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Dissertations / Theses on the topic 'Virus SARS-CoV-2'

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1

Condé, Lionel. "Contrôle traductionnel du SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., Lyon, École normale supérieure, 2024. http://www.theses.fr/2024ENSL0010.

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Abstract:
Endant l’infection virale, la régulation de l’expression des gènes est au cœur des interactions complexes entre l'hôte et le pathogène. Les virus exploitent la machinerie cellulaire de l'hôte pour assurer la synthèse de leurs protéines nécessaires pour la réplication et la propagation de l'infection. C'est notamment le cas lors de l'infection par le SARS-CoV-2, qui induit rapidement une inhibition globale de la traduction cellulaire grâce à l'action de facteurs viraux tels que la protéine Nsp1. Pour produire efficacement ses protéines, le virus doit alors mettre en place des stratégies pour co
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Pisil, Yalcin. "The Study on Neutralization of Human Immunodeficiency Virus and SARS CoV-2 - Neutralization Resistance of SHIV and Neutralization Assay for SARS CoV-2 -." Doctoral thesis, Kyoto University, 2021. http://hdl.handle.net/2433/264673.

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Abstract:
京都大学<br>新制・課程博士<br>博士(人間・環境学)<br>甲第23392号<br>人博第1005号<br>新制||人||237(附属図書館)<br>京都大学大学院人間・環境学研究科相関環境学専攻<br>(主査)准教授 三浦 智行, 教授 川本 卓男, 准教授 西川 完途<br>学位規則第4条第1項該当<br>Doctor of Human and Environmental Studies<br>Kyoto University<br>DFAM
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Courjon, Johan. "Activation de l’inflammasome NLRP3 au cours des bactériémies à E. coli ou S. aureus et durant l’infection à SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., Université Côte d'Azur, 2021. http://www.theses.fr/2021COAZ6009.

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Abstract:
A la phase précoce d’une infection bactérienne ou virale l’immunité innée est capable de détecter certains motifs microbiens conservés (PAMP) reconnus par des récepteurs dédiés à ces motifs (PRR) permettant ainsi d’amorcer la réaction pro-inflammatoire via différentes voies de signalisation. Les inflammasomes représentent une catégorie de PRR capable de transformer la pro-IL-1β et la pro-IL-18 en cytokines pro-inflammatoires actives ainsi que d’induire une mort cellulaire pro-inflammatoire nommée pyroptose. NLRP3 est l’inflammasome le plus étudié. De nombreuses bactéries et de nombreux virus o
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4

Venkatesan, Lavanya. "Identifying and Tracking the Evolution of Mutations in the SARS-CoV-2 Virus." Thesis, Virginia Tech, 2021. http://hdl.handle.net/10919/103939.

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Abstract:
SARS-CoV-2 is caused by a pathogenic and highly transmissible beta coronavirus leading to severe infections in immuno-compromised individuals. This study first evaluates the primers used in the Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) to detect SARS-CoV-2 by understanding how mutations might affect the primer efficiency with the SARS-CoV-2 sequences. Mutations on the Spike protein of SARS-CoV-2 are the most important as the spike protein mediates the viral entry into host cells. This study tracks the course of mutations on the spike protein by focusing on the haplogroups of th
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Chenane, Houssem Eddine. "Étude de marqueurs sérologiques et génomiques des virus respiratoires SARS-CoV-2 et VRS." Electronic Thesis or Diss., Université Paris Cité, 2025. https://wo.app.u-paris.fr/cgi-bin/WebObjects/TheseWeb.woa/wa/show?t=7854&f=76741.

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Abstract:
Depuis son émergence en 2019, le SARS-CoV-2 a engendré une pandémie mondiale sans précédent, bouleversant les systèmes de santé et provoquant une crise sanitaire majeure. Le diagnostic de la COVID-19 repose principalement sur la détection de l'ARN viral par RT-PCR nasopharyngée, mais la quantification de l'antigène N dans le sérum (antigénémie N) pourrait offrir une alternative précieuse en tant que marqueur pronostique de la sévérité de la maladie. Par ailleurs, l'apparition continue de nouveaux variants, porteurs de mutations sur la protéine de spicule S, a amplifié les défis posés par la pa
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Gouin, Carla. "Tropisme cellulaire initial du SARS-CoV-2 dans le poumon humain : du poumon entier aux sous-populations de macrophages." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2023. http://www.theses.fr/2023UPASL147.

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Abstract:
Les mécanismes pathogéniques impliqués dans les phases initiales de l'infection par le SARS-CoV-2 restent mal compris au niveau pulmonaire, en dépit d'une abondante activité de recherche depuis l'émergence de la pandémie COVID-19. Des travaux conduits sur des modèles de culture de cellules humaines isolées, d'explants, d'organoïdes ou de lung-on-a-chip ont donné des résultats discordants quant aux cibles initiales pulmonaires principales du virus et à la réponse innée induite. Dans ce travail de thèse, j'ai évalué un modèle original d'étude des premières étapes de l'infection virale qui consis
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Mazzini, Livia. "VIRUS PANDEMICI EMERGENTI: VALUTAZIONE IMMUNOLOGICA DEL VIRUS INFLUENZALE A/VIETNAM/1194/2004 (H5N1) E DEL NUOVO SARS-COV-2." Doctoral thesis, Università di Siena, 2021. http://hdl.handle.net/11365/1126879.

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Abstract:
The historical moment we are experiencing has raised global awareness about the importance of identifying the main characteristics of emerging pandemic viruses in order to limit the damage caused by infection-associated diseases and safeguard global health. This work included two main studies focused on pandemic A/Vietnam/1194/2004 (H5N1) and the novel SARS-CoV-2, respectively. H5N1 is a type of influenza virus that causes a highly infectious, severe respiratory disease in birds called avian influenza (or "bird flu"). Influenza A viruses circulating among poultry have the potential to recomb
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Gruvnäs, Amanda. "Avloppsvattenbaserad epidemiologi med fokus på SARS-CoV-2 : Analys inom Västerås kommun." Thesis, Uppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning, 2021. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-451696.

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Abstract:
Globalt har hela världens befolkning påverkats både ekonomiskt och psykiskt av coronaviruset SARS-CoV-2, som har drabbat så många människor med covid-19 att det klassas som en pandemi. Strax efter pandemins utbrott upptäcktes det att viruset utsöndras från avföring och ut i spillvattennätet som leder till reningsverken. Då virusmängden ökar i avloppsvattnet ökar även covid-19 fallen i samhället. Ökning av virusmängd i avloppsvatten kan nämligen signalera om att det förekommer smittspridning i samhället. Avloppsvattenbaserad övervakning kan dock användas som komplement till andra teststrategier
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Marot, Stéphane. "Étude de la réponse humorale lors de l'infection par le SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS722.

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Abstract:
Au début de la pandémie de COVID-19, nous ne disposions que de peu de données portant sur la réponse humorale spécifique anti-SARS-CoV-2 et elles étaient principalement issues des connaissances des coronavirus humains proches. L’objectif de ce travail était de décrire la cinétique de la réponse humorale et son activité neutralisante à la suite d’une infection par le SARS-CoV-2 ou au décours d’une vaccination contre le COVID-19. Dans notre première étude, nous avons pu décrire, chez des professionnels de santé ayant présenté un COVID-19 modéré, la cinétique d’apparition de différents isotypes d
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Gambino, Adèle. "Etude du rôle de l'immunité innée dans la physiopathologie et dans la transgression de la barrière d'espèces par le SARS-CoV-2 chez différentes espèces animales." Electronic Thesis or Diss., Maisons-Alfort, École nationale vétérinaire d'Alfort, 2024. http://www.theses.fr/2024ENVA0004.

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Abstract:
Le SARS-CoV-2 est un virus de la famille des Coronaviridae, genre Betacoronavirus qui aurait pour origine un virus proche provenant d'une espèce de chauve-souris. Son émergence en Chine fin 2019 ainsi que l'apparition de nombreux variants ont donné lieu à la plus grande pandémie virale du XXIème siècle. L'infection va engendrer la maladie COVID-19 qui est caractérisée par des symptômes respiratoires pouvant être de légers à sévères avec une pneumonie parfois fatale. La réponse immunitaire innée est la première ligne de défense contre une infection virale et permet la synthèse d'interférons (IF
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Decarreaux, Dorine. "Séroprévalence des IgG dirigées contre le SARS-CoV-2 dans une population universitaire et parmi des professionnels de santé en soins primaires et leurs contacts au sein des ménages." Electronic Thesis or Diss., Corte, 2024. http://www.theses.fr/2024CORT0007.

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Abstract:
Cette thèse émerge dans le contexte de la pandémie de la COVID-19, mettant en lumière les défis rencontrés en raison de la nouveauté et de la complexité du virus, et révélant des lacunes majeures dans nos connaissances. Elle s’est concentrée sur la communauté universitaire en Corse et les professionnels de la santé exerçant en soins primaires en France métropolitaine, considérés comme potentiellement à risque. L’hypothèse est que ces différentes populations, en raison de leur environnement ou de leur profession, présentent un risque important d’exposition au virus SARS-CoV-2 par rapport à la p
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Saade, Carla. "Immune response against SARS-CoV-2 : impact of viral variants, vaccination, and protection against reinfection." Electronic Thesis or Diss., Lyon 1, 2024. http://www.theses.fr/2024LYO10271.

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Abstract:
La pandémie COVID-19 a posé des défis majeurs aux systèmes de santé mondiaux, notamment en raison de la capacité du SARS-CoV-2 à acquérir des mutations. Cela a entraîné l'émergence séquentielle de variants préoccupants (VOCs de l’anglais Variants of concern) tels que Alpha, Beta, Delta, et désormais Omicron qui circule sous forme de sous-variants successifs (BA.1, JN.1, KP.3). Ces VOCs soulèvent des questions sur leur capacité à échapper à la réponse immunitaire induite par une infection et/ou une vaccination. Alors que les campagnes de vaccination se poursuivent, il est crucial d'évaluer comm
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Checa, Ruano Luis. "Structure-based design of antiviral drugs against respiratory viruses using in silico approaches." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2024SORUS0743.pdf.

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Abstract:
Les interactions protéine-protéine (IPP) jouent un rôle crucial dans de nombreuses voies biologiques et sont de plus en plus explorées en tant que cibles thérapeutiques potentielles, notamment pour le traitement des maladies infectieuses. Cependant, la conception de petites molécules modulatrices pour les IPP reste un défi, car les interfaces des IPP n'ont pas évolué pour lier des petites molécules comme les cibles thérapeutiques conventionnelles telles que les enzymes ou les récepteurs membranaires. Par conséquent, la preuve de leur drugabilité doit être apportée au cas par cas. Dans ce conte
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Carbonnel, Marie. "Enjeux immunologiques liés à la grossesse, à propos de deux modèles : la transplantation utérine et l’infection à SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2023SORUS521.pdf.

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Abstract:
La transplantation utérine est un nouveau traitement permettant aux femmes avec une infertilité utérine d’être enceintes. Cette greffe d’organe est tout à fait unique car son but est l’obtention d’un enfant en bonne santé et le greffon est transitoire. Néanmoins, elle nécessite un traitement immunosuppresseur comme les autres greffes d’organes. Le but de mon travail de thèse était de mieux comprendre les mécanismes en jeu dans le rejet de greffe utérine et l’impact des altérations immunologiques sur l’interface materno-foetale. Sur une série rétrospective de biopsies de col analysées par RNA s
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Galmiche, Simon. "Identifying the settings at risk of transmission of SARS-CoV-2, the role of children in household transmission, and the incubation period of the main variants in an online case-control study in France." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2024SORUS144.pdf.

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Abstract:
Notre objectif était d’identifier, pour l’infection à SARS-CoV-2, les lieux de transmission, le rôle des enfants dans la transmission intra-domiciliaire et la période d’incubation. Dans une étude cas-témoins en France métropolitaine incluant des adultes avec infection récente et des témoins non infectés appariés sur l’âge, le sexe, la région, la taille de population, et la semaine, nous avons estimé les odds ratios d’infection par le SARS-CoV-2 pour certains lieux d’intérêt, comportements, activités et la présence d’enfants au domicile. Nous avons analysé les circonstances de transmission décr
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Garnier, Nathalie. "De l'étude du rôle des miARN dans la physiopathologie de l'infection par le SARS-CoV-2 à l'élaboration d'une application clinique." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024ULILS035.

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Abstract:
Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, SARS-CoV-2), de la famille Coronaviridae, est responsable de la maladie à coronavirus de 2019 (coronavirus disease 2019, COVID-19). Malgré la disponibilité de vaccins, en cause dans la fin de l’urgence sanitaire de la COVID-19, la circulation virale du SARS-CoV-2 subsiste ainsi que les recherches sur la compréhension de sa physiopathologie, notamment l’implication et le rôle des microARN (miARN) dans cette infection virale. Les miARN sont des petits ARN non codants régulant l’expressio
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Aquino, Yann. "Bases génétiques et évolutives de la variabilité interpopulationnelle de la réponse immunitaire au SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS488.

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Abstract:
Tous les humains ne sont pas égaux face au SARS-CoV-2. Les bases génétiques et immunologiques de ces différences inter-individuelles commencent à être déchiffrées, mais les prédicteurs de différences immunitaires face au SARS-CoV-2 entre populations restent méconnus. Dans ce contexte, nous rapportons des données de séquençage d'ARN en résolution cellule unique sur des cellules mononucléaires du sang périphérique provenant de 222 donneurs sains de diverses origines, qui ont été stimulées par le SARS-CoV-2 ou le virus de la grippe. Nous montrons que le SARS-CoV-2 induit une activité moins forte,
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Maguiña, Jorge L., Percy Soto-Becerra, Yamilee Hurtado-Roca, and Roger V. Araujo-Castillo. "Laboratory tests for identification of sars-cov-2 during pandemic times in Peru: Some clarification regarding «diagnostic performance»." Instituto Nacional de Salud, 2020. http://hdl.handle.net/10757/655698.

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Lyrio, Ana Paula Batisti. "Desenvolvimento e implementação de equipamento para descontaminação de superfícies." Master's thesis, Universidade de Évora, 2021. http://hdl.handle.net/10174/30555.

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Abstract:
O SARS-CoV-2 foi identificado, pela primeira vez na cidade de Wuhan, China, em dezembro de 2019, que veio, mais tarde a causar milhares de mortes, dando origem a uma crise na saúde pública em todo o mundo. O SARS-CoV-2 é uma infeção respiratória altamente transmissível através de contato próximo a doentes infetados. Em Portugal, o Serviço Nacional da Saúde recomendou nomeadamente a necessidade do aumento da higiene pessoal; a constante desinfeção das mãos; o uso obrigatório de máscaras ou viseiras; o distanciamento físico; a desinfeção das superfícies em contato com infetados. O SARS-CoV-2, as
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Arotoma, De La Cruz Nahomy Lucía. "Medidas de protección según el antecedente de infección por SARS-CoV-2 en obstetras del Hospital Nacional Sergio E. Bernales, 2021." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17113.

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Abstract:
Compara las medidas de protección según el antecedente de infección por SARS-CoV-2 en obstetras del Hospital Nacional Sergio E. Bernales. Realiza un estudio no experimental, analítico, transversal y prospectivo, realizado en 45 obstetras con y sin antecedente de Covid-19.Se recolectó información con la técnica de encuesta con un instrumento válido (en constructo y contenido). Se desarrollaron estadísticos descriptivos para variables cualitativas, y para establecer la relación de las variables se utilizó, asociación lineal por lineal y el test exacto de Fisher. Encuentra que la edad prom
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Barrios, Cárdenas Pascual. "Resultados maternos y neonatales en puérperas reactivas y no reactivas SARS-COV-2 en el Hospital San Juan de Lurigancho, 2020." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17216.

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Abstract:
Compara los resultados maternos y neonatales entre las puérperas reactivas y no reactivas a SARS-CoV-2 en el Hospital San Juan de Lurigancho, abril - setiembre 2020. Realiza un estudio de enfoque cuantitativo tipo observacional descriptivo comparativo, retrospectivo y transversal con una muestra de 377 puérperas tamizadas para Sars-CoV-2, elegidas mediante muestreo probabilístico aleatorio simple, en el Hospital San Juan de Lurigancho durante abril - setiembre del año 2020. La técnica fue análisis documental de la historia clínica, se empleó estadística descriptiva a través del programa es
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Lahmar, Imran. "Impact de la polarité et de la spécificité des lymphocytes T dans la protection contre l'infection par le SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2023. http://www.theses.fr/2023UPASL067.

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Abstract:
La pandémie de COVID-19 causée par le virus SARS-CoV-2 a nécessité une compréhension approfondie de la réponse immunitaire afin de développer des stratégies de prévention et de traitement efficaces. Rapidement, la communauté scientifique a démontré que l'immunité humorale induite par l'infection ou la vaccination était capable de générer des anticorps protecteurs neutralisants contre l'infection et la sévérité de la maladie chez l'homme. Cependant, il a été observé que la protection conférée par ces anticorps diminue rapidement dans le temps, en raison de l'échappement des variants du SARS-CoV
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Velasco, Kathleen Anne. "Ruolo potenziale del particolato atmosferico nella diffusione del SARS-COV-2 in Emilia-Romagna durante la seconda ondata: un'analisi dei dati." Bachelor's thesis, Alma Mater Studiorum - Università di Bologna, 2021. http://amslaurea.unibo.it/23006/.

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Abstract:
La presente tesi è incentrata a verificare l'impatto dell'inquinamento atmosferico sulla diffusione del virus virale SARS-CoV-2. È stato adottato il metodo statistico di Pearson per analizzare l'intensità di una potenziale correlazione tra i due fenomeni elaborando le informazioni che hanno contraddistinto la seconda ondata della pandemia in Emilia Romagna. Al termine di questo studio, sono stati calcolati i coefficienti ed i p-value relativamente significativi che confermano l'esistenza di una potenziale relazione di reciprocità tra il volume di concentrazione di uno specifico particolato at
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Alvarez, Flavio. "Étude structurale et fonctionnelle du motif PBM de la protéine d'enveloppe du SARS-CoV-2 : mécanismes de pathogénicité et perturbations épithéliales." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2025. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2025SORUS074.pdf.

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Abstract:
La pandémie de COVID-19, causée par le SARS-CoV-2, a constitué un défi sanitaire mondial majeur en raison de sa forte mortalité et morbidité. Cette crise a conduit la communauté scientifique à se mobiliser pour mieux comprendre la pathogénicité du virus et développer de nouvelles stratégies thérapeutiques. La protéine d'enveloppe (E) du SARS-CoV-2 joue un rôle central dans la virulence du virus. Un motif particulier de cette protéine, le PDZ Binding Motif (PBM), situé à son extrémité C-terminale, interagit avec des protéines humaines porteuses de domaines PDZ. Ces interactions perturbent des p
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Meunier, Thomas. "Étude des mécanismes d’action de nouveaux inhibiteurs de coronavirus humains." Thesis, Université de Lille (2018-2021), 2021. http://www.theses.fr/2021LILUS057.

Full text
Abstract:
Les coronavirus sont des virus ARN enveloppés qui infectent les mammifères et les oiseaux. Chez l’homme, quatre coronavirus causent des maladies bénignes comme des rhumes et rhinites, HCoV-OC43, HCoV-229E, HCoV-NL63 et HCoV-HKU1. Au cours des deux dernières décennies, trois nouveaux coronavirus hautement pathogènes ont été identifiés, le SARS-CoV (« Severe Acute Respiratory Syndrome ») en 2003, le MERS-CoV (« Midle East Respiratory Syndrome ») en 2012 et récemment le SARS-CoV-2 en décembre 2019. La pandémie mondiale du COVID-19 a mis en évidence le manque d’antiviraux ciblant les coronavirus.
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Daniel, Matthieu. "Interactions neuro-immunitaires et rôle des cellules stromales mésenchymateuses au cours de la COVID-19." Electronic Thesis or Diss., La Réunion, 2024. http://www.theses.fr/2024LARE0045.

Full text
Abstract:
Le virus responsable du « Severe Acute Respiratory Syndrome-CoronaVirus 2 » ou SARS-CoV-2, et de la maladie nommée COVID-19 est caractérisé, sur le plan clinique, par une atteinte des voies respiratoires. Cette atteinte semble représenter un des déterminants essentiels de la sévérité et de l'évolution clinique des patients infectés. Elle peut s'accompagner d'un tableau d'hypoxémie profonde nécessitant parfois le recours à la ventilation mécanique et pouvant mener au décès. Si cette atteinte respiratoire demeure la préoccupation principale des cliniciens, elle n'est pour autant pas la seule cib
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Leducq, Valentin. "Apport des outils de biologie moléculaire dans l'étude et la surveillance du SARS-CoV-2 au cours de la pandémie de COVID-19." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS203.

Full text
Abstract:
Dès le début de la pandémie de COVID-19, des outils de biologie moléculaire permettant la détection et l’analyse du génome du SARS-CoV-2 ont été développés et déployés à une échelle sans précédent. Les techniques de PCR ont été utilisées pour diagnostiquer quotidiennement des millions de personnes, tandis que la démocratisation du séquençage de nouvelle génération (NGS) a permis de générer rapidement des centaines de milliers de génomes viraux. Ces outils ont été une source d’information majeure dans l’étude et la compréhension de la physiopathologie du SARS-CoV-2, mais également dans le suivi
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Cucho, Gamboa Grover Omar. "Verificación del desempeño analítico de la prueba Elecsys AntiSARS-CoV-2 para la detección cualitativa de anticuerpos en el analizador inmunológico automatizado Cobas e 411, Lima 2020." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/16408.

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Abstract:
El brote de la nueva infección por SARS CoV2 se ha extendido rápidamente por China y por muchos países siendo considerado un problema en la salud pública de interés internacional, el diagnóstico es realizado por la técnica moléculas de RT-PCR, sin embargo existe la necesidad urgente de contar con otros métodos que sean rápidos y precisos para poder identificar rápidamente a la gran cantidad de pacientes infectados, portadores asintomáticos, previniendo la transmisión del virus y asegurando un oportuno tratamiento. Aunque las distintas pruebas son validadas por el fabricante es necesario
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Alejos, Tapia Renzo Carlos. "Utilidad de la tomografía con reconstrucción SAFIRE para la caracterización de lesiones pulmonares en pacientes infectados por SARS-COV2." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2022. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17806.

Full text
Abstract:
Determina la utilidad de la tomografía con reconstrucción SAFIRE para la caracterización de lesiones pulmonares en pacientes infectados por SARS-COV2 en el Servicio de Tomografía de la Clínica Montefiori entre Marzo y Abril del año 2021. Realiza un estudio observacional, retrospectivo, corte transversal, diseño correlacional. Se trabajó con una población de 100 estudios de tomografía torácicas en ventana pulmonar de pacientes infectados por SARS-COV2 atendidos en una clínica en el año 2021; se reconstruyó 2 volúmenes por paciente: retroproyección filtrada y reconstrucción SAFIRE. Se utilizó a
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Giraudet, Rémi. "Développement d'approches de suppression des épitopes T d'anticorps et de VHH pour réduire leur risque d'immunogénicité." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASQ067.

Full text
Abstract:
Dans un contexte où l'immunogénicité des biothérapies, en particulier des anticorps thérapeutiques, constitue un obstacle majeur à leur efficacité clinique, cette thèse explore des stratégies pour réduire ce risque, en se concentrant sur trois axes principaux : le développement d'outils in silico pour concevoir des mutations déimmunisantes, la déimmunisation de l'adalimumab et l'évaluation des réponses immunitaires CD4+ spécifiques aux VHH.Les outils in silico actuellement disponibles se concentrent soit sur la prévision de la liaison aux molécules HLA-II soit sur l'évaluation de l'humanité de
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Brier, Lucile. "Conception d'une stratégie de découverte de composés antiviraux contre les coronavirus : du criblage à l'optimisation d'inhibiteurs de la protéase 3CL du SARS-CoV-2." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2022. http://www.theses.fr/2022ULILS031.

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Abstract:
Les coronavirus sont des virus à ARN provoquant des maladies respiratoires, entériques, hépatiques et neurologiques de gravité variable chez différentes espèces, dont l'Homme. Parmi eux, sept peuvent infecter l'Homme. Les souches HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-229E et HCoV-HKU1 entraînent des infections légères des voies respiratoires. Le SARS-CoV, le MERS-CoV et le SARS-CoV-2, potentiellement mortels, ont quant à eux été à l'origine de pandémies. Aujourd'hui, le SARS-CoV-2 circule toujours mais la stratégie vaccinale a permis de réduire significativement les risques d'hospitalisation et de décès.
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Fahey, Nisha. "Epidemiology and Characteristics of Pediatric COVID-19 Cases Among UMass Memorial Health Care Patients." eScholarship@UMMS, 2021. https://escholarship.umassmed.edu/gsbs_diss/1140.

Full text
Abstract:
Background: The epidemiology of SARS-CoV-2 infection in the pediatric population, with a focus on racial and ethnic disparities and impact of societal public health measures, remains poorly understood. Methods: This large observational study used electronically abstracted data from pediatric (≤ 19 years of age) patients who received a molecular test for SARS-CoV-2 at a UMass Memorial Health Care (UMMHC) site between March 8, 2020 and April 3, 2021 which was further supplemented by manual chart review of a subset of pediatric SARS-CoV-2 cases. Multivariable logistic regression models with inter
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Matteo, Broketa. "Identification des répertoires d'affinité des cellules sécrétrices d'anticorps." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS616.

Full text
Abstract:
Cette recherche à explorer les complexités des affinités d’anticorps des cellules sécrétant des anticorps (CSA). Le premier objectif était de caractériser la réponse de l’CSA à la vaccination par ARNm contre le SRAS-CoV-2. Les nouveaux vaccins à ARNm pour lutter contre la pandémie de COVID-19 a présenté une opportunité unique d’étudier une nouvelle réponse humorale des cellules B après l’immunisation. Nous avons utilisé un test microfluidique, DropMap, capable de mesurer la sécrétion d'anticorps et l'affinité envers l'antigène pour caractériser les caractéristiques des CSA dans les semaines et
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Colosi, Elisabetta. "Modélisation de la propagation de COVID-19 dans les établissements scolaires afin de maintenir l'apprentissage en personne en toute sécurité." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2023SORUS416.pdf.

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Abstract:
Lorsque le COVID-19 est apparu comme une pandémie mondiale en mars 2020, les établissements scolaires ont été parmi les premiers lieux à être fermés pour freiner la transmission du SRAS-CoV-2. Cependant, le choix de fermer les écoles pendant une période relativement longue a été très controversé et largement débattu, notamment en raison des effets néfastes sur le bien-être des élèves et le développement de l'apprentissage. C'est pourquoi les gouvernements du monde entier ont progressivement réintroduit les activités en personne dans les écoles, en mettant en œuvre diverses mesures de contrôle
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Custodio, Cuzcano Dante Miguel. "Factores sociodemográficos relacionados a la clasificación CORADS en pacientes con diagnóstico de SARS-CoV-2 que acuden al servicio de Tomografía Computada de una clínica privada, Lima. Marzo – julio 2020." Bachelor's thesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021. https://hdl.handle.net/20.500.12672/17096.

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Abstract:
Determina los factores sociodemográficos relacionados a la clasificación CO-RADS en pacientes con diagnóstico de SARS-CoV-2 que acuden al servicio de tomografía computada de una Clínica Privada de Lima entre marzo – julio del 2020. El presente estudio es de enfoque cuantitativo, no experimental y de tipo de diseño correlacional, que tuvo como muestra a 348 pacientes con diagnóstico de SARS-CoV-2 que acudieron al servicio de tomografía computada y cumplieron los criterios de selección. Para analizar la relación se utilizó la prueba chi cuadrado de Pearson, considerando un valor significa
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Barthelemy, Johanna. "Infections virales respiratoires et tissus adipeux blancs : Exemple de la grippe et de la COVID-19." Thesis, Université de Lille (2022-....), 2022. http://www.theses.fr/2022ULILS009.

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Abstract:
Les infections virales respiratoires demeurent un enjeu majeur de santé publique dans le monde entier. C’est notamment le cas de la grippe, causée par les virus influenza, et de la COVID-19, une maladie infectieuse émergente due au virus SARS-CoV-2. De manière notable, les populations les plus à risque de développer des formes sévères de grippe ou de COVID-19, sont les individus obèses et les personnes âgées. Bien que l’obésité et le vieillissement soient associées à des altérations fonctionnelles majeures du tissu adipeux blanc, la participation de ce dernier dans la physiopathologie de la gr
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Rouzé, Anahita. "Impact de l'infection par SARS-CoV-2 sur l'épidémiologie des infections respiratoires bactériennes et des aspergilloses pulmonaires invasives chez les patients de réanimation sous ventilation mécanique." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. https://pepite-depot.univ-lille.fr/ToutIDP/EDBSL/2024/2024ULILS017.pdf.

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Abstract:
Objectifs : Le projet CoVAPid visait à étudier l'impact de l'infection par SARS-CoV-2 sur l'épidémiologie des infections respiratoires bactériennes et fongiques chez les patients de réanimation sous ventilation mécanique (VM). Trois entités ont été analysées : les infections pulmonaires bactériennes précoces, les infections respiratoires bactériennes acquises sous VM (IAVM) - pneumonies (PAVM) et trachéobronchites (TAVM) - et les aspergilloses pulmonaires invasives (API). Les objectifs principaux étaient de comparer la prévalence d'infection pulmonaire bactérienne précoce entre les patients ad
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Al, Ibrahim Malak. "Anti-coronavirus potential of halophytes and invasive plants from Northern France : discovery of active terpenoids from Hippophae rhamnoides and Senecio inaequidens." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024ULILS003.

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Abstract:
Les coronavirus sont responsables de maladies des voies respiratoires bénignes à graves chez l’Homme. Malgré des progrès significatifs dans la compréhension de la pathologie et de la gestion clinique des coronavirus, ces maladies virales restent un problème de santé publique en raison d’épidémies récurrentes provoquées par l’émergence de variants, d’un accès inégal aux traitements contre la COVID-19, de taux de vaccination inadéquats et de populations à haut risque non vaccinées. Il est donc impératif de développer des solutions antivirales spécifiques et abordables pour contrôler et prévenir
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Silverstein, Noah J. "Disease Tolerance, Epigenetic Inheritance, and Surviving Pathogenic Viral Infections." eScholarship@UMMS, 2021. https://escholarship.umassmed.edu/gsbs_diss/1149.

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Abstract:
Health is often defined in terms of absence of disease or pathological processes, but this is a definition of exclusion and incomplete. For example, SARS-CoV-2 viral load does not reliably predict disease severity, and so individuals must vary in their ability to control inflammation and maintain normal tissue homeostasis. This host defense strategy is called disease tolerance, and better understanding of disease tolerance mechanisms could change the way that we treat disease and work to maintain health. The first project presented in this dissertation found that after accounting for effects o
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Hognon, Cecilia. "Modélisation et simulation moléculaire pour la compréhension des processus biologiques fondamentaux et le développement de nouveaux agents thérapeutiques contre le cancer et la Covid-19." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2021. http://www.theses.fr/2021LORR0233.

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Abstract:
Au cours de cette thèse, j'ai utilisé la modélisation moléculaire et des techniques de simulation pour répondre à des questions biologiques clés, dans le cadre de la compréhension des bases fondamentales du développement cancéreux et des mécanismes de réplication/diffusion virales, y compris ceux du SARS-CoV-2. En plus de rationaliser les bases moléculaires derrière les résultats biologiques critiques, y compris l'évaluation des propriétés thermodynamiques des agrégats biologiques clés, j'ai également étudié la conception moléculaire rationnelle possible de nouveaux agents thérapeutiques agiss
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Bost, Pierre. "Decoding cellular communications and interactions between immune cells by using single-cell approaches." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2020. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2020SORUS020.pdf.

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Abstract:
Les communications cellulaires sont indispensables au bon fonctionnement des organismes multicellulaires, notamment pour s’adapter à un environnement changeant en permanence. Les cellules du système immunitaire n’échappent pas à cette règle mais les interactions entre cellules immunitaires restent peu connues et compliquée à étudier. La récente apparition des technologies de séquençage dites ‘cellules uniques’ représente une opportunité unique pour étudier ces communications. Dans cette thèse, différentes approches expérimentales et analytiques ont été développées pour étudier ces communicatio
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Labbé, Vincent. "Risques thrombotiques et hémodynamiques chez les patients hospitalisés en réanimation présentant une fibrillation atriale de novo au cours d’un sepsis : caractérisation, stratification et stratégies thérapeutiques." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2023SORUS556.pdf.

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Abstract:
Objectifs Les patients hospitalisés en réanimation pour un sepsis sont à haut risque d’accidents thrombotiques (AT) intéressant l’ensemble des circulations (grande, coronaire, petite). Nous souhaitons étudier ce risque thrombotique lors du sepsis (i) au sein de la grande circulation chez les patients présentant une fibrillation atriale de novo (FAN), (ii) au sein de la circulation coronaire chez les patients présentant un infarctus du myocarde (IDM) et (iii) au sein de la petite circulation chez les patients COVID-19 sévère. Par ailleurs, si le risque d’AT pose la question de l’intérêt de la t
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Esteves, Souza Jerónimo, and Ríos Joaquín Javier Vela. "Efectos de una pandemia en los mercados de valores de renta variable: comparativa entre la Influenza de tipo A(H1N1) durante el periodo 2009- 2010 y el COVID-19 en el año 2019- 2020." Bachelor's thesis, Pontificia Universidad Católica del Perú, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.12404/18466.

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Abstract:
Después de la pandemia más conocida como la gripe española del año 1918, no hubo otra capaz de poner en serios problemas la economía mundial, en especial los mercados de valores de todos los países hasta la llegada del nuevo coronavirus SARS-COV2, denominado también COVID19. Por ello, el presente trabajo busca analizar y comparar los efectos de dos pandemias ocurridas en el periodo 2008-2020 en los mercados de renta de variable. Estas pandemias son la gripe A(H1N1) ocurrida en el periodo 2009- 2011 y el nuevo coronavirus SARS-COV2 que inició a finales del 2019 en Wuhan, China. El perio
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Malladi, Sameer Kumar. "HIV-1 and SARS-CoV-2 immunogen design." Thesis, 2020. https://etd.iisc.ac.in/handle/2005/5595.

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Abstract:
Human Immunodeficiency Virus (HIV-1) is the aetiologic agent of AIDS. Presently there are ~38 million HIV-1 infected individuals worldwide and ~1 million deaths in 2019. Since its discovery, the quest for vaccine candidate for HIV-1 is alive, yet no effective vaccine exists till date. HIV-1 viral displayed Envelope (Env) protein is the primary viral target of the humoral immune system and is thus an obvious vaccine candidate. The historic RV144 HIV-1 clinical trial resulted in a modest efficacy of the gp120 clade B/E vaccine candidate and renewed hope in finding a HIV-1 vaccine. However, monom
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Piçarra, Patricia Alexandra Jacinto. "Internship Reports and Monograph entitled "Virus-like particles based vaccines and their role in the COVID-19 pandemic”." Master's thesis, 2021. http://hdl.handle.net/10316/99021.

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Abstract:
Relatório de Estágio do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas apresentado à Faculdade de Farmácia<br>Este trabalho de Final de Mestrado engloba os Relatórios de Estágio e Monografia Intitulada "Virus-like particles based vaccines and their role in the COVID-19 pandemic". No final de 2019, na China, um novo coronavírus foi identificado com o surgimento de uma pneumonia atípica. O mundo rapidamente ficou em alerta devido à alta velocidade com que este vírus se transmitia em todo o mundo. Este novo surto foi rapidamente declarado como uma pandemia.Desde o início surgiu a necessidade de cri
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Costa, Maria Gabriela Meneses. "Relatório de Estágio e Monografia intitulada" Organoides Cerebrais na Modelação de Doenças Degenerativas e Infeciosas." Master's thesis, 2021. http://hdl.handle.net/10316/99162.

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Abstract:
Relatório de Estágio do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas apresentado à Faculdade de Farmácia<br>O presente documento redigido no âmbito da Unidade Curricular “Estágio Curricular” do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra inclui dois relatórios de estágio e uma monografia. Os relatórios de estágio, que seguem uma estrutura de análise SWOT (Strengths, Weaknesses, Opportunities and Threats), incidem sobre os estágios realizados na Indústria Farmacêutica Bluepharma Indústria Farmacêutica, S.A e em Farmácia Comunitária, na Farmác
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Costa, Maria Gabriela Meneses. "Relatório de Estágio e Monografia intitulada" Organoides Cerebrais na Modelação de Doenças Degenerativas e Infeciosas." Master's thesis, 2021. http://hdl.handle.net/10316/99172.

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Abstract:
Relatório de Estágio do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas apresentado à Faculdade de Farmácia<br>O presente documento redigido no âmbito da Unidade Curricular “Estágio Curricular” do Mestrado Integrado em Ciências Farmacêuticas da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra inclui dois relatórios de estágio e uma monografia. Os relatórios de estágio, que seguem uma estrutura de análise SWOT (Strengths, Weaknesses, Opportunities and Threats), incidem sobre os estágios realizados na Indústria Farmacêutica Bluepharma Indústria Farmacêutica, S.A e em Farmácia Comunitária, na Farmác
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Gutiérrez, Laura. "Evaluación del desempeño analítico de dos ensayos inmunológicos de diferente configuración para la detección de anticuerpos anti SARS-CoV-2." Doctoral thesis, 2021. http://hdl.handle.net/11086/21904.

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Abstract:
Trabajo Integrador Final (Especialista en Virología) - - Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas, 2021<br>Calcular la sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo y valor predictivo negativo de dos ensayos inmunológicos de diferente configuración (CMIA y ELISA) para la detección de anticuerpos anti SARS CoV 2 Evaluar la concordancia analítica entre los diferentes ensayos.<br>2023-11-30<br>Fil: Gutiérrez, Laura. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas; Argentina.<br>Fil: Barbás, María G. Gobierno de la Provincia de Córdoba. Ministerio de
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Raheja, Harsha. "Deciphering the role of host protein HuR in RNA virus life cycle and pathogenesis: Hepatitis C Virus and SARS-CoV-2 as exemplars." Thesis, 2023. https://etd.iisc.ac.in/handle/2005/6167.

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Abstract:
Viruses pose a major threat to human health and the ongoing SARS-CoV-2 pandemic proves as the best evidence for that. Historically, RNA viruses have a major potential to cause such pandemics. They utilise RNA binding proteins at several stages of their life cycle. We have worked on one such RBP, ELAVL1 (also known as HuR) to study its role in life cycle and pathogenesis of two kind of RNA viruses, one which causes chronic infection, Hepatitis C Virus and the other that causes lytic infection, SARS-CoV-2. HuR is an RNA-binding protein which binds to AU-rich elements in the RNA and regulates the
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Jesus, Ana Rita Moreira Gaspar de. "O Processo de Desenvolvimento e Aprovação de Medicamentos: O Caso Particular das Vacinas COVID-19." Master's thesis, 2021. http://hdl.handle.net/10316/99135.

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Abstract:
Dissertação de Mestrado em Biotecnologia Farmacêutica apresentada à Faculdade de Farmácia<br>Um novo medicamento está sujeito a um rigoroso processo de investigação, desenvolvimento, avaliação e aprovação, por forma a garantir a sua qualidade, segurança e eficácia e o cumprimento dos requisitos exigidos pelas entidades regulamentares competente. No final do ano de 2019, foi identificado um novo coronavírus, o SARS-CoV-2. Este agente etiológico, causador da doença COVID-19, rapidamente se disseminou por todo o mundo,
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