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Dissertations / Theses

Academic literature on the topic 'Interactions protéine-RNA'

Author: Grafiati

Published: 27 July 2024

Last updated: 31 July 2025

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Dissertations / Theses on the topic "Interactions protéine-RNA"

1

Corsi, Flavia. "Towards the in silico reconstruction of protein interaction networks : identification of DNA- and RNA-protein interfaces, and construction of a database of multiple interactions of proteins." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2019SORUS452.pdf.

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Abstract:

Cette thèse porte sur la caractérisation et la prédiction des interfaces protéine-ADN et -ARN, et des comparaisons avec les interfaces protéine-protéine. Nous avons créé un ensemble non-redondant et représentatif de 187 complexes protéine-ADN à haute résolution, comprenant aussi les conformations non liées de 82 protéines. Cette base de données peut servir de référence dans le domaine. Nous avons mené une analyse exhaustive des propriétés de séquence et structurels des interfaces protéine-ADN/ARN et nous les avons comparé avec les propriétés des interfaces protéine-protéine et celles des régio

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2

Ribeiro, Diogo. "Discovery of the role of protein-RNA interactions in protein multifunctionality and cellular complexity." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0449/document.

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Abstract:

Au fil du temps, la vie a évolué pour produire des organismes remarquablement complexes. Pour faire face à cette complexité, les organismes ont développé une pléthore de mécanismes régulateurs. Par exemple, les mammifères transcrivent des milliers d'ARN longs non codants (ARNlnc), accroissant ainsi la capacité régulatrice de leurs cellules. Un concept émergent est que les ARNlnc peuvent servir d'échafaudages aux complexes protéiques, mais la prévalence de ce mécanisme n'a pas encore été démontrée. De plus, pour chaque ARN messager, plusieurs régions 3’ non traduites (3’UTRs) sont souvent prése

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3

Mahmoudi, Ikram. "Structural and evolutionary analysis of protein-RNA interfaces and prediction perspectives." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASQ024.

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Abstract:

Les interactions protéine-ARN sont cruciales dans de nombreuses voies cellulaires et pathologiques. La connaissance de leurs structures 3D est essentielle pour comprendre leurs fonctions, mais leur détermination expérimentale reste difficile. Le manque de données structurales et la flexibilité de ces complexes ont entravé la prédiction structurale des interfaces protéine-ARN. En parallèle, la prédiction des interactions protéine-protéine a connu d'énormes progrès récents grâce aux informations évolutives et à l'apprentissage profond.Ma thèse s'est concentrée sur une analyse évolutive détaillée

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4

Michaux, Charlotte. "Identification et caractérisation fonctionnelle de petits ARN non codants chez Enterococcus faecalis et analyse d'une protéine "RNA-binding"." Caen, 2013. http://www.theses.fr/2013CAEN2094.

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5

Chevrollier, Nicolas. "Développement et application d’une approche de docking par fragments pour modéliser les interactions entre protéines et ARN simple-brin." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS106/document.

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Abstract:

Les interactions ARN-protéine interviennent dans de nombreux processus cellulaires fondamentaux. L'obtention de détails à l'échelle atomique de ces interactions nous éclaire sur leurs fonctions, mais permet également d'envisager la conception rationnelle de ligands pouvant les moduler. Lorsque les deux techniques majeures que sont la RMN et la cristallographie aux rayons X ne permettent pas d'obtenir une structure 3D entre les deux partenaires, des approches de docking peuvent être utilisées pour apporter des modèles. L'application de ces approches aux complexes ARN-protéine se heurtent cepend

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6

Angius, Federica. "Molecular basis of membrane protein production and intracellular membranes proliferation in E. coli." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCC217/document.

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Abstract:

Le système d’expression le plus utilisé pour la production des protéines membranaires, est le système basé sur l’ARN polymérase T7 (ARNpol T7) (Hattab et al., 2015). L'inconvénient de ce système est néanmoins que la vitesse de transcription de l’ARNpol T7 est dix fois plus rapide que celle de l’enzyme bactérienne. Depuis l’isolement de mutants spontanés, notamment C41 (DE3) et C43 (DE3) (Miroux et Walker, 1996) et l’identification de leurs mutations dans le génome, il apparaît clairement que la toxicité provoquée par la surproduction des protéines membranaires est liée à la quantité trop élevé

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7

Capozi, Serena. "Dynamique d'interaction entre la protéine SRSF1 et l'ARN et cinétique de formation du spliceosome." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT067.

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Abstract:

La protéine SRSF1, aussi appelée ASF/SF2, fait partie de la famille des protéines SR, une famille de protéines liant l’ARN très conservées. Ces protéines jouent un rôle régulateur de l’épissage, également lors de l’épissage alternatif. Une centaine d’ARN cible ont été décrits pour SRSF1 mais la manière dont SRSF1 sélectionne ses cibles parmi tous les pré-ARNm est mal comprise. Des études in vitro et in vivo ont montré que les protéines SR reconnaissent un petit motif dégénéré qui est souvent présent en plusieurs copies dans les ESE («enhancer splicing element »). Bien que les protéines SR lien

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8

Robert-Paganin, Julien. "Étude structurale et fonctionnelle de la régulation de l’hélicase Prp43." Thesis, Paris 5, 2014. http://www.theses.fr/2014PA05P633/document.

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Abstract:

Les hélicases à ARN de la famille DEAH/RHA sont impliquées dans la plupart des processus essentiels à la vie tels que l'épissage, la biogenèse des ribosomes, la réplication, la transcription ou encore la détection d’ARN viraux. Ces enzymes sont capables de catalyser la dissociation de duplexes d'ARN, la réorganisation de structures secondaires ou de remodeler des complexes ARN-protéines. L'hélicase DEAH/RHA Prp43 présente la particularité d'être bifonctionnelle. Prp43 est impliquée dans l'épissage des Pré-ARNm, où elle assure le recyclage du spliceosome et du lasso, mais aussi dans la biogenès

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9

Paternina, Osorio J. Antonio. "Biocomputational tools for transcriptome-wide analyses of RNA-binding proteins." Electronic Thesis or Diss., Université Paris sciences et lettres, 2020. http://www.theses.fr/2020UPSLE058.

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Abstract:

La régulation post-transcriptionnelle de l’expression des gènes est un réseau d’interactions impliquant de nombreuses protéines de liaison à l’ARN et des ARN non-codants afin d’orchestrer la vie complexe des ARN messagers (ARNm). Chez les métazoaires, le complexe EJC (Exon Junction Complex) est un complexe multiprotéique déposé sur la jonction exonique des ARNm pendant l’épissage. L’EJC interagit avec de nombreux facteurs et est important pour le couplage fonctionnel entre l’épissage et l’export du noyau, la localisation, la traduction et la dégradation des ARNm. Malgré son rôle central dans l

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Ben, ouirane Kaouther. "Apport des approches in silico aux études structure-fonction de la polymérase du virus de l'hépatite C." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLS323.

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Abstract:

Le virus de l'hépatite C (HCV) est un virus à ARN qui synthétise ses nouveaux génomes dans les cellules hôtes infectées grâce à une ARN polymérase ARN dépendante (RdRp), appelée NS5B. Cette polymérase a été pendant longtemps une cible majeure dans la recherche d'antiviraux contre l'hépatite C. Aujourd'hui, de nombreux antiviraux ont été approuvés dans le traitement de l’hépatite C ciblant différentes protéines virales, entre autre, NS5B. Le sofosbuvir qui cible le site actif de NS5B est un antiviral qui a démontré une efficacité extraordinaire dans le traitement anti-HCV.Durant ces dernières a

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