiées en fonction de stress en nutriments, en lumière et de perturbations par des études in situ, en laboratoire et d'une approche de modélisation. R. Peltatus adapte ses traits biologiques selon des gradients de stress et de perturbation selon différents patrons d'allocations de ressources. Une étude plus précise des facteurs environnementaux influant cette plasticité a montré que R. Peltatus s'adapte rapidement à des variations d'ombrage et de profondeur d'eau par des modifications morphologiques classiques. Des adaptations essentiellement physiologiques sont mises en place face à la réduction de la quantité de nutriments. Vis-à-vis d'une perturbation (coupe), des ajustements plastiques s'observent au niveau des types de régénération. L'approche de modélisation a permis d'expliquer de manière mécanistique certains schémas adaptatifs écophysiologiques observés expérimentalement. Elle constitue également une première étape dans l'évaluation des coûts et bénéfices de chaque adaptation physiologique. La plasticité adaptative accroît ainsi la compétitivité de R. Peltatus et sa capacité à coloniser et à s'adapter à de nouveaux sites. L'intérêt compétitif de la plasticité est d'autant plus important qu'elle est liée à une combinaison de traits adaptée et que son amplitude et son dynamisme sont élevés
Phenotypic plasticity is an important aspect of how plants develop, function and evolve in their environments. This thesis aimed at investigating the ecological significance of plasticity in hydrophytes and analysing its influence on plant competitiveness. We selected, as a study model, Ranunculus peltatus Schrank, well-known for its high plasticity. Its adaptations to nutrient or light stress and to disturbances were analysed through in situ, laboratory and semi-controlled experiments and a modelling approach. The following results were highlighted: R. Peltatus adapted its biological traits according to stress and disturbance via different resource allocation patterns. R. Peltatus rapidly adjusted its morphology in response to variations in shade and water depth following classical adaptive patterns. Adaptations developed in response to nutrient stress were essentially physiological and consisted mainly in the increase of nutrient uptake and nutrient-use efficiency in stressful conditions. With respect to disturbance, R. Peltatus regeneration types were plastic. Mechanistic modelisation was used to simulate and improve the understanding of adaptative patterns highlighted experimentally. This approach constituted a first step in the evaluation of costs and benefits of a physiological adaptation in response to environmental stress. Hence, adaptive plasticity favours R. Peltatus competitiveness and its ability to colonise and adapt to new sites. A large number of hydrophytes possesses this capacity. Its competitive interests is therefore essentially dependent on the plant combination of traits and on the amplitude and dynamic of their plastic adjustments

La consanguinité peut générer d'importants effets négatifs en diminuant l'aptitude phénotypique des individus consanguins. Dans de petites populations isolées, les événements de consanguinité devraient être davantage fréquents. Cependant, l'étude de la consanguinité en nature est rare, car peu d'études ont la possibilité de documenter les liens de parenté de façon précise. L'étude à long terme portant sur le mouflon d'Amérique (Ovis canadensis) à Ram Mountain, Alberta, nous a permis d'établir le pedigree et de calculer le coefficient de consanguinité (f ) des agneaux et d'avoir différentes mesures liées à la masse corporelle et à la survie des individus. Également, la population a subi un déclin majeur dans les dernières années dû d'abord à des effets de densité-dépendance et par la suite à une forte prédation par le couguar. Quoique ces facteurs ne soient plus présents dans la population, elle demeure toujours à une faible taille, entre 15 et 23 femelles matures. Il est donc important d'établir si la consanguinité est en cause dans le maintien de ce faible effectif pour mieux gérer et protéger la population. Mon étude avait trois objectifs principaux. Premièrement, je voulais quantifier l'occurrence de la consanguinité dans la population au fil des années (de 1988 à 2008) et en fonction de sa taille. Puis, je voulais quantifier les effets de la consanguinité sur la masse des individus, leur date de naissance et leur survie pour évaluer l'importance de la dépression consanguine dans la population. Finalement, je voulais déterminer si les mouflons ont développé des mécanismes d'évitement de la consanguinité. Mes analyses ont révélé que le coefficient moyen de consanguinité des agneaux a augmenté avec une baisse de la taille de la population. Plus particulièrement, le nombre de mâles âgés de 5 ans et plus dans la population semblait être fortement corrélé avec la consanguinité.La consanguinité n'avait aucun effet sur la masse des agneaux, que ce soit au mois de juin ou septembre, sur le gain en masse et sur la date de naissance. Par contre, elle avait un effet majeur sur la survie hivernale des agneaux femelles, mais pas chez les mâles. Pour avoir la même probabilité de survie que les femelles non-consanguines, les consanguines devaient avoir une masse à la mi-septembre 50% plus élevée. Également, les agneaux femelles consanguins étaient significativement plus lourds au mois de septembre que les non-consanguins. Cette même tendance se répétait pour les femelles âgées d'un an au mois de juin. Une explication possible à ces observations est que les agneaux consanguins très légers sont morts avant d'être échantillonnés. Ces résultats permettent de mieux comprendre pourquoi la dépression consanguine est plus difficilement détectable à des stades de vie plus vieux et pourquoi il est parfois difficile d'établir des corrélations entre des mesures de génétique et la valeur de divers traits. Par exemple, si les pressions de sélection sont plus fortes pour les individus consanguins, des individus homozygotes peuvent avoir une masse plus élevée que des individus hétérozygotes. Puis, j'ai calculé un coefficient moyen de consanguinité à chaque année en simulant des accouplements aléatoires afin de voir si les accouplements entre individus apparentés survenaient moins souvent qu'aléatoirement. Le coefficient simulé n'était pas significativement différent de celui observé dans la population. Également, les mouflons n'évitaient pas les accouplements avec des individus hautement apparentés. Deux explications sont possibles : les mouflons ne semblent pas avoir développé des mécanismes d'évitement de la consanguinité ou, étant donné le faible nombre de partenaires potentiels, ils sont contraints à se reproduire avec des individus apparentés.La première explication semble plus probable étant donné le mode d'appariement polygyne du mouflon qui favorise à la base les événements de consanguinité, le coût de la consanguinité sur la survie seulement chez les femelles et non chez les mâles, la faible fréquence des rencontres avec un individu hautement apparenté et la migration lors du rut qui a été observée dans d'autres populations de mouflon non isolées qui permettrait l'évitement de la consanguinité. Tous ces résultats sont importants pour deux raisons. Premièrement, pour mieux comprendre le phénomène de la consanguinité. Deuxièmement, ils sont importants dans une optique de conservation des populations surtout considérant que, dans les dernières années, les taux de survie ont été très faibles dans la population à l'étude ce qui a entraîné une chute drastique de sa taille. Les résultats sont également potentiellement applicables aux populations qui subissent un déclin drastique suite à la destruction ou à la fragmentation des habitats, un scénario souvent observé de nos jours par exemple par la déforestation ou la construction de routes.

L’objectif de cette thèse est de proposer une démarche pour identifier des plantes de service (Pds) utilisables en couverture vivante pour contrôler les adventices en bananeraie. Nous avons d’abord quantifié les effets de compétition réciproque entre le bananier et une couverture contrôlée par fauchage pour Brachiaria decumbens et Cynodon dactylon. Ces couverts ont eu des effets dépressifs sur la nutrition azotée du bananier et la productivité en premier cycle, le second cycle n’étant pas affecté. Dans un deuxième temps nous avons caractérisé au champ, en plantes isolées, la croissance en biomasse de huit légumineuses candidates sous différentes intensités lumineuses. En conditions lumineuses non limitantes, chaque espèce répondait à une dynamique exponentielle, définie par la biomasse 14 jours après semis et le taux de croissance relative (RGR). En conditions d’ombrage limitant, le RGR est réduit et le rapport surface foliaire sur biomasse aérienne croît. Ces réponses permettent de définir quatre stratégies d’adaptation à l’ombrage et d’identifier les Pds adaptées sous bananeraie. Pour trois de ces espèces, sur la base de la réponse de l’efficience photosynthétique, nous proposons un modèle de croissance en fonction de la ressource lumineuse. En peuplement, en présence d’adventices, aucune espèce évaluée n’a pu contrôler les grandes graminées, Stylosanthes guianensis et Centrosema pascuorum ont cependant réduit la biomasse des autres adventices de 60%. En bananeraie, les deux espèces évaluées ont exercé un contrôle sur les adventices mais ont réduit la productivité du premier cycle. Pour autant, ces résultats sont encourageants pour l’utilisation de Pds en bananeraie à des fins de contrôle des adventices
The objective of this PhD thesis was to provide an approach to identify suitable cover crops (Pds) for weed control use in banana plantations. Firstly, we quantified the reciprocal effects between the banana crop and a grass cover controlled by mowing, for Brachiaria decumbens or Cynodon dactylon. These cover crops have had similar depressive effects on the nitrogen nutrition and on the productivity of the first cycle, but not afterward during the second cycle. Second step, we carried out a field characterization of eight legume cover crops, on isolated plants, under a range of light intensity. In non-limited light growth conditions, the biomass growth corresponded to an exponential dynamic, mathematically defined for each species by the biomass 14 days after sowing, and the relative growth rate (RGR). When affected by the shade, the RGR was reduced and the ratio between Leaf area and aerial plant biomass increased. We defined four adaptive strategies of the cover crops to the shade, what constitute criteria guidelines for cover crop use in banana cropping systems. For three of these species, on the basis of the response of the radiation use efficiency, we are proposing a plant growth model without any limiting factor other than light resource. In stands with the presence of weeds, neither of this cover crops was able to control the tall gramineous, but Stylosanthes guianensis and Centrosema pascuorum reduced the biomass of other weeds by 60%. Finally, in banana plantations, the two evaluated species provided a control of the weeds but reduced the productivity of the first cycle. Our results are comforting for the use of cover crops in banana plantation as a mean for weed control

Au cours des dernières décennies, le nombre de mares a connu un déclin de plus de 50 % dans les pays européens, atteignant parfois jusqu'à 90 % dans certaines régions. Cette diminution a entraîné une forte perte de connectivité entre les mares. Pourtant, ces écosystèmes petits et dispersés sont essentiels au cycle de vie d'une grande diversité d'espèces d'eau douce. Les politiques d'aménagement du territoire, comme la création des Trames Vertes et Bleues en France, visent à améliorer les continuités écologiques pour permettre le maintien des populations existantes et les échanges entre elles. Cependant, les études de connectivité entre les mares doivent prendre en compte les capacités de dispersion des espèces et cette information fait souvent défaut pour orienter les mesures de restauration. Dans le présent travail, nous avons étudié les capacités de dispersion des libellules à plusieurs échelles spatiales ainsi que les caractéristiques biologiques et les facteurs environnementaux qui façonnent leurs mouvements. Dans la première partie, nous avons évalué la colonisation par les libellules de 20 mares normandes pendant les trois années suivant leur création ou leur restauration. Les résultats mettent en évidence des taux de colonisation élevés pendant la première année et aucune différence de richesse spécifique n'a été constatée entre les mares nouvellement créées ou restaurées. Cela suggère que la restauration des mares après un assèchement total ne devrait pas toujours être prioritaire par rapport à la création de nouvelles mares dans les stratégies de gestion. Nous avons constaté que les espèces généralistes étaient davantage présentes la première année après la création ou la restauration des mares, alors que la présence d’espèces spécialistes des forêts augmentait avec l'âge du plan d’eau. Les résultats ont également mis en évidence que le contexte paysager autour des mares (i.e. milieu forestier ou ouvert) avait un effet sur la composition des communautés de libellules. Enfin, l'abondance totale des espèces d'odonates était liée à la densité des plans d’eau alentours. Ce résultat souligne que les mares très connectées peuvent abriter des populations plus importantes que les mares isolées et donc être plus résistantes aux perturbations. La deuxième partie fournit des éléments sur le développement larvaire d'Anax imperator et la relation entre les caractéristiques morphologiques des larves et des adultes. Les résultats suggèrent que la survie de cette espèce pendant la période de maturation pourrait dépendre de la longueur des individus. Nous avons également essayé d'étudier la dispersion natale en marquant 87 individus à l'émergence, mais seuls deux mâles ont été retrouvés après la période de maturation. Enfin, l'effet de deux polluants de l'eau (Round-up et DEET) sur le développement larvaire et les adultes d'Aeshna cyanea a également été étudié à différentes concentrations. Les larves ont été élevées dans des conditions de laboratoire et exposées à des concentrations allant jusqu'à 30 mg.L-1 des deux polluants. Aucun effet des polluants sur les conditions morphologiques des larves ou des ténéraux n'a été détecté, ce qui suggère que A. cyanea est une espèce tolérante aux potentielles pollutions de l'eau dans les mares. Le niveau de la protéine de stress HSP70 était également similaire selon les différents traitements, mais les adultes ténéraux présentaient des niveaux de stress plus élevés que les larves, ce qui suggère que l'émergence a provoqué un stress élevé chez les individus
During the last decades, the number of ponds decreased by more than 50 % in European countries, occasionally reaching up to 90 % in some regions. Their decline in number has led to a strong loss of connectivity between waterbodies. Yet, these small and scattered ecosystems are essential for the life cycle of a high diversity of freshwater species. Land use policies like the creation of Greenways and Blueways in France aim to improve ecological continuities to allow maintenance of existent biological populations and exchanges between them. However, the connectivity between ponds must be considered according to the dispersal abilities of freshwater species and this information often lacks to guide restoration measures. In the present work, we studied the dispersal abilities of dragonflies on several spatial scales and investigated the biological traits and environmental factors that shaped their movements. In the first part, we evaluated the colonization of 20 ponds in Normandy by dragonflies during three years after pond restoration or pond creation. The results highlight high colonization rates during the first year and no difference in species richness was found between newly created or restored ponds. This suggests that restoration of ponds after complete drought should not always be prioritized over pond creation in management strategies. We found that generalist species were more present in the first year after pond creation or restoration, whereas the occurrence of forest specialists increased with the age of the pond. The results also highlighted that the landscape context around ponds (i.e. forest vs. open lands) had an effect on the composition of dragonfly communities. Finally, the total abundance of odonate species was related to the density of other ponds in the surroundings. This result emphasizes that highly connected ponds can support larger populations than isolated ones and thus, be more resilient to perturbations. The second part provides insights into the larval development of Anax imperator and the relationship between morphological traits of larvae and adults. The results suggest that the survival of this species might depend on its body length during the maturation period. We also tried to study the natal dispersal by marking 87 individuals at emergence, but only two males were resighted after the maturation period. Finally, the effect of two water pollutants (i.e. Round-up and DEET) at different concentrations was also investigated on the larval development and adults of Aeshna cyanea. Larvae were reared under laboratory conditions and exposed to concentrations up to 30 mg.L-1 of the two pollutants. No effect of the pollutants was detected on the morphological conditions of larvae or tenerals, suggesting that A. cyanea is tolerant to potential water pollution of ponds. The level of HSP70 stress protein was also similar according to the different treatments, but teneral adults presented higher levels of stress than larvae, suggesting that emergence induced a high stress in the individuals. The third part focuses on the dispersal of A. imperator. We first assessed the local movements within a pond network in the Normandy region

La biodiversité est un concept à multiples facettes qui comprend trois composantes principales, à savoir la diversité taxonomique, phylogénétique et fonctionnelle. Les études biogéographiques ont jusqu'à présent accordé plus d'attention aux deux premières facettes tandis que les déterminants de la diversité fonctionnelle et ses changements sous l'effet de l'anthropisation restent largement inconnus à l'échelle du globe. Ces lacunes sont particulièrement importantes pour les poissons d'eau douce, car ils représentent non seulement un quart des vertébrés et soutiennent le fonctionnement et la stabilité des écosystèmes, mais sont également l'un des groupes de vertébrés les plus menacés au monde. Ainsi, l'objectif de cette thèse est d'améliorer la compréhension de la diversité fonctionnelle des poissons d'eau douce du globe et de combler le fossé entre les facettes taxonomiques, fonctionnelles et phylogénétiques pour évaluer les impacts des activités humaines sur la biodiversité des poissons d'eau douce. Dans ce but, nous avons d'abord construit une base de données de traits décrivant la morphologie de 10 600 espèces présentes dans plus de 2 400 bassins fluviaux dans les six royaumes terrestres. Nous avons d'abord testé les distributions des traits morphologiques des poissons dans chaque zone biogéographique Nous avons montré que les traits morphologiques des poissons sont i) très variés à travers le globe et ii) que la distribution de ces traits est diffère entre zones biogéographiques. Cependant, les espèces morphologiquement extrêmes occupent la plus grande partie de l'espace morphologique dans toutes les zones biogéographiques. De plus, en utilisant une approche multi-traits à l'échelle du bassin versant, nous avons constaté que la diversité fonctionnelle historique a été façonnée par des variables liées à l'habitat, à l'énergie et à l'histoire. Nous avons également démontré que la morphologie diffère entre les espèces qui n'ont jamais été introduites et celles qui ont été introduites et celles qui se sont même établies. Enfin, nous avons réalisé une approche holistique en proposant un nouvel indice cumulatif combinant les changements dans les six principales facettes de la biodiversité pour évaluer les impacts des activités humaines sur la biodiversité des poissons. Nous avons constaté que les activités humaines ont considérablement affecté la biodiversité des poissons dans plus de la moitié des fleuves mondiaux (52,8%, 1 297 bassins versants). Parmi ces cours d'eau, les zones tempérées sont les plus affectées par les changements de biodiversité, et les changements de biodiversité sont principalement dus à des altérations de la connectivité de l'eau et à l'introduction d'espèces non indigènes. Ce travail a souligné le potentiel des caractéristiques morphologiques dans l'étude de la diversité fonctionnelle mondiale des poissons d'eau douce, et le indice de changement de la biodiversité à multiples facettes donnera ici ouvre de nouvelles implications pour la conservation de la biodiversité
Biodiversity is a multifaceted concept that includes three main components, namely taxonomic, phylogenetic and functional diversity. Biogeographical studies have paid more attention to the first two facets while the patterns and drivers of functional diversity and their changes because of global change remains largely unknown at the global scale. These knowledge gaps are especially large for freshwater fishes, because they not only account for a quarter of vertebrates and support the functioning and stability of ecosystems, but are also one the most threatened vertebrates groups in the world. Thus this thesis aims to improve the understanding of the functional diversity of global freshwater fishes and bridge the gap between taxonomic, functional and phylogenetic facets to evaluate the impacts of human activities on the multifaceted biodiversity of global fishes. Towards this aim, we first built a trait database describing the morphology of 10 600 species occurring in over 2 400 river basins all over the six terrestrial realms. First, we assessed the distributions of the morphological traits within the fauna of each realm. We revealed that fish morphological traits are different between realms and that morphologically extreme species are distributed in all realms. Second, using a multi-traits approach at the basin scale we found that the historical functional diversities have been shaped by habitat, energy and history-related variables. Third, we demonstrated that morphology differs between species that have never been introduced species and those that were introduced and those that were even established. Last, using a novel cumulative index combining changes in six facets of biodiversity we found that human activities have markedly affected fish biodiversity in more than half of the world river (52.8%, 1 297 rivers). Those biodiversity changes were primarily due to alterations of water connectivity and introductions of non-native species. This work underlined the potential of morphological features in the study of global freshwater fish functional diversity, and the combination of functional phylogenetic and taxonomic features in a novel multifaceted biodiversity change index will constitute a useful tool for biological conservation

L'ubiquisme des diatomées et leur diversité taxonomique a favorisé l'utilisation croissante de ces algues pour l'évaluation des conditions environnementales en eaux douces. La contamination métallique qui affecte certains cours d'eau peut conduire à des modifications de la structure des communautés et de la morphologie des individus. Dans ces travaux, les caractéristiques des biofilms périphytiques ont été étudiées sur le terrain (bassin versant du Riou-Mort, Sud-Ouest de la France) et en conditions expérimentales. La présence de métaux (ici : cadmium, zinc) induit non seulement un remplacement des espèces sensibles (Cyclotella meneghiniana, Navicula gregaria, Navicula veneta) par des espèces plus tolérantes (notamment Eolimna minima), mais également une diminution de la taille de certains individus et / ou l'apparition d'anomalies morphologiques affectant de nombreuses espèces. Le rôle structurant d'autres facteurs abiotiques sur les communautés diatomiques a de plus été souligné, particulièrement celui de la présence de nutriments en concentrations élevées qui stimule la production de biomasse et modifie la structure des assemblages au profit d'espèces saprophiles. L'action protectrice de la matrice organique vis-à-vis des contaminants métalliques a également été confirmée au travers de ces travaux. La pertinence de l'utilisation des diatomées pour la bioindication des pollutions métalliques a été validée, et ces études fournissent une base à l'élaboration d'un indice diatomique de pollution métallique probable.

Les conséquences des flux de gènes et de l'introgression entre les cultures transgéniques et leurs apparentés sauvages sont encore au cœur des débats associés à la commercialisation des plantes génétiquement modifiées. J'ai développé mon étude sur les conséquences écologiques et évolutives du flux de gènes entre le colza (Brassica napus) et ses apparentés, la moutarde brune sauvage (B. juncea) et la ravenelle (Raphanus raphanistrum), en réalisant une série d'expériences en serre, au jardin et au champ à Beijing et à Dijon. En premier, j'ai présenté une revue synthétique de la littérature publiée sur les flux de gènes et ses effets sur la fitness chez les Brassicées. En second, j'ai cherché à mettre en évidence le rôle de la taille des semences hybrides entre du colza transgénique Bt et la moutarde. La petite taille des semences a réduit les capacités de croissance et de reproduction, mais l'effet sur la fitness était variable en fonction des fonds génétiques ou spécifiques. Les rétrocroisements sur le colza étaient plus faciles et productifs que pour les autres types de descendants. La plupart de ces plantes avait une morphologie de colza. Liée à la résistance à l'herbicide, cette caractéristique pourrait permettre aux descendants de survivre dans les champs et de disséminer les transgènes aux repousses et aux autres colzas, ce qui serait peut être plus gênant que de voir l'introgression réelle dans le génome du parent sauvage. Troisièmement, j'ai simulé le phénomène d'herbivorie chez la moutarde pour étudier la compétition entre des plantes résistantes et des plantes sensibles indépendamment des problèmes de fitness des hybrides interspécifiques. Les plantes résistantes ont un avantage compétitif évident sous la pression d'herbivorie, et cet avantage est exacerbé sous des conditions difficiles telles que de faibles ressources du milieu et l'intensité de l'herbivorie. L'utilisation d'insectes pour attaquer des populations mixtes composées de rétrocroisements sensibles et Bt-résistants aux insectes a confirmé ce résultat et a montré que le transgène n'avait pas de coût en l'absence d'insectes. La productivité totale des populations a augmenté avec la proportion de plantes résistantes. Quatrièmement, des populations de ravenelles ont été échantillonnées dans quatre régions éloignées entre elles, dont une ayant une longue histoire de coexistence avec le colza et donc ayant plus de chance d'avoir été soumise à l'hybridation interspécifique avec le colza. J'ai interprété la divergence des traits et leur polymorphisme dans le cadre d'une hypothèse d'introgression stabilisée en opposition au simple hasard, bien que les différences avec les autres populations n'étaient pas assez marquées pour faire sortir ces populations du domaine de variation décrit pour les ravenelles. Ces études soulignent plusieurs facteurs qui peuvent accroître le risque des flux de transgènes et l'introgression entre les cultures génétiquement modifiées et leurs apparentés sauvages, et cela doit être pris en compte dans les procédures d'évaluation des risques de l'usage de ces plantes. A savoir : la morphologie cultivée qui rend confuse l'identification des introgressants dans le cadre de la bio-surveillance, les petites semences hybrides avec une dormance et une dispersion supérieures, et l'intensité de l'herbivorie et de la compétition qui exacerbe l'avantage adaptatif des plantes transgéniques résistantes aux insectes. Cependant, l'hypothèse de la formation de " super mauvaises herbes " ne semble pas justifiée.

Le milieu souterrain comprend des vides de toute taille dans lesquels la vie peut se développer dans des conditions aphotiques, souvent déconnectées des fluctuations saisonnières et largement oligotrophes. Une faible proportion d'organismes vivants a pu évoluer et s'adapter à de telles conditions. Certains d'entre eux sont devenus strictement dépendants de cet environnement hostile, au prix d'un ensemble d'adaptations biologiques profondes. Leurs adaptations physiologiques, biologiques et morphologiques ont convergé vers une réduction drastique de la capacité de dispersion et du flux génique entre les populations. Combinés à l'extrême fragmentation de nombreux habitats souterrains, ces traits font de la faune souterraine un modèle particulièrement intéressant par rapport à la faune de surface pour explorer l'impact de la fragmentation de l'habitat sur la spéciation, la diversification et les radiations évolutives, en particulier pour définir et dater les barrières à la dispersion sur la base de preuves géologiques et hydrogéologiques.

Le langage littéraire présente un excellent potentiel pour ennoblir des formes autrefois stigmatisées. La pleine exploitation de ce potentiel dépend de plusieurs facteurs : de la nature des traits choisis, de leur mode d’utilisation et de leur fréquence. Le présent article se penche sur la question de savoir dans quelle mesure la littérature africaine francophone en profite. Il met en évidence une nette différence entre le traitement des caractéristiques phonétiques et morphologiques d’une part, et lexicales de l’autre. Alors que les premières sont en grande majorité utilisées pour ridiculiser des personnages simples, ce qui est parfois encore mis en relief par l’ajout de commentaires explicites, les particularités lexicales sont employées suivant un programme plus varié, qui va d’une utilisation tout-à-fait naturelle à un marquage explicatif qui s’appuie sur des remarques métalinguistiques dans le texte, en note ou dans un glossaire, en passant par un marquage typographique (italiques, caractères gras ou guillemets). Ce type de traitement s’avère nettement plus positif que les commentaires plutôt stigmatisants concernant la phonétique et la morphosyntaxe locales. Le lexique local profitent donc d’un support littéraire plus fort, comparé à la prononciation et la grammaire. Ce support reste cependant faible, vu la basse fréquence totale du lexique spécifique dans les textes étudiés.

Dans ce chapitre, nous nous concentrons sur le problème de la détection non supervisée de changements dans les images multitemporelles multispectrales. En particulier, nous examinons et analysons la représentation des changements spectraux-spatiaux pour traiter le problème important de la détection multiclasse de changements. À cette fin, deux approches sont développées, à savoir une analyse morphologique multi-échelles de vecteurs de changements compressés et une détection multi-classes au niveau des superpixels.

Cette étude porte sur une des innovations contemporaines liées à l’économie de la publication scientifique : les accords dits transformants, un objet relativement circonscrit au sein des relations entre consortiums de bibliothèques et éditeurs scientifiques, et temporellement situé entre 2015 et 2020. Ce type d’accords a pour objectif affiché d’organiser la transition du modèle traditionnel de l’abonnement à des revues (souvent proposées par regroupements thématiques ou collections) vers celui de l’accès ouvert en opérant une réaffectation des budgets qui y sont consacrés. Notre travail d’analyse sociologique constitue une première étude systématique de cet objet, fondée sur la recension de 197 accords. Le corpus ainsi constitué inclut des accords caractérisés par la coprésence d’une composante d’abonnement et d’une composante de publication en accès ouvert, même minimale (« jetons » de publication offerts, réduction sur les APC...). En conséquence, ont été exclus de l’analyse les accords portant uniquement sur du financement centralisé de publication en accès ouvert, que ce soit avec des éditeurs ne proposant que des revues avec paiement par l’auteur (PLOS, Frontiers, MDPI...) ou des éditeurs dont une partie du catalogue est constitué de revues en accès ouvert. L’accord le plus ancien de notre corpus a été signé en 2010, les plus récents en 2020 – les accords ne commençant qu’en 2021, même annoncés au cours de l’étude, n’ont pas été retenus. Plusieurs résultats se dégagent de notre analyse. Tout d’abord, on note une grande diversité des acteurs impliqués avec 22 pays et 39 éditeurs, même si certains consortiums (Pays-Bas, Suède, Autriche, Allemagne) et éditeurs (CUP, Elsevier, RSC, Springer) en ont signé beaucoup plus que d’autres. Ensuite, la durée des accords, comprise entre une et six années, révèle une distribution très inégalitaire, avec plus de la moitié des accords (103) signés pour 3 ans, ainsi qu’une faible proportion pour 4 ans ou plus (22 accords). Enfin, en dépit d’appels répétés à la transparence, moins de la moitié des accords (96) ont un texte accessible au moment de cette étude, sans qu’on puisse observer une tendance récente à une plus grande disponibilité. L’analyse montre également des degrés d’ouverture très variables, allant d’une simple information sur le répertoire ESAC en passant par la mise à disposition d’un format annotable jusqu’à l’attribution d’un DOI et d’une licence de réutilisation (CC-BY), en incluant le détail des sommes monétaires. Parmi les 96 accords disponibles, dont 47 signés en 2020, 62 ont fait l’objet d’une analyse en profondeur. C’est à notre connaissance la première analyse à cette échelle, sur un type de matériel non seulement inédit, mais qui était auparavant soumis à des clauses de confidentialité. Fondée sur une lecture minutieuse, l’étude décrit de manière fine leurs propriétés, depuis la matérialité du document jusqu’aux formules financières, en passant par leur morphologie et l’ensemble des droits et devoirs des parties. Les contenus des accords sont donc analysés comme une collection dont nous cherchons à déterminer les points communs et les variations, à travers des codages explicites sur certaines de leurs caractéristiques. L’étude pointe également des incertitudes, et notamment leur caractère « transitionnel », qui demeure fortement discuté. D’un point de vue morphologique, les accords montrent une grande diversité en matière de taille (de 7 à 488 pages) et de structure. Néanmoins, par définition, ils articulent tous deux objets essentiels : d’une part, les conditions de réalisation d’une lecture d’articles de revues, sous forme d’abonnement, mêlant des préoccupations d’accès et de sécurité ; d’autre part, les modalités de publication en accès ouvert, articulant la gestion d’un nouveau type de workflow à toute une série d’options possibles. Parmi ces options, mentionnons notamment le périmètre des revues considérées (hybrides et/ou accès ouvert), les licences disponibles, le degré d’obligation de cette publication, les auteurs éligibles ou le volume d’articles publiables. L’un des résultats les plus importants de cette analyse approfondie est la mise au jour d’un découplage presque complet, au sein même des accords, entre l’objet abonnement et l’objet publication. Bien entendu, l’abonnement est systématiquement configuré dans un monde fermé, soumis à paiement qui déclenche des séries d’identification des circulations légitimes tant du contenu informationnel que des usagers. Il insiste notamment sur les interdictions de réutilisation ou même de copie des articles scientifiques. À l’opposé, la publication en accès ouvert est attachée à un monde régi par l’accès gratuit au contenu, ce qui induit des préoccupations de gestion du workflow et des modalités d’accessibilité. De plus, les différents éléments constitutifs de ces objets contractuels ne sont pas couplés : d’un côté, les lecteurs sont constitués de l’ensemble des membres des institutions abonnées, de l’autre, seuls les auteurs correspondants (« corresponding authors ») sont concernés ; les listes de revues accessibles à la lecture et celles réservées à la publication en accès ouvert sont le plus souvent distinctes ; les workflows ont des objectifs et des organisations matérielles totalement différentes, etc. L’articulation entre les deux objets contractuels relève uniquement d’une formule de distribution financière qui, outre des combinaisons particulières entre l’un et l’autre, permet d’attribuer des étiquettes distinctes aux accords (offset agreement, publish & read, read & publish, read & free articles, read & discount). Au-delà de cette distribution, l’étude des arrangements financiers montre une gamme de dispositions allant d’une prévisibilité budgétaire totale, donc identique aux accords d’abonnement antérieurs, à une incertitude sur le volume de publication ou sur le montant définitif des sommes échangées. Les modalités concrètes de calcul des montants associés à la publication en accès ouvert sont relativement variées. S’il existe effectivement des formules récurrentes (volume d’articles multiplié par un prix individuel, reprise de la moyenne des sommes totales d’APC des années précédentes...), le calcul des sommes en jeu est toujours le résultat d’une négociation singulière entre un consortium et un éditeur scientifique, et aboutit parfois à des formules originales et complexes. À ce titre, l’espace des possibles en matière de formules financières n’est jamais totalement clos. Par ailleurs, la volonté des consortiums d’opérer une « transformation » de leurs accords vers la publication à coût constant renvoie à des définitions diversifiées du « coût » (inclusion ou non des dépenses d’APC préexistantes) et de la constance (admission ou pas d’une « inflation » à 2 ou 3%). De plus, nous n’avons observé aucune disposition contractuelle permettant d’anticiper les sommes en jeu au-delà de l’horizon temporel de l’accord courant. La grande diversité des accords provient d’une part des conditions initiales des relations entre consortiums et éditeurs scientifiques – les sommes dépensées en abonnement étant le point de départ des nouveaux accords –, d’autre part des objectifs de chaque partie. Même si cette étude excluait volontairement les négociations, les accords portent des traces de ces objectifs. Ainsi, de nombreux accords sont de nature explicitement expérimentale, quand certains visent un contrôle budgétaire strict, ou d’autres ambitionnent, dans la période plus récente, la publication du plus grand nombre possible d’articles en accès ouvert. C’est dans ce dernier cas qu’on touche à l’ambiguïté des attentes générales sur les accords transformants. En effet, pour les consortiums, la dimension « transformante » consiste essentiellement à transférer les sommes traditionnellement allouées à l’abonnement vers la publication en accès ouvert. Mais l’objectif n’est jamais de transformer le modèle économique des revues, c'est-à-dire de faire basculer des revues sous abonnement ou hybrides en revues entièrement en accès ouvert. D’ailleurs, aucune clause ne vise une telle fin – à l’exception du modèle d’accord proposé par l’éditeur ACM. Du côté des éditeurs, et notamment de Springer, le caractère cumulatif des accords nationaux passés vise à projeter un monde de la publication où l’accès ouvert devient de fait quantitativement très dominant, sans pour autant modifier de manière pérenne le modèle économique de leurs revues. Notre étude montre que les accords transformants actuels ne permettent pas d’assurer de manière durable une transition de l’économie de la publication vers l’accès ouvert, dans la mesure où ils n’offrent pas de garantie sur le contrôle des dépenses ni sur la pérennité de l’ouverture des contenus. L’avenir des relations entre consortium et éditeur demeure largement indéterminé.Cette étude porte sur une des innovations contemporaines liées à l’économie de la publication scientifique : les accords dits transformants, un objet relativement circonscrit au sein des relations entre consortiums de bibliothèques et éditeurs scientifiques, et temporellement situé entre 2015 et 2020. Ce type d’accords a pour objectif affiché d’organiser la transition du modèle traditionnel de l’abonnement à des revues (souvent proposées par regroupements thématiques ou collections) vers celui de l’accès ouvert en opérant une réaffectation des budgets qui y sont consacrés. Notre travail d’analyse sociologique constitue une première étude systématique de cet objet, fondée sur la recension de 197 accords. Le corpus ainsi constitué inclut des accords caractérisés par la coprésence d’une composante d’abonnement et d’une composante de publication en accès ouvert, même minimale (« jetons » de publication offerts, réduction sur les APC...). En conséquence, ont été exclus de l’analyse les accords portant uniquement sur du financement centralisé de publication en accès ouvert, que ce soit avec des éditeurs ne proposant que des revues avec paiement par l’auteur (PLOS, Frontiers, MDPI...) ou des éditeurs dont une partie du catalogue est constitué de revues en accès ouvert. L’accord le plus ancien de notre corpus a été signé en 2010, les plus récents en 2020 – les accords ne commençant qu’en 2021, même annoncés au cours de l’étude, n’ont pas été retenus. Plusieurs résultats se dégagent de notre analyse. Tout d’abord, on note une grande diversité des acteurs impliqués avec 22 pays et 39 éditeurs, même si certains consortiums (Pays-Bas, Suède, Autriche, Allemagne) et éditeurs (CUP, Elsevier, RSC, Springer) en ont signé beaucoup plus que d’autres. Ensuite, la durée des accords, comprise entre une et six années, révèle une distribution très inégalitaire, avec plus de la moitié des accords (103) signés pour 3 ans, ainsi qu’une faible proportion pour 4 ans ou plus (22 accords). Enfin, en dépit d’appels répétés à la transparence, moins de la moitié des accords (96) ont un texte accessible au moment de cette étude, sans qu’on puisse observer une tendance récente à une plus grande disponibilité. L’analyse montre également des degrés d’ouverture très variables, allant d’une simple information sur le répertoire ESAC en passant par la mise à disposition d’un format annotable jusqu’à l’attribution d’un DOI et d’une licence de réutilisation (CC-BY), en incluant le détail des sommes monétaires. Parmi les 96 accords disponibles, dont 47 signés en 2020, 62 ont fait l’objet d’une analyse en profondeur. C’est à notre connaissance la première analyse à cette échelle, sur un type de matériel non seulement inédit, mais qui était auparavant soumis à des clauses de confidentialité. Fondée sur une lecture minutieuse, l’étude décrit de manière fine leurs propriétés, depuis la matérialité du document jusqu’aux formules financières, en passant par leur morphologie et l’ensemble des droits et devoirs des parties. Les contenus des accords sont donc analysés comme une collection dont nous cherchons à déterminer les points communs et les variations, à travers des codages explicites sur certaines de leurs caractéristiques. L’étude pointe également des incertitudes, et notamment leur caractère « transitionnel », qui demeure fortement discuté. D’un point de vue morphologique, les accords montrent une grande diversité en matière de taille (de 7 à 488 pages) et de structure. Néanmoins, par définition, ils articulent tous deux objets essentiels : d’une part, les conditions de réalisation d’une lecture d’articles de revues, sous forme d’abonnement, mêlant des préoccupations d’accès et de sécurité ; d’autre part, les modalités de publication en accès ouvert, articulant la gestion d’un nouveau type de workflow à toute une série d’options possibles. Parmi ces options, mentionnons notamment le périmètre des revues considérées (hybrides et/ou accès ouvert), les licences disponibles, le degré d’obligation de cette publication, les auteurs éligibles ou le volume d’articles publiables. L’un des résultats les plus importants de cette analyse approfondie est la mise au jour d’un découplage presque complet, au sein même des accords, entre l’objet abonnement et l’objet publication. Bien entendu, l’abonnement est systématiquement configuré dans un monde fermé, soumis à paiement qui déclenche des séries d’identification des circulations légitimes tant du contenu informationnel que des usagers. Il insiste notamment sur les interdictions de réutilisation ou même de copie des articles scientifiques. À l’opposé, la publication en accès ouvert est attachée à un monde régi par l’accès gratuit au contenu, ce qui induit des préoccupations de gestion du workflow et des modalités d’accessibilité. De plus, les différents éléments constitutifs de ces objets contractuels ne sont pas couplés : d’un côté, les lecteurs sont constitués de l’ensemble des membres des institutions abonnées, de l’autre, seuls les auteurs correspondants (« corresponding authors ») sont concernés ; les listes de revues accessibles à la lecture et celles réservées à la publication en accès ouvert sont le plus souvent distinctes ; les workflows ont des objectifs et des organisations matérielles totalement différentes, etc. L’articulation entre les deux objets contractuels relève uniquement d’une formule de distribution financière qui, outre des combinaisons particulières entre l’un et l’autre, permet d’attribuer des étiquettes distinctes aux accords (offset agreement, publish & read, read & publish, read & free articles, read & discount). Au-delà de cette distribution, l’étude des arrangements financiers montre une gamme de dispositions allant d’une prévisibilité budgétaire totale, donc identique aux accords d’abonnement antérieurs, à une incertitude sur le volume de publication ou sur le montant définitif des sommes échangées. Les modalités concrètes de calcul des montants associés à la publication en accès ouvert sont relativement variées. S’il existe effectivement des formules récurrentes (volume d’articles multiplié par un prix individuel, reprise de la moyenne des sommes totales d’APC des années précédentes...), le calcul des sommes en jeu est toujours le résultat d’une négociation singulière entre un consortium et un éditeur scientifique, et aboutit parfois à des formules originales et complexes. À ce titre, l’espace des possibles en matière de formules financières n’est jamais totalement clos. Par ailleurs, la volonté des consortiums d’opérer une « transformation » de leurs accords vers la publication à coût constant renvoie à des définitions diversifiées du « coût » (inclusion ou non des dépenses d’APC préexistantes) et de la constance (admission ou pas d’une « inflation » à 2 ou 3%). De plus, nous n’avons observé aucune disposition contractuelle permettant d’anticiper les sommes en jeu au-delà de l’horizon temporel de l’accord courant. La grande diversité des accords provient d’une part des conditions initiales des relations entre consortiums et éditeurs scientifiques – les sommes dépensées en abonnement étant le point de départ des nouveaux accords –, d’autre part des objectifs de chaque partie. Même si cette étude excluait volontairement les négociations, les accords portent des traces de ces objectifs. Ainsi, de nombreux accords sont de nature explicitement expérimentale, quand certains visent un contrôle budgétaire strict, ou d’autres ambitionnent, dans la période plus récente, la publication du plus grand nombre possible d’articles en accès ouvert. C’est dans ce dernier cas qu’on touche à l’ambiguïté des attentes générales sur les accords transformants. En effet, pour les consortiums, la dimension « transformante » consiste essentiellement à transférer les sommes traditionnellement allouées à l’abonnement vers la publication en accès ouvert. Mais l’objectif n’est jamais de transformer le modèle économique des revues, c'est-à-dire de faire basculer des revues sous abonnement ou hybrides en revues entièrement en accès ouvert. D’ailleurs, aucune clause ne vise une telle fin – à l’exception du modèle d’accord proposé par l’éditeur ACM. Du côté des éditeurs, et notamment de Springer, le caractère cumulatif des accords nationaux passés vise à projeter un monde de la publication où l’accès ouvert devient de fait quantitativement très dominant, sans pour autant modifier de manière pérenne le modèle économique de leurs revues. Notre étude montre que les accords transformants actuels ne permettent pas d’assurer de manière durable une transition de l’économie de la publication vers l’accès ouvert, dans la mesure où ils n’offrent pas de garantie sur le contrôle des dépenses ni sur la pérennité de l’ouverture des contenus. L’avenir des relations entre consortium et éditeur demeure largement indéterminé.