Academic literature on the topic 'Phosphorelays'

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Journal articles on the topic "Phosphorelays"

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Alves, Rui, Baldiri Salvadó, Ron Milo, Ester Vilaprinyo, and Albert Sorribas. "Maximization of information transmission influences selection of native phosphorelay architectures." PeerJ 9 (June 10, 2021): e11558. http://dx.doi.org/10.7717/peerj.11558.

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Abstract:
Phosphorelays are signal transduction circuits that sense environmental changes and adjust cellular metabolism. Five different circuit architectures account for 99% of all phosphorelay operons annotated in over 9,000 fully sequenced genomes. Here we asked what biological design principles, if any, could explain selection among those architectures in nature. We began by studying kinetically well characterized phosphorelays (Spo0 of Bacillus subtilis and Sln1 of Saccharomyces cerevisiae). We find that natural circuit architecture maximizes information transmission in both cases. We use mathemati
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Csikász-Nagy, Attila, Luca Cardelli, and Orkun S. Soyer. "Response dynamics of phosphorelays suggest their potential utility in cell signalling." Journal of The Royal Society Interface 8, no. 57 (2010): 480–88. http://dx.doi.org/10.1098/rsif.2010.0336.

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Abstract:
Phosphorelays are extended two-component signalling systems found in diverse bacteria, lower eukaryotes and plants. Only few of these systems are characterized, and we still lack a full understanding of their signalling abilities. Here, we aim to achieve a global understanding of phosphorelay signalling and its dynamical properties. We develop a generic model, allowing us to systematically analyse response dynamics under different assumptions. Using this model, we find that the steady-state concentration of phosphorylated protein at the final layer of a phosphorelay is a linearly increasing, b
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Thomason, P., and R. Kay. "Eukaryotic signal transduction via histidine-aspartate phosphorelay." Journal of Cell Science 113, no. 18 (2000): 3141–50. http://dx.doi.org/10.1242/jcs.113.18.3141.

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Abstract:
Transmembrane signal transduction is a feature common to all eukaryotic and prokaryotic cells. We now understand that a subset of the signalling mechanisms used by eukaryotes and prokaryotes are not just similar in principle, but actually use homologous proteins. These are the histidine-aspartate phosphorelays, signalling systems of eubacterial origin, now known to be widespread in eukaryotes outside the animal kingdom. Genome projects are revealing that His-Asp phosphorelays are present as multigene families in lower eukaryotes and in plants. A major challenge is to understand how these ‘nove
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Koppenhöfer, Sonja, and Andrew S. Lang. "Interactions among Redox Regulators and the CtrA Phosphorelay in Dinoroseobacter shibae and Rhodobacter capsulatus." Microorganisms 8, no. 4 (2020): 562. http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms8040562.

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Abstract:
Bacteria employ regulatory networks to detect environmental signals and respond appropriately, often by adjusting gene expression. Some regulatory networks influence many genes, and many genes are affected by multiple regulatory networks. Here, we investigate the extent to which regulatory systems controlling aerobic–anaerobic energetics overlap with the CtrA phosphorelay, an important system that controls a variety of behavioral processes, in two metabolically versatile alphaproteobacteria, Dinoroseobacter shibae and Rhodobacter capsulatus. We analyzed ten available transcriptomic datasets fr
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Chen, Y. Erin, Christos G. Tsokos, Emanuele G. Biondi, Barrett S. Perchuk, and Michael T. Laub. "Dynamics of Two Phosphorelays Controlling Cell Cycle Progression in Caulobacter crescentus." Journal of Bacteriology 191, no. 24 (2009): 7417–29. http://dx.doi.org/10.1128/jb.00992-09.

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Abstract:
ABSTRACT In Caulobacter crescentus, progression through the cell cycle is governed by the periodic activation and inactivation of the master regulator CtrA. Two phosphorelays, each initiating with the histidine kinase CckA, promote CtrA activation by driving its phosphorylation and by inactivating its proteolysis. Here, we examined whether the CckA phosphorelays also influence the downregulation of CtrA. We demonstrate that CckA is bifunctional, capable of acting as either a kinase or phosphatase to drive the activation or inactivation, respectively, of CtrA. By identifying mutations that unco
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Schaller, G. Eric, Joseph J. Kieber, and Shin-Han Shiu. "Two-Component Signaling Elements and Histidyl-Aspartyl Phosphorelays†." Arabidopsis Book 6 (January 2008): e0112. http://dx.doi.org/10.1199/tab.0112.

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Chauhan, Neeraj. "Two-component phosphorelays in fungal mitochondria and beyond." Mitochondrion 22 (May 2015): 60–65. http://dx.doi.org/10.1016/j.mito.2015.03.003.

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Tierrez, Alberto, and Francisco García-del Portillo. "The Salmonella Membrane Protein IgaA Modulates the Activity of the RcsC-YojN-RcsB and PhoP-PhoQ Regulons." Journal of Bacteriology 186, no. 22 (2004): 7481–89. http://dx.doi.org/10.1128/jb.186.22.7481-7489.2004.

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Abstract:
ABSTRACT The Salmonella enterica serovar Typhimurium membrane protein IgaA and the PhoP-PhoQ two-component system are used by this pathogen to attenuate the intracellular growth rate within fibroblasts. IgaA has also recently been shown to contribute to virulence by exerting tight repression of the RcsC-YojN-RcsB phosphorelay in host tissues. Here we show that loss of repression of the RcsC-YojN-RcsB system, linked to an R188H mutation in the IgaA protein (igaA1 allele), is accompanied by altered expression of PhoP-PhoQ-activated (pag) genes. The changes in gene expression were different depen
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Kothamachu, Varun B., Elisenda Feliu, Carsten Wiuf, Luca Cardelli, and Orkun S. Soyer. "Phosphorelays Provide Tunable Signal Processing Capabilities for the Cell." PLoS Computational Biology 9, no. 11 (2013): e1003322. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003322.

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Knudsen, Michael, Elisenda Feliu, and Carsten Wiuf. "Exact analysis of intrinsic qualitative features of phosphorelays using mathematical models." Journal of Theoretical Biology 300 (May 2012): 7–18. http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2012.01.007.

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Dissertations / Theses on the topic "Phosphorelays"

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Salvadó, López Baldiri. "Design principles in two component systems and his-asp phosphorelays." Doctoral thesis, Universitat de Lleida, 2016. http://hdl.handle.net/10803/393740.

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Abstract:
L’objectiu d’aquesta tesi és trobar principis generals que permetin relacionar l’estructura i les propietats funcionals dels circuits moleculars de transducció de senyals two-component systems (TCS) i his-asp phosphorelays (PR). La tesi s’inicia revisant els mètodes usats per a l’estudi de principis de disseny en sistemes moleculars i alguns dels resultats obtinguts fins ara, i discutint la importància de l’estudi dels principis de disseny. A continuació, explorem els proteomes seqüenciats de més de 7000 organismes i fem un inventari dels diferents tipus d’organització en operons i proteïne
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Cochard, Clémence. "Régulation fine du système EnvZ/OmpR chez Dickeya dadantii : clef d'une infection réussie." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2023. http://www.theses.fr/2023ULILS109.

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Abstract:
Tout au long de sa vie, la bactérie doit faire face à de nombreuses variations de l'environnement. Elle doit s'y adapter rapidement et efficacement afin de survivre. Pour cela, elle dispose des phosphorelais, ou systèmes à deux composants qui sont les outils moléculaires majeurs permettant la perception et l'adaptation de l'environnement chez les bactéries. Ils sont composés d'un capteur et d'un régulateur associé. Suite à la perception d'un stimulus, le capteur s'autophosphoryle et transmet le groupement phosphate au régulateur qui va alors moduler l'expression de l'ensemble des gènes cibles,
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Treffandier, Hélène. "Etude du phosphorelais RcsCDB/FA d'Escherichia coli." Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/797/.

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Abstract:
Les phosphorelais histidine-aspartate constituent la voie préférentielle de transduction des signaux environnementaux chez les bactéries et médient un grand nombre de réponses adaptatives différentes. Le système Rcs d'Escherichia coli est un phosphorelais complexe constitué de cinq protéines RcsCDBFA. Exclusif des Entérobactéries, il module la formation des biofilms et la virulence de différents pathogènes. Il est activé par des altérations de l'enveloppe et contrôle 2 à 3 % du génome bactérien. Cependant, le rôle du système Rcs dans l'adaptation des cellules à leur environnement reste peu doc
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Caby, Marine. "Rôle du phosphorelais EnvZ/OmpR chez la bactérie phytopathogène Dickeya dadantii." Thesis, Lille 1, 2020. http://www.theses.fr/2020LIL1S108.

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Abstract:
Au cours de leur vie, les bactéries pathogènes sont confrontées à de nombreuses variations environnementales souvent appelées stress, notamment au cours du processus infectieux. Pour survivre et coloniser avec succès son hôte, la bactérie doit percevoir ce nouvel et hostile environnement pour s'y adapter rapidement. C'est le rôle principal assigné aux phosphorelais. Ces systèmes sont composés d'un couple capteur/régulateur. Sous l'action d'un stimulus, le capteur s'autophosphoryle et transmet son phosphate au régulateur, qui module l’activité d’un ensemble de gènes cibles perme
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Huang, Ya-hui. "Genetic and functional analysis of the Rcs phosphorelay in the Enterobacteriaceae." Thesis, University of Bath, 2006. https://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.436882.

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Djeghdir, Inès. "Identification et caractérisation de facteurs de transcription appartenant à la famille des régulateurs de réponse de type B, impliqués dans la réponse à la sécheresse chez le peuplier." Thesis, Orléans, 2016. http://www.theses.fr/2016ORLE2056/document.

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Abstract:
Les plantes sont de plus en plus confrontées à une diminution de la disponibilité en eau du sol, constituant une contrainte hydrique et osmotique impactant leur survie. La tolérance des plantes face à cette contrainte sera conditionnée par la perception de celle-ci. Un des mécanismes de signalisation de cette contrainte est appelé MultiStep Phosphorelay (MSP) et est composé de 3 partenaires : un récepteur Histidine-aspartate Kinase (HK), des protéines Histidine Phosphotransfert (HPt) et des Régulateurs de Réponse (RR), dont les facteurs de transcription RR-B. Chez Arabidopsis, un MSP constitué
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Borland, Stéphanie. "Rôle des systèmes à deux composants dans l’adaptation de la bactérie phytostimulatrice Azospirillum à la rhizosphère." Thesis, Lyon 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LYO10037.

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Abstract:
Les systèmes à deux composants jouent un rôle prépondérant dans l'adaptation des bactéries à leur environnement. L'objectif de ce travail de thèse était d'identifier et de caractériser des systèmes à deux composants chez la bactérie phytostimulatrice Azospirillum nécessaires à l'adaptation à la rhizosphère de sa plante-hôte. L'analyse de la distribution génomique des gènes appartenant à la famille des systèmes à deux composants dans les génomes d'Azospirillum disponibles a révélé l'existence d'un grand nombre de gènes codant des hisitidine kinases hybrides, et une analyse plus approfondie a mo
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Fernandez, Marion. "Le rôle de systèmes à phosphorelais dans l’infection de la puce Xenopsylla cheopis par Yersinia pestis." Thesis, Lille, 2019. http://www.theses.fr/2019LILUS050.

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Abstract:
Les systèmes à deux composants sont utilisés par les bactéries afin de percevoir un stimulus environnemental et de s’y adapter, via une modulation de l’expression génétique. Ils sont composés d’une histidine kinase, un capteur, qui transmet le signal perçu à un régulateur de réponse par un mécanisme de phosphotransfert. Y. pestis est un bacille à Gram négatif responsable de la peste, une zoonose, transmis par les puces. La formation d’un biofilm bactérien obstruant le proventricule de la puce infectée, qualifiée alors de bloquée, est un élément essentiel dans le processus de transmission de la
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Sexauer, Anne [Verfasser], and Nicole [Akademischer Betreuer] Frankenberg-Dinkel. "Characterization of a bacterial-like signal transduction phosphorelay in Methanosarcina acetivorans / Anne Sexauer ; Betreuer: Nicole Frankenberg-Dinkel." Kaiserslautern : Technische Universität Kaiserslautern, 2021. http://d-nb.info/1237268974/34.

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Chefdor, Françoise. "Recherche d’un phosphorelais multiple impliqué dans la perception et la transduction du signal stress hydrique chez le peuplier." Orléans, 2006. http://www.theses.fr/2006ORLE2054.

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Abstract:
A partir d’une banque d’ADNc de racines de peuplier ‘Dorskamp’, nous avons isolé un ADNc codant pour une histidine-aspartate kinase appelé HK1 et quatre ADNc codant pour trois protéines à domaine transmetteur de phosphate à histidine, HPt1, HPt2 et HPt3/4. Nous avons montré dans les racines de peuplier cultivé en hydroponie que le taux de transcrits HK1 augmente 5 min après l’application d’une contrainte hyper-osmotique et qu’il existe une interaction entre HK1 et HPt2 chez la levure. L’ensemble de ces résultats est un argument fort en faveur de l’implication d’un système de phosphorelais mult
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More sources

Book chapters on the topic "Phosphorelays"

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Perego, Marta, and James A. Hoch. "Two-Component Systems, Phosphorelays, and Regulation of Their Activities by Phosphatases." In Bacillus subtilis and Its Closest Relatives. ASM Press, 2014. http://dx.doi.org/10.1128/9781555817992.ch33.

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Hoch, James A. "spoO Genes, the Phosphorelay, and the Initiation of Sporulation." In Bacillus subtilis and Other Gram-Positive Bacteria. ASM Press, 2014. http://dx.doi.org/10.1128/9781555818388.ch51.

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Hoch, James A. "Control of Cellular Development in Sporulating Bacteria by the Phosphorelay Two-Component Signal Transduction System." In Two-Component Signal Transduction. ASM Press, 2014. http://dx.doi.org/10.1128/9781555818319.ch8.

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Hosoda, Kazuo, Etsuko Katoh, Tomohisa Hatta, Takeshi Mizuno, and Toshimasa Yamazaki. "NMR Solution Structure of B-Motif, a Signature Motif of Type-B Response Regulators for His-to-Asp Phosphorelay Signal Transduction System, and Its Interactions with DNA." In Peptides: The Wave of the Future. Springer Netherlands, 2001. http://dx.doi.org/10.1007/978-94-010-0464-0_190.

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Laub, Michael T., Emanuele G. Biondi, and Jeffrey M. Skerker. "Phosphotransfer Profiling: Systematic Mapping of Two‐Component Signal Transduction Pathways and Phosphorelays." In Methods in Enzymology. Elsevier, 2007. http://dx.doi.org/10.1016/s0076-6879(07)23026-5.

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"Phosphorelay." In Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics and Informatics. Springer Netherlands, 2008. http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4020-6754-9_12759.

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"Serine/Threonine Protein Kinase Phosphorelay Modules." In Encyclopedia of Molecular Pharmacology. Springer International Publishing, 2021. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-57401-7_300467.

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Varughese, Kottayil I., Haiyan Zhao, Vidya Harini Veldore, and James Zapf. "Sporulation Phosphorelay Proteins and Their Complexes: Crystallographic Characterization." In Methods in Enzymology. Elsevier, 2007. http://dx.doi.org/10.1016/s0076-6879(06)22005-6.

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Majdalani, Nadim, and Susan Gottesman. "Genetic Dissection of Signaling Through the Rcs Phosphorelay." In Methods in Enzymology. Elsevier, 2007. http://dx.doi.org/10.1016/s0076-6879(07)23016-2.

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Kaserer, Alla O., Babak Andi, Paul F. Cook, and Ann H. West. "Kinetic Studies of the Yeast His-Asp Phosphorelay Signaling Pathway." In Methods in Enzymology. Elsevier, 2010. http://dx.doi.org/10.1016/s0076-6879(10)71004-1.

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Conference papers on the topic "Phosphorelays"

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Lampoudi, Sotiria, Robin Hulbert, Corinne Williams, Peggy Cotter, and Linda Petzold. "The development of a model of a bacterial phosphorelay signal transduction system." In 2006 Bio Micro and Nanosystems Conference. IEEE, 2006. http://dx.doi.org/10.1109/bmn.2006.330933.

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Reports on the topic "Phosphorelays"

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Lers, Amnon, and Gan Susheng. Study of the regulatory mechanism involved in dark-induced Postharvest leaf senescence. United States Department of Agriculture, 2009. http://dx.doi.org/10.32747/2009.7591734.bard.

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Abstract:
Postharvest leaf senescence contributes to quality losses in flowers and leafy vegetables. The general goal of this research project was to investigate the regulatory mechanisms involved in dark-induced leaf senescence. The regulatory system involved in senescence induction and control is highly complex and possibly involves a network of senescence promoting pathways responsible for activation of the senescence-associated genes. Pathways involving different internal signals and environmental factors may have distinctive importance in different leaf senescence systems. Darkness is known to have
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