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  1. Dissertations / Theses

Academic literature on the topic 'Simulations moléculaire interactive'

Author: Grafiati
Published: 25 May 2024
Last updated: 31 July 2025

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Dissertations / Theses on the topic "Simulations moléculaire interactive"

1

Lanrezac, André. "Interprétation de données expérimentales par simulation et visualisation moléculaire interactive." Electronic Thesis or Diss., Université Paris Cité, 2023. http://www.theses.fr/2023UNIP7133.

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Abstract:
L'objectif de l'approche des simulations moléculaires interactive (Interactive Molecular Simulations - IMS) est d'observer en direct la dynamique conformationnelle d'une simulation moléculaire en cours. Le retour visuel instantané permet un suivi instructif ainsi que l'observation des changements structurels imposés par la manipulation de l'IMS par l'utilisateur. J'ai mené une étude approfondie des connaissances pour rassembler et synthétiser l'ensemble des recherches qui ont développé l'IMS. La dynamique moléculaire interactive (Interactive Molecular Dynamics - IMD) est l'un des premiers prot
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2

Barnoud, Jonathan. "Interaction entre modèles de membranes biologiques et nanoparticules, une études par simulation moléculaire." Paris 7, 2014. http://www.theses.fr/2014PA077260.

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Abstract:
Les membranes biologiques jouent un rôle crucial pour les cellules. Elles constituent leurs barrières externes et internes. Ces membranes régulent les flux de matière, d'information et d'énergie au sein des cellules. Les fonctions d'une membrane sont intimement liées à sa composition, altérer de cette composition peut altérer les fonctions membranaires. Un tel changement de composition peut être du à l'ajout de molécules exogènes, tels des médicaments ou des polluants. L'effet de ces molécules sur les membranes n'est pas toujours compris. De plus, l'environnement chimique d'une molécule affect
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3

Özdamar, Burak. "First-principles simulations of the interaction of metal-organic molecules with a surface and as building blocks for nanodevices." Thesis, Strasbourg, 2016. http://www.theses.fr/2016STRAE043/document.

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Abstract:
Ce travail de thèse est focalisé sur l'interaction de molécules organométalliques avec des métaux de transition. Cette thématique a un large éventail d'applications dans plusieurs domaines tels que la réalisation de nanojonctions pour la nano-électronique, la bioimagerie et le stockage d'énergie magnétique, la nano-catalyse et les applications biomédicales. Dans ce cadre général, ce projet de thèse vise la modélisation à l’échelle atomique des interactions fondamentales entre les briques moléculaires afin de comprendre leur rôle dans l’assemblage et la fonctionnalisation des nanostructures. L’
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4

Roux, Raphaël. "Étude probabiliste de systèmes de particules en interaction : applications à la simulation moléculaire." Phd thesis, Université Paris-Est, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00597479.

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Abstract:
Ce travail présente quelques résultats sur les systèmes de particules en interaction pour l'interprétation probabiliste des équations aux dérivées partielles, avec des applications à des questions de dynamique moléculaire et de chimie quantique. On présente notamment une méthode particulaire permettant d'analyser le processus de la force biaisante adaptative, utilisé en dynamique moléculaire pour le calcul de différences d'énergies libres. On étudie également la sensibilité de dynamiques stochastiques par rapport à un paramètre, en vue du calcul des forces dans l'approximation de Born-Oppenhei
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Simard, Jean. "Collaboration haptique étroitement couplée pour la manipulation moléculaire interactive." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00688036.

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Abstract:
Le docking moléculaire est une tâche complexe, difficile à appréhender pour une personne seule. C'est pourquoi, nous nous proposons d'étudier la distribution cognitive des charges de travail à travers la collaboration. Une plate-forme distribuée de déformation moléculaire interactive a été mise en place afin d'étudier les avantages mais aussi les limites et les contraintes du travail collaboratif étroitement couplé. Cette première étude, basée sur trois expérimentations, a permis de valider l'intérêt d'une approche collaborative pour des tâches complexes à fort couplage.
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Davydova, Alexandra. "MD simulation of H2 plasma/graphene interaction for innovative etching processes development." Thesis, Grenoble, 2014. http://www.theses.fr/2014GRENT054.

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Abstract:
Graphène est un matériau bidimensionnel unique physique, chimique et les propriétés mécaniques. Il pourrait être prometteur pour de nouvelles applications, mais le contrôle nm échelle de traitement de graphène défis la technologie actuelle, en particulier dans le traitement du plasma, empêchant ainsi le développement de la technologie à base de graphène à l'échelle industrielle<br>Graphene is a two-dimensional material with unique physical, chemical and mechanical properties. It could be promising for novel applications, but the nm-scale control of graphene processing challenges current techno
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Luo, Yun. "Etude des interactions sucre-sucre : synthèse totale de deux glycosphingolipides pentaosyl Lewis déoxygéné et simulations de dynamique moléculaire d'un agglomérat de Lewis." Paris 6, 2007. http://www.theses.fr/2007PA066355.

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Abstract:
Depuis leur découverte, par Hakomori durant les années 1989-1993, les interactions sucre-sucre ont été étudiées par diverses méthodes. Elles représentent un nouveau type d'interaction moléculaire rencontré dans l'adhésion et la reconnaissance cellulaire. Une des structures impliquées dans ce mécanisme est le déterminant Lewisx (Lex) (Ga14 [Fuc13]GcNAc1R). Des agglomérats de glycosphingolipides du Lewisx (Lex GSLs) se forment à la surface des cellules, et l'interaction entre ces microdomaines a été proposée comme étant responsable de l'étape initiale de l'adhésion cellulaire, l'embryogénè
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8

Doutreligne, Sébastien. "interactive molecular dynamics software development : Application to biomolecule folding." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCC180/document.

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Abstract:
Le repliement de biomolécules à partir de méthodes computationelles reste un grand défi. Plus particulièrement, les simulations de dynamique moléculaire tout-atomes sont intrinsèquement longues et ne permettent pas encore d’atteindre l’échelle de temps de la microseconde de façon courante. En général, un approche gros-grain est préférée pour simuler des systèmes plus grands et des échelles de temps plus longues. Les approches automatiques comme la dynamique moléculaire ne tiennent pas compte de l’expertise de l’investigateur. Ce travail de thèse explore le repliement des biomolécules au
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9

Khalfa, Adil. "Etude des cycles peptidiques en interaction avec les membranes lipidiques par simulations de dynamique moléculaire utilisant l'approche gros grains." Thesis, Nancy 1, 2009. http://www.theses.fr/2009NAN10024/document.

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Abstract:
Les cycles peptidiques (CPs) composés d’un nombre paire d’acides aminés avec l’alternance de chiralité L/D, sont capables de s’auto assembler pour former des nanotubes peptidiques tubulaires creux grâce à un réseau de liaisons d’hydrogène. La partition des CPs hydrophobes dans une membrane lipidique forme un nanotube transmembranaire, alors que les CPs chargés caractérisé par l’amphipacité montrent une forte activité antibactérienne contre les bactéries gram+/-. Le but de ce travail consiste principalement à étudier les interactions des CPs avec des membranes lipidiques par simulations de dyna
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10

Madeleine, Noelly. "Recherche d'inhibiteurs de l'interaction Lutheran-Laminine par des techniques de modélisation et de simulation moléculaires." Thesis, La Réunion, 2017. http://www.theses.fr/2017LARE0054/document.

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Abstract:
La drépanocytose est une maladie génétique qui se caractérise par des globules rouges en forme de faucille. Chez les personnes atteintes de drépanocytose, ces globules rouges (GR) adhèrent à l’endothélium vasculaire et provoquent ainsi une vaso-occlusion. Ce phénomène s’explique par la surexpression de la protéine Lutheran (Lu) à la surface des globules rouges falciformes qui se lie fortement à la Laminine (Ln) 511/521 exprimée par l’endothélium vasculaire enflammé. Le but de cette étude est d’identifier un inhibiteur d’interaction protéine-protéine (PPI) qui possède une forte probabilité de l
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