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Dissertations / Theses on the topic 'Bio-statistics'

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Liu, Fangda, and 刘芳达. "Two results in financial mathematics and bio-statistics." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2011. http://hub.hku.hk/bib/B46976437.

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Duforet-Frebourg, Nicolas. "Statistiques bayésiennes en génétique des populations : modèle à facteurs et processus gaussiens pour étudier la variation génétique neutre et adaptative." Thesis, Grenoble, 2014. http://www.theses.fr/2014GRENS015/document.

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Abstract:
Nous présentons dans cette thèse plusieurs travaux de statistiques bayésiennes appliquées à la génétique des populations. La génétique des populations a pour but d'expliquer les variations génétiques au sein d'une espèce, et d'inférer les processus ayant conduits à ces variations. Pour cela, des données génétiques massives sont utilisées et il y a un besoin grandissant de méthodes statistiques pour traiter ces données. Le travail de cette thèse s'inscrit dans cet effort de modélisation statistique pour répondre aux enjeux de la génétique des populations, et de la biologie de l'évolution. Nous
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Hadj, Amor Khaoula. "Classification et inférence de réseaux de gènes à partir de séries temporelles très courtes : application à la modélisation de la mémoire transcriptionnelle végétale associée à des stimulations sonores répétées." Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSES037.

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Abstract:
Les avancées des nouvelles technologies de séquençage ont ouvert l'accès aux données d'expression dynamique des gènes à l'échelle du génome. Les approches ensemblistes classiques, habituellement utilisées en biologie, ne permettent pas la compréhension des mécanismes moléculaires complexes sous-jacents. Par conséquent, le développement de méthodes analytiques permettant d'appréhender de manière plus satisfaisante ce type de données représente un défi majeur pour la biologie contemporaine. Cependant, les coûts techniques et expérimentaux associés aux données de transcriptomiques limitent la dim
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CALLEGARO, GIULIA. "Fostering Cell Transformation Assay in carcinogenicity assessment: toward in vitro-in silico bridging." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano-Bicocca, 2017. http://hdl.handle.net/10281/158270.

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Abstract:
La valutazione del potenziale carcinogeno delle sostanze chimiche si basa, a livello regolatorio, sul saggio di cancerogenesi sui roditori (OECD, TG 451). La loro diffusa applicabilità è però messa in discussione a causa delle lunghe tempistiche e dei costi associati alla loro esecuzione, e dal potenzialmente limitato valore predittivo verso l'uomo. I Cell Transformation Assays (CTA) sono tra i metodi in vitro più avanzati e standardizzati a livello regolatorio. I CTA riproducono passaggi chiave della trasformazione in vivo; si basano sulla formazione, in seguito al trattamento con un sospet
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BENAZZO, Andrea. "LE SIMULAZIONI DEL PROCESSO COALESCENTE IN GENETICA DI POPOLAZIONI: INFERENZE DEMOGRAFICHE ED EVOLUTIVE." Doctoral thesis, Università degli studi di Ferrara, 2012. http://hdl.handle.net/11392/2389456.

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Abstract:
The main goal of population genetics is to understand the factors that affect genetic variation within a species. Mathematical models are used to predict the effects on genetic variation of processes such as mutation, recombination, selection, migration and population size changes, but analytical results are difficult to obtain when these processes interact and when equilibrium conditions are not met. In these situations, common in real biological systems especially when recent human activities (e.g., stocking, urbanization, overhunting) perturb natural populations, computer simulations can be
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Blum, Michael G. B. "Statistique bayésienne et applications en génétique des populations." Habilitation à diriger des recherches, Université de Grenoble, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00766196.

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Abstract:
Les approches statistiques en génétique des populations visent deux objectifs distincts qui sont la description des données et la possibilité d'inférer les processus évolutifs qui ont généré les patrons observés. Le premier chapitre de ce manuscrit décrit nos apports théoriques et méthodologiques concernant le calcul bayésien approché (Approximate Bayesian Computation) qui permet de réaliser l'objectif d'inférence des processus évolutifs. Je décris des résultats asymptotiques qui permettent de décrire des propriétés statistiques du calcul bayésien approché. Ces résultats mettent en évidence à
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Abdulgader, Musbah M. "Bio Inspired Evolutionary Fuzzy System for Data Classification." University of Toledo / OhioLINK, 2019. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=toledo1575563281684676.

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Xayaphoummine, Alain. "Simulations et expériences sur le repliement de l'ARN : prédictions statistiques des pseudonoeuds in silico et réalisation de commutateurs ARN par transcription in vitro." Phd thesis, Université Louis Pasteur - Strasbourg I, 2004. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00221533.

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Abstract:
Modélisation du coût thermodynamique des structures pseudoneuds.<br />Développement d'un algorithme d'accélération exacte de la dynamique de monte Carlo.<br />Développement et interfaçage web d'un code de repliement de molécule ARN incluant les motifs pseudoneuds. Rendu cinématique de la dynamique de repliement.<br />Etude statistique de la prévalence des pseudoneouds dans des séquences biologiques et aléatoires.<br />Vérification expérimentale du code repliement. Démonstration expérimentale de l'existence d'un super-code guidant pour le repliement natif des ARN.
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Dhifli, Wajdi. "Fouille de Sous-graphes Basée sur la Topologie et la Connaissance du Domaine: Application sur les Structures 3D de Protéines." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00922209.

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Abstract:
Cette thèse est à l'intersection de deux domaines de recherche en plein expansion, à savoir la fouille de données et la bio-informatique. Avec l'émergence des bases de graphes au cours des dernières années, de nombreux efforts ont été consacrés à la fouille des sous-graphes fréquents. Mais le nombre de sous-graphes fréquents découverts est exponentiel, cela est due principalement à la nature combinatoire des graphes. Beaucoup de sous-graphes fréquents ne sont pas pertinents parce qu'ils sont redondants ou tout simplement inutiles pour l'utilisateur. En outre, leur nombre élevé peut nuire ou mê
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Marzin, Anahita. "Indicateurs biologiques de la qualité écologique des cours d’eau : variabilités et incertitudes associées." Thesis, Paris, AgroParisTech, 2013. http://www.theses.fr/2013AGPT0002/document.

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Abstract:
Evaluer, maintenir et restaurer les conditions écologiques des rivières nécessitent des mesures du fonctionnement de leurs écosystèmes. De par leur complexité, notre compréhension de ces systèmes est imparfaite. La prise en compte des incertitudes et variabilités liées à leur évaluation est donc indispensable à la prise de décision des gestionnaires. En analysant des données nationales (~ 1654 sites), les objectifs principaux de cette thèse étaient de (1) tester certaines hypothèses intrinsèques aux bio-indicateurs et (2) d'étudier les incertitudes de l'évaluation écologique associées à la var
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Laurent, Benoist. "Étude de l'anesthésie générale à l'échelle atomique par modélisation d'un homologue bactérien du récepteur nicotinique humain." Phd thesis, Université Paris-Diderot - Paris VII, 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01053431.

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Abstract:
La découverte des anesthésiques représente un progrès majeur de la médecine, rendu possible par l'observation empirique de leurs effets. Des expériences ont révélées les neurorécepteurs comme cibles possibles des anesthésiques, des canaux localisés sur la membrane des cellules cibles aux terminaisons nerveuses. Le récepteur GLIC, un homologue bactérien du récepteur nicotinique humain, a été co-cristallisé en 2011 avec des anesthésiques généraux liés à lui. Dans cette thèse, j'utilise les simulations de dynamique moléculaire pour caractériser les interactions entre des
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Lawrie, Sofía. "Information representation and processing in neuronal networks: from biological to artificial systems and from first to second-order statistics." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2022. http://hdl.handle.net/10803/673989.

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Abstract:
Neuronal networks are today hypothesized to the basis for the computing capabilities of biological nervous systems. In the same manner, artificial neuronal systems are intensively exploited for a diversity of industrial and scientific applications. However, how information is represented and processed by these networks remains under debate, meaning that it is not clear which sets of neuronal activity features are useful for computation. In this thesis, I present a set of results that link the first-order statistics of neuronal activity with behavior, in the general context of encoding/decoding
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Carvalho, Ricardo de. "Controle estatístico de processo da produção da suspensão viral da vacina contra a febre amarela fabricada por Bio-Manguinhos/FIOCRUZ." Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos, 2005. https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/5793.

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Abstract:
Submitted by Priscila Nascimento (pnascimento@icict.fiocruz.br) on 2012-11-12T18:43:04Z No. of bitstreams: 1 ricardo-de-carvalho.pdf: 1945198 bytes, checksum: 8586b33e6fabb5d0036c0443e9c26caa (MD5)<br>Made available in DSpace on 2012-11-12T18:43:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ricardo-de-carvalho.pdf: 1945198 bytes, checksum: 8586b33e6fabb5d0036c0443e9c26caa (MD5) Previous issue date: 2005<br>Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz Rio de Janeiro, RJ, Brasil.<br>Esta dissertação investig
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"A Study on Optimization Measurement Policies for Quality Control Improvements in Gene Therapy Manufacturing." Master's thesis, 2020. http://hdl.handle.net/2286/R.I.62668.

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Abstract:
abstract: With the increased demand for genetically modified T-cells in treating hematological malignancies, the need for an optimized measurement policy within the current good manufacturing practices for better quality control has grown greatly. There are several steps involved in manufacturing gene therapy. These steps are for the autologous-type gene therapy, in chronological order, are harvesting T-cells from the patient, activation of the cells (thawing the cryogenically frozen cells after transport to manufacturing center), viral vector transduction, Chimeric Antigen Receptor (CAR) atta
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Srinath, M. "Simulation modelling in marine fisheries for fish stock assessment a bio-statistical analysis." Thesis, 1996. http://eprints.cmfri.org.in/6948/1/TH-58_Sri.pdf.

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Abstract:
Exploited fish stocks are assessed with the help of micro analytic and macro models (Alagaraja, 1990). Catch in numbers (age specific or length specific) or catch in weight and the corresponding fishing effort expended are the main inputs to the fish population models. The quality of this input data governs the performance (predictive or interpolative) of the models and determines the relevance of management decisions inferred from the stock assessment studies. Catches usually are estimated from sampling of commercial landings. These sampling schemes are often complex and multistage
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Odhiambo, Nancy. "The role of immune-genetic factors in modelling longitudinally measured HIV bio-markers including the handling of missing data." Thesis, 2013. http://hdl.handle.net/10413/10277.

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Abstract:
Since the discovery of AIDS among the gay men in 1981 in the United States of America, it has become a major world pandemic with over 40 million individuals infected world wide. According to the Joint United Nations Programme against HIV/AIDS epidermic updates in 2012, 28.3 million individuals are living with HIV world wide, 23.5 million among them coming from sub-saharan Africa and 4.8 million individuals residing in Asia. The report showed that approximately 1.7 million individuals have died from AIDS related deaths, 34 million ± 50% know their HIV status, a total of 2:5 million individuals
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Sun, Ruoxi. "Modern Statistical/Machine Learning Techniques for Bio/Neuro-imaging Applications." Thesis, 2019. https://doi.org/10.7916/d8-jeqq-bn37.

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Abstract:
Developments in modern bio-imaging techniques have allowed the routine collection of a vast amount of data from various techniques. The challenges lie in how to build accurate and efficient models to draw conclusions from the data and facilitate scientific discoveries. Fortunately, recent advances in statistics, machine learning, and deep learning provide valuable tools. This thesis describes some of our efforts to build scalable Bayesian models for four bio-imaging applications: (1) Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (STORM) Imaging, (2) particle tracking, (3) voltage smoothing, (4)
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Kleinman, Claudia L. "Statistical potentials for evolutionary studies." Thèse, 2010. http://hdl.handle.net/1866/5185.

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Abstract:
Les séquences protéiques naturelles sont le résultat net de l’interaction entre les mécanismes de mutation, de sélection naturelle et de dérive stochastique au cours des temps évolutifs. Les modèles probabilistes d’évolution moléculaire qui tiennent compte de ces différents facteurs ont été substantiellement améliorés au cours des dernières années. En particulier, ont été proposés des modèles incorporant explicitement la structure des protéines et les interdépendances entre sites, ainsi que les outils statistiques pour évaluer la performance de ces modèles. Toutefois, en dépit des avancées sig
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