Дисертації з теми "ARN activateur"

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Sharov, Grigory. "Etude structurale du co-activateur transcriptionnel SAGA et de son module d'acétylation des histones." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ040/document.

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Анотація:
L’initiation de la transcription chez les eucaryotes nécessite le recrutement de l'ARN polymérase II (Pol II) et des facteurs de transcription généraux sur les promoteurs de gènes formant le complexe de préinitiation (PIC). Des activateurs se lient en amont du promoteur et stimulent l’ouverture de la chromatine et la formation du PIC en recrutant des complexes coactivateurs. SAGA est un tel coactivateur, conservé chez les eucaryotes, connu pour modifier les histones de tous les gènes et impliqué dans la transcription par Pol II. Dans ce travail, j’ai analysé l'organisation moléculaire de SAGA par microscopie électronique. J'ai (i) étudié l'architecture et les interactions des sous unités du module d’acétylation des histones et l’ai localisé dans SAGA; (ii) obtenu la première carte cryo-EM du complexe SAGA chez la levure et analysé sa flexibilité; (iii) défini le site d'interaction entre TBP et SAGA et montré que le complexe subit un changement conformationnel lors de cette liaison
Transcription initiation in eukaryotes requires the recruitment of RNA polymerase II (Pol II) and general transcription factors to the promoters of protein coding genes in order to form a PreInitiation Complex (PIC). Sequence specific activators bind up stream of the promoter, stimulating chromatin opening and PIC formation via recruitment of coactivator complexes. SAGA is such a coactivator, conserved in all eukaryotes, known to modify the histones on all expressed genes in yeast and human and involved in Pol II transcription. In this work I have analyzed SAGA’s molecular organization mostly by electron microscopy. I have (i) studied the architecture and sub unit interactions of SAGA histone acetylation (HAT) module and localized it in the full SAGA complex; (ii) obtained the first cryo-EM map of yeast SAGA and analyzed its flexibility; (iii) defined the interaction site of SAGA with TBP protein and shown that the complex under goes a large conformational change upon TBP binding
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Yang, Qi. "Regulation of the yifK locus by multi-target small RNA GcvB in Salmonella." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00954416.

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Анотація:
GcvB is a conserved 200 nucleotide RNA that downregulates several genes involved in amino acid uptake or biosynthesis in bacteria. The physiological role of GcvB action is not entirely clear, but it is likely aimed at balancing of nutritional resources under fast growth conditions. GcvB inhibits translation of target messenger RNAs by pairing with sequences inside or upstream of ribosome binding sites. In the present study, characterization of a novel GcvB-regulated locus revealed some unique features in the mode of functioning of this regulatory RNA. We found that GcvB represses yifK - a highly conserved locus encoding a putative amino acid transporter - by targeting a translational enhancer element. Two ACA motifs within the target sequence are the main determinants of the enhancer activity. Replacing either of these motifs with random triplets caused up to a 10-fold decrease in yifK expression regardless of the GcvB allele (deleted or suitably modified to recognize the mutated target). It thus appears that GcvB effectiveness as a regulator results from countering the enhancer activity. When the enhancer is removed, GcvB action no longer constitutes a rate-limiting factor for yifK expression. Overall, this study is relevant not only to a better understanding of GcvB function but it also provides insight into an elusive aspect of the translation initiation process. Besides the GcvB control, the yifK locus is regulated at the transcriptional level by the leucine responsive regulator Lrp, and by HdfR (YifA) a poorly known transcriptional regulator, that appears to require the product of the adjacent, divergently oriented gene, yifE, for expression or activity. Transcription initiating at the yifK promoter extends into the adjacent argX-hisR-leuT-proM tRNA operon yielding an unusual primary transcript which both a messenger RNA and a tRNA precursor. This chimeric RNA si rapidly processed by RNAse E.
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Hache, Antoine. "Molecular basis of transcriptional dysregulations in the spinocerebellar ataxia type 7, a neurodegenerative polyglutamine disorder." Thesis, Strasbourg, 2020. http://www.theses.fr/2020STRAJ083.

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Анотація:
SCA7 est une maladie génétique dont l’un des principaux symptômes est une perte progressive d’acuité visuelle pouvant aller jusqu’à la cécité. La mutation responsible de cette pathologie est une expansion instable d’un triplet CAG au sein de l’ATXN7, gene codant une sous-unité du complexe SAGA, un co-activateur de l’ARN polymerase de type II. Des études réalisées sur modèles de souris transgéniques mirent en évidence une perte d’identité des photorécepteurs au niveau morphologique, fonctionnel, et moléculaire. Au cours de ma thèse la caractérisation d’un nouveau modèle knock-in de SCA7 fut réalisée. Ce modèle, qui exprime le gène muté à un niveau endogène récapitule les atteintes rétiniennes observées dans les modèles transgéniques et chez les patients. Une étude transcriptomique (RNA-seq) et épigénomique (ChIP-seq) de ce modèle fut réalisée et mis en évidence des défauts globaux de l’acétylation des lysines 9 et 27 de l’histone H3 (H3K9 et H3K27ac). De plus une étude plus poussée des ARNs non codants mit en évidence l’existance d’ARN enhancer (eRNA) encore non répertoriés au niveau des loci de gènes uniquement exprimés dans les photorécepteurs comme Rho, ces même eRNAs sont retrouvés dérégulés chez les animaux développant la rétinopathie SCA7
SCA7 is a genetic disorder whose one of its main symptoms is a progressive loss of visual acuity which can ultimately lead to blindness. The mutation responsible for this disease is an unstable CAG expansion within ATXN7, a gene encoding a subunit of the SAGA complex, a co-activator of the RNA polymerase II. Previous studies performed on transgenic mouse models highlighted a neuronal identity loss of the photoreceptors at the morphological, functional and molecular levels. During my PhD a characterization of a new SCA7 knock-in mouse model was performed. This model, which expresses the mutated genes at endogenous level recapitulates the retinal impairments observed in transgenic models and in patients. A transcriptomic (RNA-seq) and epigenomic (ChIP-seq) analyses were performed on this model and highlight global acetylation defects on lysine 9 and 27 of histone H3 (H3K9ac and H3K27ac). Moreover, investigations on non-coding RNAs identified the presence of enhancer RNAs (eRNAs) on photoreceptor specific genes such as Rho. These eRNAs, which were never described before, undergo a downregulation in symptomatic SCA7 mice
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Laustriat, Delphine. "Les cellules souches pluripotentes en modélisation pathologique pour l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques : application à la Dystrophie Myotonique de type 1." Thesis, Evry-Val d'Essonne, 2010. http://www.theses.fr/2010EVRY0017.

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Анотація:
La Dystrophie Myotonique de type 1 (DM1) ou maladie de Steinert est une des atteintes neuromusculaires parmi les plus fréquentes chez l’adulte et pour laquelle il n’existe de solution thérapeutique autre que symptomatique à l’heure actuelle. La mutation, une expansion instable d’un triplet CTG dans la région 3’ transcrite non traduite du gène codant la DMPK, conduit notamment à la dérégulation de protéines de liaison à l’ARN, ce qui engendre différents défauts d’épissage alternatif qui sont associés aux atteintes multisystémiques observées dans la maladie. La disponibilité d’un diagnostic préimplantatoire a permis la dérivation de lignées de cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) à partir d’embryons portant la mutation causale. Ces lignées, et désormais les cellules souches induites à la pluripotence issues de patients, constituent des sources prometteuses de modèles pour l’étude des maladies génétiques. Outre la possibilité d’étudier la pathologie dans un contexte naturel, ces cellules offrent l’accès à tous les phénotypes cellulaires sans limite quantitative. Ceci en fait un outil de choix pour les approches de criblage à grande échelle, et notamment celles de génomique fonctionnelle, qui visent à explorer de manière systématique l’implication de gènes dans une maladie. L’objectif de mes travaux de doctorat a été de démontrer l’intérêt de tels cribles en développant une approche par perte de fonction, via le mécanisme d’interférence par l’ARN (ARNi), pour identifier de nouvelles cibles thérapeutiques pour la DM1 en utilisant une lignée de CSEh exprimant la mutation causale. Après avoir identifié une population de progéniteurs mésenchymateux issus de cette lignée qui exprime deux biomarqueurs de la DM1 - les foci et le défaut d’épissage de l’INSR - et qui est adaptée à une approche de crible par transfection, mes travaux ont consisté à développer, miniaturiser puis automatiser les étapes de transfection et de détection des phénotypes pathologiques. Le crible de collections de siRNAs a permis d’identifier plusieurs gènes candidats, parmi lesquels ELAVL1 qui apparaît comme une nouvelle cible thérapeutique pour la DM1. En effet, l’extinction de son expression permet d’améliorer plusieurs défauts d’épissages et de normaliser l’anomalie de capture du glucose. Nous avons montré que l’enrichissement de sa fraction nucléaire par l’utilisation d’activateurs de l’AMPK, composés classiquement indiqués pour la prise en charge du diabète de type 2, permettait de reproduire cet effet restaurateur. Mes travaux ont ainsi montré l’intérêt d’associer, et particulièrement dans le cas des maladies rares, les approches de crible par ARNi aux cellules souches pluripotentes modèles de maladies pour l’identification de nouvelles cibles moléculaires afin d’accélérer le développement de thérapeutiques
Myotonic Dystrophy type 1 (DM1), or Steinert disease, is one of the most common neuromuscular disorders in adults for whom no therapeutic solution other than symptomatic is available at present. The mutation, which consists in an unstable CTG expansion located in the 3' transcribed but untranslated region of the DMPK gene, leads in particular to the deregulation of several RNA-binding proteins. This engenders various splicing defects that are associated to the multisystemic symptoms. The availability of a preimplantation genetic diagnosis enabled the derivation of human embryonic stem cell lines (hESC) from embryos carrying the causative mutation. These cell lines, and now the induced pluripotent stem cells established from patients, constitute promising models for genetic disease’s exploration. Besides the possibility to investigate the pathology in a natural context, these cells open the way to every cell phenotypes without any quantitative restriction and thus appear as a valuable tool for large scale screening, and particularly for functional genomics approaches that systematically explore the involvement of genes in a given phenotype. The aim of my work was to explore the potential of such an approach by developing a loss of function RNA interference screen in order to identify new therapeutic targets by using a hESC line expressing the DM1 mutation. To that purpose we first identified a disease relevant cell population, i.e. hESC derived-mesenchymal progenitors expressing two DM1 biomarkers – foci and INSR splicing defects, suitable for large scale siRNA transfection. Then we developed, miniaturized and automated the transfection’s and phenotype detection’s steps. Finally, once all the conditions determined, we conducted a screening of a siRNA library targeting RNA-binding proteins that led to the identification of several candidate genes, including ELAVL1 which appears as a new DM1 therapeutic target. Indeed, its knockdown resulted in the improvement of several pathological splicing defects and normalized the glucose uptake impairment. We also showed that the enrichment of its nuclear fraction through the use of AMPK activators, some of which being widely prescribed anti-diabetic drug, was able to mimic this corrective effect. My work thus underlies the interest of coupling RNAi screening to pathological pluripotent stem cells for the identification of new therapeutic targets with the view to accelerate drug discovery, and particularly in the case of rare diseases
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Saguy, Matthieu. "Activateurs précoces du processus de trans-traduction : rôle de la protéine ribosomique S1 et recherche d’une activité ribonucléase liée au ribosome." Rennes 1, 2008. http://www.theses.fr/2008REN1S001.

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Анотація:
Lorsque la traduction bactérienne est bloquée sur un ARN messager (ARNm) incomplet, les ribosomes sont libérés grâce à un mécanisme appelé trans-traduction. Ce système requiert le concours de l?ARN transfert-message (ARNtm) qui agit en présence de plusieurs protéines dont la protéine ribosomique S1. Des études in vitro ont permis d?établir que S1 est essentielle à la traduction du cadre interne de lecture de l?ARNtm et des études in vitro d'observer qu'une variation de son expression était néfaste à ce processus. Dans le cas d'ARNm en cours de traduction, un site de décodage libre est nécessaire au recrutement de la trans-traduction. Le facteur responsable du clivage de l'ARNm dans ce site est encore inconnu. Afin de l'identifier, un système de purification des ribosomes bloqués a été mis au point au laboratoire. Le facteur responsable de cette activité n'a pu être identifié cependant une activité exonucléase a été observée. Un modèle d'intervention de la trans-traduction a été proposé
When bacterial translation stalls on a truncated messenger RNA (mRNA), ribosomes are released by process called trans-translation. This system requires a particular ribonucleic acid: transfer-messenger RNA (tmRNA), acting in concert with several protein partners including ribosomal protein S1. In vitro studies showed that S1 is essential to the resume of translation on the internal open reading frame of tmRNA. Accordingly, any variation of the expression level of S1 in vivo is harmful to the process. Trans-translation occurs sometimes on non truncated mRNAs, which are subsequently cleaved into the ribosomal A site to trigger the process. The factor responsible of the cleavage is still unknown. In order to find out the way these mRNA are cleaved, an in vivo system allowing purification of stalled ribosomes on non truncated mRNAs was set up. No endoribonuclease could be identified, nevertheless an exonucleotytic activity was observed. A new model of trans-translation intervention was established
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Kieffer, Kyong-Rim. "Stimulation de la réparation de l'ADN par des activateurs de la transcription." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2002. http://www.theses.fr/2002STR13085.

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Анотація:
Les gènes eucaryotes sont organisés, grâce aux protéines d'histones, en une structure appelée la chromatine. La compaction de l'ADN au sein de la chromatine permet non seulement à l'ensemble du génome d'être contenu dans un noyau cellulaire mais également de restreindre l'accès de cette ADN à une multitude de protéines de régulation impliquées dans des processus essentiels tel que la réplication, la transcription ou la recombinaison. La chromatine adopte une structure dynamique capable localement de se condenser ou de se décondenser, c'est-à-dire capable de se remodeler en réponse à des signaux spécifiques. Le remodelage de la chromatine nécessite un ensemble d'enzymes spécifiques qui agit au niveau du nucléosome, unité de base de la chromatine. Ce travail montre d'une part que les processus de réparation de l'ADN sont également entravés par une structure condensée de la chromatine et d'autre part, que les enzymes de remodelage de la chromatine sont nécessaires pour permettre une fonctionnalité optimale des processus de réparation de l'ADN. L'action des enzymes de remodelage est gérée par des activateurs de la transcription, qui facilitent et stimule la réparation dans les régions promotrices des gènes. Cette stimulation est totalement indépendante des machineries d'initiation et d'élongation de la transcription et ce malgré le fait que tous ces processus coexistent. En effet des activateurs inactifs sur la transcription sont tout de même aptes à stimuler les processus de réparation de l'ADN. Il est probable que la fonction des activateurs soit double. Ils permettent une décondensation locale de la chromatine, phénomène commun à tous processus génomiques et en parallèle ou séquentiellement voir de manière coopérative recrutent les facteurs spécifiques impliqués dans la transcription, la réparation de l'ADN ou la réplication
Eukaryotic genes are contained within a higher order complex of DNA and histones called chromatin. Although packaging of DNA into chromatin provides the means for compaction of the entire genome to fit in the nucleus, it restricts the access of the many regulatory proteins required for essential biological processes such as DNA replication, transcription, and recombination. The chromatin, however, is not a static structure, but rather a dynamic assembly that condenses and decondenses (remodeling) in response to specific signals during cell life. Chromatin remodeling requires a specific set of enzymes that modify the nucleosome, the building block of chromatin. These enzymes fall into two classes: the first includes ATP-dependent chromatin remodeling activities that use energy derived from ATP hydrolysis to alter nucleosomal structure and/or arrangement, whereas the second class includes enzymes that add acetyl groups to the histone N termini. This thesis has described that DNA repair is also hindered by chromatin structure and requires a subset of chromatin remodeling enzymes from each class to optimally occur. In the promoter region, chromatin remodeling enzymes are dictated by sequence-specific activators, resulting in facilitated damage removal in the proximity of transcription initiation site. The mechanism of this preferential repair is independent of transcription machinery and transcription per se, although two events pass on the same template. Furthermore, transcriptionally inactive activator accomplishes the stimulation of repair by binding to its cognate sequences. It is likely that the function of activators is dual : (i) they help to derepress chromatin, a step common to DNA processes, (ii) in parallel or subsequently, and possibly in a cooperative manner according to activities demanded by the surrounding DNA, they recruit specific factors involved in transcription, DNA repair or replication
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Diouf, Sarah. "Le co-activateur transcriptionnel CREB-binding protein (CBP) : un nouvel acteur de la fonction mitochondriale." Thesis, Toulouse 3, 2018. http://www.theses.fr/2018TOU30050.

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Анотація:
De par son activité acétyltransférase et sa capacité à interagir avec un très grand nombre de facteurs de transcription, CBP (CREB Binding Protein également appelé KAT3A) co-active la transcription de nombreux gènes. De ce fait, CBP est impliqué dans des processus physiologiques variés tels que la prolifération, la différentiation ou l'apoptose, mais également dans certaines pathologies (cancers, syndrome de Rubinstein-Taybi, ...). Il a notamment été montré que CBP régulait la myogenèse, processus conduisant à la formation des muscles au cours de l'embryogenèse et chez l'adulte au cours de la régénération. L'étude du rôle de CBP au cours de ce processus a été réalisée en utilisant des myoblastes primaires humains comme modèle. L'analyse de l'expression et de la localisation subcellulaire de CBP dans ces cellules a permis d'observer qu'une fraction de la protéine se relocalisait dans les mitochondries au cours de la différenciation myogénique. Mes travaux de thèse ont consisté à étudier ce rôle inédit de CBP hors du noyau et en particulier dans les mitochondries. Les mitochondries possèdent leur propre génome et une de leurs fonctions principales est de produire l'énergie nécessaire au fonctionnement cellulaire. Nous avons pu montrer que l'adressage de CBP aux mitochondries est dépendant de l'état métabolique des cellules. Nous avons également montré que CBP, ainsi que son activité acétyltransférase, étaient impliqués dans la régulation de la réplication et de la transcription de l'ADN mitochondrial. Nos résultats indiquent aussi que CBP participe au contrôle de la respiration mitochondriale et ainsi à la production d'énergie via la phosphorylation oxydative. Pour finir, nous avons montré que CBP est présent dans les mitochondries d'autres types cellulaires et d'autres espèces, suggérant que CBP aurait un rôle important et conservé dans le contrôle de la fonction mitochondriale
CBP (CREB Binding Protein also called KAT3A) is a nuclear co-activator with an acetyltransferase activity. It interacts with a large number of transcription factors and thus regulates the transcription of many genes thereby being involved in a wide range of processes (proliferation, differentiation, apoptosis ...). CBP expression is also deregulated in several pathologies such as Rubinstein-Taybi Syndrome or cancers. For instance, CBP has been shown to regulate myogenesis, i.e. the formation of muscles during embryogenesis and during regeneration in adults. In this work, we studied the role of CBP in this process using human primary myoblasts as a model. The analysis of CBP expression and sub-cellular localization in these cells showed that a fraction of the protein is found inside mitochondria. This finding suggests for the first time a role of this well-known nuclear co-activator outside of the nucleus. Hence, my Ph.D. project focused on deciphering the functions of CBP in this organelle. Mitochondria have their own genome and one of their main functions is to produce the energy required for the cell functions. We have shown that the cellular metabolic state controls the import of CBP into mitochondria. We also found that CBP and its acetyltransferase activity regulate the mitochondrial DNA replication and transcription. Furthermore, our results indicate that CBP is involved in the regulation of mitochondrial oxidative phosphorylation and therefore in the energy production. Finally, we show that CBP is also in mitochondria in other cell types and in other species, strongly suggesting that CBP functions in mitochondria are important and conserved
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Jomrich, Gerd, Florian Maroske, Jasmin Stieger, Matthias Preusser, Aysegül Ilhan-Mutlu, Daniel Winkler, Ivan Kristo, Matthias Paireder, and Sebastian Friedrich Schoppmann. "MK2 and ETV1 Are Prognostic Factors in Esophageal Adenocarcinomas." IVyspring International Publisher, 2018. http://dx.doi.org/10.7150/jca.22310.

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Анотація:
Background. Esophageal cancer is ranked in the top ten of diagnosed tumors worldwide. Even though improvements in survival could be noticed over the last years, prognosis remains poor. ETS translocation variant 1 (ETV1) is a member of a family of transcription factors and is phosphorylated by mitogen-activated protein kinase (MAPK)-activated protein kinase 2 (MK2). Aim of this study was to evaluate the prognostic role of MK2 and ETV1 in esophageal cancer. Methods. Consecutive patients that underwent surgical resection at the department of surgery at the Medical University of Vienna between 1991 and 2012 were included into this study. After microscopic analysis, tissue micro arrays (TMAs) were created and immunohistochemistry was performed with antibodies against MK2 and ETV1. Results. 323 patients were included in this study. Clinical data was achieved from a prospective patient data base. Nuclear overexpression of MK2 was observed in 143 (44.3%) cases for nuclear staining and in 142 (44.0%) cases a cytoplasmic overexpression of MK2 was observed. Nuclear and cytoplasmic ETV1 overexpression was detected in 20 cases (6.2%) and 30 cases (9.3%), respectively. In univariate survival analysis, cMK2 and nETV1 were found to be significantly associated with patients' overall survival. Whereas overexpression of cMK2 was associated with shorter, nETV1 was associated with longer overall survival. In multivariate survival analysis, both cMK2 and nETV1 were found to be independent prognostic factors for the subgroup of EAC as well. Discussion. Expression of MK2 and ETV1 are prognostic factors in patients, with esophageal adenocarcinoma.
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Mikaelian, Ivan. "Identification des domaines fonctionnels de la protéine EB1, activateur des gènes précoces du virus d'Epstein-Barr." Lyon 1, 1992. http://www.theses.fr/1992LYO1T178.

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Gruffat, Henri. "Caractérisation fonctionnelle des éléments géniques transmettant l'effet activateur du facteur de transcription R codé par le virus d'Epstein-Barr." Lyon 1, 1991. http://www.theses.fr/1991LYO1T128.

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Lemadre, Elodie. "Nouveaux rôles anti-tumoraux de STAT1 : expression des immunoglobulines et réparation de l'ADN." Thesis, Paris 13, 2014. http://www.theses.fr/2014PA132020/document.

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Le facteur de transcription STAT1 est un effecteur majeur de la réponse à l’interféron exerçant ainsi un rôle clé dans l’immunité innée. Il est également un suppresseur de tumeur et régule des effets antiprolifératifs et pro-apoptotiques. Afin de mettre en évidence de nouvelles implications anti-tumorales de STAT1, ce projet de doctorat a porté sur son implication fonctionnelle i) dans l’expression des immunoglobulines (Ig), processus essentiel de l’immunité adaptative et ii) dans la réponse cellulaire aux traitements par les agents génotoxiquesNotre étude cinétique, après induction de l’expression de STAT1 dans des cellules initialement totalement déficientes, a montré son implication dans l’expression des IgG membranaires. Le mécanisme régulateur est indirect : il impliquerait une inhibition de l’activation de STAT3 conduisant à l’inhibition de l’expression de BLIMP1, un acteur essentiel de la différenciation plasmocytaire. La capacité de STAT1 à pouvoir se fixer sur le promoteur de BLIMP1, de même que STAT3 n’exclut pas une implication transcriptionnelle.Au cours d’un traitement génotoxique par le MNNG, nous avons décrit la participation de STAT1 à un complexe de réparation de l’ADN. Seule la présence de STAT1 permet l’intégration au complexe MLH1/p53 de la kinase c-Abl. Dans ce contexte, on observe une cytotoxicité sous le contrôle de l’activité kinase de c-Abl, une réparation rapide et efficace de l’ADN, un arrêt seulement transitoire du cycle et une orientation vers la survie cellulaire équivalent à une résistance à ce traitement.Ces résultats mettent en évidence deux nouveaux rôles anti-tumoraux de STAT1 par sa contribution à des complexes régulateurs essentiels et la désigne comme une potentielle cible thérapeutique
The transcription factor STAT1, as a major effector of interferon, plays a key role in innate immunity. Through its strong anti-proliferative and pro-apoptotic properties STAT1 is also considered as a tumor suppressor. The aim of this project was to delineate new potential tumor suppressor properties for STAT1 in two signaling mechanisms: i) Ig expression in plasmacytoid cells and ii) cellular response to genotoxic stress.Our kinetic experiments, upon “de novo” expression of STAT1 in a rare STAT1-deficient cell line showed its modulation of membrane IgG expression. The underlying mechanism involves a STAT1-dependent inactivation of STAT3 and subsequently a decreased expression of BLIMP1, a major contributor to plasma cell differentiation. Since STAT1, like STAT3, is able to bind to the BLIMP1 promoter elements a transcriptional interference cannot be excluded.During alkylating agent treatment with MNNG we have observed the presence of STAT1 in DNA repair complex. STAT1 expression allows the recruitment into a MLH1/p53 complex of the kinase c-Abl. This complex leads to cytotoxic dependence on c-Abl kinase activity, an efficient DNA repair with a transient cell cycle arrest and to signaling mechanisms toward cell survival. At longer term of exposure STAT1 also lead to cellular resistance to treatment.These results provide evidences for new anti-tumor roles of STAT1 in two major regulatory systems and indicate STAT1 as a potential therapeutic target
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Crotty, Christopher M. "Two distinct outward K+ conductances are simultaneously activated in TBY-2 suspension culture protoplasts." Thesis, McGill University, 2001. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=38174.

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Two kinetically and pharmacologically distinct outward K+ conductances were found to be simultaneously activated at the plasma membrane of TBY-2 suspension culture protoplasts using the whole-cell patch-clamp technique. We used a modified Hodgkin-Huxley model to quantify the activation kinetics of the outward current. Time constants for the two conductances derived from the model differed in magnitude by 5--10 fold over the voltage range from -10 mV to +50 mV, allowing their classification as either fast or slow. Deactivation kinetics were better fit by two exponential terms rather than one, yielding fast and slow deactivation time constants. The voltage dependence of time constants derived from these two independent two-channel models followed a bell-shaped distribution with mid-point potentials for both components at -20 mV with a standard 10-fold K+ gradient (10 K+o/100K+i).
Both components were highly K+-selective, however the tail current amplitudes of the slowly activating component at hyperpolarized potentials exhibited non-linear rectification whereas the tail current amplitudes of the fast activating component were linear. The ratio of inward tail current/activated outward current (envelope of tails test) was not constant during the depolarizing step; during the first 50--100 milliseconds the ratio was 6 times higher than at quasi-steady-state (i.e. after 0.3 second).
A pharmacological dissection of outward currents revealed that external Ba2+ in the range from 10 muM to 1 mM selectively inhibited a fast, sigmoidally activating, slowly inactivating current as revealed by examining difference currents. The more slowly activating component was inhibited by only 20% with 5 mM Ba2+. Conversely, nitrendipine or bepridil (5--100 muM) selectively inhibited the slower component of outward current. External TEA inhibited both the fast and slow components equally; tail current amplitudes of both components were inhibited by 40% with 2 mM TEA and the activation time courses in the presence of TEA conserved the same kinetic parameters as control currents.
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Weißenberg, Sarah Yasmin [Verfasser], Thomas [Akademischer Betreuer] Dörner, Roland [Gutachter] Lauster, and Thomas [Gutachter] Dörner. "CD40 stimulation activates ‘post-activated’ B Cells which are hyporesponsive to B Cell receptor and toll-like receptor 9 stimulation in autoimmunity / Sarah Yasmin Weißenberg ; Gutachter: Roland Lauster, Thomas Dörner ; Betreuer: Thomas Dörner." Berlin : Technische Universität Berlin, 2021. http://d-nb.info/1226852769/34.

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McDonald, John Tyson. "The Nrf2/ARE pathway influences intrinsic radiosensitivity and is activated by exposure to ionizing radiation." Diss., Restricted to subscribing institutions, 2009. http://proquest.umi.com/pqdweb?did=1930285351&sid=1&Fmt=2&clientId=1564&RQT=309&VName=PQD.

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Sütterlin-Diradourian, Claire. "Implication de la protéine ZIP/p62 dans la régulation, par la p38-MAPK, de l'activité transcriptionnelle du récepteur nucléaire PPARalpha." Paris 7, 2006. http://www.theses.fr/2006PA077060.

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Le récepteur activé par les proliférateurs de péroxysomes alpha (PPARa) appartient à la famille des récepteurs nucléaires et joue un rôle majeur dans la régulation du métabolisme des lipides, de l'homéostasie glucidique et des processus inflammatoires. En plus de son activation par un ligand, PPARa est également contrôlé par des processus post-traductionnels comme la phosphorylation. Dans le foie, PPARa est phosphorylé par des kinases comme les MAPKs, la PKA et la PKC. Le but de ce travail était d'étudier l'effet de la p38-MAPK sur l'activité transcriptionnelle de PPARa. Nous avons tout d'abord montré que, dans des cellules COS-7, un activateur de la p38-MAPK, l'anisomycine, phosphorylait PPARa de manière dose dépendante et inhibait de 50% son activité transcriptionnelle. Deuxièmement, dans des hépatomes, la phosphorylation de la p38-MAPK induite par l'anisomycine entraîne une diminution de l'expression endogène de la L-CPT I (liver-carnitine palmitoyltransferase), un gène cible de PPARa. Troisièmement, nous avons démontré que l'interaction PPARa/p38-MAPK nécessite un adaptateur, la protéine ZIP (zêta PKC-interacting protein). En effet, des expériences de co-immunoprécipitation nous ont permis de mettre en évidence une interaction trimèrique entre PPARa, la p38-MAPK et ZIP. Enfin, en diminuant l'expression de ZIP à l'aide d'un siRNA, nous avons observé une réduction de l'effet inhibiteur de l'anisomycine sur l'expression du gène codant la L-CPT I. En conclusion, nous avons montré que l'activation de la p38-MAPK induisait une phosphorylation de PPARa et une inhibition de son activité transcriptionnelle secondairement à la formation d'un trimère PPARa/ZIP/p38-MAPK
The peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARa) belongs to the nuclear receptor family and plays a central role in the regulation of lipid metabolism, glucose homeostasis an inflammatory processes. In addition to its ligand-induced transcriptional activity, PPARa is also regulated by phosphorylation. In the liver, PPARa is phosphorylated by kinases such as ERK mitogen-activated protein kinases (MAPK), cAMP-dependent protein kinase (PKA) and calcium dependent protein kinase (PKC). The aim of this work was to examine the effect of p38-MAPK on PPARa transcriptional activity. Firstly, we showed that in COS-7 cells, the p38-MAPK activator anisomycin, phosphorylated PPARa in a dose dépendent manner and inhibited by 50% its transcriptional activity. Secondly, in H4IIE hepatoma cells, anisomycin-induced p38-MAPK phosphorylation decreased the endogenous mRNA and protein expression levels of liver carnitine palmitoyltransferase I (L-CPTI), a PPARa target gene. Thirdly, we demonstrated that PPARa/p38 MAPK interaction required a molecular adapter, the zeta PKC-interacting protein (ZIP). Indeed using co-immunoprecipitation assays, we found a trimeric interaction between PPARa, p38-MAPJ and ZIP. Finally, reducing ZIP expression by siRNA, impaired L-CPTI gene expression in response to anisomycin. In conclusion, we showed that p38-MAPK activation induced PPARa phosphorylatio and inhibition of its transcriptional activity through a trimeric interaction between thé p38-MAPK, ZlP and PPARa
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Taylor, Patricia R. "J-LEAPS VACCINES ARE SUFFICIENT TO ACTIVATE AND DIRECT AN IMMUNE RESPONSE THROUGH DENDRITIC CELLS." Kent State University / OhioLINK, 2010. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=kent1278684731.

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López, López Carlos. "Factor de transcripción ACII ("Activator of Class II"), El. Formas proteicas, estructura y unión al ADN." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2002. http://hdl.handle.net/10803/3003.

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Las principales funciones del sistema inmunitario son: el reconocimiento de lo propio frente a lo extraño, la eliminación de lo extraño y la reparación de los tejidos dañados. En los macrófagos, los Ags son fagocitados y degradados en péptidos lineales más pequeños que serán presentados por las moléculas de clase II del MHC (Complejo Mayor de Histocompatibilidad) y son reconocidos por las moléculas del denominado TCR (receptor de las células T).
Las moléculas del MHC de clase II se expresan en un reducido número de tipos celulares y estos se pueden dividir en dos grupos principales: aquellos que expresan estas moléculas de una forma constitutiva como son los linfocitos B y las células dendríticas, y aquellas que expresan las moléculas de clase II tras la estimulación con IFN-gamma como son los macrófagos, los fibroblastos y las células tímicas epiteliales. En todos los promotores de los diferentes genes de clase II tanto en humanos como en ratón se pueden encontrar en situación cis una serie de elementos comunes: En la región proximal se encuentran 3 elementos reguladores denominados W, X e Y cuya orientación, posiciones relativas y distancia entre sí están conservadas en todos los genes de clase II, tanto en las cadenas alpha como beta, y en todas las especies examinadas. Esto también es así también para la cadena invariante aunque se encuentra codificada en otro cromosoma diferente al de los genes del MHC. En la región distal contiene los mismos elementos reguladores que la región proximal pero en sentido inverso actuando como región represora. La regulación de los genes de clase II del MHC es mayoritariamente transcripcional aunque también existe una regulación a nivel traduccional. El factor que determina la expresión específica de las moléculas de clase II es el CIITA por activador transcripcional de clase II. El CIITA es un transactivador que no interacciona directamente con el ADN pero si con los factores constitutivos, con la maquinaria general de transcripción y con factores implicados en el remodelado del ADN. La expresión del factor CIITA está regulada por el uso de diferentes regiones promotoras. Quedan por definir todas las proteínas que intervendrían en la especificidad e inducibilidad del CIITA. En nuestro grupo una de la líneas de investigación es la del estudio de la regulación de la expresión de las moléculas de clase II. Mediante el rastreo de una genoteca murina de expresión con una sonda que contenía la secuencia de la caja X del gen IA beta nuestro grupo clonó un factor denominado ACII por activador de clase II que pensamos está implicado en la regulación de los genes de clase II.
El factor ACII presenta una localización nuclear y en los tipos celulares que expresan ACII, observamos el mismo patrón de cuatro formas proteícas y en ningún caso detectamos la forma proteica de 42.3 KDa que solamente la detectamos in vitro. Por lo que la forma de hACII.2 se corresponde con un mRNA no procesado mientras que hACII.1 sufre un procesamiento de 320 nt similar al caso murino donde se eliminan 260 nt. Se ha identificado el dominio hélice-giro-hélice de ACII como responsable de la unión al ADN. Además existen tres dominios LRR y un dominio rico en prolina que podrían mediar interacciones de tipo proteína-proteína. Mediante la utilización de diversas estrategias no hemos identificado ninguna proteína con la suficiente similitud con ACII para formar parte de una misma familia de factores de transcripción y mediante la técnica de la PCR-SITE SELECTION se ha identificado el motivo ACAA como el más afín en la unión al ADN del Factor ACII.
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Traboulsi, Hussein. "Relationship between the transcription/DNA repair factor TFIIH and the Peroxisome Proliferator-Activated Receptor coactivator 1α PGC-1α". Strasbourg, 2011. http://www.theses.fr/2011STRA6063.

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Des mutations dans la sous unité XPD du facteur de transcription IIH (TFIIH) conduit à des maladies génétiques rares incluant trichothiodystrophy TTD. Connaissant que la sous unité MAT1 de TFIIH est nécessaire pour une activité complète de l’activateur proliferator activated receptor g coactivator 1a (PGC-1a), on a décidé de regarder l’influence de la mutation R722W dans XPD sur l’activité de PGC-1a dans les hépatocytes TTD. Nos résultats montrent que le facteur transcriptionnel TFIIH est nécessaire pour l’activité hépatique du cofacteur PGC-1α dans la voie de la néoglucogenèse. En plus on montre que la mutation R722W dans la sous unité XPD du TFIIH perturbe l’interaction du PGC-1α avec SIRT1, dérégulant par ca l’activité du PGC-1α. Etant PGC-1α un régulateur important du métabolisme du glucose et des lipides, nos résultats permet donc de suggérer un lien entre les symptômes liés à un défaut du métabolisme observés chez les patients TTD et le dérèglement du comportement du PGC-1α. Des études ultérieures seront nécessaires pour mieux comprendre le mécanisme d’activation du PGC-1α par TFIIH, surtout voir si ca implique un lien directe entre SIRT1 et TFIIH. Il est ainsi important d’analyser si d’autres voies du PGC-1α sont aussi affectées
Mutations in the subunit XPD of the transcription factor IIH (TFIIH) lead to genetic disorders including trichothiodystrophy TTD. Knowing that subunit MAT1 of TFIIH is required for the full function of the proliferator activated receptor γ coactivator 1 α (PGC-1α), we decided to study the influence of the mutation R722W in XPD on PGC-1α activity. Using immortalized hepatocytes isolated from TTD mutant mice, we investigated the expression of PGC-1α target genes involved in gluconeogenesis. We observed that these genes are downregulated in TTD hepatocytes. Moreover, we found that XPD mutation disrupted the interaction between PGC-1α and the deacetylase Sirtuin1 (SIRT1) leading to reduced activation of PGC-1α. We also showed that PGC-1α and SIRT1 both interact with TFIIH. We thus established that TFIIH is required for full PGC-1α activity in the gluconeogenesis pathway, and more likely through modulation of SIRT1 activity. Therefore, our results suggest that the deregulation in TTD likely results from the inability of the mutated TFIIH to fully participate in recruitment of PGC-1α and/or SIRT1 to the DNA
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Galão, Rui Pedro Ribeiro. "Role of the cellular decapping activator LSM1-7 complex in the replication of positive-strand RNA viruses." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2010. http://hdl.handle.net/10803/7222.

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By using the ability of the positive-strand RNA ((+)RNA) virus BMV to replicate in yeast it was previously shown that subunits of the LSm1-7 ring, as well as Pat1 and Dhh1 play an essential role in the transit of the BMV genome from translation to replication. In non-infected cells, these proteins mediate the transition of cellular mRNAs from a translational to a non-translational state by activating decapping in the 5'-3' - deadenylation-dependent mRNA decay pathway. Given the conservation of this pathway from yeast to humans and the common need of all (+)RNA viruses to regulate the transition of their genomes from active translation to a translationally inactive state to allow replication, an exciting possibility, and our working hypothesis, was that LSm1-7, Dhh1 and Pat1 are used not only by BMV to replicate in yeast but also by human (+) RNA viruses, such as HCV, to replicate in mammalian cells. Furthermore, given the key role of these proteins in a common step to all (+)RNA viruses, it is essential to characterize the not yet defined molecular mechanisms associated with such function. In this regard, we also hypothesized that the LSm1-7 complex, as member of the Sm family of proteins, would directly interact with viral genomes of (+)RNA viruses in order to play their role in the virus life cycle in a similar way that other family counterparts directly interact with their RNA targets in order to achieve their different cellular functions. In this work we were able to confirm both hypothesis showing that human homologues of the upper mentioned proteins LSm1-7, Rck/p54 and PatL1, are required for HCV RNA translation and replication. Additionally, we also showed that reconstituted LSm1-7 complexes specifically recognize important signals, either in BMV or HCV genomes, that regulate their translation and/or replication. These observations constitute the first evidence that the LSm1-7 complex is able to directly interact with viral genomes representing also novel LSm1-7 interaction sites. Given the common replication strategies of (+)RNA viruses and the conserved cellular functions of LSm1-7, Pat1 and Dhh1 from yeast to humans, our findings pinpoint a weak spot that may be exploited to generate broad-spectrum antiviral drugs.
Utilizando la capacidad del BMV, un virus de ARN de cadena positiva (ARN(+)), para replicar en levaduras se ha demostrado previamente que las subunidades del anillo LSm1-7, así como Pat1 y Dhh1, desempeñan un papel esencial en la transición del genoma del virus de BMV desde traducción a replicación. En células no infectadas, estas proteínas median la transición de ARNm celulares de la traducción a un estado de no-traducción mediante la activación del proceso de decapping en la via 5'-3' de degradación de los ARNs celulares dependiente de deadenilación. Teniendo en cuenta la conservación de esta vía desde levaduras a humanos y la necesidad común de todos los virus ARN(+) para regular la transición de sus genomas desde un estado activo de traducción a otro no activo para permitir la replicación, una posibilidad interesante, y nuestra hipótesis de trabajo, es que LSm1-7, Dhh1 y Pat1 son utilizadas no solo por BMV para replicar en levaduras, sino también por otros virus ARN(+) que infectan a humanos, como el virus de la hepatitis C, para replicar en células de mamíferos. Por otra parte, dado el papel clave de estas proteínas en un paso común en todos los virus de ARN(+), es esencial caracterizar los mecanismos moleculares aun no conocidos y asociados a dicha función. En este sentido, también estudiamos la hipótesis de que el complejo LSm1-7, como miembro de la familia de proteínas Sm, pueda interactuar directamente con los genomas virales de virus de ARN(+) con el fin de desempeñar su papel en el ciclo de vida del virus de una manera similar a la que otros miembros de su familia interactúan con sus ARN con el fin de lograr sus diferentes funciones celulares. En este trabajo hemos podido confirmar ambas hipótesis demostrando que los homólogos humanos de las proteínas anteriormente mencionadas, LSm1-7, Rck/p54 y PatL1, son necesarios para la traducción y replicación del ARN del virus de la Hepatitis C. Por otra parte, los anillos reconstituidos de LSm1-7 reconocen específicamente señales importantes, tanto en el genoma de BMV como en el de la Hepatitis C que regulan su traducción y/o replicación. Estas observaciones constituyen la primera evidencia de que el complejo LSm1-7 es capaz de interactuar directamente con genomas virales y representan también novedosos patrones de interacción de este complejo con ARN. Teniendo en cuenta las estrategias de replicación en común de los virus de ARN de cadena positiva y las funciones celulares conservadas de LSm1-7, Pat1 y Dhh1 de levaduras a humanos, nuestros resultados señalan la posibilidad de explotar estas proteínas para la generación de medicamentos antivirales de amplio espectro.
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Matias, Madeleine Gundayao. "Animal calcium release-activated calcium (CRAC) channels are homologous and derived from the ubiquitous Cation Diffusion Facilitators." Diss., Connect to a 24 p. preview or request complete full text in PDF format. Access restricted to UC campuses, 2008. http://wwwlib.umi.com/cr/ucsd/fullcit?p1453033.

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Thesis (M.S.)--University of California, San Diego, 2008.
Title from first page of PDF file (viewed June 25, 2008). Available via ProQuest Digital Dissertations. Includes bibliographical references (p. 48-51).
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Hirata, Hirokazu. "Caspases are Activated in a Branched Protease Cascade and Control Distinct Downstream Processes in Fas-induced Apoptosis." Kyoto University, 1998. http://hdl.handle.net/2433/182269.

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Busso, Nathalie. "Expression des activateurs du plasminogène dans la pathophysiologie de la glande mammaire." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376035296.

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Rondeau, Eric. "Les Activateurs du plasminogène du rein humain identification, localisation, facteurs de secrétion /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37609458z.

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Xia, Changlei. "Biomass-Derived Activated Carbon Through Self-Activation Process." Thesis, University of North Texas, 2016. https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc849716/.

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Self-activation is a process that takes advantage of the gases emitted from the pyrolysis process of biomass to activate the converted carbon. The pyrolytic gases from the biomass contain CO2 and H2O, which can be used as activating agents. As two common methods, both of physical activation using CO2 and chemical activation using ZnCl2 introduce additional gas (CO2) or chemical (ZnCl2), in which the CO2 emission from the activation process or the zinc compound removal by acid from the follow-up process will cause environmental concerns. In comparison with these conventional activation processes, the self-activation process could avoid the cost of activating agents and is more environmentally friendly, since the exhaust gases (CO and H2) can be used as fuel or feedstock for the further synthesis in methanol production. In this research, many types of biomass were successfully converted into activated carbon through the self-activation process. An activation model was developed to describe the changes of specific surface area and pore volume during the activation. The relationships between the activating temperature, dwelling time, yield, specific surface area, and specific pore volume were detailed investigated. The highest specific surface area and pore volume of the biomass-derived activated carbon through the self-activation process were up to 2738 m2 g-1 and 2.209 cm3 g-1, respectively. Moreover, the applications of the activated carbons from the self-activation process have been studied, including lithium-ion battery (LIB) manufacturing, water cleaning, oil absorption, and electromagnetic interference (EMI) shielding.
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Trambakoulos, Dimitra Mimi. "Cardiovascular effects of activated coagulation FXII, 'new pressor protein' (NPP), are associated with potent adrenal medullary catecholamine release." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp01/MQ46164.pdf.

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Sutton, Kate Maurice. "Functions of receptor activator of NF-κB ligand (RANKL) and its receptors, RANK and OPG, are evolutionarily conserved". Thesis, University of Edinburgh, 2014. http://hdl.handle.net/1842/10041.

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The tumour necrosis factor (TNF) superfamily is a group of cytokines that orchestrate a variety of functions, both in the development of the architecture of immune organs and of the immune response. The mammalian TNF superfamily consists of 19 ligands and 29 receptors, whereas in the chicken only 10 ligands and 15 receptors are present. Chickens do not develop lymph nodes, possibly due to the absence of the lymphotoxin genes (TNF superfamily members) in their genome. New members of the chicken TNF superfamily have recently been identified in the genome, namely chicken receptor activator of NF-κB ligand (chRANKL), its signalling receptor, chRANK, and its decoy receptor, osteoprotegerin (chOPG). In mammals, RANKL and RANK are transmembrane proteins expressed on the surface of Th1 cells and mature dendritic cells (DC), respectively. OPG is expressed as a soluble protein from osteoblasts and DC, regulating the interaction between RANKL and RANK. To investigate the bioactivity of this triad of molecules, the extracellular soluble domains of chRANKL and chRANK and full-length chOPG were identified and cDNAs cloned. ChRANKL, chRANK and chOPG mRNA are ubiquitously expressed across non-lymphoid and lymphoid tissues and immune cells in the chicken. Similar to mammals, chRANK and chOPG mRNA expression levels are upregulated in mature bone marrow-derived DC (BMDC). ChRANKL transcription is regulated by Ca2+-mobilisation and is further enhanced by the activation of the protein kinase C pathway, as seen in mammals. The biological activities of chRANKL, chRANK and chOPG were investigated by the production of recombinant soluble fusion proteins. The extracellular, TNF-homology, domain of chRANKL (schRANKL) was sub-cloned into a modified pCI-neo vector expressing an in-frame isoleucine zipper to encourage trimer formation. FLAG-tagged schRANKL produced in COS-7 cells predominantly forms homotrimers and chOPG is expressed as homodimers, both signatures of their mammalian TNF superfamily orthologues. SchRANKL enhances the mRNA expression levels of pro-inflammatory cytokines in mature BMDC and BM-derived macrophages (BMDM). Pre-incubation with soluble chRANK-Fc or chOPG-Fc blocked the schRANKL-mediated increase in pro-inflammatory cytokine mRNA expression levels in BMDC. Expression of surface markers on BMDC and BMDM were not affected by schRANKL treatment. SchRANKL enhances the survival rates of BMDC and BMDM and can drive osteoclast differentiation from monocyte/macrophage progenitor cells. The chRANKL signalling receptor, chRANK, does not contain an intracellular catalytic domain but requires the binding of intracellular TNF receptor-associated factors (TRAF) to initiate signalling. TRAFs are a family of seven proteins (TRAF1-7) grouped due to their highly conserved RING domains, zinc finger domains, TRAF-N and TRAF-C domains. ChRANK possesses four of the five TRAF peptide-binding motifs found in mammalian RANK. The "missing" chRANK TRAF peptide-binding motif is TRAF6-specific, a vital protein for RANKL-mediated osteoclastogenesis. All seven members of the mammalian TRAF family are present in the chicken genome. To investigate the conservation of RANK-specific TRAF signalling proteins, chicken TRAF2 (chTRAF2), chTRAF5, chTRAF6 and a newly found member, chTRAF7, were identified and their cDNAs cloned. ChTRAF5, chTRAF6 and chTRAF7 had mRNA expression patterns, in non-lymphoid and lymphoid tissues and in a number of immune cells, similar to their orthologues in mammals. Interestingly, chTRAF2 has two variants, the full-length chTRAF2 and a novel isoform (chTRAF2S) lacking exon 4. ChTRAF2S lacks a portion of zinger finger one, all of zinc finger two and a portion of zinc finger three, producing a protein with a hybrid of zinc fingers 1 and 3 and intact zinc fingers 4 and 5. RT-PCR analyses indicated differential expression of both of the chTRAF2 isoforms in a number of non-lymphoid and lymphoid tissues, splenocyte subsets and in a kinetic study of ConA-stimulated splenocytes. ChTRAF2S is biologically active compared to chTRAF2, inducing higher levels of NF-κB activation. Co-transfections indicate that chTRAF2 may regulate chTRAF2S bioactivity as no synergistic effect was identified when cells were transfected with both isoforms. Knowledge gained from this study will help work to further dissect the interactions between chRANKL-expressing T cells and chRANK-expressing DC to drive Th1 immune responses and to understand how the chicken mounts an effective immune response while expressing a minimal essential repertoire of the TNF superfamily.
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Sudalaiyadum, Perumal Ayyappasamy. "Role of the activator protein RbpA from Mycobacterium tuberculosis in transcription regulation." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT092/document.

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La polymérase d'A.R.N. la protéine obligatoire (le RbpA) est l'activateur transcriptional global (mondial) de l'espèce actinomycetes qui est essentielle pour la croissance et qu'augmente la tolérance de bactéries aux antibiotiques. RbpA de la tuberculose Mycobacterium (Mtb) stimule spécifiquement la transcription par la polymérase d'A.R.N. (RNAP) contenant σA ou les sous-unités σB, mais aucune de la 11 autre alternative σ des facteurs. Il a été rapporté que le fonctionnement de RbpA est dépendant de promoteur et c'est indispensable pour le déroulement de promoteur du promoteur sigAP constitutif.Pour déchiffrer la nature de spécificité de promoteur de RbpA, nous avons utilisé des essais biochimiques, mutagensis et des approches de génomique. Nous avons identifié ce remplacement 'TG' le motif entre-14 à-17 positions (postes) dans le promoteur sauvage-type sigAP fait la transcription indépendante de RbpA. Aussi, nous avons montré que la capacité d'augmentations de RbpA de RNAP pour fondre le promoteur sigAP aux températures sous-optimales et stabilise des complexes de promoteur. Mutational l'analyse de résidus d'acide aminé H166 et E169 dans la région σB 3.0 (σR3.0) a démontré une implication de σR3.0 dans la stabilisation RbpA-servie-d'intermédiaire de complexes de promoteur RNAP. Plus loin, la substitution à RbpA au résidu d'acide aminé R79 a affecté la stabilité complexe de promoteur, tandis que les substitutions à RbpA resdiues K73, K74 a affecté l'initiation de transcription. Cependant, aucun des mutants RbpA n'a étudié l'ouverture ici affectée de l'ADN de promoteur par RNAP. Les rôles différentiels joués par ces résidus RbpA dans la stabilisation de complexe de promoteur et l'initiation de transcription ensemble avec l'effet produit par les mutations σB suggèrent l'implication de R3.0 σB dans l'action de RbpA. Ensuite, nous avons exécuté la large de génome cartographie des gènes RbpA-dépendants du σB regulon en utilisant une Analyse de Puce à ADN de Finale(d'Écoulement) in vitro (des ROMS). L'analyse ROM a montré la preuve claire de 15 augmentation de pli du nombre de gènes activés par σB-RNAP en présence de RbpA. L'analyse de bio-informatique de 140 gènes contrôlés par la paire de RbpA-σB nous a permis d'identifier la signature caractéristique dans le-10 consensus ('TANNNT') spécifique à la sous-unité σB.Notre étude sur l'impact d'échelle de génome de RbpA, ensemble avec le déchiffrement du mécanisme moléculaire d'action de RbpA, souligne une importance de l'interaction entre σR3.0 et RbpA dans la transcription Mtb. Basé sur nos résultats nous proposons que RbpA puisse jouer un rôle du remplacement(remplaçant) fonctionnel pour-10 motifs prolongés(étendus) dans l'espèce mycobacterium
RNA polymerase binding protein A (RbpA) is global transcriptional activator from actinomycetes species which is essential for growth and which increases tolerance of bacteria to antibiotics. RbpA from Mycobacterium tuberculosis (Mtb) specifically stimulates transcription by RNA polymerase (RNAP) containing either the σA or σB subunits but none of the other 11 alternative σ factors. It has been reported that the functioning of RbpA is promoter-dependent and it is indispensible for promoter unwinding of the constitutive sigAP promoter. To decipher the nature of promoter specificity of RbpA, we used biochemical assays, mutagensis and genomics approaches. We found that placing ‘TG-motif' between -14 to -17 positions in sigAP wild-type promoter makes transcription independent of RbpA. Also, we have shown that RbpA increases ability of RNAP to melt sigAP promoter at sub-optimal temperatures and stabilises promoter complexes. Mutational analysis of amino acid residues H166 and E169 in the σB region 3.0 (σR3.0), interacting with TG-motif, demonstrated an implication of σR3.0 in RbpA-mediated stabilisation of RNAP promoter complexes. Substitution in RbpA at amino acid residue R79 affected the promoter-complex stability, while the substitutions at RbpA resdiues K73, K74 affected the transcription initiation. However, none of the RbpA mutants studied here affected opening of the promoter DNA. The differential roles played by these RbpA residues in promoter complex stabilization and transcription initiation together with the effect produced by the σB mutations suggest the implication of σR3.0 in RbpA action. Next, we performed genome-wide cartography of the RbpA-dependent genes from the σB regulon by using an in vitro RunOff Microarray Analysis (ROMA). ROMA analysis has shown clear evidence of 15 fold increase in the number of genes activated by σB-RNAP in the presence of RbpA. Bioinformatics analysis of 140 genes controlled by RbpA-σB pair allowed us to identify characteristic signature in the -10 consensus (‘TANNNT’) specific to σB subunit. Our study underlines an importance of the interplay between σR3.0 and RbpA in Mtb transcription. Based on our results we propose that RbpA may play a role of functional replacement for TG-motif of the extended -10 elements in mycobacterium species
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Tran, van Nhan. "Study of trm112, a unique methyltransferase activator at the interface between ribosome synthesis and function." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLX052/document.

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La traduction des ARNm est un processus très complexe qui en plus des nombreux facteurs impliqués, nécessite également des étapes de maturation des protéines et ARN pour la production fidèle des protéines. Parmi ces évènements, des modifications post-transcriptionnelles et post-traductionnelles, dont la méthylation est la plus fréquente, sont trouvées dans tous les composants et principalement chez les eucaryotes. Le rôle des méthylations dans la traduction est parfaitement illustré par la protéine Trm112, qui est un activateur essentiel pour la fonction de 4 méthyltransférases (MTase) (Trm9, Trm11, Bud23 et Mtq2) qui modifient des facteurs impliqués dans la synthèse des protéines. Chez la levure, les complexes Trm9-Trm112 et Trm11-Trm112 catalysent la formation de mcm5U34 et m2G10, respectivement sur certains ARNts. Le complexe Bud23-Trm112 modifie l’ARNr 18S pour former la m7G1575 tandis que le complexe Mtq2-Trm112 modifie le facteur de terminaison de classe I eRF1sur la chaine latérale de la glutamine du motif GGQ. Jusqu’à présent, des études structurales et fonctionnelles du réseau d’interaction de la protéine Trm112 se sont uniquement focalisées chez les eucaryotes alors que cette protéine est trouvée dans les 3 domaines du vivant. Dans cette étude, des expériences de co-immunoprécipitations couplées à de la LC-MS/MS ont permis d’étudier le réseau d’interaction de la protéine Trm112 chez l’archée H. volcanii. Celui-ci s’avère être composé de plus de MTase que chez les eucaryotes. Pour la première fois, la structure cristallographique d’un complexe Trm112-MTase d’archée a été déterminée, révélant un mode d’interaction conservé par rapport aux complexes eucaryotes malgré une très faible identité de séquence. De façon très intéressante, un des partenaires de Trm112 chez H. volcanii est orthologue d’une protéine humaine dont nous avons pu démontré qu’elle est une nouveau partenaire de la protéine TRMT112 humaine
Methylation is a widely distributed modification found in a variety of substrates involved in different steps of eukaryotic protein translation. Methylation reactions are catalyzed by enzymes called methyltransferases (MTases) generally using S-adenosyl-L- methionine (SAM or AdoMet) as the methyl donor. The effects of methylation on translation are perfectly illustrated by the Trm112 protein, which is an activating platform, essential for the function of four SAM-dependent MTases (Trm9, Trm11, Bud23 and Mtq2) modifying factors participated in protein synthesis. The Trm9-Trm112 and Trm11-Trm112 complexes methylate some tRNAs to form mcm5U34 and m2G10 respectively. The Bud23-Trm112 complex modifies 18S rRNA to form m7G1715 while the Mtq2-Trm112 complex methylates class I translation termination factor eRF1 at glutamine side chain of GGQ motif. Until now, the study of Trm112 network in eukaryotes has been quite clear structurally and functionally, however, little is known for corresponding proteins in Archaea.My PhD project aims to characterize the Trm112 network in archaea using Haloferax volcanii as a model organism and to decipher the mechanisms of substrate modification by Trm112-MTase complexes. This will help understanding the roles of these enzymes in protein synthesis from an evolutionary point of view.Towards this goal, I have generated several H. volcanii strains (Δtrm112, Δtrm112 Trm112-Flag, …). Co-immunoprecipitation of Trm112-Flag coupled to mass spectrometry allowed me identifying a significant number of methyltransferases (MTases), including putative orthologues of eukaryotic Trm112 partners, as potential interactors. I have next validated these new partners by biochemical approaches (co-purification, enzymatic assays, …) and determined the crystal structure for one Trm112-MTase complex. I have then convincing evidences that H. volcanii Trm12 has more MTase partners than the eukaryotic one. My work opens new routes towards the characterization of the role of Trm112 in archaea but has also led to the identification of a new MTase partner of the eukaryotic Trm112
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Jagot, Lacoussière Léonard. "Interactions protéine-protéine dans le contrôle de l'apoptose : Développements thérapeutiques." Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC218.

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Mon travail, s'est axé sur l'identification et la caractérisation biologique de nouvelles molécules impliquées dans la réponse apoptotique grâce à l'étude des interactions protéiques. L'objectif in-fine est de produire des petites molécules actives contre les cancers au travers du contrôle des interactions protéine-protéine. Mon travail de recherche comprend deux axes. Le premier porte sur les fonctions non apoptotiques de la protéine Apaf-1 dans la réponse au stress génotoxiques induite par les agents anticancéreux au travers du blocage du cycle cellulaire. Ce rôle d'Apaf-1 nécessite une redistribution de cette protéine du cytoplasme vers le noyau, et la translocation nucléaire d'Apaf-1 semble constituer un marqueur très favorable pour des patients atteints de cancer bronchique non à petites cellules. Je montre que ce processus de redistribution d'Apaf-1 du cytoplasme vers le noyau dépendante des dommages à l'ADN est médiée par une interaction entre la protéine et la nucléoporine NUP107. Le second axe porte sur la validation de l'inactivation de la protéine AAC-11 en tant que stratégie thérapeutique dans le cancer. Cette protéine, initialement identifiée comment permettant la survie de cellules en absence de facteurs de croissance, est surexprimée dans de nombreux tissus tumoraux et est indispensable à leur survie. Elle interagit avec ses partenaires au travers d'un module leucine-zipper et nous avons développé une série de peptides pénétrants ciblant ce domaine, empêchant ainsi à la protéine d'interagir avec ses partenaires protéiques et d'exercer sa fonction. Mon travail de recherche porte sur l'évaluation et l'optimisation de ces peptides
My work is based on the identification and the biological characterization of new molecules implicated in the apoptotic response by the study of protein interactions. Our goal is to produce small molecules effective against cancer cells by the control of protein-protein interactions. My work has two main axes. Le first one is focused on the non-apoptotic functions of the Apaf-1 protein in the stress response induced by anti-cancer agents through the arrest of the cell cycle. This role of Apaf-1 requires a redistribution of the protein from the cytoplasm to the nucleus and its nuclear translocation seems to be a positive prognosis for patients with non-small cell lung cancer. I show that this process of redistribution of Apaf-1 from the cytoplasm to the nucleus, dependent on the DNA damage, is mediated by an interaction between the protein and the nucleoporin NUP107. The second axe is based on the validation of the inactivation of the AAC-11 protein as a therapeutic strategy for the cancer. This protein, initially identified as a survival protein in the absence of growth factors, is overexpressed in a large number of tumor tissues and is essential to their survival. It interacts with its partners through a leucine-zipper domain and we have developed cell penetrating peptides targeting this domain, preventing the interaction between AAC-11 and its protein partners and interfering with its functions. My work is based on the evaluation of these peptides and on their optimization
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Mexas, Angela Marie. "CD4+CD25+ REGULATORY T CELLS ARE INFECTED AND ACTIVATED PHENOTYPICALLY AND FUNCTIONALLY DURING ACUTE INFECTION WITH FELINE IMMUNODEFICIENCY VIRUS." NCSU, 2007. http://www.lib.ncsu.edu/theses/available/etd-11022007-103144/.

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HIV-induced AIDS may be mediated by the activation of immunosuppressive CD4+CD25+ T regulatory cells (Tregs). Tregs have been shown to regulate CD4+ and CD8+ immune responses to HIV and FIV antigens in vitro. We tested the hypothesis that Tregs become infected and activated during the acute stage of FIV infection leading to the suppression of CD4+ T helper cell responses. Cats were experimentally infected with FIV-NCSU-1 and blood and lymph node biopsies were collected at 1 week intervals following inoculation. Real-Time PCR was used to determine plasma viremia and relative number of FIV copies in CD4+CD25+ and CD4+CD25- T cell subsets. Flow cytometry was used to assess the absolute numbers of each cell type and the expression of activation markers. Real-time RT-PCR was also used to assess relative increases in FoxP3 and TGF- mRNA levels over time. Treg suppression of IL-2 production in CD4+ T helper cells was assessed by ELISPOT assays and inhibition of cellular proliferation was assessed by incorporation of tritiated thymidine and CFSE. Our results show that peak viremia levels correlate with maximal infectivity in lymph node CD4+CD25+ populations. FIV-gag-mRNA levels are higher in CD4+CD25+ T cells than CD4+CD25- lymph node T cells. Activation of FoxP3 and increased expression of TGF1 in CD4+CD25+ cells correlates with peak plasma viremia and FIV-gag-mRNA levels in CD4+CD25+ T cells. Regulatory function can be detected in CD4+CD25+ T cells during the acute phase of FIV infection. Our findings support the hypothesis that early activation of immunosuppressor function in Treg cells may limit an effective anti-FIV response contributing to the establishment of the chronic infection and the immunodeficiency caused by this virus.
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Orlandini, Ervin. "Pesticide removal by combined ozonation and granular activated carbon filtration /." Rotterdam ; Brookfield : Balkema, 1999. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37738501t.

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Gründel, Anne, Kathleen Friedrich, Melanie Pfeiffer, Enno Jacobs, and Roger Dumke. "Subunits of the Pyruvate Dehydrogenase Cluster of Mycoplasma pneumoniae Are Surface-Displayed Proteins that Bind and Activate Human Plasminogen." Saechsische Landesbibliothek- Staats- und Universitaetsbibliothek Dresden, 2015. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:14-qucosa-173747.

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The dual role of glycolytic enzymes in cytosol-located metabolic processes and in cell surface-mediated functions with an influence on virulence is described for various micro-organisms. Cell wall-less bacteria of the class Mollicutes including the common human pathogen Mycoplasma pneumoniae possess a reduced genome limiting the repertoire of virulence factors and metabolic pathways. After the initial contact of bacteria with cells of the respiratory epithelium via a specialized complex of adhesins and release of cell-damaging factors, surface-displayed glycolytic enzymes may facilitate the further interac-tion between host and microbe. In this study, we described detection of the four subunits of pyruvate dehydrogenase complex (PDHA-D) among the cytosolic and membrane-associated proteins of M.pneumoniae. Subunits of PDH were cloned, expressed and purified to produce specific polyclonal guinea pig antisera. Using colony blotting, fractionation of total proteins and immunofluorescence experiments, the surface localization of PDHA-C was demonstrated. All pecombinant PDH subunits are able to bind to HeLa cells and human plasminogen. These interactions can be specifically blocked by the corresponding polyclon-al antisera. In addition, an influence of ionic interactions on PDHC-binding to plasminogen as well as of lysine residues on the association of PDHA-D with plasminogen was confirmed. The PDHB subunit was shown to activate plasminogen and the PDHB-plasminogen complex induces degradation of human fibrinogen. Hence, our data indicate that the surface-associated PDH subunits might play a role in the pathogenesis of M.pneumoniae infections by interaction with human plasminogen.
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Steiner, Ann-Kristin [Verfasser], Konstantin [Akademischer Betreuer] Amsharov, and Konstantin [Gutachter] Amsharov. "Synthesis of Carbon-Based Nanostructures by Cyclodehydrofluorination on Activated gamma-Al2O3 / Ann-Kristin Steiner ; Gutachter: Konstantin Amsharov ; Betreuer: Konstantin Amsharov." Erlangen : Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU), 2021. http://d-nb.info/1232496898/34.

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Sadji-Ouatas, Zahia. "Mécanismes de signalisation de l'analogue de la somatostatine, octréotide : rôle dans la régulation de l'activité du complexe Ku86/DNA-PKcs, de la prolifération cellulaire et des modifications post-traductionnelles de la protéine p53." Paris 7, 2001. http://www.theses.fr/2001PA077243.

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Deutsch, Matthias [Verfasser], Sigrun [Gutachter] Korsching, Arnd [Gutachter] Baumann, and Guenter [Gutachter] Schwarz. "Role of Hyperpolarization activated and Cyclic Nucleotide gated (HCN) Channels in Hippocampal Neurons / Matthias Deutsch ; Gutachter: Sigrun Korsching, Arnd Baumann, Guenter Schwarz." Köln : Universitäts- und Stadtbibliothek Köln, 2020. http://d-nb.info/1207074314/34.

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Teichert, Arnaud. "Etude du contrôle de l'expression génique par le récepteur des glucocorticoïdes : importance de ses fonctions trans-activatrices dans sa spécificité tissulaire et génique." Paris 7, 2004. http://www.theses.fr/2004PA077174.

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Mennour, Sabrina. "Activité de liaison à l’ARN des protéines de la voie de signalisation MAPK (Mitogen-Activated Protein Kinase) dans le mélanome LncRNA-Mediated Protein-Protein Scaffolding in Intracellular Signal Transduction Pathways." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASL062.

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Des études récentes ont souligné l'importance des ARN dans la régulation des interactions protéine-protéine. En permettant l'assemblage de complexes protéiques nucléaires, les ARN non codants agissent comme des échafaudages et favorisent ainsi les interactions protéine-protéine afin de réguler l'état de la chromatine. Les ARN sont également capables d’interagir avec des protéines pour en moduler leurs activités, leurs interactions ou encore leurs localisations. Cependant, le rôle potentiel des ARN dans la régulation des interactions protéine-protéine dans les principales voies de transduction du signal cytoplasmique reste largement inconnu. L’objectif de la thèse a consisté à rechercher et à mettre en évidence une activité de liaison directe à l’ARN de protéines impliquées dans les voies de transduction du signal cytoplasmique et d’évaluer le rôle des interactions ARN-protéines de transduction sur la signalisation intra-cellulaire. En utilisant des approches de CLIP (CrossLink et ImmunoPrécipitation) et de 2C (Complexe Capture : purification d’ARN basée sur leur affinité pour une matrice de silice), qui peuvent mettre en évidence des interactions directes entre les protéines et les ARN in vivo, nous avons démontré une interaction directe avec l’ARN de certaines protéines clés de la voie de signalisation MAPK. Des approches de microscopie telles que le PLA (Proximity Ligation Assay) nous ont permis de démontrer une modulation des interactions protéine-protéine dépendant de l'ARN dans la voie MAPK, suggérant qu'une composante ARN est impliquée dans la stabilisation de ces interactions protéine-protéine. Nous avons spécifiquement identifié un mutant de délétion BRAF, une protéine oncogène centrale et une cible thérapeutique dans le mélanome, qui montre une déficience dans son activité de liaison à l'ARN, ainsi qu’une activité de signalisation réduite. En mettant en évidence l'existence d'une modulation des interactions protéine-protéine médiée par l'ARN, cette étude démontre l'importance sans précédent de l'activité de liaison à l'ARN des principales protéines de transduction du signal qui devrait être prise en compte dans la compréhension et le ciblage des cellules tumorales
Recent studies have underscored the importance of RNAs in the regulation of protein-protein interactions. By allowing the assembly of protein complexes, non-coding RNAs act as scaffolds and thus promote protein-protein interactions in order to regulate the chromatin state. RNAs are also able to interact with proteins in order to modulate their activities, interactions or localisation. In the cytoplasm, signalling pathways are regulated through a cascade of protein-protein interactions. In the MAPK (Mitogen-Activated Protein Kinase) signalling pathway, the binding of a ligand to a membrane receptor triggers a cascade of phosphorylation and protein-protein interactions that allow the transduction of the signal. Abnormal activity of this pathway through increased ligand binding or activating mutations lead to cellular dysfunction associated with tumor initiation and progression.The potential role of RNAs in the direct regulation of protein-protein interactions of key cytoplasmic signal transduction pathways remains largely unknown. The aim of the thesis was to investigate and demonstrate the direct RNA binding activity of proteins involved in the MAPK pathway and to evaluate the role of RNA-protein interactions on intracellular signalling.Using a combination of CLIP (crosslinking and immunoprecipitation) and silica matrix-based affinity capture (2C complex capture) approaches that can uncover direct interactions between proteins and RNAs in vivo, we demonstrated a direct interaction between key MAPK signalling proteins and RNA in melanoma cells. Subsequent microscopy studies using proximity ligation assay (PLA) led us to demonstrate an RNA-dependent modulation of protein-protein interactions in the MAPK pathway, suggesting that an RNA component is involved in the stabilization of these protein-protein interactions. We specifically identified a deletion mutant in BRAF, a central oncogenic protein and therapeutic target in melanoma, that lacks RNA binding activity and harbors decreased signalling activity.By highlighting the existence of an RNA-mediated modulation of protein-protein interactions, this study shows the unprecedented importance of the RNA binding activity of key signal transduction proteins that should be considered in the understanding and targeting of tumor cells
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Malm, S. W., N. T. Hanke, A. Gill, L. Carbajal, and A. F. Baker. "The anti-tumor efficacy of 2-deoxyglucose and D-allose are enhanced with p38 inhibition in pancreatic and ovarian cell lines." BioMed Central, 2015. http://hdl.handle.net/10150/610319.

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PURPOSE: The anti-tumor activity of glucose analogs 2-deoxy-glucose (2-DG) and D-allose was investigated alone or in combination with p38 mitogen-activated protein kinase (MAPK) inhibitor SB202190 or platinum analogs as a strategy to pharmacologically target glycolytic tumor phenotypes. METHODS: Hypoxia inducible factor-1 alpha (HIF-1alpha) protein accumulation in pancreatic cell lines treated with SB202190 alone and in combination with glucose analogs was analyzed by Western blot. HIF-1alpha transcriptional activity was measured in MIA PaCa-2 cells stably transfected with a hypoxia response element luciferase reporter following treatment with glucose analogs alone, and in combination with SB202190. Induction of cleaved poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) was measured by Western blot in the MIA PaCa-2 cells. In vitro anti-proliferative activity of 2-DG and D-allose alone, or in combination with oxaliplatin (pancreatic cell lines), cisplatin (ovarian cell lines), or with SB202190 were investigated using the MTT assay. RESULTS: SB202190 decreased HIF-1alpha protein accumulation and transcriptional activity. 2-DG demonstrated greater anti-proliferative activity than D-allose. Pre-treatment with SB202190 enhanced activity of both 2-DG and D-allose in MIA PaCa-2, BxPC-3, ASPC-1, and SK-OV-3 cells. The combination of D-allose and platinum agents was additive to moderately synergistic in all but the OVCAR-3 and HEY cells. SB202190 pre-treatment further enhanced activity of D-allose and 2-DG with platinum agents in most cell lines investigated. CONCLUSIONS: SB202190 induced sensitization of tumor cells to 2-DG and D-allose may be partially mediated by inhibition of HIF-1alpha activity. Combining glucose analogs and p38 MAPK inhibitors with chemotherapy may be an effective approach to target glycolytic tumor phenotypes.
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Brami, Brigitte. "Modulation de l'activité adénylate-cyclase du cortex surrénal bovin par l'angiotensine II et les activateurs potentiels de la protéine-kinase C." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37612297t.

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Kryszke, Marie-Hélène. "Aspects du mécanisme de fonctionnement des activateurs identification de protéines cellulaires impliquées dans la reconnaissance des séquences activatrices du virus Polyome /." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376148075.

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Ericsson, Emma-Helena. "Are organohalogen compounds in backwash water from swimming pool facilities treatable? : An experimental investigation of removal capacities by different filter materials." Thesis, KTH, Hållbar utveckling, miljövetenskap och teknik, 2020. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-284338.

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Organohalogen compounds are formed in swimming pool waters when natural organic matter, such as hair, urine or sweat etc., react with the used disinfectant (usually chlorine). Many of the organohalogen compounds are persistent and hazardous for human health and aquatic ecosystems. Backwash water from swimming pool facilities is often released to the sewer and contain these compounds. The connected wastewater treatment plant receives this water, where some of these compounds escapes the treatment process, into the recipient. It is therefore important to minimize the levels of organohalogen compounds in the influent water to the wastewater treatment plant. In this study, potential treatment techniques for organohalogen compounds at the swimming pool facility have been investigated. The main focus have been on an experimental column test with four filter materials applied (granular activated carbon, natural zeolites, PoloniteR and Zugol). Real backwash water was used. Furthermore, other techniques have been theoretically investigated as well. The activated carbon directly showed the most efficient removal efficiency (above 95 %), but all filter materials had a removal to a certain degree and became more efficient by time. The results further suggest that the more lipophilic organohalogen compounds are bound to particulate matter and highly affected by physical filtration. Another important conclusion is that the specific activated carbon used in the study is not suitable for the purpose, because it released very high levels of phosphorus in the beginning of the column test as well as showing some practical problems. However, other types of activated carbon exists. Next step recommended is to determine the lifetime of the filters.
När människor badar i bassänger hamnar vanligtvis naturligt organiskt material i dem, såsom urin, svett, hår och hudflagor. Desinfektionsmedlet som tillsätts (oftast klor) har som syfte att avlägsna mikroorganismer, men när naturligt organiskt material hamnar i vattnet kommer också oavsiktliga reaktioner ske och halogenerade organiska föreningar bildas. Dessa föreningar kan kvantifieras via AOX måttet (adsorberbar organisk halogen), vilket är den samlade förekomsten av alla bundna organiska halogener i ett prov. AOX består således av flera hundra olika föreningar, varav vissa är mer lipofila och benämns EOX (extraherbar organisk halogen). Många av de föreningar inkluderade i AOX är bioackumulativa, persistenta och giftiga för akvatiska organismer, även i låga koncentrationer. Förutom att vara miljöfarliga för akvatiska ekosystem, kan de också vara skadliga för människans hälsa. Filtret som renar badvattnet i simhallar behöver backspolas regelbundet och backspolvattnet, som innehåller AOX, skickas vanligen till spillvattennätet. Vid avloppsreningsverket är det visat i ett tidigare examensarbete samt i andra rapporter att en del av de inkommande AOX ämnena även följer med det utgående, renade, vattnet ut i recipienten. Det är därmed av vikt att minimera ämnena redan vid källan, det vill säga på badanläggningen. I denna masteruppsats har behandlingstekniker för halogenerade organiska föreningar undersökts. Huvudfokus har varit på experimentella kolonntester för fyra filtermaterial (granulerat aktivt kol, naturliga zeoliter, PoloniteR och Zugol), men även andra tekniker har studerats teoretiskt. I testerna användes äkta backspolvatten från en simhall. Alla material reducerade AOX till viss del och visade på effektivare reducering efter hand. Det var dock tydligt att det aktiva kolet var mest effektivt och hade hög reducering redan i första mätningen, AOX-reduceringen låg på över 95 % (jämfört med det obehandlade backspolvattnet). Vad som dock var problematiskt med det aktiva kolet var att det släppte höga halter fosfor i början av kolonntestet, vilket också bekräftades med ett skaktest. Dessutom uppvisade materialet praktiska problem. Ur ett realistiskt perspektiv med dessa problem i åtanke, blir det inte hållbart i längden att använda detta specifika kol. Det finns dock många olika typer av aktivt kol, vilka förmodligen är mer lämpliga och som inte uppvisar dessa problem, och kan användas för detta ändamål. Vidare antyder det erhållna resultatet att de mer lipofila föreningarna av AOX (EOX) är bundet till partikulärt organiskt material och därmed påverkas väsentligt av mekanisk filtrering. Det är dock viktigt med en aktiv bindning. Projektet har påverkats av covid-19 pandemin med lägre antal folk på badhusen samt mindre tillgång till laboratoriet vid KTH. En föreslagen förbättring av metoden är att ha en kontinuerlig omblandning i förvaringskärlet med det obehandlade vattnet innan det tillförs kolonnerna. Vidare nämns det att modifierade zeoliter verkar lovande samt att nästa viktiga steg för projektet är att bestämma livstiden för filtermaterialen.
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Zana, Elodie. "Physiopathologie des anomalies du développement alvéolaire dans le RCIU : approche expérimentale et clinique." Thesis, Paris 5, 2014. http://www.theses.fr/2014PA05T020/document.

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Une croissance intra-utérine insuffisante représente, avec la prématurité et les malfor-mations congénitales, une des principales causes de morbidité et de mortalité néonatales. Ces pathologies sont liées entre elles, les nouveau-nés prématurés étant souvent atteints de RCIU (RCIU). Les études épidémiologiques récentes ont montré que le RCIU était associé à une augmentation de la morbidité respiratoire dès la période néonatale, avec, en particulier, une augmentation du risque de dysplasie broncho-pulmonaire (DBP), principale séquelle respira-toire de la prématurité. La DBP est caractérisée par des anomalies du développement alvéo-laire et vasculaire, considérées comme les conséquences d’agressions multiples sur un poumon immature. La physiopathologie exacte reste encore largement méconnue. Nous nous sommes intéressés dans ce travail au lien entre RCIU et DBP avec un abord expérimental et clinique. Alors que les études épidémiologiques sont relativement concordantes sur le lien entre RCIU et DBP, les études expérimentales, montrent des résultats divers tant sur le développement pulmonaire qu’au niveau moléculaire. Nous avons donc voulu identifier, dans un premier temps, un modèle de RCIU reproduisant les anomalies du développement alvéolaire observées chez l’Homme en utilisant trois modèles précédemment validés chez le rat : un modèle de res-triction protidique per-gestationnelle , un modèle de ligature unilatérale de l’artère utérine, un modèle d’injection d’un inhibiteur chimique de la NO synthase, le L NAME. Seule la restric-tion protidique anténatale permet de reproduire à long terme des lésions de l’alvéolisation proches de celles observées dans la DBP. En revanche, dans ce modèle, les modifications des principaux gènes identifiés précédemment dans les anomalies le développement alvéolaire ne sont pas observées, que ce soit avant, pendant ou après l’alvéolisation. Ce résultat nous a ame-né à entreprendre une étude multigénique qui a permis d’identifier plusieurs voies modifiées pendant l’alvéolisation dans ce modèle. Parmi celles-ci, les gènes impliqués dans la contractili-té et l’adhésion cellulaire, l’immunité ou la voie des « Peroxisome Proliferator-Activated Re-ceptor ». Dans la partie clinique de cette étude, nous avons évalué le risque de DBP chez les extrêmes prématurés atteints de RCIU dont les mères présentaient des signes de pathologie vasculaire de la grossesse (prééclampsie). Cette étude rétrospective unicentrique sur 184 en-fants a permis de comparer des enfants atteints de RCIU à des enfants eutrophes pris en charge de manière homogène. Le RCIU d’origine vasculaire multiplie le risque de DBP par 6. Un marqueur précoce de l’évolution vers une DBP est un taux de plaquettes bas à la naissance, évoquant le rôle d’un taux élevé de facteurs anti-angiogéniques circulants. Une étude est en cours pour corréler les facteurs anti-angiogéniques circulants présents chez les mères pré-éclamptiques au devenir respiratoire, en particulier à l’évolution vers une DBP, de leurs nou-veau-nés d’âge gestationnel inférieur à 30 semaines d’aménorrhée. En conclusion, nous avons montré expérimentalement que seule la restriction protidique anténatale chez le rat reproduisait les troubles de l’alvéolisation comparables à ceux observés dans la DBP. De nouvelles voies moléculaires potentiellement impliquées dans les anomalies de l’alvéolisation ont été mises en évidence. Par ailleurs, le rôle de facteurs anti-angiogéniques d’origine maternelle comme fac-teurs de développement d’une DBP est en cours d’évaluation
Insufficient intrauterine growth is with prematurity and congenital malformations, a major cause of neonatal morbidity and mortality. These conditions are interrelated, the preterm infants often suffered of intrauterine growth restriction (IUGR). Recent epidemiological stud-ies showed that IUGR was associated with increased respiratory morbidity as soon as the ne-onatal period, with an increased risk of bronchopulmonary dysplasia (BPD), the main respira-tory sequelae of prematurity. BPD is characterized by impaired alveolar and vascular devel-opment and is the consequence of multiple insults on an immature lung. The exact pathophysi-ology is still largely unknown. We study in this work the relationship between IUGR and DBP with an experimental and clinical approach. While epidemiological studies are relatively concordant on the relationship between IUGR and BPD, experimental studies showed various results in lung development and molecular process. We wanted to identify, at first, a model of IUGR reproducing impaired alveolar development observed in humans using three previously validated models in rats: a model of per-gestational protein restriction, a model of unilateral ligation uterine artery, an injection pattern of a chemical inhibitor of NO synthase, L NAME. Only antenatal protein restriction can reproduce long-term impaired alveolarization as those observed in BPD. However, in this model, changes in key genes previously identified in pathological alveolar development are not observed before, during or after alveolarization. This result led us to perform a genome-wide analysis which identified several modified path-ways during alveolarization. Among these, the genes involved in the “cardiac contractility”, “cell adhesion molecules”, “immunity”, “molecular adhesion” or the "Peroxisome Proliferator-Activated Receptor" pathways. In the clinical part of this study, we evaluated the risk of BPD in extreme preterm infants with IUGR whose mothers had evidence of vascular disease of pregnancy (preeclampsia). This single-center retrospective study of 184 children was used to compare children with IUGR in adjusted for gestational age children. The vascular IUGR increases the risk of DBP by 6. An early marker of progression to BPD is a low platelet count at birth, referring to the role of high levels of circulating anti-angiogenic factors. A study is ongoing to correlate circulating anti-angiogenic factors present in preeclamptic mothers to res-piratory outcome and particularly BDP, in newborn younger than 30 weeks of gestational age at birth. In conclusion, we have shown experimentally that only prenatal protein restriction in rats reproduced impaired alveolarization comparable to those observed in the BPD. New mo-lecular pathways potentially involved in the impaired alveolarization were highlighted. More-over, the role of placental anti-angiogenic factors leading to development of BPD is evaluat-ed
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Miroslav, Dramićanin. "Uticaj aktivnog premaza na dubinu uvara pri zavarivanju nerđajućeg čelika netopljivom elektrodom u zaštiti inertnog gasa." Phd thesis, Univerzitet u Novom Sadu, Fakultet tehničkih nauka u Novom Sadu, 2019. https://www.cris.uns.ac.rs/record.jsf?recordId=111073&source=NDLTD&language=en.

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U disertaciji je prikazan odabir rastvarača, veličine, vrste i udela čestica za aktivni premaz namenjen postizanju povećane dubine uvara na austenitnom nerđajućem čeliku pri zavarivanju netopljivom elektrodom u zaštiti inertnog gasa. Pored sastava aktivnog premaza, u disertaciji je izvršena optimizacija: geometrije elektrode, jačine struje i brzine zavarivanja. Nakon odabira perspektivnih tipova sastava premaza i parametara zavarivanja, na zavarenim uzorcima izvršena je karakterizacija mehaničkih osobina, hemijskog sastava i mikrostrukture.
In this doctoral thesis, the selection of solvent, size, type and the content ofoxide particles in activated flux aimed at increasing the penetration onaustenitic stainless steel in gas tungsten arc welding is presented. Besidesactivated flux composition, the optimization of welding parameters such aselectrode geometry, welding current and welding speed was done. After theselection of successful activated flux formulations and welding parameters,the characterization of mechanical properties, chemical composition andmicrostructure was determined.
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Kemme, Michiel Jan Bernard. "Endothelial function determined from systemic plasma concentrations : release of tissue factor pathway inhibitor and binding of tissue plasminogen activator /." Leiden, 2003. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb40223396n.

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Kumar, Alan P. "Structure-Function Studies on Aspartate Transcarbamoylase and Regulation of Pyrimidine Biosynthesis by a Positive Activator Protein, PyrR in Pseudomonas putida." Thesis, University of North Texas, 2003. https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc4362/.

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Анотація:
The regulation of pyrimidine biosynthesis was studied in Pseudomonas putida. The biosynthetic and salvage pathways provide pyrimidine nucleotides for RNA, DNA, cell membrane and cell wall biosynthesis. Pyrimidine metabolism is intensely studied because many of its enzymes are targets for chemotheraphy. Four aspects of pyrimidine regulation are described in this dissertation. Chapter I compares the salvage pathways of Escherichia coli and P. putida. Surprisingly, P. putida lacks several salvage enzymes including nucleoside kinases, uridine phosphorylase and cytidine deaminase. Without a functional nucleoside kinase, it was impossible to feed exogenous uridine to P. putida. To obviate this problem, uridine kinase was transferred to P. putida from E. coli and shown to function in this heterologous host. Chapter II details the enzymology of Pseudomonas aspartate transcarbamoylase (ATCase), its allosteric regulation and how it is assembled. The E. coli ATCase is a dodecamer of two different polypeptides, encoded by pyrBI. Six regulatory (PyrI) and six catalytic (PyrB) polypeptides assemble from two preformed trimers (B3) and three preformed regulatory dimers (I2) in the conserved 2B3:3I2 molecular structure. The Pseudomonas ATCase also assembles from two different polypeptides encoded by pyrBC'. However, a PyrB polypeptide combines with a PyrC. polypeptide to form a PyrB:PyrC. protomer; six of these assemble into a dodecamer of structure 2B3:3C'2. pyrC' encodes an inactive dihydroorotase with pyrB and pyrC' overlapping by 4 bp. Chapter III explores how catabolite repression affects pyrimidine metabolism. The global catabolite repression control protein, Crc, has been shown to affect pyrimidine metabolism in a number of ways. This includes orotate transport for use as pyrimidine, carbon and nitrogen sources. Orotate is important because it interacts with PyrR in repressing the pyr genes. Chapter IV describes PyrR, the positive activator of the pyrimidine pathway. As with other positive activator proteins, when pyrimidine nucleotides are depleted, PyrR binds to DNA thereby enhancing expression of pyrD, pyrE and pyrF genes. When pyrimidine nucleotides are in excess, the PyrR apoprotein binds to orotate, its co-repressor, to shut down all the pyrimidine genes. Like many positive activators, PyrR is subject to autoregulation and has catalytic activity for uracil phosphoribosyltransferase inducible by orotate.
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Akbay, Burkitkan. "Regulation of the Akt/mTORC1 Pathway by HIV Transcriptional Activator Tat in B Cells Modulation of mTORC1 Signaling Pathway by HIV-1 Production of Stable Cell Lines on the Basis of the Cultured RPMI 8866 B-Cells with Constant and Inducible Expression of the Human Immunodeficiency Virus Tat Protein HIV-1 Tat Activates Akt/mTORC1 Pathway and AICDA Expression by Downregulating Its Transcriptional Inhibitors in B Cells." Thesis, université Paris-Saclay, 2021. http://www.theses.fr/2021UPASL026.

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Анотація:
Les lymphomes agressifs à cellules B sont la principale cause de décès chez les personnes infectées par le VIH-1, bien que les cellules B ne soient pas ciblées par le virus. Les mécanismes exacts du développement de ces lymphomes ne sont pas connus. Des études antérieures de notre équipe ont révélé que le HIV-1 Tat peut pénétrer les cellules B, où il peut induire la production de ROS, endommager l'ADN et augmenter les chances de translocations oncogènes spécifiques au lymphome de Burkitt. En outre, dans de nombreuses cellules immunitaires, le VIH-1 et ses protéines (par exemple Tat) peuvent réguler la voie Akt/mTORC1, un intégrateur central de nombreux signaux intra et extracellulaires, y compris l'infection virale et les dommages à l'ADN. Cependant, aucune étude n'a examiné la régulation de la voie Akt/mTORC1 par Tat dans les cellules B. J'ai testé dans cette thèse l'hypothèse selon laquelle Tat pourrait produire des effets oncogènes dans les cellules B en modulant la voie de signalisation Akt/mTORC1 et en régulant l'expression des gènes impliqués dans la lymphomagenèse. J'ai découvert que HIV-1 Tat activait la voie de signalisation Akt/mTORC1, ce qui entraîne une activation aberrante de l'AICDA (cytidine désaminase induite par l'activation) en raison de l'inhibition des répresseurs transcriptionnels c-Myb et E2F8 de l'AICDA. Ces perturbations peuvent finalement conduire à une instabilité génomique accrue et à une prolifération qui pourrait provoquer des malignités des cellules B
Aggressive B cell lymphomas are the main cause of death in HIV-1 infected individuals, although B cells are not targeted by the virus. The exact mechanisms of the development of these lymphomas are not known. Previous studies of our team revealed that HIV-1 Tat can penetrate B cells, where it can induce ROS production, DNA damage and increase the chances of the oncogenic translocations specific for Burkitt lymphoma. In addition in many immune cells HIV-1 and its proteins (e.g. Tat) can regulate Akt/mTORC1 pathway, a central integrator of many intra and extracellular signals including viral infection and DNA damage. However, no studies have examined the regulation of Akt/mTORC1 pathway by Tat in B cells. In this thesis I have tested the hypothesis that HIV-1 Tat might produce oncogenic effects in B cells by modulating Akt/mTORC1 signaling pathway and regulating expression of genes involved in lymphomagenesis. I found that HIV-1 Tat activated Akt/mTORC1 signaling pathway, which leads to aberrant activation of AICDA (activation induced cytidine deaminase) due to inhibition of AICDA transcriptional repressors c-Myb and E2F8. These perturbations may ultimately lead to an increased genomic instability and proliferation that might cause B cell malignancies
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Palm-Forster, Mieder Anthony Thomas [Verfasser], Dierk [Akademischer Betreuer] Scheel, Sacha [Akademischer Betreuer] Baginsky, and Wolfgang [Akademischer Betreuer] Dröge-Laser. "Identification and functional characterisation of three novel Proline Rich Proteins that are Mitogen Activated Protein Kinase substrates / Mieder Anthony Thomas Palm-Forster. Betreuer: Dierk Scheel ; Sacha Baginsky ; Wolfgang Dröge-Laser." Halle, Saale : Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt, 2013. http://d-nb.info/1031915028/34.

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Volk, Nadine [Verfasser], and Peter Paul [Akademischer Betreuer] Nawroth. "Diabetes-induced mitochondrial changes are tissue- and model-dependent and elevated glucose levels do not activate the pathways of hyperglycemic damage in the kidney / Nadine Volk ; Betreuer: Peter Paul Nawroth." Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2018. http://d-nb.info/1177384280/34.

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Zana-Taïeb, Elodie. "Physiopathologie des anomalies du développement alvéolaire dans le RCIU : approche expérimentale et clinique." Phd thesis, Université René Descartes - Paris V, 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01060181.

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Анотація:
Une croissance intra-utérine insuffisante représente, avec la prématurité et les malfor-mations congénitales, une des principales causes de morbidité et de mortalité néonatales. Ces pathologies sont liées entre elles, les nouveau-nés prématurés étant souvent atteints de RCIU (RCIU). Les études épidémiologiques récentes ont montré que le RCIU était associé à une augmentation de la morbidité respiratoire dès la période néonatale, avec, en particulier, une augmentation du risque de dysplasie broncho-pulmonaire (DBP), principale séquelle respira-toire de la prématurité. La DBP est caractérisée par des anomalies du développement alvéo-laire et vasculaire, considérées comme les conséquences d'agressions multiples sur un poumon immature. La physiopathologie exacte reste encore largement méconnue. Nous nous sommes intéressés dans ce travail au lien entre RCIU et DBP avec un abord expérimental et clinique. Alors que les études épidémiologiques sont relativement concordantes sur le lien entre RCIU et DBP, les études expérimentales, montrent des résultats divers tant sur le développement pulmonaire qu'au niveau moléculaire. Nous avons donc voulu identifier, dans un premier temps, un modèle de RCIU reproduisant les anomalies du développement alvéolaire observées chez l'Homme en utilisant trois modèles précédemment validés chez le rat : un modèle de res-triction protidique per-gestationnelle , un modèle de ligature unilatérale de l'artère utérine, un modèle d'injection d'un inhibiteur chimique de la NO synthase, le L NAME. Seule la restric-tion protidique anténatale permet de reproduire à long terme des lésions de l'alvéolisation proches de celles observées dans la DBP. En revanche, dans ce modèle, les modifications des principaux gènes identifiés précédemment dans les anomalies le développement alvéolaire ne sont pas observées, que ce soit avant, pendant ou après l'alvéolisation. Ce résultat nous a ame-né à entreprendre une étude multigénique qui a permis d'identifier plusieurs voies modifiées pendant l'alvéolisation dans ce modèle. Parmi celles-ci, les gènes impliqués dans la contractili-té et l'adhésion cellulaire, l'immunité ou la voie des " Peroxisome Proliferator-Activated Re-ceptor ". Dans la partie clinique de cette étude, nous avons évalué le risque de DBP chez les extrêmes prématurés atteints de RCIU dont les mères présentaient des signes de pathologie vasculaire de la grossesse (prééclampsie). Cette étude rétrospective unicentrique sur 184 en-fants a permis de comparer des enfants atteints de RCIU à des enfants eutrophes pris en charge de manière homogène. Le RCIU d'origine vasculaire multiplie le risque de DBP par 6. Un marqueur précoce de l'évolution vers une DBP est un taux de plaquettes bas à la naissance, évoquant le rôle d'un taux élevé de facteurs anti-angiogéniques circulants. Une étude est en cours pour corréler les facteurs anti-angiogéniques circulants présents chez les mères pré-éclamptiques au devenir respiratoire, en particulier à l'évolution vers une DBP, de leurs nou-veau-nés d'âge gestationnel inférieur à 30 semaines d'aménorrhée. En conclusion, nous avons montré expérimentalement que seule la restriction protidique anténatale chez le rat reproduisait les troubles de l'alvéolisation comparables à ceux observés dans la DBP. De nouvelles voies moléculaires potentiellement impliquées dans les anomalies de l'alvéolisation ont été mises en évidence. Par ailleurs, le rôle de facteurs anti-angiogéniques d'origine maternelle comme fac-teurs de développement d'une DBP est en cours d'évaluation.
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Noriega, Esteban Núria. "The Rtg1 and Rtg3 proteins are novel transcription factors regulated by the yeast hog1 mapk upon osmotic stress." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2009. http://hdl.handle.net/10803/7158.

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La adaptación de la levadura Saccharomyces cerevisiae a condiciones de alta osmolaridad está mediada por la vía de HOG ((high-osmolarity glycerol). La activación de esta vía induce una serie de respuestas que van a permitir la supervivencia celular en respuesta a estrés. La regulación génica constituye una respuesta clave para dicha supervivencia. Se han descrito cinco factores de transcripción regulados por Hog1 en respuesta a estrés osmótico. Sin embargo, éstos no pueden explicar la totalidad de los genes regulados por la MAPK Hog1. En el presente trabajo describimos cómo el complejo transcripcional formado por las proteínas Rtg1 y Rtg3 regula, a través de la quinasa Hog1, la expresión de un conjunto específico de genes. Hog1 fosforila Rtg1 y Rtg3, aunque ninguna de estas fosforilaciones son esenciales para regulación transcripcional en respuesta a estrés. Este trabajo también muestra cómo la deleción de proteínas RTG provoca osmosensibilidad celular, lo que indica que la integridad de la vía de RTG es esencial para la supervivencia celular frente a un estrés osmótico.
In Saccharomyces cerevisiae the adaptation to high osmolarity is mediated by the HOG (high-osmolarity glycerol) pathway, which elicits different cellular responses required for cell survival upon osmostress. Regulation of gene expression is a major adaptative response required for cell survival in response to osmotic stress. At least five transcription factors have been reported to be controlled by the Hog1 MAPK. However, they cannot account for the regulation of all of the genes under the control of the Hog1 MAPK. Here we show that the Rtg1/3 transcriptional complex regulates the expression of specific genes upon osmostress in a Hog1-dependent manner. Hog1 phosphorylates both Rtg1 and Rtg3 proteins. However, none of these phosphorylations are essential for the transcriptional regulation upon osmostress. Here we also show that the deletion of RTG proteins leads to osmosensitivity at high osmolarity, suggesting that the RTG-pathway integrity is essential for cell survival upon stress.

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